Result of FASTA (ccds) for pFN21AB4875
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4875, 1042 aa
  1>>>pF1KB4875 1042 - 1042 aa - 1042 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1379+/-0.000776; mu= 10.4353+/- 0.047
 mean_var=165.6423+/-33.110, 0's: 0 Z-trim(113.7): 23  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.099653
 statistics sampled from 14271 (14294) to 14271 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.439), width:  16
 Scan time:  5.380

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8108.1 SIPA1 gene_id:6494|Hs108|chr11          (1042) 6961 1013.2       0
CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14      (1782) 1593 241.6 1.1e-62
CCDS61490.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14      (1783) 1593 241.6 1.1e-62
CCDS9807.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14       (1804) 1593 241.6 1.1e-62
CCDS41474.1 SIPA1L2 gene_id:57568|Hs108|chr1       (1722) 1561 237.0 2.6e-61
CCDS33007.1 SIPA1L3 gene_id:23094|Hs108|chr19      (1781) 1524 231.7 1.1e-59
CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9        ( 991)  688 111.3   1e-23
CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9         (1013)  688 111.3   1e-23
CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17     ( 711)  664 107.8 8.5e-23
CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17     ( 715)  664 107.8 8.6e-23
CCDS45573.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17     ( 730)  664 107.8 8.7e-23
CCDS218.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1          ( 663)  636 103.8 1.3e-21
CCDS53276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1        ( 681)  636 103.8 1.3e-21
CCDS53277.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1        ( 727)  636 103.8 1.4e-21
CCDS81276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1        ( 748)  636 103.8 1.5e-21


>>CCDS8108.1 SIPA1 gene_id:6494|Hs108|chr11               (1042 aa)
 initn: 6961 init1: 6961 opt: 6961  Z-score: 5413.0  bits: 1013.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6961; 100.0% identity (100.0% similar) in 1042 aa overlap (1-1042:1-1042)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MPMWAGGVGSPRRGMAPASTDDLFARKLRQPARPPLTPHTFEPRPVRGPLLRSGSDAGEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MPMWAGGVGSPRRGMAPASTDDLFARKLRQPARPPLTPHTFEPRPVRGPLLRSGSDAGEA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 RPPTPASPRARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RPPTPASPRARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 VQSLLFDWAPRSQGMGSHSEASSGTLASAEDQAASSDLLHGAPGFVCELGGEGELGLGGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VQSLLFDWAPRSQGMGSHSEASSGTLASAEDQAASSDLLHGAPGFVCELGGEGELGLGGP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 ASPPVPPALPNAAVSILEEPQNRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASPPVPPALPNAAVSILEEPQNRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 VAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPPGPPRGLSPRKLLEHVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPPGPPRGLSPRKLLEHVA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 PQLSPSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PQLSPSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 MQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 QLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 QDTPAFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QDTPAFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 TNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRGPGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRGPGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQAS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 GPEGIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GPEGIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 FDGSPGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FDGSPGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 GLRPGARLLRVCGQTLPSLRPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYTLSLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLRPGARLLRVCGQTLPSLRPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYTLSLQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 EPSRRGAPDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQDGGSPPGPGDLAEERTEFLHSQNSLSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EPSRRGAPDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQDGGSPPGPGDLAEERTEFLHSQNSLSP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 RSSLSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQDRPGSPSGSEDKGNPAPELRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RSSLSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQDRPGSPSGSEDKGNPAPELRA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 SFLPRTLSLRNSISRIMSEAGSGTLEDEWQAISEIASTCNTILESLSREGQPIPESGDPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SFLPRTLSLRNSISRIMSEAGSGTLEDEWQAISEIASTCNTILESLSREGQPIPESGDPK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 GTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQEDLQKEKADRAALEEEVRSLRHNNRRLQAES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQEDLQKEKADRAALEEEVRSLRHNNRRLQAES
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040  
pF1KB4 ESAATRLLLASKQLGSPTADLA
       ::::::::::::::::::::::
CCDS81 ESAATRLLLASKQLGSPTADLA
             1030      1040  

>>CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14           (1782 aa)
 initn: 2043 init1: 1046 opt: 1593  Z-score: 1238.7  bits: 241.6 E(32554): 1.1e-62
Smith-Waterman score: 2174; 42.3% identity (64.8% similar) in 962 aa overlap (98-961:313-1237)

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB4 PRARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYDVQSLLFD
                                     :  .. : .  :   :. ::::::::.:::
CCDS61 KRRSKSETGDSSIFRKLRNAKGEELGKSSDLEDNRSEDSVRPWTCPKCFAHYDVQSILFD
            290       300       310       320       330       340  

       130                                140       150            
pF1KB4 WAP-----------RSQGMG--------------SHSEASSGTLASAEDQAA--------
                     :.   :              ::: . :. ..:.::  .        
CCDS61 LNEAIMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLSMDQ
            350       360       370       380       390       400  

              160       170                 180       190          
pF1KB4 ----SSDLLHGAPGFVCELGGEGEL----------GLGGPASPPVPPALP----NAAVSI
           :..:. . : :  :.:::::           ...:  :     .:     ::.:..
CCDS61 GDDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAV
            410       420       430       440       450       460  

        200              210       220       230       240         
pF1KB4 LEEPQ-------NRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPVAVSLRREE
       :: :.       .:.. : .::.:::: ::::.:: ::: :.:: ::.:::::::.:::.
CCDS61 LEVPKENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREK
            470       480       490       500       510       520  

     250        260       270       280           290       300    
pF1KB4 K-EGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSPRKLLEHVAPQLS
         : . .:. ..::.: ::..: ::::.. :::.:     .  :::  ...::::.:.:.
CCDS61 PDEMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVVPELN
            530       540       550       560       570       580  

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB4 PSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAFMQFL
        .::::.  .::: . :. :::: :..:.::::.::.:::..:::::::. ::::: .::
CCDS61 VQCLRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQQKVGIMYCKAGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFL
            590       600       610       620       630       640  

