Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3567
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3567, 714 aa
1>>>pF1KB3567 714 - 714 aa - 714 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0865+/-0.00107; mu= 21.3414+/- 0.065
mean_var=74.6224+/-14.438, 0's: 0 Z-trim(103.7): 60 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.148470
statistics sampled from 7479 (7537) to 7479 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 2.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11 ( 714) 4816 1041.7 0
CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 ( 700) 3189 693.2 3.3e-199
CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1 ( 703) 2913 634.1 2.1e-181
CCDS53478.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 ( 622) 2855 621.7 1.1e-177
CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6 ( 739) 2770 603.5 3.6e-172
CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 729) 2691 586.6 4.5e-167
CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 690) 2200 481.4 2e-135
CCDS81431.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 627) 1744 383.7 4.6e-106
CCDS12519.1 CAPN12 gene_id:147968|Hs108|chr19 ( 719) 1375 304.7 3.2e-82
CCDS46254.1 CAPN14 gene_id:440854|Hs108|chr2 ( 684) 1333 295.7 1.6e-79
CCDS31053.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 664) 1154 257.3 5.3e-68
CCDS46252.1 CAPN13 gene_id:92291|Hs108|chr2 ( 669) 937 210.9 5.2e-54
CCDS32207.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 815) 921 207.5 6.5e-53
CCDS45245.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 821) 921 207.5 6.6e-53
CCDS8248.1 CAPN5 gene_id:726|Hs108|chr11 ( 640) 828 187.5 5.4e-47
CCDS45246.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 309) 744 169.2 8.1e-42
CCDS14555.1 CAPN6 gene_id:827|Hs108|chrX ( 641) 664 152.4 2e-36
CCDS54010.1 CAPNS2 gene_id:84290|Hs108|chr16 ( 248) 651 149.2 6.8e-36
CCDS10086.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 156) 644 147.6 1.4e-35
CCDS33420.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2 ( 517) 638 146.7 8.2e-35
CCDS12489.1 CAPNS1 gene_id:826|Hs108|chr19 ( 268) 634 145.6 9e-35
CCDS42838.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2 ( 672) 638 146.8 1e-34
CCDS10410.1 CAPN15 gene_id:6650|Hs108|chr16 (1086) 488 114.8 6.7e-25
CCDS47638.1 SRI gene_id:6717|Hs108|chr7 ( 183) 322 78.7 8.9e-15
CCDS5612.1 SRI gene_id:6717|Hs108|chr7 ( 198) 322 78.7 9.4e-15
CCDS59063.1 SRI gene_id:6717|Hs108|chr7 ( 180) 315 77.2 2.5e-14
CCDS82527.1 GCA gene_id:25801|Hs108|chr2 ( 198) 311 76.3 4.8e-14
CCDS2218.1 GCA gene_id:25801|Hs108|chr2 ( 217) 311 76.4 5.2e-14
>>CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11 (714 aa)
initn: 4816 init1: 4816 opt: 4816 Z-score: 5573.1 bits: 1041.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4816; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB3 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
670 680 690 700 710
>>CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 (700 aa)
initn: 3163 init1: 1972 opt: 3189 Z-score: 3689.8 bits: 693.2 E(32554): 3.3e-199
Smith-Waterman score: 3189; 62.8% identity (86.9% similar) in 701 aa overlap (13-713:3-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
:..:.. :.: ::: :. :::::.:::: :: .::..::::.: .
CCDS31 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHDRAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
:: .:..::.:.::: :::: ::.::::::. ..::::. ::::::::::::::::::::
CCDS31 FPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
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CCDS31 IASLTLNEEILARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
:::.:::::::::::::.:: :::::::.:.:::::::::..:::::.: : .:..:: :
CCDS31 AEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
::..::::::::::.:. : :::::.:::::::::::::..:. :.. .:::.::::::
CCDS31 ALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
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CCDS31 VEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
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CCDS31 DTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEED--EDEEDGESGCTFL
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
..:.::::::.:..:.::.::::..:::: :: :: .::...:::.: .: ::. ::::
CCDS31 VGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINL
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
::: .::.::::::..:::::::::.::: .: ::::.: .::.:.::: . .. ::
CCDS31 REVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDI-SE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
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CCDS31 DDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSD
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
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CCDS31 GSGKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIV
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710
pF1KB3 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
.:... .: .:::::: :::::::.:..:: :: . :.. .::..:: ....
