Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3230
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3230, 629 aa
1>>>pF1KB3230 629 - 629 aa - 629 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6807+/-0.00124; mu= 7.4508+/- 0.074
mean_var=149.8931+/-31.958, 0's: 0 Z-trim(105.1): 136 B-trim: 161 in 2/51
Lambda= 0.104757
statistics sampled from 8090 (8238) to 8090 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 3.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 667) 2978 462.9 6.2e-130
CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 705) 2310 362.0 1.6e-99
CCDS75953.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 228) 1472 235.0 8.6e-62
CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 540) 1279 206.1 1e-52
CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 735) 1223 197.7 4.7e-50
CCDS6765.3 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 497) 457 81.8 2.4e-15
CCDS75870.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 508) 457 81.8 2.5e-15
CCDS83391.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 509) 457 81.8 2.5e-15
CCDS47999.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 530) 452 81.1 4.3e-15
CCDS45332.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15 ( 749) 436 78.7 3e-14
CCDS61738.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15 ( 704) 433 78.3 3.9e-14
>>CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX (667 aa)
initn: 2977 init1: 2977 opt: 2978 Z-score: 2446.2 bits: 462.9 E(32554): 6.2e-130
Smith-Waterman score: 4123; 94.3% identity (94.3% similar) in 661 aa overlap (7-629:7-667)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KB3 EK--------------------------------------QNLESNLTNLIKRNTELETL
:: ::::::::::::::::::::
CCDS14 EKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLKQNLESNLTNLIKRNTELETL
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 LAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIA
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 NCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFD
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 TFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTI
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 FTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLK
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 TNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGR
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 HYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPH
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 LRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHL
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 DCTEQLP
:::::::
CCDS14 DCTEQLP
>>CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX (705 aa)
initn: 3422 init1: 2308 opt: 2310 Z-score: 1900.3 bits: 362.0 E(32554): 1.6e-99
Smith-Waterman score: 3266; 71.2% identity (87.4% similar) in 659 aa overlap (7-627:27-685)
10 20 30 40
pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVS
:::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS14 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 HCATNESVESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET
:...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS14 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHR
::::.. .: :.:.. ::::.::: .::::::.::::::::.::.::::::::::.::
CCDS14 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
130 140 150 160 170 180
170 180
pF1KB3 LIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEK--------------------------------------
:.::.::.:.::. ::.::.::
CCDS14 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQII
:.:: :::::.:::.:::. .::::: ::.::::.. .:::: :::: :.::::::.:.:
CCDS14 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVS
..:::: :::.:::::::.:::.::.:::. ::.:::: :::::.:::::.::::.:::.
CCDS14 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 MATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTIT
:::::::::::.::.::.:..::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.::::
CCDS14 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI
::: ::::::. :::::::::::::: .:: ::.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS14 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPE
:.::::::::::.::: .::::::::::::: .:.:::.:.:.: .:.:::: :::::::
CCDS14 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 RFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRC
::.. : ::.:::.::::: ::::::...:::::::.:::::::.::::::..::.. ::
CCDS14 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 NNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPT
:.:.:::::.::. .. :::.:.:.::::::. ..::: ::.::.::::.: :::::
CCDS14 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
610 620 630 640 650 660
610 620
pF1KB3 FTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
::.::: : :..::: :: .: :.
CCDS14 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
670 680 690 700
>>CCDS75953.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX (228 aa)
initn: 1472 init1: 1472 opt: 1472 Z-score: 1222.9 bits: 235.0 E(32554): 8.6e-62
Smith-Waterman score: 1472; 98.6% identity (99.5% similar) in 218 aa overlap (1-218:1-218)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::.. :
CCDS75 EKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVELECSVLFPRVAQWG
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 IIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITER
>>CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX (540 aa)
initn: 2392 init1: 1279 opt: 1279 Z-score: 1059.8 bits: 206.1 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 2395; 81.5% identity (81.5% similar) in 480 aa overlap (1-391:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KB3 EK--------------------------------------QNLESNLTNLIKRNTELETL
:: ::::::::::::::::::::
CCDS75 EKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLKQNLESNLTNLIKRNTELETL
190 200 210 220 230 240
210
pF1KB3 LAKLIQTCQHVE------------------------------------------------
::::::::::::
CCDS75 LAKLIQTCQHVETVKDQKVIGREKQQYYPRNRRKWVSNSLQARLMGRRCISRRERKLTLD
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 ---VNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VEKVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERS
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 ASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSRE
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 KKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVS
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 LCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLD
CCDS75 EYLMAYLFLSLVAFFRLIAFLNLNFKGRQGRKEHTIFIDLSFLNKKVIALTCTTLVKTAG
490 500 510 520 530 540
>>CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX (735 aa)
initn: 3406 init1: 1221 opt: 1223 Z-score: 1012.2 bits: 197.7 E(32554): 4.7e-50
Smith-Waterman score: 2971; 66.8% identity (82.9% similar) in 659 aa overlap (37-627:57-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 ELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCRHVITLS
:::: :...::.: ::::::::::.::.:.
