Result of FASTA (omim) for pFN21AB3681
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3681, 895 aa
  1>>>pF1KB3681 895 - 895 aa - 895 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.0851+/-0.000473; mu= -28.7847+/- 0.029
 mean_var=741.0640+/-153.102, 0's: 0 Z-trim(125.1): 41  B-trim: 0 in 0/62
 Lambda= 0.047114
 statistics sampled from 47959 (48007) to 47959 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.821), E-opt: 0.2 (0.563), width:  16
 Scan time: 17.450

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004454 (OMIM: 300546,305400) FYVE, RhoGEF and P ( 961) 3209 233.9 2.8e-60
XP_016865918 (OMIM: 605091) PREDICTED: FYVE, RhoGE ( 662) 1418 112.1 9.2e-24
NP_775829 (OMIM: 605091) FYVE, RhoGEF and PH domai ( 655) 1361 108.2 1.3e-22
NP_001291412 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 471) 1227 99.0 5.8e-20
XP_011518861 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 511) 1227 99.0 6.1e-20
XP_005253367 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 518) 1227 99.0 6.2e-20
XP_011518860 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 567) 1227 99.0 6.6e-20
XP_011518859 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 582) 1227 99.0 6.8e-20
XP_016874294 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 582) 1227 99.0 6.8e-20
XP_005253366 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 673) 1227 99.1 7.6e-20
NP_001317302 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 673) 1227 99.1 7.6e-20
XP_005253365 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 673) 1227 99.1 7.6e-20
NP_001317303 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 673) 1227 99.1 7.6e-20
XP_011518857 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 766) 1227 99.1 8.3e-20
XP_011518858 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 766) 1227 99.1 8.3e-20
NP_640334 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF and P ( 766) 1227 99.1 8.3e-20
NP_001291410 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 851) 1227 99.2   9e-20
XP_011518856 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 864) 1227 99.2 9.1e-20
NP_001291409 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 878) 1227 99.2 9.3e-20
XP_016874292 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 914) 1227 99.2 9.5e-20
XP_005253361 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 930) 1227 99.2 9.7e-20
NP_001291413 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 422) 1125 92.0 6.5e-18
NP_060821 (OMIM: 613520) FYVE, RhoGEF and PH domai (1430)  627 58.6 2.5e-07
XP_011512675 (OMIM: 605091) PREDICTED: FYVE, RhoGE ( 398)  599 56.2 3.6e-07
XP_011512674 (OMIM: 605091) PREDICTED: FYVE, RhoGE ( 401)  467 47.3 0.00018


>>NP_004454 (OMIM: 300546,305400) FYVE, RhoGEF and PH do  (961 aa)
 initn: 3170 init1: 3170 opt: 3209  Z-score: 1203.3  bits: 233.9 E(85289): 2.8e-60
Smith-Waterman score: 5777; 92.9% identity (92.9% similar) in 927 aa overlap (35-895:35-961)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB3 RAPGGAGPSEPEHPATNPPGAAPPACADSDPGASEPGLLARRGSGSALGGPLDPQFVGPS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RAPGGAGPSEPEHPATNPPGAAPPACADSDPGASEPGLLARRGSGSALGGPLDPQFVGPS
           10        20        30        40        50        60    

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB3 DTSLGAAPGHRVLPCGPSPQHHRALRFSYHLEGSQPRPGLHQGNRILVKSLSLDPGQSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DTSLGAAPGHRVLPCGPSPQHHRALRFSYHLEGSQPRPGLHQGNRILVKSLSLDPGQSLE
           70        80        90       100       110       120    

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB3 PHPEGPQRLRSDPGPPTETPSQRPSPLKRAPGPKPQVPPKPSYLQMPRMPPPLEPIPPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PHPEGPQRLRSDPGPPTETPSQRPSPLKRAPGPKPQVPPKPSYLQMPRMPPPLEPIPPPP
          130       140       150       160       170       180    

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB3 SRPLPADPRVAKGLAPRAEASPSSAAVSSLIEKFEREPVIVASDRPVPGPSPGPPEPVML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SRPLPADPRVAKGLAPRAEASPSSAAVSSLIEKFEREPVIVASDRPVPGPSPGPPEPVML
          190       200       210       220       230       240    

