Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9467
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9467, 1181 aa
1>>>pF1KB9467 1181 - 1181 aa - 1181 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0111+/-0.00141; mu= 17.9971+/- 0.084
mean_var=67.4040+/-13.382, 0's: 0 Z-trim(99.4): 66 B-trim: 341 in 1/47
Lambda= 0.156218
statistics sampled from 5670 (5734) to 5670 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16
Scan time: 4.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5 (1181) 7727 1751.6 0
CCDS72869.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1167) 2280 524.0 8.4e-148
CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15 (1188) 2042 470.3 1.2e-131
CCDS76204.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1024) 1886 435.2 4e-121
CCDS3955.1 ITGA1 gene_id:3672|Hs108|chr5 (1179) 1742 402.7 2.7e-111
CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17 (1179) 1012 238.2 9e-62
CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152) 907 214.5 1.2e-54
CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163) 843 200.1 2.6e-50
CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1169) 843 200.1 2.6e-50
CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1086) 777 185.2 7.3e-46
CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153) 777 185.2 7.7e-46
CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1170) 769 183.4 2.7e-45
CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161) 741 177.1 2.2e-43
CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (1032) 569 138.3 9e-32
CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3 (1035) 547 133.4 2.8e-30
CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17 (1039) 481 118.5 8.5e-26
CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17 (1051) 461 114.0 1.9e-24
CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063) 459 113.5 2.7e-24
CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12 (1049) 408 102.1 7.7e-21
CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002) 400 100.2 2.6e-20
CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012) 400 100.2 2.6e-20
CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048) 400 100.2 2.7e-20
CCDS34938.1 COL14A1 gene_id:7373|Hs108|chr8 (1796) 275 72.1 1.3e-11
>>CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5 (1181 aa)
initn: 7727 init1: 7727 opt: 7727 Z-score: 9401.5 bits: 1751.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7727; 100.0% identity (100.0% similar) in 1181 aa overlap (1-1181:1-1181)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGPERTGAAPLPLLLVLALSQGILNCCLAYNVGLPEAKIFSGPSSEQFGYAVQQFINPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MGPERTGAAPLPLLLVLALSQGILNCCLAYNVGLPEAKIFSGPSSEQFGYAVQQFINPKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NWLLVGSPWSGFPENRMGDVYKCPVDLSTATCEKLNLQTSTSIPNVTEMKTNMSLGLILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NWLLVGSPWSGFPENRMGDVYKCPVDLSTATCEKLNLQTSTSIPNVTEMKTNMSLGLILT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RNMGTGGFLTCGPLWAQQCGNQYYTTGVCSDISPDFQLSASFSPATQPCPSLIDVVVVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RNMGTGGFLTCGPLWAQQCGNQYYTTGVCSDISPDFQLSASFSPATQPCPSLIDVVVVCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ESNSIYPWDAVKNFLEKFVQGLDIGPTKTQVGLIQYANNPRVVFNLNTYKTKEEMIVATS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 ESNSIYPWDAVKNFLEKFVQGLDIGPTKTQVGLIQYANNPRVVFNLNTYKTKEEMIVATS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QTSQYGGDLTNTFGAIQYARKYAYSAASGGRRSATKVMVVVTDGESHDGSMLKAVIDQCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 QTSQYGGDLTNTFGAIQYARKYAYSAASGGRRSATKVMVVVTDGESHDGSMLKAVIDQCN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 HDNILRFGIAVLGYLNRNALDTKNLIKEIKAIASIPTERYFFNVSDEAALLEKAGTLGEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 HDNILRFGIAVLGYLNRNALDTKNLIKEIKAIASIPTERYFFNVSDEAALLEKAGTLGEQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 IFSIEGTVQGGDNFQMEMSQVGFSADYSSQNDILMLGAVGAFGWSGTIVQKTSHGHLIFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 IFSIEGTVQGGDNFQMEMSQVGFSADYSSQNDILMLGAVGAFGWSGTIVQKTSHGHLIFP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KQAFDQILQDRNHSSYLGYSVAAISTGESTHFVAGAPRANYTGQIVLYSVNENGNITVIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 KQAFDQILQDRNHSSYLGYSVAAISTGESTHFVAGAPRANYTGQIVLYSVNENGNITVIQ
