Result of FASTA (omim) for
pFN21AB3336
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3336, 551 aa
1>>>pF1KB3336 551 - 551 aa - 551 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3616+/-0.000373; mu= 1.0385+/- 0.023
mean_var=255.5794+/-54.461, 0's: 0 Z-trim(121.6): 38 B-trim: 661 in 2/54
Lambda= 0.080225
statistics sampled from 38401 (38439) to 38401 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.451), width: 16
Scan time: 11.950
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001333151 (OMIM: 146710) interleukin-2 receptor ( 551) 3866 460.7 5.4e-129
NP_001333152 (OMIM: 146710) interleukin-2 receptor ( 551) 3866 460.7 5.4e-129
NP_000869 (OMIM: 146710) interleukin-2 receptor su ( 551) 3866 460.7 5.4e-129
XP_016878746 (OMIM: 147050,605383,615207) PREDICTE ( 538) 324 50.7 1.4e-05
NP_851564 (OMIM: 147050,605383,615207) interleukin ( 538) 324 50.7 1.4e-05
NP_068570 (OMIM: 147050,605383,615207) interleukin ( 538) 324 50.7 1.4e-05
XP_011544159 (OMIM: 147050,605383,615207) PREDICTE ( 560) 324 50.7 1.4e-05
NP_851565 (OMIM: 147050,605383,615207) interleukin ( 560) 324 50.7 1.4e-05
XP_011544160 (OMIM: 147050,605383,615207) PREDICTE ( 414) 272 44.6 0.00072
>>NP_001333151 (OMIM: 146710) interleukin-2 receptor sub (551 aa)
initn: 3866 init1: 3866 opt: 3866 Z-score: 2436.8 bits: 460.7 E(85289): 5.4e-129
Smith-Waterman score: 3866; 100.0% identity (100.0% similar) in 551 aa overlap (1-551:1-551)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCVWSQDGALQDTSCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCVWSQDGALQDTSCQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VHAWPDRRRWNQTCELLPVSQASWACNLILGAPDSQKLTTVDIVTLRVLCREGVRWRVMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHAWPDRRRWNQTCELLPVSQASWACNLILGAPDSQKLTTVDIVTLRVLCREGVRWRVMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQASHYFERHLEFEARTLSPGHTWEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQASHYFERHLEFEARTLSPGHTWEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 APLLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFTTWSPWSQPLAFRTKPAALGKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APLLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFTTWSPWSQPLAFRTKPAALGKDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 IPWLGHLLVGLSGAFGFIILVYLLINCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPWLGHLLVGLSGAFGFIILVYLLINCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLLQQDKVPEPASLSSNHSLTSCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLLQQDKVPEPASLSSNHSLTSCFT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FPSRDDLLLFSPSLLGGPSPPSTAPGGSGAGEERMPPSLQERVPRDWDPQPLGPPTPGVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPSRDDLLLFSPSLLGGPSPPSTAPGGSGAGEERMPPSLQERVPRDWDPQPLGPPTPGVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DLVDFQPPPELVLREAGEEVPDAGPREGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLVDFQPPPELVLREAGEEVPDAGPREGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQ
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB3 ELQGQDPTHLV
:::::::::::
NP_001 ELQGQDPTHLV
550
>>NP_001333152 (OMIM: 146710) interleukin-2 receptor sub (551 aa)
initn: 3866 init1: 3866 opt: 3866 Z-score: 2436.8 bits: 460.7 E(85289): 5.4e-129
Smith-Waterman score: 3866; 100.0% identity (100.0% similar) in 551 aa overlap (1-551:1-551)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCVWSQDGALQDTSCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCVWSQDGALQDTSCQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VHAWPDRRRWNQTCELLPVSQASWACNLILGAPDSQKLTTVDIVTLRVLCREGVRWRVMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHAWPDRRRWNQTCELLPVSQASWACNLILGAPDSQKLTTVDIVTLRVLCREGVRWRVMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQASHYFERHLEFEARTLSPGHTWEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQASHYFERHLEFEARTLSPGHTWEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 APLLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFTTWSPWSQPLAFRTKPAALGKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APLLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFTTWSPWSQPLAFRTKPAALGKDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 IPWLGHLLVGLSGAFGFIILVYLLINCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPWLGHLLVGLSGAFGFIILVYLLINCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLLQQDKVPEPASLSSNHSLTSCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLLQQDKVPEPASLSSNHSLTSCFT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FPSRDDLLLFSPSLLGGPSPPSTAPGGSGAGEERMPPSLQERVPRDWDPQPLGPPTPGVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPSRDDLLLFSPSLLGGPSPPSTAPGGSGAGEERMPPSLQERVPRDWDPQPLGPPTPGVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DLVDFQPPPELVLREAGEEVPDAGPREGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLVDFQPPPELVLREAGEEVPDAGPREGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQ
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB3 ELQGQDPTHLV
:::::::::::
NP_001 ELQGQDPTHLV
550
>>NP_000869 (OMIM: 146710) interleukin-2 receptor subuni (551 aa)
initn: 3866 init1: 3866 opt: 3866 Z-score: 2436.8 bits: 460.7 E(85289): 5.4e-129
Smith-Waterman score: 3866; 100.0% identity (100.0% similar) in 551 aa overlap (1-551:1-551)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCVWSQDGALQDTSCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCVWSQDGALQDTSCQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VHAWPDRRRWNQTCELLPVSQASWACNLILGAPDSQKLTTVDIVTLRVLCREGVRWRVMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VHAWPDRRRWNQTCELLPVSQASWACNLILGAPDSQKLTTVDIVTLRVLCREGVRWRVMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQASHYFERHLEFEARTLSPGHTWEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQASHYFERHLEFEARTLSPGHTWEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 APLLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFTTWSPWSQPLAFRTKPAALGKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 APLLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFTTWSPWSQPLAFRTKPAALGKDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 IPWLGHLLVGLSGAFGFIILVYLLINCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IPWLGHLLVGLSGAFGFIILVYLLINCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLLQQDKVPEPASLSSNHSLTSCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLLQQDKVPEPASLSSNHSLTSCFT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FPSRDDLLLFSPSLLGGPSPPSTAPGGSGAGEERMPPSLQERVPRDWDPQPLGPPTPGVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FPSRDDLLLFSPSLLGGPSPPSTAPGGSGAGEERMPPSLQERVPRDWDPQPLGPPTPGVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DLVDFQPPPELVLREAGEEVPDAGPREGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DLVDFQPPPELVLREAGEEVPDAGPREGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQ
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB3 ELQGQDPTHLV
:::::::::::
NP_000 ELQGQDPTHLV
550
>>XP_016878746 (OMIM: 147050,605383,615207) PREDICTED: i (538 aa)
initn: 245 init1: 120 opt: 324 Z-score: 221.4 bits: 50.7 E(85289): 1.4e-05
Smith-Waterman score: 357; 25.1% identity (50.6% similar) in 514 aa overlap (8-478:5-471)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCV---WSQDGALQDT
: :::.::: .: : ...:. . .. :. :. :. .
XP_016 MPRGWAAPLLLLLL--QGGW------GCPDLVCYTDYLQTVICILEMWN----LHPS
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB3 SCQVHAWPDR----RRWNQTCELL----PVSQASWACNLILGAPDSQKLTTVDIVTLRVL
. . .: :. . .: : ...:...:.. : .. . :: .. .
XP_016 TLTL-TWQDQYEELKDEATSCSLHRSAHNATHATYTCHM-----DVFHFMADDIFSVNIT
50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 CREGVRWRVMAIQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQ---ASHYFERHLE
. : . .: :... :... :. . . ::::. . : .... .:.
