Result of FASTA (omim) for
pFN21AB4626
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4626, 770 aa
1>>>pF1KB4626 770 - 770 aa - 770 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8908+/-0.000435; mu= -1.0602+/- 0.027
mean_var=267.3534+/-53.634, 0's: 0 Z-trim(119.6): 132 B-trim: 637 in 2/53
Lambda= 0.078439
statistics sampled from 33633 (33820) to 33633 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.397), width: 16
Scan time: 14.550
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001078923 (OMIM: 608434) ARF GTPase-activating ( 770) 5118 593.2 1.4e-168
XP_011522986 (OMIM: 608434) PREDICTED: ARF GTPase- ( 777) 5094 590.5 9e-168
NP_054749 (OMIM: 608434) ARF GTPase-activating pro ( 761) 3309 388.5 5.7e-107
XP_011522987 (OMIM: 608434) PREDICTED: ARF GTPase- ( 768) 3285 385.8 3.8e-106
XP_016875749 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 664) 2538 301.2 9.4e-81
NP_001128686 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating ( 729) 2538 301.2 1e-80
XP_016875748 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 694) 2528 300.1 2.1e-80
NP_476510 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating pro ( 759) 2528 300.1 2.3e-80
XP_005254054 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 758) 2526 299.9 2.7e-80
NP_631940 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating pro ( 471) 2434 289.3 2.5e-77
XP_016875750 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 470) 2432 289.1 2.9e-77
XP_016875747 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 713) 2414 287.2 1.7e-76
XP_006719771 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 714) 2404 286.0 3.7e-76
XP_006719770 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 744) 2381 283.5 2.3e-75
XP_006719776 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 456) 2373 282.4 2.9e-75
NP_476511 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating pro ( 631) 2373 282.5 3.8e-75
NP_001128685 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating ( 681) 2238 267.2 1.6e-70
NP_055591 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating pro ( 679) 2230 266.3 3e-70
XP_006719775 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 596) 2224 265.6 4.3e-70
XP_006719772 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 709) 2225 265.8 4.6e-70
NP_001317083 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating ( 421) 2218 264.8 5.3e-70
NP_001317082 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating ( 708) 2217 264.9 8.5e-70
XP_016867224 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 462) 309 48.8 6.1e-05
XP_016867222 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 527) 309 48.9 6.7e-05
XP_005250000 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 565) 309 48.9 7.1e-05
NP_001268229 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 580) 309 48.9 7.2e-05
XP_016867223 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 580) 309 48.9 7.2e-05
XP_016867221 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 630) 309 48.9 7.7e-05
XP_011514082 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 683) 309 49.0 8.2e-05
NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK ( 911) 309 49.0 0.0001
NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK ( 804) 294 47.3 0.0003
XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 808) 294 47.3 0.0003
NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 857) 294 47.3 0.00032
XP_006712298 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 882) 294 47.3 0.00033
XP_006712297 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 886) 294 47.3 0.00033
XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1073) 294 47.4 0.00038
XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1098) 294 47.4 0.00039
XP_016858771 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1106) 294 47.4 0.00039
XP_011508849 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1126) 294 47.4 0.00039
XP_006712300 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1147) 294 47.4 0.0004
XP_006712302 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1151) 294 47.4 0.0004
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK ( 836) 283 46.1 0.00074
XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit ( 856) 283 46.1 0.00075
XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1172) 283 46.2 0.00096
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192) 283 46.2 0.00097
XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1192) 283 46.2 0.00097
XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 259 43.3 0.0046
XP_011510906 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 259 43.3 0.0046
XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 259 43.3 0.0046
NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ( 778) 259 43.3 0.0046
>>NP_001078923 (OMIM: 608434) ARF GTPase-activating prot (770 aa)
initn: 5118 init1: 5118 opt: 5118 Z-score: 3147.8 bits: 593.2 E(85289): 1.4e-168
Smith-Waterman score: 5118; 100.0% identity (100.0% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KB4 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
730 740 750 760 770
>>XP_011522986 (OMIM: 608434) PREDICTED: ARF GTPase-acti (777 aa)
initn: 4667 init1: 4667 opt: 5094 Z-score: 3133.0 bits: 590.5 E(85289): 9e-168
Smith-Waterman score: 5094; 99.1% identity (99.1% similar) in 777 aa overlap (1-770:1-777)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB4 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPK-------RPALEPVRSSLRL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
XP_011 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKPHSCPLQRPALEPVRSSLRL
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 LNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
730 740 750 760 770
>>NP_054749 (OMIM: 608434) ARF GTPase-activating protein (761 aa)
initn: 3307 init1: 3307 opt: 3309 Z-score: 2041.5 bits: 388.5 E(85289): 5.7e-107
Smith-Waterman score: 5026; 98.8% identity (98.8% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-761)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 HKNGHYIIPQMAD---------SLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
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:::: :.::::::: .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
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:.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
XP_016 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
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:::::::.:::. ::.:: :.. .:. .:: :::::::::::: : : :.
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pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:....
XP_016 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
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pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
::.:: .::. : : .. ..:. . :. : . .:::: ::. ::.
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pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
: :. : ::::: ::
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pF1KB4 SCSQEGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELES
:.:.: ...: .:::.:: . :. .:.. . . . :.