          250       260       270       280       290       300    
pF1KB3 PQPTSQPPVPQLPEGEASRCLFLLAPGPRDGEKVPNRDSGIDSISSPSNSEETCFVSDDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PQPTSQPPVPQLPEGEASRCLFLLAPGPRDGEKVPNRDSGIDSISSPSNSEETCFVSDDG
          250       260       270       280       290       300    

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB3 PPSHSLCPGPPALASVPVALADPHRPGSQEVDSDLEEEDDEEEEEEKDREIPVPLMERQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PPSHSLCPGPPALASVPVALADPHRPGSQEVDSDLEEEDDEEEEEEKDREIPVPLMERQE
          310       320       330       340       350       360    

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB3 SVELTVQQKVFHIANELLQTEKAYVSRLHLLDQVFCARLLEEARNRSSFPADVVHGIFSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SVELTVQQKVFHIANELLQTEKAYVSRLHLLDQVFCARLLEEARNRSSFPADVVHGIFSN
          370       380       390       400       410       420    

                                                                   
pF1KB3 ICSI--------------------------------------------------------
       ::::                                                        
NP_004 ICSIYCFHQQFLLPELEKRMEEWDRYPRIGDILQKLAPFLKMYGEYVKNFDRAVELVNTW
          430       440       450       460       470       480    

                430       440       450       460       470        
pF1KB3 ----------IHEVQKEEACGNLTLQHHMLEPVQRIPRYELLLKDYLLKLPHGSPDSKDA
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TERSTQFKVIIHEVQKEEACGNLTLQHHMLEPVQRIPRYELLLKDYLLKLPHGSPDSKDA
          490       500       510       520       530       540    

      480       490       500       510       520       530        
pF1KB3 QKSLELIATAAEHSNAAIRKMERMHKLLKVYELLGGEEDIVSPTKELIKEGHILKLSAKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QKSLELIATAAEHSNAAIRKMERMHKLLKVYELLGGEEDIVSPTKELIKEGHILKLSAKN
          550       560       570       580       590       600    

      540       550       560       570       580       590        
pF1KB3 GTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFSVRARIDVDGMELKESSNLNLPRTFLVSGKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFSVRARIDVDGMELKESSNLNLPRTFLVSGKQ
          610       620       630       640       650       660    

      600       610       620       630       640       650        
pF1KB3 RSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETFKLLNSTNREDEDTPPNSPNVDLGKRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETFKLLNSTNREDEDTPPNSPNVDLGKRA
          670       680       690       700       710       720    

      660       670       680       690       700       710        
pF1KB3 PTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCKACGHVVCGKCSEFRARLVYDNNRSNRVCTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCKACGHVVCGKCSEFRARLVYDNNRSNRVCTD
          730       740       750       760       770       780    

      720       730       740       750       760       770        
pF1KB3 CYVALHGVPGSSPACSQHTPQRRRSILEKQASVAAENSVICSFLHYMEKGGKGWHKAWFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CYVALHGVPGSSPACSQHTPQRRRSILEKQASVAAENSVICSFLHYMEKGGKGWHKAWFV
          790       800       810       820       830       840    

      780       790       800       810       820       830        
pF1KB3 VPENEPLVLYIYGAPQDVKAQRSLPLIGFEVGPPEAGERPDRRHVFKITQSHLSWYFSPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VPENEPLVLYIYGAPQDVKAQRSLPLIGFEVGPPEAGERPDRRHVFKITQSHLSWYFSPE
          850       860       870       880       890       900    

      840       850       860       870       880       890     
pF1KB3 TEELQRRWMAVLGRAGRGDTFCPGPTLSEDREMEEAPVAALGATAEPPESPQTRDKT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TEELQRRWMAVLGRAGRGDTFCPGPTLSEDREMEEAPVAALGATAEPPESPQTRDKT
          910       920       930       940       950       960 

>>XP_016865918 (OMIM: 605091) PREDICTED: FYVE, RhoGEF an  (662 aa)
 initn: 1305 init1: 769 opt: 1418  Z-score: 547.6  bits: 112.1 E(85289): 9.2e-24
Smith-Waterman score: 1489; 42.2% identity (66.1% similar) in 626 aa overlap (305-856:45-649)

