Result of FASTA (ccds) for pFN21AB3987
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3987, 381 aa
  1>>>pF1KB3987 381 - 381 aa - 381 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9289+/-0.00102; mu= 19.7851+/- 0.062
 mean_var=76.1727+/-14.960, 0's: 0 Z-trim(105.0): 55  B-trim: 0 in 0/47
 Lambda= 0.146952
 statistics sampled from 8156 (8206) to 8156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.252), width:  16
 Scan time:  2.470

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7           ( 381) 2496 538.7 3.2e-153
CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7          ( 322) 1848 401.3 6.3e-112
CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17        ( 377) 1575 343.5 1.9e-94
CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7          ( 305) 1372 300.3 1.5e-81
CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17        ( 282) 1254 275.3 4.7e-74
CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9            ( 359)  999 221.3   1e-57
CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19         ( 359)  978 216.9 2.3e-56
CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9           ( 355)  948 210.5 1.9e-54
CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16         ( 354)  933 207.3 1.7e-53
CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7        ( 354)  932 207.1   2e-53
CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1            ( 354)  916 203.7 2.1e-52
CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16         ( 354)  914 203.3 2.8e-52
CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7           ( 354)  912 202.9 3.7e-52
CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1            ( 354)  902 200.8 1.6e-51
CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22          ( 355)  895 199.3 4.5e-51
CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3           ( 350)  880 196.1   4e-50
CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3           ( 355)  871 194.2 1.5e-49
CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3          ( 318)  813 181.9 7.1e-46
CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3          ( 339)  813 181.9 7.5e-46
CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19         ( 374)  804 180.0   3e-45
CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7          ( 302)  787 176.3 3.1e-44
CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3          ( 303)  743 167.0   2e-41
CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          ( 379)  719 162.0 8.1e-40
CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          ( 380)  716 161.4 1.3e-39
CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18          ( 458)  712 160.6 2.6e-39
CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18          ( 381)  681 153.9 2.2e-37
CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          ( 394)  567 129.8 4.2e-30
CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          ( 395)  567 129.8 4.2e-30
CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          (1037)  567 130.2 8.4e-30
CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18          ( 174)  327 78.6 4.8e-15


>>CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7                (381 aa)
 initn: 2496 init1: 2496 opt: 2496  Z-score: 2864.4  bits: 538.7 E(32554): 3.2e-153
Smith-Waterman score: 2496; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSGVVRTLSRCLLPAEAGGARERRAGSGARDAEREARRRSRDIDALLARERRAVRRLVKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MSGVVRTLSRCLLPAEAGGARERRAGSGARDAEREARRRSRDIDALLARERRAVRRLVKI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 LLLGAGESGKSTFLKQMRIIHGREFDQKALLEFRDTIFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LLLGAGESGKSTFLKQMRIIHGREFDQKALLEFRDTIFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 YSENEKHGMFLMAFENKAGLPVEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YSENEKHGMFLMAFENKAGLPVEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 YFLDNLDRIGQLNYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YFLDNLDRIGQLNYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 CFDGITSILFMVSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CFDGITSILFMVSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LVEKVKTVSIKKHFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCFDRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LVEKVKTVSIKKHFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCFDRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENVR
              310       320       330       340       350       360

              370       380 
pF1KB3 FVFHAVKDTILQENLKDIMLQ
       :::::::::::::::::::::
CCDS53 FVFHAVKDTILQENLKDIMLQ
              370       380 

>>CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7               (322 aa)
 initn: 1848 init1: 1848 opt: 1848  Z-score: 2122.9  bits: 401.3 E(32554): 6.3e-112
Smith-Waterman score: 1848; 99.6% identity (100.0% similar) in 279 aa overlap (103-381:44-322)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB3 FLKQMRIIHGREFDQKALLEFRDTIFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQYSENEKHGMFLM
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MPGSRGSGSTPDGNRKCCRFEHLLIAHPGSRGSRVLVDARDKLGIPWQYSENEKHGMFLM
            20        30        40        50        60        70   

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB3 AFENKAGLPVEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVKYFLDNLDRIGQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AFENKAGLPVEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVKYFLDNLDRIGQL
            80        90       100       110       120       130   

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB3 NYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQCFDGITSILFMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQCFDGITSILFMV
           140       150       160       170       180       190   

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB3 SSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDLLVEKVKTVSIKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDLLVEKVKTVSIKK
           200       210       220       230       240       250   

            320       330       340       350       360       370  
pF1KB3 HFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCFDRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENVRFVFHAVKDTILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCFDRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENVRFVFHAVKDTILQ
           260       270       280       290       300       310   

