Result of FASTA (ccds) for pFN21AB4698
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4698, 883 aa
  1>>>pF1KB4698 883 - 883 aa - 883 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2326+/-0.00134; mu= 20.9189+/- 0.080
 mean_var=64.6258+/-12.860, 0's: 0 Z-trim(99.4): 53  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.159541
 statistics sampled from 5657 (5705) to 5657 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.175), width:  16
 Scan time:  3.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4           ( 883) 5791 1342.8       0
CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4          ( 883) 5732 1329.3       0
CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4          ( 836) 5480 1271.2       0
CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11         ( 884) 4492 1043.9       0
CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11          ( 902) 4353 1011.9       0
CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX          ( 894) 4346 1010.2       0
CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX          ( 894) 4288 996.9       0
CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 906) 4158 967.0       0
CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5           ( 906) 4127 959.8       0
CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 916) 4114 956.9       0
CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 916) 4083 949.7       0
CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 837) 3974 924.6       0
CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 826) 3563 830.0       0
CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6           ( 869) 2021 475.1 2.4e-133
CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6          ( 892) 2021 475.1 2.4e-133
CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6           ( 908) 2021 475.1 2.5e-133
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1            ( 919) 1956 460.2  8e-129
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 905) 1945 457.6 4.6e-128
CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 934) 1945 457.6 4.7e-128
CCDS41707.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11         ( 433) 1724 406.6 5.1e-113
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11          ( 956) 1647 389.0 2.1e-107
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19         ( 980) 1620 382.8 1.6e-105
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19         ( 981) 1616 381.9  3e-105
CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 918) 1601 378.4 3.2e-104
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 920) 1601 378.4 3.2e-104
CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 949) 1601 378.5 3.2e-104
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16        (1281)  660 161.9 6.6e-39
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16        (1464)  660 162.0 7.4e-39
CCDS31236.1 GRID1 gene_id:2894|Hs108|chr10         (1009)  651 159.8 2.3e-38
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12         (1484)  648 159.2 5.1e-38
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19        (1336)  634 156.0 4.3e-37
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17        ( 873)  619 152.4 3.3e-36
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17        (1233)  619 152.5 4.4e-36
CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4          ( 912)  599 147.8 8.4e-35
CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4           (1007)  599 147.8 9.1e-35
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9          ( 885)  548 136.1 2.8e-31
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9           ( 901)  548 136.1 2.8e-31
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9           ( 938)  548 136.1 2.9e-31
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9          ( 906)  543 134.9 6.3e-31
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9          ( 943)  543 134.9 6.5e-31
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9        (1115)  321 83.9 1.8e-15
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19      (1043)  312 81.8 7.2e-15


>>CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4                (883 aa)
 initn: 5791 init1: 5791 opt: 5791  Z-score: 7197.0  bits: 1342.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5791; 99.9% identity (100.0% similar) in 883 aa overlap (1-883:1-883)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 HIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 HIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 THPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 THPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 GNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 YDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 KFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 ILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 WNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 WNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 PLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 SLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDL
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 SKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 DKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880   
pF1KB4 AEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 AEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
              850       860       870       880   

>>CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4               (883 aa)
 initn: 5732 init1: 5732 opt: 5732  Z-score: 7123.6  bits: 1329.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5732; 98.9% identity (99.5% similar) in 883 aa overlap (1-883:1-883)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 HIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 THPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 THPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 GNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 YDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNI
              310       320       330       340       350       360

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWF
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       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::::.:::.:
CCDS43 YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRNAVNLAVLKLNEQGLL
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pF1KB4 DKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSR
       :::::::::::::::.  . ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSR
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
              850       860       870       880   

>>CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4               (836 aa)
 initn: 5480 init1: 5480 opt: 5480  Z-score: 6810.5  bits: 1271.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5480; 99.9% identity (100.0% similar) in 836 aa overlap (48-883:1-836)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KB4 LIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43                               MVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALL
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pF1KB4 SLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANV
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pF1KB4 SGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQ
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pF1KB4 RIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIME
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 APLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGV
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pF1KB4 SVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS43 SVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSL
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pF1KB4 SGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTK
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pF1KB4 EFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRK
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pF1KB4 PCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAK
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pF1KB4 DSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINP
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pF1KB4 SSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
              820       830      