CCDS14 ELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVSSCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLN
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 QRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDP
.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.. .: :.:.. ::::.:::
CCDS14 HRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDP
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 AQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEK----
.::::::.::::::::.::.::::::::::.:::.::.::.:.::. ::.::.::
CCDS14 PRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHRLVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMY
150 160 170 180 190 200
190 200
pF1KB3 ----------------------------------QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ
:.:: :::::.:::.:::. .:::::
CCDS14 CVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLKQTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQ
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI
::.::::.. .:::: :::: :.::::::.:.:..:::: :::.:::::::.:::.::.
CCDS14 ICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMIAVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCL
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF
:::. ::.:::: :::::.:::::.::::.:::.:::::::::::.::.::.:..:::::
CCDS14 ERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVAMATASSQVLIPDINFNDAFENFALDF
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQAN
:::::::: ::::::::::.:::::::::.::::::: ::::::. ::::::::::::::
CCDS14 SREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTITVHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQAN
390 400 410 420 430 440
390 400 410
pF1KB3 VVS------------------------------LCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSG
.: : ::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 FISKSWCSWGLWPEIRKCKEAVSCSRLAGAPRGLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSG
450 460 470 480 490 500
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 TKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKS
:.:::.::::::::::.::: .::::::::::::: .:.:::.:.:.: .:.:::: :::
CCDS14 TRYIFIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKS
510 520 530 540 550 560
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 HTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWA
::::::.. : ::.:::.::::: ::::::...:::::::.:::::::.::::::..::.
CCDS14 HTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWV
570 580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 LCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQP
. :::.:.:::::.::. .. :::.:.:.::::::. ..::: ::.::.::::.: :
CCDS14 FSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILP
630 640 650 660 670 680
600 610 620
pF1KB3 VCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
::::::.::: : :..::: :: .: :.
CCDS14 VCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
690 700 710 720 730
>>CCDS6765.3 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 (497 aa)
initn: 460 init1: 136 opt: 457 Z-score: 389.0 bits: 81.8 E(32554): 2.4e-15
Smith-Waterman score: 739; 31.1% identity (61.9% similar) in 483 aa overlap (179-619:2-471)
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 THPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ
...:. :. ...: ..: :..... : .
CCDS67 MDSQKEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLHH
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI
: . :. :.: ..: :: : : :... .. . . ::. .. . ..: .::..:.. .
CCDS67 TLKGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEVKESMINCIKQEQARKSQELQSQISQCNNAL
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF
: : :. : .:: .. .: ..:..: .::.::.: : :... :.. . .::
CCDS67 ENSEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDF
100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTG
:.:...:. : .: .:. : : : .. ...:: : .: . ... : . : : :
CCDS67 SQERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDG
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 QANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKT
: .. : :. ::: ..::. ::. .::. : :.: :.: ... :.: :.:
CCDS67 LPRV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLET
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480
pF1KB3 NSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESS------------SKKSHTP----------
.. :.:: .:.: .::: .. :: : .. .: : ::
CCDS67 KALNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGSGTPSPKRTSVGSR
270 280 290 300 310 320
490 500 510 520 530
pF1KB3 --------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLAYKSAPKHEWIGK
.:::.. :: : :.. :.::.::::: . . :..:.:::. : . .::
CCDS67 PPAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVAYKTLGKFDQLGK
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580
pF1KB3 NSASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSI
...:: : :::. ..::.: .. .: ...:.. :.:.:...:::: ..
CCDS67 TNTSW--CIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVP--EKIGVFCDFDGGQLSFYDANSKQ
390 400 410 420 430
590 600 610 620
pF1KB3 HLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
::.: . :.::: : : :: :.. ::. .:
CCDS67 LLYSFKTKFTQPVLPGFMVWCGGLSLSTGMQVPSAVRTLQKSENGMTGSASSLNNVVTQ
440 450 460 470 480 490
>>CCDS75870.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 (508 aa)
initn: 460 init1: 136 opt: 457 Z-score: 388.8 bits: 81.8 E(32554): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 721; 30.6% identity (60.9% similar) in 494 aa overlap (179-619:2-482)
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 THPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ
...:. :. ...: ..: :..... : .
