Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0868
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0868, 1331 aa
1>>>pF1KA0868 1331 - 1331 aa - 1331 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0378+/-0.00137; mu= 19.5988+/- 0.082
mean_var=104.7374+/-20.134, 0's: 0 Z-trim(103.1): 115 B-trim: 10 in 1/49
Lambda= 0.125321
statistics sampled from 7139 (7261) to 7139 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 5.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7 (1331) 9171 1670.5 0
CCDS46401.1 CNTNAP5 gene_id:129684|Hs108|chr2 (1306) 4421 811.7 0
CCDS73915.1 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16 (1308) 4253 781.3 0
CCDS6616.1 CNTNAP3 gene_id:79937|Hs108|chr9 (1288) 4107 754.9 3.2e-217
CCDS75836.1 CNTNAP3B gene_id:728577|Hs108|chr9 (1288) 4078 749.6 1.2e-215
CCDS11436.1 CNTNAP1 gene_id:8506|Hs108|chr17 (1384) 3322 613.0 1.8e-174
CCDS10924.2 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16 (1235) 2988 552.6 2.5e-156
CCDS82015.1 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16 (1260) 2988 552.6 2.5e-156
CCDS81831.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1571) 540 110.0 5.1e-23
CCDS82450.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1496) 519 106.2 6.8e-22
CCDS82449.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1499) 519 106.2 6.8e-22
CCDS9870.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1061) 382 81.3 1.5e-14
CCDS54360.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1477) 376 80.4 4.1e-14
CCDS46282.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1547) 354 76.4 6.7e-13
CCDS82451.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1507) 353 76.2 7.4e-13
CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 343) 335 72.4 2.3e-12
CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 387) 335 72.5 2.5e-12
CCDS56363.1 EGFLAM gene_id:133584|Hs108|chr5 (1017) 339 73.6 3.2e-12
CCDS31597.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (1642) 326 71.4 2.3e-11
CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1 (2224) 317 69.9 9e-11
>>CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7 (1331 aa)
initn: 9171 init1: 9171 opt: 9171 Z-score: 8961.3 bits: 1670.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9171; 100.0% identity (100.0% similar) in 1331 aa overlap (1-1331:1-1331)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQAAPRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSP
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CCDS58 MQAAPRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GYAKINKRGGAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GYAKINKRGGAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GRNWKPYHQDGNIWAFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GRNWKPYHQDGNIWAFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 CSYWADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CSYWADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VGNLSFSCVEPYTVPVFFNATSYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VGNLSFSCVEPYTVPVFFNATSYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 NVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNLYEVAQRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNLYEVAQRK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSCE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 AYKHLGQTSNYYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYNPEKYSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AYKHLGQTSNYYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYNPEKYSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 TQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEKHYYWGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEKHYYWGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SGPGIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGDTDRQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGPGIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGDTDRQGS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EAKLSVGPLRCQGDRNYWNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWGVFLENM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EAKLSVGPLRCQGDRNYWNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWGVFLENM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GKEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQASLQVDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GKEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQASLQVDR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LPQQIRKAPTEGHTRLELYSQLFVGGAGGQQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERAKVTSGFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPQQIRKAPTEGHTRLELYSQLFVGGAGGQQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERAKVTSGFI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SGCSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGMWLRYNFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGCSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGMWLRYNFQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 APATNARDSSSRVDNAPDQQNSHPDLAQEEIRFSFSTTKAPCILLYISSFTTDFLAVLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 APATNARDSSSRVDNAPDQQNSHPDLAQEEIRFSFSTTKAPCILLYISSFTTDFLAVLVK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 PTGSLQIRYNLGGTREPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKLDHYPSVSYHLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PTGSLQIRYNLGGTREPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKLDHYPSVSYHLPS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 SSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIAPLKAALRQTNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIAPLKAALRQTNAS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 AHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPGQGQAIRNGVNRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPGQGQAIRNGVNRN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 SAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESADAAIMNNDPNFTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESADAAIMNNDPNFTE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330
pF1KA0 TIDESKKEWLI
:::::::::::
CCDS58 TIDESKKEWLI
1330
>>CCDS46401.1 CNTNAP5 gene_id:129684|Hs108|chr2 (1306 aa)
initn: 3956 init1: 2077 opt: 4421 Z-score: 4320.1 bits: 811.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4586; 50.8% identity (78.2% similar) in 1314 aa overlap (30-1331:25-1306)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQAAPRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSP
.:. .::.::.: : .::::::...:..::
CCDS46 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GYAKINKRGGAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDT
:..: : :.:::::.::. ::::.:.::: .:.:.::::::.::::::.: ...:::
CCDS46 --AQLNWRVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GRNWKPYHQDGNIWAFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYG
::::: :.:. .::.: ::.:.:.::.:.: : . ::.::.:::.:: :.::.:.::::
CCDS46 GRNWKQYKQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 CSYWADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLEL
::: .:: .:::. : ::: .: :.::::::.:.::. ...::..:::::.::.:::::
CCDS46 CSYKSDVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLEL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFR
.:..:.: ::::... . :. ::::::.:::::.::: :...:.:.:. ::::
CCDS46 QKGRLALHLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
:.:: : ::.:::..::::: :::.. .:::.::.:.. :::::: :::.:.: . .
CCDS46 TKGETDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KA0 VGNLSFSCVEPYTVPV-FFNAT-SYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADN
::..::: :: ::. : :.. ::: .:: . : .:::::::::: .:::. ......
CCDS46 -GNVTFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LGNVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQ--IDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDG
:.. ..: . :. . .. ::.. .: .::.:::: :: : . :..: ::.:
CCDS46 SGTLLLSL---EGGI-LRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDD
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 DEASAVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQP--SFQGCMQLIQVDDQLVNLY
. : . .. .:. .:..:.::: .....:. :.: .:::::.:: .:.: .:
CCDS46 EAAPPAPDSTWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQ--CLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLI
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EVAQRKPGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSI
: : . :.:... ::.:.: :::.::.:::::.:::.: .: :.:..:.:.::::::::
CCDS46 SVQQGSLGNFSDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSI
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 YEPSCEAYKHLGQTSNYYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYN
:: :::.:.: :.:.....:: :::::::::.::::.::::.:: :.:. : : : :
CCDS46 YEQSCEVYRHQGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGAN
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 PEKYSVTQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEK
::: . : :..::.:. :. :..:.::: :.: :. :::::::::.:.:::.:..::.
CCDS46 PEKPYAMALDYGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNER
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 HYYWGGSGPGIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGD
: ::::: ::.:.: ::....: : ...:::::: .: .:.::::.::::::.:.:. :
CCDS46 HPYWGGSPPGVQQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITD
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 TDRQGSEAKLSVGPLRCQGDRNYWNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWG
:::..::: .::::: ::: .:::.:: . .::::: ::..: ::::::.::: . :
CCDS46 TDRSNSEAAWRIGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSG
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 VFLENMGKEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQA
:::::.: .:::.::..: .:..:..::::::::.::.::. :::.::: : ::::.:..
CCDS46 VFLENLGIKDFIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKET
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 SLQVDRLPQQIRKAPTEGHTRLELYSQLFVGGAGG-QQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERA
::::: ::.. :.. ::: ::.: :::::::... :.:::::::::..:: .::::::
CCDS46 SLQVDNLPRSTRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERA
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 KVTSGFISGCSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGM
::::: :: :::.:::. :.:::::.:...:: :::.:. :.: ::.:.:.: :: :
CCDS46 KVTSGVRPGCPGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGT
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 WLRYNFQAP---ATNARDSSSRV--DNAPDQQNSHPDLAQEEIRFSFSTTKAPCILLYIS
. : :: : . : ::: . :.::...: : .:: ::.:: .::.:.