CCDS31 ARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
650 660 670 680 690 700
>>CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1 (703 aa)
initn: 2907 init1: 2907 opt: 2913 Z-score: 3370.2 bits: 634.1 E(32554): 2.1e-181
Smith-Waterman score: 2913; 59.0% identity (83.9% similar) in 695 aa overlap (15-708:5-698)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
.: :..::: ::: ..::.::::::.. :: .::.::.::.:
CCDS73 MAAQAAGVSRQRAATQGLGSNQNALKYLGQDFKTLRQQCLDSGVLFKDPE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
:: :..::::::::.: .: :: ::::::: .::::: ::::::::::.:::::::::
CCDS73 FPACPSALGYKDLGPGSPQTQGIIWKRPTELCPSPQFIVGGATRTDICQGGLGDCWLLAA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
:::::::. ::.::::. :.::..::::::::.::.::::.::.:: :: :.:.:.:.::
CCDS73 IASLTLNEELLYRVVPRDQDFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVIDDRLPTKNGQLLFLHS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
.:::::::::::::::.:: ::::.:::: :::::::::..:.:.:.: :..::::: :
CCDS73 EQGNEFWSALLEKAYAKLNGCYEALAGGSTVEGFEDFTGGISEFYDLKKPPANLYQIIRK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
:: :::::::::.::. . :::: .::::.:::::::...::..:. .:::.::::::
CCDS73 ALCAGSLLGCSIDVSSAAEAEAITSQKLVKSHAYSVTGVEEVNFQGHPEKLIRLRNPWGE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
:::.:::::.. :::..:: ....: :.::::::::. ::.:.:.:::::::.::.:.:
CCDS73 VEWSGAWSDDAPEWNHIDPRRKEELDKKVEDGEFWMSLSDFVRQFSRLEICNLSPDSLSS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
. ..::: .:..: : ::::::::.:::::.:.::::::::::.:. .. . : :. .
CCDS73 EEVHKWNLVLFNGHWTRGSTAGGCQNYPATYWTNPQFKIRLDEVDEDQEESIGEPCCTVL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
:.::::.:: ..:.:. : .::.:::.:: :: .. .:: :::::: ::. ..::
CCDS73 LGLMQKNRRWRKRIGQGMLSIGYAVYQVPKELESHTDAHLGRDFFLAYQPSARTSTYVNL
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
:::: : :::::::.:::::::: :.:.: :: ::::.: ..:. : . .: : : ::
CCDS73 REVSGRARLPPGEYLVVPSTFEPFKDGEFCLRVFSEKKAQALEIGDVVAGN-PYEPHPSE
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KB3 -EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDR
.. :..:. ::..:::.: ::... :. .::. .::. :.. ::....:: :..:.:
CCDS73 VDQEDDQFRRLFEKLAGKDSEITANALKILLNEAFSKRTDIKFDGFNINTCREMISLLDS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DGNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELI
.:.: :: :::. :: .:..:: :. . : ..::...:.::: :...::: ::... . :
CCDS73 NGTGTLGAVEFKTLWLKIQKYLEIYWETDYNHSGTIDAHEMRTALRKAGFTLNSQVQQTI
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 ITRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
::. :...::.:: :..::::.:..:. :: : ::.: ..: .::
CCDS73 ALRYACSKLGINFDSFVACMIRLETLFKLFSLLDEDKDGMVQLSLAEWLCCVLV
650 660 670 680 690 700
>>CCDS53478.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 (622 aa)
initn: 2846 init1: 1655 opt: 2855 Z-score: 3303.8 bits: 621.7 E(32554): 1.1e-177
Smith-Waterman score: 2855; 63.1% identity (87.3% similar) in 624 aa overlap (90-713:2-622)
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 AFPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLA
:. ..::::. :::::::::::::::::::
CCDS53 MEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLA
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 AIASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVH
::::::::. .: :::: .::::..::::::::.::.::::.::::: :: :::.:.:::
CCDS53 AIASLTLNEEILARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVH
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 SAEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIIL
::::.:::::::::::::.:: :::::::.:.:::::::::..:::::.: : .:..::
CCDS53 SAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQ
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 KALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWG
:::..::::::::::.:. : :::::.:::::::::::::..:. :.. .:::.:::::
CCDS53 KALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWG
160 170 180 190 200 210
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CCDS53 EVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLT
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CCDS53 SDTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEED--EDEEDGESGCTF
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CCDS53 LVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFIN
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CCDS53 LREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDI-S
