Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9075
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9075, 1338 aa
  1>>>pF1KB9075 1338 - 1338 aa - 1338 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.6516+/-0.00162; mu= -30.0249+/- 0.091
 mean_var=645.4942+/-146.477, 0's: 0 Z-trim(104.9): 391  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.050481
 statistics sampled from 7805 (8153) to 7805 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.25), width:  16
 Scan time:  5.160

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13           (1338) 8848 662.0 3.1e-189
CCDS53860.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13          ( 733) 4651 356.1   2e-97
CCDS73556.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13          ( 687) 4308 331.1 6.3e-90
CCDS53861.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13          ( 541) 3427 266.9 1.1e-70
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4             (1356) 2483 198.4 1.1e-49
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5           (1298) 2080 169.1 7.3e-41
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5            (1363) 2080 169.1 7.5e-41
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5           ( 972) 1176 103.1 3.8e-21
CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13          ( 993) 1166 102.4 6.4e-21
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4            ( 972) 1081 96.2 4.6e-19
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4             ( 976) 1058 94.5 1.5e-18
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 709)  768 73.3 2.6e-12
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4          (1089)  773 73.8 2.9e-12
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 812)  725 70.2 2.6e-11
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  725 70.2 2.6e-11
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 593)  718 69.6 2.8e-11
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 731)  720 69.8   3e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 733)  720 69.8   3e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 707)  719 69.8 3.1e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  720 69.9 3.3e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8           ( 822)  720 69.9 3.3e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 732)  718 69.7 3.3e-11
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5          ( 734)  718 69.7 3.4e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 704)  717 69.6 3.4e-11
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 853)  720 69.9 3.4e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 705)  717 69.6 3.4e-11
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 762)  718 69.7 3.5e-11
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 802)  718 69.7 3.6e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 821)  718 69.7 3.7e-11
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 819)  717 69.7 3.8e-11
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10          ( 822)  717 69.7 3.9e-11
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 680)  714 69.4 3.9e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 769)  714 69.4 4.3e-11
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 694)  712 69.2 4.3e-11
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 806)  712 69.3 4.9e-11
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4          ( 808)  712 69.3 4.9e-11


>>CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13                (1338 aa)
 initn: 8848 init1: 8848 opt: 8848  Z-score: 3510.8  bits: 662.0 E(32554): 3.1e-189
Smith-Waterman score: 8848; 99.9% identity (99.9% similar) in 1338 aa overlap (1-1338:1-1338)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 AFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 AFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 DFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRISGIYICIASNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRISGIYICIASNK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 VGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDVTWILLRTVNNRTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDVTWILLRTVNNRTM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIILGPGSSTLFIER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIILGPGSSTLFIER
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 VTEEDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKSNLELITLTCTCVAATLFWLLLTLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VTEEDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKSNLELITLTCTCVAATLFWLLLTLFI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 RKMKRSSSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RKMKRSSSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB9 VVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTK
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB9 QGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNKDAALHMEPKKEKMEPGLEQGKKPRLDSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 QGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNKDAALHMEPKKEKMEPGLEQGKKPRLDSV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB9 TSSESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 TSSESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIH
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB9 RDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB9 DVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB9 PKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGKDYIPINAILTGNSGFTYSTPAFSEDFFKESISA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 PKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGKDYIPINAILTGNSGFTYSTPAFSEDFFKESISA
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB9 LKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERIKTFEELLPNATSMFDDYQGDSSTLLASPMLKRFTW
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 PKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERIKTFEELLPNATSMFDDYQGDSSTLLASPMLKRFTW
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB9 TDSKPKASLKIDLRVTSKSKESGLSDVSRPSFCHSSCGHVSEGKRRFTYDHAELERKIAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 TDSKPKASLKIDLRVTSKSKESGLSDVSRPSFCHSSCGHVSEGKRRFTYDHAELERKIAC
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330        
pF1KB9 CSPPPDYNSVVLYSTPPI
       ::::::::::::::::::
CCDS93 CSPPPDYNSVVLYSTPPI
             1330        

>>CCDS53860.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13               (733 aa)
 initn: 4646 init1: 4646 opt: 4651  Z-score: 1862.6  bits: 356.1 E(32554): 2e-97
Smith-Waterman score: 4651; 98.7% identity (99.3% similar) in 717 aa overlap (1-715:1-717)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDVTWILLRTVNNRTM
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pF1KB9 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA
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pF1KB9 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIILG--PGSSTLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .  .  :.::.   
CCDS53 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPELYTSTSPSSSSSSP
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pF1KB9 ERVTEEDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKSNLELITLTCTCVAATLFWLLLTL
                                                                   
