Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9425
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9425, 737 aa
1>>>pF1KB9425 737 - 737 aa - 737 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0755+/-0.00133; mu= -3.8850+/- 0.077
mean_var=300.3414+/-69.570, 0's: 0 Z-trim(108.6): 659 B-trim: 110 in 1/49
Lambda= 0.074006
statistics sampled from 9547 (10298) to 9547 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 4.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 5079 557.1 3.4e-158
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 1747 201.4 4e-51
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 1535 178.7 2.6e-44
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 1534 178.6 2.8e-44
CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 673) 1526 177.8 5e-44
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 ( 697) 1366 160.7 7.1e-39
CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 ( 676) 1351 159.1 2.1e-38
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 581) 1317 155.4 2.3e-37
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 706) 1317 155.5 2.7e-37
CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 409) 1271 150.3 5.4e-36
CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 488) 1271 150.4 6.2e-36
CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 592) 1271 150.5 7.1e-36
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 936) 1206 143.7 1.2e-33
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 984) 1206 143.7 1.3e-33
CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3 ( 596) 1184 141.2 4.5e-33
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 1122 134.5 3.8e-31
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 1117 133.9 5.3e-31
CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 942) 1099 132.3 3.4e-30
CCDS42514.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 948) 1099 132.3 3.4e-30
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 1079 129.9 9.1e-30
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 1072 129.2 1.5e-29
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 427) 1002 121.6 2.5e-27
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 367) 995 120.8 3.7e-27
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 995 120.9 4.2e-27
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 995 120.9 4.3e-27
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 995 120.9 4.4e-27
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 995 120.9 4.6e-27
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 995 121.0 4.9e-27
CCDS6908.1 PKN3 gene_id:29941|Hs108|chr9 ( 889) 975 119.0 3.2e-26
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 928 113.8 6.2e-25
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 928 113.8 6.4e-25
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 928 113.8 6.9e-25
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 902 111.0 4.4e-24
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 875 108.3 4.5e-23
CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 549) 872 107.9 4.5e-23
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 874 108.2 4.9e-23
CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 802) 872 108.0 6e-23
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 865 107.2 9.6e-23
CCDS62272.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 502) 841 104.5 4.2e-22
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 836 104.1 8.1e-22
CCDS73313.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 765) 833 103.8 1e-21
CCDS8073.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 772) 833 103.8 1e-21
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 831 103.6 1.2e-21
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 821 102.2 1.4e-21
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 821 102.2 1.4e-21
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 826 103.1 1.7e-21
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 338) 818 101.9 1.7e-21
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 818 101.9 1.7e-21
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 818 101.9 1.8e-21
CCDS55610.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 355) 818 101.9 1.8e-21
>>CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 (737 aa)
initn: 5079 init1: 5079 opt: 5079 Z-score: 2953.5 bits: 557.1 E(32554): 3.4e-158
Smith-Waterman score: 5079; 100.0% identity (100.0% similar) in 737 aa overlap (1-737:1-737)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MVVFNGLLKIKICEAVSLKPTAWSLRHAVGPRPQTFLLDPYIALNVDDSRIGQTATKQKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MVVFNGLLKIKICEAVSLKPTAWSLRHAVGPRPQTFLLDPYIALNVDDSRIGQTATKQKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NSPAWHDEFVTDVCNGRKIELAVFHDAPIGYDDFVANCTIQFEELLQNGSRHFEDWIDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NSPAWHDEFVTDVCNGRKIELAVFHDAPIGYDDFVANCTIQFEELLQNGSRHFEDWIDLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 