430 440 450 460 470 480
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pF1KB9 AHRGDQIGSYFGSVLCSVDVDKDTITDVLLVGAPMYMSDLKKEEGRVYLFTIKEGILGQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 AHRGDQIGSYFGSVLCSVDVDKDTITDVLLVGAPMYMSDLKKEEGRVYLFTIKEGILGQH
490 500 510 520 530 540
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pF1KB9 QFLEGPEGIENTRFGSAIAALSDINMDGFNDVIVGSPLENQNSGAVYIYNGHQGTIRTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 QFLEGPEGIENTRFGSAIAALSDINMDGFNDVIVGSPLENQNSGAVYIYNGHQGTIRTKY
550 560 570 580 590 600
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pF1KB9 SQKILGSDGAFRSHLQYFGRSLDGYGDLNGDSITDVSIGAFGQVVQLWSQSIADVAIEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 SQKILGSDGAFRSHLQYFGRSLDGYGDLNGDSITDVSIGAFGQVVQLWSQSIADVAIEAS
610 620 630 640 650 660
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pF1KB9 FTPEKITLVNKNAQIILKLCFSAKFRPTKQNNQVAIVYNITLDADGFSSRVTSRGLFKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 FTPEKITLVNKNAQIILKLCFSAKFRPTKQNNQVAIVYNITLDADGFSSRVTSRGLFKEN
670 680 690 700 710 720
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pF1KB9 NERCLQKNMVVNQAQSCPEHIIYIQEPSDVVNSLDLRVDISLENPGTSPALEAYSETAKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NERCLQKNMVVNQAQSCPEHIIYIQEPSDVVNSLDLRVDISLENPGTSPALEAYSETAKV
730 740 750 760 770 780
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pF1KB9 FSIPFHKDCGEDGLCISDLVLDVRQIPAAQEQPFIVSNQNKRLTFSVTLKNKRESAYNTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 FSIPFHKDCGEDGLCISDLVLDVRQIPAAQEQPFIVSNQNKRLTFSVTLKNKRESAYNTG
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pF1KB9 IVVDFSENLFFASFSLPVDGTEVTCQVAASQKSVACDVGYPALKREQQVTFTINFDFNLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 IVVDFSENLFFASFSLPVDGTEVTCQVAASQKSVACDVGYPALKREQQVTFTINFDFNLQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NLQNQASLSFQALSESQEENKADNLVNLKIPLLYDAEIHLTRSTNINFYEISSDGNVPSI
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pF1KB9 VHSFEDVGPKFIFSLKVTTGSVPVSMATVIIHIPQYTKEKNPLMYLTGVQTDKAGDISCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VHSFEDVGPKFIFSLKVTTGSVPVSMATVIIHIPQYTKEKNPLMYLTGVQTDKAGDISCN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 ADINPLKIGQTSSSVSFKSENFRHTKELNCRTASCSNVTCWLKDVHMKGEYFVNVTTRIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 ADINPLKIGQTSSSVSFKSENFRHTKELNCRTASCSNVTCWLKDVHMKGEYFVNVTTRIW
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pF1KB9 NGTFASSTFQTVQLTAAAEINTYNPEIYVIEDNTVTIPLMIMKPDEKAEVPTGVIIGSII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NGTFASSTFQTVQLTAAAEINTYNPEIYVIEDNTVTIPLMIMKPDEKAEVPTGVIIGSII
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180
pF1KB9 AGILLLLALVAILWKLGFFKRKYEKMTKNPDEIDETTELSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 AGILLLLALVAILWKLGFFKRKYEKMTKNPDEIDETTELSS
1150 1160 1170 1180
>>CCDS72869.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1167 aa)
initn: 1870 init1: 954 opt: 2280 Z-score: 2767.0 bits: 524.0 E(32554): 8.4e-148
Smith-Waterman score: 2347; 34.8% identity (65.6% similar) in 1186 aa overlap (13-1172:9-1158)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGPERTGAAPLPLLLVLALSQGILNCCLAYNVGLPEAKIFSGPSSEQFGYAVQQFINPKG
:.: :.. :. : .:. . ..: :: .:::.: : ..
