Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7145
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7145, 344 aa
1>>>pF1KB7145 344 - 344 aa - 344 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3243+/-0.0015; mu= 16.0779+/- 0.088
mean_var=114.7573+/-30.879, 0's: 0 Z-trim(99.5): 320 B-trim: 790 in 2/44
Lambda= 0.119725
statistics sampled from 5282 (5748) to 5282 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.494), E-opt: 0.2 (0.177), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 2280 405.9 2.6e-113
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 1227 224.0 1.5e-58
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 700 133.0 3.9e-31
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 642 122.9 3.8e-28
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 642 123.0 4e-28
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 639 122.4 5.4e-28
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 634 121.5 9.7e-28
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 627 120.4 2.4e-27
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 608 117.2 2.6e-26
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 595 114.8 1.1e-25
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 591 114.2 1.8e-25
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 582 112.6 5e-25
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 580 112.2 6.3e-25
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 580 112.2 6.5e-25
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 580 112.3 6.9e-25
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 580 112.3 6.9e-25
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 566 109.8 3.5e-24
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 553 107.6 1.6e-23
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 551 107.3 2.2e-23
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 546 106.4 3.9e-23
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 541 105.5 7e-23
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 541 105.5 7e-23
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 541 105.5 7.2e-23
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 540 105.3 7.8e-23
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 525 102.7 4.8e-22
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 524 102.6 5.3e-22
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 523 102.3 5.7e-22
CCDS2480.1 GPR55 gene_id:9290|Hs108|chr2 ( 319) 519 101.6 9e-22
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 510 100.2 3e-21
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 509 100.0 3.2e-21
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 508 99.8 3.8e-21
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 507 99.7 4.3e-21
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 507 99.7 4.3e-21
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 507 99.7 4.4e-21
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 507 99.7 4.4e-21
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 507 99.7 4.4e-21
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 507 99.7 4.4e-21
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 507 99.7 4.5e-21
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 507 99.7 4.5e-21
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 507 99.7 4.7e-21
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 507 99.8 5e-21
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 503 98.9 6.6e-21
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 502 98.8 7.6e-21
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 494 97.4 1.9e-20
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 494 97.4 2e-20
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 489 96.5 3.4e-20
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 488 96.4 4.2e-20
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 486 96.0 5e-20
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 486 96.0 5.2e-20
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 485 95.8 5.5e-20
>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 (344 aa)
initn: 2280 init1: 2280 opt: 2280 Z-score: 2147.8 bits: 405.9 E(32554): 2.6e-113
Smith-Waterman score: 2280; 100.0% identity (100.0% similar) in 344 aa overlap (1-344:1-344)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVLKVRNETTTYMINLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVLKVRNETTTYMINLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAIVY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNNASEACFENFPEATWKTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 PFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNNASEACFENFPEATWKTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLIIFCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLIIFCF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAVSNCCFDPIVYYFTSDTIQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 CFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAVSNCCFDPIVYYFTSDTIQN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB7 SIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNESAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNESAA
310 320 330 340
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
initn: 1253 init1: 636 opt: 1227 Z-score: 1164.5 bits: 224.0 E(32554): 1.5e-58
Smith-Waterman score: 1227; 58.6% identity (83.1% similar) in 302 aa overlap (9-310:31-329)
10 20 30
pF1KB7 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVA
:. .:::::.: : ..:.::.::::.: :.
CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 IYIFICVLKVRNETTTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYT
...: .:.:.::. .. :::.:::::: ::::.::: .:.::::: ::::: : :
CCDS14 LFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRHWPFGDTLCKISGTAFLT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 NMYGSILFLTCISVDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTH
:.:::.::::::::::::::::::.:.:.::.::. :::.:::. :..:. : . ..:.
CCDS14 NIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTTN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 SQGNNASEACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLS
:::. .:::.: . .::::::.:.::::.:::.:::::::.:::.::.:: ::.:::
CCDS14 V--NNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATLS
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 RSKINKTKVLKMIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLC
. :: :::::: ::. .: :::::: :.::.:::.:...:: . .. :::::::
CCDS14 QIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPITLC
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 IAVSNCCFDPIVYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIF
.:. ::::::..:::: ...:.:. . : .:
CCDS14 LATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYI-NAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQT
300 310 320 330 340 350
340
pF1KB7 DNESAA
CCDS14 TNNGGELMLESTF
360 370
>>CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 (372 aa)
initn: 647 init1: 429 opt: 700 Z-score: 672.5 bits: 133.0 E(32554): 3.9e-31
Smith-Waterman score: 700; 37.1% identity (70.4% similar) in 291 aa overlap (17-303:22-309)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVLKVRNETTTY
. :. ..:.:.. :: : .:...:. .:.:.. ...:
CCDS85 MLANSSSTNSSVLPCPDYRPTHRLHLVVYSLVLAAGLPLNALALWVFLRALRVHSVVSVY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 MINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRF
: ::: :::::...:: :. :.. ..::: ::::. . .: ::::: .:: :.:::.