PEGRVYVIIDLSGSSGEAPKDNEERVFRERMRPRKRQGAVRRRVHQVNGHKFMATYLRQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PEGRVYVIIDLSGSSGEAPKDNEERVFRERMRPRKRQGAVRRRVHQVNGHKFMATYLRQP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TYCSHCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAGLKKQETPDQVGSQRFSVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TYCSHCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAGLKKQETPDQVGSQRFSVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 MPHKFGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHRRCETNVAPNCGVDARGIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MPHKFGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHRRCETNVAPNCGVDARGIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KVLADLGVTPDKITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGSSPSEEDRSKSAPTSPCDQEIKELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KVLADLGVTPDKITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGSSPSEEDRSKSAPTSPCDQEIKELE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 NNIRKALSFDNRGEEHRAASSPDGQLMSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFNFIKVLGKGSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NNIRKALSFDNRGEEHRAASSPDGQLMSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFNFIKVLGKGSFG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQDDDVDCTMTEKRILALARKHPYLTQLYCCFQTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQDDDVDCTMTEKRILALARKHPYLTQLYCCFQTKD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 RLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYRDLKLDNILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYRDLKLDNILL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 DAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTTFCGTPDYIAPEILQELEYGPSVDWWALGVLMYEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 DAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTTFCGTPDYIAPEILQELEYGPSVDWWALGVLMYEM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 MAGQPPFEADNEDDLFESILHDDVLYPVWLSKEAVSILKAFMTKNPHKRLGCVASQNGED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MAGQPPFEADNEDDLFESILHDDVLYPVWLSKEAVSILKAFMTKNPHKRLGCVASQNGED
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 AIKQHPFFKEIDWVLLEQKKIKPPFKPRIKTKRDVNNFDQDFTREEPVLTLVDEAIVKQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AIKQHPFFKEIDWVLLEQKKIKPPFKPRIKTKRDVNNFDQDFTREEPVLTLVDEAIVKQI
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB9 NQEEFKGFSYFGEDLMP
:::::::::::::::::
CCDS18 NQEEFKGFSYFGEDLMP
730
>>CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 (683 aa)
initn: 2498 init1: 1394 opt: 1747 Z-score: 1031.3 bits: 201.4 E(32554): 4e-51
Smith-Waterman score: 3085; 61.3% identity (82.2% similar) in 737 aa overlap (4-737:8-683)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MVVFNGLLKIKICEAVSLKPTAWSLRHAVGPRPQTFLLDPYIALNVDDSRIGQTAT
::: :...: :::.:.:: :::::.. . . :::::....::. :.:::.:
CCDS97 MSSGTMKFNGYLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQ-LLDPYLTVSVDQVRVGQTST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 KQKTNSPAWHDEFVTDVCNGRKIELAVFHDAPIGYDDFVANCTIQFEELLQN--GSRHFE
:::::.:....:: ..: .: ..::::::..:.::: ::::::.::.:::.. .: ::
CCDS97 KQKTNKPTYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTTGASDTFE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 DWIDLEPEGRVYVIIDLSGSSGEAPKDNEERVFRERMRPRKRQGAVRRRVHQVNGHKFMA
:.::::::.:.:.: :.:: :: . ..:.:.. : ::: :.::::::.:::::::
CCDS97 GWVDLEPEGKVFVVITLTGSFTEATLQ-RDRIFKHFTR--KRQRAMRRRVHQINGHKFMA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TYLRQPTYCSHCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAGLKKQETPD-QVG
:::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::.::.: :. .. . : ...
CCDS97 TYLRQPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 SQRFSVNMPHKFGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHRRCETNVAPNCG
:::..:.::::.:::::::::::::::::::..:::::::.:::::: ::..:::::::
CCDS97 EQRFGINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 VDARGIAKVLADLGVTPDKITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGSSPSEEDRSKSAPTSPCD
:.: .::.:: .:. : .: ::. . :.:.
CCDS97 VNAVELAKTLAGMGLQPGNI-----------------------SPTSKLVSRST------
300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 QEIKELENNIRKALSFDNRGEEHRAASSPDGQLMSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFNFIKV
.:. .:.: :: .: :: . ....:::.:.:.::.:
CCDS97 ---------LRR------QGKE----SSKEG-------NG-IGVNSSNRLGIDNFEFIRV
330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 LGKGSFGKVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQDDDVDCTMTEKRILALARKHPYLTQLY
::::::::::::..: ..:::::::::::::::::.:::::::::.:::.::.::::.
CCDS97 LGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLF
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 CCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYRDL
::::: ::::::::.::::::::.::.::.::: :.::::::. :::::::..:.:::::
CCDS97 CCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDL
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 KLDNILLDAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTTFCGTPDYIAPEILQELEYGPSVDWWAL
::::.::: :::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::. :::.:::::.
CCDS97 KLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAM
490 500 510 520 530 540
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 GVLMYEMMAGQPPFEADNEDDLFESILHDDVLYPVWLSKEAVSILKAFMTKNPHKRLGCV
:::.:::. :. ::::.:::::::.::.:.:.::.:: ..:..:::.:::::: ::: .
