Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9098
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9098, 1257 aa
1>>>pF1KB9098 1257 - 1257 aa - 1257 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2320+/-0.00116; mu= 13.2950+/- 0.070
mean_var=121.0504+/-23.744, 0's: 0 Z-trim(105.5): 133 B-trim: 23 in 1/50
Lambda= 0.116571
statistics sampled from 8336 (8481) to 8336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 4.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257) 8195 1390.7 0
CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1273) 4025 689.4 1.6e-197
CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237) 3747 642.6 1.8e-183
CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 ( 489) 3175 546.2 7.6e-155
CCDS1802.1 SOS1 gene_id:6654|Hs108|chr2 (1333) 531 101.8 1.3e-20
CCDS9697.1 SOS2 gene_id:6655|Hs108|chr14 (1332) 511 98.4 1.3e-19
CCDS48047.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1077) 506 97.5 2e-19
CCDS78450.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1094) 506 97.5 2e-19
CCDS48048.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1095) 506 97.5 2e-19
CCDS65733.1 RALGPS2 gene_id:55103|Hs108|chr1 ( 557) 442 86.6 1.9e-16
CCDS1325.1 RALGPS2 gene_id:55103|Hs108|chr1 ( 583) 442 86.6 2e-16
CCDS55344.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9 ( 305) 396 78.7 2.5e-14
CCDS55346.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9 ( 529) 396 78.9 4e-14
CCDS55345.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9 ( 537) 396 78.9 4e-14
CCDS35143.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9 ( 557) 396 78.9 4.1e-14
CCDS54346.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 ( 689) 397 79.1 4.4e-14
CCDS46256.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 ( 690) 397 79.1 4.4e-14
CCDS55093.1 RAPGEF5 gene_id:9771|Hs108|chr7 ( 730) 381 76.4 3e-13
CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 791) 346 70.5 1.9e-11
CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 840) 346 70.5 2e-11
CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 858) 346 70.6 2e-11
CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 867) 346 70.6 2e-11
CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (1011) 346 70.6 2.3e-11
CCDS43508.1 ECT2L gene_id:345930|Hs108|chr6 ( 904) 339 69.4 4.8e-11
CCDS76733.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 597) 330 67.8 9.6e-11
>>CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257 aa)
initn: 8195 init1: 8195 opt: 8195 Z-score: 7449.9 bits: 1390.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8195; 100.0% identity (100.0% similar) in 1257 aa overlap (1-1257:1-1257)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQKGIRLNDGHVASLGLLARKDGTRKGYLSKRSSDNTKWQTKWFALLQNLLFYFESDSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MQKGIRLNDGHVASLGLLARKDGTRKGYLSKRSSDNTKWQTKWFALLQNLLFYFESDSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RPSGLYLLEGCVCDRAPSPKPALSAKEPLEKQHYFTVNFSHENQKALELRTEDAKDCDEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RPSGLYLLEGCVCDRAPSPKPALSAKEPLEKQHYFTVNFSHENQKALELRTEDAKDCDEW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIERLKAEITS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIERLKAEITS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LLKDNERIQSTQTVAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRRKWKTIIQDYIRSPHADSMRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLKDNERIQSTQTVAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRRKWKTIIQDYIRSPHADSMRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETIMFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETIMFLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QIFYQGLKARISSWPTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQILAHCKQNRDFDKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QIFYQGLKARISSWPTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQILAHCKQNRDFDKLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVERNSLDYAKSKLEELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVERNSLDYAKSKLEELS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 RIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQVPMSEKGKITRGRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQVPMSEKGKITRGRLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 SLSLKKEGERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNGVISLIDCTLLEEPESTEEEAKGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLSLKKEGERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNGVISLIDCTLLEEPESTEEEAKGSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 QDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDNIRCNGLMMNAFEENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDNIRCNGLMMNAFEENS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 