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CCDS53 EDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDS
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CCDS53 DGSGKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVI
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CCDS53 VARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
570 580 590 600 610 620
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10 20 30
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CCDS47 FIMDGISPTDICQGILGDCWLLAAIGSLTTCPKLLYRVVPRGQSFKKNYAGIFHFQIWQF
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160 170 180 190 200 210
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CCDS47 GQWVNVVVDDRLPTKNDKLVFVHSTERSEFWSALLEKAYAKLSGSYEALSGGSTMEGLED
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220 230 240 250 260 270
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CCDS47 FTGGVAQSFQLQRPPQNLLRLLRKAVERSSLMGCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSV
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CCDS47 TGLQDVHYRGKMETLIRVRNPWGRIEWNGAWSDSAREWEEVASDIQMQLLHKTEDGEFWM
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CCDS47 SYQDFLNNFTLLEICNLTPDTLSGDYKSYWHTTFYEGSWRRGSSAGGCRNHPGTFWTNPQ
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CCDS47 FKISLPEGDDPED--DAEGNVVVCTCLVALMQKNWRHARQQGAQLQTIGFVLYAVPKEFQ
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CCDS47 NIQDVHLKKEFFTKYQDHGFSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRV
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pF1KB3 FSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRI
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CCDS47 FTEKHSESWELDEVNYAEQLQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRM
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CCDS47 AIKFKSFKTKGFGLDACRCMINLMDKDGSGKLGLLEFKILWKKLKKWMDIFRECDQDHSG
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pF1KB3 SMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELIITRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLD
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CCDS47 TLNSYEMRLVIEKAGIKLNNKVMQVLVARYADDDLIIDFDSFISCFLRLKTMFTFFLTMD
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700 710
pF1KB3 TDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
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CCDS47 PKNTGHICLSLEQWLQMTMWG
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CCDS10 Y-------SQKFPIQFVWKRPPEICENPRFIIDGANRTDICQGELGDCWFLAAIACLTLN
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CCDS10 QHLLFRVIPHDQSFIENYAGIFHFQFWRYGEWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRNEFW
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CCDS10 SALLEKAYAKLHGSYEALKGGNTTEAMEDFTGGVAEFFEIRDAPSDMYKIMKKAIERGSL
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CCDS10 SDRWKDWSFVDKDEKARLQHQVTEDGEFWMSYEDFIYHFTKLEICNLTADALQSDKLQTW
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pF1KB3 NTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRL-DETDDPDDYGDRESGCSFVLALMQ
.... :: : :: .::::::.: :::.:::....: .: ::::: : :::..::::
CCDS10 TVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDD---SEVICSFLVALMQ
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CCDS10 KNRRKDRKLGASLFTIGFAIYEVPKEMHGNKQ-HLQKDFFLYNASKARSKTYINMREVSQ
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pF1KB3 RFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLS---EEE
::::::.:::.::::.::..::.:.:: :::: . :... :... : : : : :
CCDS10 RFRLPPSEYVIVPSTYEPHQEGEFILRVFSEKRNLSEEVENTISVDRPVPQPGSSDQESE
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pF1KB3 IDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRDGN
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CCDS10 EQQQFRNIFKQIAGDDMEICADELKKVLNTVVNKHKDLKTHGFTLESCRSMIALMDTDGS
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pF1KB3 GKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELIITR
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CCDS10 GKLNLQEFHHLWNKIKAWQKIFKHYDTDQSGTINSYEMRNAVNDAGFHLNNQLYDIITMR
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pF1KB3 YSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
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CCDS10 YADKHMNIDFDSFICCFVRLEGMFRAFHAFDKDGDGIIKLNVLEWLQLTMYA
680 690 700 710 720
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pF1KB3 VYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQSL
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pF1KB3 GYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLND
