Result of FASTA (omim) for
pFN21AB3702
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3702, 1038 aa
1>>>pF1KB3702 1038 - 1038 aa - 1038 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4934+/-0.000575; mu= -2.4120+/- 0.035
mean_var=493.8265+/-109.589, 0's: 0 Z-trim(116.0): 105 B-trim: 624 in 1/54
Lambda= 0.057715
statistics sampled from 26751 (26837) to 26751 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16
Scan time: 14.930
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001195 (OMIM: 178600,265450,600799) bone morpho (1038) 6928 593.5 2e-168
XP_011509989 (OMIM: 178600,265450,600799) PREDICTE (1037) 6903 591.4 8.3e-168
NP_065434 (OMIM: 261550,600956) anti-Muellerian ho ( 573) 871 88.9 9e-17
XP_011536478 (OMIM: 261550,600956) PREDICTED: anti ( 574) 866 88.4 1.2e-16
NP_001097 (OMIM: 602730,613751) activin receptor t ( 512) 819 84.5 1.7e-15
XP_016863003 (OMIM: 602730,613751) PREDICTED: acti ( 526) 809 83.6 3.1e-15
XP_016863005 (OMIM: 602730,613751) PREDICTED: acti ( 511) 799 82.8 5.4e-15
XP_016863004 (OMIM: 602730,613751) PREDICTED: acti ( 518) 799 82.8 5.4e-15
XP_005265640 (OMIM: 602730,613751) PREDICTED: acti ( 533) 799 82.8 5.5e-15
NP_001607 (OMIM: 102581) activin receptor type-2A ( 513) 774 80.7 2.3e-14
NP_001265508 (OMIM: 102581) activin receptor type- ( 513) 774 80.7 2.3e-14
NP_001158162 (OMIM: 261550,600956) anti-Muellerian ( 478) 756 79.2 6.2e-14
XP_011536483 (OMIM: 261550,600956) PREDICTED: anti ( 481) 732 77.2 2.5e-13
XP_011536482 (OMIM: 261550,600956) PREDICTED: anti ( 482) 732 77.2 2.5e-13
XP_011536480 (OMIM: 261550,600956) PREDICTED: anti ( 520) 732 77.2 2.6e-13
XP_011536476 (OMIM: 261550,600956) PREDICTED: anti ( 592) 732 77.3 2.8e-13
XP_011536475 (OMIM: 261550,600956) PREDICTED: anti ( 593) 732 77.3 2.8e-13
NP_001265509 (OMIM: 102581) activin receptor type- ( 405) 635 69.0 6e-11
XP_011532347 (OMIM: 133239,190182,610168,614331) P ( 532) 622 68.1 1.5e-10
XP_016862595 (OMIM: 133239,190182,610168,614331) P ( 532) 622 68.1 1.5e-10
NP_003233 (OMIM: 133239,190182,610168,614331) TGF- ( 567) 622 68.1 1.6e-10
XP_011532345 (OMIM: 133239,190182,610168,614331) P ( 576) 622 68.1 1.6e-10
NP_001020018 (OMIM: 133239,190182,610168,614331) T ( 592) 622 68.1 1.6e-10
XP_011517252 (OMIM: 132800,190181) PREDICTED: TGF- ( 357) 615 67.3 1.8e-10
NP_001124388 (OMIM: 132800,190181) TGF-beta recept ( 426) 615 67.4 2e-10
XP_011517251 (OMIM: 132800,190181) PREDICTED: TGF- ( 434) 615 67.4 2e-10
XP_011517250 (OMIM: 132800,190181) PREDICTED: TGF- ( 438) 615 67.4 2e-10
XP_016870552 (OMIM: 132800,190181) PREDICTED: TGF- ( 438) 615 67.4 2e-10
NP_004603 (OMIM: 132800,190181) TGF-beta receptor ( 503) 615 67.5 2.2e-10
NP_001293139 (OMIM: 132800,190181) TGF-beta recept ( 507) 615 67.5 2.2e-10
XP_011536488 (OMIM: 261550,600956) PREDICTED: anti ( 298) 588 64.9 7.5e-10
NP_001158163 (OMIM: 261550,600956) anti-Muellerian ( 478) 587 65.1 1.1e-09
XP_011538405 (OMIM: 174900,601299,610069) PREDICTE ( 532) 587 65.2 1.1e-09
NP_004320 (OMIM: 174900,601299,610069) bone morpho ( 532) 587 65.2 1.1e-09
XP_011538406 (OMIM: 174900,601299,610069) PREDICTE ( 532) 587 65.2 1.1e-09
NP_001104502 (OMIM: 608981) activin receptor type- ( 413) 581 64.5 1.4e-09
NP_001104501 (OMIM: 608981) activin receptor type- ( 443) 581 64.6 1.4e-09
NP_660302 (OMIM: 608981) activin receptor type-1C ( 493) 581 64.6 1.5e-09
XP_005246997 (OMIM: 102576,135100) PREDICTED: acti ( 509) 528 60.2 3.3e-08
