Result of FASTA (omim) for pFN21AB9484
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9484, 2045 aa
  1>>>pF1KB9484 2045 - 2045 aa - 2045 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6656+/-0.00046; mu= 1.7452+/- 0.029
 mean_var=395.9417+/-80.533, 0's: 0 Z-trim(121.4): 360  B-trim: 116 in 1/58
 Lambda= 0.064455
 statistics sampled from 37450 (37871) to 37450 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.444), width:  16
 Scan time: 18.710

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_940978 (OMIM: 103320,615120) agrin isoform 2 pr (2045) 14597 1373.6       0
XP_005244806 (OMIM: 103320,615120) PREDICTED: agri (2049) 14579 1372.0       0
XP_011539731 (OMIM: 103320,615120) PREDICTED: agri (2004) 14213 1337.9       0
NP_001292204 (OMIM: 103320,615120) agrin isoform 1 (2068) 13507 1272.3       0
NP_005520 (OMIM: 142461,224410,255800) basement me (4391)  701 81.8 1.8e-13
NP_001278789 (OMIM: 142461,224410,255800) basement (4392)  701 81.8 1.8e-13
XP_016856611 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4438)  701 81.8 1.8e-13
XP_016856610 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4439)  701 81.8 1.8e-13
XP_016856609 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4456)  701 81.8 1.8e-13
XP_011539620 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4574)  701 81.8 1.9e-13
NP_001136272 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3144)  570 69.5 6.7e-10
XP_006714202 (OMIM: 600976) PREDICTED: protocadher (4588)  526 65.6 1.5e-08
NP_005236 (OMIM: 600976) protocadherin Fat 1 precu (4588)  526 65.6 1.5e-08
XP_005262892 (OMIM: 600976) PREDICTED: protocadher (4600)  526 65.6 1.5e-08
XP_005262891 (OMIM: 600976) PREDICTED: protocadher (4600)  526 65.6 1.5e-08
XP_011539190 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1364)  475 60.3 1.7e-07
XP_011539189 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1395)  475 60.3 1.7e-07
XP_006710469 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1436)  475 60.3 1.8e-07
NP_001400 (OMIM: 604266) multiple epidermal growth (1541)  475 60.3 1.9e-07
XP_011539188 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1560)  475 60.3 1.9e-07
XP_011539187 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1603)  475 60.3 1.9e-07
XP_016859228 (OMIM: 605734) PREDICTED: tomoregulin ( 337)  447 57.0   4e-07
XP_011509192 (OMIM: 605734) PREDICTED: tomoregulin ( 365)  447 57.1 4.2e-07
XP_016856022 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1559)  456 58.6 6.4e-07
NP_001292063 (OMIM: 605734) tomoregulin-2 isoform  ( 346)  435 55.9 8.8e-07
NP_057276 (OMIM: 605734) tomoregulin-2 isoform 1 p ( 374)  435 56.0 9.3e-07
XP_005248460 (OMIM: 136470) PREDICTED: follistatin ( 316)  430 55.4 1.1e-06
XP_005248458 (OMIM: 136470) PREDICTED: follistatin ( 343)  430 55.5 1.2e-06
NP_006341 (OMIM: 136470) follistatin isoform FST31 ( 317)  428 55.2 1.3e-06
NP_037541 (OMIM: 136470) follistatin isoform FST34 ( 344)  428 55.3 1.4e-06
XP_006716984 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1259)  424 55.5 4.4e-06
NP_006050 (OMIM: 604349,614115) laminin subunit ga (1575)  424 55.6 5.1e-06
XP_011516423 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1581)  424 55.6 5.1e-06
XP_016859229 (OMIM: 605734) PREDICTED: tomoregulin ( 266)  396 52.2 9.1e-06
XP_006723861 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (2300)  384 52.0 8.7e-05
XP_016878159 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1097)  376 51.0 8.7e-05
NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin sub (1798)  378 51.4 0.00011
XP_005265184 (OMIM: 150325,609049,614199) PREDICTE (1798)  378 51.4 0.00011
NP_005551 (OMIM: 601033) laminin subunit alpha-5 p (3695)  384 52.3 0.00012
XP_006723859 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3700)  384 52.3 0.00012
NP_001129131 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1547)  371 50.7 0.00015
XP_016867691 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1212)  368 50.3 0.00016
NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit be (1786)  368 50.4  0.0002
XP_016867690 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1810)  368 50.4 0.00021
NP_001129386 (OMIM: 609344) kielin/chordin-like pr (1503)  366 50.2 0.00021
NP_001278938 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3165)  370 50.9 0.00027
NP_002284 (OMIM: 150290) laminin subunit gamma-1 p (1609)  362 49.8 0.00028
NP_663325 (OMIM: 607873) scavenger receptor class  ( 569)  350 48.2  0.0003
NP_003683 (OMIM: 603421) tomoregulin-1 precursor [ ( 380)  342 47.3 0.00038
XP_016874066 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- ( 974)  352 48.7 0.00038


>>NP_940978 (OMIM: 103320,615120) agrin isoform 2 precur  (2045 aa)
 initn: 14597 init1: 14597 opt: 14597  Z-score: 7350.4  bits: 1373.