>>CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11              (884 aa)
 initn: 3983 init1: 3380 opt: 4492  Z-score: 5581.1  bits: 1043.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4492; 73.6% identity (92.2% similar) in 890 aa overlap (1-883:1-884)

               10        20        30        40        50          
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSE-----
       :. : .  :::   .::: .:.  .:.:::::: :..::::.:::...   .::      
CCDS41 MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNTSPNASEA
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB4 -FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITP
        : :.::.::.:.:::::::::::::.::::.::::.:::.::.:.::::..::.:.:::
CCDS41 PFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSALHISLITP
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB4 SFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQ
       ::::.:   ::.:.::.:.::::::...:.:. :..:::.::: : :::....:... :.
CCDS41 SFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEKAGQNGWH
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB4 VTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYH
       :.:: : :.:    :  ::.:...:. ..:.. ..::: .....:..:....::::::::
CCDS41 VSAICVENFN----DVSYRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHVKGYH
              190           200       210       220       230      

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pF1KB4 YIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIK
       :::::::: : .: ..  :::::.:::.::..  .: :...::. :...::::..:   :
CCDS41 YIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSETPP-K
        240       250       260       270       280       290      

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pF1KB4 YTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVE
       ::::::::.: ::.:.::.::.:.:.:::::::::::::::.:::::...::.::::...
CCDS41 YTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQVRIQ
         300       310       320       330       340       350     

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pF1KB4 GLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPS-GNDTSGLEN
       ::.::..::. :.:.:::....:::..::::.:::...::.:. . ..:. ::::...::
CCDS41 GLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVL-IQDVPTLGNDTAAIEN
         360       370       380       390        400       410    

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pF1KB4 KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGA
       .:::::::.::::::.::::::.:::..:::::::::.::::: :.:::..:: ::::::
CCDS41 RTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGA
          420       430       440       450       460       470    

           480       490       500       510       520       530   
pF1KB4 RDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKP
       ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKP
          480       490       500       510       520       530    

           540       550       560       570       580       590   
pF1KB4 GVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:  :..  ::::
CCDS41 GVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEPEDGKEGPSDQPPNEFG
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       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 IESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVAR
       :::::::.::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.:::::::::
CCDS41 IESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVAR
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pF1KB4 VRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLK
       :::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::. :::::::
CCDS41 VRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRNAVNLAVLK
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pF1KB4 LSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALI
       :.:::.::::::::::::::::.  . ::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALI
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pF1KB4 EFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
       :::::::::::::::::.::..::.::::.::.:::.::::::: ::.::
CCDS41 EFCYKSRAEAKRMKVAKSAQTFNPTSSQNTQNLATYREGYNVYGTESIKI
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>>CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11               (902 aa)
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Smith-Waterman score: 4353; 74.3% identity (92.3% similar) in 855 aa overlap (1-848:1-849)

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       :. : .  :::   .::: .:.  .:.:::::: :..::::.:::...   .::      
CCDS83 MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNTSPNASEA
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pF1KB4 -FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITP
        : :.::.::.:.:::::::::::::.::::.::::.:::.::.:.::::..::.:.:::
CCDS83 PFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSALHISLITP
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pF1KB4 SFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQ
       ::::.:   ::.:.::.:.::::::...:.:. :..:::.::: : :::....:... :.
CCDS83 SFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEKAGQNGWH
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pF1KB4 VTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYH
       :.:: : :.:    :  ::.:...:. ..:.. ..::: .....:..:....::::::::
CCDS83 VSAICVENFN----DVSYRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHVKGYH
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pF1KB4 YIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIK
       :::::::: : .: ..  :::::.:::.::..  .: :...::. :...::::..:   :
CCDS83 YIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSETPP-K
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pF1KB4 YTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVE
       ::::::::.: ::.:.::.::.:.:.:::::::::::::::.:::::...::.::::...
CCDS83 YTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQVRIQ
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       ::.::..::. :.:.:::....:::..::::.:::...::.:. . ..:. ::::...::
CCDS83 GLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVL-IQDVPTLGNDTAAIEN
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pF1KB4 KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGA
       .:::::::.::::::.::::::.:::..:::::::::.::::: :.:::..:: ::::::
CCDS83 RTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGA
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       ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKP
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pF1KB4 GVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:  :..  ::::
CCDS83 GVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEPEDGKEGPSDQPPNEFG
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       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::.::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.:::::::::
CCDS83 IESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVAR
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       :::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS83 VRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLK
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       ::: :::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 EFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI          
       ::::::::::::::.                                             
CCDS83 EFCYKSRAEAKRMKLTFSEAIRNKARLSITGSVGENGRVLTPDCPKAVHTGTAIRQSSGL
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>>CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX               (894 aa)
 initn: 3472 init1: 1781 opt: 4346  Z-score: 5399.5  bits: 1010.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4346; 71.7% identity (90.2% similar) in 890 aa overlap (2-883:9-894)