XP_011510408 (OMIM: 102576,135100) PREDICTED: acti ( 509) 528 60.2 3.3e-08
XP_005246996 (OMIM: 102576,135100) PREDICTED: acti ( 509) 528 60.2 3.3e-08
XP_011510410 (OMIM: 102576,135100) PREDICTED: acti ( 509) 528 60.2 3.3e-08
NP_001096 (OMIM: 102576,135100) activin receptor t ( 509) 528 60.2 3.3e-08
NP_001104537 (OMIM: 102576,135100) activin recepto ( 509) 528 60.2 3.3e-08
XP_011510409 (OMIM: 102576,135100) PREDICTED: acti ( 509) 528 60.2 3.3e-08
XP_006712888 (OMIM: 102576,135100) PREDICTED: acti ( 509) 528 60.2 3.3e-08
NP_064732 (OMIM: 601300) activin receptor type-1B ( 453) 522 59.7 4.4e-08
NP_004293 (OMIM: 601300) activin receptor type-1B ( 505) 522 59.7 4.7e-08
XP_011530503 (OMIM: 112600,603248,609441,616849) P ( 502) 518 59.4 5.9e-08
XP_016864050 (OMIM: 112600,603248,609441,616849) P ( 502) 518 59.4 5.9e-08
>>NP_001195 (OMIM: 178600,265450,600799) bone morphogene (1038 aa)
initn: 6928 init1: 6928 opt: 6928 Z-score: 3144.9 bits: 593.5 E(85289): 2e-168
Smith-Waterman score: 6928; 100.0% identity (100.0% similar) in 1038 aa overlap (1-1038:1-1038)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTSSLQRPWRVPWLPWTILLVSTAAASQNQERLCAFKDPYQQDLGIGESRISHENGTILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTSSLQRPWRVPWLPWTILLVSTAAASQNQERLCAFKDPYQQDLGIGESRISHENGTILC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SKGSTCYGLWEKSKGDINLVKQGCWSHIGDPQECHYEECVVTTTPPSIQNGTYRFCCCST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKGSTCYGLWEKSKGDINLVKQGCWSHIGDPQECHYEECVVTTTPPSIQNGTYRFCCCST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 DLCNVNFTENFPPPDTTPLSPPHSFNRDETIIIALASVSVLAVLIVALCFGYRMLTGDRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLCNVNFTENFPPPDTTPLSPPHSFNRDETIIIALASVSVLAVLIVALCFGYRMLTGDRK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QGLHSMNMMEAAASEPSLDLDNLKLLELIGRGRYGAVYKGSLDERPVAVKVFSFANRQNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGLHSMNMMEAAASEPSLDLDNLKLLELIGRGRYGAVYKGSLDERPVAVKVFSFANRQNF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 INEKNIYRVPLMEHDNIARFIVGDERVTADGRMEYLLVMEYYPNGSLCKYLSLHTSDWVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INEKNIYRVPLMEHDNIARFIVGDERVTADGRMEYLLVMEYYPNGSLCKYLSLHTSDWVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SCRLAHSVTRGLAYLHTELPRGDHYKPAISHRDLNSRNVLVKNDGTCVISDFGLSMRLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCRLAHSVTRGLAYLHTELPRGDHYKPAISHRDLNSRNVLVKNDGTCVISDFGLSMRLTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NRLVRPGEEDNAAISEVGTIRYMAPEVLEGAVNLRDCESALKQVDMYALGLIYWEIFMRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NRLVRPGEEDNAAISEVGTIRYMAPEVLEGAVNLRDCESALKQVDMYALGLIYWEIFMRC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TDLFPGESVPEYQMAFQTEVGNHPTFEDMQVLVSREKQRPKFPEAWKENSLAVRSLKETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDLFPGESVPEYQMAFQTEVGNHPTFEDMQVLVSREKQRPKFPEAWKENSLAVRSLKETI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 EDCWDQDAEARLTAQCAEERMAELMMIWERNKSVSPTVNPMSTAMQNERNLSHNRRVPKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDCWDQDAEARLTAQCAEERMAELMMIWERNKSVSPTVNPMSTAMQNERNLSHNRRVPKI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GPYPDYSSSSYIEDSIHHTDSIVKNISSEHSMSSTPLTIGEKNRNSINYERQQAQARIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPYPDYSSSSYIEDSIHHTDSIVKNISSEHSMSSTPLTIGEKNRNSINYERQQAQARIPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 