CCDS85 MCNLAASDLLFTLSLPVRLSYYALHHWPFPDLLCQTTGAIFQMNMYGSCIFLMLINVDRY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQ--STHSQGNNASEACFENFP
:::.:.. . :: : :...: ::: .. ..::. :. : . . :::.:
CCDS85 AAIVHPLRLRHLRRPRVARLLCLGVWALILVFAVPAARVHRPSRCRYRDLEVRLCFESFS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 EATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSKINKTKVLKMIFV
. :: : .:.. : .::..:: : :. :. ::..: . . .. . :.......
CCDS85 DELWKGRLLPLVLLAEALGFLLPLAAVVYSSGRVFWTLARPDATQSQR--RRKTVRLLLA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 HLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAA--VRTMYPITLCIAVSNCCFDPIVY
.:.:: .:::::: .: .:.:.:.. .: :: : :: . . . .: .:: .::.::
CCDS85 NLVIFLLCFVPYNSTLAVYGLLRSK-LVAASVPARDRVRGVLMVMVLLAGANCVLDPLVY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 YFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNESAA
::... ..:...
CCDS85 YFSAEGFRNTLRGLGTPHRARTSATNGTRAALAQSERSAVTTDATRPDAASQGLLRPSDS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX (339 aa)
initn: 592 init1: 316 opt: 642 Z-score: 618.9 bits: 122.9 E(32554): 3.8e-28
Smith-Waterman score: 642; 32.1% identity (68.2% similar) in 302 aa overlap (12-312:29-326)
10 20 30 40
pF1KB7 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFI
: .:.:.::. . ..:. ::..: .:....
CCDS14 MANLDKYTETFKMGSNSTSTAEIYCNVTNVKFQYSLYATTYILIFIPGLLANSAALWVLC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 CVLKVRNETTTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGS
.. .:.. .::::...:: :..::.::.:. ...::: :: . .: : :::.:
CCDS14 RFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKYLNMYAS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ILFLTCISVDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNN
: ::::::..: . .. ::... . . .. : ...:..: . : ...:: . .::
CCDS14 ICFLTCISLQRCFFLLKPFRARDWKRRYDVGI-SAAIWIVVGTACLPFPILRST-DLNNN
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 ASEACFENFPEATWKTY-LSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSKI
: :: .. .. : .. :..:: ::.:. . :. . .: .: ..
CCDS14 KS--CFADLGYKQMNAVALVGMITVAELAGFVIPVIIIAWCTWKTTISLRQPPMAFQGIS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 NKTKVLKMIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAVS
.. :.:.:.:. .: .::.::.::.:.:..:. . .: :: . ..:. ::.:
CCDS14 ERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKETIISSCPVVRIALYFHPFCLCLASL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 NCCFDPIVYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNES
: .:::.::: .. ...... .. :: ::
CCDS14 CCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHGSSVTRSRLMSKESGSSMIG
300 310 320 330
>>CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX (365 aa)
initn: 462 init1: 229 opt: 642 Z-score: 618.5 bits: 123.0 E(32554): 4e-28
Smith-Waterman score: 642; 33.4% identity (66.6% similar) in 296 aa overlap (9-303:27-318)
10 20 30 40
pF1KB7 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIF
:.....::. : ...:::::: : ....:
CCDS14 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 ICVLKVRNETTTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRN-WPFGDLLCKISVMLFYTNMY
: :. . :.:::..::.:: :.:..:: :.:....: :::: .::. .::: :.:
CCDS14 IFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GSILFLTCISVDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQG
:.:::::::: :.:.: .:... : : ..: .:::.: : .: .: .: ..:
CCDS14 CSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSNKG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 NNASEACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSK
... : .. . :. . .. : .: .....: ... . : .:. : ..
CCDS14 TTV--LCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLL-FGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQS
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 INKTKVLKMIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAV
.. . :. : : : .: ::::..:. .: :.: ..: :. : ..: .: .:
CCDS14 SSRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLE-ADCRVLNIVNVVYKVTRPLAS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 SNCCFDPIVYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNE
.: :.::..: .:.: . ...
CCDS14 ANSCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX (337 aa)
initn: 464 init1: 245 opt: 639 Z-score: 616.1 bits: 122.4 E(32554): 5.4e-28
Smith-Waterman score: 639; 32.7% identity (70.0% similar) in 303 aa overlap (2-302:7-306)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVSVNSSHCFYN-DSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVLKVRNETTT
..:.:. : . :.:. .:. ..::. :.:...: ..:..: . . .. .
CCDS14 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQV
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.. .... .
CCDS14 SGGNFRKRLSTFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
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CCDS14 FRRRLS-------RQDLHDSIQLH-AKSFVSNHTASTMTPELC
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CCDS82 ANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARRRLGLRRSDRTDMQRIEDVLGSS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]