Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9418
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9418, 619 aa
1>>>pF1KB9418 619 - 619 aa - 619 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0978+/-0.000946; mu= 7.4385+/- 0.057
mean_var=158.5860+/-31.744, 0's: 0 Z-trim(110.8): 77 B-trim: 323 in 2/50
Lambda= 0.101845
statistics sampled from 11817 (11894) to 11817 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 3.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9374.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 ( 619) 3993 598.8 6.9e-171
CCDS45043.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 ( 595) 3058 461.4 1.5e-129
CCDS14617.1 ELF4 gene_id:2000|Hs108|chrX ( 663) 1117 176.2 1.2e-43
CCDS82954.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 593) 981 156.2 1.1e-37
CCDS3745.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 533) 870 139.9 8.3e-33
CCDS3744.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 581) 801 129.8 1e-29
CCDS64062.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 521) 793 128.6 2.1e-29
CCDS64063.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 504) 698 114.6 3.2e-25
CCDS14283.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX ( 428) 395 70.0 7.1e-12
>>CCDS9374.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 (619 aa)
initn: 3993 init1: 3993 opt: 3993 Z-score: 3181.4 bits: 598.8 E(32554): 6.9e-171
Smith-Waterman score: 3993; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (1-619:1-619)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAAVVQQNDLVFEFASNVMEDERQLGDPAIFPAVIVEHVPGADILNSYAGLACVEEPNDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MAAVVQQNDLVFEFASNVMEDERQLGDPAIFPAVIVEHVPGADILNSYAGLACVEEPNDM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDETIETIEAAEALLNMDSPGPMLDEKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDETIETIEAAEALLNMDSPGPMLDEKRI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NNNIFSSPEDDMVVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQEKYADSPGASSPEQPKRKKGRKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 NNNIFSSPEDDMVVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQEKYADSPGASSPEQPKRKKGRKT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KPPRPDSPATTPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKWTQREKGIFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 KPPRPDSPATTPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKWTQREKGIFKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 VDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLIYIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLIYIN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSRSRVSSSPGVKGGATTVLKPGNSKAAKPKDPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSRSRVSSSPGVKGGATTVLKPGNSKAAKPKDPVE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 VAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEGEAARTSTMQDETLNSSVQSIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEGEAARTSTMQDETLNSSVQSIRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 IQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSAGTGSQKFILQAIPSSQPMTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 IQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSAGTGSQKFILQAIPSSQPMTVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KENVMLQSQKAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTICNGTVSVASSPSFSATAPVVTFSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 KENVMLQSQKAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTICNGTVSVASSPSFSATAPVVTFSPR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 SSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQEVEKKESEDHLKENTEKTEQQPQPYVMVVSSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQEVEKKESEDHLKENTEKTEQQPQPYVMVVSSSN
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB9 GFTSQVAMKQNELLEPNSF
:::::::::::::::::::
CCDS93 GFTSQVAMKQNELLEPNSF
610
>>CCDS45043.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 (595 aa)
initn: 3058 init1: 3058 opt: 3058 Z-score: 2439.2 bits: 461.4 E(32554): 1.5e-129
Smith-Waterman score: 3781; 96.1% identity (96.1% similar) in 619 aa overlap (1-619:1-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAAVVQQNDLVFEFASNVMEDERQLGDPAIFPAVIVEHVPGADILNSYAGLACVEEPNDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAAVVQQNDLVFEFASNVMEDERQLGDPAIFPAVIVEHVPGADILNSYAGLACVEEPNDM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDETIETIEAAEALLNMDSPGPMLDEKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDETIETIEAAEALLNMDSPGPMLDEKRI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NNNIFSSPEDDMVVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQEKYADSPGASSPEQPKRKKGRKT
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 N------------------------GIPEVMETQQVQEKYADSPGASSPEQPKRKKGRKT
130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KPPRPDSPATTPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKWTQREKGIFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KPPRPDSPATTPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKWTQREKGIFKL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 VDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLIYIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLIYIN
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSRSRVSSSPGVKGGATTVLKPGNSKAAKPKDPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSRSRVSSSPGVKGGATTVLKPGNSKAAKPKDPVE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 VAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEGEAARTSTMQDETLNSSVQSIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEGEAARTSTMQDETLNSSVQSIRT
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 IQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSAGTGSQKFILQAIPSSQPMTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSAGTGSQKFILQAIPSSQPMTVL
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KENVMLQSQKAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTICNGTVSVASSPSFSATAPVVTFSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KENVMLQSQKAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTICNGTVSVASSPSFSATAPVVTFSPR
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 SSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQEVEKKESEDHLKENTEKTEQQPQPYVMVVSSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQEVEKKESEDHLKENTEKTEQQPQPYVMVVSSSN
520 530 540 550 560 570
610
pF1KB9 GFTSQVAMKQNELLEPNSF
:::::::::::::::::::
CCDS45 GFTSQVAMKQNELLEPNSF
580 590
>>CCDS14617.1 ELF4 gene_id:2000|Hs108|chrX (663 aa)
initn: 1021 init1: 856 opt: 1117 Z-score: 897.2 bits: 176.2 E(32554): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 1239; 42.5% identity (67.5% similar) in 579 aa overlap (1-562:1-530)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAAVVQQNDLVFEFASNVMEDE-RQLGDPAIFPAVIVEHVPGADILNSYAGLACVEEPND
:: ..: .::.:::::: :.:. .:: ::..:::::::.:: :.:. :.:: . :
CCDS14 MAITLQPSDLIFEFASNGMDDDIHQLEDPSVFPAVIVEQVPYPDLLHLYSGLELDDVHNG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 MITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDETIETIEAAEALLNMDSPGPMLDEKR
.::...: .....:.. .. :: :.. : .:. .::.::::.::. .::::.