KVTVPQMIKSDASLYCDDVDIRFSKTMNSCKVLQIRYASVERLLERLTDLRFLSIDFLNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KVTVPQMIKSDASLYCDDVDIRFSKTMNSCKVLQIRYASVERLLERLTDLRFLSIDFLNT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 FLHSYRVFTTAIVVLDKLITIYKKPISAIPARSLELLFASGQNNKLLYGEPPKSPRATRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FLHSYRVFTTAIVVLDKLITIYKKPISAIPARSLELLFASGQNNKLLYGEPPKSPRATRK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 FSSPPPLSITKTSSPSRRRKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSNGYTSMYSAMSPFSKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FSSPPPLSITKTSSPSRRRKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSNGYTSMYSAMSPFSKAT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 LDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDGDTET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDGDTET
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 SPTKSPTTPKSVKNKNSSEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASAFAIATAGANEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPTKSPTTPKSVKNKNSSEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASAFAIATAGANEG
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pF1KB9 TPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKHSQDFETNDELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKHSQDFETNDELK
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pF1KB9 CKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLEEITQMAEGVKAEPFEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLEEITQMAEGVKAEPFEN
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KB9 HSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKHFNDISNLIASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKHFNDISNLIASE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB9 IIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLKKTWLKVSKQTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLKKTWLKVSKQTK
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 ALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTEDGLVNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTEDGLVNFS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB9 KMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESLYESSLRIEPKLPT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESLYESSLRIEPKLPT
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1273 aa)
initn: 7665 init1: 4009 opt: 4025 Z-score: 3659.7 bits: 689.4 E(32554): 1.6e-197
Smith-Waterman score: 8143; 98.7% identity (98.7% similar) in 1273 aa overlap (1-1257:1-1273)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQKGIRLNDGHVASLGLLARKDGTRKGYLSKRSSDNTKWQTKWFALLQNLLFYFESDSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RPSGLYLLEGCVCDRAPSPKPALSAKEPLEKQHYFTVNFSHENQKALELRTEDAKDCDEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RPSGLYLLEGCVCDRAPSPKPALSAKEPLEKQHYFTVNFSHENQKALELRTEDAKDCDEW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIERLKAEITS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIERLKAEITS
130 140 150 160 170 180
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pF1KB9 LLKDNERIQSTQTVAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRRKWKTIIQDYIRSPHADSMRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLKDNERIQSTQTVAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRRKWKTIIQDYIRSPHADSMRK
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pF1KB9 RNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETIMFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETIMFLH
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310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QIFYQGLKARISSWPTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQILAHCKQNRDFDKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QIFYQGLKARISSWPTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQILAHCKQNRDFDKLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVERNSLDYAKSKLEELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVERNSLDYAKSKLEELS
370 380 390 400 410 420
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pF1KB9 RIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQVPMSEKGKITRGRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQVPMSEKGKITRGRLG
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pF1KB9 SLSLKKEGERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNGVISLIDCTLLEEPESTEEEAKGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SLSLKKEGERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNGVISLIDCTLLEEPESTEEEAKGSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 QDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDNIRCNGLMMNAFEENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDNIRCNGLMMNAFEENS
550 560 570 580 590 600
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pF1KB9 KVTVPQMIK-------------SDASLYCDDVDIRFSKTMNSCKVLQIRYASVERLLERL
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KVTVPQMIKRTREGTREAEMSRSDASLYCDDVDIRFSKTMNSCKVLQIRYASVERLLERL
