Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2505
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2505, 1040 aa
1>>>pF1KE2505 1040 - 1040 aa - 1040 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8554+/-0.00118; mu= 10.2785+/- 0.070
mean_var=227.1130+/-49.137, 0's: 0 Z-trim(109.1): 189 B-trim: 37 in 1/49
Lambda= 0.085105
statistics sampled from 10446 (10652) to 10446 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16
Scan time: 3.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1 (1040) 6991 872.9 0
CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1018) 3362 427.3 8.1e-119
CCDS8738.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1007) 3356 426.6 1.3e-118
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028) 3084 393.2 1.5e-108
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1026) 3057 389.9 1.5e-107
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1100) 3054 389.5 2.1e-107
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (1026) 3050 389.0 2.8e-107
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3 (1028) 2912 372.1 3.5e-102
CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 ( 911) 2653 340.2 1.2e-92
CCDS2558.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 ( 698) 2192 283.5 1.1e-75
CCDS58225.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 ( 627) 2090 270.9 6e-72
CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208) 1415 188.3 8.3e-47
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192) 1271 170.6 1.7e-41
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248) 1217 164.0 1.8e-39
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253) 1217 164.0 1.8e-39
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257) 1217 164.0 1.8e-39
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1240) 1209 163.1 3.5e-39
CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1171) 1169 158.1 1e-37
CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1224) 1169 158.1 1e-37
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1183) 1159 156.9 2.4e-37
CCDS34590.1 SDK1 gene_id:221935|Hs108|chr7 (2213) 1110 151.2 2.3e-35
CCDS53461.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 ( 619) 767 108.5 4.7e-23
CCDS30982.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1169) 699 100.4 2.4e-20
CCDS53462.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1174) 699 100.4 2.4e-20
CCDS2971.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1114) 611 89.6 4.1e-17
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 609 89.4 5.7e-17
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 609 89.5 5.8e-17
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 609 89.5 5.8e-17
CCDS77788.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1115) 606 89.0 6.2e-17
CCDS10205.1 IGDCC3 gene_id:9543|Hs108|chr15 ( 814) 540 80.7 1.4e-14
CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15 (1150) 533 80.0 3.2e-14
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 521 78.5 8.4e-14
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 521 78.5 8.5e-14
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012) 473 72.9 7.6e-12
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 467 71.9 8e-12
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1551) 466 71.9 1.2e-11
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1606) 466 72.0 1.2e-11
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 465 71.9 1.5e-11
CCDS10206.1 IGDCC4 gene_id:57722|Hs108|chr15 (1250) 453 70.2 3e-11
>>CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1 (1040 aa)
initn: 6991 init1: 6991 opt: 6991 Z-score: 4654.6 bits: 872.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6991; 99.8% identity (99.9% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKAHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPTLQIPSVSFED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPTLQIPSVSFED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRNGEPLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 TVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 GGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 YTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KE2 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
::::::::::::::::::::
CCDS14 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
1030 1040
>>CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1018 aa)
initn: 2772 init1: 1723 opt: 3362 Z-score: 2246.7 bits: 427.3 E(32554): 8.1e-119
Smith-Waterman score: 3362; 50.5% identity (75.1% similar) in 1003 aa overlap (10-1000:9-992)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTT-----FGPVFEDQPLSVLFPEESTEE
::.... .. .. .: : .. :::.::.::.....:::: :
CCDS87 MKMWLLVSHLVIISITTCLAEFTWYRRYGHGVSEEDKGFGPIFEEQPINTIYPEESLEG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QVLLACRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASN
.: : ::::::: .:.:.::. .. : ..:...::::::: :: : .:::.: :::::
CCDS87 KVSLNCRARASPFPVYKWRMNNGDVDLT-SDRYSMVGGNLVINNPDKQKDAGIYYCLASN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PVGTVVSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPG-LSYRWLLNEFP
: : : :: : ::.:. : ::: :...:: :..: :.:: :.: :::::::::::
CCDS87 NYGMVRSTEATLSFGYLDPFPPEERPEVRVKEGKGMVLLCDPPYHFPDDLSYRWLLNEFP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NFIPTDGRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQL-NLAAED
:: : :.:::::.:::::: ..::: :::::...: :::::::: : . .
CCDS87 VFITMDKRRFVSQTNGNLYIANVEASDKGNYSCFVSSPS--ITKSVFSKFIPLIPIPERT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TRLFAPSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPT---
:. . .: ..: ..:::.::.:::::::.::::: :.:::: : :. .::: .