            380 
pF1KB3 ENLKDIMLQ
       :::::::::
CCDS64 ENLKDIMLQ
           320  

>>CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17             (377 aa)
 initn: 1403 init1: 966 opt: 1575  Z-score: 1809.2  bits: 343.5 E(32554): 1.9e-94
Smith-Waterman score: 1575; 66.7% identity (87.3% similar) in 354 aa overlap (33-381:24-377)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB3 GVVRTLSRCLLPAEAGGARERRAGSGARDAEREARRRSRDIDALLARERRAVRRLVKILL
                                     : : .:.:..::  :.::.  :.:::::::
CCDS11        MADFLPSRSVLSVCFPGCLLTSGEAEQQRKSKEIDKCLSREKTYVKRLVKILL
                      10        20        30        40        50   

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB3 LGAGESGKSTFLKQMRIIHGREFDQKALLEFRDTIFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQYS
       ::::::::::::::::::::..:::.:  ::: ::..:..:: :::::::.:: :::  .
CCDS11 LGAGESGKSTFLKQMRIIHGQDFDQRAREEFRPTIYSNVIKGMRVLVDAREKLHIPWGDN
            60        70        80        90       100       110   

            130       140           150       160       170        
pF1KB3 ENEKHGMFLMAFENKAGLP----VEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGES
        :..::  .:.:...: .     ::  .:  :.::. ::: ::::..:..:: :::::::
CCDS11 SNQQHGDKMMSFDTRAPMAAQGMVETRVFLQYLPAIRALWADSGIQNAYDRRREFQLGES
           120       130       140       150       160       170   

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB3 VKYFLDNLDRIGQLNYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKW
       :::::::::..:. .:.::.:::::::. :::: :.:: ::..::::::::::::.:..:
CCDS11 VKYFLDNLDKLGEPDYIPSQQDILLARRPTKGIHEYDFEIKNVPFKMVDVGGQRSERKRW
           180       190       200       210       220       230   

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB3 FQCFDGITSILFMVSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFFNVSIILFLNKM
       :.:::..:::::.:::::.:::::::: ::::.::.:::::::::..: :::::::::: 
CCDS11 FECFDSVTSILFLVSSSEFDQVLMEDRLTNRLTESLNIFETIVNNRVFSNVSIILFLNKT
           240       250       260       270       280       290   

      300       310       320       330       340        350       
pF1KB3 DLLVEKVKTVSIKKHFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCFDRKRRNRS-KPLFHHFTTAIDTE
       ::: :::. :::: .: .:.:::: :.:::..::.::  :::... :::.:::::::.::
CCDS11 DLLEEKVQIVSIKDYFLEFEGDPHCLRDVQKFLVECFRNKRRDQQQKPLYHHFTTAINTE
           300       310       320       330       340       350   

       360       370       380 
pF1KB3 NVRFVFHAVKDTILQENLKDIMLQ
       :.:.::. ::::::..:::..:::
CCDS11 NIRLVFRDVKDTILHDNLKQLMLQ
           360       370       

>>CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7               (305 aa)
 initn: 1360 init1: 1360 opt: 1372  Z-score: 1577.8  bits: 300.3 E(32554): 1.5e-81
Smith-Waterman score: 1372; 84.8% identity (89.8% similar) in 256 aa overlap (127-381:54-305)

        100       110       120        130       140       150     
pF1KB3 IFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQYSENEKHGM-FLMAFENKAGLPVEPATFQLYVPALS
                                     ::  : .:. . ...      . : :  : 
CCDS64 GWEAALSAPPPFCTAWVERTGLVHFLREGGHGACFPLALLHPGSVVSFQMIYPLIVLPLC
            30        40        50        60        70        80   

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB3 ALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVKYFLDNLDRIGQLNYFPSKQDILLARKATKGIVEHD
       : :. . ::...     .  ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ASWHWGLIRKGIV----LFWGESVKYFLDNLDRIGQLNYFPSKQDILLARKATKGIVEHD
            90           100       110       120       130         

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB3 FVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQCFDGITSILFMVSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQCFDGITSILFMVSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMN
     140       150       160       170       180       190         

         280       290       300       310       320       330     
pF1KB3 IFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDLLVEKVKTVSIKKHFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDLLVEKVKTVSIKKHFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCF
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         340       350       360       370       380 
pF1KB3 DRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENVRFVFHAVKDTILQENLKDIMLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENVRFVFHAVKDTILQENLKDIMLQ
     260       270       280       290       300     

>>CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17             (282 aa)
 initn: 1082 init1: 966 opt: 1254  Z-score: 1443.0  bits: 275.3 E(32554): 4.7e-74
Smith-Waterman score: 1254; 66.5% identity (87.5% similar) in 281 aa overlap (106-381:2-282)

