Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0400
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0400, 1006 aa
1>>>pF1KA0400 1006 - 1006 aa - 1006 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.0885+/-0.00128; mu= -21.7107+/- 0.078
mean_var=616.5105+/-127.876, 0's: 0 Z-trim(114.3): 49 B-trim: 53 in 1/54
Lambda= 0.051654
statistics sampled from 14831 (14871) to 14831 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.749), E-opt: 0.2 (0.457), width: 16
Scan time: 4.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1661.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2 (1006) 6734 517.6 5.1e-146
CCDS46224.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2 ( 961) 5343 413.9 7.9e-115
CCDS75788.1 ASAP1 gene_id:50807|Hs108|chr8 (1122) 3494 276.2 2.7e-73
CCDS6362.1 ASAP1 gene_id:50807|Hs108|chr8 (1129) 3494 276.2 2.7e-73
CCDS235.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1 ( 903) 2600 209.5 2.6e-53
CCDS44087.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1 ( 894) 2071 170.1 1.9e-41
>>CCDS1661.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2 (1006 aa)
initn: 6734 init1: 6734 opt: 6734 Z-score: 2734.9 bits: 517.6 E(32554): 5.1e-146
Smith-Waterman score: 6734; 100.0% identity (100.0% similar) in 1006 aa overlap (1-1006:1-1006)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MPDQISVSEFVAETHEDYKAPTASSFTTRTAQCRNTVAAIEEALDVDRMVLYKMKKSVKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MPDQISVSEFVAETHEDYKAPTASSFTTRTAQCRNTVAAIEEALDVDRMVLYKMKKSVKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 INSSGLAHVENEEQYTQALEKFGGNCVCRDDPDLGSAFLKFSVFTKELTALFKNLIQNMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 INSSGLAHVENEEQYTQALEKFGGNCVCRDDPDLGSAFLKFSVFTKELTALFKNLIQNMN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 NIISFPLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKITKIEKEKKEHAKLHGMIRTEISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 NIISFPLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKITKIEKEKKEHAKLHGMIRTEISG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AEIAEEMEKERRFFQLQMCEYLLKVNEIKIKKGVDLLQNLIKYFHAQCNFFQDGLKAVES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 AEIAEEMEKERRFFQLQMCEYLLKVNEIKIKKGVDLLQNLIKYFHAQCNFFQDGLKAVES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LKPSIETLSTDLHTIKQAQDEERRQLIQLRDILKSALQVEQKEDSQIRQSTAYSLHQPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LKPSIETLSTDLHTIKQAQDEERRQLIQLRDILKSALQVEQKEDSQIRQSTAYSLHQPQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NKEHGTERNGSLYKKSDGIRKVWQKRKCSVKNGFLTISHGTANRPPAKLNLLTCQVKTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 NKEHGTERNGSLYKKSDGIRKVWQKRKCSVKNGFLTISHGTANRPPAKLNLLTCQVKTNP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EEKKCFDLISHDRTYHFQAEDEQECQIWMSVLQNSKEEALNNAFKGDDNTGENNIVQELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 EEKKCFDLISHDRTYHFQAEDEQECQIWMSVLQNSKEEALNNAFKGDDNTGENNIVQELT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KEIISEVQRMTGNDVCCDCGAPDPTWLSTNLGILTCIECSGIHRELGVHYSRMQSLTLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 KEIISEVQRMTGNDVCCDCGAPDPTWLSTNLGILTCIECSGIHRELGVHYSRMQSLTLDV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKDYITAKYIERRYARKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKDYITAKYIERRYARKKH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ADNAAKLHSLCEAVKTRDIFGLLQAYADGVDLTEKIPLANGHEPDETALHLAVRSVDRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 ADNAAKLHSLCEAVKTRDIFGLLQAYADGVDLTEKIPLANGHEPDETALHLAVRSVDRTS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LHIVDFLVQNSGNLDKQTGKGSTALHYCCLTDNAECLKLLLRGKASIEIANESGETPLDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LHIVDFLVQNSGNLDKQTGKGSTALHYCCLTDNAECLKLLLRGKASIEIANESGETPLDI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 AKRLKHEHCEELLTQALSGRFNSHVHVEYEWRLLHEDLDESDDDMDEKLQPSPNRREDRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 AKRLKHEHCEELLTQALSGRFNSHVHVEYEWRLLHEDLDESDDDMDEKLQPSPNRREDRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 ISFYQLGSNQLQSNAVSLARDAANLAKEKQRAFMPSILQNETYGALLSGSPPPAQPAAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 ISFYQLGSNQLQSNAVSLARDAANLAKEKQRAFMPSILQNETYGALLSGSPPPAQPAAPS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TTSAPPLPPRNVGKVQTASSANTLWKTNSVSVDGGSRQRSSSDPPAVHPPLPPLRVTSTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 TTSAPPLPPRNVGKVQTASSANTLWKTNSVSVDGGSRQRSSSDPPAVHPPLPPLRVTSTN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 PLTPTPPPPVAKTPSVMEALSQPSKPAPPGISQIRPPPLPPQPPSRLPQKKPAPGADKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PLTPTPPPPVAKTPSVMEALSQPSKPAPPGISQIRPPPLPPQPPSRLPQKKPAPGADKST