XP_016 DQSGN--YSQECGSFLLAESIKPAPPFNVTVTF--SGQYNISWRSDYEDPAFYMLKGKLQ
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 FEARTLSPGHTWEEAP---LLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFT--TWS
.: . . : : .: :... ... . . :..::.:::. :. : :::
XP_016 YELQYRNRGDPWAVSPRRKLISVDSRSVSLLPLEFRKDSSYELQVRAGPMPGSSYQGTWS
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KB3 PWSQPLAFRTKPAALGKDTIPWLGHLLVGLSGAFGFIILVYLLINCRNTGP-W--LKKVL
::.:. :.:. : . : :::. : .. :: . : .: : : ::.
XP_016 EWSDPVIFQTQSEELKEG---WNPHLLLLLLLVIVFIPAFWSL----KTHPLWRLWKKIW
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KB3 KCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDVQKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEI-SPLEVL---------
.:.: .:: : . .:: .::...:: .::. : .::. : :::
XP_016 --AVPSPERFFMPLYKGCSGDFKKWVGAPFTGSSLELGPWSPEVPSTLEVYSCHPPRSPA
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370
pF1KB3 ERDKVTQL-----LLQQDKVPEPA----SLSSNHSLTSCFTNQGYFFFHLPDALEIEACQ
.: ..:.: :...: ::.:. . .:. : : .. : . . :.. . .
XP_016 KRLQLTELQEPAELVESDGVPKPSFWPTAQNSGGSAYSEERDRPYGLVSI-DTVTVLDAE
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCTFPSRD-DLLLFSPSLLGGP
:. : : :: : :. . :.: : .: : : ..: . ...
XP_016 GPCTW-PCSCEDD-----GYPALDLDAGLEPSPGLED-----PLLDAGTTVLSCGCVSAG
390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 SPPSTAPGGSGAGEERMPPSLQERVPRDW-DPQPLGPPTPGVPDLVDFQPPPELVLREAG
:: .: :: .:. : : . .:: : : .::
XP_016 SPGLGGPLGSLL--DRLKPPLAD--GEDWAGGLPWGGRSPGGVSESEAGSPLAGLDMDTF
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 EEVPDAGPREGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQELQGQDPTHLV
XP_016 DSGFVGSDCSSPVECDFTSPGDEGPPRSYLRQWVVIPPPLSSPGPQAS
500 510 520 530
>>NP_851564 (OMIM: 147050,605383,615207) interleukin-21 (538 aa)
initn: 245 init1: 120 opt: 324 Z-score: 221.4 bits: 50.7 E(85289): 1.4e-05
Smith-Waterman score: 357; 25.1% identity (50.6% similar) in 514 aa overlap (8-478:5-471)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCV---WSQDGALQDT
: :::.::: .: : ...:. . .. :. :. :. .
NP_851 MPRGWAAPLLLLLL--QGGW------GCPDLVCYTDYLQTVICILEMWN----LHPS
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB3 SCQVHAWPDR----RRWNQTCELL----PVSQASWACNLILGAPDSQKLTTVDIVTLRVL
. . .: :. . .: : ...:...:.. : .. . :: .. .
NP_851 TLTL-TWQDQYEELKDEATSCSLHRSAHNATHATYTCHM-----DVFHFMADDIFSVNIT
50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 CREGVRWRVMAIQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQ---ASHYFERHLE
. : . .: :... :... :. . . ::::. . : .... .:.
NP_851 DQSGN--YSQECGSFLLAESIKPAPPFNVTVTF--SGQYNISWRSDYEDPAFYMLKGKLQ
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 FEARTLSPGHTWEEAP---LLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFT--TWS
.: . . : : .: :... ... . . :..::.:::. :. : :::
NP_851 YELQYRNRGDPWAVSPRRKLISVDSRSVSLLPLEFRKDSSYELQVRAGPMPGSSYQGTWS
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KB3 PWSQPLAFRTKPAALGKDTIPWLGHLLVGLSGAFGFIILVYLLINCRNTGP-W--LKKVL
::.:. :.:. : . : :::. : .. :: . : .: : : ::.