CCDS75 MDSQKEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLHH
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI
: . :. :.: ..: :: : : :... .. . . ::. .. . ..: .::..:.. .
CCDS75 TLKGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEVKESMINCIKQEQARKSQELQSQISQCNNAL
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF
: : :. : .:: .. .: ..:..: .::.::.: : :... :.. . .::
CCDS75 ENSEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDF
100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTG
:.:...:. : .: .:. : : : .. ...:: : .: . ... : . : : :
CCDS75 SQERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDG
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 QANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKT
: .. : :. ::: ..::. ::. .::. : :.: :.: ... :.: :.:
CCDS75 LPRV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLET
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480
pF1KB3 NSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK--------------------KSHT---
.. :.:: .:.: .::: .. :: : ...: :.::
CCDS75 KALNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGSVHVTSLKKHTSGT
270 280 290 300 310 320
490 500 510 520
pF1KB3 P------------------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLAY
: .:::.. :: : :.. :.::.::::: . . :..:.::
CCDS75 PSPKRTSVGSRPPAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVAY
330 340 350 360 370 380
530 540 550 560 570
pF1KB3 KSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDNG
:. : . .::...:: : :::. ..::.: .. .: ...:.. :.:.:
CCDS75 KTLGKFDQLGKTNTSW--CIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVP--EKIGVFCDFDGG
390 400 410 420 430
580 590 600 610 620
pF1KB3 SIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
...:::: .. ::.: . :.::: : : :: :.. ::. .:
CCDS75 QLSFYDANSKQLLYSFKTKFTQPVLPGFMVWCGGLSLSTGMQVPSAVRTLQKSENGMTGS
440 450 460 470 480 490
CCDS75 ASSLNNVVTQ
500
>>CCDS83391.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 (509 aa)
initn: 460 init1: 136 opt: 457 Z-score: 388.8 bits: 81.8 E(32554): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 719; 30.5% identity (60.8% similar) in 495 aa overlap (179-619:2-483)
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 THPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ
...:. :. ...: ..: :..... : .
CCDS83 MDSQKEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLHH
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI
: . :. :.: ..: :: : : :... .. . . ::. .. . ..: .::..:.. .
CCDS83 TLKGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEVKESMINCIKQEQARKSQELQSQISQCNNAL
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF
: : :. : .:: .. .: ..:..: .::.::.: : :... :.. . .::
CCDS83 ENSEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDF
100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTG
:.:...:. : .: .:. : : : .. ...:: : .: . ... : . : : :
CCDS83 SQERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDG
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 QANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKT
: .. : :. ::: ..::. ::. .::. : :.: :.: ... :.: :.:
CCDS83 LPRV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLET
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480
pF1KB3 NSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK--------------------KSHT---
.. :.:: .:.: .::: .. :: : ...: :.::
CCDS83 KALNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGSVHVTSLKKHTRSG
270 280 290 300 310 320
490 500 510 520
pF1KB3 -P------------------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLA
: .:::.. :: : :.. :.::.::::: . . :..:.:
CCDS83 TPSPKRTSVGSRPPAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVA
330 340 350 360 370 380
530 540 550 560 570
pF1KB3 YKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDN
::. : . .::...:: : :::. ..::.: .. .: ...:.. :.:.
CCDS83 YKTLGKFDQLGKTNTSW--CIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVP--EKIGVFCDFDG
390 400 410 420 430
580 590 600 610 620
pF1KB3 GSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
:...:::: .. ::.: . :.::: : : :: :.. ::. .:
CCDS83 GQLSFYDANSKQLLYSFKTKFTQPVLPGFMVWCGGLSLSTGMQVPSAVRTLQKSENGMTG
440 450 460 470 480 490
CCDS83 SASSLNNVVTQ
500
>>CCDS47999.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 (530 aa)
initn: 460 init1: 136 opt: 452 Z-score: 384.5 bits: 81.1 E(32554): 4.3e-15
Smith-Waterman score: 735; 30.9% identity (61.8% similar) in 482 aa overlap (181-619:36-504)
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 PNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTC
... :. ...: ..: :..... : .:
CCDS47 YCFKENENVTVDKACFLISNITIGPESINLQQEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLHHTL
10 20 30 40 50 60
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 QHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIER
. :. :.: ..: :: : : :... .. . . ::. .. . ..: .::..:.. .:
CCDS47 KGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEVKESMINCIKQEQARKSQELQSQISQCNNALEN
70 80 90 100 110 120
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 SASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSR
: :. : .:: .. .: ..:..: .::.::.: : :... :.. . .:::.