CCDS87 TKPYPADIVVQFK-DVYALMGQNVTLECFALGNPVPDIRWRKV---LEPMPSTAEISTSG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE2 --LQIPSVSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGC
:.: ....:::: ::::::: .:.: :.:: ::: :::.. :.:::.::::.: : :
CCDS87 AVLKIFNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPC
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 AAAGKPRPTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASA
.:.::: ::.:::.:: :.::. ...:..:::::.::: .:.:::.:
CCDS87 VATGKPIPTIRWLKNG--------YAYHKGELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANA
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 ELAVQALAPDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVT
:: . :::: :..::... : ::.::...: :.:.:::: :::::: ::::::. .
CCDS87 ELKILALAPTFEMNPMKKKILAAKGGRVIIECKPKAAPKPKFSWSKGTEWLVNSSRILIW
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 PDGTLIIRNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTL
::.: : ::.:.: : ::::::: ::::::: : . : :.: ::: .:::..:.: :.
CCDS87 EDGSLEINNITRNDGGIYTCFAENNRGKANSTGTLVITDPTRIILAPINADITVGENATM
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 QCHASHDPTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCM
:: :: ::..::::.:... . :::.: . ::.:. . .. :.: : ::::.:.:.:::
CCDS87 QCAASFDPALDLTFVWSFNGYVIDFNKENIHYQRNFMLDSNGELLIRNAQLKHAGRYTCT
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 AQTVVDSASKEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTP
:::.::..: : ..::::::::::. ..:: :.. :.:::: ::::::.:::.:..:
CCDS87 AQTIVDNSSASADLVVRGPPGPPGGLRIEDIRATSVALTWSRGSDNHSPISKYTIQTKTI
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 PAGKWKQVRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREA
. ::...:.: :::: :.:... : :::.:::::.:.: :: :::: ::..:.: :
CCDS87 LSDDWKDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGA
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 APSVAPSGLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADA
::.:::: ..:::: :: ..:.:.::::. :..:::...:. . .:. . : . :.
CCDS87 APNVAPSDVGGGGGRNRELTITWAPLSREYHYGNNFGYIVAFKPFDGEEWKKVTVTNPDT
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 QYFVYSNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSE
.:...:.. : : :.::....: .:::: ::.:.. ::.. : :::.: .: .::::
CCDS87 GRYVHKDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSE
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 MNVTWEPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTV
..: :: : .. :. .:.:::: : ::: ::.::.... . :::. .: :.:.: . :
CCDS87 ISVHWEHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEV
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 RAYNRAGTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYK
: : :: :: : .: : : :: .:: :: . :.: : :: :: . :::.:::::
CCDS87 GACNSAGCGPPSDMIEAFTKKAPPSQPPRIISSVRSGSRYIITWDHVVALSNESTVTGYK
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 MLYQNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSM
.::. : . :. : :. ::.:.:.: :. .:..:. . ::::. ..:.:
CCDS87 VLYRPDGQHDGKLYSTHKHSIEVPIPRD-GEYVVEVRAHSDGGDGVVSQVKISGAPTLSP
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040
pF1KE2 MVENMAVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
CCDS87 SLLGLLLPAFGILVYLEF
1010
>>CCDS8738.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1007 aa)
initn: 2780 init1: 1723 opt: 3356 Z-score: 2242.7 bits: 426.6 E(32554): 1.3e-118
Smith-Waterman score: 3356; 50.9% identity (75.6% similar) in 996 aa overlap (12-1000:5-981)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
:::. ....: .. .. . :::.::.::.....:::: : .: :
CCDS87 MKMWLLVSHLVIISITTCLAVSEEDKGFGPIFEEQPINTIYPEESLEGKVSLN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
::::::: .:.:.::. .. : ..:...::::::: :: : .:::.: ::::: : :
CCDS87 CRARASPFPVYKWRMNNGDVDLT-SDRYSMVGGNLVINNPDKQKDAGIYYCLASNNYGMV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPG-LSYRWLLNEFPNFIPT
: :: : ::.:. : ::: :...:: :..: :.:: :.: ::::::::::: ::
CCDS87 RSTEATLSFGYLDPFPPEERPEVRVKEGKGMVLLCDPPYHFPDDLSYRWLLNEFPVFITM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 DGRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQL-NLAAEDTRLFA
: :.:::::.:::::: ..::: :::::...: :::::::: : . . :. .
