Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5120
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5120, 420 aa
1>>>pF1KB5120 420 - 420 aa - 420 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7024+/-0.00127; mu= 0.0004+/- 0.072
mean_var=284.0397+/-67.075, 0's: 0 Z-trim(108.7): 536 B-trim: 250 in 1/48
Lambda= 0.076100
statistics sampled from 9692 (10380) to 9692 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.319), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS54628.1 GSK3B gene_id:2932|Hs108|chr3 ( 420) 2798 321.3 1.1e-87
CCDS12599.1 GSK3A gene_id:2931|Hs108|chr19 ( 483) 2082 242.8 5.4e-64
CCDS2996.1 GSK3B gene_id:2932|Hs108|chr3 ( 433) 2034 237.5 1.9e-62
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 612 81.3 1.8e-15
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 606 80.6 2.7e-15
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 597 79.5 4.7e-15
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 596 79.5 5.8e-15
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 594 79.2 6e-15
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 576 77.3 2.6e-14
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 580 78.1 3.3e-14
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 575 77.4 3.9e-14
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 575 77.5 4.1e-14
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 575 77.5 4.2e-14
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 563 75.9 6.9e-14
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 559 75.6 1.2e-13
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 559 75.7 1.3e-13
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 554 74.9 1.4e-13
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 552 74.7 1.7e-13
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 555 75.3 1.9e-13
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 536 72.9 5.5e-13
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 539 73.4 5.8e-13
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 523 71.4 1.3e-12
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 533 73.1 1.3e-12
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 533 73.1 1.4e-12
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 521 71.2 1.6e-12
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17 ( 527) 524 71.8 1.8e-12
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 525 72.1 2.1e-12
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 525 72.1 2.1e-12
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 525 72.1 2.1e-12
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 525 72.1 2.1e-12
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 515 70.6 2.7e-12
CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 253) 511 70.0 2.9e-12
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 514 70.5 3.1e-12
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 519 71.4 3.3e-12
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 519 71.4 3.4e-12
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 519 71.4 3.4e-12
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 512 70.3 3.5e-12
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 ( 721) 514 70.8 4.7e-12
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 506 69.5 4.7e-12
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 509 70.0 4.9e-12
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 508 69.9 5e-12
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 509 70.1 5.3e-12
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 509 70.1 5.4e-12
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 509 70.2 5.9e-12
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 505 69.5 5.9e-12
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 503 69.5 8.7e-12
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 503 69.5 8.7e-12
CCDS46075.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 589) 501 69.3 1.1e-11
CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 419) 494 68.4 1.5e-11
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 335) 489 67.7 1.9e-11
>>CCDS54628.1 GSK3B gene_id:2932|Hs108|chr3 (420 aa)
initn: 2798 init1: 2798 opt: 2798 Z-score: 1687.9 bits: 321.3 E(32554): 1.1e-87
Smith-Waterman score: 2798; 100.0% identity (100.0% similar) in 420 aa overlap (1-420:1-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSGRPRTTSFAESCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSGRPRTTSFAESCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 WSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFKFPQIKAHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFKFPQIKAHP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 WTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANTGDRGQTNNAASASASNST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANTGDRGQTNNAASASASNST
370 380 390 400 410 420
>>CCDS12599.1 GSK3A gene_id:2931|Hs108|chr19 (483 aa)
initn: 2131 init1: 2065 opt: 2082 Z-score: 1262.4 bits: 242.8 E(32554): 5.4e-64
Smith-Waterman score: 2082; 78.1% identity (90.8% similar) in 401 aa overlap (21-420:84-483)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSGRPRTTSFAESCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDR
..: :. .:..:::::::: ::::.:
CCDS12 GAMGGGVGASSSGGGPGGSGGGGSGGPGAGTSFPPPGVKLGRDSGKVTTVVATLGQGPER
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIV
:::.::: ::::::::::::::.: .. :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQEVAYTDIKVIGNGSFGVVYQARLAETRELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIV
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RLRYFFYSSGEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLA
:::::::::::::::.::::::.::::::::::::...:: :.:..:::.::::::::::
CCDS12 RLRYFFYSSGEKKDELYLNLVLEYVPETVYRVARHFTKAKLTIPILYVKVYMYQLFRSLA
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 YIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFG
:::: :.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YIHSQGVCHRDIKPQNLLVDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFG
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTE
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKL
:::::::::::::::. ::::::::::: ::::::..::.:::::::::::::: ...:
CCDS12 FKFPQIKAHPWTKVFKSRTPPEAIALCSSLLEYTPSSRLSPLEACAHSFFDELRCLGTQL
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400
pF1KB5 PNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAA-SDANTGDRGQTN
::.: : ::::.. ::: .: : .:::::: : :...: : .. : ... :.. :..
