Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4351
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4351, 360 aa
1>>>pF1KB4351 360 - 360 aa - 360 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1681+/-0.00146; mu= 1.2322+/- 0.082
mean_var=304.1752+/-70.251, 0's: 0 Z-trim(105.7): 647 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.073538
statistics sampled from 7802 (8566) to 7802 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 2.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 2432 272.5 3.9e-73
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 2109 238.3 8.2e-63
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 1910 217.1 1.8e-56
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 335) 1441 167.3 1.6e-41
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 1139 135.8 1.2e-31
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 1095 130.7 1.9e-30
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 1081 129.2 5.4e-30
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 1051 126.0 4.9e-29
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 985 119.0 6.3e-27
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 968 117.2 2.2e-26
CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 587) 899 110.2 4.7e-24
CCDS43247.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 422) 893 109.3 6e-24
CCDS3612.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 426) 893 109.3 6e-24
CCDS34026.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 464) 893 109.4 6.4e-24
CCDS43410.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 890 109.0 7.1e-24
CCDS4454.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 890 109.0 7.5e-24
CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 677) 886 108.9 1.3e-23
CCDS7225.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 881 108.0 1.4e-23
CCDS7224.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 881 108.1 1.5e-23
CCDS7226.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 869 106.7 3.3e-23
CCDS7223.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 869 106.8 3.5e-23
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17 ( 527) 865 106.5 5.4e-23
CCDS43409.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 858 105.6 7.4e-23
CCDS4453.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 858 105.6 7.9e-23
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 307) 845 104.1 1.7e-22
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 836 103.4 4.6e-22
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 ( 721) 773 96.9 5.6e-20
CCDS77188.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 233) 650 83.2 2.4e-16
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 648 83.2 3.6e-16
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 648 83.5 4.9e-16
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 648 83.6 5.1e-16
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 648 83.6 5.2e-16
CCDS82937.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 319) 642 82.6 5.3e-16
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 639 82.2 6.4e-16
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 635 81.8 8.5e-16
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 628 81.1 1.5e-15
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 631 81.7 1.6e-15
CCDS47356.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 242) 624 80.5 1.7e-15
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 631 81.8 1.8e-15
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 627 81.2 2.1e-15
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 623 81.0 3.6e-15
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 623 81.1 3.7e-15
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 623 81.1 3.7e-15
CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452) 623 81.4 5.3e-15
CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512) 623 81.4 5.4e-15
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 609 79.0 5.7e-15
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 616 80.3 6.1e-15
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 616 80.3 6.1e-15
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 616 80.3 6.1e-15
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 616 80.3 6.1e-15
>>CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 (360 aa)
initn: 2432 init1: 2432 opt: 2432 Z-score: 1426.6 bits: 272.5 E(32554): 3.9e-73
Smith-Waterman score: 2432; 100.0% identity (100.0% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAAAAAAGAGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAAAAAAGAGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 HQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHDH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 TGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 RIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGYRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGYRS
310 320 330 340 350 360
>>CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (379 aa)
initn: 2138 init1: 2105 opt: 2109 Z-score: 1241.1 bits: 238.3 E(32554): 8.2e-63
Smith-Waterman score: 2109; 86.5% identity (94.4% similar) in 356 aa overlap (8-357:19-374)
10 20 30 40
pF1KB4 MAAAAAAGAGP------EMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAY
:.:: :::.:: ::::::::.:.:::::::::: :::
CCDS10 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 DNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYI
:.: :.:::::::::::::::::::::::.:::::::::.::: ::.:: :.: :.::::
CCDS10 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 VQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDL
::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS10 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 KICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
:::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::: :.:: : .:::..:
CCDS10 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 SKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKL
::::::::.::::::.::: ::.:::::::::::::.:::.:: :: : :::::::::.:
CCDS10 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
310 320 330 340 350 360
350 360
pF1KB4 KELIFEETARFQPGYRS
:::::.::::::::
CCDS10 KELIFQETARFQPGVLEAP
370
>>CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (357 aa)
initn: 1934 init1: 1901 opt: 1910 Z-score: 1127.3 bits: 217.1 E(32554): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 1910; 85.6% identity (94.5% similar) in 327 aa overlap (8-328:19-344)
10 20 30 40
pF1KB4 MAAAAAAGAGP------EMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAY
:.:: :::.:: ::::::::.:.:::::::::: :::
CCDS42 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 DNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYI
:.: :.:::::::::::::::::::::::.:::::::::.::: ::.:: :.: :.::::
CCDS42 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 VQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDL
::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS42 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 KICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
:::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::: :.:: : .:::..:
CCDS42 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 SKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKL
::::::::.::::::.::: ::.:::::::::::::.:: ....:
CCDS42 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDE-VGQSPAAVGLGAGEQGGT
310 320 330 340 350
350 360
pF1KB4 KELIFEETARFQPGYRS
>>CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (335 aa)
initn: 1470 init1: 1437 opt: 1441 Z-score: 858.7 bits: 167.3 E(32554): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 1768; 76.7% identity (83.1% similar) in 356 aa overlap (8-357:19-330)
10 20 30 40
pF1KB4 MAAAAAAGAGP------EMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAY
:.:: :::.:: ::::::::.:.:::::::::: :::
CCDS42 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 DNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYI
:.: :.:::::::::::::::::::::::.:::::::::.::: ::.:: :.: :.::::
CCDS42 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 VQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDL
::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS42 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 KICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
:::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNAD
::::::::::::::::::
CCDS42 NRPIFPGKHYLDQLNHIL------------------------------------------
250
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 SKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKL
::::::.::::::.::: ::.:::::::::::::.:::.:: :: : :::::::::.:
CCDS42 --ALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
260 270 280 290 300 310
350 360
pF1KB4 KELIFEETARFQPGYRS
:::::.::::::::
CCDS42 KELIFQETARFQPGVLEAP
320 330
>>CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 (816 aa)
initn: 1043 init1: 590 opt: 1139 Z-score: 681.4 bits: 135.8 E(32554): 1.2e-31
Smith-Waterman score: 1139; 50.9% identity (76.3% similar) in 342 aa overlap (19-355:49-389)
10 20 30 40
pF1KB4 MAAAAAAGAGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNK
:::: .: . ::.::::.: :: ..
CCDS11 GPVKAEPAHTAASVAAKNLALLKARSFDVTFDVGDEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTG
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VRVAIKKI-SPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIE--QMKDVYIVQ
.:::::: . :. : .:::::.::: .:.:.:::.:.::.: ::. ..:.::.:
CCDS11 QQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILR-PTVPYGEFKSVYVVL
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 DLMETDLYKLLKT-QHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLK
::::.::...... : :. .:. :::::.::::::.:::.:.::::::::::.: .:.::
CCDS11 DLMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELK
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 ICDFGLAR-VADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
: :::.:: . .: :.:::::::::::::.::. . ::..::.::::::..:::.
CCDS11 IGDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLA
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNAD
: .::::.:. ::. :. .::.:: .. . ..: :. ::: .. :::. ..:.::
CCDS11 RRQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPVPWETVYPGAD
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 SKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKL
.::.:: .:: :.: :: . :: ::.: .:.::.::: :: : .. . : .:..
CCDS11 RQALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDREALTRERI
320 330 340 350 360 370
350 360
pF1KB4 KELIFEETARFQPGYRS
:: : : :.
CCDS11 KEAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDCAMESPPPA
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CCDS48 LDQEEMES
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CCDS14 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
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CCDS14 E------MTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQ
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.:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]