          280       290       300       310       320       330    
pF1KB3 GEKVPNRDSGIDSISSPSNSEETCFVSDDGPPSHSLCPGPPALASVPVALADPHRPGSQE
                                     ::     :::   ..:  :...  :  :..
XP_016 LVTVFENSRTPEAAPRGQRLEDVHHRPECRPPES---PGPREKTNVGEAVGSEPRTVSRR
           20        30        40           50        60        70 

          340       350       360       370       380       390    
pF1KB3 VDSDLEEEDDEEEEEEKDREIPVPLMERQESVELTVQQKVFHIANELLQTEKAYVSRLHL
         ..:... . :  ... . . .     ::  .  ::        :::.::.:::.::::
XP_016 YLNSLKNKLSSEAWRKSCQPVTLSGSGTQEPEKKIVQ--------ELLETEQAYVARLHL
              80        90       100               110       120   

          400       410       420       430                        
pF1KB3 LDQVFCARLLEEARNRSSFPADVVHGIFSNICSIIH------------------------
       :::::  .::. ::. ..:: :::. ::::: :: .                        
XP_016 LDQVFFQELLKTARSSKAFPEDVVRVIFSNISSIYQFHSQFFLPELQRRLDDWTANPRIG
           130       140       150       160       170       180   

                                                        440        
pF1KB3 ------------------------------------------EVQKEEACGNLTLQHHML
                                                 ..:. :: :.::::::::
XP_016 DVIQKLAPFLKMYSEYVKNFERAAELLATWTDKSPLFQEVLTRIQSSEASGSLTLQHHML
           190       200       210       220       230       240   

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB3 EPVQRIPRYELLLKDYLLKLPHGSPDSKDAQKSLELIATAAEHSNAAIRKMERMHKLLKV
       ::::::::::::::.:. :::  .::. ::::.:..: .::.:::::: .:::.. : .:
XP_016 EPVQRIPRYELLLKEYIQKLPAQAPDQADAQKALDMIFSAAQHSNAAITEMERLQDLWEV
           250       260       270       280       290       300   

      510       520       530       540       550       560        
pF1KB3 YELLGGEEDIVSPTKELIKEGHILKLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFS
       :. :: :.:::.:.. :..:: .::.: . .  ..:::.:::. :::::::.  .: .:.
XP_016 YQRLGLEDDIVDPSNTLLREGPVLKISFRRNDPMERYLFLFNNMLLYCVPRVIQVGAQFQ
           310       320       330       340       350       360   

      570       580       590       600       610       620        
pF1KB3 VRARIDVDGMELKESSNLNLPRTFLVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQT
       ::.:::: ::...:  . ..:..::::::::.::::::..::  .:.::..... . :. 
XP_016 VRTRIDVAGMKVRELMDAEFPHSFLVSGKQRTLELQARSQEEMISWMQAFQAAIDQIEKR
           370       380       390       400       410       420   

      630       640       650       660       670       680        
pF1KB3 LETFKLLNSTNREDEDTPPNSPNVDLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCK
        ::::   . . : .    .  . .:: :::  .:.: ::::::::::::..:.:::::.
XP_016 NETFKA-AAQGPEGDIQEQELQSEELGLRAPQWVRDKMVTMCMRCQEPFNALTRRRHHCR
            430       440       450       460       470       480  

      690              700       710       720       730       740 
pF1KB3 ACGH-------VVCGKCSEFRARLVYDNNRSNRVCTDCYVALHGVPGSSPACSQHTPQRR
       :::.       :::..::..::.: ::.:: ::::  ::. : :  .  :  ..   ..:
XP_016 ACGYIFVPAEPVVCARCSDYRAELKYDDNRPNRVCLHCYAFLTG--NVLPEAKE---DKR
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pF1KB3 RSILEKQASVAAENSVICSFLHYM-EKGGKGWHKAWFVVPENEPLVLYIYGAPQDVKAQR
       :.:::: .:.. ..:..::::. . .: ::.  ..: :.:...:::::.:.::::..:. 
XP_016 RGILEKGSSATPDQSLMCSFLQLIGDKWGKSGPRGWCVIPRDDPLVLYVYAAPQDMRAHT
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pF1KB3 SLPLIGFEVGPPEAGERPDRRHVFKITQSHLSWYFSPETEELQRRWMAVLGRAGRGDTFC
       :.::.:..:    .: . : : ::.. ::   . :. :::::. ::. .. ::. :    
XP_016 SIPLLGYQV---TVGPQGDPR-VFQLQQSGQLYTFKAETEELKGRWVKAMERAASGWSPS
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pF1KB3 PGPTLSEDREMEEAPVAALGATAEPPESPQTRDKT
                                          