CCDS87 DKRRFVSQTNGNLYIANVEASDKGNYSCFVSSPS--ITKSVFSKFIPLIPIPERTTKPYP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPT-----LQI
.: ..: ..:::.::.:::::::.::::: :.:::: : :. .::: . :.:
CCDS87 ADIVVQFK-DVYALMGQNVTLECFALGNPVPDIRWRKV---LEPMPSTAEISTSGAVLKI
240 250 260 270 280
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pF1KE2 PSVSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGK
....:::: ::::::: .:.: :.:: ::: :::.. :.:::.::::.: : :.:.::
CCDS87 FNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPCVATGK
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pF1KE2 PRPTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQ
: ::.:::.:: . :.::. ...:..:::::.::: .:.:::.::: .
CCDS87 PIPTIRWLKNGYAYHK--------GELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANAELKIL
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pF1KE2 ALAPDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTL
:::: :..::... : ::.::...: :.:.:::: :::::: ::::::. . ::.:
CCDS87 ALAPTFEMNPMKKKILAAKGGRVIIECKPKAAPKPKFSWSKGTEWLVNSSRILIWEDGSL
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pF1KE2 IIRNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHAS
: ::.:.: : ::::::: ::::::: : . : :.: ::: .:::..:.: :.:: ::
CCDS87 EINNITRNDGGIYTCFAENNRGKANSTGTLVITDPTRIILAPINADITVGENATMQCAAS
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pF1KE2 HDPTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVV
::..::::.:... . :::.: . ::.:. . .. :.: : ::::.:.:.::: :::.:
CCDS87 FDPALDLTFVWSFNGYVIDFNKENIHYQRNFMLDSNGELLIRNAQLKHAGRYTCTAQTIV
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:..: : ..::::::::::. ..:: :.. :.:::: ::::::.:::.:..: . :
CCDS87 DNSSASADLVVRGPPGPPGGLRIEDIRATSVALTWSRGSDNHSPISKYTIQTKTILSDDW
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pF1KE2 KQVRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVA
:...:.: :::: :.:... : :::.:::::.:.: :: :::: ::..:.: :::.::
CCDS87 KDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGAAPNVA
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pF1KE2 PSGLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVY
:: ..:::: :: ..:.:.::::. :..:::...:. . .:. . : . :. .:.
CCDS87 PSDVGGGGGRNRELTITWAPLSREYHYGNNFGYIVAFKPFDGEEWKKVTVTNPDTGRYVH
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pF1KE2 SNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTW
..:.. : : :.::....: .:::: ::.:.. ::.. : :::.: .: .::::..: :
CCDS87 KDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSEISVHW
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pF1KE2 EPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNR
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CCDS87 EHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEVGACNS
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pF1KE2 AGTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQN
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CCDS87 AGCGPPSDMIEAFTKKAPPSQPPRIISSVRSGSRYIITWDHVVALSNESTVTGYKVLYRP
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pF1KE2 DLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENM
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CCDS87 DGQHDGKLYSTHKHSIEVPIPRD-GEYVVEVRAHSDGGDGVVSQVKISGAPTLSPSLLGL
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1020 1030 1040
pF1KE2 AVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
CCDS87 LLPAFGILVYLEF
1000
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CCDS33 MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITL
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pF1KE2 ACRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGT
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CCDS33 HCEARGNPSPHYRWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGT
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pF1KE2 VVSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPT
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CCDS33 IVSREAKLQFAYLENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEE
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CCDS33 DSRRFVSQETGHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSMV--TNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYE
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CCDS33 PKIEVQFPETLPAAKGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDGLPFSSKIKLRKFSGVLEIPN
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pF1KE2 VSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPR
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CCDS33 FQQEDAGSYECIAENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPK
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pF1KE2 APDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLII
:::: ::...:. . :. . . :.:::.:.:. :.:: . . :... :: : :
CCDS33 APDFSKNPMKKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKI
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pF1KE2 RNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHD
:....: : :::.::: .::::.: : : . :.::::::. :...:... : :...::
CCDS33 ANVTKADAGTYTCMAENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHD
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pF1KE2 PTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDS
: .:. ::: .. :: : :.:..... . . ::: : : ::.:.:::.::.:: :::
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CCDS33 VSSAADLIVRGSPGPPENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQT
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pF1KE2 VRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPS
: : : :.:...:: :. :.::..:::::.::: .: :::: :: :.::.::.: : ::
CCDS33 VTTVPEVIDGKTHTATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPS
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..::::. .::...: :. .: :::.::::...:: : : : . : . :. .:. :
CCDS33 EVNGGGGSRSELVITWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRN
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::. ::.:.:::. :: .:.:: : .. :.:::::: :::..: :...::::..:.:.
CCDS33 ESIVPYSPYEVKVGVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNT
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pF1KE2 VQQDM-NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRA
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CCDS33 IPWKLSNGHLLGYEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSA
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pF1KE2 GTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLY---
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CCDS33 GAGPFSATVNVTTKKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTS
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pF1KE2 -QNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAE-VHIVRNGGTSMM
::.... : . ... . .:. :: ......: :::: .: ..: : . .
CCDS33 SQNNVQVLNTNKTSAE--LVLPIKEDY---IIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDAR
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1010 1020 1030 1040
pF1KE2 VENMAVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
. :. . :: . : .::.
CCDS33 GSTSAISNV-HPMSSYMPIVLFLIVYVLW
1010 1020
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CCDS53 CEVRGNPVPSYRWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSI
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.:::: :.:..: .:: . :. :...:: ::.: :.:: : : . : :..::::.:. :
CCDS53 LSREATLQFAYLGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAED
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pF1KE2 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTR-LFAP
.:.:.:: ::::::.....::.:.: ::. . . .. :.: . :.: . . . :
CCDS53 SRRFISQETGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTV--TNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEP
170 180 190 200 210 220
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pF1KE2 SIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQ--WTTAEPTLQIPSVS
.:...:: . : : : .::::.::::: : : ::.: . . .. .:.::.:.
CCDS53 KIEVHFPFTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIPSKARLRKSQAVLEIPNVQ
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pF1KE2 FEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPT
..: : :::.::::.:... .:.. : . :.:.. ..::. : :: ::: : :.::::::
CCDS53 LDDAGIYECRAENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPT
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pF1KE2 VRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAP
:::.:: :. :.:::.. : : . ... :.:::::.::::.:.::::::: . : ::
CCDS53 YRWLKNGVPLSPQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAP
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pF1KE2 DFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRN
: :: ... : ... :..: :.:...:: .. :.:: . . ...:... :::.: : :
CCDS53 TFALNQLKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILN
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:.::::::.: .:: .:.:. . :::.. :.: :.:. .....:....:.:.: :: .
CCDS53 ASKSDEGKYVCRGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDAS
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.:.:: ::: ::::.. :::.. .. . .:: : : : :.:.: : .::..::.:
CCDS53 LDVTFYWTLKGQPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVS
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:: .:::::::::: :.:..: ..: :::: . ::::::..:.::::.: . :. :.
CCDS53 DEAELLVRGPPGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVK
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pF1KE2 TNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGL
: : : :. :.:... :.::..:::::.:.: .:::.:: :: ::: ::.:..::...
CCDS53 TVPEIITGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNV
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pF1KE2 SGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNES
:: .: ::.. : :.:.:.:::.::::...:: .:. :. : ...:. :.: .::
CCDS53 SGRSGRRHELVIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDES
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pF1KE2 VRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQ
: : ::::::. :: .:::: : ... ::: :: .::: : : .:: ::. :.:. ..
CCDS53 VPPLTPFEVKVGVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHIK
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pF1KE2 QDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTG
... : :.:. ::: ..: .:. :.: : .. . ..::. :: :: :::::: :: :
CCDS53 ESL-GRPQGFEVGYWKDMEQEDTAETVKTRGNESFVILTGLEGNTLYHFTVRAYNGAGYG
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pF1KE2 PASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHL
: : ..::: : :: . :.:. : ..:..:. :.::.:. ::: :.:::..:... :
CCDS53 PPSSEVSATTKKSPPSQAPSNLRWEQQGSQVSLGWEPVIPLANESEVVGYKVFYRQEGHS
890 900 910 920 930 940
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pF1KE2 TPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPA-EVHIVRNGGTSMMVENMAVR
. . : : .:.: : : ....:. . :::: . .... .: .. ...
