Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5438
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5438, 442 aa
1>>>pF1KB5438 442 - 442 aa - 442 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2788+/-0.00104; mu= 9.0808+/- 0.063
mean_var=161.1023+/-44.249, 0's: 0 Z-trim(108.0): 237 B-trim: 1163 in 2/50
Lambda= 0.101047
statistics sampled from 9578 (9934) to 9578 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.305), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 2951 442.5 3.9e-124
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 1184 184.9 1.3e-46
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 896 142.9 5.1e-34
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 896 142.9 5.5e-34
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 742 120.5 3.5e-27
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 693 113.4 4.9e-25
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 ( 419) 540 91.0 2.4e-18
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 527 89.2 9.5e-18
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 500 85.2 1.4e-16
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 500 85.2 1.4e-16
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 500 85.3 1.5e-16
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 489 83.7 4.8e-16
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 485 83.1 6.6e-16
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 478 82.0 1.3e-15
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 471 80.9 2.2e-15
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 472 81.1 2.4e-15
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 471 81.0 2.6e-15
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 471 81.0 2.7e-15
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 471 81.0 2.7e-15
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 471 81.0 2.8e-15
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 467 80.5 4.8e-15
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 458 79.1 1e-14
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 430 75.0 1.5e-13
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 415 72.8 7.6e-13
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 405 71.4 2.2e-12
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 403 71.0 2.2e-12
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 377 67.2 3e-11
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 377 67.3 3.3e-11
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 369 66.2 8.4e-11
>>CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 (443 aa)
initn: 2336 init1: 2336 opt: 2951 Z-score: 2342.1 bits: 442.5 E(32554): 3.9e-124
Smith-Waterman score: 2951; 99.8% identity (99.8% similar) in 443 aa overlap (1-442:1-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEV-GEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS83 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SILNLCAISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNADQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SILNLCAISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNADQN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRVNTKRSSRAFRAHLRAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRVNTKRSSRAFRAHLRAPL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFEIQTMPNGKTRTSLKTMSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFEIQTMPNGKTRTSLKTMSR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 RKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHCDCNIPPVLYSAFTWLGYVNSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHCDCNIPPVLYSAFTWLGYVNSA
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KB5 VNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
:::::::::::::::::::::::
CCDS83 VNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
430 440
>>CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 (414 aa)
initn: 2115 init1: 1184 opt: 1184 Z-score: 950.4 bits: 184.9 E(32554): 1.3e-46
Smith-Waterman score: 2676; 93.2% identity (93.2% similar) in 443 aa overlap (1-442:1-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEV-GEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS83 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SILNLCAISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNADQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SILNLCAISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNADQN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRVNTKRSSRAFRAHLRAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRVNTKRSSRAFRAHLRAPL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPP
: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 K-----------------------------EAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPP
250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFEIQTMPNGKTRTSLKTMSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFEIQTMPNGKTRTSLKTMSR
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 RKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHCDCNIPPVLYSAFTWLGYVNSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHCDCNIPPVLYSAFTWLGYVNSA
340 350 360 370 380 390
420 430 440
pF1KB5 VNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
:::::::::::::::::::::::
CCDS83 VNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
400 410
>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 (367 aa)
initn: 1276 init1: 295 opt: 896 Z-score: 724.2 bits: 142.9 E(32554): 5.1e-34
Smith-Waterman score: 1218; 52.9% identity (67.7% similar) in 427 aa overlap (23-442:19-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
:.. .. ::: ::: :: .::::: ::::::
CCDS33 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPH-AYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEV--GEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCT
.:.:::::::::.::::::::::::::::::::::: : :.:::: ::.::::::::::
CCDS33 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ASILNLCAISIDRYTAVAMPMLYN--TRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNA
:::::::::::::::::.::. :. : :: :::..::. ::::.:..:::::::.:..
CCDS33 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 -DQNECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLR-RRRKRVNTKRSSRAFRAH
: . : :.:: ::.:::.::::.:: ::.::: .::.::. :::::. :...:.
CCDS33 GDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQC----
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRY
: ..: .:: . . :. ::.. ::
CCDS33 -------NSVRP--------------GFPQQTLSPDPAH----LELK-----------RY
240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFEIQTMPNGKTRTSL
: : . : :. :..:. : . : ::.::
CCDS33 YSI--------CQDTALGG-------PGFQERGGELKREEK--------------TRNSL
260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KTMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHCD-CNIPPVLYSAFTWL
. .:::::::.:::::.::.::::::.::.:: ::. :.. : :::: :::
CCDS33 MPL--------REKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWL
290 300 310 320 330
420 430 440
pF1KB5 GYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
::::::.::.::::::::::::::::: :
CCDS33 GYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
340 350 360
>>CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 (400 aa)
initn: 1196 init1: 295 opt: 896 Z-score: 723.7 bits: 142.9 E(32554): 5.5e-34
Smith-Waterman score: 1276; 53.8% identity (71.0% similar) in 431 aa overlap (23-442:19-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
:.. .. ::: ::: :: .::::: ::::::
CCDS29 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPH-AYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEV--GEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCT
.:.:::::::::.::::::::::::::::::::::: : :.:::: ::.::::::::::
CCDS29 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ASILNLCAISIDRYTAVAMPMLYN--TRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNA
:::::::::::::::::.::. :. : :: :::..::. ::::.:..:::::::.:..