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PLTNKGQPRGPVDLSATEALGPLSNAMVLQPPAPMPRKSQATKLKPKRVKALYNCVADNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PLTNKGQPRGPVDLSATEALGPLSNAMVLQPPAPMPRKSQATKLKPKRVKALYNCVADNP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KA0 DELTFSEGDVIIVDGEEDQEWWIGHIDGDPGRKGAFPVSFVHFIAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 DELTFSEGDVIIVDGEEDQEWWIGHIDGDPGRKGAFPVSFVHFIAD
970 980 990 1000
>>CCDS46224.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2 (961 aa)
initn: 5286 init1: 5286 opt: 5343 Z-score: 2175.0 bits: 413.9 E(32554): 7.9e-115
Smith-Waterman score: 6332; 95.4% identity (95.5% similar) in 1006 aa overlap (1-1006:1-961)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MPDQISVSEFVAETHEDYKAPTASSFTTRTAQCRNTVAAIEEALDVDRMVLYKMKKSVKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MPDQISVSEFVAETHEDYKAPTASSFTTRTAQCRNTVAAIEEALDVDRMVLYKMKKSVKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 INSSGLAHVENEEQYTQALEKFGGNCVCRDDPDLGSAFLKFSVFTKELTALFKNLIQNMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 INSSGLAHVENEEQYTQALEKFGGNCVCRDDPDLGSAFLKFSVFTKELTALFKNLIQNMN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 NIISFPLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKITKIEKEKKEHAKLHGMIRTEISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NIISFPLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKITKIEKEKKEHAKLHGMIRTEISG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AEIAEEMEKERRFFQLQMCEYLLKVNEIKIKKGVDLLQNLIKYFHAQCNFFQDGLKAVES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AEIAEEMEKERRFFQLQMCEYLLKVNEIKIKKGVDLLQNLIKYFHAQCNFFQDGLKAVES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LKPSIETLSTDLHTIKQAQDEERRQLIQLRDILKSALQVEQKEDSQIRQSTAYSLHQPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKPSIETLSTDLHTIKQAQDEERRQLIQLRDILKSALQVEQKEDSQIRQSTAYSLHQPQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NKEHGTERNGSLYKKSDGIRKVWQKRKCSVKNGFLTISHGTANRPPAKLNLLTCQVKTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NKEHGTERNGSLYKKSDGIRKVWQKRKCSVKNGFLTISHGTANRPPAKLNLLTCQVKTNP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EEKKCFDLISHDRTYHFQAEDEQECQIWMSVLQNSKEEALNNAFKGDDNTGENNIVQELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEKKCFDLISHDRTYHFQAEDEQECQIWMSVLQNSKEEALNNAFKGDDNTGENNIVQELT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KEIISEVQRMTGNDVCCDCGAPDPTWLSTNLGILTCIECSGIHRELGVHYSRMQSLTLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEIISEVQRMTGNDVCCDCGAPDPTWLSTNLGILTCIECSGIHRELGVHYSRMQSLTLDV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKDYITAKYIERRYARKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKDYITAKYIERRYARKKH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ADNAAKLHSLCEAVKTRDIFGLLQAYADGVDLTEKIPLANGHEPDETALHLAVRSVDRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ADNAAKLHSLCEAVKTRDIFGLLQAYADGVDLTEKIPLANGHEPDETALHLAVRSVDRTS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LHIVDFLVQNSGNLDKQTGKGSTALHYCCLTDNAECLKLLLRGKASIEIANESGETPLDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LHIVDFLVQNSGNLDKQTGKGSTALHYCCLTDNAECLKLLLRGKASIEIANESGETPLDI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 AKRLKHEHCEELLTQALSGRFNSHVHVEYEWRLLHEDLDESDDDMDEKLQPSPNRREDRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKRLKHEHCEELLTQALSGRFNSHVHVEYEWRLLHEDLDESDDDMDEKLQPSPNRREDRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 ISFYQLGSNQLQSNAVSLARDAANLAKEKQRAFMPSILQNETYGALLSGSPPPAQPAAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ISFYQLGSNQLQSNAVSLARDAANLAKEKQRAFMPSILQNETYGALLSGSPPPAQPAAPS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TTSAPPLPPRNVGKVQTASSANTLWKTNSVSVDGGSRQRSSSDPPAVHPPLPPLRVTSTN
:::::::::::::: .
