Result of FASTA (ccds) for pFN21AB5634
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5634, 784 aa
  1>>>pF1KB5634 784 - 784 aa - 784 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9573+/-0.000986; mu= 18.2402+/- 0.060
 mean_var=91.8696+/-18.467, 0's: 0 Z-trim(106.5): 194  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.133810
 statistics sampled from 8838 (9037) to 8838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.278), width:  16
 Scan time:  3.290

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16          ( 784) 5186 1011.9       0
CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18        ( 801) 1925 382.3 1.6e-105
CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5           ( 790) 1845 366.9 7.2e-101
CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5            ( 789) 1840 365.9 1.4e-100
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5            ( 790) 1834 364.8 3.1e-100
CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5           ( 788) 1830 364.0 5.3e-100
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16          ( 799) 1823 362.7 1.4e-99
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14         ( 781) 1781 354.5 3.7e-97
CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18          ( 785) 1776 353.6 7.3e-97
CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5           ( 794) 1756 349.7 1.1e-95
CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18        ( 772) 1668 332.7 1.4e-90
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 796) 1502 300.7 6.2e-81
CCDS13395.1 CDH22 gene_id:64405|Hs108|chr20        ( 828) 1431 287.0 8.5e-77
CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18          ( 630) 1411 283.1   1e-75
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 670) 1300 261.6   3e-69
CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5          ( 754) 1279 257.6 5.4e-68
CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5          ( 575) 1247 251.4 3.2e-66
CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5          ( 574) 1245 251.0 4.1e-66
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 693) 1215 245.2 2.6e-64
CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16         ( 814) 1168 236.2 1.6e-61
CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18        ( 490) 1092 221.4 2.8e-57
CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14         ( 819) 1075 218.3 4.1e-56
CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18          ( 875) 1013 206.3 1.7e-52
CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18          ( 906) 1013 206.3 1.8e-52
CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20          ( 842) 1004 204.6 5.6e-52
CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20          ( 916) 1004 204.6   6e-52
CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16          ( 784)  798 164.8   5e-40
CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20        ( 832)  679 141.8 4.3e-33
CCDS3785.1 DCHS2 gene_id:54798|Hs108|chr4          (2916)  599 126.7 5.2e-28
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5       ( 829)  570 120.8 9.3e-27
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5       ( 932)  570 120.8   1e-26
CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 674)  553 117.4 7.7e-26
CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 713)  553 117.5   8e-26
CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 760)  553 117.5 8.4e-26
CCDS81769.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13         (1032)  539 114.9   7e-25
CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18          (1118)  539 114.9 7.5e-25
CCDS81770.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13         (1195)  539 114.9 7.9e-25
CCDS9443.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13          (1203)  539 114.9 7.9e-25
CCDS9444.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13          (1237)  539 114.9 8.1e-25
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5       ( 817)  526 112.3 3.3e-24
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5       ( 932)  526 112.3 3.7e-24
CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18        (1040)  526 112.4   4e-24
CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18        (1059)  526 112.4 4.1e-24
CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16         ( 732)  516 110.3 1.2e-23
CCDS10823.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16         ( 829)  516 110.4 1.3e-23
CCDS81472.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10        (1381)  513 109.9 2.9e-23
CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18          ( 999)  511 109.4 2.9e-23
CCDS75348.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5        ( 863)  509 109.0 3.4e-23
CCDS4261.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5         ( 934)  509 109.0 3.6e-23
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5       ( 808)  503 107.8 7.1e-23


>>CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16               (784 aa)
 initn: 5186 init1: 5186 opt: 5186  Z-score: 5410.2  bits: 1011.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5186; 100.0% identity (100.0% similar) in 784 aa overlap (1-784:1-784)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 NTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 TATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMSPPAGNRAQVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMSPPAGNRAQVI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 INITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 INITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 VTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 KPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHDNTANITVKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHDNTANITVKY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 VVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 SVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 DGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPRE
              730       740       750       760       770       780

           
pF1KB5 ELLY
       ::::
CCDS10 ELLY
           

>>CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18             (801 aa)
 initn: 1581 init1: 433 opt: 1925  Z-score: 2007.8  bits: 382.3 E(32554): 1.6e-105
Smith-Waterman score: 1925; 41.6% identity (69.0% similar) in 781 aa overlap (16-776:24-793)