XP_016 WPNDGDLSD                          
           660                            

>>NP_775829 (OMIM: 605091) FYVE, RhoGEF and PH domain-co  (655 aa)
 initn: 1455 init1: 769 opt: 1361  Z-score: 526.7  bits: 108.2 E(85289): 1.3e-22
Smith-Waterman score: 1513; 42.6% identity (66.9% similar) in 619 aa overlap (305-856:45-642)

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pF1KB3 GEKVPNRDSGIDSISSPSNSEETCFVSDDGPPSHSLCPGPPALASVPVALADPHRPGSQE
                                     ::     :::   ..:  :...  :  :..
NP_775 LVTVFENSRTPEAAPRGQRLEDVHHRPECRPPES---PGPREKTNVGEAVGSEPRTVSRR
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pF1KB3 VDSDLEEEDDEEEEEEKDREIPVPLMERQESVELTVQQKVFHIANELLQTEKAYVSRLHL
         ..:... . :  ... . . .     ::  .  ::        :::.::.:::.::::
NP_775 YLNSLKNKLSSEAWRKSCQPVTLSGSGTQEPEKKIVQ--------ELLETEQAYVARLHL
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pF1KB3 LDQVFCARLLEEARNRSSFPADVVHGIFSNICSIIH------------------------
       :::::  .::. ::. ..:: :::. ::::: :: .                        
NP_775 LDQVFFQELLKTARSSKAFPEDVVRVIFSNISSIYQFHSQFFLPELQRRLDDWTANPRIG
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pF1KB3 ------------------------------------------EVQKEEACGNLTLQHHML
                                                 ..:. :: :.::::::::
NP_775 DVIQKLAPFLKMYSEYVKNFERAAELLATWTDKSPLFQEVLTRIQSSEASGSLTLQHHML
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pF1KB3 EPVQRIPRYELLLKDYLLKLPHGSPDSKDAQKSLELIATAAEHSNAAIRKMERMHKLLKV
       ::::::::::::::.:. :::  .::. ::::.:..: .::.:::::: .:::.. : .:
NP_775 EPVQRIPRYELLLKEYIQKLPAQAPDQADAQKALDMIFSAAQHSNAAITEMERLQDLWEV
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pF1KB3 YELLGGEEDIVSPTKELIKEGHILKLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFS
       :. :: :.:::.:.. :..:: .::.: . .  ..:::.:::. :::::::.  .: .:.
NP_775 YQRLGLEDDIVDPSNTLLREGPVLKISFRRNDPMERYLFLFNNMLLYCVPRVIQVGAQFQ
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pF1KB3 VRARIDVDGMELKESSNLNLPRTFLVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQT
       ::.:::: ::...:  . ..:..::::::::.::::::..::  .:.::..... . :. 
NP_775 VRTRIDVAGMKVRELMDAEFPHSFLVSGKQRTLELQARSQEEMISWMQAFQAAIDQIEKR
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pF1KB3 LETFKLLNSTNREDEDTPPNSPNVDLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCK
        ::::   . . : .    .  . .:: :::  .:.: ::::::::::::..:.:::::.
NP_775 NETFKA-AAQGPEGDIQEQELQSEELGLRAPQWVRDKMVTMCMRCQEPFNALTRRRHHCR
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pF1KB3 ACGHVVCGKCSEFRARLVYDNNRSNRVCTDCYVALHGVPGSSPACSQHTPQRRRSILEKQ
       :::.:::..::..::.: ::.:: ::::  ::. : :  .  :  ..   ..::.:::: 
NP_775 ACGYVVCARCSDYRAELKYDDNRPNRVCLHCYAFLTG--NVLPEAKE---DKRRGILEKG
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pF1KB3 ASVAAENSVICSFLHYM-EKGGKGWHKAWFVVPENEPLVLYIYGAPQDVKAQRSLPLIGF
       .:.. ..:..::::. . .: ::.  ..: :.:...:::::.:.::::..:. :.::.:.
NP_775 SSATPDQSLMCSFLQLIGDKWGKSGPRGWCVIPRDDPLVLYVYAAPQDMRAHTSIPLLGY
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pF1KB3 EVGPPEAGERPDRRHVFKITQSHLSWYFSPETEELQRRWMAVLGRAGRGDTFCPGPTLSE
       .:    .: . : : ::.. ::   . :. :::::. ::. .. ::. :           
NP_775 QV---TVGPQGDPR-VFQLQQSGQLYTFKAETEELKGRWVKAMERAASGWSPSWPNDGDL
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pF1KB3 DREMEEAPVAALGATAEPPESPQTRDKT
                                   