          80        90       100       110       120       130     
pF1KB3 QMRIIHGREFDQKALLEFRDTIFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQYSENEKHGMFLMAFE
                                     :::::::.:: :::  . :..::  .:.:.
CCDS62                              MRVLVDAREKLHIPWGDNSNQQHGDKMMSFD
                                            10        20        30 

         140           150       160       170       180       190 
pF1KB3 NKAGLP----VEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVKYFLDNLDRIGQ
       ..: .     ::  .:  :.::. ::: ::::..:..:: ::::::::::::::::..:.
CCDS62 TRAPMAAQGMVETRVFLQYLPAIRALWADSGIQNAYDRRREFQLGESVKYFLDNLDKLGE
              40        50        60        70        80        90 

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB3 LNYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQCFDGITSILFM
        .:.::.:::::::. :::: :.:: ::..::::::::::::.:..::.:::..:::::.
CCDS62 PDYIPSQQDILLARRPTKGIHEYDFEIKNVPFKMVDVGGQRSERKRWFECFDSVTSILFL
             100       110       120       130       140       150 

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pF1KB3 VSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDLLVEKVKTVSIK
       :::::.:::::::: ::::.::.:::::::::..: :::::::::: ::: :::. ::::
CCDS62 VSSSEFDQVLMEDRLTNRLTESLNIFETIVNNRVFSNVSIILFLNKTDLLEEKVQIVSIK
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pF1KB3 KHFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCFDRKRRNRS-KPLFHHFTTAIDTENVRFVFHAVKDTI
        .: .:.:::: :.:::..::.::  :::... :::.:::::::.:::.:.::. :::::
CCDS62 DYFLEFEGDPHCLRDVQKFLVECFRNKRRDQQQKPLYHHFTTAINTENIRLVFRDVKDTI
             220       230       240       250       260       270 

              380 
pF1KB3 LQENLKDIMLQ
       :..:::..:::
CCDS62 LHDNLKQLMLQ
             280  

>>CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9                 (359 aa)
 initn: 1012 init1: 750 opt: 999  Z-score: 1149.5  bits: 221.3 E(32554): 1e-57
Smith-Waterman score: 999; 45.0% identity (73.9% similar) in 349 aa overlap (34-380:16-358)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KB3 VVRTLSRCLLPAEAGGARERRAGSGARDAEREARRRSRDIDALLARERRAVRRLVKILLL
                                     .:::: . .:.  : :..: .:: .:.:::
CCDS66                MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLL
                              10        20        30        40     

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pF1KB3 GAGESGKSTFLKQMRIIHGREFDQKALLEFRDTIFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQYSE
       :.::::::::.::::::::  ....    :   ...::. . .... : : : ::..: .
CCDS66 GTGESGKSTFIKQMRIIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEH
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pF1KB3 NEKHGMFLMAFE-NKAGLPVEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVKYF
       :. :....   . .:..   .:     :: :...:: : ::.: ..:: :.::..:.::.
CCDS66 NKAHAQLVREVDVEKVSAFENP-----YVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYY
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pF1KB3 LDNLDRIGQLNYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQCF
       :..:::...  :.:..::.: .:  : ::.:. : .... :.:::::::::.:.::..::
CCDS66 LNDLDRVADPAYLPTQQDVLRVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCF
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pF1KB3 DGITSILFMVSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDLLV
       ...:::.:.:. :::::::.:.   ::. ::  .:.::..   : : :.:::::: ::: 
CCDS66 ENVTSIMFLVALSEYDQVLVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLE
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pF1KB3 EKVKTVSIKKHFPDFRGDPHRLEDVQR-YLVQCFDRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENVRF
       ::.    .  .::.. : :.:  .. : .... :     . .: .. ::: : ::::.::
CCDS66 EKIMYSHLVDYFPEYDG-PQRDAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRF
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             370       380 
pF1KB3 VFHAVKDTILQENLKDIMLQ
       :: :::::::: :::.  : 
CCDS66 VFAAVKDTILQLNLKEYNLV
     340       350         