                       10        20        30           40         
pF1KB5         MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLL---P-THRRQKRD
                              ::. ..... . .   : . ..::   : .:.: ::.
CCDS11 MWTSGRMSNAKNWLGLGMSLYFWGLMDLTTTVLSDTPTPQGELEALLSDKPQSHQRTKRS
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80          90       100      
pF1KB5 WIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIE
       :.:::. . :: . . : .:::..:...: ..  ::.:.:: .: :: .:  :::. ::.
CCDS11 WVWNQFFVLEEYTGTDPLYVGKLHSDMDRGDGSIKYILSGEGAGIVFTIDDTTGDIHAIQ
               70        80        90       100       110       120

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB5 RLDRENISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAV
       :::::. ..: : :  .:. ::. .:  : : ::..:.::: : :    . :.::: : :
CCDS11 RLDREERAQYTLRAQALDRRTGRPMEPESEFIIKIQDINDNEPKFLDGPYVATVPEMSPV
              130       140       150       160       170       180

        170       180       190       200        210       220     
pF1KB5 GTSVISVTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDN-SGRIITITKSLDREKQARYEI
       :::::.:::.:::::: :. : :.:.::.:. ::..:. .: : :   ..::: .  ::.
CCDS11 GTSVIQVTATDADDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVDSKTGVIRTALMNMDREAKEYYEV
              190       200       210       220       230       240

         230        240       250       260       270       280    
pF1KB5 VVEARDAQG-LRGDSGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVED
       ...:.:  : : : .::.:: .::.:.::: : : : .: . : :.. ....:: .:..:
CCDS11 IIQAKDMGGQLGGLAGTTTVNITLSDVNDNPPRFPQKHYQMSVLESAPISSTVGRVFAKD
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CCDS11 SEQSFDFLTDWGPRFRKLAELYGASEGPAPLW
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CCDS38 IIVCENSKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRR
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CCDS38 GALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLI--ISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAF
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CCDS38 DITALRN--PSAAEELKYRRDIRP----EVKLTPRHQTSSTLESIDVQEFIKQRLAEADL
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CCDS38 SERTT 
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CCDS38 VDTILLQEKPNSYLSSKKIAGLTKDDGKMLRRTKRGWMWNQFFLLEEYTGTDTQYVGKLH
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CCDS38 YSILQGQPYFSVDPESGIIKTALPDMSRENREQYQVVIQAKDMGGQMGGLSGTTTVNITL
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CCDS38 TDVNNNPPRFPQSTYQFNSPESVPLGTHLGRIKANDPDVGENAEMEYSIAEGDGADMFDV
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CCDS38 DYLSDWGPRFKKLADMYGGVDSDKDS 
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CCDS38 DVRDFINERLKEHDLDPTAPPYDSLATYAYEGNDSIAESLSSLESGTTEGDQNYDYLREW
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pF1KB5 GPRFKMLAELYGSDPREELLY
       ::::. :::.::         
CCDS38 GPRFNKLAEMYGGGESDKDS 
      770       780         

>>CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16               (799 aa)
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CCDS10 MPERLAEMLLDLWTPLIILWITLPPCIYMAPMNQSQVLMSGS-PL--ELNSLGEEQRILN
               10        20        30        40           50       