PETSVTSLSTNTTTTNTTGLTPSTGMTTISEMPYPDETNLHTTNVAQSIGPTPVCLQLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PETSVTSLSTNTTTTNTTGLTPSTGMTTISEMPYPDETNLHTTNVAQSIGPTPVCLQLTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 EDLETNKLDPKEVDKNLKESSDENLMEHSLKQFSGPDPLSSTSSSLLYPLIKLAVEATGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDLETNKLDPKEVDKNLKESSDENLMEHSLKQFSGPDPLSSTSSSLLYPLIKLAVEATGQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 QDFTQTANGQACLIPDVLPTQIYPLPKQQNLPKRPTSLPLNTKNSTKEPRLKFGSKHKSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDFTQTANGQACLIPDVLPTQIYPLPKQQNLPKRPTSLPLNTKNSTKEPRLKFGSKHKSN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 LKQVETGVAKMNTINAAEPHVVTVTMNGVAGRNHSVNSHAATTQYANGTVLSGQTTNIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKQVETGVAKMNTINAAEPHVVTVTMNGVAGRNHSVNSHAATTQYANGTVLSGQTTNIVT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 HRAQEMLQNQFIGEDTRLNINSSPDEHEPLLRREQQAGHDEGVLDRLVDRRERPLEGGRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRAQEMLQNQFIGEDTRLNINSSPDEHEPLLRREQQAGHDEGVLDRLVDRRERPLEGGRT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 NSNNNNSNPCSEQDVLAQGVPSTAADPGPSKPRRAQRPNSLDLSATNVLDGSSIQIGEST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSNNNNSNPCSEQDVLAQGVPSTAADPGPSKPRRAQRPNSLDLSATNVLDGSSIQIGEST
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 QDGKSGSGEKIKKRVKTPYSLKRWRPSTWVISTESLDCEVNNNGSNRAVHSKSSTAVYLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDGKSGSGEKIKKRVKTPYSLKRWRPSTWVISTESLDCEVNNNGSNRAVHSKSSTAVYLA
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KB3 EGGTATTMVSKDIGMNCL
::::::::::::::::::
NP_001 EGGTATTMVSKDIGMNCL
1030
>>XP_011509989 (OMIM: 178600,265450,600799) PREDICTED: b (1037 aa)
initn: 6901 init1: 6386 opt: 6903 Z-score: 3133.7 bits: 591.4 E(85289): 8.3e-168
Smith-Waterman score: 6903; 99.8% identity (99.9% similar) in 1038 aa overlap (1-1038:1-1037)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTSSLQRPWRVPWLPWTILLVSTAAASQNQERLCAFKDPYQQDLGIGESRISHENGTILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTSSLQRPWRVPWLPWTILLVSTAAASQNQERLCAFKDPYQQDLGIGESRISHENGTILC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SKGSTCYGLWEKSKGDINLVKQGCWSHIGDPQECHYEECVVTTTPPSIQNGTYRFCCCST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKGSTCYGLWEKSKGDINLVKQGCWSHIGDPQECHYEECVVTTTPPSIQNGTYRFCCCST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 DLCNVNFTENFPPPDTTPLSPPHSFNRDETIIIALASVSVLAVLIVALCFGYRMLTGDRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLCNVNFTENFPPPDTTPLSPPHSFNRDETIIIALASVSVLAVLIVALCFGYRMLTGDRK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QGLHSMNMMEAAASEPSLDLDNLKLLELIGRGRYGAVYKGSLDERPVAVKVFSFANRQNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QGLHSMNMMEAAASEPSLDLDNLKLLELIGRGRYGAVYKGSLDERPVAVKVFSFANRQNF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 INEKNIYRVPLMEHDNIARFIVGDERVTADGRMEYLLVMEYYPNGSLCKYLSLHTSDWVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 INEKNIYRVPLMEHDNIARFIVGDERVTADGRMEYLLVMEYYPNGSLCKYLSLHTSDWVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SCRLAHSVTRGLAYLHTELPRGDHYKPAISHRDLNSRNVLVKNDGTCVISDFGLSMRLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SCRLAHSVTRGLAYLHTELPRGDHYKPAISHRDLNSRNVLVKNDGTCVISDFGLSMRLTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 NRLVRPGEEDNAAISEVGTIRYMAPEVLEGAVNLRDCESALKQVDMYALGLIYWEIFMRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NRLVRPGEEDNAAISEVGTIRYMAPEVLEGAVNLRDCESALKQVDMYALGLIYWEIFMRC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TDLFPGESVPEYQMAFQTEVGNHPTFEDMQVLVSREKQRPKFPEAWKENSLAVRSLKETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TDLFPGESVPEYQMAFQTEVGNHPTFEDMQVLVSREKQRPKFPEAWKENSLAVRSLKETI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 