CCDS53 LSSSSSSSSSSSS                                               
              730                                                  

>>CCDS73556.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13               (687 aa)
 initn: 4308 init1: 4308 opt: 4308  Z-score: 1728.0  bits: 331.1 E(32554): 6.3e-90
Smith-Waterman score: 4308; 99.7% identity (99.8% similar) in 658 aa overlap (1-658:1-658)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET
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pF1KB9 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRISGIYICIASNK
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pF1KB9 VGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDVTWILLRTVNNRTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDVTWILLRTVNNRTM
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pF1KB9 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .  
CCDS73 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRGEHC
              610       620       630       640       650       660

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pF1KB9 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIILGPGSSTLFIER
                                                                   
CCDS73 NKKAVFSRISKFKSTRNDCTTQSNVKH                                 
              670       680                                        

>>CCDS53861.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13               (541 aa)
 initn: 3425 init1: 3425 opt: 3427  Z-score: 1382.7  bits: 266.9 E(32554): 1.1e-70
Smith-Waterman score: 3427; 97.0% identity (98.5% similar) in 536 aa overlap (1-533:1-536)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB9 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET
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pF1KB9 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD
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pF1KB9 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV
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pF1KB9 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK
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pF1KB9 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK
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pF1KB9 AFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTA
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pF1KB9 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC
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pF1KB9 DFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMA---STLVVADSRISGIYICIA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.    :....  . .:. :    
CCDS53 DFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKLPPANSSFMLPPTSFSSNYFHFL
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CCDS53 P                                                           
                                                                   