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 14597; 100.0% identity (100.0% similar) in 2045 aa overlap (1-2045:1-2045)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAGRSHPGPLRPLLPLLVVAACVLPGAGGTCPERALERREEEANVVLTGTVEEILNVDPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 MAGRSHPGPLRPLLPLLVVAACVLPGAGGTCPERALERREEEANVVLTGTVEEILNVDPV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 QHTYSCKVRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDPLICDNQVSTGDTRIFFVNPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 QHTYSCKVRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDPLICDNQVSTGDTRIFFVNPA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 PPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVEFCVEDKPGTHFTPVPPTPPDACRGMLCGFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 PPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVEFCVEDKPGTHFTPVPPTPPDACRGMLCGFG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AVCEPNAEGPGRASCVCKKSPCPSVVAPVCGSDASTYSNECELQRAQCSQQRRIRLLSRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 AVCEPNAEGPGRASCVCKKSPCPSVVAPVCGSDASTYSNECELQRAQCSQQRRIRLLSRG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 PCGSRDPCSNVTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 PCGSRDPCSNVTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 RACARQENVFKKFDGPCDPCQGALPDPSRSCRVNPRTRRPEMLLRPESCPARQAPVCGDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 RACARQENVFKKFDGPCDPCQGALPDPSRSCRVNPRTRRPEMLLRPESCPARQAPVCGDD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 GVTYENDCVMGRSGAARGLLLQKVRSGQCQGRDQCPEPCRFNAVCLSRRGRPRCSCDRVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 GVTYENDCVMGRSGAARGLLLQKVRSGQCQGRDQCPEPCRFNAVCLSRRGRPRCSCDRVT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 CDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 CDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 VKNGQAACECLQACSSLYDPVCGSDGVTYGSACELEATACTLGREIQVARKGPCDRCGQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 VKNGQAACECLQACSSLYDPVCGSDGVTYGSACELEATACTLGREIQVARKGPCDRCGQC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 RFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 RFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 TCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAACLQQTQIEEAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 TCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAACLQQTQIEEAR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 AGPCEQAECGSGGSGSGEDGDCEQELCRQRGGIWDEDSEDGPCVCDFSCQSVPGSPVCGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 AGPCEQAECGSGGSGSGEDGDCEQELCRQRGGIWDEDSEDGPCVCDFSCQSVPGSPVCGS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 DGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 DGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 ARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 ARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB9 RSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 RSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPAT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB9 CAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 CAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB9 ISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 ISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB9 SSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 SSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB9 GSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 GSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLEL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB9 EGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 EGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB9 RAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 RAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGA
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pF1KB9 TSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 TSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 RRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPAFEGR
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pF1KB9 SFLAFPTLRAYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNARGKDFLALALLDGRVQLRFDTGSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 SFLAFPTLRAYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNARGKDFLALALLDGRVQLRFDTGSGP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 AVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPVLGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 DQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGPGAATRGSGVGECGDHPCLPNPCHG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 GAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKSPCQPNPCHGAAPCRVLPEGGAQCECPLGRE
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pF1KB9 GTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 GTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYN
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pF1KB9 GQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 GQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRV
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pF1KB9 GDGPRVLGESPVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQLVSLGGRQLLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 GDGPRVLGESPVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQLVSLGGRQLLT
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pF1KB9 PEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGPHCEKGLVEKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 PEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGPHCEKGLVEKS
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pF1KB9 AGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSGKATERADYVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 AGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSGKATERADYVA
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pF1KB9 LAIVDGHLQLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNRWLRVVAHREQREGSLQVGNEAPVTGSSPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 LAIVDGHLQLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNRWLRVVAHREQREGSLQVGNEAPVTGSSPL
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pF1KB9 GATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCLRDVVVGRHPLHLLEDAVTKPELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 GATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCLRDVVVGRHPLHLLEDAVTKPELR