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB4 TLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQQLLR
        :::. :::::::.:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::.:::::
CCDS61 QLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTMLPYTPNNKQQLLR
            650       660       670       680       690       700  

          430       440       450       460       470       480    
pF1KB4 KRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRTQDTP
       :::::::::::::::::..:: : .:::::::::..::.:.::.  . : :::.:..:.:
CCDS61 KRHIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRVHNPCSDSVCYSVAVTRSRDVP
            710       720       730       740       750       760  

          490       500       510       520       530       540    
pF1KB4 AFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLATNEV
       .::: .: :   :  .  :: :::::..:.:.:: ....:.::::::::.::.::: ..:
CCDS61 SFGPPIPKGV-TFPKSNVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAEKNV
            770        780       790       800       810       820 

          550       560       570        580       590       600   
pF1KB4 TTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRG-PGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQASGPE
       :.: .: ...: . ::.....   .  :::::.. :..::.:::    ..          
CCDS61 TNTPIDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVWAVRAEDYNKA----------
             830       840       850       860       870           

           610       620       630       640       650       660   
pF1KB4 GIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLRFDG
        .:. :::::: : .::.  .   :::::.::::..:: .. .: ... ::: ...   :
CCDS61 -MELDCLLGISNEFIVLIEQETKSVVFNCSCRDVIGWTSTDTSLKIFYERGECVSV---G
              880       890       900       910       920          

             670       680       690       700       710       720 
pF1KB4 S--PGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETAG
       :    . . :.: :::.::.:::. :..: :.: :.:::.:. ::.:. :: . .:  ::
CCDS61 SFINIEEIKEIVKRLQFVSKGCESVEMTLRRNGLGQLGFHVNYEGIVADVEPYGYAWQAG
       930       940       950       960       970       980       

             730       740       750       760       770       780 
pF1KB4 LRPGARLLRVCGQTLPSLRPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYTLSLQE
       :: :.::...:  .. .:  :   .:::..  : :...:: ..  :::: :: : . ..:
CCDS61 LRQGSRLVEICKVAVATLSHEQMIDLLRTSVTVKVVIIPPHDDCTPRRSCSETYRMPVME
       990      1000      1010      1020      1030      1040       

                                 790       800       810       820 
pF1KB4 -------------P-------SRRGAPDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQDGGSPPGP
                    :       .: ..  : . .: . .  : :..: .    ::  :: :
CCDS61 YKMNEGVSYEFKFPFRNNNKWQRNASKGPHSPQVPSQVQSPMTSRL-NAGKGDGKMPP-P
      1050      1060      1070      1080      1090       1100      

             830       840       850       860       870       880 
pF1KB4 GDLAEERTEFLHSQNSLSPRSSLSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQDR
            ::.  .       :::  ::  :.    .:   . .:.. :.  : :.    .. 
CCDS61 -----ERAANI-------PRSISSDGRPLERRLSPGSDIYVTVS-SMALARSQC---RNS
             1110             1120      1130       1140            

             890       900         910         920          930    
pF1KB4 PGSPSGSEDKGNPAPELRASFLPRTL--SLRN--SISRIMSEA---GSGTLEDEWQ----
       :.. :.: : :. .   : . .:. .  : :.  ::.:  ...   :::     ::    
CCDS61 PSNLSSSSDTGSVGGTYRQKSMPEGFGVSRRSPASIDRQNTQSDIGGSGKSTPSWQRSED
    1150      1160      1170      1180      1190      1200         

               940       950       960       970       980         
pF1KB4 -AISEIASTCNTILESLSREGQPIPESGDPKGTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQ
          ...  ::.  : ..:.    . ::  :.:                            
CCDS61 SIADQMEPTCH--LPAVSKVLPAFRES--PSGRLMRQDPVVHLSPNKQGHSDSHYSSHSS
    1210      1220        1230        1240      1250      1260     

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KB4 EDLQKEKADRAALEEEVRSLRHNNRRLQAESESAATRLLLASKQLGSPTADLA       
                                                                   
CCDS61 SNTLSSNASSAHSDEKWYDGDRTESELNSYNYLQGTSADSGIDTTSYGPSHGSTASLGAA
        1270      1280      1290      1300      1310      1320     

>>CCDS61490.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14           (1783 aa)
 initn: 2043 init1: 1046 opt: 1593  Z-score: 1238.7  bits: 241.6 E(32554): 1.1e-62
Smith-Waterman score: 2174; 42.3% identity (64.8% similar) in 962 aa overlap (98-961:313-1237)

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB4 PRARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYDVQSLLFD
                                     :  .. : .  :   :. ::::::::.:::
CCDS61 KRRSKSETGDSSIFRKLRNAKGEELGKSSDLEDNRSEDSVRPWTCPKCFAHYDVQSILFD
            290       300       310       320       330       340  

       130                                140       150            
pF1KB4 WAP-----------RSQGMG--------------SHSEASSGTLASAEDQAA--------
                     :.   :              ::: . :. ..:.::  .        
CCDS61 LNEAIMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLSMDQ
            350       360       370       380       390       400  

              160       170                 180       190          
pF1KB4 ----SSDLLHGAPGFVCELGGEGEL----------GLGGPASPPVPPALP----NAAVSI
           :..:. . : :  :.:::::           ...:  :     .:     ::.:..
CCDS61 GDDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAV
            410       420       430       440       450       460  

        200              210       220       230       240         
pF1KB4 LEEPQ-------NRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPVAVSLRREE
       :: :.       .:.. : .::.:::: ::::.:: ::: :.:: ::.:::::::.:::.
CCDS61 LEVPKENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREK
            470       480       490       500       510       520  