CCDS46 TTSAPPLPPRNVGK---------------------------------------------D
790
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 PLTPTPPPPVAKTPSVMEALSQPSKPAPPGISQIRPPPLPPQPPSRLPQKKPAPGADKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PLTPTPPPPVAKTPSVMEALSQPSKPAPPGISQIRPPPLPPQPPSRLPQKKPAPGADKST
800 810 820 830 840 850
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PLTNKGQPRGPVDLSATEALGPLSNAMVLQPPAPMPRKSQATKLKPKRVKALYNCVADNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PLTNKGQPRGPVDLSATEALGPLSNAMVLQPPAPMPRKSQATKLKPKRVKALYNCVADNP
860 870 880 890 900 910
970 980 990 1000
pF1KA0 DELTFSEGDVIIVDGEEDQEWWIGHIDGDPGRKGAFPVSFVHFIAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DELTFSEGDVIIVDGEEDQEWWIGHIDGDPGRKGAFPVSFVHFIAD
920 930 940 950 960
>>CCDS75788.1 ASAP1 gene_id:50807|Hs108|chr8 (1122 aa)
initn: 3282 init1: 1415 opt: 3494 Z-score: 1429.4 bits: 276.2 E(32554): 2.7e-73
Smith-Waterman score: 3528; 58.4% identity (78.2% similar) in 979 aa overlap (1-947:14-967)
10 20 30 40
pF1KA0 MPDQISVSEFVAETHEDYKAPTASSFTTRTAQCRNTVAAIEEALDVD
::::::::::.::: :::..::.:::::: .:::::. .::::: :
CCDS75 MVSNLKRIMAQKWMPDQISVSEFIAETTEDYNSPTTSSFTTRLHNCRNTVTLLEEALDQD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 RMVLYKMKKSVKAINSSGLAHVENEEQYTQALEKFGGNCVCRDDPDLGSAFLKFSVFTKE
: .: :.::::::: .:: ::.:::.:.:.:.:::.: . ::.::::.::.:::..:::
CCDS75 RTALQKVKKSVKAIYNSGQDHVQNEENYAQVLDKFGSNFLSRDNPDLGTAFVKFSTLTKE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LTALFKNLIQNMNNIISFPLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKITKIEKEKKEH
:..:.:::.:.... . : ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::
CCDS75 LSTLLKNLLQGLSHNVIFTLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKFTKIEKEKREH
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 AKLHGMIRTEISGAEIAEEMEKERRFFQLQMCEYLLKVNEIKIKKGVDLLQNLIKYFHAQ
:: ::::::::.:::::::::::::.:::::::::.:::::: :::::::::::::.:::
CCDS75 AKQHGMIRTEITGAEIAEEMEKERRLFQLQMCEYLIKVNEIKTKKGVDLLQNLIKYYHAQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 CNFFQDGLKAVESLKPSIETLSTDLHTIKQAQDEERRQLIQLRDILKSALQVEQKEDSQI
:::::::::....:: :: :..::..:::.::::..:: :::..::.::..::::::
CCDS75 CNFFQDGLKTADKLKQYIEKLAADLYNIKQTQDEEKKQLTALRDLIKSSLQLDQKEDSQS
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 RQSTAYSLHQPQGNKEHGTERNGSLYKKSDGIRKVWQKRKCSVKNGFLTISHGTANRPPA
::. .::.:: :::::.:.:..: : :::::::::::.::::::::.:::::.:.:: ::
CCDS75 RQG-GYSMHQLQGNKEYGSEKKGYLLKKSDGIRKVWQRRKCSVKNGILTISHATSNRQPA
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 KLNLLTCQVKTNPEEKKCFDLISHDRTYHFQAEDEQECQIWMSVLQNSKEEALNNAFKGD
:::::::::: : :.:: ::::::.:::::::::::. :.::: :::::::. ::.:.