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

            
pF1KB9 PCPTP
       :::::
NP_940 PCPTP
            

>>XP_005244806 (OMIM: 103320,615120) PREDICTED: agrin is  (2049 aa)
 initn: 14583 init1: 12609 opt: 14579  Z-score: 7341.3  bits: 1372.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 14579; 99.8% identity (99.8% similar) in 2049 aa overlap (1-2045:1-2049)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAGRSHPGPLRPLLPLLVVAACVLPGAGGTCPERALERREEEANVVLTGTVEEILNVDPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAGRSHPGPLRPLLPLLVVAACVLPGAGGTCPERALERREEEANVVLTGTVEEILNVDPV
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pF1KB9 QHTYSCKVRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDPLICDNQVSTGDTRIFFVNPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QHTYSCKVRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDPLICDNQVSTGDTRIFFVNPA
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pF1KB9 PPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVEFCVEDKPGTHFTPVPPTPPDACRGMLCGFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVEFCVEDKPGTHFTPVPPTPPDACRGMLCGFG
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pF1KB9 AVCEPNAEGPGRASCVCKKSPCPSVVAPVCGSDASTYSNECELQRAQCSQQRRIRLLSRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVCEPNAEGPGRASCVCKKSPCPSVVAPVCGSDASTYSNECELQRAQCSQQRRIRLLSRG
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pF1KB9 PCGSRDPCSNVTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PCGSRDPCSNVTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLR
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pF1KB9 RACARQENVFKKFDGPCDPCQGALPDPSRSCRVNPRTRRPEMLLRPESCPARQAPVCGDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RACARQENVFKKFDGPCDPCQGALPDPSRSCRVNPRTRRPEMLLRPESCPARQAPVCGDD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GVTYENDCVMGRSGAARGLLLQKVRSGQCQGRDQCPEPCRFNAVCLSRRGRPRCSCDRVT
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pF1KB9 CDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCA
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pF1KB9 VKNGQAACECLQACSSLYDPVCGSDGVTYGSACELEATACTLGREIQVARKGPCDRCGQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB9 RFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCE
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pF1KB9 TCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAACLQQTQIEEAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAACLQQTQIEEAR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AGPCEQAECGSGGSGSGEDGDCEQELCRQRGGIWDEDSEDGPCVCDFSCQSVPGSPVCGS
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pF1KB9 DGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITA
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pF1KB9 ARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDG
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pF1KB9 RSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPAT
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pF1KB9 CAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQ
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pF1KB9 ISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPP
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pF1KB9 SSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGG
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pF1KB9 GSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLEL
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pF1KB9 EGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSV
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pF1KB9 RAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGA
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pF1KB9 TSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPG
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pF1KB9 RRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPAFEGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPAFEGR
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pF1KB9 SFLAFPTLRAYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNARGKDFLALALLDGRVQLRFDTGSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SFLAFPTLRAYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNARGKDFLALALLDGRVQLRFDTGSGP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPVLGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPE
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pF1KB9 DQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGPGAATRGSGVGECGDHPCLPNPCHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGPGAATRGSGVGECGDHPCLPNPCHG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKSPCQPNPCHGAAPCRVLPEGGAQCECPLGRE
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pF1KB9 GTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYN
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pF1KB9 GQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRV
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pF1KB9 GDGPRVLGESP----VPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQLVSLGGR
       :::::::::::    :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GDGPRVLGESPKSRKVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQLVSLGGR
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pF1KB9 QLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGPHCEKGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGPHCEKGL
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       1860      1870      1880      1890      1900      1910      
pF1KB9 VEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSGKATERA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSGKATERA
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

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pF1KB9 DYVALAIVDGHLQLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNRWLRVVAHREQREGSLQVGNEAPVTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DYVALAIVDGHLQLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNRWLRVVAHREQREGSLQVGNEAPVTG
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       1980      1990      2000      2010      2020      2030      
pF1KB9 SSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCLRDVVVGRHPLHLLEDAVTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCLRDVVVGRHPLHLLEDAVTK
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

       2040     
pF1KB9 PELRPCPTP
       :::::::::
XP_005 PELRPCPTP
                

>>XP_011539731 (OMIM: 103320,615120) PREDICTED: agrin is  (2004 aa)
 initn: 14216 init1: 12609 opt: 14213  Z-score: 7157.5  bits: 1337.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 14213; 99.5% identity (99.7% similar) in 2005 aa overlap (1-2001:1-2004)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAGRSHPGPLRPLLPLLVVAACVLPGAGGTCPERALERREEEANVVLTGTVEEILNVDPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAGRSHPGPLRPLLPLLVVAACVLPGAGGTCPERALERREEEANVVLTGTVEEILNVDPV
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pF1KB9 QHTYSCKVRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDPLICDNQVSTGDTRIFFVNPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QHTYSCKVRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDPLICDNQVSTGDTRIFFVNPA
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pF1KB9 PPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVEFCVEDKPGTHFTPVPPTPPDACRGMLCGFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVEFCVEDKPGTHFTPVPPTPPDACRGMLCGFG
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pF1KB9 AVCEPNAEGPGRASCVCKKSPCPSVVAPVCGSDASTYSNECELQRAQCSQQRRIRLLSRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVCEPNAEGPGRASCVCKKSPCPSVVAPVCGSDASTYSNECELQRAQCSQQRRIRLLSRG
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pF1KB9 PCGSRDPCSNVTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PCGSRDPCSNVTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLR
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pF1KB9 RACARQENVFKKFDGPCDPCQGALPDPSRSCRVNPRTRRPEMLLRPESCPARQAPVCGDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RACARQENVFKKFDGPCDPCQGALPDPSRSCRVNPRTRRPEMLLRPESCPARQAPVCGDD
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pF1KB9 GVTYENDCVMGRSGAARGLLLQKVRSGQCQGRDQCPEPCRFNAVCLSRRGRPRCSCDRVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVTYENDCVMGRSGAARGLLLQKVRSGQCQGRDQCPEPCRFNAVCLSRRGRPRCSCDRVT
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pF1KB9 CDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCA
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pF1KB9 VKNGQAACECLQACSSLYDPVCGSDGVTYGSACELEATACTLGREIQVARKGPCDRCGQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VKNGQAACECLQACSSLYDPVCGSDGVTYGSACELEATACTLGREIQVARKGPCDRCGQC
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pF1KB9 RFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCE
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pF1KB9 TCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAACLQQTQIEEAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAACLQQTQIEEAR
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pF1KB9 AGPCEQAECGSGGSGSGEDGDCEQELCRQRGGIWDEDSEDGPCVCDFSCQSVPGSPVCGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGPCEQAECGSGGSGSGEDGDCEQELCRQRGGIWDEDSEDGPCVCDFSCQSVPGSPVCGS
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pF1KB9 DGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITA
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pF1KB9 ARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDG
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pF1KB9 RSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPAT
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pF1KB9 CAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQ
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pF1KB9 ISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPP
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pF1KB9 SSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGG
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pF1KB9 GSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLEL
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pF1KB9 EGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSV
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pF1KB9 RAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGA
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pF1KB9 TSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SFLAFPTLRAYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNARGKDFLALALLDGRVQLRFDTGSGP
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XP_011 AVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPVLGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRV
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       :::::::::::    :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGPHCEKGL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSGKATERA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DYVALAIVDGHLQLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNRWLRVVAHREQREGSLQVGNEAPVTG
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       1980      1990      2000      2010      2020      2030      
pF1KB9 SSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCLRDVVVGRHPLHLLEDAVTK
       :::::::::::::::::: . . :.                                   