     250        260       270       280           290       300    
pF1KB4 K-EGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSPRKLLEHVAPQLS
         : . .:. ..::.: ::..: ::::.. :::.:     .  :::  ...::::.:.:.
CCDS61 PDEMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVVPELN
            530       540       550       560       570       580  

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB4 PSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAFMQFL
        .::::.  .::: . :. :::: :..:.::::.::.:::..:::::::. ::::: .::
CCDS61 VQCLRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQQKVGIMYCKAGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFL
            590       600       610       620       630       640  

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB4 TLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQQLLR
        :::. :::::::.:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::.:::::
CCDS61 QLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTMLPYTPNNKQQLLR
            650       660       670       680       690       700  

          430       440       450       460       470       480    
pF1KB4 KRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRTQDTP
       :::::::::::::::::..:: : .:::::::::..::.:.::.  . : :::.:..:.:
CCDS61 KRHIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRVHNPCSDSVCYSVAVTRSRDVP
            710       720       730       740       750       760  

          490       500       510       520       530       540    
pF1KB4 AFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLATNEV
       .::: .: :   :  .  :: :::::..:.:.:: ....:.::::::::.::.::: ..:
CCDS61 SFGPPIPKGV-TFPKSNVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAEKNV
            770        780       790       800       810       820 

          550       560       570        580       590       600   
pF1KB4 TTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRG-PGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQASGPE
       :.: .: ...: . ::.....   .  :::::.. :..::.:::    ..          
CCDS61 TNTPIDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVWAVRAEDYNKA----------
             830       840       850       860       870           

           610       620       630       640       650       660   
pF1KB4 GIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLRFDG
        .:. :::::: : .::.  .   :::::.::::..:: .. .: ... ::: ...   :
CCDS61 -MELDCLLGISNEFIVLIEQETKSVVFNCSCRDVIGWTSTDTSLKIFYERGECVSV---G
              880       890       900       910       920          

             670       680       690       700       710       720 
pF1KB4 S--PGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETAG
       :    . . :.: :::.::.:::. :..: :.: :.:::.:. ::.:. :: . .:  ::
CCDS61 SFINIEEIKEIVKRLQFVSKGCESVEMTLRRNGLGQLGFHVNYEGIVADVEPYGYAWQAG
       930       940       950       960       970       980       

             730       740       750       760       770       780 
pF1KB4 LRPGARLLRVCGQTLPSLRPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYTLSLQE
       :: :.::...:  .. .:  :   .:::..  : :...:: ..  :::: :: : . ..:
CCDS61 LRQGSRLVEICKVAVATLSHEQMIDLLRTSVTVKVVIIPPHDDCTPRRSCSETYRMPVME
       990      1000      1010      1020      1030      1040       

                                 790       800       810       820 
pF1KB4 -------------P-------SRRGAPDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQDGGSPPGP
                    :       .: ..  : . .: . .  : :..: .    ::  :: :
CCDS61 YKMNEGVSYEFKFPFRNNNKWQRNASKGPHSPQVPSQVQSPMTSRL-NAGKGDGKMPP-P
      1050      1060      1070      1080      1090       1100      

             830       840       850       860       870       880 
pF1KB4 GDLAEERTEFLHSQNSLSPRSSLSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQDR
            ::.  .       :::  ::  :.    .:   . .:.. :.  : :.    .. 
CCDS61 -----ERAANI-------PRSISSDGRPLERRLSPGSDIYVTVS-SMALARSQC---RNS
             1110             1120      1130       1140            

             890       900         910         920          930    
pF1KB4 PGSPSGSEDKGNPAPELRASFLPRTL--SLRN--SISRIMSEA---GSGTLEDEWQ----
       :.. :.: : :. .   : . .:. .  : :.  ::.:  ...   :::     ::    
CCDS61 PSNLSSSSDTGSVGGTYRQKSMPEGFGVSRRSPASIDRQNTQSDIGGSGKSTPSWQRSED
    1150      1160      1170      1180      1190      1200         

               940       950       960       970       980         
pF1KB4 -AISEIASTCNTILESLSREGQPIPESGDPKGTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQ
          ...  ::.  : ..:.    . ::  :.:                            
CCDS61 SIADQMEPTCH--LPAVSKVLPAFRES--PSGRLMRQDPVVHLSPNKQGHSDSHYSSHSS
    1210      1220        1230        1240      1250      1260     

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KB4 EDLQKEKADRAALEEEVRSLRHNNRRLQAESESAATRLLLASKQLGSPTADLA       
                                                                   
CCDS61 SNTLSSNASSAHSDEKWYDGDRTESELNSYNYLQGTSADSGIDTTSYGPSHGSTASLGAA
        1270      1280      1290      1300      1310      1320     

>>CCDS9807.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14            (1804 aa)
 initn: 2043 init1: 1046 opt: 1593  Z-score: 1238.6  bits: 241.6 E(32554): 1.1e-62
Smith-Waterman score: 2172; 43.1% identity (65.4% similar) in 926 aa overlap (98-930:313-1205)

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB4 PRARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYDVQSLLFD
                                     :  .. : .  :   :. ::::::::.:::
CCDS98 KRRSKSETGDSSIFRKLRNAKGEELGKSSDLEDNRSEDSVRPWTCPKCFAHYDVQSILFD
            290       300       310       320       330       340  

       130                                140       150            
pF1KB4 WAP-----------RSQGMG--------------SHSEASSGTLASAEDQAA--------
                     :.   :              ::: . :. ..:.::  .        
CCDS98 LNEAIMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLSMDQ
            350       360       370       380       390       400  

              160       170                 180       190          
pF1KB4 ----SSDLLHGAPGFVCELGGEGEL----------GLGGPASPPVPPALP----NAAVSI
           :..:. . : :  :.:::::           ...:  :     .:     ::.:..
CCDS98 GDDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAV
            410       420       430       440       450       460  

        200              210       220       230       240         
pF1KB4 LEEPQ-------NRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPVAVSLRREE
       :: :.       .:.. : .::.:::: ::::.:: ::: :.:: ::.:::::::.:::.
CCDS98 LEVPKENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREK
            470       480       490       500       510       520  