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pF1KB9 TDLRFLSIDFLNTFLHSYRVFTTAIVVLDKLITIYKKPISAIPAR---SLELLFASGQNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS10 TDLRFLSIDFLNTFLHSYRVFTTAIVVLDKLITIYKKPISAIPARWLRSLELLFASGQNN
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pF1KB9 KLLYGEPPKSPRATRKFSSPPPLSITKTSSPSRRRKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLLYGEPPKSPRATRKFSSPPPLSITKTSSPSRRRKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSN
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pF1KB9 GYTSMYSAMSPFSKATLDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GYTSMYSAMSPFSKATLDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMRE
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KB9 ESDIDQNQSDDGDTETSPTKSPTTPKSVKNKNSSEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESDIDQNQSDDGDTETSPTKSPTTPKSVKNKNSSEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSAL
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890 900 910 920 930 940
pF1KB9 SAASAFAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SAASAFAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRH
910 920 930 940 950 960
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pF1KB9 WVSKHSQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WVSKHSQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLE
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1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB9 EITQMAEGVKAEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EITQMAEGVKAEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB9 KTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSA
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB9 IFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB9 EEGTPNYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EEGTPNYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1250
pF1KB9 YESSLRIEPKLPT
:::::::::::::
CCDS10 YESSLRIEPKLPT
1270
>>CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237 aa)
initn: 4086 init1: 1877 opt: 3747 Z-score: 3407.3 bits: 642.6 E(32554): 1.8e-183
Smith-Waterman score: 5499; 66.5% identity (85.2% similar) in 1267 aa overlap (1-1256:1-1236)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQKGIRLNDGHVASLGLLARKDGTRKGYLSKRSSDNTKWQTKWFALLQNLLFYFESDSSS
:::..: :.::. :..::::.::..:.:::.... ..:. ::::: ::.:::::...:
CCDS40 MQKSVRYNEGHALYLAFLARKEGTKRGFLSKKTAEASRWHEKWFALYQNVLFYFEGEQSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB9 RPSGLYLLEGCVCDRAPSPKPALSA----KEPLEKQHYFTVNFSHENQKALELRTEDAKD
::.:.:::::: :.:.:.: : .. .. :.::.:::: :.::.:: :::: :. .:
CCDS40 RPAGMYLLEGCSCERTPAPPRAGAGQGGVRDALDKQYYFTVLFGHEGQKPLELRCEEEQD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 CDEWVAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIERLKA
::. :: .::: . :.:.:::::.::.::::::: .:.:::.:.:: . ::::::.
CCDS40 GKEWMEAIHQASYADILIEREVLMQKYIHLVQIVETEKIAANQLRHQLEDQDTEIERLKS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 EITSLLKDNERIQSTQTVAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRRKWKTIIQDYIRSPHAD
:: .: : .::.. :. .::: :::::::::::.::::::::::::.:::: ::::.
CCDS40 EIIALNKTKERMRPYQS-NQEDEDPDIKKIKKVQSFMRGWLCRRKWKTIVQDYICSPHAE
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 SMRKRNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETI
:::::::.::.:.:::.:::.::.::::.::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS40 SMRKRNQIVFTMVEAESEYVHQLYILVNGFLRPLRMAASSKKPPISHDDVSSIFLNSETI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 MFLHQIFYQGLKARISSWPTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQILAHCKQNRDF
::::.::.:::::::..::::.:::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::
CCDS40 MFLHEIFHQGLKARIANWPTLILADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQVLANCKQNRDF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 DKLLKHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVERNSLDYAKSKL
:::::.:::.: :: : ::::::::::::::::.::::::::::::::::.::..:::::
CCDS40 DKLLKQYEANPACEGRMLETFLTYPMFQIPRYIITLHELLAHTPHEHVERKSLEFAKSKL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 EELSRIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQVPMSEKGKITR
:::::.::::::.::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::::: :.::...
CCDS40 EELSRVMHDEVSDTENIRKNLAIERMIVEGCDILLDTSQTFIRQGSLIQVPSVERGKLSK
420 430 440 450 460 470
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pF1KB9 GRLGSLSLKKEGERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNG-VISLIDCTLLEEPESTEEE
::::::::::::::::::.::..::::.::::::: :.: :.:::::::.:::......
CCDS40 VRLGSLSLKKEGERQCFLFTKHFLICTRSSGGKLHLLKTGGVLSLIDCTLIEEPDASDDD
480 490 500 510 520 530
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pF1KB9 AKGSGQDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDNIRCNGLMMNA
.::::: . :::::: ::: :. :::.:.: :::::::: :::::::::::::::: .