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               .:  ::  :.   ..: :    .:  :.::..     ..:. ::.. :::. 
CCDS34    MQSKVLLAVALWLCVETRAASVGLPSVSLDLPRLSIQKDILTIKANTTLQITCRGQR
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          :  :.  :   .:. .:. . :     ::.:::.  . .: :: :.: :      ..
CCDS34 DLDWLWPNNQSGSEQRVEVTECSDG----LFCKTLTIPKVIGNDTGAYKCFY------RE
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        .  :.::....:   ::.   :.   ....::...  .::::  .  :..:.:  ..: 
CCDS34 TDLASVIYVYVQDYRSPFIASVSDQHGVVYITENKNKTVVIPCLGSISNLNVSLCARYPE
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         ..:::.:: :::.::: : .   .  :.. ::: .: . :..  :..      : :: 
CCDS34 KRFVPDGNRISWDSKKGFTIPSYMISYAGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIYDVV
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pF1KB9 ISTPRPVKLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRAS-VRRRID-QSNSHANI
       .:  . ..:  :. ::::::: : ::. ....: ::. :... . : : .  ::.:. . 
CCDS34 LSPSHGIELSVGEKLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEMKK
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pF1KB9 FYSVLTIDKMQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKR
       : :.:::: .  .:.::::: . ::   :. .: :....: :..     ....:...:.:
CCDS34 FLSTLTIDGVTRSDQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATVGER
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pF1KB9 SYRLSMKVKAFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQ
         :.  :  ..: ::. : :.:.:   .: . .  :. : : .:.:.:.::::..:.   
CCDS34 -VRIPAKYLGYPPPEIKWYKNGIPL--ESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPI
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pF1KB9 SNVFKNLTATLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPT-IKWFWH-
       :.  .. ...:.: : ::: ::.. :  :   :  :. : ::::.:.:: :  :.:.:. 
CCDS34 SKEKQSHVVSLVVYVPPQIGEKSLISPVDS--YQYGTTQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQL
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pF1KB9 --PCNHNHSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADS
          : .. :.:         : .    : . ::.::   ...:.:::::: .::::.  .
CCDS34 EEECANEPSQAVSVTNPYPCEEWRSVEDFQGGNKIEVNKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAA
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pF1KB9 RISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDV
        .:..: : : ::::   : :::..:  :. . .. . .::: :...: ::...  ....
CCDS34 NVSALYKCEAVNKVGRGERVISFHVTRGPE-ITLQPDMQPTEQESVSLWCTADRSTFENL
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pF1KB9 TWILLRT----VNNRTMHYSISKQ-----KMAITKEHSITLNLTIM---NVSLQDSGTYA
       ::  :      ..   .   . :.     :.  :   . : .. ::   :.::::.: :.
CCDS34 TWYKLGPQPLPIHVGELPTPVCKNLDTLWKLNATMFSNSTNDILIMELKNASLQDQGDYV
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pF1KB9 CRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWF
       : :..  : ..    ...:. .. :: .  :: ..:..:. :  ..: :.: : ::: ::
CCDS34 CLAQDRKTKKRHCVVRQLTVLERVAPTITGNLENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWF
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pF1KB9 KNNHKIQQEPGIILGPGSSTLFIERVTEEDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKS
       :.:. . .. ::.:  :. .: :.:: .::::.: :.: .  : ..  :.. ..:...:.
CCDS34 KDNETLVEDSGIVLKDGNRNLTIRRVRKEDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKT
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pF1KB9 NLELITLTCTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSSS-EIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLP
       :::.: :. : : : .:::::....: .::... :.:: ::::.:::::.::::.:::::
CCDS34 NLEIIILVGTAVIAMFFWLLLVIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCERLP
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pF1KB9 YDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKA
       :::::::: :.:::::: :::::::.:..:.:::: :. ::::::::::::::: ::..:
CCDS34 YDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRA
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pF1KB9 LMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNKDA
       ::.::::: ::::::::::::::::: :::::::::.::.::::.::.:::. :   :  
CCDS34 LMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKTK
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pF1KB9 ALHMEPKKEKMEPGLEQGKKPRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSDGFYKEPI
       . ...  :. .  ..    : ::::.:::.: ::::: :.::::::::::  . .::. .
CCDS34 GARFRQGKDYV-GAIPVDLKRRLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFL
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pF1KB9 TMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYV
       :.: :: ::::::.:::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::
CCDS34 TLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYV
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pF1KB9 RKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLR
       ::::.::::::::::.:::..:. .:::::.:::::::::::.::::::..::.:: ::.
CCDS34 RKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLK
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pF1KB9 EGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGKDYI--PI
       :: :::::.:.:::.:: :::::: .:..:: :.::::.::.:::::.::::::::  ::
CCDS34 EGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPI
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pF1KB9 NAILTG--NSGFTYSTPAFSEDFFKESISALKFNSGSSDDV-RYVNAFKFMSLE-RIKTF
       .  :.   .::..  :   :  . .: .   ::.  ..  . .:..  :  :    .:::
CCDS34 SETLSMEEDSGLSLPTSPVSC-MEEEEVCDPKFHYDNTAGISQYLQNSKRKSRPVSVKTF
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pF1KB9 EEL---LPNATSMFDDYQGDSSTLLASPMLKRFTWTDSKPKASLKIDLRVTSKSKESGLS
       :..    :..  . :: : ::. .:::  :: .   ... : : ..   : :::.::  :
CCDS34 EDIPLEEPEVKVIPDDNQTDSGMVLASEELKTL---EDRTKLSPSFGGMVPSKSRESVAS
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pF1KB9 DVSRPSFCHSSCGHVSEGKRR-FTYDHAELERKIACCSPPPDYNSVVLYSTPPI      
       . :  .  ..:  : ..     .. ..::: . :                          
CCDS34 EGSNQTSGYQSGYHSDDTDTTVYSSEEAELLKLIEIGVQTGSTAQILQPDSGTTLSSPPV
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>>CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5                (1298 aa)
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CCDS43     MQRGAALCLRLWLCLGLLDGLVSGYSMTPPTLNITEESHVIDTGDSLSISCRGQHP
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pF1KB9 HKWSLP------EMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAV
        .:. :         .:.::  .....  : ... .:..: :. ..:: :: : : :  .
CCDS43 LEWAWPGAQEAPATGDKDSEDTGVVRDCEGTDARPYCKVLLLHEVHANDTGSYVCYYKYI
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pF1KB9 PTSKKKETESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKF
        .  .  : .. :.:. :  .::..     :. . ...   . .:: :. :...:::.. 
CCDS43 KARIEGTTAASSYVFVRDFEQPFINK----PDTLLVNRKDAMWVPCLVSIPGLNVTLRS-
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pF1KB9 PLDTLIPDGKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTN-YLTHRQTNTIID
         ..: :::....::.:.:...:.   ..   : ::.: . . . .: .:.:   : . :
CCDS43 QSSVLWPDGQEVVWDDRRGMLVSTPLLHDALYLQCETTWGDQDFLSNPFLVHITGNELYD
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pF1KB9 VQISTPRPVKLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASV--RRRIDQSNSHA
       .:.   . ..:: :. ::::::. . .:. : . :.:: .. .:..   .:: .:.... 
CCDS43 IQLLPRKSLELLVGEKLVLNCTVWAEFNSGVTFDWDYPGKQAERGKWVPERRSQQTHTE-
             240       250       260       270       280       290 

