Result of FASTA (ccds) for pFN21AB7139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7139, 333 aa
  1>>>pF1KB7139 333 - 333 aa - 333 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6010+/-0.000678; mu= 11.1660+/- 0.041
 mean_var=104.1230+/-20.224, 0's: 0 Z-trim(113.8): 21  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.125690
 statistics sampled from 14428 (14449) to 14428 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.444), width:  16
 Scan time:  3.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1           ( 333) 2274 422.1  3e-118
CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6            ( 382)  995 190.2 2.2e-48
CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13           ( 435)  989 189.2 5.3e-48
CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1             ( 358)  935 179.4   4e-45
CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1            ( 515)  887 170.7 2.2e-42
CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1           ( 433)  881 169.6 4.1e-42
CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6          ( 543)  882 169.8 4.4e-42
CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13           ( 226)  487 98.0 7.7e-21
CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1             ( 270)  477 96.2 3.1e-20
CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13          ( 261)  464 93.9 1.6e-19
CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1           ( 439)  449 91.3 1.6e-18
CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1           ( 266)  441 89.7 2.9e-18
CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX           ( 283)  439 89.4 3.9e-18
CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17         ( 396)  438 89.3 5.8e-18
CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15         ( 321)  428 87.4 1.7e-17
CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1             ( 273)  425 86.8 2.2e-17
CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6          ( 223)  419 85.7 3.9e-17
CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17        ( 294)  387 79.9 2.8e-15
CCDS34697.1 GJC3 gene_id:349149|Hs108|chr7         ( 279)  322 68.1 9.4e-12


>>CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1                (333 aa)
 initn: 2274 init1: 2274 opt: 2274  Z-score: 2236.3  bits: 422.1 E(32554): 3e-118
Smith-Waterman score: 2274; 99.7% identity (99.7% similar) in 333 aa overlap (1-333:1-333)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 MEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRGM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 RARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEERL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330   
pF1KB7 ASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV
       :::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS30 ASSRPPLFLDPPPQNGQKPPSRPSSSASKKQYV
              310       320       330   

>>CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6                 (382 aa)
 initn: 1039 init1: 967 opt: 995  Z-score: 982.0  bits: 190.2 E(32554): 2.2e-48
Smith-Waterman score: 1023; 49.1% identity (73.9% similar) in 322 aa overlap (1-298:1-317)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
       ::::. : ::::.:: .::. ::.::.::::::::.:: : ::.:::::: :.::: :::
CCDS51 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
       : :::::..:::::.:.::::..:::.:::.::.::.:. :.::.: .:: ::..  .  
CCDS51 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWT
        .:.  :  .: .  : .. : :....::.:. ::. :.: ::..:..::  :: .::..
CCDS51 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 MEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRGM
       .  :..:.: :::. ::::.::::::::::::::::.:.::.::..:: ... .    :.
CCDS51 LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFK----GV
              190       200       210       220       230          

              250         260               270                    
pF1KB7 RARQGQDAPPTQGTSS--DPYTD---QVFFYL-----PVGQ-GPSSPP------------
       . :    . : ..::.  .:  :   : . :.     :..  .: :::            
CCDS51 KDRVKGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNS
        240       250       260       270       280       290      

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB7 -CPTYNGLSSSEQNWANLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV   
        : .::  ..::::::: ..:.                                      
CCDS51 SCRNYNK-QASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHELQP
        300        310       320       330       340       350     

>>CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13                (435 aa)
 initn: 1064 init1: 603 opt: 989  Z-score: 975.3  bits: 189.2 E(32554): 5.3e-48
Smith-Waterman score: 1020; 46.8% identity (67.2% similar) in 372 aa overlap (1-328:1-359)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
       ::::.:: .::...::::::.::.:::::::::::.:: :.:.::::::::: ::: :::
CCDS92 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
       : :::::.::::::::.:.::..:::::::.:::::... : ::. ...: : . :  ..
CCDS92 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEE-EQLKRES
               70        80        90       100       110          