CCDS40 SKGSGQVFGHLDFKIVVEPPDAAAFTVVLLAPSRQEKAAWMSDISQCVDNIRCNGLMTIV
540 550 560 570 580 590
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pF1KB9 FEENSKVTVPQMIKSDASLYCDDVDIRFSKTMNSCKVLQIRYASVERLLERLTDLRFLSI
::::::::::.:::::: :. ::.:: ::::.::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS40 FEENSKVTVPHMIKSDARLHKDDTDICFSKTLNSCKVPQIRYASVERLLERLTDLRFLSI
600 610 620 630 640 650
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pF1KB9 DFLNTFLHSYRVFTTAIVVLDKLITIYKKPISAIPARSLELLFASGQNNKLLYGEPPKSP
::::::::.::.:::: ::: :: :::.:...::.:::::.::..:::. . :::
CCDS40 DFLNTFLHTYRIFTTAAVVLGKLSDIYKRPFTSIPVRSLELFFATSQNNRGEHLVDGKSP
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pF1KB9 RATRKFSSPPPLSITKTSSPSRRRKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSNGYTSMYSAMSP
: :::::::::....:::: : :::::. :. . ::::.. : .. : .. :
CCDS40 RLCRKFSSPPPLAVSRTSSPVRARKLSLTSPLNSKIGALDLTTSSSPTTTTQSPAASPPP
720 730 740 750 760 770
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pF1KB9 FS-KATLDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPE-DPSALSKQSSEVSMREESDIDQ---
. . :: :. . : .. : . . ..:. : :.: . .. : . :.
CCDS40 HTGQIPLDLSR---GLSSPEQSPGTVEENVDNPRVDLCNKLKRSIQKAVLESAPADRAGV
780 790 800 810 820 830
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pF1KB9 NQSDDGDT-ETSPTKSPTTPKSVKNKNSSEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASA
..: .:: : :: .::.::. .. .. : .: . :: . ..: :::
CCDS40 ESSPAADTTELSPCRSPSTPRHLRYRQ----P-----GG------QTADNAHCSVSPASA
840 850 860 870 880
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pF1KB9 FAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKH
::::::.:..:.: :: .:. ::::.:::.::::::::::::::::
CCDS40 FAIATAAAGHGSP------------PGFNNTERTCDKEFIIRRTATNRVLNVLRHWVSKH
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pF1KB9 SQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLEEITQM
.:::: :.::: .:...::::..::.:: :::::::::.:.:.:.: : .. ::.: ::
CCDS40 AQDFELNNELKMNVLNLLEEVLRDPDLLPQERKAAANILRALSQDDQDDIHLKLEDIIQM
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1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB9 AEGVKAEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKH
.. .::: ::. ::.:.:::.:::::..:..::::::.:::::::.:::::::::::..:
CCDS40 TDCMKAECFESLSAMELAEQITLLDHVIFRSIPYEEFLGQGWMKLDKNERTPYIMKTSQH
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KB9 FNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLK
:::.:::.::.:. :...:..:::::::::::::::::::.::::::..:::::.:::
CCDS40 FNDMSNLVASQIMNYADVSSRANAIEKWVAVADICRCLHNYNGVLEITSALNRSAIYRLK
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pF1KB9 KTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTP
::: :::::::::.::::: ::::::::::::.::::.:: :::::::::::::::::::
CCDS40 KTWAKVSKQTKALMDKLQKTVSSEGRFKNLRETLKNCNPPAVPYLGMYLTDLAFIEEGTP
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KB9 NYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESLYESSL
:.::.::::::::::::::::::::::::.:.:.:: ::.:::::.....::..::: ::
CCDS40 NFTEEGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTSYRIDHQPKVAQYLLDKDLIIDEDTLYELSL
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1250
pF1KB9 RIEPKLPT
.:::.::
CCDS40 KIEPRLPA
1230
>>CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (489 aa)
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CCDS42 MYSAMSPFSKATLDTSKLYVSSSFTNKIPD
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pF1KB9 EGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDGDTETSPTKSPTTPKSVKNKNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDGDTETSPTKSPTTPKSVKNKNSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASAFAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKHSQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLEEITQMAEGVKAEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWV
280 290 300 310 320 330
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKN
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pF1KB9 LREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQT
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESLYESSLRIEPKLPT
460 470 480
>>CCDS1802.1 SOS1 gene_id:6654|Hs108|chr2 (1333 aa)
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880 890 900 910 920
pF1KB9 TSCRELDNNRSALSAASAFAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFP--PDQRNGDKEFV
:. . :... .. : . . ::..