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CCDS15 FYSER-PQ----IPFVWKRPGEIVKNPEFILGGATRTDICQGELGDCWLLAAIASLTLNQ
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CCDS15 KALARVIPQDQSFGPGYAGIFHFQFWQHSEWLDVVIDDRLPTFRDRLVFLHSADHNEFWS
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CCDS15 ALLEKAYAKLNGSYEALKGGSAIEAMEDFTGGVAETFQTKEAPENFYEILEKALKRGSLL
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pF1KB3 GCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWS
:: :: :. . :: : :.::::::::: ::..::: . :::.:::::.:::.:.::
CCDS15 GCFIDTRSAAESEARTPFGLIKGHAYSVTGIDQVSFRGQRIELIRIRNPWGQVEWNGSWS
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pF1KB3 DSSSEWNNVDPYERDQL-RVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKSRTIRKWN
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CCDS15 DSSPEWRSVGPAEQKRLCHTALDDGEFWMAFKDFKAHFDKVEICNLTPDALEEDAIHKWE
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pF1KB3 TTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALMQKH
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CCDS15 VTVHQGSWVRGSTAGGCRNFLDTFWTNPQIKLSLTEKDE----GQEE--CSFLVALMQKD
360 370 380 390 400
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pF1KB3 RRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINLREVSTRF
::. .::: .. :::.:.:: : . ::..::: .::::::. :::::::: ::
CCDS15 RRKLKRFGANVLTIGYAIYECPDK-----DEHLNKDFFRYHASRARSKTFINLREVSDRF
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pF1KB3 RLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLS----EEEI
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CCDS15 KLPPGEYILIPSTFEPHQEADFCLRIFSEKKAITRDMDGNVDIDLPEPPKPTPPDQETEE
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pF1KB3 DENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRDGNG
.. :.:::.:.::::::....::. .:: ...:.::.. : .:: ::.....::: .:::
CCDS15 EQRFRALFEQVAGEDMEVTAEELEYVLNAVLQKKKDIKFKKLSLISCKNIISLMDTSGNG
520 530 540 550 560 570
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pF1KB3 KLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELIITRY
:: . ::...:.........: .:: ::::.::.::.: :...:::.:...: .::. ::
CCDS15 KLEFDEFKVFWDKLKQWINLFLRFDADKSGTMSTYELRTALKAAGFQLSSHLLQLIVLRY
580 590 600 610 620 630
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pF1KB3 SEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
.. .: .:::.:. ::::::. : :..:.: . ... ....:::
CCDS15 ADEELQLDFDDFLNCLVRLENASRVFQALSTKNKEFIHLNINEFIHLTMNI
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>>CCDS81431.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 (627 aa)
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pF1KB3 SLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHSAE
.:: .::.:::.:: :: .:::.:::.
CCDS81 LFEDADFPASNSSLFYSERPQIPFVWKRPGFWQHSEWLDVVIDDRLPTFRDRLVFLHSAD
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pF1KB3 GNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILKAL
::::::::::::::.:::::::.:::. :..:::::::.: .. ..:: ..:.:. :::
CCDS81 HNEFWSALLEKAYAKLNGSYEALKGGSAIEAMEDFTGGVAETFQTKEAPENFYEILEKAL
110 120 130 140 150 160
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pF1KB3 ERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGEVE
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CCDS81 KRGSLLGCFIDTRSAAESEARTPFGLIKGHAYSVTGIDQVSFRGQRIELIRIRNPWGQVE
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pF1KB3 WTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQL-RVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKSR
:.:.::::: :: .: : :. .: .. ..::::::.:.:: .: ..::::::::::.
CCDS81 WNGSWSDSSPEWRSVGPAEQKRLCHTALDDGEFWMAFKDFKAHFDKVEICNLTPDALEED
230 240 250 260 270 280
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pF1KB3 TIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVL
.:.::..:...:.: ::::::::::. :::.:::.:. : : :. :..: :::..
CCDS81 AIHKWEVTVHQGSWVRGSTAGGCRNFLDTFWTNPQIKLSLTEKDE----GQEE--CSFLV
290 300 310 320 330
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pF1KB3 ALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINLR
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CCDS81 ALMQKDRRKLKRFGANVLTIGYAIYECPDK-----DEHLNKDFFRYHASRARSKTFINLR
340 350 360 370 380 390
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CCDS81 EVSDRFKLPPGEYILIPSTFEPHQEADFCLRIFSEKKAITRDMDGNVDIDLPEPPKPTPP
400 410 420 430 440 450
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700 710
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]