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pF1KB4        MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFST
               :....   .:   : :   :   :.:.::::: :.. ::.:::: ..  ..:
CCDS14 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB4 SE------FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTL
       ..      :.:. :.:.:. .:::.:::::::::::::::::::::. :.::.:::::.:
CCDS14 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
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pF1KB4 HVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDS
       :.::.:::::::.   ::::::: ::::.:::. .:.:.::.::::..::.: :::....
CCDS14 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
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pF1KB4 AAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIG
       :....::::: .::::   :  . .: ...... ..:.: ..::: ...: :..::. .:
CCDS14 AVQNNWQVTARSVGNI---KDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILG
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pF1KB4 KHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPG
       :: .::::..:::::::  : ... ::::..:::::. .. .:..::.::  :.:.:.: 
CCDS14 KHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPE
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pF1KB4 AHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERA
       :... .:::::::.::. :..:::: ::.::...::::.::::::::::::.::..::::
CCDS14 AKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERA
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pF1KB4 LKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGND
       ::.:::.:..:::.::  :.: ::::...:.:..: :: :::.: ...:  ...   .::
CCDS14 LKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFV-PFSDQQISND
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pF1KB4 TSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVG
       ... ::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::: :::::  .::::.:::
CCDS14 SASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVG
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pF1KB4 DGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
       :::::::: .::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
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pF1KB4 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEF-EDGRETQSS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.  :. :. :: 
CCDS14 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSP
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pF1KB4 -ESTNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
        .  :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
        600       610       620       630       640       650      

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pF1KB4 TVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVR
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:::.::.:::::::..
CCDS14 TVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTK
        660       670       680       690       700       710      

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pF1KB4 TTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRT
       :::.:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::
CCDS14 TTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALRT
        720       730       740       750       760       770      

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pF1KB4 PVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
       :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 PVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
        780       790       800       810       820       830      

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pF1KB4 LAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
       :::.:::::::::::::.::::..::.::..:. . :.::.:::.::::::: :::::
CCDS14 LAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
        840       850       860       870       880       890    

>>CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX               (894 aa)
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                      10        20        30        40        50   
pF1KB4        MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFST
               :....   .:   : :   :   :.:.::::: :.. ::.:::: ..  ..:
CCDS14 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB4 SE------FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTL
       ..      :.:. :.:.:. .:::.:::::::::::::::::::::. :.::.:::::.:
CCDS14 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
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pF1KB4 HVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDS
       :.::.:::::::.   ::::::: ::::.:::. .:.:.::.::::..::.: :::....
CCDS14 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
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pF1KB4 AAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIG
       :....::::: .::::   :  . .: ...... ..:.: ..::: ...: :..::. .:
CCDS14 AVQNNWQVTARSVGNI---KDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILG
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pF1KB4 KHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPG
       :: .::::..:::::::  : ... ::::..:::::. .. .:..::.::  :.:.:.: 
CCDS14 KHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPE
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pF1KB4 AHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERA
       :... .:::::::.::. :..:::: ::.::...::::.::::::::::::.::..::::
CCDS14 AKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERA
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pF1KB4 LKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGND
       ::.:::.:..:::.::  :.: ::::...:.:..: :: :::.: ...:  ...   .::
CCDS14 LKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFV-PFSDQQISND
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pF1KB4 TSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVG
       ... ::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::: :::::  .::::.:::
CCDS14 SASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVG
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pF1KB4 DGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
       :::::::: .::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
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pF1KB4 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEF-EDGRETQSS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.  :. :. :: 
CCDS14 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSP
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pF1KB4 -ESTNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
        .  :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
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pF1KB4 TVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVR
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:::.::.:::::::..
CCDS14 TVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTK
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pF1KB4 TTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRT
       :::.:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::.
CCDS14 TTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALRN
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pF1KB4 PVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
        ::::::::.:::.::::::::::::::::.  . ::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
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pF1KB4 LAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
       :::.:::::::::::::.::::..::.::..:. . :.::.:::.::::::: :::::
CCDS14 LAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
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>>CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5               (906 aa)
 initn: 3576 init1: 3492 opt: 4158  Z-score: 5165.5  bits: 967.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4158; 71.7% identity (90.4% similar) in 845 aa overlap (4-847:1-840)