CCDS18 FVRTFLTTYRSFCKPQELLSLIIERFEIPEPEPTEADRIAIENGDQPLSAELKRFRKEYI
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pF1KB9 IRRAATNRVLNVLRHWVSKHSQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANII-
. . ::::: :::: .: ::: . : .. :. : . . . .. ..::
CCDS18 --QPVQLRVLNVCRHWVEHHFYDFERDAYLLQRMEEFIGTVRG--KAMKKWVESITKIIQ
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pF1KB9 RTLTQED--PGDNQITLEEITQMAEGVKAEP--FENHSAL-----EIAEQLTLLDHLVFK
: .: :: : ::.. .: ..: .:. . : :::.:::::. ...
CCDS18 RKKIARDNGPGHN-ITFQSSPPTVEWHISRPGHIETFDLLTLHPIEIARQLTLLESDLYR
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pF1KB9 KIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVA
. :. :. : : .:. .: ..: .: .... . . :...:... ::... . .
CCDS18 AVQPSELVGSVWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVETENLEERVAVVSRIIE
800 810 820 830 840 850
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pF1KB9 VADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNL
. .. . :.:.:.:::..:.:: : ..:: .:. .. .. : .... ..: :: ..:.
CCDS18 ILQVFQELNNFNGVLEVVSAMNSSPVYRLDHTFEQIPSRQKKILEEAHEL--SEDHYKKY
860 870 880 890 900 910
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pF1KB9 REALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTE-DG--LVNFSKMRMISHIIREIRQFQ
:.. .:::::..:.:::.. :::.:. . : :.:::: : ...: ::.:.:
CCDS18 LAKLRSINPPCVPFFGIYLTNILKTEEGNPEVLKRHGKELINFSKRRKVAEITGEIQQYQ
920 930 940 950 960 970
1220 1230 1240 1250
pF1KB9 QTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFV---MDEE---SLYESSLRIEPKLPT
. : .. .. . ... . . . :..: :...::.:::. :
CCDS18 NQPYCLRVESDIKRFFENLNPMGNSMEKEFTDYLFNKSLEIEPRNPKPLPRFPKKYSYPL
980 990 1000 1010 1020 1030
CCDS18 KSPGVRPSNPRPGTMRHPTPLQQEPRKISYSRIPESETESTASAPNSPRTPLTPPPASGA
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>>CCDS9697.1 SOS2 gene_id:6655|Hs108|chr14 (1332 aa)
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Smith-Waterman score: 523; 29.5% identity (63.2% similar) in 353 aa overlap (920-1254:671-1017)
890 900 910 920 930 940
pF1KB9 FAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKH
: . ::.: . . :.:::.:::: .:
CCDS96 LLIERFEIPEPEPTDADKLAIEKGEQPISADLKRFRKEYV--QPVQLRILNVFRHWVEHH
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950 960 970 980 990 1000
pF1KB9 SQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPG--DNQITLEEIT
::: . :: .. .:. : . . . .. :.::: : . . ...::.:
CCDS96 FYDFERDLELLERLESFISSVRG--KAMKKWVESIAKIIRRKKQAQANGVSHNITFESPP
700 710 720 730 740 750
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pF1KB9 QMAEGVKAEP--FENHSAL-----EIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERT
: ..: ::. . . :::.:::::. ...:. :. :. : : .:. .
CCDS96 PPIEWHISKPGQFETFDLMTLHPIEIARQLTLLESDLYRKVQPSELVGSVWTKEDKEINS
760 770 780 790 800 810
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pF1KB9 PYIMKTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSM
: ..: .: .... . . :.. :... ::... . . . .. . :.:.:.::::.:..
CCDS96 PNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVEAENFEERVAVLSRIIEILQVFQDLNNFNGVLEIVSAV
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pF1KB9 NRSAIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTD
: ...:: .:. .... . ..:. .: :. .::. ::. .:::::..:.:::.