     250        260       270       280           290       300    
pF1KB4 K-EGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSPRKLLEHVAPQLS
         : . .:. ..::.: ::..: ::::.. :::.:     .  :::  ...::::.:.:.
CCDS98 PDEMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVVPELN
            530       540       550       560       570       580  

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB4 PSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAFMQFL
        .::::.  .::: . :. :::: :..:.::::.::.:::..:::::::. ::::: .::
CCDS98 VQCLRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQQKVGIMYCKAGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFL
            590       600       610       620       630       640  

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB4 TLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQQLLR
        :::. :::::::.:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::.:::::
CCDS98 QLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTMLPYTPNNKQQLLR
            650       660       670       680       690       700  

          430       440       450       460       470       480    
pF1KB4 KRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRTQDTP
       :::::::::::::::::..:: : .:::::::::..::.:.::.  . : :::.:..:.:
CCDS98 KRHIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRVHNPCSDSVCYSVAVTRSRDVP
            710       720       730       740       750       760  

          490       500       510       520       530       540    
pF1KB4 AFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLATNEV
       .::: .: :   :  .  :: :::::..:.:.:: ....:.::::::::.::.::: ..:
CCDS98 SFGPPIPKGV-TFPKSNVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAEKNV
            770        780       790       800       810       820 

          550       560       570        580       590       600   
pF1KB4 TTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRG-PGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQASGPE
       :.: .: ...: . ::.....   .  :::::.. :..::.:::    ..          
CCDS98 TNTPIDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVWAVRAEDYNKA----------
             830       840       850       860       870           

           610       620       630       640       650       660   
pF1KB4 GIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLRFDG
        .:. :::::: : .::.  .   :::::.::::..:: .. .: ... ::: ...   :
CCDS98 -MELDCLLGISNEFIVLIEQETKSVVFNCSCRDVIGWTSTDTSLKIFYERGECVSV---G
              880       890       900       910       920          

             670       680       690       700       710       720 
pF1KB4 S--PGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETAG
       :    . . :.: :::.::.:::. :..: :.: :.:::.:. ::.:. :: . .:  ::
CCDS98 SFINIEEIKEIVKRLQFVSKGCESVEMTLRRNGLGQLGFHVNYEGIVADVEPYGYAWQAG
       930       940       950       960       970       980       

             730       740       750       760       770       780 
pF1KB4 LRPGARLLRVCGQTLPSLRPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYTLSLQE
       :: :.::...:  .. .:  :   .:::..  : :...:: ..  :::: :: : . ..:
CCDS98 LRQGSRLVEICKVAVATLSHEQMIDLLRTSVTVKVVIIPPHDDCTPRRSCSETYRMPVME
       990      1000      1010      1020      1030      1040       

                                 790       800       810       820 
pF1KB4 -------------P-------SRRGAPDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQDGGSPPGP
                    :       .: ..  : . .: . .  : :..: .    ::  :: :
CCDS98 YKMNEGVSYEFKFPFRNNNKWQRNASKGPHSPQVPSQVQSPMTSRL-NAGKGDGKMPP-P
      1050      1060      1070      1080      1090       1100      

             830       840       850       860       870       880 
pF1KB4 GDLAEERTEFLHSQNSLSPRSSLSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQDR
            ::.  .       :::  ::  :.    .:   . .:.. :.  : :.    .. 
CCDS98 -----ERAANI-------PRSISSDGRPLERRLSPGSDIYVTVS-SMALARSQC---RNS
             1110             1120      1130       1140            

             890       900         910         920          930    
pF1KB4 PGSPSGSEDKGNPAPELRASFLPRTL--SLRN--SISRIMSEA---GSGTLEDEWQAISE
       :.. :.: : :. .   : . .:. .  : :.  ::.:  ...   :::     ::    
CCDS98 PSNLSSSSDTGSVGGTYRQKSMPEGFGVSRRSPASIDRQNTQSDIGGSGKSTPSWQRSED
    1150      1160      1170      1180      1190      1200         

          940       950       960       970       980       990    
pF1KB4 IASTCNTILESLSREGQPIPESGDPKGTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQEDLQK
                                                                   
CCDS98 SIADQMAYSYRGPQDFNSFVLEQHEYTEPTCHLPAVSKVLPAFRESPSGRLMRQDPVVHL
    1210      1220      1230      1240      1250      1260         

>>CCDS41474.1 SIPA1L2 gene_id:57568|Hs108|chr1            (1722 aa)
 initn: 1913 init1: 1016 opt: 1561  Z-score: 1214.1  bits: 237.0 E(32554): 2.6e-61
Smith-Waterman score: 2079; 41.4% identity (64.7% similar) in 950 aa overlap (114-970:327-1251)

            90       100       110       120           130         
pF1KB4 TSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYDVQSLLFD----WAPRSQGMGSHS
                                     : ::::::::.::.     : :.. .:...
CCDS41 TVKSEHETFKFTSELEESRLERGIRPWNCQRCFAHYDVQSILFNINEAMATRAN-VGKRK
        300       310       320       330       340       350      

     140                          150                   160        
pF1KB4 EASSGT-------------------LASAED------------QAASSDLLHGAPGFVCE
       . ..:.                   :.: ::            .. :.::. . : :  :
CCDS41 NITTGASAASQTQMPTGQTGNCESPLGSKEDLNSKENLDADEGDGKSNDLVLSCPYFRNE
         360       370       380       390       400       410     

      170         180                   190       200              
pF1KB4 LGGEGE--LGLGGPASPPVPPA------------LPNAAVSILEEPQN-------RTSAY
        ::::.  ..:.   :     .              ::.::.:: :..       ... :
CCDS41 TGGEGDRRIALSRANSSSFSSGESCSFESSLSSHCTNAGVSVLEVPRENQPIHREKVKRY
         420       430       440       450       460       470     