XP_011 SSPLGATQLDTDGALWLGPF-QAPI                                   
             1990      2000                                        

>>NP_001292204 (OMIM: 103320,615120) agrin isoform 1 pre  (2068 aa)
 initn: 13680 init1: 12609 opt: 13507  Z-score: 6802.6  bits: 1272.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 14531; 98.9% identity (98.9% similar) in 2068 aa overlap (1-2045:1-2068)

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NP_001 QHTYSCKVRVWRYLKGKDLVARESLLDGGNKVVISGFGDPLICDNQVSTGDTRIFFVNPA
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NP_001 PPYLWPAHKNELMLNSSLMRITLRNLEEVEFCVEDKPGTHFTPVPPTPPDACRGMLCGFG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PCGSRDPCSNVTCSFGSTCARSADGLTASCLCPATCRGAPEGTVCGSDGADYPGECQLLR
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pF1KB9 CDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CDGAYRPVCAQDGRTYDSDCWRQQAECRQQRAIPSKHQGPCDQAPSPCLGVQCAFGATCA
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pF1KB9 VKNGQAACECLQACSSLYDPVCGSDGVTYGSACELEATACTLGREIQVARKGPCDRCGQC
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pF1KB9 RFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RFGALCEAETGRCVCPSECVALAQPVCGSDGHTYPSECMLHVHACTHQISLHVASAGPCE
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pF1KB9 TCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPGPVCGSDGVTYGSACELREAACLQQTQIEEAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 AGPCEQAECGSGGSGSGEDGDCEQELCRQRGGIWDEDSEDGPCVCDFSCQSVPGSPVCGS
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pF1KB9 DGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGVTYSTECELKKARCESQRGLYVAAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDNITA
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pF1KB9 ARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARGVGLAGCPSACQCNPHGSYGGTCDPATGQCSCRPGVGGLRCDRCEPGFWNFRGIVTDG
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pF1KB9 RSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSGCTPCSCDPQGAVRDDCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEADASAPAT
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pF1KB9 CAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CAEMRCEFGARCVEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKTIACRQGLQ
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pF1KB9 ISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISIQSLGPCQEAVAPSTHPTSASVTVTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSSTAHSQTTPPP
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pF1KB9 SSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSRPRTTASVPRTTVWPVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGG
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pF1KB9 GSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSGGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCCSDGKTPSLDAEGSNCPATKVFQGVLEL
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pF1KB9 EGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGVEGQELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGPGKSV
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pF1KB9 RAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAFITGA
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pF1KB9 TSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAPTTRRPPTTAPSRVPG
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pF1KB9 RRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPAFEGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPAFEGR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFLAFPTLRAYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNARGKDFLALALLDGRVQLRFDTGSGP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPVLGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGPGAATRGSGVGECGDHPCLPNPCHG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKSPCQPNPCHGAAPCRVLPEGGAQCECPLGRE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRV
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       :::::::::::    :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDGPRVLGESPKSRKVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQLVSLGGR
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pF1KB9 QLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGPHCEKGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGPHCEKGL
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pF1KB9 VEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESE-------------------KALQSNHFELSL
       :::::::::::::::::::::::::::::                   ::::::::::::
NP_001 VEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESELANEIPVPETLDSGALHSEKALQSNHFELSL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTEATQGLVLWSGKATERADYVALAIVDGHLQLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNRWLRVVA
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pF1KB9 HREQREGSLQVGNEAPVTGSSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HREQREGSLQVGNEAPVTGSSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGTGFVGCL
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      2020      2030      2040     
pF1KB9 RDVVVGRHPLHLLEDAVTKPELRPCPTP
       ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDVVVGRHPLHLLEDAVTKPELRPCPTP
             2050      2060        

>>NP_005520 (OMIM: 142461,224410,255800) basement membra  (4391 aa)
 initn: 907 init1: 319 opt: 701  Z-score: 362.8  bits: 81.8 E(85289): 1.8e-13
Smith-Waterman score: 1203; 26.5% identity (50.3% similar) in 1601 aa overlap (552-2022:2847-4361)

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NP_005 AVHVPAPGGAPPIRIEPSSSRVAEGQTLDLKCVVPGQ--AHAQVTWHKRGGNLPARHQVH
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pF1KB9 VHACT-HQISLHVASAGPCETCGDAVCAFGAVCSAGQCVCPRCEHPPPG---PV---CGS
             .:.:   ..   :.. :..    ..:  . .   :    : ::   :.    .:
NP_005 GPLLRLNQVSPADSGEYSCQVTGSSGTLEASVLVTIEPSSPG-PIPAPGLAQPIYIEASS
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pF1KB9 DGVTYGSACELREAACLQ-QTQIEEARAGPCEQAECGSGGSGSG----EDGDCEQELCRQ
       . :: :.. .:  ..  : ..:.   . :    :.  . ::         .:  . .:: 
NP_005 SHVTEGQTLDLNCVVPGQAHAQVTWYKRGGSLPARHQTHGSQLRLHLVSPADSGEYVCRA
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pF1KB9 RGGIWDEDSEDGPCVCDFSCQSVPG--SPVCGSDGVTYSTECELKKA--RCESQRGLY-V
        .:   :.  .   .   :  :     ::: . :  . ::  . . :  .:  . :   .
NP_005 ASGPGPEQEASFTVTVPPSEGSSYRLRSPVISIDPPS-STVQQGQDASFKCLIHDGAAPI
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pF1KB9 AAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDN-----ITAARGVGLAGCPSACQCNPHG
       . .   :.  .     ..:     :  :   .:      .:. . :.:   :. . . ::
NP_005 SLEWKTRNQELEDNVHISPNGSIITIVGTRPSNHGTYRCVASNAYGVA--QSVVNLSVHG
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pF1KB9 SYGGTCDPATGQCSCRPGVG-GLRC-DRCEPGFWNFRGIVTDGRSGCTPCSCDPQGAVRD
           .  :  :    . : .  :.: .  ::     :. .   : . :: . . .     
NP_005 PPTVSVLPE-GPVWVKVGKAVTLECVSAGEP-----RSSARWTRISSTPAKLEQRTYGLM
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pF1KB9 DCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEA----DASAPATCA-EMRCEFGARC
       : . .  . : ::. ::     :    ::: :  ..    :..: :  : ... : .   
NP_005 DSHAVLQISSAKPSDAGTYV--CLAQNALGTAQKQVEVIVDTGAMAPGAPQVQAEEAELT
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pF1KB9 VEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKT-IACRQGLQISIQSLGPCQE
       :: . .:   :     :  .       . . . .. .  : :  : . : : : .  :. 
NP_005 VEAGHTATLRCSATGSPAPTIHWSKLRSPLPWQHRLEGDTLIIPRVAQQDSGQYI--CN-
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pF1KB9 AVAPSTHPTSASVT-VTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSST-----AHSQTTPPPSSR-P
       :..:. :  .. .  : .:      :  .:  :   :  ..     ::.  ::: . .  
NP_005 ATSPAGHAEATIILHVESP----PYATTVPEHASVQAGETVQLQCLAHG--TPPLTFQWS
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pF1KB9 RTTASVP-RTTVW-PVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGGGS
       :. .:.: :.:.   .:    .::  .      . .. ::... ..  ..:     :.  
NP_005 RVGSSLPGRATARNELLHFERAAPEDSGRYRCRVTNKVGSAEAFAQLLVQG---PPGSLP
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pF1KB9 GGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCC---SD-GKTPSLDAEGSNCPATKVFQ-GV
       .   :  .. ..   : .:  :   :.   :   :: :       ::.. :  .  : ::
NP_005 ATSIPAGSTPTVQVTPQLETKSIGASVEFHCAVPSDRGTQLRWFKEGGQLPPGHSVQDGV
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pF1KB9 LELEGVEGQ-ELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGP
       :...... . .  :  .   :    .:..  : . ... :    .:  ..:.  .. .  