CCDS75 KLNLLTCQVKPNAEDKKSFDLISHNRTYHFQAEDEQDYVAWISVLTNSKEEALTMAFRGE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 DNTGENNIVQELTKEIISEVQRMTGNDVCCDCGAPDPTWLSTNLGILTCIECSGIHRELG
...:::.. ..::: :: .:::. :::.:::::. .::::::::::::::::::::::.:
CCDS75 QSAGENSL-EDLTKAIIEDVQRLPGNDICCDCGSSEPTWLSTNLGILTCIECSGIHREMG
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 VHYSRMQSLTLDVLGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKDYIT
:: ::.::: :: :::::::::::.:: .::.::: ::. : ::.:.:::..::.:::
CCDS75 VHISRIQSLELDKLGTSELLLAKNVGNNSFNDIMEANLPSP-SPKPTPSSDMTVRKEYIT
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 AKYIERRYARKKHADNAAKLHSLCEAVKTRDIFGLLQAYADGVDLTEKIPLANGHEPDET
:::...:..:: . ..:::. : ::.:.::...:.:.::.::.: : . : :.: ::
CCDS75 AKYVDHRFSRKTCSTSSAKLNELLEAIKSRDLLALIQVYAEGVELMEPL-LEPGQELGET
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 ALHLAVRSVDRTSLHIVDFLVQNSGNLDKQTGKGSTALHYCCLTDNAECLKLLLRGKASI
:::::::..:.::::.::::::: :::::::. :.:.:::: . .. ::::::::.: ..
CCDS75 ALHLAVRTADQTSLHLVDFLVQNCGNLDKQTALGNTVLHYCSMYSKPECLKLLLRSKPTV
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 EIANESGETPLDIAKRLKHEHCEELLTQALSGRFNSHVHVEYEWRLLHEDLDESDDDMDE
.:.:..::: :::::::: .::.::.:: ::.:: :::::::: : .:..::::::.:.
CCDS75 DIVNQAGETALDIAKRLKATQCEDLLSQAKSGKFNPHVHVEYEWNLRQEEIDESDDDLDD
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 KLQPSPNRREDRPISFYQLGSNQLQSNAVSLARDAANLAKEKQRAFMPSILQNETYGALL
: .: ..: :: :: . .: . :.. :: . . ..::: .:::.
CCDS75 KPSPIKKERSPRPQSFCHSSSISPQDK---LALPGFSTPRDKQRL---------SYGAFT
720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 SG---SPPPAQPAAPSTTSAPPLPPRNVGKVQTASSANTLWKTNSVSVDGGSRQRSSSDP
. : .:..: :: ::::::::.:: :. .. .:.. : :: :.. :
CCDS75 NQIFVSTSTDSPTSP-TTEAPPLPPRNAGKGPTGPPSTLPLSTQTSS---GSSTLSKKRP
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860
pF1KA0 PAVHPPLPPLRVTSTNPLTPTP--PP-----P---------VAKTPSVMEALSQPSKPAP
: :: : . : ..: .: : :: : .:: . .:.::: :. .