CCDS97 GVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSL
550 560 570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 ASQNGEDAIKQHPFFKEIDWVLLEQKKIKPPFKPRIKTKRDVNNFDQDFTREEPVLTLVD
.:.:: :: .:::::::::. :....:.:::.::::...::.::: :: .:::::: .:
CCDS97 -TQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPID
610 620 630 640 650
720 730
pF1KB9 EAIVKQINQEEFKGFSYFGEDLMP
:. . .:::.::..::: . .:.:
CCDS97 EGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
660 670 680
>>CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 (672 aa)
initn: 1732 init1: 1235 opt: 1535 Z-score: 909.1 bits: 178.7 E(32554): 2.6e-44
Smith-Waterman score: 1979; 48.2% identity (69.7% similar) in 651 aa overlap (156-730:22-658)
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 YVIIDLSGSSGEAPKDNEERVFRERMRPRKRQGAVRRR-VHQVNGHKFMATYLRQPTYCS
:.::.:.. ::.:. :::.: ...:::.::
CCDS11 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCS
10 20 30 40 50
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 HCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAGLKKQETPDQVGSQRFSVNMPHK
:: ::::: .::::.::::: ::::::::.. .: : : :. :. ::
CCDS11 HCTDFIWG-FGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDDPRSK-------HK
60 70 80 90 100
250 260 270 280 290
pF1KB9 FGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHRRCETNVAPNCGVD---ARG---
: ::.: :::::::::::.::..::..: .: ::::..: :: ::.: ::
CCDS11 FKIHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIY
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330
pF1KB9 IAKVLAD--LGVT-----------PDKIT-------------NSGQRRKKLIAGAESPQP
. .:: : :: :. .. : .... : : .. .::
CCDS11 LKAEVADEKLHVTVRDAKNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQW
170 180 190 200 210 220
340 350 360 370
pF1KB9 ASGSS----PSEEDRSKSAPTSPCDQEIKELENNIRKALSF------------------D
. . ::..:: :. :. . :.. .::: .
CCDS11 NESFTFKLKPSDKDRRLSVEIWDWDRTTR---NDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQ
230 240 250 260 270 280
380 390 400
pF1KB9 NRGEEH--------------------RAASSPDG-QLMSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFN
..:: . .: .: : ...::.:. . ... :. : .::
CCDS11 EEGEYYNVPIPEGDEEGNMELRQKFEKAKLGPAGNKVISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFN
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 FIKVLGKGSFGKVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQDDDVDCTMTEKRILALARKHPYL
:. :::::::::::::. :: .:.::.:.:::::..:::::.:::.:::.::: : :.:
CCDS11 FLMVLGKGSFGKVMLADRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFL
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 TQLYCCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVI
:::. :::: :::.::::::::::::..::. :: ::.. :::::.. .:.:::..:.:
CCDS11 TQLHSCFQTVDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGII
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 YRDLKLDNILLDAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTTFCGTPDYIAPEILQELEYGPSVD
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CCDS28 KSTFDAHIYEGRVIQIVLMRAAEEPVSEVTVGVSVLAERCKKNNGKA-EFWLDLQPQAKV
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CCDS28 LMSVQYFLEDVDCKQSMRSEDEAKFPTM---NRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTF
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CCDS28 CSVCKDFVWG-LNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAANSRDTIFQKERFNIDMP
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CCDS28 HRFKVHNYMSPTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCEDCGMNVHHKCREKVANLCGINQKLLAEA
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: ...:. ..:: : :: . : .
CCDS28 L-------NQVTQRASRR-----------------------SDSASSEPV---------G
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CCDS28 IYQGF------EKKTGVAGEDMQDNS-GTYGKIWEGSSK-CNINNFIFHKVLGKGSFGKV
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CCDS28 LLGELKGRGEYFAIKALKKDVVLIDDDVECTMVEKRVLTLAAENPFLTHLICTFQTKDHL
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CCDS28 FFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEIMCGLQFLHSKGIIYRDLKLDNVLLDR
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CCDS28 DGHIKIADFGMCKENIFGESRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYTFSVDWWSFGVLLYEMLI
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CCDS28 GQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFEREPTKRLGVTGN------I
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]