CCDS46 SVTYMFQEPYPVTKNISLSSSAIYTDSAPSKEN---------IALSFVTTQAPSLLLFIN
1010 1020 1030 1040 1050
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 SFTTDFLAVLVKPTGSLQIRYNLGGTREPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKL
: . ::..::. .::::.::.:. .: . . .: :.:: . : ..:.:. . . ...
CCDS46 SSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYHLN-KEETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQM
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 DHYPSVSYHLPSSSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIA
:. .::.. : .. : .:: :::: :. .:.:. : :. ::.::.: ::.:.::
CCDS46 DQQLRLSYNF--SPEVEFRVIRSLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIA
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 PLKAALRQTNASAHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPG
:::::::.... : : ..: :.::.:: .. : ....: . :.: : .
CCDS46 PLKAALRHATV-APVTVHGTLTESSCGF--MVDSDVNAVTT------VHSSSDPFG-KTD
1180 1190 1200 1210 1220
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 QGQAIRNGVNRNSAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESAD
. . . :.: .::.:::::::::: :.: . .. :....:: ...:.. : : :. :
CCDS46 EREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCIIGIMTRFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLD
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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CCDS66 GSSMTYHFQEHYTLSENSSSLVSSL------HRDVTLTREMITLSFRTTRTPSLLLYVSS
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CCDS66 Q--STKKQVILSSGTEFNAVKSLILGKVLEAAGADPDTRRAATSGFTGCLSAVRFGRAAP
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CCDS66 LKAALRPSGPS-RVTVRGHVAPMARCAAGAASGSPARELAPRLAGGAGRSGPAD------
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CCDS66 EGEPLVNADRRDSAVIGGVIAVVIFILLCITAIAIR-IYQQRKLRKENESKVSKKEEC
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CCDS75 SSSHGPGFSRLNRRDGAGGWTPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSDWVTSYL
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360 370 380 390 400 410
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CCDS75 ELQRGSGSFVLFLKDGK--LKLSLFQAGQSPRNVTAGAGLNDGQWHSVSFSAKWSHMNVV
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:: . ::: ..::: :.::...::.::: . .::::: .:.:: .::. :.::: .
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CCDS75 RATVTPGVEPGCAGHCSTYGHLCRNGGRCREKRRGVTCDCAFSAYDGPFCSNEISAYFAT
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CCDS75 GSSMTYHFQEHYTLSENSSSLVSSL------HRDVTLTREMITLSFRTTRTPSLLLYVSS
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CCDS75 FYEEYLSVILANNGSLQIRYKLDRHQNPDAFTFDFKNMADGQLHQVKINREEAVVMVEVN
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pF1KA0 HYPSVSYHLPSSSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIAP
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CCDS75 Q--SAKKQVILSSGTEFNAVKSLILGKVLEAAGADPDTRRAATSGFTGCLSAVRFGCAAP
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pF1KA0 LKAALRQTNASAHVHIQGELVE-SNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPG
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CCDS75 LKAALRPSGPS-RVTVRGHVAPMARCAAGAASGSP-ARELAP-RLA--GGAGRSGPVD--
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CCDS75 EGEPLVNADRRDSAVIGGVIAVEIFILLCITAIAIR-IYQQRKLRKENESKVSKKEEC
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CCDS11 WMRYNLQSALRSAAREFSHMLSRPVPGYEPGYIPGYDTPGYVPGYHGPGYRLPDYPRPGR
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CCDS11 --PYVYQLTTRPVTDGQPHSINITRVYRNLFIQVDYFPLTEQKFSLLVDSQLDSPKALYL
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CCDS11 SESNCGAMPRLVSEVPPELDPWYLP------PDFPYYHDEGWV--------AILLGFLVA
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pF1KA0 VVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESADAAIMNNDPNFTETIDESKKEW
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CCDS11 FLLLGLVGMLVLFYLQNHRYKGSYHTNEPKAAHEYHPGSKPPLPTSGPAQVPTPTAAPNQ
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1330
pF1KA0 LI
CCDS11 APASAPAPAPTPAPAPGPRDQNLPQILEESRSE
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pF1KA0 PRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSPGYAK
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CCDS10 MWNYDCDDPLVSALPQASFSSSSELSSSHGPGFAR
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CCDS10 LNRRDGAGGWSPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSNWVTSYLLMFSDSGWNW
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CCDS10 KQYRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFGCAYR
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pF1KA0 ADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLELKKAK
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CCDS10 SEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQLRRAR
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CCDS10 LFLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFHARGE
220 230 240 250 260 270
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pF1KA0 FDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSNVGNL
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CCDS10 FNLMNLDYE------------------------------------------------GNV
280
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CCDS10 SFSCSQPQSMPVTFLSSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISGGIL
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CCDS10 LFLSDGKL--KSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMASAAP
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CCDS10 LLGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQGSLGN
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CCDS10 FSDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSCEAYK
470 480 490 500 510 520
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CCDS10 HRGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTET-AWTIIQHNGSDLTRVRNTNPENPYAGFF
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CCDS10 EYVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQTYWGGSSP
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pF1KA0 GIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGDTDRQGSEAK
.:::.::.: :: : .:::::::: ..: .:.:.:.::.::::...:. :: : :::
CCDS10 DLQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHLPVTKIVITDTGRLHSEAA
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pF1KA0 LSVGPLRCQGDRNYWNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWGVFLENMGKE
..::: :::::..::.::: . .::::: ::.:: :::.::.::: . ::::::.:
CCDS10 YKLGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSFFFKTTASSGVFLENLGIA
710 720 730 740 750 760
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pF1KA0 DFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQASLQVDRLPQ
:::..::.: : :.::::::::: :: :.::: .::.:::.: .:::.:.::::::.:
CCDS10 DFIRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHVRVERNMKEASLQVDQLTP
770 780 790 800 810 820
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pF1KA0 QIRKAPTEGHTRLELYSQLFVGG-AGGQQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERAKVTSGFISG
. . ::..::. :.: ::::::: : :.:::::::::..::.::::::::.:: :
CCDS10 KTQPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGMTLDLEERAQVTPEVQPG
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pF1KA0 CSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGMWLRYNFQAP
: :::.::: :.::::: :: :. :::. .:: : ::.....:.: : . ::::
CCDS10 CRGHCSSYGKLCRNGGKCRERPIGFFCDCTFSAYTGPFCSNEISAYFGSGSSVIYNFQEN
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 ATNARDSSSRVDNAPDQQNSHPD--LAQEEIRFSFSTTKAPCILLYISSFTTDFLAVLVK
...:::.. . : : :..: :.::: ::..: .::..::: ..:.:..
CCDS10 YLLSKNSSSHA------ASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLSVIIA
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pF1KA0 PTGSLQIRYNLGGTREPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKLDHYPSVSYHLPS
.:::::::.:. .:: .. : .:::.:: : . :.:.: ..:...: . ::
CCDS10 KNGSLQIRYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQVHL--
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pF1KA0 SSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIAPLKAALRQTNAS
:: : :.. ::: ::...: . .::. .. ::::::: ::....:::::::. .. .
CCDS10 SSGTEFSAVKSLVLGRILEHSDVDQDTALAGAQGFTGCLSAVQLSHVAPLKAALHPSHPD
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pF1KA0 AHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPGQGQAIRNGVNRN
: . :...::.: :.: : . : . :: :.. : . . . :... .