NP_851 EWSDPVIFQTQSEELKEG---WNPHLLLLLLLVIVFIPAFWSL----KTHPLWRLWKKIW
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KB3 KCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDVQKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEI-SPLEVL---------
.:.: .:: : . .:: .::...:: .::. : .::. : :::
NP_851 --AVPSPERFFMPLYKGCSGDFKKWVGAPFTGSSLELGPWSPEVPSTLEVYSCHPPRSPA
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370
pF1KB3 ERDKVTQL-----LLQQDKVPEPA----SLSSNHSLTSCFTNQGYFFFHLPDALEIEACQ
.: ..:.: :...: ::.:. . .:. : : .. : . . :.. . .
NP_851 KRLQLTELQEPAELVESDGVPKPSFWPTAQNSGGSAYSEERDRPYGLVSI-DTVTVLDAE
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCTFPSRD-DLLLFSPSLLGGP
:. : : :: : :. . :.: : .: : : ..: . ...
NP_851 GPCTW-PCSCEDD-----GYPALDLDAGLEPSPGLED-----PLLDAGTTVLSCGCVSAG
390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 SPPSTAPGGSGAGEERMPPSLQERVPRDW-DPQPLGPPTPGVPDLVDFQPPPELVLREAG
:: .: :: .:. : : . .:: : : .::
NP_851 SPGLGGPLGSLL--DRLKPPLAD--GEDWAGGLPWGGRSPGGVSESEAGSPLAGLDMDTF
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 EEVPDAGPREGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQELQGQDPTHLV
NP_851 DSGFVGSDCSSPVECDFTSPGDEGPPRSYLRQWVVIPPPLSSPGPQAS
500 510 520 530
>>NP_068570 (OMIM: 147050,605383,615207) interleukin-21 (538 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCV---WSQDGALQDT
: :::.::: .: : ...:. . .. :. :. :. .
NP_068 MPRGWAAPLLLLLL--QGGW------GCPDLVCYTDYLQTVICILEMWN----LHPS
10 20 30 40
60 70 80 90 100
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. . .: :. . .: : ...:...:.. : .. . :: .. .
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pF1KB3 CREGVRWRVMAIQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQ---ASHYFERHLE
. : . .: :... :... :. . . ::::. . : .... .:.
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100 110 120 130 140 150
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.: . . : : .: :... ... . . :..::.:::. :. : :::
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::.:. :.:. : . : :::. : .. :: . : .: : : ::.
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.:.: .:: : . .:: .::...:: .::. : .::. : :::
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.: ..:.: :...: ::.:. . .:. : : .. : . . :.. . .
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:. : : :: : :. . :.: : .: : : ..: . ...
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:: .: :: .:. : : . .:: : : .::
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>>XP_011544159 (OMIM: 147050,605383,615207) PREDICTED: i (560 aa)
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10 20 30 40
pF1KB3 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSR
: :::.::: .: : ...:. .
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.. :. :. :. .. . .: :. . .: : ...:...:..
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pF1KB3 GAPDSQKLTTVDIVTLRVLCREGVRWRVMAIQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNI
: .. . :: .. . . : . .: :... :... :. . . ::
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160 170 180 190 200
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::. . : .... .:..: . . : : .: :... ... . . :..:
XP_011 SWRSDYEDPAFYMLKGKLQYELQYRNRGDPWAVSPRRKLISVDSRSVSLLPLEFRKDSSY
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pF1KB3 EFQVRVKPLQGEFT--TWSPWSQPLAFRTKPAALGKDTIPWLGHLLVGLSGAFGFIILVY
:.:::. :. : ::: ::.:. :.:. : . : :::. : .. :: .
XP_011 ELQVRAGPMPGSSYQGTWSEWSDPVIFQTQSEELKEG---WNPHLLLLLLLVIVFIPAFW
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270 280 290 300 310
pF1KB3 LLINCRNTGP-W--LKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDVQKWLSSPFPSSSFSPGGLA
: .: : : ::. .:.: .:: : . .:: .::...:: .::. : .