EDCWDQDAEARLTAQCAEERMAELMMIWERNKSVSPTVNPMSTAMQNERNLSHNRRVPKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDCWDQDAEARLTAQCAEERMAELMMIWERNKSVSPTVNPMSTAMQNERNLSHNRRVPKI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GPYPDYSSSSYIEDSIHHTDSIVKNISSEHSMSSTPLTIGEKNRNSINYERQQAQARIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPYPDYSSSSYIEDSIHHTDSIVKNISSEHSMSSTPLTIGEKNRNSINYERQQAQARIPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 PETSVTSLSTNTTTTNTTGLTPSTGMTTISEMPYPDETNLHTTNVAQSIGPTPVCLQLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PETSVTSLSTNTTTTNTTGLTPSTGMTTISEMPYPDETNLHTTNVAQSIGPTPVCLQLTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 EDLETNKLDPKEVDKNLKESSDENLMEHSLKQFSGPDPLSSTSSSLLYPLIKLAVEATGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDLETNKLDPKEVDKNLKESSDENLMEHSLKQFSGPDPLSSTSSSLLYPLIKLAVEATGQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 QDFTQTANGQACLIPDVLPTQIYPLPKQQNLPKRPTSLPLNTKNSTKEPRLKFGSKHKSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDFTQTANGQACLIPDVLPTQIYPLPKQQNLPKRPTSLPLNTKNSTKEPRLKFGSKHKSN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 LKQVETGVAKMNTINAAEPHVVTVTMNGVAGRNHSVNSHAATTQYANGTVLSGQTTNIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKQVETGVAKMNTINAAEPHVVTVTMNGVAGRNHSVNSHAATTQYANGTVLSGQTTNIVT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 HRAQEMLQNQFIGEDTRLNINSSPDEHEPLLRREQQAGHDEGVLDRLVDRRERPLEGGRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HRAQEMLQNQFIGEDTRLNINSSPDEHEPLLRREQQAGHDEGVLDRLVDRRERPLEGGRT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 NSNNNNSNPCSEQDVLAQGVPSTAADPGPSKPRRAQRPNSLDLSATNVLDGSSIQIGEST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::
XP_011 NSNNNNSNPCSEQDVLAQGVPSTAADPGPSKPRRAQRPNSLDLSATNVLDGSSIQ-SEST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 EGGTATTMVSKDIGMNCL
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: :.::.::.:.. ..::: . :: : . :.: .::. .... .:.. :
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: .. ... . : .. . :..:..: : ..: .: ...:. :.:. . :
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:.:.: . .: :. .:..: ..::.:.:::.... . ::. :::.: .:.:
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: .: .:. . .:.: .::::: : ::::::.:...:.: :
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:: .: .:. . .:.: .::::: : ::::::.:...:.: :
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..::::..:. .::. . . ..::: :::::::::::.:.. ..:. ..::::
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.::. ::. :: : : ::.. :. :.:.::..:..: .: ..:.:: . . : :
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. .:: .: :::.:::.::::::.: :.:::.. .. : ..: . . :.. :
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510
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. ::::.: . ..:.. .:..:. .: :.:.:. .::....: .. ..: :. ..
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.::: ::. . : :..:....:::.::: ..: ::. .::.:.:::..:.:::
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XP_016 VLEGAINFQRD---AFLRIDMYAMGLVLWELVSRCKA--ADGPVDEYMLPFEEEIGQHPS
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XP_016 LIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPPKESSI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]