CCDS12 PNNRPLPPLFNFSAGELSIQPSLNAILIPPHLRSPAGTTTLTPSSQALTETPTSSDWQST
420 430 440 450 460 470
410 420
pF1KB5 NAASASASNST
.: . . .::.
CCDS12 DA-TPTLTNSS
480
>>CCDS2996.1 GSK3B gene_id:2932|Hs108|chr3 (433 aa)
initn: 2034 init1: 2034 opt: 2034 Z-score: 1234.4 bits: 237.5 E(32554): 1.9e-62
Smith-Waterman score: 2762; 97.0% identity (97.0% similar) in 433 aa overlap (1-420:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSGRPRTTSFAESCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MSGRPRTTSFAESCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 EKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 DIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 WSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFKFPQIKAHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 WSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFKFPQIKAHP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB5 WTK-------------VFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPN
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 WTKDSSGTGHFTSGVRVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPN
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 VKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANTGDRGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANTGDRGQ
370 380 390 400 410 420
410 420
pF1KB5 TNNAASASASNST
:::::::::::::
CCDS29 TNNAASASASNST
430
>>CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (379 aa)
initn: 537 init1: 263 opt: 612 Z-score: 391.4 bits: 81.3 E(32554): 1.8e-15
Smith-Waterman score: 619; 33.9% identity (63.4% similar) in 372 aa overlap (43-385:17-372)
20 30 40 50 60
pF1KB5 SCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVS------------YTDTK
: : :: : :: ::. .
CCDS10 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB5 VIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKV--LQDKRFKNR---ELQIMRKLDHCNIVRLRYF
::.:..:.: .: :::::. .. . . .: :.::. .. : :.. .: .
CCDS10 YIGEGAYGMVSSAYDHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 FYSSG-EKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHS
. .: : .:: .: : . .:.. . .: : .. ..::..:.: ::::
CCDS10 LRASTLEAMRDVY--IVQDLMETDLYKLLK-----SQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHS
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KB5 FGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPN-----VSYICSRYYRAPELIF
.. :::.::.:::.. : ::.:::: :. .. : . . :. .:.:::::...
CCDS10 ANVLHRDLKPSNLLINT-TCDLKICDFGLAR-IADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIML
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIR---EMNP
.. ::.:::.::.::.:::.: ..::::: .::: .:. .::.:..:.. .:.
CCDS10 NSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKA
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 -NYTEFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRD
:: . ..:. :.:.: :.. .:. : .:.: ..:. :.: :: :: .... :
CCDS10 RNYLQ-SLPSKTKVAWAKLF-PKSDSKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYD
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPP--LATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANTG
:. . : ... : :.:. .::.. : : ... ::.:
CCDS10 PTDE-PVAEE-P--FTFA-MELDDLPKERLKELIFQETARFQPGVLEAP
340 350 360 370
410 420
pF1KB5 DRGQTNNAASASASNST
>>CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (357 aa)
initn: 537 init1: 263 opt: 606 Z-score: 388.1 bits: 80.6 E(32554): 2.7e-15
Smith-Waterman score: 613; 34.7% identity (63.7% similar) in 331 aa overlap (43-346:17-336)
20 30 40 50 60
pF1KB5 SCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVS------------YTDTK
: : :: : :: ::. .
CCDS42 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB5 VIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKV--LQDKRFKNR---ELQIMRKLDHCNIVRLRYF
::.:..:.: .: :::::. .. . . .: :.::. .. : :.. .: .