>>CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19              (359 aa)
 initn: 944 init1: 752 opt: 978  Z-score: 1125.4  bits: 216.9 E(32554): 2.3e-56
Smith-Waterman score: 978; 43.9% identity (72.9% similar) in 351 aa overlap (31-380:13-358)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSGVVRTLSRCLLPAEAGGARERRAGSGARDAEREARRRSRDIDALLARERRAVRRLVKI
                                     :  .:..: . .:.  : :..: .:: .:.
CCDS12                   MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKL
                                 10        20        30        40  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 LLLGAGESGKSTFLKQMRIIHGREFDQKALLEFRDTIFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQ
       ::::.::::::::.::::::::  ....    :   ...::. . .... : . : : ..
CCDS12 LLLGTGESGKSTFIKQMRIIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILYK
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pF1KB3 YSENEKHGMFLMAFENKAGLPVEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVK
       : .:. .....   . .     :    . :: :...::.: ::.: ..:: :.::..:.:
CCDS12 YEQNKANALLIREVDVEKVTTFE----HQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAK
            110       120           130       140       150        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 YFLDNLDRIGQLNYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQ
       :.: ..:::. :.:.:..::.: .:  : ::.:. : ...: :.:::::::::.:.::..
CCDS12 YYLTDVDRIATLGYLPTQQDVLRVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIH
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pF1KB3 CFDGITSILFMVSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDL
       ::...:::.:.:. :::::::.:.   ::. ::  .:.::..   : : :.:::::: ::
CCDS12 CFENVTSIMFLVALSEYDQVLVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDL
      220       230       240       250       260       270        

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pF1KB3 LVEKVKTVSIKKHFPDFRGDPHRLEDVQR-YLVQCFDRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENV
       : .:.    .  .::.: : :.:  .. : .... :     . .: .. ::: : ::::.
CCDS12 LEDKILYSHLVDYFPEFDG-PQRDAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENI
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     360       370       380 
pF1KB3 RFVFHAVKDTILQENLKDIMLQ
       :::: :::::::: :::.  : 
CCDS12 RFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
       340       350         

>>CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9                (355 aa)
 initn: 921 init1: 725 opt: 948  Z-score: 1091.1  bits: 210.5 E(32554): 1.9e-54
Smith-Waterman score: 948; 41.8% identity (73.4% similar) in 349 aa overlap (33-380:11-354)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB3 GVVRTLSRCLLPAEAGGARERRAGSGARDAEREARRRSRDIDALLARERRAVRRLVKILL
                                     :.:..: : .:.  : :... .:: .:.::
CCDS66                     MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLL
                                   10        20        30        40

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pF1KB3 LGAGESGKSTFLKQMRIIHGREFDQKALLEFRDTIFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQYS
       ::.::::::::.::::::::  ....    :   ...::. . .... : : : : .   
CCDS66 LGTGESGKSTFIKQMRIIHGSGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCE
               50        60        70        80        90       100

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pF1KB3 ENEKHGMFLMAFE-NKAGLPVEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVKY
       .:.......   : .:...       .  : :.. ::.: ::.: ..:: :.::..:.::
CCDS66 QNKENAQIIREVEVDKVSM-----LSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKY
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             190       200       210       220       230       240 
pF1KB3 FLDNLDRIGQLNYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQC
       .: ..:::.  .. :..::.: .:  : ::.:. : ...: :.:::::::::.:.::..:
CCDS66 YLTDIDRIATPSFVPTQQDVLRVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHC
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pF1KB3 FDGITSILFMVSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFFNVSIILFLNKMDLL
       :...:::.:.:. ::::::: :    ::. ::  .:.::..   :.: :.:::::: :::
CCDS66 FESVTSIIFLVALSEYDQVLAECDNENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLL
         220       230       240       250       260       270     

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pF1KB3 VEKVKTVSIKKHFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCFDRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENVRF
        ::.    . ..::.. :  . .. .. .... .. .  .. : .. ::: : ::.:.::
CCDS66 EEKIMYSHLISYFPEYTGPKQDVRAARDFILKLYQDQNPDKEKVIYSHFTCATDTDNIRF
         280       290       300       310       320       330     

             370       380 
pF1KB3 VFHAVKDTILQENLKDIMLQ
       :: :::::::: ::... : 
CCDS66 VFAAVKDTILQLNLREFNLV
         340       350     

>>CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16              (354 aa)
 initn: 913 init1: 603 opt: 933  Z-score: 1073.9  bits: 207.3 E(32554): 1.7e-53
Smith-Waterman score: 933; 44.1% identity (73.0% similar) in 345 aa overlap (33-376:9-349)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB3 GVVRTLSRCLLPAEAGGARERRAGSGARDAEREARRRSRDIDALLARERRAVRRLVKILL
                                     :: : .::. :.  : ..  .. . ::.::
CCDS10                       MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLL
                                     10        20        30        

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB3 LGAGESGKSTFLKQMRIIHGREFDQKALLEFRDTIFDNILKGSRVLVDARDKLGIPWQYS
       ::::::::::..:::.:::   :. . . ... ....: ...  ..: : : :::  .:.
CCDS10 LGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGFSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGI--EYG
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pF1KB3 ENEKHGMFLMAFENKAGLP-VEPATFQLYVPALSALWRDSGIREAFSRRSEFQLGESVKY
       ..:...   :. .  . .  .:: . .: . :.  :: ::::.: :.:  :.::..:.::
CCDS10 DKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPFSAEL-LSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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