NP_775 SD                          
                                   

>>NP_001291412 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF and PH  (471 aa)
 initn: 1444 init1: 845 opt: 1227  Z-score: 479.4  bits: 99.0 E(85289): 5.8e-20
Smith-Waterman score: 1437; 55.2% identity (82.4% similar) in 375 aa overlap (427-801:77-440)

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pF1KB3 QVFCARLLEEARNRSSFPADVVHGIFSNICSIIHEVQKEEACGNLTLQHHMLEPVQRIPR
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NP_001 FLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEIQKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPR
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pF1KB3 YELLLKDYLLKLPHGSPDSKDAQKSLELIATAAEHSNAAIRKMERMHKLLKVYELLGGEE
       ::.:::::: :::  : : .::.::::.:.::: :::.:::::: ..:::..::.:: ::
NP_001 YEMLLKDYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHSNSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEE
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pF1KB3 DIVSPTKELIKEGHILKLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFSVRARIDVD
       :::.:..::::::.::::.:.: ..:.:::.:::. ::::::.. :.:.::.::.:. .:
NP_001 DIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGID
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pF1KB3 GMELKESSNLNLPRTFLVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETFKLLN
       ::.. :..: . :.:: ::::.:.::::: . ..:..:..:.. :.   .:  :::.  :
NP_001 GMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETFR--N
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pF1KB3 STNREDEDTPPNSPNVDLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCKACGHVVCG
       .  . :.:   .  ...::::::  ::..::::::.:.::::..:.:::::.:::.::: 
NP_001 AIAK-DNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKEPFNALTRRRHHCRACGYVVCW
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pF1KB3 KCSEFRARLVYDNNRSNRVCTDCYVALHGVPGSSPACSQHTPQRRRSILEKQASVAAENS
       :::...:.: ::... ..:: :::  . :   :         ..:..::: ... .. ::
NP_001 KCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEE-------KKRKGILEIESAEVSGNS
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pF1KB3 VICSFLHYMEKGGKGWHKAWFVVPENEPLVLYIYGAPQDVKAQRSLPLIGFEVGPPEAGE
       :.::::.::::. : :.::: :.:...:::::.:::::  : . :               
NP_001 VVCSFLQYMEKS-KPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQVSKPHLSEGTDALGGKGKRVDS
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pF1KB3 RPDRRHVFKITQSHLSWYFSPETEELQRRWMAVLGRAGRGDTFCPGPTLSEDREMEEAPV
                                                                   
NP_001 GLKICRTRVQAVSLFH                                            
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>>XP_011518861 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE, Rh  (511 aa)
 initn: 1546 init1: 868 opt: 1227  Z-score: 478.9  bits: 99.0 E(85289): 6.1e-20
Smith-Waterman score: 1591; 51.8% identity (79.6% similar) in 450 aa overlap (427-875:70-503)