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pF1KB9 NIFYSVLTIDKMQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAG
         . :.::: .....: : :.:.. .: .    .: : .... ::.:.  :  .::..::
CCDS43 --LSSILTIHNVSQHDLGSYVCKANNGIQRFRESTEVIVHENPFISVEWLKGPILEATAG
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CCDS43 NWVSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMTPTTYKGSVDNQTDSGMVLAS---EEFEQIE
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CCDS43 SRHRQESGFR                                                  
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pF1KB9 DPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVA
       :: ::::.:::: : ::::.::: ::::.::. :: :::::::.::::::.:. .: :::
CCDS44 DPGEVPLEEQCEYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVA
       820       830       840       850       860       870       

     860       870       880       890       900       910         
pF1KB9 VKMLKEGATASEYKALMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSN
       ::::::::::::..:::.::::: :::.:::::::::::::  ::::::::.::::::::
CCDS44 VKMLKEGATASEHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSN
       880       890       900       910       920       930       

     920       930       940       950       960       970         
pF1KB9 YLKSKRDLFFLNKDAALHMEPKKEKMEPGLEQGKKPRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLSD
       .:..::: :   .  : .   .. ...  .: ..  :    .:.. . .   . . .   
CCDS44 FLRAKRDAF---SPCAEKSPEQRGRFRAMVELARLDRRRPGSSDRVLFARFSKTEGGARR
       940          950       960       970       980       990    

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KB9 VEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKIC
       .  ..... ..  :.:::::. ::::::::::::.::::::::::::::::::..:::::
CCDS44 ASPDQEAEDLWLSPLTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDVVKIC
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

    1040      1050      1060      1070      1080      1090         
pF1KB9 DFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSP
       ::::::::::.:::::::..:::::::::::::::.:.:.:::::.:::::::::::.::
CCDS44 DFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSLGASP
         1060      1070      1080      1090      1100      1110    

    1100      1110      1120      1130      1140      1150         
pF1KB9 YPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQ
       :::::..:.::.:::.: :::::: .:: : .:::.::  ::: :: :.:::: ::::::
CCDS44 YPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILGDLLQ
         1120      1130      1140      1150      1160      1170    

    1160        1170      1180         1190      1200      1210    
pF1KB9 ANVQQDGKD--YIPINAILTGNSGFTY-STPAF--SEDFFKESISALKFNSGSSDDVRYV
       .   :. ..  . : ..  . ...:.  :: :.  ..   ..:  .:. .: ..   :: 
CCDS44 GRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSLAA---RYY
         1180      1190      1200      1210      1220         1230 

         1220                1230        1240      1250      1260  
pF1KB9 NAFKFMSL----------ERIKTFEE--LLPNATSMFDDYQGDSSTLLASPMLKRFTWTD
       :  .: .            :.:::::  . :.. .   : : ::. .:::   ..:   .
CCDS44 NWVSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMTPTTYKGSVDNQTDSGMVLAS---EEFEQIE
            1240      1250      1260      1270      1280           

           1270      1280      1290      1300      1310      1320  
pF1KB9 SKPKASLKIDLRVTSKSKESGLSDVSRPSFCHSSCGHVSEGKRRFTYDHAELERKIACCS
       :. .                                                        
CCDS44 SRHRQESGFSCKGPGQNVAVTRAHPDSQGRRRRPERGARGGQVFYNSEYGELSEPSEEDH
     1290      1300      1310      1320      1330      1340        

>>CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5                (972 aa)
 initn: 973 init1: 636 opt: 1176  Z-score: 493.1  bits: 103.1 E(32554): 3.8e-21
Smith-Waterman score: 1282; 34.9% identity (62.9% similar) in 744 aa overlap (477-1185:218-940)

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB9 GSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESIT
                                     ::    :: .  .  .:.  . .:   .: 
CCDS43 SISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHNNTKLAIP
       190       200       210       220       230       240       

        510       520         530       540       550          560 
pF1KB9 QRMAIIEGKNKMASTLVV--ADSRISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPN---GFHV
       :.  . ... . . :: .  .: . .: : :.:::  :  . .. : ...      . . 
CCDS43 QQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAYLNLSSEQ
       250       260       270       280       290       300       