CCDS53 NSQVIETQKLQAVVPLP-DAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVPSYSGGKIT----SAQ
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1020 1030 1040
pF1KE2 PAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
. : .. : ::..:.
CCDS53 STLHSLSTSSSSVTLLLALMIPSTSW
1010 1020
>>CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1100 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 TRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLACRAR
.:::: ..: ...:: .: :..: : :..:
CCDS53 PSWLGAAQNYYSPINLYHSSDAFKQDESVDYGPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALNCEVR
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTVVSRE
..: .::: ::::. :: :..:. :...: ::..:.:.: :::::.: ::...:::
CCDS53 GNPVPSYRWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSILSRE
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTDGRHF
: :.:..: .:: . :. :...:: ::.: :.:: : : . : :..::::.:. :.:.:
CCDS53 ATLQFAYLGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAEDSRRF
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTR-LFAPSIKA
.:: ::::::.....::.:.: ::. . . .. :.: . :.: . . . :.:..
CCDS53 ISQETGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTV--TNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPKIEV
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQ--WTTAEPTLQIPSVSFEDE
.:: . : : : .::::.::::: : : ::.: . . .. .:.::.:...:
CCDS53 HFPFTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIPSKARLRKSQAVLEIPNVQLDDA
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 GTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRWL
: :::.::::.:... .:.. : . :.:.. ..::. : :: ::: : :.:::::: :::
CCDS53 GIYECRAENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWL
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370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFRL
.:: :. :.:::.. : : . ... :.:::::.::::.:.::::::: . : :: : :
CCDS53 KNGVPLSPQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAPTFAL
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430 440 450 460 470 480
pF1KE2 NPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISRS
: ... : ... :..: :.:...:: .. :.:: . . ...:... :::.: : : :.:
CCDS53 NQLKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILNASKS
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490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDLT
:::::.: .:: .:.:. . :::.. :.: :.:. .....:....:.:.: :: ..:.:
CCDS53 DEGKYVCRGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDASLDVT
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550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEAT
: ::: ::::.. :::.. .. . .:: : : : :.:.: : .::..::.: ::
CCDS53 FYWTLKGQPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVSDEAE
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610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNPA
.:::::::::: :.:..: ..: :::: . ::::::..:.::::.: . :. :.: :
CCDS53 LLVRGPPGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVKTVPE
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670 680 690 700 710 720
pF1KE2 NIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGGG
: :. :.:... :.::..:::::.:.: .:::.:: :: ::: ::.:..::...:: .
CCDS53 IITGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRS
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730 740 750 760 770 780
pF1KE2 GAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRPY
: ::.. : :.:.:.:::.::::...:: .:. :. : ...:. :.: .::: :
CCDS53 GRRHELVIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDESVPPL
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790 800 810 820 830 840
pF1KE2 TPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDMN
::::::. :: .:::: : ... ::: :: .::: : : .:: ::. :.:. .....
CCDS53 TPFEVKVGVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHIKESL-
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850 860 870 880 890 900
pF1KE2 GILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPASP
: :.:. ::: ..: .:. :.: : .. . ..::. :: :: :::::: :: :: :
CCDS53 GRPQGFEVGYWKDMEQEDTAETVKTRGNESFVILTGLEGNTLYHFTVRAYNGAGYGPPSS
910 920 930 940 950 960
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 SANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPTL
..::: : :: . :.:. : ..:..:. :.::.:. ::: :.:::..:... : . .
CCDS53 EVSATTKKSPPSQAPSNLRWEQQGSQVSLGWEPVIPLANESEVVGYKVFYRQEGHSNSQV
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 HLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPA-EVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
: : .:.: : : ....:. . :::: . .... .: .. ... . :
CCDS53 IETQKLQAVVPLP-DAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVPSYSGGKIT----SAQSTLH
1030 1040 1050 1060 1070
1030 1040
pF1KE2 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
.. : ::..:.