               10        20         30        40        50         
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVS-SNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLT
          ..:: ...   . : . :..  :.::::::::   .::..::: .. :..    .: 
CCDS47    MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPP-KLL
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pF1KB4 PHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTD
       :.:: .....:: .:  ::::::.:::::::::....:: .:::::.::: :::::::.:
CCDS47 PQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVD
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pF1KB4 GTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAIN
        .. ::.:.::.:. ::.:.:..:.:.::.:.::.:::::.:: :::.::::.:::::.:
CCDS47 TSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVN
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pF1KB4 VGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIAN
       . . .    .: :: :::::: :::: :..::: ...: :. :.: . :.  :::::.::
CCDS47 ILTTT----EEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILAN
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pF1KB4 LGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSAL
       ::: : :: :.. .::::.:::.:.: :.. .:....:.. . ...  .     ::::::
CCDS47 LGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSAL
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     300       310       320       330       340       350         
pF1KB4 TYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGN
       :::.:.::.:::..::.:::.:::::::::::::::::::::..:.:::.::. :::.::
CCDS47 TYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGN
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KB4 IKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVT
       ..:...:.: :::....:.: .: ::::::.: ::.: . :.  .:.:.:...:.: .::
CCDS47 VQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVT
            360       370       380       390       400       410  

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pF1KB4 TILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTK
       ::::.::::.::: ...:::.:::::::.:::::::: :..:.: ::.:::::::: :::
CCDS47 TILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTK
            420       430       440       450       460       470  

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pF1KB4 IWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFL
        :::::::::::.::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFL
            480       490       500       510       520       530  

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pF1KB4 DPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.  .:...::::::::::
CCDS47 DPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLW
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pF1KB4 FSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED
       :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED
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pF1KB4 LSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKG
       :.::::::::::..:::::::::::::::.::::::.::::::::::: ::. :::::::
CCDS47 LAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKG
            660       670       680       690       700       710  

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pF1KB4 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::::::
CCDS47 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGV
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pF1KB4 LDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKS
       :::::.::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS47 LDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKS
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CCDS47 RSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPC
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CCDS43    MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPP-KLL
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CCDS43 ILTTT----EEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILAN
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pF1KB4 IKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVT
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CCDS43 VQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVT
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pF1KB4 IWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFL
        :::::::::::.::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.  .:...::::::::::
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       :.::::::::::..:::::::::::::::.::::::.::::::::::: ::. :::::::
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CCDS43 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGL
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CCDS43 LDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKS
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pF1KB4 RAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI                
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CCDS43 RSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPC
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>>CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5               (916 aa)
 initn: 3551 init1: 3492 opt: 4114  Z-score: 5110.7  bits: 956.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4114; 72.9% identity (91.1% similar) in 820 aa overlap (28-847:36-850)

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CCDS58 HLFQPLQLAGGLEWPWSNLLCFLTPVKLHPEVWGLFPNQQSQEHAAFRFALSQL-TEPPK
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pF1KB4 TDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTA
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CCDS58 VDTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTA
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pF1KB4 INVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYII
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CCDS58 VNILTTT----EEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYIL
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pF1KB4 ANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTS
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CCDS58 ANLGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTS
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pF1KB4 ALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLS
       :::::.:.::.:::..::.:::.:::::::::::::::::::::..:.:::.::. :::.
CCDS58 ALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLT
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pF1KB4 GNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVV
       ::..:...:.: :::....:.: .: ::::::.: ::.: . :.  .:.:.:...:.: .
CCDS58 GNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYI
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pF1KB4 VTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDAD
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CCDS58 VTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPD
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       :: :::::::::::.::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKAWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFS
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pF1KB4 FLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.  .:...::::::::
CCDS58 FLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNS
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       :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESA
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pF1KB4 EDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKS
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CCDS58 EDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::::
CCDS58 KGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQ
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pF1KB4 GVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCY
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CCDS58 GVLDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCY
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CCDS58 KSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSI
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883 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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