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pF1KB5 RQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVS--RKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGD
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CCDS10 RSKRGWVWNQMFVLEEFSGPEPILVGRLHTDLDPGSKKIKYILSGDGAGTIFQINDVTGD
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pF1KB5 VFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVP
       . ::.:::::. .:: :::  :: .:.. :: :: : :::.:.::: : : .  ..:.::
CCDS10 IHAIKRLDREEKAEYTLTAQAVDWETSKPLEPPSEFIIKVQDINDNAPEFLNGPYHATVP
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pF1KB5 ESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRII-TITKSLDREKQ
       : : .:::: .:::.:::::. :. :...:.::.:. ::.:.    :: :   ..::: .
CCDS10 EMSILGTSVTNVTATDADDPVYGNSAKLVYSILEGQPYFSIEPETAIIKTALPNMDREAK
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pF1KB5 ARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGS
        .: .:..:.:  :  :  :::.:. ::: :.::: : :.:. : : ::::. .::..: 
CCDS10 EEYLVVIQAKDMGGHSGGLSGTTTLTVTLTDVNDNPPKFAQSLYHFSVPEDVVLGTAIGR
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pF1KB5 LFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEA
       . ..: :  .: ...:.:. ::    : : ..   ..:::.  ::::.:  ..:.. :::
CCDS10 VKANDQDIGENAQSSYDIIDGDGTALFEITSDAQAQDGIIRLRKPLDFETKKSYTLKVEA
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pF1KB5 TDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMD
       ..  :: :. .  :  . : : : . :.::::.:..: : ....::   . .:: : : :
CCDS10 ANVHIDPRFSGRGPFKDTATVKIVVEDADEPPVFSSPTYLLEVHENAALNSVIGQVTARD
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pF1KB5 PDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRVTKK-GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTP
       :: .   : .:: : .:  . : ..   : :     ::::.  :.:.:. : :. .    
CCDS10 PDITSSPIRFSIDRHTDLERQFNINADDGKITLATPLDRELSVWHNITIIATEIRNH---
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pF1KB5 TGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVK-FK
        .. : : : :.::: ::::::::. :.  .:::.  ::..  .::.:::  :.: . : 
CCDS10 -SQISRVPVAIKVLDVNDNAPEFASEYEAFLCENGKPGQVIQTVSAMDKD-DPKNGHYFL
           480       490       500       510       520        530  

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pF1KB5 FILNTEN----NFTLTDNHDNTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTL
       . :  :     :::.  :.::. .: .:.. :.:.. .:..::..:::.: :  ..::::
CCDS10 YSLLPEMVNNPNFTIKKNEDNSLSILAKHNGFNRQKQEVYLLPIIISDSGNPPLSSTSTL
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pF1KB5 TVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSIQAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQAR
       :. :: :...:    :  : ..  .:.:. :..::: ::. . ::..:.   :: ...  
CCDS10 TIRVCGCSNDGVVQSCNVEAYVLPIGLSMGALIAILACIILLLVIVVLFVTLRRHKNEPL
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pF1KB5 AHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQ
          :.  ...:... ::.::::: :: ..:...:..    : .   :  : .:.:    :
CCDS10 II-KDDEDVRENIIRYDDEGGGEEDTEAFDIATLQNP--DGINGFLPRKDIKPDL----Q
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pF1KB5 KPPRH--APGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLG
         ::.  ::  .:   ..  .:.:.  :::.:  .::::...::::::  :.: ::::: 
CCDS10 FMPRQGLAPVPNGV--DVDEFINVRLHEADNDPTAPPYDSIQIYGYEGRGSVAGSLSSLE
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pF1KB5 TDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELY--GSDPREELLY
       . .:::: ..:.:.::::::: :.:::  : . .:    
CCDS10 STTSDSDQNFDYLSDWGPRFKRLGELYSVGESDKET   
           770       780       790            