              130       140        150       160       170         
pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAED-GRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGW
       :. .      :  . . :  .: ::.:. :::. ::: ... :...:.::. ::. :::.
CCDS92 PSPK------EPPQDNPSSRDDRGRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGF
     120             130       140       150       160       170   

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 TMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRG
        ..:.. :.: :::  ::::.::::::::::::::.:.  ::.::.::. ::  . :..:
CCDS92 ELKPLYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQG
           180       190       200       210       220       230   

     240                250       260              270             
pF1KB7 MRARQGQDA---------PPTQGTSSDPYTDQVFF--YL-----PVGQG-----PSSPP-
       . .: : ::         ::    :: : .  . :  :      :.::.     :..:: 
CCDS92 VTSRLGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPP
           240       250       260       270       280       290   

                         280          290       300       310      
pF1KB7 ------------------CPTYNG---LSSSEQNWANLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNG
                            :::   :  .:::::: ..:..     :: .   :  . 
CCDS92 AADFKLLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTEQNWANQAAERQ-----PPALKAYPAAST
           300       310       320       330            340        

        320       330                                              
pF1KB7 QKSPSRPSSSASKKQYV                                           
         .:: : .:.:                                                
CCDS92 PAAPS-PVGSSSPPLAHEAEAGAAPLLLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQP
      350        360       370       380       390       400       

>>CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1                  (358 aa)
 initn: 944 init1: 579 opt: 935  Z-score: 923.7  bits: 179.4 E(32554): 4e-45
Smith-Waterman score: 935; 45.8% identity (71.9% similar) in 334 aa overlap (1-324:1-325)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
       ::::.:: ..:..:..:::::::.:::::::::.:.:: :.:: :::::.::.:.: :::
CCDS92 MGDWSFLGNFLEEVHKHSTVVGKVWLTVLFIFRMLVLGTAAESSWGDEQADFRCDTIQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
       : :::::::::::::::::::..:::::.:::.::...  : .:. . .:.: ::  .. 
CCDS92 CQNVCYDQAFPISHIRYWVLQIIFVSTPSLVYMGHAMHTVRMQEKRKLREAE-RAKEVRG
               70        80        90       100       110          

               130       140         150       160       170       
pF1KB7 P-QVERALAAVERQMAKISVAEDG--RLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY
         . :  .:    . :..:  :.:  :. ..:.:..::: :.: ....:.::. ::. .:
CCDS92 SGSYEYPVA----EKAELSCWEEGNGRIALQGTLLNTYVCSILIRTTMEVGFIVGQYFIY
     120           130       140       150       160       170     

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB7 GWTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCL-
       :  .  . ::.:.:::. :.:.:::::::..::.:::.:. .::.:.: :: ::  . . 
CCDS92 GIFLTTLHVCRRSPCPHPVNCYVSRPTEKNVFIVFMLAVAALSLLLSLAELYHLGWKKIR
         180       190       200       210       220       230     

        240           250         260       270       280       290
pF1KB7 SRGMRARQG----QDAPPTQGT--SSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQN
       .: .. ::     : . :. :   :  :  :   :   . .::..     ...  .:.::
CCDS92 QRFVKPRQHMAKCQLSGPSVGIVQSCTPPPD---FNQCLENGPGGKFFNPFSNNMASQQN
         240       250       260          270       280       290  

              300       310       320       330                    
pF1KB7 WANLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV                 
         ::.::.  .. . :       . ::: :  :.                          
CCDS92 TDNLVTEQVRGQEQTPGEGFIQVRYGQK-PEVPNGVSPGHRLPHGYHSDKRRLSKASSKA
            300       310       320        330       340       350 