CCDS53 SLSTSSSSVTLLLALMIPSTSW
1080 1090 1100
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CCDS43 MRLPWELLVLQSFILCLADDSTLHGPIFIQEPSPVMFPLDSEEKKVKLNCE
10 20 30 40 50
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pF1KE2 ARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTVVS
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CCDS43 VKGNPKPHIRWKLNGTDVDTGMDFRYSVVEGSLLINNPNKTQDAGTYQCTATNSFGTIVS
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pF1KE2 REAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTDGR
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CCDS43 REAKLQFAYLDNFKTRTRSTVSVRRGQGMVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSY--QDNR
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.:::: :::::::... ::.:::.:..:. . ....:.. . : : . . . :.:
CCDS43 RFVSQETGNLYIAKVEKSDVGNYTCVVTNTV--TNHKVLGPPTPLILRNDGVMGEYEPKI
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CCDS43 EVQFPETVPTAKGATVKLECFALGNPVPTIIWRRADGKPIARKARRHKSNGILEIPNFQQ
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pF1KE2 EDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTV
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CCDS43 EDAGLYECVAENSRGKNVARGQLTFYAQPNWIQKINDIHVAMEENVFWECKANGRPKPTY
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pF1KE2 FRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNI
: . ..:. . :::..: :.:.:.:: : :.:: .:: .. :.:.. ::.: : :.
CCDS43 FSRTLLKRVTLVKVGGEVVIECKPKASPKPVYTWKKGRDILKENERITISEDGNLRIINV
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..:: :.:::.: : .: :.::: : :.: :.. . ::: :...:....: :...:: ..
CCDS43 TKSDAGSYTCIATNHFGTASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIVLPCQVTHDHSL
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: ..:::::::: .:.. .: ::: :::: : ::::::. :..::::: . :. : :
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: :.:.. :: :.::.::..::::..:.:..: :::: :: : ::.:: : :.:...:
CCDS43 VPELIDGKTFTATVVGLNPWVEYEFRTVAANVIGIGEPSRPSEKRRTEEALPEVTPANVS
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::::. .::...: . .: ::: ::::...:: :. :. . . .:::. .:. ::::
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pF1KE2 RPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQ
.:..:::::. .: .:.:: : :..:::::::: :....:...:.....: : .
CCDS43 HPFSPFEVKVGVFNNKGEGPFSPTTVVYSAEEEPTKPPASIFARSLSATDIEVFWASPLE
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pF1KE2 DMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGP
: . :::..::. ::: : ..::.: .::.....:. .. ::..:.::: :::::
CCDS43 KNRGRIQGYEVKYWRHEDKEENARKIRTVGNQTSTKITNLKGSVLYHLAVKAYNSAGTGP
830 840 850 860 870 880
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pF1KE2 ASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLT
.: ..:.:: :::: .::::: :. :.:.. ..:: : . ::: : :::.::. . . .
CCDS43 SSATVNVTTRKPPPSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQVKALDNESEVKGYKVLYRWNRQSS
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pF1KE2 PTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPA
.. :.:. .:. .: : . ...:. . :::: .:
CCDS43 TSVIETNKTSVELSLPFDEDY-IIEIKPFSDGGDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSN
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1020 1030 1040
pF1KE2 PHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
CCDS43 ACTLSAISTIMISLTARSSL
1010 1020
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CCDS25 MRLLWKLVILLPLINSSAGDGLLSR-----PIFTQEPHDVIFPLDLSKSEVILN
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pF1KE2 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
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CCDS25 CAANGYPSPHYRWKQNGTDIDFTMSYHYRLDGGSLAINSPHTDQDIGMYQCLATNLLGTI
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pF1KE2 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
.::.: :.:.....: . :. :...:: ::.: :.:: :. ::: : .:. : .. :
CCDS25 LSRKAKLQFAYIEDFETKTRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHFGDLSYAWTFNDNPLYVQED
110 120 130 140 150 160
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pF1KE2 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRL--FA
.:.:::: :::::::... ::.:::.:. :.. . .:: . . : . : . .
CCDS25 NRRFVSQETGNLYIAKVEPSDVGNYTCFITNKE--AQRSVQGPPTPL-VQRTDGVMGEYE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSP---QWTTAEPTLQIPS
:.:..::: : ..: :::::.::::: :.::..::: : ... .. :.::.