CCDS10 P-VTVTGHVTESSCMAQPGTDATSRERTHSFA-DH--SGTID------DREPLANAIKSD
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pF1KA0 SAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESADAAIMNNDPNFTE
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CCDS10 SAVIGGLIAVVIFILLCITAIAVR-IYQQKRLYKRSEAKRSENVDSAEA-VLKSELNIQN
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1330
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CCDS10 AVNENQKEYFF
1230
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CCDS82 GFARLNRRDGAGGWSPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSNWVTSYLLMFSDS
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:.: ..:...::. : ::: .:... .::.:.:.::: .:.:..:: :: .::.:::.:
CCDS82 CAYRSEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQL
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CCDS82 RRARLFLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFH
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CCDS82 ARGEFNLMNLDYE-----------------------------------------------
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CCDS82 -GNVSFSCSQPQSMPVTFLSSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLIS
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CCDS82 GGILLFLSDGK--LKSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMA
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CCDS82 SAAPLLGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQG
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. :.:....:: :.: :::.::.:::::.:::.:..:.:.: .::: :::::::::: ::
CCDS82 SLGNFSDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSC
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CCDS82 EAYKHRGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTET-AWTIIQHNGSDLTRVRNTNPENPY
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CCDS82 GSSPDLQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHLPVTKIVITDTGRLH
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CCDS82 SEAAYKLGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSFFFKTTASSGVFLEN
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CCDS82 LGIADFIRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHVRVERNMKEASLQVD
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CCDS82 VQPGCRGHCSSYGKLCRNGGKCRERPIGFFCDCTFSAYTGPFCSNEISAYFGSGSSVIYN
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CCDS82 FQENYLLSKNSSSHA------ASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLS
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CCDS82 VIIAKNGSLQIRYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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CCDS82 HL--SSGTEFSAVKSLVLGRILEHSDVDQDTALAGAQGFTGCLSAVQLSHVAPLKAALHP
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CCDS82 SHPDP-VTVTGHVTESSCMAQPGTDATSRERTHSFA-DH--SGTID-DREP-----LANA
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CCDS82 IKSDSAVIGGLIAVVIFILLCITAIAVR-IYQQKRLYKRSEAKRSENVDSAEA-VLKSEL
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pF1KA0 NFTETIDESKKEWLI
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CCDS82 NIQNAVNENQKEYFF
1250 1260
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CCDS81 TGYGGKLCSEDVSQDPGLSHLMMSEQAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLS
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CCDS81 FKTWQRNGLILH-TGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAI---VEPVNGKF-NDNA
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::.: . :. :......: . :. .. .: : . :: : .. :.: .::
CCDS81 WHDVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNF
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::.. . :.. .: .:.: .. ... :.. :.: . :. :. :.. .:. .:
CCDS81 MGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLP
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.. . :.::.::: .::::..:.: . . . ..:: ... . .. .
CCDS81 KWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLL
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pF1KA0 DISSGS--------GLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEASAVRTNSPLQVKTGEKYF
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CCDS81 DMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMY
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.::. : .. ..:. .. ::.. . .: . :. ..:. . .. .. : .
CCDS81 LGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSR
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pF1KA0 MCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSCEAYKHLGQTSN
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CCDS81 MSA--KQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCE---REASILSY--------
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pF1KA0 YYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYNPEKYSVTQLVYSASMD
::: : . .: : .. .. . :.. :: ..: :
CCDS81 ------DGS-----------MYMKIIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGL--LVATTSRD
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CCDS81 --SADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKS
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CCDS81 LKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYID
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..:. .. :. . : :: . ..: . :::: ..:.:. :: . : ::: .:
CCDS81 LCKNGD---IDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSP
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CCDS81 DGFILFNSGDGNDFIAVELVKGY-IHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDN
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CCDS81 SNTHSLKVD---TKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLA
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CCDS81 SVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSY
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pF1KA0 DGTFCNKDVGA---FFEEGMWLRYNFQAPATNARDSSSRVDNAPDQQNSHPDLAQEEIRF
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CCDS81 SGNQCN-DPGATYIFGKSGGLILYTW--PA-----------------NDRPSTRSDRLAV
1090 1100 1110 1120
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.:::: ::. :.: ::: . .. :.. . .:.: . .: .. . .:.
CCDS81 GFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQ-GKIGVVFNIGTV--DISIKEERTPVNDGK
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pF1KA0 PHSVNITRHEKTIFLKLDHYPSVSYHLPSSSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYN
: : .::. . :..:..: :. : :...
CCDS81 YHVVRFTRNGGNATLQVDNWP-VNEHYPTGNTDNERFQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKG
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KA0 TPGFTGCLSRVQFNQIAPLKAALRQTNASAHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPW
CCDS81 RQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEV
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]