       210       220       230       240       250         260     
pF1KB4 SLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPVAVSLRREEKEGSGG--GTLHSYRVIV
        .:: :::: ::::.::::::::.::.::.:::::::.:::. : .    :.  .:::  
CCDS41 IIEHIDLGAYYYRKFFYGKEHQNYFGIDENLGPVAVSIRREKVEDAKEKEGSQFNYRVAF
         480       490       500       510       520       530     

         270       280           290       300       310       320 
pF1KB4 RTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSPRKLLEHVAPQLSPSCLRLGSASPKVPRTL
       ::..: ::::.: :::.:     :  :::  ...::.: :.:: .::: .: :::: . :
CCDS41 RTSELTTLRGAILEDAIPSTARHGTARGLPLKEVLEYVIPELSIQCLRQASNSPKVSEQL
         540       550       560       570       580       590     

             330       340       350       360       370       380 
pF1KB4 LTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRA
       : :::: ::::.:.:::::.:::..:::::::. ::::: .:: :::. :::::: .:::
CCDS41 LKLDEQGLSFQHKIGILYCKAGQSTEEEMYNNETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRA
         600       610       620       630       640       650     

             390       400       410       420       430       440 
pF1KB4 QLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPG
       :::.::::::::::::::.:.:.::::::.::: :::.::::::::::::::::::::::
CCDS41 QLDNKTDSTGTHSLYTTYKDYELMFHVSTLLPYMPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPG
         660       670       680       690       700       710     

             450       460       470       480       490       500 
pF1KB4 SKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRTQDTPAFGPALPAGGGPFAANA
       . :: : .:::::::::..:..:.::: .. : :.:::..:.: ::: .: :   :  .:
CCDS41 ALPFTPKSIRSHFQHVFVIVKVHNPCTENVCYSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGV-TFPKSA
         720       730       740       750       760        770    

             510       520       530       540       550       560 
pF1KB4 DFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLATNEVTTTSLDSASRFGLPSLG
        :: :::::..:.:.:: ....:.::::::::.::.::: : :::...:.. .:.. .::
CCDS41 VFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSVKFSFITLG
          780       790       800       810       820       830    

               570       580       590       600       610         
pF1KB4 GRRR--AAPRGPGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQASGPEGIEVPCLLGISAEALV
       ....  . ::   :.: . :...: : :   .. :           .. :::::: : ..
CCDS41 AKKKEKVKPR-KDAHLFSIGAIMWHVIARDFGQSA-----------DIECLLGISNEFIM
          840        850       860                  870       880  

     620       630       640       650       660       670         
pF1KB4 LVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLRFDGSPGQAVGEVVARLQLV
       :.   .  :::::.::::..:: .  .. ... ::: . :    . .. . :.: :: .:
CCDS41 LIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTSGLVSIKVFYERGECVLLSSVDNCAEDIREIVQRLVIV
            890       900       910       920       930       940  

     680       690       700       710       720       730         
pF1KB4 SRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETAGLRPGARLLRVCGQTLPSL
       .::::: :..: :.: :.:::.:. ::.:. :: : ::  :::: :.::...:  .. .:
CCDS41 TRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVADVEPFGFAWKAGLRQGSRLVEICKVAVATL
            950       960       970       980       990      1000  

     740       750       760       770       780                   
pF1KB4 RPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYTLSLQE--------------PSRR
         :   .:::..  : :... : ..: :::. :::  . . :              : ::
CCDS41 THEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHDDGSPRRGCSELCRIPMVEYKLDSEGTPCEYKTPFRR
           1010      1020      1030      1040      1050      1060  

              790       800       810         820       830        
pF1KB4 GA-----PDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQ--DGGSPPGPGDLAEERTEFLHSQNSL
       ..     : :. . .. .. .: : . :  : :  . ..   : . . .:     ...: 
CCDS41 NTTWHRVPTPALQPLSRASPIPGTPDRLP-CQQLLQQAQAAIPRSTSFDRKLPDGTRSSP
           1070      1080      1090       1100      1110      1120 

      840       850       860       870       880        890       
pF1KB4 SPRSSLSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQDRPGS-PSGSEDKGNPAPE
       : .:: :: .:   .. :        .:.:     ..::  .. :: :   .   .    
CCDS41 SNQSSSSDPGP--GGSGP-------WRPQVGYDGCQSPLLLEHQGSGPLECDGAREREDT
            1130               1140      1150      1160      1170  

       900       910             920       930        940       950
pF1KB4 LRASFLPRTLSLRNSISRIMSE------AGSGTLEDEWQAISEIAS-TCNTILESLSREG
       ..::  :.: . ..  :....         .:. .:  . .:.:.. .:..   : .  .
CCDS41 MEASRHPET-KWHGPPSKVLGSYKERALQKDGSCKDSPNKLSHIGDKSCSSHSSSNTLSS
           1180       1190      1200      1210      1220      1230 

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KB4 QPIPESGDPKGTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQEDLQKEKADRAALEEEVRSLR
       .   .: : .    .  .::                                        
CCDS41 NTSSNSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDTAPCMPATILGPVHLAGSRSLIH
            1240      1250      1260      1270      1280      1290 

>>CCDS33007.1 SIPA1L3 gene_id:23094|Hs108|chr19           (1781 aa)
 initn: 2099 init1: 978 opt: 1524  Z-score: 1185.1  bits: 231.7 E(32554): 1.1e-59
Smith-Waterman score: 2082; 43.4% identity (64.8% similar) in 913 aa overlap (99-924:318-1204)

       70        80        90       100       110            120   
pF1KB4 RARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRW-----FAHYDVQS
                                     :.:  :   ::     :     :::.::::
CCDS33 ARGLGGGDTVDSSIFRKLRSSKPEGEAGRSPGEADEGRSPPEASRPWVCQKSFAHFDVQS
       290       300       310       320       330       340       