CCDS72 MELPFVTHLFLPLVFLTGL---CSPFNLDEHHPRLFPGPPEAEFGYSVLQHVGGGQ
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pF1KB9 NWLLVGSPWSGFPENRMGDVYKCPVDLS-TATCEKLNLQTSTSIPNVTEMKTNMSLGLIL
:.:::.::.: .: ::::.::: . .: : : .: . .. : .. .:: ::. :
CCDS72 RWMLVGAPWDGPSGDRRGDVYRCPVGGAHNAPCAKGHLG-DYQLGNSSHPAVNMHLGMSL
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120 130 140 150 160 170
pF1KB9 TRNMGTGGFLTCGPLWAQQCGNQYYTTGVCSDISPDFQLSASFSPATQPCPSLIDVVVVC
.. : :::..:.:::.. ::.. ...:.:. .. .:: ..:..:..: ::. .:::.:
CCDS72 LETDGDGGFMACAPLWSRACGSSVFSSGICARVDASFQPQGSLAPTAQRCPTYMDVVIVL
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pF1KB9 DESNSIYPWDAVKNFLEKFVQGLDIGPTKTQVGLIQYANNPRVVFNLNTYKTKEEMIVAT
: :::::::. :..::...: : : : . ::::.::...: ..:. ..::::.. :.
CCDS72 DGSNSIYPWSEVQTFLRRLVGKLFIDPEQIQVGLVQYGESPVHEWSLGDFRTKEEVVRAA
180 190 200 210 220 230
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pF1KB9 SQTSQYGGDLTNTFGAIQYARKYAYSAASGGRRSATKVMVVVTDGESHDGSMLKAVIDQC
.. :. : :.: ::. : ..: . ::: :....::::::::::: : :.. :
CCDS72 KNLSRREGRETKTAQAIMVACTEGFSQSHGGRPEAARLLVVVTDGESHDGEELPAALKAC
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 NHDNILRFGIAVLGYLNRNALDTKNLIKEIKAIASIPTERYFFNVSDEAALLEKAGTLGE
. . :.::::::. : : .....::..::: : ::.::::.::::: . . .::.
CCDS72 EAGRVTRYGIAVLGHYLRRQRDPSSFLREIRTIASDPDERFFFNVTDEAALTDIVDALGD
300 310 320 330 340 350
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pF1KB9 QIFSIEGT-VQGGDNFQMEMSQVGFSADYSSQNDILMLGAVGAFGWSGTIVQKTSHGHLI
.::..::. ... ..: .::::.:::. .: ...: :::. :.:... :: .
CCDS72 RIFGLEGSHAENESSFGLEMSQIGFSTHR--LKDGILFGMVGAYDWGGSVLW-LEGGHRL
360 370 380 390 400
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pF1KB9 FP-----KQAFDQILQDRNHSSYLGYSVAAIST-GESTHFVAGAPRANYTGQIVLYSVNE
:: .. : :: ::..::::::... : :..:::: . :... .....
CCDS72 FPPRMALEDEFPPALQ--NHAAYLGYSVSSMLLRGGRRLFLSGAPRFRHRGKVIAFQLKK
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pF1KB9 NGNITVIQAHRGDQIGSYFGSVLCSVDVDKDTITDVLLVGAPMYMSDLKKEEGRVYLFTI
.: . : :. .:.:::::::: :: .:.:.: ::::::.:::... .:: ::::.. .
CCDS72 DGAVRVAQSLQGEQIGSYFGSELCPLDTDRDGTTDVLLVAAPMFLGPQNKETGRVYVYLV
470 480 490 500 510 520
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pF1KB9 KEGILGQHQFLEGPEGIENTRFGSAIAALSDINMDGFNDVIVGSPLENQNSGAVYIYNGH
. : : :: ...::: :..:: :.:.::: :: ::.:::. ..::.:.:.:
CCDS72 GQQSLLTLQGTLQPEPPQDARFGFAMGALPDLNQDGFADVAVGAPLEDGHQGALYLYHGT
530 540 550 560 570 580
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pF1KB9 QGTIRTKYSQKILGSDGAFRSHLQYFGRSLDGYGDLNGDSITDVSIGAFGQVVQLWSQSI
:. .: . .:.: .. .. :.:::::.:: ::.::...::..:: : .. : :. :
CCDS72 QSGVRPHPAQRIAAA--SMPHALSYFGRSVDGRLDLDGDDLVDVAVGAQGAAILLSSRPI
590 600 610 620 630 640
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pF1KB9 ADVAIEASFTPEKITLVNKNAQ--------IILKLCFSAKFR-PTKQNNQVAIVYNITLD
. .. ::. :..:... . . :::.. : : . ..: . .. .::
CCDS72 VHLTPSLEVTPQAISVVQRDCRRRGQEAVCLTAALCFQVTSRTPGRWDHQFYMRFTASLD
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pF1KB9 ADGFSSRVTSRGLFKENNERCLQKNMVVNQAQSCPEHIIYIQEPSDVVNSLDLRVDISLE
..:.. : .. . : :. . :... .: . ... . :: . . : : ..:.