CCDS29 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 -DQNECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLR-RRRKRVNTKRSSRAFRAH
: . : :.:: ::.:::.::::.:: ::.::: .::.::. :::::. :...:.
CCDS29 GDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQC----
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRY
: ..: .:: . . :. ::.. ::
CCDS29 -------NSVRP--------------GFPQQTLSPDPAH----LELK-----------RY
240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIA-KI-FEIQTMPNGKTRT
: .. .: : :.. . ::. .. . : :: :. .:.. . ::. :
CCDS29 YSI---CQDTALGGP---GFQERGGELKREEKTRNSLS-PTIAPKLSLEVRKLSNGRLST
260 270 280 290 300
360 370 380 390 400
pF1KB5 SLKT--MSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHCD-CNIPPVLYSA
::: .. : . .:::::::.:::::.::.::::::.::.:: ::. :.. : ::::
CCDS29 SLKLGPLQPRGVPL-REKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSA
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440
pF1KB5 FTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
:::::::::.::.::::::::::::::::: :
CCDS29 TTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
370 380 390 400
>>CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 (465 aa)
initn: 569 init1: 199 opt: 742 Z-score: 601.5 bits: 120.5 E(32554): 3.5e-27
Smith-Waterman score: 783; 33.6% identity (60.2% similar) in 455 aa overlap (22-442:28-457)
10 20 30 40
pF1KB5 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSD---GKADRPHYNYYATLLT-----LLIA
.::.. : : :. .:: ::.
CCDS75 MFRQEQPLAEGSFAPMGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLML
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 VIVFGNVLVCMAVSREKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEV-GEWKFSRIH
. ::::::: .:: .::.. : ..:::: ::.::::::.:. . :: : : :..
CCDS75 LTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAW
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 CDIFVTLDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTI
:.:...:::..::.::..:::::.::: .... . :: . . ::. ..: :::.: .:
CCDS75 CEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTP-RRIKAIIITVWVISAVI
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB5 SCPLLFGLNNAD--------QNECIIANPAFVVYSSIV-SFYVPFIVTLLVYIKIYIVLR
: : :..... . .: : . . : :: . ::..: .. .:::..:: . .
CCDS75 SFPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 RRRKRVNTKRSSRAFRAHLRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQ
:: . ..:. : . :: :. .: :: : .: .. .:.
CCDS75 RRTRVPPSRRGPDA----VAAPPGGTERRP------------NGLGP-ERSAGPGGAEAE
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 ELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPPSHHQ-LTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPK
: .. .. . : .: : . : : . : : .: .::.. ..: . .
CCDS75 PLPTQLNGAPGEP-----APAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKAR
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380
pF1KB5 IAKIFEIQTMPN---------------GKTRTSLKTMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGV
... ...: :. :.. :: . :..::. : .::.:.::
CCDS75 ASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGV
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 FIICWLPFFITHILNIHCDCNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKIL
:..::.:::.:. :. :..: .:.. : :.:: ::..::.::: :: .::.:: :::
CCDS75 FVVCWFPFFFTYTLTA-VGCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 HC
:
CCDS75 -CRGDRKRIV
460
>>CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 (462 aa)
initn: 680 init1: 187 opt: 693 Z-score: 562.9 bits: 113.4 E(32554): 4.9e-25
Smith-Waterman score: 705; 32.9% identity (63.1% similar) in 423 aa overlap (38-440:55-452)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 WYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVSREKALQT
:... .::. : ::::: .:: .::..
CCDS47 ERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGFLIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRA
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEV-GEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTASILNLCA
: ..:::: ::.::::::::. . :. . : :... : ....:::..::.::..:::
CCDS47 PQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFGQVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCA
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGL----NNADQNECI
::.::: .:.. . :: . . ::: . : ::..: .:: : : .: ..: .:
CCDS47 ISLDRYWSVTQAVEYNLKRTP-RRVKATIVAVWLISAVISFPPLVSLYRQPDGAAYPQCG
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230
pF1KB5 IANPAFVVYSSIV-SFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRVNTKR-----------SSRA
. . .. . :: . ::..: .. ::: .:: : . : . .. :: . .
CCDS47 LNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRVAKLRTRTLSEKRAPVGPDGASPTTENG
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280
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. : : .:.:. : . . ...: ..::: ..: ::. . . ....