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pF1KB3 QVFCARLLEEARNRSSFPADVVHGIFSNICSIIHEVQKEEACGNLTLQHHMLEPVQRIPR
                                     :...:.::.. ::.::::::::::::::::
XP_011 FLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEIQKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPR
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pF1KB3 YELLLKDYLLKLPHGSPDSKDAQKSLELIATAAEHSNAAIRKMERMHKLLKVYELLGGEE
       ::.:::::: :::  : : .::.::::.:.::: :::.:::::: ..:::..::.:: ::
XP_011 YEMLLKDYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHSNSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEE
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pF1KB3 DIVSPTKELIKEGHILKLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFSVRARIDVD
       :::.:..::::::.::::.:.: ..:.:::.:::. ::::::.. :.:.::.::.:. .:
XP_011 DIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGID
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pF1KB3 GMELKESSNLNLPRTFLVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETFKLLN
       ::.. :..: . :.:: ::::.:.::::: . ..:..:..:.. :.   .:  :::.  :
XP_011 GMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETFR--N
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pF1KB3 STNREDEDTPPNSPNVDLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCKACGHVVCG
       .  . :.:   .  ...::::::  ::..::::::.:.::::..:.:::::.:::.::: 
XP_011 AIAK-DNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKEPFNALTRRRHHCRACGYVVCW
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pF1KB3 KCSEFRARLVYDNNRSNRVCTDCYVALHGVPGSSPACSQHTPQRRRSILEKQASVAAENS
       :::...:.: ::... ..:: :::  . :   :         ..:..::: ... .. ::
XP_011 KCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEE-------KKRKGILEIESAEVSGNS
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pF1KB3 VICSFLHYMEKGGKGWHKAWFVVPENEPLVLYIYGAPQDVKAQRSLPLIGFEVGP-PEAG
       :.::::.::::. : :.::: :.:...:::::.:::::::.:: ..::.:. :   :...
XP_011 VVCSFLQYMEKS-KPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIPLLGYVVDEMPRSA
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pF1KB3 ERPDRRHVFKITQSHLSWYFSPETEELQRRWMAVLGRAGRGDTFCPGPTLSEDREMEEAP
       . :   : ::.:::.    :. ..:::...:. :.  :  :.:  ::    .   ... :
XP_011 DLP---HSFKLTQSKSVHSFAADSEELKQKWLKVILLAVTGET--PGGPNEHPATLDDHP
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         880       890     
pF1KB3 VAALGATAEPPESPQTRDKT
                           
XP_011 EPKKKSEC            
           510             

>>XP_005253367 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE, Rh  (518 aa)
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Smith-Waterman score: 1591; 51.8% identity (79.6% similar) in 450 aa overlap (427-875:77-510)

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                                     :...:.::.. ::.::::::::::::::::
XP_005 FLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEIQKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPR
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pF1KB3 YELLLKDYLLKLPHGSPDSKDAQKSLELIATAAEHSNAAIRKMERMHKLLKVYELLGGEE
       ::.:::::: :::  : : .::.::::.:.::: :::.:::::: ..:::..::.:: ::
XP_005 YEMLLKDYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHSNSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEE
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pF1KB3 DIVSPTKELIKEGHILKLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFSVRARIDVD
       :::.:..::::::.::::.:.: ..:.:::.:::. ::::::.. :.:.::.::.:. .:
XP_005 DIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGID
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pF1KB3 GMELKESSNLNLPRTFLVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETFKLLN
       ::.. :..: . :.:: ::::.:.::::: . ..:..:..:.. :.   .:  :::.  :
XP_005 GMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETFR--N
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pF1KB3 STNREDEDTPPNSPNVDLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCKACGHVVCG
       .  . :.:   .  ...::::::  ::..::::::.:.::::..:.:::::.:::.::: 
XP_005 AIAK-DNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKEPFNALTRRRHHCRACGYVVCW
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pF1KB3 KCSEFRARLVYDNNRSNRVCTDCYVALHGVPGSSPACSQHTPQRRRSILEKQASVAAENS
       :::...:.: ::... ..:: :::  . :   :         ..:..::: ... .. ::
XP_005 KCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEE-------KKRKGILEIESAEVSGNS
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pF1KB3 VICSFLHYMEKGGKGWHKAWFVVPENEPLVLYIYGAPQDVKAQRSLPLIGFEVGP-PEAG
       :.::::.::::. : :.::: :.:...:::::.:::::::.:: ..::.:. :   :...
XP_005 VVCSFLQYMEKS-KPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIPLLGYVVDEMPRSA
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pF1KB3 ERPDRRHVFKITQSHLSWYFSPETEELQRRWMAVLGRAGRGDTFCPGPTLSEDREMEEAP
       . :   : ::.:::.    :. ..:::...:. :.  :  :.:  ::    .   ... :
XP_005 DLP---HSFKLTQSKSVHSFAADSEELKQKWLKVILLAVTGET--PGGPNEHPATLDDHP
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pF1KB3 VAALGATAEPPESPQTRDKT
                           