CCDS72 EWTAGARAAFDGSGQRLSPRRLR--LSVGNV-TCEQLHFHVLDTSDYLRPVALTVTFALD
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810
pF1KB9 N---PGTSPALEAYSETAKVFSIPFHKDCGEDGLCISDLVLDVRQ-IPAAQEQPFIVSNQ
: :: :.:. : :. .:: :::: :. :..::::.: . : .... ::.: .
CCDS72 NTTKPG--PVLNEGSPTSIQKLVPFSKDCGPDNECVTDLVLQVNMDIRGSRKAPFVVRGG
770 780 790 800 810 820
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pF1KB9 NKRLTFSVTLKNKRESAYNTGIVVDFSENLFFASFSLPVDGTEVTCQVAA-SQKSVACDV
... :.::.:..:.::::.. . ::.:: .::.. : . . . :: : .. :.:
CCDS72 RRKVLVSTTLENRKENAYNTSLSLIFSRNLHLASLT-PQRESPIKVECAAPSAHARLCSV
830 840 850 860 870
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pF1KB9 GYPALKREQQVTFTINFDFNLQNLQNQASLSFQALSESQEENKA--DNLVNLKIPLLYDA
:.:... .::: ..:.:. ..: .:. ... : :.: :.: . :: .. . . :.
CCDS72 GHPVFQTGAKVTFLLEFEFSCSSLLSQVFVKLTASSDSLERNGTLQDNTAQTSAYIQYEP
880 890 900 910 920 930
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 EIHLTRSTNINFYEISSDGNVPSIVHSFEDVGPKFIFSLKVTT-GSVPVSMATVIIHIPQ
.. .. .... ::. :..: ::.: .:.: . : :: . .:
CCDS72 HLLFSSESTLHRYEVHPYGTLPV------GPGPEFKTTLRVQNLGCYVVSGLIISALLPA
940 950 960 970 980 990
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB9 YTKEKNPLMYLTGVQTDKAGDISCNADINPLKIGQTSSSVSFKSENFRHTKELNCRTASC
.. : .. :. : :..:. : : : : . :...::..:: ...:
CCDS72 VAHGGNYFLSLSQVITNNASCIVQNLTEPP---GPP-----VHPEELQHTNRLNGSNTQC
1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KB9 SNVTCWLKDVHMKGEYFVNVTTRIWNGTFASSTFQTVQLTAAAEINTYNPEIY-VIEDNT
. : : : .. : :.. . : : . :... .... :..: . . . : .
CCDS72 QVVRCHLGQLAKGTEVSVGLLRLVHNEFFRRAKFKSLTVVSTFELGTEEGSVLQLTEASR
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB9 VTIPLMIMKPDEKAEVPTGVIIGSIIAGILLLLALVAILWKLGFFKRKYEKMTKNPDEID
. :. . . . ..:::...:.::: :: ::::::: .: : :.:
CCDS72 WSESLLEVVQTRPILISLWILIGSVLGGLLLLALLVFCLWKLGFFAHK-----KIPEEEK
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1180
pF1KB9 ETTELSS
CCDS72 REEKLEQ
>>CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15 (1188 aa)
initn: 1908 init1: 591 opt: 2042 Z-score: 2477.0 bits: 470.3 E(32554): 1.2e-131
Smith-Waterman score: 2471; 35.9% identity (67.2% similar) in 1217 aa overlap (10-1178:4-1188)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGPERTGAAPLPLLLVLALS--QGILNCCLAYNVGLPEAKIFSGPSSEQFGYAVQQFINP
: :... ::: :. . ..:. . ... : . :::.::: .