CCDS47 LGAAAGAGENGHCAPPP-----ADVEPDESSAAAERRRRRGALRRGGRRRAGAEGGAGGA
270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
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. : . : .. : .. ::. . ..:.. . ...: ..
CCDS47 D-----------GQGAGPGAAESGALTASRSPGPGGRLSRASS--RSVEFFL------SR
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: . ... :::..: .::. : .::.:.:::..::.:::... : : :..: :.
CCDS47 RRRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSLYGICREACQVPGPLF
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410 420 430 440
pF1KB5 SAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
. : :.:: ::..::.:::.:: .::..: .::
CCDS47 KFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRRRGFRQ
420 430 440 450 460
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20 30 40 50 60 70
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:::::.::::.: ::.: :: :: : : .: :: ....:::.:::::.::::::.:
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:..:::.:. :: : ...:: ..:. .:.:: ... :.: :::.. : : . .
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.:::::. ::..: . ::.: . : .: .. : :: . : ::: . . :
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. . . .. : . : : : : .: :: :
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:: : .: .:. :. : : .. . :: :. . : : .:
CCDS77 DPC--GPDCAPPAPGLPPDPCGSNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGR-----
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CCDS77 IYTVFNAEFRNVFRKALRACC
400 410
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20 30 40 50 60 70
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pF1KB5 IVSLAVADLLVATLVMP-WVVYLEVGEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTASILNLCAISIDR
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: .:. :. : .. . ::...::...:..::.. : .:: : .. ..: :
CCDS80 YFSVTRPLSYRAKRTP-RRAALMIGLAWLVSFVLWAPAILFWQYLVGERTVLAGQCYIQF
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pF1KB5 -ANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRVNTKRSSRAFRAHLRAPLKGN
..: .. .....::.: : .: .:: :. : : :... ..: ::.
CCDS80 LSQPIITFGTAMAAFYLPVTVMCTLYWRIY------RETENRARELAALQGS-ETPGKGG
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. . . ... : .: : ..: .: : :: :.:.
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pF1KB5 ERTRYSPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFEIQTMPNGK
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pF1KB5 TRTSLKTMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHC-DCNIPPVLYS
. . .:. .: :::::.. :. .: .::. : :. : ... : :: .: .:.
CCDS80 EQLA----KRKTFSLVKEKKAARTLSAILLAFILTWTPYNIMVLVSTFCKDC-VPETLWE
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pF1KB5 AFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
:: ::::..::. :. : :: .: .: :
CCDS80 LGYWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDTFRLLLLCRWDKRRWRKIPKRPGSVHRTPSRQC
410 420 430 440 450 460
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10 20
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30 40 50 60 70 80
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140 150 160 170 180 190
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. : .: ..: . ...: ::.:: .:. : ::: : :.. :.:.. ....::. :
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200 210 220 230 240 250
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260 270 280 290 300 310
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.:: :::
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::: :: .: . .. . ... . :: :...: ..:.::. :
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.:..:.: .::::::. : . :.: :: . .: ::::.:: .::.::. ::
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pF1KB5 IEFRKAFLKILHC
..: .. ..:.:
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Smith-Waterman score: 578; 29.8% identity (54.2% similar) in 463 aa overlap (2-442:38-401)
10 20
pF1KB5 MDPLNLSWYDDDLER------QNWSRPFNGS
::. :: : . .:. : ...
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10 20 30 40 50 60
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 DGKADRPHYNYY-----ATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVSREKALQTTTNYLIVSLAVAD
.: ... .:. ...:::. . . :: :: ..: : :. .::::::::.::
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CCDS74 LSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRP
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 MLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGL--NNADQNECIIANP-AFVVYSSIV
. : .: ..: . ...: ::.:: .:. : ::: : :.. :.:.. ....::. :
CCDS74 LTYPVRQNGKCMAKMILS-VWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQDFGYTIYSTAV
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 SFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRVNTKRSSRAFRAHLRAPLKGNCTHPEDMKLCTVI
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CCDS74 AFYIPMSVMLFMYYQIY-------------KAARKSAAKHKFP-----------------
250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 MKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPPSHHQLTLPDPSHHGLH
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CCDS74 -----GFP----RVE---------------------------------------------
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pF1KB5 STPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFEIQTMPNGKTRTSLKTMSRRKLSQ-QKEKKATQML
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CCDS74 --PDSVIA--LNGIVKLQKEVEECANLSRL--------LK-HERKNISIFKREQKAATTL
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CCDS74 GIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC-IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFN
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pF1KB5 IEFRKAFLKILHC
..: .. ..:.:
CCDS74 RDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLQNADYCRKKGHDS
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442 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:20:32 2016 done: Thu Nov 3 17:20:32 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]