XP_005 EPKKKSEC            
                           

>>XP_011518860 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE, Rh  (567 aa)
 initn: 1688 init1: 868 opt: 1227  Z-score: 478.3  bits: 99.0 E(85289): 6.6e-20
Smith-Waterman score: 1672; 47.6% identity (70.9% similar) in 574 aa overlap (369-875:3-559)

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XP_011                             METNEQKLHKIANELLLTERAYVNRLDLLDQV
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pF1KB3 FCARLLEEARNRSSFPADVVHGIFSNICSI------------------------------
       :  .::::: ::.::::..:. ::::: ::                              
XP_011 FYCKLLEEA-NRGSFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLPELEKRMQEWETTPRIGDILQ
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pF1KB3 ------------------------------------IHEVQKEEACGNLTLQHHMLEPVQ
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XP_011 KLAPFLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEIQKQKICGSLTLQHHMLEPVQ
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pF1KB3 RIPRYELLLKDYLLKLPHGSPDSKDAQKSLELIATAAEHSNAAIRKMERMHKLLKVYELL
       ::::::.:::::: :::  : : .::.::::.:.::: :::.:::::: ..:::..::.:
XP_011 RIPRYEMLLKDYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHSNSAIRKMENLKKLLEIYEML
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pF1KB3 GGEEDIVSPTKELIKEGHILKLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFSVRAR
       : :::::.:..::::::.::::.:.: ..:.:::.:::. ::::::.. :.:.::.::.:
XP_011 GEEEDIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTR
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pF1KB3 IDVDGMELKESSNLNLPRTFLVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETF
       . .:::.. :..: . :.:: ::::.:.::::: . ..:..:..:.. :.   .:  :::
XP_011 VGIDGMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETF
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pF1KB3 KLLNSTNREDEDTPPNSPNVDLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCKACGH
       .  :.  . :.:   .  ...::::::  ::..::::::.:.::::..:.:::::.:::.
XP_011 R--NAIAK-DNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKEPFNALTRRRHHCRACGY
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pF1KB3 VVCGKCSEFRARLVYDNNRSNRVCTDCYVALHGVPGSSPACSQHTPQRRRSILEKQASVA
       ::: :::...:.: ::... ..:: :::  . :   :         ..:..::: ... .
XP_011 VVCWKCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEE-------KKRKGILEIESAEV
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pF1KB3 AENSVICSFLHYMEKGGKGWHKAWFVVPENEPLVLYIYGAPQDVKAQRSLPLIGFEVGP-
       . :::.::::.::::. : :.::: :.:...:::::.:::::::.:: ..::.:. :   
XP_011 SGNSVVCSFLQYMEKS-KPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIPLLGYVVDEM
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pF1KB3 PEAGERPDRRHVFKITQSHLSWYFSPETEELQRRWMAVLGRAGRGDTFCPGPTLSEDREM
       :.... :   : ::.:::.    :. ..:::...:. :.  :  :.:  ::    .   .
XP_011 PRSADLP---HSFKLTQSKSVHSFAADSEELKQKWLKVILLAVTGET--PGGPNEHPATL
                 510       520       530       540         550     

             880       890     
pF1KB3 EEAPVAALGATAEPPESPQTRDKT
       .. :                    
XP_011 DDHPEPKKKSEC            
         560                   

>>XP_011518859 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE, Rh  (582 aa)
 initn: 1688 init1: 868 opt: 1227  Z-score: 478.2  bits: 99.0 E(85289): 6.8e-20
Smith-Waterman score: 1673; 47.3% identity (70.8% similar) in 579 aa overlap (364-875:13-574)