>>CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14              (781 aa)
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pF1KB5    MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHID
            ::..    . .:.: ::. : : ::.    :.  .  :.  : .:.:.:::. . 
CCDS95 MWGLVRLLLAWLGGWGCMGRLAAPARAWAGS----REHPG--PALLRTRRSWVWNQFFVI
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pF1KB5 EEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISE
       ::     :  .::..:.:.: ..  :::: :: .: :: .:  ::.. . . ::::. ..
CCDS95 EEYAGPEPVLIGKLHSDVDRGEGRTKYLLTGEGAGTVFVIDEATGNIHVTKSLDREEKAQ
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pF1KB5 YHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTA
       : : :  ::. ... :: :: : :::.:.::: :.:    ..:.::: : ::::::.:::
CCDS95 YVLLAQAVDRASNRPLEPPSEFIIKVQDINDNPPIFPLGPYHATVPEMSNVGTSVIQVTA
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pF1KB5 VDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQG
        :::::. :. :...: .: :  .:..: ..: . :   ..::: : .. .:..:.:  :
CCDS95 HDADDPSYGNSAKLVYTVLDGLPFFSVDPQTGVVRTAIPNMDRETQEEFLVVIQAKDMGG
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pF1KB5 -LRGDSGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMT
        . : ::..:: :::.:.::: : : :. : : : : .  :: :: : ..:::  .: . 
CCDS95 HMGGLSGSTTVTVTLSDVNDNPPKFPQSLYQFSVVETAGPGTLVGRLRAQDPDLGDNALM
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pF1KB5 KYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PP
        :::: :. ..::.: :.    .:..   ::::.:  ..::: ::::.  ::  :.   :
CCDS95 AYSILDGEGSEAFSISTDLQGRDGLLTVRKPLDFESQRSYSFRVEATNTLIDPAYLRRGP
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pF1KB5 AGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKP--LIGTVLAMDPDAARHSIGYSIR
         . :.: . . :. ::: : :  ::. . :: : :  :.: . : : :.    : ::: 
CCDS95 FKDVASVRVAVQDAPEPPAFTQAAYHLTVPEN-KAPGTLVGQISAADLDSPASPIRYSIL
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pF1KB5 RTSDKGQFFRVT-KKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEV
         ::  . : .  ..: :..   ::::.  :.:::: : ::::..    . : ::: :..
CCDS95 PHSDPERCFSIQPEEGTIHTAAPLDREARAWHNLTVLATELDSSA----QASRVQVAIQT
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pF1KB5 LDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDIT--PRNVKFKFILNTENNFTLT
       ::::::::..:.::.  ::..:. :::.  : :.:.: .    .:.:.  :. . :::. 
CCDS95 LDENDNAPQLAEPYDTFVCDSAAPGQLIQVIRALDRDEVGNSSHVSFQGPLGPDANFTVQ
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pF1KB5 DNHDNTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC
       ::.:..:.. .       .:.  ...:. . : :.:. ..:.:.::.::.:. .:  . :
CCDS95 DNRDGSASLLLPSRPAPPRHAP-YLVPIELWDWGQPALSSTATVTVSVCRCQPDGSVASC
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pF1KB5 --EDMAAQVGVSIQAVVAILLCI-LTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVT
         :   . .:.:  :..::. :.   .....:.. :::  .::         ...:...:
CCDS95 WPEAHLSAAGLSTGALLAIITCVGALLALVVLFVALRR--QKQEALMVLEEEDVRENIIT
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pF1KB5 YDEEGGGEMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLY--AQVQKPPRHAPGAHGGP
       ::.::::: :: ..:...:..    :: :: :.  :: ..   :.:.. ::  ::    :
CCDS95 YDDEGGGEEDTEAFDITALQNP--DGAAPPAPGPPARRDVLPRARVSRQPR-PPG----P
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pF1KB5 GEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVD--YDFL
       ...: .. ..  :::.:   ::::....:::::  :   ::::::. :  . .    . :
CCDS95 ADVAQLLALRLREADEDPGVPPYDSVQVYGYEGRGSSCGSLSSLGSGSEAGGAPGPAEPL
     700       710       720       730       740       750         

              770       780    
pF1KB5 NDWGPRFKMLAELYGSDPREELLY
       .:::: :. ::::::.        
CCDS95 DDWGPLFRTLAELYGAKEPPAP  
     760       770       780   

>>CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18               (785 aa)
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Smith-Waterman score: 1776; 40.9% identity (67.6% similar) in 756 aa overlap (44-784:44-784)

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pF1KB5 CLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKS
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CCDS11 LIALFLCFSGMSQAELSRSRSKPYFQSGRSRTKRSWVWNQFFVLEEYMGSDPLYVGKLHS
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pF1KB5 SVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGENL
       .:.. ..  ::.:.:: ....: .: .:::. : .:::::. . : : :  .:. :.. .
CCDS11 DVDKGDGSIKYILSGEGASSIFIIDENTGDIHATKRLDREEQAYYTLRAQALDRLTNKPV
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pF1KB5 ETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASVMY
       :  : :.::..:.::: : :    ..:.::: : :::::..:::.:::::: :. : :.:
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