CCDS92 RSDDLSV
              

>>CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1                 (515 aa)
 initn: 903 init1: 529 opt: 887  Z-score: 874.3  bits: 170.7 E(32554): 2.2e-42
Smith-Waterman score: 887; 52.7% identity (78.6% similar) in 243 aa overlap (1-240:1-242)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
       ::::..:   :..:. :::..::::::.:::::.:.::.:.:.::.:::: : ::: :::
CCDS43 MGDWNLLGDTLEEVHIHSTMIGKIWLTILFIFRMLVLGVAAEDVWNDEQSGFICNTEQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100         110        
pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSR--REERLRQKEGELRA-LP
       : ::::::::::: ::::::: .:::.:.:::.::..:  :  .::: :.: ..::. : 
CCDS43 CRNVCYDQAFPISLIRYWVLQVIFVSSPSLVYMGHALYRLRVLEEERQRMK-AQLRVELE
               70        80        90       100       110          

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 AKDPQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY
         . .. :    .:... ..   . ..  .::.:. :::  .. .::.:.::. ::. ::
CCDS43 EVEFEMPRDRRRLEQELCQLEKRKLNKAPLRGTLLCTYVIHIFTRSVVEVGFMIGQYLLY
     120       130       140       150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB7 GWTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLS
       :. .::.: :.  ::: ..:::::::::::::..::  .. ::: ::.::. ::  . ..
CCDS43 GFHLEPLFKCHGHPCPNIIDCFVSRPTEKTIFLLFMQSIATISLFLNILEIFHLGFKKIK
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB7 RGMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTE
       ::.                                                         
CCDS43 RGLWGKYKLKKEHNEFHANKAKQNVAKYQSTSANSLKRLPSAPDYNLLVEKQTHTAVYPS
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1                (433 aa)
 initn: 904 init1: 577 opt: 881  Z-score: 869.5  bits: 169.6 E(32554): 4.1e-42
Smith-Waterman score: 881; 54.5% identity (79.4% similar) in 233 aa overlap (1-231:1-227)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
       ::::.:: ..:..:.:::::.:..:::::::::::::: :.: ::::::::: ::: :::
CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
       : :::::.:::::::: ::::..:::::.:.:.::...  : ::. ...:.:  .  :  
CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
               70        80        90       100       110       120

              130       140         150       160       170        
pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAEDG--RLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYG
              .. ..  .: : .  :  ..:..:.:. ::.  .. :...:.::. :.. :::
CCDS30 N------GGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYG
                    130       140       150       160       170    

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 WTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSR
       . . :.. :.: ::: .:::::::::::::::.::: :. .:: ::..:: ::       
CCDS30 FRILPLYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRS
          180       190       200       210       220       230    

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB7 GMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEE
                                                                   
CCDS30 ALKRPVEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPA
          240       250       260       270       280       290    

>>CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6               (543 aa)
 initn: 909 init1: 522 opt: 882  Z-score: 869.0  bits: 169.8 E(32554): 4.4e-42
Smith-Waterman score: 882; 41.8% identity (71.2% similar) in 337 aa overlap (1-329:1-331)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
       ::::..:  .:..:. :::.:::::::.:::::.:.: .:.:.:: :::: : ::: :::
CCDS50 MGDWNLLGGILEEVHSHSTIVGKIWLTILFIFRMLVLRVAAEDVWDDEQSAFACNTRQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100        110         
pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQ-KEGELRALPAK
       :.:.:::.::::: ::.::::..:::.:.:::.::..:  :  :. :: :...:::   .
CCDS50 CNNICYDDAFPISLIRFWVLQIIFVSSPSLVYMGHALYRLRAFEKDRQRKKSHLRA-QME
               70        80        90       100       110          

     120        130       140          150       160       170     
pF1KB7 DPQVE-RALAAVERQMAKISVAEDGRLR---IRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWR
       .:... .    ..:.. ..   :. :..   ..: :. :::  .: .::::.::. ::. 
CCDS50 NPDLDLEEQQRIDRELRRLE--EQKRIHKVPLKGCLLRTYVLHILTRSVLEVGFMIGQYI
     120       130         140       150       160       170       

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB7 LYGWTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRC
       :::. :.:.. : . :::  ::::::::::::::..::  .. :::.::.::. ::  : 
CCDS50 LYGFQMHPLYKCTQPPCPNAVDCFVSRPTEKTIFMLFMHSIAAISLLLNILEIFHLGIRK
       180       190       200       210       220       230       