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pF1KB3 EVDSDLEEEDDEEEEEEKDREIPVPLMERQESVELTVQQKVFHIANELLQTEKAYVSRLH
                                     .: . : .::. .:::::: ::.:::.:: 
XP_011                   MGTGQQNTQLQVQSHKETNEQKLHKIANELLLTERAYVNRLD
                                 10        20        30        40  

           400       410       420                                 
pF1KB3 LLDQVFCARLLEEARNRSSFPADVVHGIFSNICSI-------------------------
       ::::::  .::::: ::.::::..:. ::::: ::                         
XP_011 LLDQVFYCKLLEEA-NRGSFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLPELEKRMQEWETTPRI
             50         60        70        80        90       100 

                                               430       440       
pF1KB3 -----------------------------------------IHEVQKEEACGNLTLQHHM
                                                ..:.::.. ::.:::::::
XP_011 GDILQKLAPFLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEIQKQKICGSLTLQHHM
             110       120       130       140       150       160 

       450       460       470       480       490       500       
pF1KB3 LEPVQRIPRYELLLKDYLLKLPHGSPDSKDAQKSLELIATAAEHSNAAIRKMERMHKLLK
       :::::::::::.:::::: :::  : : .::.::::.:.::: :::.:::::: ..:::.
XP_011 LEPVQRIPRYEMLLKDYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHSNSAIRKMENLKKLLE
             170       180       190       200       210       220 

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pF1KB3 VYELLGGEEDIVSPTKELIKEGHILKLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKF
       .::.:: :::::.:..::::::.::::.:.: ..:.:::.:::. ::::::.. :.:.::
XP_011 IYEMLGEEEDIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNMLLYCVPKFSLVGSKF
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pF1KB3 SVRARIDVDGMELKESSNLNLPRTFLVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQ
       .::.:. .:::.. :..: . :.:: ::::.:.::::: . ..:..:..:.. :.   .:
XP_011 TVRTRVGIDGMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKEEWIKALQETIDAFHQ
             290       300       310       320       330       340 

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pF1KB3 TLETFKLLNSTNREDEDTPPNSPNVDLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHC
         :::.  :.  . :.:   .  ...::::::  ::..::::::.:.::::..:.:::::
XP_011 RHETFR--NAIAK-DNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKEPFNALTRRRHHC
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pF1KB3 KACGHVVCGKCSEFRARLVYDNNRSNRVCTDCYVALHGVPGSSPACSQHTPQRRRSILEK
       .:::.::: :::...:.: ::... ..:: :::  . :   :         ..:..::: 
XP_011 RACGYVVCWKCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEE-------KKRKGILEI
      400       410       420       430       440              450 

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pF1KB3 QASVAAENSVICSFLHYMEKGGKGWHKAWFVVPENEPLVLYIYGAPQDVKAQRSLPLIGF
       ... .. :::.::::.::::. : :.::: :.:...:::::.:::::::.:: ..::.:.
XP_011 ESAEVSGNSVVCSFLQYMEKS-KPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIPLLGY
             460       470        480       490       500       510

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pF1KB3 EVGP-PEAGERPDRRHVFKITQSHLSWYFSPETEELQRRWMAVLGRAGRGDTFCPGPTLS
        :   :.... :   : ::.:::.    :. ..:::...:. :.  :  :.:  ::    
XP_011 VVDEMPRSADLP---HSFKLTQSKSVHSFAADSEELKQKWLKVILLAVTGET--PGGPNE
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       .::.:: :::::.:..::::::.::::.:.: ..:.:::.:::. ::::::.. :.:.::
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       .::.:. .:::.. :..: . :.:: ::::.:.::::: . ..:..:..:.. :.   .:
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pF1KB3 TLETFKLLNSTNREDEDTPPNSPNVDLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHC
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       .:::.::: :::...:.: ::... ..:: :::  . :   :         ..:..::: 
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XP_016 HPATLDDHPEPKKKSEC            
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        ::::::.. :.:.::.::.:. .:::.. :..: . :.:: ::::.:.::::: . ..:
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       .:.::::..:.:::::.:::.::: :::...:.: ::... ..:: :::  . :   :  
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895 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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