CCDS45 MDLPRGLVVAWALSLWPGFTD---TFNMDTRKPRVIPGSRTAFFGYTVQQH-DI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 KGN-WLLVGSPWSGFPENRMGDVYKCPVDLSTATCEKLNLQTSTSIPNVTEMKTNMSLGL
.:: ::.::.: .. :::::::: ..: :::: : . ::.: : :: :::
CCDS45 SGNKWLVVGAPLETNGYQKTGDVYKCPV--IHGNCTKLNLGRVT-LSNVSERKDNMRLGL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 ILTRNMGTGGFLTCGPLWAQQCGNQYYTTGVCSDISPDFQLSASFSPATQPCPSLIDVVV
:. : ..::.:.:::...::..:::::.:: .. .:..: . .:: : : . .:.:.
CCDS45 SLATNPKDNSFLACSPLWSHECGSSYYTTGMCSRVNSNFRFSKTVAPALQRCQTYMDIVI
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CCDS45 LWKLGFFRSARRRREPGLDPTPKVLE
1170 1180
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CCDS39 KWVLIGSPLVGQPKNRTGDVYKCPVGRGESLPCVKLDLPVNTSIPNVTEVKENMTFGSTL
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CCDS39 DGSNSIYPWDSVTAFLNDLLERMDIGPKQTQVGIVQYGENVTHEFNLNKYSSTEEVLVAA
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CCDS39 KKIVQRGGRQTMTALGIDTARKEAFTEARGARRGVKKVMVIVTDGESHDNHRLKKVIQDC
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CCDS39 EDENIQRFSIAILGSYNRGNLSTEKFVEEIKSIASEPTEKHFFNVSDELALVTIVKTLGE
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CCDS39 RIFALEATADQSAASFEMEMSQTGFSAHYS--QDWVMLGAVGAYDWNGTVVMQKASQ--I
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CCDS39 IIPRNTTFNVESTKKNEPLASYLGYTVNSATASSGD-VLYIAGQPRYNHTGQVIIYRM-E
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CCDS39 DGNIKILQTLSGEQIGSYFGSILTTTDIDKDSNTDILLVGAPMYMGTEKEEQGKVYVYAL
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CCDS39 GAPLEDDHGGAVYIYHGSGKTIRKEYAQRIPSGGDG---KTLKFFGQSIHGEMDLNGDGL
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CCDS39 TDVTIGGLGGAALFWSRDVAVVKVTMNFEPNKVNIQKKNCHMEGKETVCINATVCFDVKL
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pF1KB9 RPTKQNN--QVAIVYNITLDADGFSSRVTSRGLFKENNERCLQKNMVVNQAQSCPEHIIY
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CCDS39 K-SKEDTIYEADLQYRVTLD----SLRQISRSFFSGTQERKVQRNITVRKSE-CTKHSFY
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CCDS39 MLDKHDFQDSVRITLDFNLTDPENGPVLDDSLPNSVHEYIPFAKDCGNKEKCISDLSL--
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CCDS39 -HVATTEKDLLIVRSQNDKFNVSLTVKNTKDSAYNTRTIVHYSPNLVFSGIEAIQKD---
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CCDS39 -SCE---SNHNITCKVGYPFLRRGEMVTFKILFQFNTSYLMENVTIYLSATSDSEEPPET
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CCDS39 GFFKRPLKKKMEK
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CCDS32 N
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CCDS45 ALITAALYKLGFFKRQYKDMMSEGGPPGAEPQ
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CCDS10 SWVVVGAPQKITAANQTGGLYQC--GYSTGACEPIGLQ----VP---PEAVNMSLGLSLA
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CCDS10 STTSPSQLLACGPTVHHECGRNMYLTGLCFLLGPT-QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLI
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CCDS10 DGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQFQ-RPS-TQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLS
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CCDS10 LLASVHQLQG-FTYTATAIQNVVHRLFHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVI
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CCDS10 PMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSW------KELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQN
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CCDS10 GAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQS-LVLGAPRYQHTGKAVIF
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CCDS10 T--QVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGAPHYYEQTRG--GQV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]