               130          140                             150    
pF1KB4 LLFDW----APR---SQGMGSHSEASSGTLASA----------------------ED---
       .:::     : :   ::  .. . ::... :::                      ::   
CCDS33 MLFDLNEAAANRVSVSQRRNTTTGASAASAASAMASLTASRAHSLGGLDPAFTSTEDLNC
       350       360       370       380       390       400       

                      160       170              180          190  
pF1KB4 ---------QAASSDLLHGAPGFVCELGGEGE-------LGLGGPASPP---VPPALP--
                .  :.::: . : :  :.::: :        ..:.:.:     . :::   
CCDS33 KENLEQDLGDDNSNDLLLSCPHFRNEIGGECERNVSFSRASVGSPSSGEGHLAEPALSAY
       410       420       430       440       450       460       

                200             210       220       230       240  
pF1KB4 --NAAVSILEEP------QNRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPVA
         ::..:.:: :      :.:   ::.::.:::: ::. :: :::: :.::.::.:::::
CCDS33 RTNASISVLEVPKEQQRTQSRPRQYSIEHVDLGARYYQDYFVGKEHANYFGVDEKLGPVA
       470       480       490       500       510       520       

            250        260       270       280           290       
pF1KB4 VSLRREEKEGSG-GGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSPRKLLE
       ::..::. :     :  ..::.: :: .: ::::.: ::: :     :  :::  .  ::
CCDS33 VSIKREKLEDHKEHGPQYQYRIIFRTRELITLRGSILEDATPTATKHGTGRGLPLKDALE
       530       540       550       560       570       580       

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB4 HVAPQLSPSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAG
       .: :.:.  ::::.  .::: . :: :::: :  ..:::::::.:::.::::::::.:::
CCDS33 YVIPELNIHCLRLALNTPKVTEQLLKLDEQGLCRKHKVGILYCKAGQSSEEEMYNNEEAG
       590       600       610       620       630       640       

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB4 PAFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPN
       ::: .::.:.:. : :::: .: ::::.:::::::::::: :::.::::::::.::::::
CCDS33 PAFEEFLSLIGEKVCLKGFTKYAAQLDVKTDSTGTHSLYTMYQDYEIMFHVSTLLPYTPN
       650       660       670       680       690       700       

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB4 NQQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAV
       :.::::::::::::::::.:::::. :: : .:::::::::..::.:.::: .. : .::
CCDS33 NRQQLLRKRHIGNDIVTIIFQEPGALPFTPKNIRSHFQHVFIIVRVHNPCTDNVCYSMAV
       710       720       730       740       750       760       

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB4 SRTQDTPAFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQ
       .:..:.: ::: .:.:   :  .  :: :::::..:.:.:: .. .::.:::::::.::.
CCDS33 TRSKDAPPFGPPIPSGT-TFRKSDVFRDFLLAKVINAENAAHKSDKFHTMATRTRQEYLK
       770       780        790       800       810       820      

       540       550       560       570        580       590      
pF1KB4 DLATNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRG-PGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAG
       ::: : :..: .::...:.: :: ....   ..  ::: ..::...:        ::.: 
CCDS33 DLAENCVSNTPIDSTGKFNLISLTSKKKEKTKARAGAEQHSAGAIAW--------RVVAQ
        830       840       850       860       870                

        600       610       620       630       640       650      
pF1KB4 AQASGPEGIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEA
         :   .:.:. :.:::: : .::.  :  .::::: : ::..:: . . : ...:::. 
CCDS33 DYA---QGVEIDCILGISNEFVVLLDLRTKEVVFNCYCGDVIGWTPDSSTLKIFYGRGDH
      880          890       900       910       920       930     

        660       670       680       690       700       710      
pF1KB4 ITLRFDGSPGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTF
       : :.   .  . . :.: ::.... : :: ...: :.: :.:::.:  .: :..:: . :
CCDS33 IFLQATEGSVEDIREIVQRLKVMTSGWETVDMTLRRNGLGQLGFHVKYDGTVAEVEDYGF
         940       950       960       970       980       990     

        720       730       740       750       760       770      
pF1KB4 AETAGLRPGARLLRVCGQTLPSLRPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYT
       :  :::: :.::...:  .. .:  .   .:::..  : :...:: :.: :::.. : : 
CCDS33 AWQAGLRQGSRLVEICKVAVVTLTHDQMIDLLRTSVTVKVVIIPPFEDGTPRRGWPETYD
        1000      1010      1020      1030      1040      1050     

        780             790       800       810       820       830
pF1KB4 LSLQEPSRR------GAPDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQDGGSPPGPGDLAEERTE
       .. .::. .      :.  : ....      :.... :    .  ..:  ::  :.  ..
CCDS33 MNTSEPKTEQESITPGGRPPYRSNAPWQWSGPASHNSLPA--SKWATPTTPGH-AQSLSR
        1060      1070      1080      1090        1100       1110  

              840          850       860       870            880  
pF1KB4 FLHSQNSLSP-RSS--LSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQ-----DRP
        :. :. . : : :  : .. ::    ::      :..:.  .::   :  :     . :
CCDS33 PLK-QTPIVPFRESQPLHSKRPVSFPETP-----YTVSPA--GADRVPPYRQPSGSFSTP
            1120      1130      1140             1150      1160    

            890       900        910       920       930       940 
pF1KB4 GSPSGSEDKGNPAPELRASFLPRTL-SLRNSISRIMSEAGSGTLEDEWQAISEIASTCNT
       :: .  . :  :.:: : .  :. : ::   .:.  . .:...                 
CCDS33 GSATYVRYK--PSPE-RYTAAPHPLLSLDPHFSHDGTSSGDSSSGGLTSQESTMERQKPE
         1170         1180      1190      1200      1210      1220 

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KB4 ILESLSREGQPIPESGDPKGTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQEDLQKEKADRAA
                                                                   