CCDS14 IITDGTLCMTQDQILE---GSFLLT-----DDNEATSHTMSTAEVLLNMESPSDILDEKQ
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 INNNIFSSPEDDMVVAPVTHVSVTL------DGIPEVMETQQVQEKYADSPGASSPEQPK
: .. :..: ::.. . : :.. .. .:.. :: .. :: :. :
CCDS14 IFSTSEMLPDSD--PAPAVTLPNYLFPASEPDALNRAGDTSD-QEGHSLEEKASREESAK
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB9 R-----KKGRKTKPPRPDSPATTPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYI
. :. :::: : ::.: :.: ..::.:::::.::::::::::::::. ::::::
CCDS14 KTGKSKKRIRKTKGNRSTSPVTDPSIPIRKKSKDGKGSTIYLWEFLLALLQDRNTCPKYI
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 KWTQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQ
:::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKQKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQ
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 FKEMPKDLIYINDEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSR--SRVSSSPGVKGGATTVLK
::::::::. :.::: :: .. :. :...... . : : ::::: . .:
CCDS14 FKEMPKDLVVIEDEDESSEATAAPPQASTASVASASTTRRTSSRVSSRSAPQG-------
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 PGNSKAAKPKDPVEVAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEGEAARTSTM
:.:. ::: ::: :. . :: .. .:.:. ::.. :...
CCDS14 KGSSSWEKPKIQHVGLQPSASLELGPSLDEEIPTT---STMLVSPA----EGQVKLTKAV
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 QDETLNSSVQSIRTIQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSAGTGSQKF
. ::: :... . :.: .. ..::::.:::::... :.. :. ..
CCDS14 S----ASSV--------PSNIHLGVAPVGSG-SALTLQTIPLTTVLTNGPPASTTAPTQL
400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 ILQAIPSSQPMTVLKENVMLQSQ---KAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTICNGTVSVA
.::..:.. ...:.. ::.. .:. : : .:. .. :.. . : :
CCDS14 VLQSVPAA---STFKDTFTLQASFPLNASFQDSQVAAPG--APLILSGLPQLLAG----A
450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 SSPSFSATAPVVTFSPRSSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQEVEKKESEDHLKENTE
. :. : :. .: . . ..::::::.. :.:. :
CCDS14 NRPTNPAPPTVTGAGPAGPS--SQPPGTVIAAFIRTSGTTAAPRVKEGPLRSSSYVQGMV
500 510 520 530 540 550
590 600 610
pF1KB9 KTEQQPQPYVMVVSSSNGFTSQVAMKQNELLEPNSF
CCDS14 TGAPMEGLLVPEETLRELLRDQAHLQPLPTQVVSRGSHNPSLLGNQTLSPPSRPTVGLTP
560 570 580 590 600 610
>>CCDS82954.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 (593 aa)
initn: 1016 init1: 704 opt: 981 Z-score: 789.9 bits: 156.2 E(32554): 1.1e-37
Smith-Waterman score: 1137; 38.1% identity (65.8% similar) in 638 aa overlap (2-614:3-589)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAAVVQQNDLVFEFASNVMEDERQLGDPAIFPAVIVEHVPGADILNSYAGLACVEEPND
.:::... ..:..:: .:.... . .:::::: ::.: . ..::. . : . .
