Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5263
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5263, 379 aa
1>>>pF1KB5263 379 - 379 aa - 379 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7675+/-0.00118; mu= -0.9136+/- 0.068
mean_var=254.7311+/-57.798, 0's: 0 Z-trim(108.0): 647 B-trim: 102 in 1/50
Lambda= 0.080359
statistics sampled from 9167 (9955) to 9167 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 2542 308.4 6.6e-84
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 2281 278.2 8.1e-75
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 2109 258.2 8.2e-69
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 335) 1741 215.5 5.4e-56
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 1158 148.3 2.3e-35
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 1084 139.4 4.8e-33
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 1071 137.9 1.4e-32
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 1065 137.2 2.2e-32
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 1005 130.2 2.8e-30
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 955 124.4 1.6e-28
CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 677) 906 119.0 1.2e-26
CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 587) 894 117.6 2.9e-26
CCDS43410.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 887 116.6 3.8e-26
CCDS4454.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 887 116.6 4.1e-26
CCDS43247.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 422) 884 116.3 5.2e-26
CCDS3612.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 426) 884 116.3 5.2e-26
CCDS34026.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 464) 884 116.3 5.5e-26
CCDS7225.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 868 114.4 1.8e-25
CCDS7224.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 868 114.4 1.9e-25
CCDS7226.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 856 113.0 4.6e-25
CCDS7223.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 856 113.0 5e-25
CCDS43409.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 855 112.9 5e-25
CCDS4453.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 855 112.9 5.3e-25
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 855 113.0 6.4e-25
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17 ( 527) 847 112.1 1.2e-24
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 ( 721) 842 111.6 2.2e-24
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 307) 821 108.8 6.5e-24
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 666 90.9 1.7e-18
CCDS77188.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 233) 661 90.2 2.1e-18
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 663 90.5 2.1e-18
CCDS82937.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 319) 649 88.9 6.8e-18
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 641 87.9 1.2e-17
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 631 86.9 3e-17
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 633 87.3 3.5e-17
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 631 87.0 4.1e-17
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 622 85.8 5.6e-17
CCDS47356.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 242) 617 85.1 7.3e-17
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 623 86.2 8.8e-17
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 619 85.6 1e-16
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 619 85.6 1e-16
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 622 86.1 1.1e-16
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 622 86.2 1.1e-16
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 622 86.2 1.1e-16
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 619 85.7 1.1e-16
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 619 85.7 1.2e-16
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 619 85.7 1.2e-16
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 619 85.7 1.2e-16
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 618 85.7 1.5e-16
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 618 85.7 1.5e-16
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 618 85.7 1.5e-16
>>CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (379 aa)
initn: 2542 init1: 2542 opt: 2542 Z-score: 1619.9 bits: 308.4 E(32554): 6.6e-84
Smith-Waterman score: 2542; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB5 KELIFQETARFQPGVLEAP
:::::::::::::::::::
CCDS10 KELIFQETARFQPGVLEAP
370
>>CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (357 aa)
initn: 2277 init1: 2277 opt: 2281 Z-score: 1456.7 bits: 278.2 E(32554): 8.1e-75
Smith-Waterman score: 2281; 98.8% identity (99.4% similar) in 345 aa overlap (1-345:1-344)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.. :
CCDS42 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDE-VGQSPAAVGLGAGEQGGT
310 320 330 340 350
370
pF1KB5 KELIFQETARFQPGVLEAP
>>CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 (360 aa)
initn: 2138 init1: 2105 opt: 2109 Z-score: 1348.9 bits: 258.2 E(32554): 8.2e-69
Smith-Waterman score: 2109; 86.5% identity (94.4% similar) in 356 aa overlap (19-374:8-357)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
:.:: :::.:: ::::::::.:.:::::::::: :::
CCDS13 MAAAAAAGAGP------EMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
:.: :.:::::::::::::::::::::::.:::::::::.::: ::.:: :.: :.::::
CCDS13 DNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS13 VQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
:::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::: :.:: : .:::..:
CCDS13 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNAD
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
::::::::.::::::.::: ::.:::::::::::::.:::.:: :: : :::::::::.:
CCDS13 SKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKL
290 300 310 320 330 340
370
pF1KB5 KELIFQETARFQPGVLEAP
:::::.::::::::
CCDS13 KELIFEETARFQPGYRS
350 360
>>CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (335 aa)
initn: 1776 init1: 1741 opt: 1741 Z-score: 1118.7 bits: 215.5 E(32554): 5.4e-56
Smith-Waterman score: 2152; 88.4% identity (88.4% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
::::::::::::::::::
CCDS42 NRPIFPGKHYLDQLNHIL------------------------------------------
250
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 --ALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
260 270 280 290 300 310
370
pF1KB5 KELIFQETARFQPGVLEAP
:::::::::::::::::::
CCDS42 KELIFQETARFQPGVLEAP
320 330
>>CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 (816 aa)
initn: 1074 init1: 601 opt: 1158 Z-score: 748.5 bits: 148.3 E(32554): 2.3e-35
Smith-Waterman score: 1158; 51.0% identity (76.5% similar) in 341 aa overlap (36-372:49-389)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
:::: .: .. ::.::::.:::: ..
CCDS11 GPVKAEPAHTAASVAAKNLALLKARSFDVTFDVGDEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTG
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TRVAIKKI-SPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRAST-LEAMRDVYIVQD
.:::::: . :. : .:::::..:: .:.:.:.:.:.:::: .. ...::.: :
CCDS11 QQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRPTVPYGEFKSVYVVLD
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LMETDLYKLLKSQQ-LSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKI
:::.::.....:.: :. .:. :::::.::::::.:::.:.::::::::::.: .:.:::
CCDS11 LMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELKI
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 CDFGLAR-IADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSN
:::.:: . .: :.:::::::::::::.::. . ::..::.::::::..:::.
CCDS11 GDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLAR
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDS
: .::::.:. ::. :. .::.:: .. . ..: :.:::: . : : ..: .:
CCDS11 RQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPVPWETVYPGADR
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERLK
.::.:: ::: :.:. ::.. :: ::.: .:.:: ::: :: ::.. . : .::.:
CCDS11 QALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDREALTRERIK
320 330 340 350 360 370
370
pF1KB5 ELIFQETARFQPGVLEAP
: : : :.
CCDS11 EAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDCAMESPPPAP
380 390 400 410 420 430
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CCDS48 TYDEVISFVPPPLDQEEMES
350 360
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CCDS14 QKVAVKKLSRPFQSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTT
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CCDS14 LMGADLNNIVKCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRIL
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CCDS14 IDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAE-PYDESVEAKERTLEEWKEL
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CCDS48 EIVNFSPIARKDSRRRSGMKL
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CCDS14 LFKGSDHLDQLKEIMKVTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLA
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CCDS14 VNLLEKMLVLDAEQRVTAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQK---YDDSFDDVDRTLDEWK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]