             570       580        590       600       610       620
pF1KB9 NLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFL-YRDVTWILLRTVNNRTMHYSISKQKMAITKEHSITLN
       :: .  : :: :.:.  :. .   .  .:  :   ...  . ....     : .:..::.
CCDS43 NLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTYRHTFTLS
       310       320       330       340       350       360       

              630       640       650       660       670       680
pF1KB9 LTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTL
       :  .. :  ..: :.  :::   : . :   :.:.:      .. ..      :..: ::
CCDS43 LPRLKPS--EAGRYSFLARNP-GGWRALTF-ELTLRYPPEVSVIWTF------INGSGTL
       370         380        390        400       410             

              690        700           710          720            
pF1KB9 DCHANGVPEPQITWFK-NNHKIQQEPGIIL----GPGSSTLFIE---RVTE---------
        : :.: :.:..::.. ..:  . . . .:     :   .:  :   .::          
CCDS43 LCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETL
       420       430       440       450       460       470       

           730       740       750            760       770        
pF1KB9 EDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTS-----DKSNLELITLTCTCVAATLFWLLLTL
       : . .:.:.: :. ::  : :.. ... .     :.  .  ....:  . : :. ::: :
CCDS43 EHNQTYECRAHNSVGS-GSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLL
       480       490        500       510       520       530      

      780       790       800       810       820       830        
pF1KB9 FIRKMKRSSSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFARERLKLGKSLGRGAF
       . .  .. . ...   .      . . .:    .:::.  :::: :. :..::.:: :::
CCDS43 LYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPT--QLPYNE-KWEFPRNNLQFGKTLGAGAF
        540       550       560         570        580       590   

      840       850       860       870       880       890        
pF1KB9 GKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILTHIGHHLNVVNLLGAC
       ::::.:.:::. :  .   :::::::  : :.: .:::.::::..:.:.: :.:::::::
CCDS43 GKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGAC
           600       610       620       630       640       650   

      900       910       920       930       940         950      
pF1KB9 TKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNKDAALHMEPKK--EKMEPGLEQGKKPR
       : .:::..::.::: ::.: :.:. : . . :. . .  ..:.   .  .  ::. :  :
CCDS43 T-HGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAM-LGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLEK-KYVR
            660       670       680        690       700        710

        960       970         980       990      1000      1010    
pF1KB9 LDSVTSSESFASSGFQEDKSLS--DVEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLS
        ::  ::..  .   ..  : :  :   :.: :    .:. ..::. .: :::.:: ::.
CCDS43 RDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLA
              720       730       740       750       760       770

         1020      1030      1040      1050      1060      1070    
pF1KB9 SRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDK
       :..:::::.::::.::....:.:: ::::::::... .:. ::..:::.:::::::::: 
CCDS43 SKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDC
              780       790       800       810       820       830

         1080      1090      1100      1110      1120      1130    
pF1KB9 IYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIML
       .:...:::::::.::::::::: .::::. ..  : . ...:..:  : ..  .::.:: 
CCDS43 VYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQ
              840       850       860       870       880       890

         1140      1150      1160        1170       1180      1190 
pF1KB9 DCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGK--DYIPI-NAILTGNSGFTYSTPAFSE
        ::  .: .:: :    ... ..:: ..:.: .  ::  . ..  .:.:: . :      
CCDS43 ACWALEPTHRPTF----QQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEES
              900           910       920       930       940      

            1200      1210      1220      1230      1240      1250 
pF1KB9 DFFKESISALKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERIKTFEELLPNATSMFDDYQGDSSTLLA
                                                                   
CCDS43 SSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC                                  
        950       960       970                                    

>>CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13               (993 aa)
 initn: 1063 init1: 695 opt: 1166  Z-score: 489.0  bits: 102.4 E(32554): 6.4e-21
Smith-Waterman score: 1204; 31.5% identity (59.0% similar) in 871 aa overlap (386-1167:123-961)

         360       370       380        390       400       410    
pF1KB9 SMKVKAFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGY-SLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNV
                                     ::  :..:  .:: .::.: ...   ::..
CCDS31 VLVDAPGNISCLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTETQAGEYLLFI---QSEA
            100       110       120       130       140            

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB9 FKNLTATLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHN
         : :  . :...  .    . ..  : .  . ... :.: . ..:.: ..:    :. .
CCDS31 -TNYTILFTVSIRNTL----LYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVEWVL--CD-S
      150       160           170       180       190         200  