CCDS82 MTSAVVDSGGTILELSSNGVENQEESEKVSEYPAVIVEPVPSARLEQGYAAQVLVYDDET
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 MITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDE--TIETIEAAEALLNMDSPGPMLDE
.. . :::::. .. .. . ::::: :... : .:::::::::.:.:: : .
CCDS82 YMMQ---DVAEEQEVETENVE---TVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALLHMESP-TCLRD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 KRINNNIFSSPEDDMVVAP-VTHVSVTLDGIPE-VMETQQVQEKYAD-SPGASSPE--QP
.: ..: : : .: :... : : : :.:.. . . : :: .::. .:
CCDS82 SRSPVEVFVPP---CVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTSPIPTSPDSHEP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KRKKGRKTKPPRPDSPAT--TPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKW
.:: :: .:: . .:....::: ..::::: ::::::: ::::: :::.::::
CCDS82 MKKKKVGRKPKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCPRYIKW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFK
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 EMPKDLIYINDEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSRSRVSSSPGVKGGATTVLKPGNS
.:::... :.: : : :. . .:.... .. : ::: : : ..:: ..:
CCDS82 DMPKNIVVIDD-DKS---ETCNEDLAGTT----DEKSLERVSLS------AESLLKAASS
300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KB9 -KAAKPKDPVEVAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEGEAARTSTMQDE
...: ..:.. :.. . : :.:....: :. : . .
CCDS82 VRSGKNSSPINC---SRAEKGVA-----------RVVNITSP------GHDASSRSPTTT
340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 TLNSSVQSIRTIQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPL-TTVIASTDPSAGTGSQKFIL
. :.. . ::... :::::.. .:.. ::..:.: . .:.::.:...: : : ..
CCDS82 ASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSPTTAT-SPKVVI
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 QAIPSSQPMTVLK-ENVMLQSQKAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTICNGTVSVASSP-
:.::. .: .. . ... .: : . :. : :: : ::. .:.......:
CCDS82 QTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQL--AQCQLQTKSNLTG--SGSINIVGTPL
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KB9 --------SFSATAPVVTFSPRSSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQEVEKKESED--
:.. .::. .: ..: .. : ::..::: :.: .. : ::. .:
CCDS82 AVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPRVISAVIKGPEVK--SEAVAKKQEHDVK
500 510 520 530 540
580 590 600 610
pF1KB9 --HLKENTEKTEQQPQPYVMVVSSSNGFTSQVAMKQNELLEPNSF
.: :. .. .:.:::. .... :.:: . :.
CCDS82 TLQLVEEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK
550 560 570 580 590
>>CCDS3745.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 (533 aa)
initn: 979 init1: 704 opt: 870 Z-score: 702.4 bits: 139.9 E(32554): 8.3e-33
Smith-Waterman score: 1026; 39.0% identity (65.2% similar) in 561 aa overlap (79-614:14-529)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 AGLACVEEPNDMITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDE--TIETIEAAEALL
: . .:::: :... : .:::::::::
CCDS37 MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALL
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 NMDSPGPMLDEKRINNNIFSSPEDDMVVAP-VTHVSVTLDGIPE-VMETQQVQEKYAD-S
.:.:: : ..: ..: : : .: :... : : : :.:.. . . : :
CCDS37 HMESP-TCLRDSRSPVEVFVPP---CVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTS
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210
pF1KB9 PGASSPE--QPKRKKGRKTKPPRPDSPAT--TPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQ
: .::. .: .:: :: .:: . .:....::: ..::::: ::::::: :::
CCDS37 PIPTSPDSHEPMKKKKVGRKPKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQ
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 DKATCPKYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAK
:: :::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DKNTCPRYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAK
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 VEGQRLVYQFKEMPKDLIYINDEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSRSRVSSSPGVKG
:::::::::::.:::... :.: : : :. . .:.... .. : ::: :
CCDS37 VEGQRLVYQFKDMPKNIVVIDD-DKS---ETCNEDLAGTT----DEKSLERVSLS-----
220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 GATTVLKPGNS-KAAKPKDPVEVAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEG
: ..:: ..: ...: ..:.. :.. . : :.:....: :
CCDS37 -AESLLKAASSVRSGKNSSPINC---SRAEKGVA-----------RVVNITSP------G
270 280 290 300
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 EAARTSTMQDETLNSSVQSIRTIQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPL-TTVIASTDP
. : . . . :.. . ::... :::::.. .:.. ::..:.: . .:.::.:
CCDS37 HDASSRSPTTTASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSP
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pF1KB9 SAGTGSQKFILQAIPSSQPMTVLK-ENVMLQSQKAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTIC
...: : : ..:.::. .: .. . ... .: : . :. : :: : ::.