CCDS96 NSVSVYRLDHTFEALQERKRKILDEAVEL--SQDHFKKYLVKLKSINPPCVPFFGIYLTN
880 890 900 910 920 930
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pF1KB9 LAFIEEGTPNYTED---GLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYL--LDQ
. :::. .. . :.:::: : ...: ::.:.:. : .. . . ... :.
CCDS96 ILKTEEGNNDFLKKKGKDLINFSKRRKVAEITGEIQQYQNQPYCLRIEPDMRRFFENLNP
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pF1KB9 SFVMDEES----LYESSLRIEPKLPT
.:. :...::.:::.
CCDS96 MGSASEKEFTDYLFNKSLEIEPRNCKQPPRFPRKSTFSLKSPGIRPNTGRHGSTSGTLRG
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>>CCDS48047.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1077 aa)
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Smith-Waterman score: 508; 28.4% identity (59.2% similar) in 461 aa overlap (807-1254:628-1064)
780 790 800 810 820 830
pF1KB9 SKATLDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDG
:.::::.: . ..: ::
CCDS48 GVDSVQELAPPPALPPKQRQLEPPAGKDGHPRDPSAVS------------GVPGKDSRDG
600 610 620 630 640
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pF1KB9 DTETSPTKSPTTPKSVKNKNS-SEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASAFAIATA
.: .: ::: . .:..... .:. :...:. . . .. .. . ..:. . .
CCDS48 -SERAP-KSPDALESAQSEEEVDELSLIDHNEIMSRLTLKQEGDDGPDVRGGSGDILLVH
650 660 670 680 690 700
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pF1KB9 GANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKHS--QDF
... . : . :.. . .. :.. : . ..... :::..
CCDS48 ATETDRKDLVLYCEAFLTTYRTFISPEELIKKLQYRYEKFSPFADTFKKRVSKNTFFVLV
710 720 730 740 750 760
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pF1KB9 ETNDELKCKVIGFLEEVMHD-PELLTQER-KAAANIIRTLTQE--DPGDNQITLEEITQ-
.. ::: : .. . ::... ::. . .. .. :.: .. : :.. :. :.
CCDS48 RVVDEL-C-LVELTEEILKLLMELVFRLVCNGELSLARVLRKNILDKVDQKKLLRCATSS
770 780 790 800 810 820
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB9 ---MAEGVKAEPFENHS--ALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYI
:.:: :.: :. . :::::::::: .: :: : . : : ...:..: .
CCDS48 QPLAARGVAARPGTLHDFHSHEIAEQLTLLDAELFYKIEIPEVL--LWAKEQNEEKSPNL
830 840 850 860 870
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pF1KB9 MKTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRS
. :.:::..: . : :. .: . : . :.. . : :.:.:. : : :... .
CCDS48 TQFTEHFNNMSYWVRSIIMLQEKAQDRERLLLKFIKIMKHLRKLNNFNSYLAILSALDSA
880 890 900 910 920 930
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB9 AIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAF
: ::. : .:::. . . :..: . :. : ::.. .:::.::::. : ::.:
CCDS48 PIRRLE--W---QKQTSEGLAEYCTLIDSSSSFRAYRAALSEVEPPCIPYLGLILQDLTF
940 950 960 970 980 990
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB9 IEEGTPNYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEES
.. :.:.: :: ::::: . .:. .: :::. : .... . ... : : . ::.
CCDS48 VHLGNPDYI-DGKVNFSKRWQQFNILDSMRCFQQAHYDMRRNDDIINFFNDFSDHLAEEA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1250
pF1KB9 LYESSLRIEPKLPT
:.: ::.:.:.
CCDS48 LWELSLKIKPRNITRRKTDREEKT
1060 1070
>>CCDS78450.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1094 aa)
initn: 386 init1: 175 opt: 506 Z-score: 462.3 bits: 97.5 E(32554): 2e-19
Smith-Waterman score: 508; 28.4% identity (59.2% similar) in 461 aa overlap (807-1254:645-1081)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]