Result of FASTA (ccds) for pFN21AB5541
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5541, 977 aa
  1>>>pF1KB5541 977 - 977 aa - 977 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8897+/-0.00114; mu= -0.2922+/- 0.066
 mean_var=432.0590+/-99.242, 0's: 0 Z-trim(110.7): 255  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.061702
 statistics sampled from 11577 (11841) to 11577 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.364), width:  16
 Scan time:  4.910

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45762.1 ERN1 gene_id:2081|Hs108|chr17          ( 977) 6553 599.5 1.1e-170
CCDS76845.1 ERN2 gene_id:10595|Hs108|chr16         ( 874) 1823 178.3 5.7e-44
CCDS32407.2 ERN2 gene_id:10595|Hs108|chr16         ( 926) 1816 177.7 9.2e-44


>>CCDS45762.1 ERN1 gene_id:2081|Hs108|chr17               (977 aa)
 initn: 6553 init1: 6553 opt: 6553  Z-score: 3177.9  bits: 599.5 E(32554): 1.1e-170
Smith-Waterman score: 6553; 100.0% identity (100.0% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-977)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPARRLLLLLTLLLPGLGIFGSTSTVTLPETLLFVSTLDGSLHAVSKRTGSIKWTLKEDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MPARRLLLLLTLLLPGLGIFGSTSTVTLPETLLFVSTLDGSLHAVSKRTGSIKWTLKEDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VLQVPTHVEEPAFLPDPNDGSLYTLGSKNNEGLTKLPFTIPELVQASPCRSSDGILYMGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLQVPTHVEEPAFLPDPNDGSLYTLGSKNNEGLTKLPFTIPELVQASPCRSSDGILYMGK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KQDIWYVIDLLTGEKQQTLSSAFADSLCPSTSLLYLGRTEYTITMYDTKTRELRWNATYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KQDIWYVIDLLTGEKQQTLSSAFADSLCPSTSLLYLGRTEYTITMYDTKTRELRWNATYF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 DYAASLPEDDVDYKMSHFVSNGDGLVVTVDSESGDVLWIQNYASPVVAFYVWQREGLRKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DYAASLPEDDVDYKMSHFVSNGDGLVVTVDSESGDVLWIQNYASPVVAFYVWQREGLRKV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 MHINVAVETLRYLTFMSGEVGRITKWKYPFPKETEAKSKLTPTLYVGKYSTSLYASPSMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MHINVAVETLRYLTFMSGEVGRITKWKYPFPKETEAKSKLTPTLYVGKYSTSLYASPSMV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 HEGVAVVPRGSTLPLLEGPQTDGVTIGDKGECVITPSTDVKFDPGLKSKNKLNYLRNYWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HEGVAVVPRGSTLPLLEGPQTDGVTIGDKGECVITPSTDVKFDPGLKSKNKLNYLRNYWL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LIGHHETPLSASTKMLERFPNNLPKHRENVIPADSEKKSFEEVINLVDQTSENAPTTVSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LIGHHETPLSASTKMLERFPNNLPKHRENVIPADSEKKSFEEVINLVDQTSENAPTTVSR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DVEEKPAHAPARPEAPVDSMLKDMATIILSTFLLIGWVAFIITYPLSMHQQQQLQHQQFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVEEKPAHAPARPEAPVDSMLKDMATIILSTFLLIGWVAFIITYPLSMHQQQQLQHQQFQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 KELEKIQLLQQQQQQLPFHPPGDTAQDGELLDTSGPYSESSGTSSPSTSPRASNHSLCSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KELEKIQLLQQQQQQLPFHPPGDTAQDGELLDTSGPYSESSGTSSPSTSPRASNHSLCSG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 SSASKAGSSPSLEQDDGDEETSVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIVYRGMFDNRDVAVKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSASKAGSSPSLEQDDGDEETSVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIVYRGMFDNRDVAVKR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 ILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCAATLQEYVEQKDFAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCAATLQEYVEQKDFAH
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 LGLEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIKAMISDFGLCKKLAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LGLEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIKAMISDFGLCKKLAV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 GRHSFSRRSGVPGTEGWIAPEMLSEDCKENPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGSHPFGKSLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GRHSFSRRSGVPGTEGWIAPEMLSEDCKENPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGSHPFGKSLQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 RQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHVLKHPFFWSLEKQLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHVLKHPFFWSLEKQLQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 FFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB5 LRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGSLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYRAMELCSHERLFQPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGSLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYRAMELCSHERLFQPY
              910       920       930       940       950       960