CCDS37 TTAT-SPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQL--AQCQLQTKSNLTG--
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520 530 540 550 560
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.:.......: :.. .::. .: ..: .. : ::..::: :.: ..
CCDS37 SGSINIVGTPLAVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPRVISAVIKGPEVK--SE
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570 580 590 600 610
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: ::. .: .: :. .. .:.:::. .... :.:: . :.
CCDS37 AVAKKQEHDVKTLQLVEEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK
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.:::... ..:..:: .:.... . .:::::: ::.: . ..::. . : . .
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.. . :::::. .. .. . ::::: :... : .:::::::::.:.:: : .
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CCDS37 RK--PKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCPRYIKWTQREK
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CCDS37 GIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKDMPKN
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.. :.: : : :. . .:.... .. : ::: : : ..:: ..: ...:
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. . ::... :::::.. .:.. ::..:.: . .:.::.:...: : : ..:.::.
CCDS37 TAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSPTTAT-SPKVVIQTIPT
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.: .. . ... .: : . :. : :: : ::. .:.......:
CCDS37 VMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQL--AQCQLQTKSNLTG--SGSINIVGTPLAVRAL
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CCDS37 TPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPRVISAVIKGPEVK--SEAVAKKQEHDVKTLQLV
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CCDS37 EEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK
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CCDS64 HEPMK-KKKVGR--KPKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQDKNTC
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CCDS64 PRYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQR
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::::::.:::... :.: : : :. . .:.... .. : ::: : : ..
CCDS64 LVYQFKDMPKNIVVIDD-DKS---ETCNEDLAGTT----DEKSLERVSLS------AESL
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:: ..: ...: ..:.. :.. . : :.:....: :. : .
CCDS64 LKAASSVRSGKNSSPINC---SRAEKGVA-----------RVVNITSP------GHDASS
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CCDS64 RSPTTTASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSPTTAT-
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CCDS64 SPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQL--AQCQLQTKSNLTG--SGSIN
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....: :.. .::. .: ..: .. : ::..::: :.: .. : ::
CCDS64 IVGTPLAVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPRVISAVIKGPEVK--SEAVAKK
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. .: .: :. .. .:.:::. .... :.:: . :.
CCDS64 QEHDVKTLQLVEEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK
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CCDS64 MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALL
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110 120 130 140 150 160
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CCDS64 HMESP-TCLRDSRSPVEVFVPP---CVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEE---SEPM
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CCDS64 DTSP-----------IPTSPDSHE--P---MKKK----KGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCP
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CCDS64 RYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRL
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CCDS64 KAASSVRSGKNSSPINC---SRAEKGVA-----------RVVNITSP------GHDASSR
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CCDS64 SPTTTASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSPTTAT-S
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CCDS64 PKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQL--AQCQLQTKSNLTG--SGSINI
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CCDS64 VGTPLAVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPRVISAVIKGPEVK--SEAVAKKQ
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pF1KB9 SED----HLKENTEKTEQQPQPYVMVVSSSNGFTSQVAMKQNELLEPNSF
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CCDS64 EHDVKTLQLVEEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK
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CCDS14 MDPSVTLWQFLLQLLREQGN-GHIISWTSRDGG
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CCDS14 EFKLVDAEEVARLWGLRKNKTNMNYDKLSRALRYYYDKNIIRKVSGQKFVYKFVSYP-EV
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CCDS14 AGCSTEDCPPQPEVSVTSTMPNVAPAAI---HAAPGDTVSGKPGTPKGAGMAGPGGLARS
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CCDS14 SRNEYMRSGLYSTFTIQSLQPQPPPHP----RPA-VVLP-SAAPAGAAAPPSGSRSTSPS
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CCDS14 PLEACLEAEEAGLPLQV-ILTPPEAPNLKSEELNVEPGLGRALPPEVKVEGPKEELEVAG
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CCDS14 ERGFVPETTKAEPEVPPQEGVPARLPAVVMDTAGQAGGHAASSPEISQPQKGRKPRDLEL
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619 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 23:15:39 2016 done: Thu Nov 3 23:15:40 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]