CCDS42 YIGEGAYGMVSSAYDHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 FYSSG-EKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHS
. .: : .:: .: : . .:.. . .: : .. ..::..:.: ::::
CCDS42 LRASTLEAMRDVY--IVQDLMETDLYKLLK-----SQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHS
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KB5 FGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPN-----VSYICSRYYRAPELIF
.. :::.::.:::.. : ::.:::: :. .. : . . :. .:.:::::...
CCDS42 ANVLHRDLKPSNLLINT-TCDLKICDFGLAR-IADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIML
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIR---EMNP
.. ::.:::.::.::.:::.: ..::::: .::: .:. .::.:..:.. .:.
CCDS42 NSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKA
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 -NYTEFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRD
:: . ..:. :.:.: :.. .:. : .:.: ..:. :.: :: :: .... :
CCDS42 RNYLQ-SLPSKTKVAWAKLF-PKSDSKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYD
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 PNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANTGDR
:
CCDS42 PTDEVGQSPAAVGLGAGEQGGT
340 350
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.. .. ::.:..::::.:. .::.::.
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::. : . .. ::......:.: :::.: ... :.: : ::.... .
CCDS88 KKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHT--ENK----LYLVFEFLHQD
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pF1KB5 VYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKL
. . . : .:. .: :..::...::. :: . :::.::::::.. . :. ::
CCDS88 LKKFMD--ASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAI-KL
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CCDS88 ADFGLARAF--GVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRA
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.::::: .::: .:...:::: . . : :.: .::. . ..:: : .
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. .: :..:.: :. :.. : :: ::... :
CCDS88 GRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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:. : ::. : : .:. ::. . ::.:
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pF1KB5 SFGVVYQAKLCDSGELVAIKKV--LQDKRFKNR---ELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYS-S
..:.: .: . :::::. .. . . .: :..:. .. : ::. . .. . .
CCDS13 AYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPT
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:. .:: .: : . .:.. . : : .. ..::..:.: :::: .. :
CCDS13 IEQMKDVY--IVQDLMETDLYKLLK-----TQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLH
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::.::.::::. : ::.:::: :. ..:. . :. .:.:::::.....
CCDS13 RDLKPSNLLLNT-TCDLKICDFGLARV---ADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSK
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::.:::.::.::.:::.: ..::::: .::: .:. .::.:..:.. . ::
CCDS13 GYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNY
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pF1KB5 TEFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNV
...:. . ::...: : . .:. : ...: ..: :. .: :: .... ::.
CCDS13 L-LSLPHKNKVPWNRLF-PNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSD
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. : . ..: :.. ..: .. : ... ::.:
CCDS13 E-PIA-EAPFKFDMELDDLPKEK-LKELIFEETARFQPGYRS
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410 420
pF1KB5 NNAASASASNST
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.... ::......: : ::::: .. :.: : ::.... . . .
CCDS11 EMEGVPSTAIREISLLKELKHPNIVRLLDVVHN--ERK----LYLVFEFLSQDLKKYMD-
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: . ::. .: :..::...... :: . :::.::::::.. . ...:: ::: :.
CCDS11 -STPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHSHRVIHRDLKPQNLLIN-ELGAIKLADFGLAR
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pF1KB5 QLVRGEPNVSY---ICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSG
. : : .: . . .:::::...:. ::...:.:: ::..::.. . .:::::
CCDS11 AF--GVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSE
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.::: .:...::::... . .. :.: . .::. . .. : ::. : .
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CCDS11 LLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQYVLQRFRH
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:. .: . ::......:.: ::. : : :.:.. ..::.:..
CCDS39 KIKLGHRSEAKDGINRTALREIKLLQELSHPNIIGLLDAF---GHKSN---ISLVFDFME
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:: ::: ::.. : :: .: . .:.::::::.::: : ..:.:..::.::::::
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:..:::: .:::..:...:::::.:: .: :.:. :: :: : : ..: .
CCDS39 VPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDMCSLPDYVTFKSFPGIPLH---HIFSA-AG
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CCDS39 SNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF
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CCDS11 KIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRPTVPYGEFKS-VYV--VLDLME
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. .:..: .:.:.. :.::.. : : :. . .::. . :. : : : . :.
CCDS11 ADRQALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDE-PDCAP-PFDFAFDREALT
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pF1KB5 SNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANTGDRGQTNNAASASASNST
CCDS11 RERIKEAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDCAMES
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420 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]