NP_005 LRIQNLDQSCQGTYICQAHGP----WGKAQASAQLVIQAL---PSVLINIRT-SVQTVVV
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pF1KB9 GKSVRAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAF
       :..:.    .  ::        :. . ::   :   .: :: :    ::.. :   .   
NP_005 GHAVEFECLALGDPKPQVTWSKVG-GHLRPGIV---QSGGVVRI--AHVELADAGQYRCT
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pF1KB9 ITGATSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAP--TTRRP-PTT
        :.:      ::.:   .    :  .:. :.   :...  :...... :  ..  : :  
NP_005 ATNA------AGTTQSHVL---LLVQAL-PQISMPQEVRVPAGSAAVFPCIASGYPTPDI
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pF1KB9 APSRVPGRRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAP
       . :.. :  ::  .      ...  . .   ::   .: ..:.    .: .     : .:
NP_005 SWSKLDGSLPPDSRLE----NNMLMLPSVRPQD---AGTYVCTATNRQGKVKAFAHLQVP
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pF1KB9 ---VPAFEGR--SFLAFPTLR-AYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNAR--GK-------
          :: :     ::: .::.. ::. ... . ::    .:.:::::. :  :.       
NP_005 ERVVPYFTQTPYSFLPLPTIKDAYRKFEIKITFRPDSADGMLLYNGQKRVPGSPTNLANR
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pF1KB9 --DFLALALLDGRVQLRFDTGSGPAVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPV
         ::....:. :: ..:::.::: :..   .:.  :..: . : :   .:.: :   .::
NP_005 QPDFISFGLVGGRPEFRFDAGSGMATIRHPTPLALGHFHTVTLLRSLTQGSLIVGDLAPV
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pF1KB9 LGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPEDQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGP
        : : .  .::.:. .:..:: : : .:.   .. ...:. ::.: : ......   .  
NP_005 NGTSQGKFQGLDLNEELYLGGYP-DYGAIP--KAGLSSGFIGCVRELRIQGEEI---VFH
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pF1KB9 GAATRGSGVGECGDHPCLPNPCHGGAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKS-PCQPN
            . :...:    :   ::..:. :.. :.. . : :: : .:  :   ..  :.:.
NP_005 DLNLTAHGISHCPT--CRDRPCQNGGQCHDSESSSYVCVCPAGFTGSRCEHSQALHCHPE
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pF1KB9 PCHGAAPCRVLPEG-GAQCECPLGREGTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTF
        :   : :   :.: :  :.: ::: :  :.   :   . : :.  .  :.: : .:   
NP_005 ACGPDATCVNRPDGRGYTCRCHLGRSGLRCE--EGVTVTTPSLSGAG--SYLALPAL---
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pF1KB9 ARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYNGQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIR
         .  ... :.: :   .:.:.::..: :.    ::::::.   .:::::.::.: ::.:
NP_005 -TNTHHELRLDVEFKPLAPDGVLLFSGGKSGPVEDFVSLAMVGGHLEFRYELGSGLAVLR
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NP_001 ATSIPAGSTPTVQVTPQLETKSIGASVEFHCAVPSDRGTQLRWFKEGGQLPPGHSVQDGV
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       . :.. :  ::  .      ...  . .   ::   .: ..:.    .: .     : .:
NP_001 SWSKLDGSLPPDSRLE----NNMLMLPSVRPQD---AGTYVCTATNRQGKVKAFAHLQVP
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pF1KB9 LGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPEDQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGP
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NP_001 NGTSQGKFQGLDLNEELYLGGYP-DYGAIP--KAGLSSGFIGCVRELRIQGEEI---VFH
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NP_001 DLNLTAHGISHCPT--CRDRPCQNGGQCHDSESSSYVCVCPAGFTGSRCEHSQALHCHPE
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>>XP_016856609 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTED: b  (4456 aa)
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