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pF1KB3 PEI-SPLEVL---------ERDKVTQL-----LLQQDKVPEPA----SLSSNHSLTSCFT
::. : ::: .: ..:.: :...: ::.:. . .:. : :
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370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCT
.. : . . :.. . . :. : : :: : :. . :.: : .:
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: : ..: . ... :: .: :: .:. : : . .:: : : .::
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>>NP_851565 (OMIM: 147050,605383,615207) interleukin-21 (560 aa)
initn: 245 init1: 120 opt: 324 Z-score: 221.2 bits: 50.7 E(85289): 1.4e-05
Smith-Waterman score: 357; 25.1% identity (50.6% similar) in 514 aa overlap (8-478:27-493)
10 20 30 40
pF1KB3 MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSR
: :::.::: .: : ...:. .
NP_851 MSCRCIFLMKHGERVGWPVGVSMPRGWAAPLLLLLL--QGGW------GCPDLVCYTDYL
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pF1KB3 ANISCV---WSQDGALQDTSCQVHAWPDR----RRWNQTCELL----PVSQASWACNLIL
.. :. :. :. .. . .: :. . .: : ...:...:..
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pF1KB3 GAPDSQKLTTVDIVTLRVLCREGVRWRVMAIQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNI
: .. . :: .. . . : . .: :... :... :. . . ::
NP_851 ---DVFHFMADDIFSVNITDQSGN--YSQECGSFLLAESIKPAPPFNVTVTF--SGQYNI
110 120 130 140 150
160 170 180 190 200
pF1KB3 SWEISQ---ASHYFERHLEFEARTLSPGHTWEEAP---LLTLKQKQEWICLETLTPDTQY
::. . : .... .:..: . . : : .: :... ... . . :..:
NP_851 SWRSDYEDPAFYMLKGKLQYELQYRNRGDPWAVSPRRKLISVDSRSVSLLPLEFRKDSSY
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pF1KB3 EFQVRVKPLQGEFT--TWSPWSQPLAFRTKPAALGKDTIPWLGHLLVGLSGAFGFIILVY
:.:::. :. : ::: ::.:. :.:. : . : :::. : .. :: .
NP_851 ELQVRAGPMPGSSYQGTWSEWSDPVIFQTQSEELKEG---WNPHLLLLLLLVIVFIPAFW
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: .: : : ::. .:.: .:: : . .:: .::...:: .::. : .
NP_851 SL----KTHPLWRLWKKIW--AVPSPERFFMPLYKGCSGDFKKWVGAPFTGSSLELGPWS
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pF1KB3 PEI-SPLEVL---------ERDKVTQL-----LLQQDKVPEPA----SLSSNHSLTSCFT
::. : ::: .: ..:.: :...: ::.:. . .:. : :
NP_851 PEVPSTLEVYSCHPPRSPAKRLQLTELQEPAELVESDGVPKPSFWPTAQNSGGSAYSEER
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pF1KB3 NQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCT
.. : . . :.. . . :. : : :: : :. . :.: : .:
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: : ..: . ... :: .: :: .:. : : . .:: : : .::
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:: . . . : :... . .: .
XP_011 MPRMPPTPATWMYSTSWPTTFSVSTSQTSLATTPRSVA-AFSWLR
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pF1KB3 A-P---LLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFT--TWSPWSQPLAFRTKPA
: : :... ... . . :..::.:::. :. : ::: ::.:. :.:.
XP_011 ASPRRKLISVDSRSVSLLPLEFRKDSSYELQVRAGPMPGSSYQGTWSEWSDPVIFQTQSE
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: . : :::. : .. :: . : .: : : ::. .:.: .::
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: . .:: .::...:: .::. : .::. : ::: .: ..:.:
XP_011 LYKGCSGDFKKWVGAPFTGSSLELGPWSPEVPSTLEVYSCHPPRSPAKRLQLTELQEPAE
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: :. . :.: : .: : : ..: . ... :: .: ::
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XP_011 -DRLKPPLAD--GEDWAGGLPWGGRSPGGVSESEAGSPLAGLDMDTFDSGFVGSDCSSPV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]