CCDS33 PLWHVPAQARLSAIAGSSGNKHPSRQDAAGKDSPNRHSKGEPQYSSHSSSNTLSSNASSS
            1230      1240      1250      1260      1270      1280 

>>CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9             (991 aa)
 initn: 726 init1: 494 opt: 688  Z-score: 539.3  bits: 111.3 E(32554): 1e-23
Smith-Waterman score: 757; 36.7% identity (63.6% similar) in 420 aa overlap (203-609:61-463)

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB4 GELGLGGPASPPVPPALPNAAVSILEEPQNRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFF
                                     : .   ::. .  . .: ::: :. :::..
CCDS69 DADGAIQRAGRFRVENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYI
               40        50        60        70        80        90

            240       250       260        270       280       290 
pF1KB4 GMDESLGPVAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIV-RTTQLRTLRGTISEDALPPGPPRGLS
       : :   .:  .:.   .....    . .::.:. : :      :: ..  :: .: . ::
CCDS69 GNDAEKSPFFLSVTLSDQNNQ---RVPQYRAILWRKT------GT-QKICLPYSPTKTLS
              100       110          120              130       140

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB4 PRKLLEHVAPQLSPSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMY
        ...:  .  .   .  :     :.. . ::.:.::  : . : :.:. . :: ...::.
CCDS69 VKSILSAMNLDKFEKGPRE-IFHPEIQKDLLVLEEQEGSVNFKFGVLFAKDGQLTDDEMF
              150        160       170       180       190         

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB4 NNQEAGPAFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTM
       .:. ..  :..::.::::.. :::. .::. ::::.:.:: ::.::.:: ::::::::::
CCDS69 SNEIGSEPFQKFLNLLGDTITLKGWTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTM
     200       210       220       230       240       250         

             420       430         440       450       460         
pF1KB4 LPYTPNNQQQLLRKRHIGNDIVTIVFQE--PGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTP
       :::. .:.::. ::::::::::::::::   .:  : :. ::::: :.: .:: .     
CCDS69 LPYSKENKQQVERKRHIGNDIVTIVFQEGEESSPAFKPSMIRSHFTHIFALVRYNQ---Q
     260       270       280       290       300       310         

     470       480       490        500       510              520 
pF1KB4 HTTYRVAVSRTQDTPAFGPALPAGGGP-FAANADFRAFLLAKALNGEQA-------AGHA
       . .::. .   ...: ::: ::.   : :. . .:: :::.: .:::.:       : . 
CCDS69 NDNYRLKIFSEESVPLFGPPLPT--PPVFTDHQEFRDFLLVKLINGEKATLETPTFAQKR
        320       330         340       350       360       370    

             530        540       550       560       570       580
pF1KB4 RQFHAMATRT-RQQYLQDLATNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRGPGAELQAAGS
       :.   :  :. .:. . ::  : ..  :....   . :. . ... : ..  ...  : .
CCDS69 RRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNMLNRRSFSDVLPES-PKSARKKEEARQAEFVRIGQALK
          380       390       400       410        420       430   

               590       600       610       620       630         
pF1KB4 LVWGVRA-APGARVAAGAQASGPEGIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLA
       :   ::. ::.. .:.:   . :   .  :                              
CCDS69 LKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWEPQCFCSNFPHEAVCADPWGQALLVSTDAGVLLVDD
           440       450       460       470       480       490   

>>CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9              (1013 aa)
 initn: 726 init1: 494 opt: 688  Z-score: 539.1  bits: 111.3 E(32554): 1e-23
Smith-Waterman score: 757; 36.7% identity (63.6% similar) in 420 aa overlap (203-609:83-485)

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB4 GELGLGGPASPPVPPALPNAAVSILEEPQNRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFF
                                     : .   ::. .  . .: ::: :. :::..
CCDS68 DADGAIQRAGRFRVENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYI
             60        70        80        90       100       110  

            240       250       260        270       280       290 
pF1KB4 GMDESLGPVAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIV-RTTQLRTLRGTISEDALPPGPPRGLS
       : :   .:  .:.   .....    . .::.:. : :      :: ..  :: .: . ::
CCDS68 GNDAEKSPFFLSVTLSDQNNQ---RVPQYRAILWRKT------GT-QKICLPYSPTKTLS
            120       130          140              150       160  

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB4 PRKLLEHVAPQLSPSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMY
        ...:  .  .   .  :     :.. . ::.:.::  : . : :.:. . :: ...::.
CCDS68 VKSILSAMNLDKFEKGPRE-IFHPEIQKDLLVLEEQEGSVNFKFGVLFAKDGQLTDDEMF
            170       180        190       200       210       220 

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB4 NNQEAGPAFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTM
       .:. ..  :..::.::::.. :::. .::. ::::.:.:: ::.::.:: ::::::::::
CCDS68 SNEIGSEPFQKFLNLLGDTITLKGWTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTM
             230       240       250       260       270       280 

             420       430         440       450       460         
pF1KB4 LPYTPNNQQQLLRKRHIGNDIVTIVFQE--PGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTP
       :::. .:.::. ::::::::::::::::   .:  : :. ::::: :.: .:: .     
CCDS68 LPYSKENKQQVERKRHIGNDIVTIVFQEGEESSPAFKPSMIRSHFTHIFALVRYNQ---Q
             290       300       310       320       330           

     470       480       490        500       510              520 
pF1KB4 HTTYRVAVSRTQDTPAFGPALPAGGGP-FAANADFRAFLLAKALNGEQA-------AGHA
       . .::. .   ...: ::: ::.   : :. . .:: :::.: .:::.:       : . 
CCDS68 NDNYRLKIFSEESVPLFGPPLPT--PPVFTDHQEFRDFLLVKLINGEKATLETPTFAQKR
      340       350       360         370       380       390      