              970       
pF1KB5 YFHEPPEPQPPVTPDAL
       :::::::::::::::::
CCDS45 YFHEPPEPQPPVTPDAL
              970       

>>CCDS76845.1 ERN2 gene_id:10595|Hs108|chr16              (874 aa)
 initn: 2895 init1: 1791 opt: 1823  Z-score: 902.8  bits: 178.3 E(32554): 5.7e-44
Smith-Waterman score: 2771; 49.7% identity (68.5% similar) in 974 aa overlap (2-969:10-863)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB5         MPARRLLLLLTLLLPGLGIFGSTSTVTLPETLLFVSTLDGSLHAVSKRTGSI
                :  :: : : .    :: ..    .  ::.::.::::::::::.::.::..
CCDS76 MASAVRGSRPWPRLGLQLQFAALLLGTLSPQVHTLRPENLLLVSTLDGSLHALSKQTGDL
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB5 KWTLKEDPVLQVPTHVEEPAFLPDPNDGSLYTLGSKNNEGLTKLPFTIPELVQASPCRSS
       ::::..:::.. : .: : ::: :: ::::: ::.....:: ::::::::::.:::::::
CCDS76 KWTLRDDPVIEGPMYVTEMAFLSDPADGSLYILGTQKQQGLMKLPFTIPELVHASPCRSS
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB5 DGILYMGKKQDIWYVIDLLTGEKQQTLSSAFADSLCPSTSLLYLGRTEYTITMYDTKTRE
       ::..: :.::: :.:.:  .:: :.::..       :::  ::.:::.::.::.: ..  
CCDS76 DGVFYTGRKQDAWFVVDPESGETQMTLTTE-----GPSTPRLYIGRTQYTVTMHDPRAPA
              130       140       150            160       170     

            180       190        200       210       220       230 
pF1KB5 LRWNATYFDYAASLPEDDVDYK-MSHFVSNGDGLVVTVDSESGDVLWIQNYASPVVAFYV
       ::::.::  :.:  : :    : :::..: : ::..:::  :: ::: :. . ::.. :.
CCDS76 LRWNTTYRRYSAP-PMDGSPGKYMSHLASCGMGLLLTVDPGSGTVLWTQDLGVPVMGVYT
         180        190       200       210       220       230    

             240       250       260       270            280      
pF1KB5 WQREGLRKVMHINVAVETLRYLTFMSGEVGRITKWKYPFPKETEA-----KSKLTPTLYV
       :...:::.. :...: .::..:..  :..    .     :..: .      ..:  ::::
CCDS76 WHQDGLRQLPHLTLARDTLHFLALRWGHI----RLPASGPRDTATLFSTLDTQLLMTLYV
          240       250       260           270       280       290

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB5 GKYSTSLYASPSMVHEGVAVVPRGSTLPLLEGPQTDGVTIGDKGECVITPSTDVKFDPGL
       ::  :..:.: ..:: :::.:::: ::   .:: :: ::.  .::   .::: :..  : 
CCDS76 GKDETGFYVSKALVHTGVALVPRGLTLAPADGPTTDEVTLQVSGEREGSPSTAVRYPSGS
              300       310       320       330       340       350

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB5 KSKNKLNYLRNYWLLIGHHETPLSASTKMLERFPNNLPKHRENVIPADSEKKSFEEVINL
        .      : . :::::::: :    : ::.        :                    
CCDS76 VA------LPSQWLLIGHHELPPVLHTTMLRV-------H--------------------
                    360       370                                  

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB5 VDQTSENAPTTVSRDVEEKPAHAPARPEAPVDSMLKDMATIILSTFLLIGWVAFIITYPL
               ::  :  .: .:   :   .::                      ::.     
CCDS76 --------PTLGSGTAETRP---PENTQAP----------------------AFF-----
               380          390                                    

        470       480       490       500       510       520      
pF1KB5 SMHQQQQLQHQQFQKELEKIQLLQQQQQQLPFHPPGDTAQDGELLDTSGPYSESSGTSSP
        ..:: :.        .::       ::. :.  :.: :. ..  :..   :  ::.:  
CCDS76 -LEQQPQV--------VEK-------QQETPL-APADFAHISQ--DAQ---SLHSGAS--
      400                      410        420            430       

        530       540       550       560       570       580      
pF1KB5 STSPRASNHSLCSGSSASKAGSSPSLEQDDGDEETSVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIV
           : :.. : : :. ..  ..:  ::        ...:::::: ::::::.:: ::.:
CCDS76 ----RRSQKRLQSPSKQAQPLDDPEAEQ--------LTVVGKISFNPKDVLGRGAGGTFV
             440       450               460       470       480   

        590       600       610       620       630       640      
pF1KB5 YRGMFDNRDVAVKRILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCA
       .::.:..: :::::.: :::... ::::::.:::.::::.::::::.  ::.:::.::: 
CCDS76 FRGQFEGRAVAVKRLLRECFGLVRREVQLLQESDRHPNVLRYFCTERGPQFHYIALELCR
           490       500       510       520       530       540   

        650       660       670       680       690       700      
pF1KB5 ATLQEYVEQKDFAHLGLEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIK
       :.::::::. :. . :::: ..:::  :::::::::.:::::::: ::::. :...:  .
CCDS76 ASLQEYVENPDLDRGGLEPEVVLQQLMSGLAHLHSLHIVHRDLKPGNILITGPDSQGLGR
           550       560       570       580       590       600   

        710       720       730       740       750       760      
pF1KB5 AMISDFGLCKKLAVGRHSFSRRSGVPGTEGWIAPEMLSEDCKENPTYTVDIFSAGCVFYY
       ...::::::::: .:: ::: .::.::::::.:::.:.    ..:: .::::::::::::
CCDS76 VVLSDFGLCKKLPAGRCSFSLHSGIPGTEGWMAPELLQLLPPDSPTSAVDIFSAGCVFYY
           610       620       630       640       650       660   

        770       780       790       800       810       820      
pF1KB5 VISEGSHPFGKSLQRQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHV
       :.: :::::: :: :::::: ::  :  :. : :. :.::.:.  :..  :: :::: .:
CCDS76 VLSGGSHPFGDSLYRQANILTGAPCLAHLEEEVHDKVVARDLVGAMLSPLPQPRPSAPQV
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