CCDS75 P---PPPPGHKRTLSDPPSPLPHGPPNKGAVPWGNDGGPSSSSKTTNKFEGLSQQSSTS-
830 840 850 860 870
870 880 890 900 910
pF1KA0 PGISQIRPPPLPPQPPSRLPQKK-----------PAPGADKSTPLTNKGQPRGPVDLSAT
. . : . :. :... .: : .::. :.. : : ::
CCDS75 -SAKTALGPRVLPKLPQKVALRKTDHLSLDKATIPPEIFQKSSQLAELPQKPPPGDLPPK
880 890 900 910 920 930
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 EA-LGPLSNAMVLQP-PAPMPRKSQATKLKPKRVKALYNCVADNPDELTFSEGDVIIVDG
. :.: . : : :. .: : : : ::
CCDS75 PTELAPKPQIGDLPPKPGELPPKPQLGDLPPKPQLSDLPPKPQMKDLPPKPQLGDLLAKS
940 950 960 970 980 990
980 990 1000
pF1KA0 EEDQEWWIGHIDGDPGRKGAFPVSFVHFIAD
CCDS75 QTGDVSPKAQQPSEVTLKSHPLDLSPNVQSRDAIQKQASEDSNDLTPTLPETPVPLPRKI
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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10 20 30 40
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50 60 70 80 90 100
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CCDS63 EEALDQDRTALQKVKKSVKAIYNSGQDHVQNEENYAQVLDKFGSNFLSRDNPDLGTAFVK
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110 120 130 140 150 160
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CCDS63 FSTLTKELSTLLKNLLQGLSHNVIFTLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKFTKI
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CCDS63 EKEKREHAKQHGMIRTEITGAEIAEEMEKERRLFQLQMCEYLIKVNEIKTKKGVDLLQNL
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230 240 250 260 270 280
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CCDS63 IKYYHAQCNFFQDGLKTADKLKQYIEKLAADLYNIKQTQDEEKKQLTALRDLIKSSLQLD
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290 300 310 320 330 340
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CCDS63 QKEDSQSRQG-GYSMHQLQGNKEYGSEKKGYLLKKSDGIRKVWQRRKCSVKNGILTISHA
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CCDS63 TSNRQPAKLNLLTCQVKPNAEDKKSFDLISHNRTYHFQAEDEQDYVAWISVLTNSKEEAL
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CCDS63 TMAFRGEQSAGENSL-EDLTKAIIEDVQRLPGNDICCDCGSSEPTWLSTNLGILTCIECS
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CCDS63 GIHREMGVHISRIQSLELDKLGTSELLLAKNVGNNSFNDIMEANLPSP-SPKPTPSSDMT
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pF1KA0 ARKDYITAKYIERRYARKKHADNAAKLHSLCEAVKTRDIFGLLQAYADGVDLTEKIPLAN
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CCDS63 VRKEYITAKYVDHRFSRKTCSTSSAKLNELLEAIKSRDLLALIQVYAEGVELMEPL-LEP
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CCDS63 GQELGETALHLAVRTADQTSLHLVDFLVQNCGNLDKQTALGNTVLHYCSMYSKPECLKLL
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pF1KA0 LRGKASIEIANESGETPLDIAKRLKHEHCEELLTQALSGRFNSHVHVEYEWRLLHEDLDE
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CCDS63 LRSKPTVDIVNQAGETALDIAKRLKATQCEDLLSQAKSGKFNPHVHVEYEWNLRQEEIDE
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pF1KA0 SDDDMDEKLQPSPNRREDRPISFYQLGSNQLQSNAVSLARDAANLAKEKQRAFMPSILQN
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CCDS63 SDDDLDDKPSPIKKERSPRPQSFCHSSSISPQDK---LALPGFSTPRDKQRL--------
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CCDS63 -SYGAFTNQIFVSTSTDSPTSP-TTEAPPLPPRNAGKGPTGPPSTLPLSTQTSS---GSS
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pF1KA0 QRSSSDPPAVHPPLPPLRVTSTNPLTPTP--PP-----P---------VAKTPSVMEALS
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CCDS63 TLSKKRPP---PPPPGHKRTLSDPPSPLPHGPPNKGAVPWGNDGGPSSSSKTTNKFEGLS
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870 880 890 900 910
pF1KA0 QPSKPAPPGISQIRPPPLPPQPPSRLPQKK-----------PAPGADKSTPLTNKGQPRG
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CCDS63 QQSSTS--SAKTALGPRVLPKLPQKVALRKTDHLSLDKATIPPEIFQKSSQLAELPQKPP