XP_016 --------HASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDGMGSSRKGRQRSMVWPGDGLVPDTAE
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pF1KB4 LDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFP
.: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.:::
XP_016 PHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFP
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pF1KB4 KRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQ
:
XP_016 KVKTQV
660
>>NP_001128686 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating prot (729 aa)
initn: 3011 init1: 1468 opt: 2538 Z-score: 1570.2 bits: 301.2 E(85289): 1e-80
Smith-Waterman score: 3106; 64.0% identity (79.1% similar) in 788 aa overlap (1-767:1-726)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::.. .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
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pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
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pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::
NP_001 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
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pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_001 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
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pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
:::: :.::::::: .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
NP_001 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
250 260 270 280 290
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pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
:.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
NP_001 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
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pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
:::::::.:::. ::.:: :.. .:. .:: :::::::::::: : : :.
NP_001 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
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pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:....
NP_001 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
410 420 430 440 450 460
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pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
::.:: .::. : : .. ..:. . :. : . .:::: ::. ::.
NP_001 LQSENSNLRKQATTNVYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSA--RGSRPMSMYETGSGQKPY
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pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
: :. : ::::: ::
NP_001 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PA-----------------------
530 540
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pF1KB4 SCSQEGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELES
:.:.: ...: .:::.:: . :. .:.. . . . :.
NP_001 --------HASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDGMGSSRKGRQRSMVWPGDGLVPDTAE
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pF1KB4 LDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFP
.: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.:::
NP_001 PHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFP
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pF1KB4 KRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQ
:.: . ::.:::::..:::::::::.::.: .::.:.: ::.:::::::::::::::::
NP_001 KKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECKKTLPGDPGSPTDVQLVTQQVIQCAYDIAKAAKQ
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pF1KB4 LVTITTREKKQ
::::::.:
NP_001 LVTITTKENNN
720
>>XP_016875748 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase-acti (694 aa)
initn: 2681 init1: 1468 opt: 2528 Z-score: 1564.4 bits: 300.1 E(85289): 2.1e-80
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10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::.. .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
XP_016 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
XP_016 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::
XP_016 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
XP_016 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
:::: :.::::::: .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
XP_016 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
:.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
XP_016 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
:::::::.:::. ::.:: :.. .:. .:: :::::::::::: : : :.
XP_016 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:....
XP_016 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
410 420 430 440 450 460
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pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
::.:: .::. : : .. ..:. . :. : . .:::: ::. ::.
XP_016 LQSENSNLRKQATTNVYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSA--RGSRPMSMYETGSGQKPY
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
: :. : ::::: :: . : .:.:..: ::. :
XP_016 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PAHIGRSALVTSSSSLPSFPST--L
530 540 550 560
590 600 610 620 630
pF1KB4 SCSQ-EGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELE
: :. :..:..:.: ...: .:::.:: . :. .:.. . . . :.
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pF1KB4 SLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLF
.: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.::
XP_016 EPHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALF
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::
XP_016 PKVKTQV
690
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::.. .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
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::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
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::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
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:::: :.::::::: .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
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..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:....
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::.:: .::. : : .. ..:. . :. : . .:::: ::. ::.
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pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
: :. : ::::: :: . : .:.:..: ::. :
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530 540 550 560
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pF1KB4 SCSQ-EGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELE
: :. :..:..:.: ...: .:::.:: . :. .:.. . . . :.
NP_476 SWSRDESARRASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDGMGSSRKGRQRSMVWPGDGLVPDTA
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 SLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLF
.: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.::
NP_476 EPHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALF
630 640 650 660 670 680
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pF1KB4 PKRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAK
::.: . ::.:::::..:::::::::.::.: .::.:.: ::.::::::::::::::::
NP_476 PKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECKKTLPGDPGSPTDVQLVTQQVIQCAYDIAKAAK
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760 770
pF1KB4 QLVTITTREKKQ
:::::::.:
NP_476 QLVTITTKENNN
750
>>XP_005254054 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase-acti (758 aa)
initn: 3097 init1: 1468 opt: 2526 Z-score: 1562.6 bits: 299.9 E(85289): 2.7e-80
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10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::.. .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
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::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
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::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::
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::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
XP_005 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
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pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
:::: :.::::::: ::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
XP_005 HKNGQHFIIPQMAD---------SLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
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pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
:.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
XP_005 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
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pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
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XP_005 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
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pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
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pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
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XP_005 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PAHIGRSALVTSSSSLPSFPST--L
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pF1KB4 SCSQ-EGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELE
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XP_005 SWSRDESARRASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDGMGSSRKGRQRSMVWPGDGLVPDTA
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 SLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLF
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XP_005 EPHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALF
630 640 650 660 670 680
700 710 720 730 740 750
pF1KB4 PKRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAK
::.: . ::.:::::..:::::::::.::.: .::.:.: ::.::::::::::::::::
XP_005 PKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECKKTLPGDPGSPTDVQLVTQQVIQCAYDIAKAAK
690 700 710 720 730 740
760 770
pF1KB4 QLVTITTREKKQ
:::::::.:
XP_005 QLVTITTKENNN
750
>>NP_631940 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating protein (471 aa)
initn: 2334 init1: 1468 opt: 2434 Z-score: 1509.2 bits: 289.3 E(85289): 2.5e-77
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10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
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NP_631 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
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70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
NP_631 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
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NP_631 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_631 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
:::: :.::::::: .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
NP_631 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
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NP_631 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
300 310 320 330 340 350
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pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
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NP_631 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
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NP_631 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLLG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 LQAENLQLRQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPP
NP_631 KDAN
470
770 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:41:00 2016 done: Thu Nov 3 21:41:02 2016
Total Scan time: 14.550 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]