CCDS25 PKIEVRFPETIQAAKDSSVKLECFALGNPVPDISWRRLDGSPLPGKVKYSKSQAILEIPN
230 240 250 260 270 280
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pF1KE2 VSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPR
. :::: ::: : : .::. ..:..: : ::: . :..:. .: .:: : : :.:::
CCDS25 FQQEDEGFYECIASNLRGRNLAKGQLIFYAPPEWEQKIQNTHLSIYDNLLWECKASGKPN
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pF1KE2 PTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQAL
: ::.::: : ..:... : : .. :.. :::.:::.::::. :::.::: : :
CCDS25 PWYTWLKNGERLNPEERIQIENGTLIITMLNVSDSGVYQCAAENKYQIIYANAELRVLAS
350 360 370 380 390 400
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pF1KE2 APDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLII
:::: .::.. . ::.:.: :.: : :.:.. :..::: : .:.:. . ::.: :
CCDS25 APDFSKSPVKKKSFVQVGGDIVIGCKPNAFPRAAISWKRGTETLRQSKRIFLLEDGSLKI
410 420 430 440 450 460
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pF1KE2 RNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHD
::.::: :.:::.: : .: :..:: : :.. : ::. ::. :...:....: :..:::
CCDS25 YNITRSDAGSYTCIATNQFGTAKNTGSLIVKERTVITVPPSKMDVTVGESIVLPCQVSHD
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pF1KE2 PTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDS
:.....:.: .. ::. : .:..: . :..::: : : ::.:.::: : .::...:
CCDS25 PSIEVVFVWFFNGDVIDLKKGVAHFERIG-GESVGDLMIRNIQLHHSGKYLCTVQTTLES
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: : ..:::::::: : :.::..:: :::: : ::.::: .:.:.::: . :.
CCDS25 LSAVADIIVRGPPGPPEDVQVEDISSTTSQLSWRAGPDNNSPIQIFTIQTRTPFSVGWQA
590 600 610 620 630 640
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pF1KE2 VRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPS
: : : ..:.. .: :.::.::..:::::.:.: .: :::: :: .::. ..: :::
CCDS25 VATVPEILNGKTYNATVVGLSPWVEYEFRVVAGNSIGIGEPSEPSELLRTKASVPVVAPV
650 660 670 680 690 700
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pF1KE2 GLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSN
.. ::::. .::...: . .: :::.::::.. :: ::: :. .: ..... ::: :
CCDS25 NIHGGGGSRSELVITWESIPEELQNGEGFGYIIMFRPVGSTTWSKEKVSSVESSRFVYRN
710 720 730 740 750 760
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pF1KE2 ESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEP
::. : .:::::. :: .:.: : ...:::.:.::..:: . .. :.:::.:.:.
CCDS25 ESIIPLSPFEVKVGVYNNEGEGSLSTVTIVYSGEDEPQLAPRGTSLQSFSASEMEVSWNA
770 780 790 800 810 820
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pF1KE2 VQQDMN-GILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRA
. . : : .::::. :: .::. ..:..: :. ..::. :: : ..::::: :
CCDS25 IAWNRNTGRVLGYEVLYWTDDSKESMIGKIRVSGNVTTKNITGLKANTIYFASVRAYNTA
830 840 850 860 870 880
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pF1KE2 GTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLY---
::::.:: .:.:: : :: .::.::.: ...:.: ..:. : ..::: : :::.::
CCDS25 GTGPSSPPVNVTTKKSPPSQPPANIAWKLTNSKLCLNWEHVKTMENESEVLGYKILYRQN
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pF1KE2 -QNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAE-VHIVRNGGTSMM
:. :. : . ... . .: :: :..:::.. :::: .: ..: . .:.
CCDS25 RQSKTHILETNNTSAE--LLVPFEEDY---LIEIRTVSDGGDGSSSEEIRIPKM--SSLS
950 960 970 980 990
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pF1KE2 VENMA-VRPAPHPGT---VISHSVAMLILIGSLEL
... ..:. : . :: : :. ::
CCDS25 SRGIQFLEPSTHFLSIVIVIFHCFAIQPLI
1000 1010 1020
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CCDS58 GRPQGFEV
910
>>CCDS2558.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (698 aa)
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CCDS25 MEENVFWECKANGRPKPTYKWLKNGEPLLTRDR
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pF1KE2 VEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFRLNPVRRLIPAAR
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CCDS25 IQIEQGTLNITIVNLSDAGMYQCLAENKHGVIFSNAELSVIAVGPDFSRTLLKRVTLVKV
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CCDS25 GGEVVIECKPKASPKPVYTWKKGRDILKENERITISEDGNLRIINVTKSDAGSYTCIATN
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CCDS25 HFGTASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIVLPCQVTHDHSLDIVFTWSFNGHLID
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CCDS25 FDRDGDHFERVGGQDSAGDLMIRNIQLKHAGKYVCMVQTSVDRLSAAADLIVRGPPGPPE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]