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920 930 940 950 960
pF1KA0 PVDLSATEA-LGPLSNAMVLQP-PAPMPRKSQATKLKPKRVKALYNCVADNPDELTFSEG
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CCDS63 PGDLPPKPTELAPKPQIGDLPPKPGELPPKPQLGDLPPKPQLSDLPPKPQMKDLPPKPQL
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000
pF1KA0 DVIIVDGEEDQEWWIGHIDGDPGRKGAFPVSFVHFIAD
CCDS63 GDLLAKSQTGDVSPKAQQPSEVTLKSHPLDLSPNVQSRDAIQKQASEDSNDLTPTLPETP
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10 20 30 40 50
pF1KA0 MPDQISVSEFVAETHEDYKAPT-ASSFTTRTAQCRNTVAAIEEALDVDRMVLYKMKKSVK
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CCDS23 AIHSSGLGHVENEEQYREAVESLGNSHLSQNSHELSTGFLNLAVFTREVAALFKNLIQNL
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CCDS23 NNIVSFPLDSLMKGQLRDGRQDSKKQLEKAWKDYEAKMAKLEKER-DRARVTGGI-----
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pF1KA0 GAEIAEEMEKERRFFQLQMCEYLLKVNEIKIKKGVDLLQNLIKYFHAQCNFFQDGLKAVE
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CCDS23 PGEVAQDMQRERRIFQLHMCEYLLKAGESQMKQGPDFLQSLIKFFHAQHNFFQDGWKAAQ
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pF1KA0 SLKPSIETLSTDLHTIKQAQDEERRQLIQLRDILKSALQVEQKEDSQIRQSTA--YSLHQ
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CCDS23 SLFPFIEKLAASVHALHQAQEDELQKLTQLRDSLRGTLQLESREEHLSRKNSGCGYSIHQ
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CCDS23 PNPEEKKCFDLVTHNRTYHFQAEDEHECEAWVSVLQNSKDEALSSAFLGEPSAGPGSWGS
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CCDS23 AGHDGEPHDLTKLLIAEVKSRPGNSQCCDCGAADPTWLSTNLGVLTCIQCSGVHRELGVR
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pF1KA0 YSRMQSLTLDVLGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKDYITAK
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CCDS23 FSRMQSLTLDLLGPSELLLALNMGNTSFNEVMEAQLPSHGGPKPSAESDMGTRRDYIMAK
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pF1KA0 YIERRYARKKHADNAAKLHSLCEAVKTRDIFGLLQAYADGVDLTEKIPLANGHEPDETAL
:.:.:.::. . ..:. ::....:.:.:.: :. . .: ... :.: .:
CCDS23 YVEHRFARRCTPEPQRLWTAICN----RDLLSVLEAFANGQDFGQPLPGPDAQAPEELVL
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CCDS23 HLAVKVANQASLPLVDFIIQNGGHLDAKAADGNTALHYAALYNQPDCLKLLLKGRALVGT
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pF1KA0 ANESGETPLDIAKRLKHEHCEELLTQALSGRFNSHVHVEYEWRLLHEDLDESDDDMDEKL
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CCDS23 VNEAGETALDIARKKHHKECEELLEQAQAGTFAFPLHVDYSWVISTEPGSDSEEDEEEKR
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CCDS23 A---ATPQGESEDCPPPLPVKN--------SSRTLVQGCARHASGDRSEVSSLSSEAPET
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CCDS23 PESLGSP--ASSSSLMSPLEPGDPSQAPPNSEEGLREPPGTSRPSLTSGTTPSEMYLPVR
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CCDS23 FSSESTRSYRRGARSPEDGPSARQPLPRRNVPVGITEGDGSRTGSL-PASSVQLLQD
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10 20 30 40 50
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CCDS44 MPEQFSVAEFLAVTAEDLSSPAGAAAFAAKMPRYRGAALAREEILEGDQAILQRIKKAVR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AINSSGLAHVENEEQYTQALEKFGGNCVCRDDPDLGSAFLKFSVFTKELTALFKNLIQNM
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CCDS44 AIHSSGLGHVENEEQYREAVESLGNSHLSQNSHELSTGFLNLAVFTREVAALFKNLIQNL
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CCDS44 NNIVSFPLDSLMKGQLRDGRQASLSLG-SRA---------KLEKER-DRARVTGGI----
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pF1KA0 SGAEIAEEMEKERRFFQLQMCEYLLKVNEIKIKKGVDLLQNLIKYFHAQCNFFQDGLKAV
.:.:..:..:::.:::.:::::::..: ..:.: :.::.:::.:::: :::::: ::.