             530        540       550       560       570       580
pF1KB4 RQFHAMATRT-RQQYLQDLATNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRGPGAELQAAGS
       :.   :  :. .:. . ::  : ..  :....   . :. . ... : ..  ...  : .
CCDS68 RRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNMLNRRSFSDVLPES-PKSARKKEEARQAEFVRIGQALK
        400       410       420       430        440       450     

               590       600       610       620       630         
pF1KB4 LVWGVRA-APGARVAAGAQASGPEGIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLA
       :   ::. ::.. .:.:   . :   .  :                              
CCDS68 LKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWEPQCFCSNFPHEAVCADPWGQALLVSTDAGVLLVDD
         460       470       480       490       500       510     

>>CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17          (711 aa)
 initn: 783 init1: 429 opt: 664  Z-score: 522.7  bits: 107.8 E(32554): 8.5e-23
Smith-Waterman score: 778; 35.8% identity (61.3% similar) in 452 aa overlap (100-539:18-445)

      70        80        90       100        110       120        
pF1KB4 ARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPE-PAFPPVLEPRWFAHYDVQSLLFDW
                                     :  :. :  ::.  :  .     .: .:. 
CCDS82              MLASLKVKKQELANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMK----SSEFFEM
                            10        20        30            40   

      130       140       150           160       170       180    
pF1KB4 APRSQGMGSHSEASSGTLASAEDQAA--SSDLL--HGAPGFVCELGGEGELGLGGPASPP
         . ::. .  : . :   . .:     : : .  .:.:     :   :   .  : .  
CCDS82 LEKMQGI-KLEEQKPGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVG
            50         60        70        80        90       100  

          190       200          210       220       230       240 
pF1KB4 VPPALPNAAVSILEEPQN---RTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPV
       .: .: ....   :: .:    : .:.::     :  ::..: ::.: ::.    ::: .
CCDS82 TPTSL-GSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGE-ARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNL
             110       120       130        140       150       160

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB4 AVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPPGPPRGLSPRKLLEHVAP
        .:.. :: ::     ..  :::.:. .:.:..  :        :  :::    . ..: 
CCDS82 ILSVKCEEAEG-----IEYLRVILRS-KLKTVHERI--------PLAGLSKLPSVPQIAK
              170            180        190               200      

               310        320       330       340       350        
pF1KB4 QLSPSC--LRLGSA-SPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGP
        .  .   ::.. .  ::. . ... ::. ..   : :..: .: :  :::...:.: .:
CCDS82 AFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESP
        210       220       230       240       250       260      

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB4 AFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNN
       :: .:: ::::.. :. :...:. ::.   .::..:.:::..:.:::::::: ::.: ..
CCDS82 AFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGD
        270       280       290       300       310       320      

      420       430       440       450       460       470        
pF1KB4 QQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVS
        ::: ::::::::::.:.::: .. :: :  : :.: :...::...:: :   .:.:.:.
CCDS82 AQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENT-PFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVT
        330       340       350        360       370       380     

      480       490        500       510       520       530       
pF1KB4 RTQDTPAFGPALPAGGGP-FAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQ
         .:.:.::: ::.   : :  . .:: :::.:  :.:.:  .. .:  .  :::   :.
CCDS82 AREDVPTFGPPLPSP--PVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLD
         390       400         410       420       430       440   

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB4 DLATNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRGPGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGA
       .:                                                          
CCDS82 NLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGG
           450       460       470       480       490       500   

>>CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17          (715 aa)
 initn: 783 init1: 429 opt: 664  Z-score: 522.7  bits: 107.8 E(32554): 8.6e-23
Smith-Waterman score: 762; 39.0% identity (65.9% similar) in 367 aa overlap (180-539:102-449)

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB4 EDQAASSDLLHGAPGFVCELGGEGELGLGGPASPPVPPALPNAAVSILEEPQN---RTSA
                                     : .  .: .: ....   :: .:    : .
CCDS45 PYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSL-GSSICEEEEEDNLSPNTFG
              80        90       100       110        120       130

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB4 YSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPVAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIVR
       :.::     :  ::..: ::.: ::.    ::: . .:.. :: ::     ..  :::.:
CCDS45 YKLECKGE-ARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEG-----IEYLRVILR
               140       150       160       170            180    

        270       280       290       300         310        320   
pF1KB4 TTQLRTLRGTISEDALPPGPPRGLSPRKLLEHVAPQLSPSC--LRLGSA-SPKVPRTLLT
       . .:.:..  :        :  :::    . ..:  .  .   ::.. .  ::. . ...
CCDS45 S-KLKTVHERI--------PLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVS
           190               200       210       220       230     

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB4 LDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQL
        ::. ..   : :..: .: :  :::...:.: .::: .:: ::::.. :. :...:. :
CCDS45 YDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGL
         240       250       260       270       280       290     

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB4 DTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSK
       :.   .::..:.:::..:.:::::::: ::.: .. ::: ::::::::::.:.::: .. 
CCDS45 DVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENT-
         300       310       320       330       340       350     

           450       460       470       480       490        500  
pF1KB4 PFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRTQDTPAFGPALPAGGGP-FAANAD
       :: :  : :.: :...::...:: :   .:.:.:.  .:.:.::: ::.   : :  . .
CCDS45 PFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPS--PPVFQKGPE
          360       370       380       390       400         410  

            510       520       530       540       550       560  
pF1KB4 FRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLATNEVTTTSLDSASRFGLPSLGG
       :: :::.:  :.:.:  .. .:  .  :::   :..:                       
CCDS45 FREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFEN
            420       430       440       450       460       470  

            570       580       590       600       610       620  
pF1KB4 RRRAAPRGPGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQASGPEGIEVPCLLGISAEALVLVA
                                                                   
CCDS45 GGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPV
            480       490       500       510       520       530  




1042 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 15:33:23 2016 done: Thu Nov  3 15:33:23 2016
 Total Scan time:  5.380 Total Display time:  0.350

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com