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB7 LSRGMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWA---
       . : .  ......   .  .. :.  . .      .  :: :    . :....:. .   
CCDS50 IMRTLYKKSSSEG--IEDETGPPFHLKKYSVAQQCMICSSLP-ERISPLQANNQQQVIRV
       240       250         260       270        280       290    

            300       310       320       330                      
pF1KB7 NLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV                   
       :.   . . .   :  :.  :.::.:. :. .. ...                       
CCDS50 NVPKSKTMWQIPQPRQLEVDPSNGKKDWSEKDQHSGQLHVHSPCPWAGSAGNQHLGQQSD
          300       310       320       330       340       350    

CCDS50 HSSFGLQNTMSQSWLGTTTAPRNCPSFAVGTWEQSQDPEPSGEPLTDLHSHCRDSEGSMR
          360       370       380       390       400       410    

>>CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13                (226 aa)
 initn: 715 init1: 471 opt: 487  Z-score: 487.6  bits: 98.0 E(32554): 7.7e-21
Smith-Waterman score: 734; 47.9% identity (72.3% similar) in 242 aa overlap (3-241:2-224)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
         ::: :. .:  :..::: .:::::::::::::.:: .:.. ::::::.:: ::: :::
CCDS92  MDWGTLQTILGGVNKHSTSIGKIWLTVLFIFRIMILVVAAKEVWGDEQADFVCNTLQPG
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100        110         
pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQ-KEGELRALPAK
       : :::::. ::::::: :.::..:::::.:.   :: :  ::.:. :.  .::...   :
CCDS92 CKNVCYDHYFPISHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAY--RRHEKKRKFIKGEIKS-EFK
      60        70        80        90         100       110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 DPQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY-G
       :      .  .. :          ..::.:.:  ::..:.. . ..::.:.:  . .: :
CCDS92 D------IEEIKTQ----------KVRIEGSLWWTYTSSIFFRVIFEAAFMYVFYVMYDG
              120                 130       140       150       160

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 WTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCR-CLS
       ..:. .  :.  :::  ::::::::::::.: .::..:. : ..::. :: .:: : : .
CCDS92 FSMQRLVKCNAWPCPNTVDCFVSRPTEKTVFTVFMIAVSGICILLNVTELCYLLIRYCSG
              170       180       190       200       210       220

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB7 RGMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTE
       .. .                                                        
CCDS92 KSKKPV                                                      
                                                                   

>>CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1                  (270 aa)
 initn: 740 init1: 477 opt: 477  Z-score: 476.6  bits: 96.2 E(32554): 3.1e-20
Smith-Waterman score: 677; 40.0% identity (64.5% similar) in 290 aa overlap (3-290:2-266)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
         ::  :. ::. :...::. :.:::.:.:.::.:.  .:.: ::::::.::.::: :::
CCDS38  MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPG
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
       :::::::. ::::.:: :.::..::. :.:. . :: :  .::.: :::.:.        
CCDS38 CTNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGD--------
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170          
pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY-GW
                   : ::.    :.  . .:.:  ::. :.. : ..:  :::    :. :.
CCDS38 ------------QCAKLY---DNAGKKHGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGF
                            120       130       140       150      

     180        190       200       210       220       230        
pF1KB7 TMEPVFVCQR-APCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSR
       .:  .  :   :::: .:::...::::: ::  ::. .. . .::.. :: .:.:. . :
CCDS38 NMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLR
        160       170       180       190       200       210      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB7 GMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEE
       :..  . . .   ....:   : .    : :  :  .:  :  : :..:  :        
CCDS38 GLHKDKPRGGCSPSSSASRASTCRCHHKL-VEAGEVDPD-PGNNKLQASAPNLTPI    
        220       230       240        250        260       270    

      300       310       320       330   
pF1KB7 RLASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV

>>CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13               (261 aa)
 initn: 718 init1: 452 opt: 464  Z-score: 464.1  bits: 93.9 E(32554): 1.6e-19
Smith-Waterman score: 732; 45.4% identity (70.3% similar) in 249 aa overlap (3-249:2-232)

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