          480       490       500       510       520        530   
pF1KB9 HSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVAD-SRISGIY
       ..:.    :.. :   ..  . .. ... .   :    .  ..  . : . : ..     
CCDS31 QGES----CKE-ESPAVVKKEEKVLHELFGTDIRCCARNELGRECTRLFTIDLNQTPQTT
                  210       220       230       240       250      

           540       550       560          570        580         
pF1KB9 ICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLE---KMPTEGEDLKLSC-TVNKFLYRDVTW
       .     :::     :    . : .:: .. :   :   ::. ...:  ..:. . : .  
CCDS31 LPQLFLKVGE-PLWIRCKAVHVNHGFGLTWELENKALEEGNYFEMSTYSTNRTMIRILFA
        260        270       280       290       300       310     

     590       600       610       620         630                 
pF1KB9 ILLRTVNNRTMHYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNV--SLQD-----------------
       ..  .. : : .:. :..:    .     ..  ..:.  : .:                 
CCDS31 FVSSVARNDTGYYTCSSSKHPSQSALVTIVEKGFINATNSSEDYEIDQYEEFCFSVRFKA
         320       330       340       350       360       370     

                         640       650       660                   
pF1KB9 -----------SGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSD----------
                    .. :. ... .:  :  .:  . . : . :...  .:          
CCDS31 YPQIRCTWTFSRKSFPCEQKGLDNGYSI--SKFCNHKHQPGEYIFHAENDDAQFTKMFTL
         380       390       400         410       420       430   

           670       680       690       700                    710
pF1KB9 ------HTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQ-----EPGI--------ILG
             ...: .:..  .: ..: : :. :: : . :  .       :.        ..:
CCDS31 NIRRKPQVLAEASASQASCFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEITEGVWNRKANRKVFG
           440       450       460       470       480       490   

                720        730       740       750         760     
pF1KB9 P--GSSTLFIERVTEEDEG-VYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSD--KSNLELITLTCT
          .::::    ..:  .: . .: : :. :.   .  :.  :     ..:. . .   .
CCDS31 QWVSSSTL---NMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQDNISFYATIGV
           500          510       520       530       540       550

         770       780         790       800       810       820   
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       :.   :: ..:::.: .:.:..   : . .....  . :.  .  . ..  ::  :::: 
CCDS31 CL---LFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYDL-KWEFP
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       :: :..:: :: ::::::..:.:.::.:. .   :::::::: : .:: .:::.:::..:
CCDS31 RENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMT
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       ..: : :.::::::::  .::...: ::: ::.: :::.:::. :      . :.  . .
CCDS31 QLGSHENIVNLLGACT-LSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSF
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pF1KB9 EPKKEKME----PGLEQGK-KPRLDSVTS--SESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSDGFYK
        :  ..      :: .. . .:  :....  ..:: :    : .. . .::::: .    
CCDS31 YPTFQSHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEIEYENQKRLEEEEDLN----
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pF1KB9 EPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNP
         .:.:::. ...:::.:::::  ..:.::::::::.:.....:::::::::::::... 
CCDS31 -VLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDS
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pF1KB9 DYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCS
       .:: .:..:::.:::::::.:. ::. ::::::::.::::::::: .::::. .: .: .
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        ...:..:  : :.: ::: :: .::  : ..:: : .:.  ::    :  .:  :. ::
CCDS31 LIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDG
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       .                                                           
CCDS31 RVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS                           
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>>CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4                 (972 aa)
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CCDS47 YSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSA--N
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CCDS47 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
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pF1KB9 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA
        :  :...  :  ..   :.:: .. .  ..:::.  . :  ..  :     ...  .  
CCDS47 DYPKSENESNI--RYVSELHLTRLKGT--EGGTYTFLVSNSDVNAAI----AFNVYVNTK
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pF1KB9 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIIL----------G
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CCDS47 PEILT--YDRLV----NGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSG
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       :  . : ..   .    . .:. .::: :. :  ..:::..     .     :.:   . 
CCDS47 PPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVG--KTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIG
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pF1KB9 CTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSSSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFA
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CCDS47 FVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDP--TQLPYD-HKWEFP
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pF1KB9 RERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILT
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CCDS47 RNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLS
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pF1KB9 HIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNK-----DAALH-
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CCDS47 YLGNHMNIVNLLGACTI-GGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYK
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CCDS47 NLLHSKESSCSDSTNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVR--IGSYIERDVTPAIMEDDEL
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CCDS47 A-------LDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLAR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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