CCDS44 -PGEVAQDMQRERRIFQLHMCEYLLKAGESQMKQGPDFLQSLIKFFHAQHNFFQDGWKAA
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.:: : :: :....:...:::..: ..: :::: :...::.:..:. :.... ::.:
CCDS44 QSLFPFIEKLAASVHALHQAQEDELQKLTQLRDSLRGTLQLESREEHLSRKNSGCGYSIH
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. ::::::::::..:.::::::::::.::. :.:::::::.:::..:: :. ..:
CCDS44 RPNPEEKKCFDLVTHNRTYHFQAEDEHECEAWVSVLQNSKDEALSSAFLGEPSAGPGSWG
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... ..::: .:.::. ::. :::::: ::::::::::.::::.:::.::::::
CCDS44 SAGHDGEPHDLTKLLIAEVKSRPGNSQCCDCGAADPTWLSTNLGVLTCIQCSGVHRELGV
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pF1KA0 HYSRMQSLTLDVLGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKDYITA
..:::::::::.:: :::::: :.::..:::.:: ::.. . ::. :::..:.::: :
CCDS44 RFSRMQSLTLDLLGPSELLLALNMGNTSFNEVMEAQLPSHGGPKPSAESDMGTRRDYIMA
470 480 490 500 510 520
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pF1KA0 KYIERRYARKKHADNAAKLHSLCEAVKTRDIFGLLQAYADGVDLTEKIPLANGHEPDETA
::.:.:.::. . ..:. ::....:.:.:.: :. . .: ... :.: .
CCDS44 KYVEHRFARRCTPEPQRLWTAICN----RDLLSVLEAFANGQDFGQPLPGPDAQAPEELV
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 LHLAVRSVDRTSLHIVDFLVQNSGNLDKQTGKGSTALHYCCLTDNAECLKLLLRGKASIE
:::::. ....:: .:::..::.:.:: ... :.::::: : .. .::::::.:.: .
CCDS44 LHLAVKVANQASLPLVDFIIQNGGHLDAKAADGNTALHYAALYNQPDCLKLLLKGRALVG
590 600 610 620 630 640
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pF1KA0 IANESGETPLDIAKRLKHEHCEELLTQALSGRFNSHVHVEYEWRLLHEDLDESDDDMDEK
.::.::: ::::.. .:..::::: :: .: : .::.: : . : ..:..: .::
CCDS44 TVNEAGETALDIARKKHHKECEELLEQAQAGTFAFPLHVDYSWVISTEPGSDSEEDEEEK
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CCDS44 R------------CLLKLPA---QAHWASGRLDISN------KTY-------ETVASL--
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pF1KA0 GSPPPAQPAAPSTTSAPPLPPRNVGKVQTASSANTLWKTNSVSVDGGSRQRSS--SDPPA
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CCDS44 GA---ATPQGESEDCPPPLPVKN--------SSRTLVQGCARHASGDRSEVSSLSSEAPE
740 750 760 770
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pF1KA0 VHPPL-PPLRVTSTNPLTPTPP-PPVAKTPSVMEALSQPSKPAPPGISQIRPPP---LPP
. : : ..:.. ..: : : :. :.: .: . :.... : ::
CCDS44 TPESLGSP--ASSSSLMSPLEPGDPSQAPPNSEEGLREPPGTSRPSLTSGTTPSEMYLPV
780 790 800 810 820 830
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pF1KA0 QPPS------RLPQKKPAPGADKSTPLTNKGQPRGPV--DLSATEALGPLSNAMVLQPPA
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CCDS44 RFSSESTRSYRRGARSPEDGPSARQPLPRRNVPVGITEGDGSRTGSL-PASSVQLLQD
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pF1KA0 PMPRKSQATKLKPKRVKALYNCVADNPDELTFSEGDVIIVDGEEDQEWWIGHIDGDPGRK
1006 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:39:31 2016 done: Fri Nov 4 00:39:32 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]