CCDS47 SEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDFSQ
130 140 150 160 170 180
340 350 360 370 380
pF1KB3 EKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTGQA
:...:. : .: .:. : : : .. ...:: : .: . ... : . : : :
CCDS47 ERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDGLP
190 200 210 220 230 240
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 NVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKTNS
: .. : :. ::: ..::. ::. .::. : :.: :.: ... :.: :.:..
CCDS47 RV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLETKA
250 260 270 280 290
450 460 470 480
pF1KB3 QPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK-------------KSHTP-----------
:.:: .:.: .::: .. :: : ...: .: ::
CCDS47 LNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGRSGTPSPKRTSVGSRP
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530
pF1KB3 -------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLAYKSAPKHEWIGKN
.:::.. :: : :.. :.::.::::: . . :..:.:::. : . .::.
CCDS47 PAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVAYKTLGKFDQLGKT
360 370 380 390 400 410
540 550 560 570 580
pF1KB3 SASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIH
..:: : :::. ..::.: .. .:. ..:.. :.:.:...:::: ..
CCDS47 NTSW--CIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVPE--KIGVFCDFDGGQLSFYDANSKQL
420 430 440 450 460 470
590 600 610 620
pF1KB3 LYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
::.: . :.::: : : :: :.. ::. .:
CCDS47 LYSFKTKFTQPVLPGFMVWCGGLSLSTGMQVPSAVRTLQKSENGMTGSASSLNNVVTQ
480 490 500 510 520 530
>>CCDS45332.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15 (749 aa)
initn: 331 init1: 118 opt: 436 Z-score: 369.2 bits: 78.7 E(32554): 3e-14
Smith-Waterman score: 440; 23.9% identity (50.7% similar) in 598 aa overlap (123-622:171-746)
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 GPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPN
:.. : :. ::::.. ..:
CCDS45 GQCQDLREAYRYTHGRASEEYECYVIPEEEDEEEAADVF--CVTCKTP-----IRAF---
150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 KKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQH
.: : :. : :: . :. :.....:. .: :. :.:.. .: ..
CCDS45 QKVFDEHKEHEVIP-------LNEALESAKDEIHKNMYKLEKQIIEMENFANHLEEVFIT
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 VEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSA
:: : ..:: .. . . ..: . :. . . : : .:. : :...: . ..
CCDS45 VEENFGKQEQNFESHYNEILETLAQKYEEKIQALGEKKKEKLEALYGQLVSCGENLDTCK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 SLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSREK
:. :. .: ... :.. : ...:.. .. . ::. . :. .:::: .
CCDS45 ELMETIEEMCHE-EKVDFIKDAVAMADRLGKFLKTKTDV--EISAQPEFEDQTLDFSDVE
310 320 330 340 350 360
340 350 360
pF1KB3 KLLECLDYLTAPNPPTIREEL-CTASYDTITVHWT--SDD--------------------
.:. .. . ::. :.: .. .:. ... : :. :::
CCDS45 QLMGSINTIPAPSAPVINPQVPNSATGSSVRVCWSLYSDDTVESYQLSYRPVQDSSPGTD
370 380 390 400 410 420
370 380
pF1KB3 --EFSVVSYEL-----------QYTIFTGQAN----------------------------
::.:. : :: ... :
CCDS45 QAEFTVTVKETYCSVTNLVPNTQYEFWVTAHNRAGPSPSSERAVYMTAPSPPIIKTKEIR
430 440 450 460 470 480
390 400 410 420
pF1KB3 ----VVSLC------NSADSWMI------VPNIKQNHYTVHG---------LQSGTKYIF
.: .: : .::. . :. . .: : :: : .::.
CCDS45 SCEEAVLICWESGNLNPVDSYTVELTQAESPEASGVTESVVGIPTCESVVQLQPGRSYII
490 500 510 520 530 540
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 MVKAINQAG-SRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK-KSHTP
.:.:.:..: : :::. ..: .. :.:. . : : .:.:.::. :.: . . .:
CCDS45 YVRALNMGGPSVRSEPATVHTIGSYFRLNKDTCHPWLTISEDGLTAVRSERRTPARELSP
550 560 570 580 590 600
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCR
.: ::.. :.::::: .. : .:.:. .. :.: .: : :: :
CCDS45 SDTHFTRCVAVMGNLIPVRGHHYWEVEVDEHLDYRVGVAFADVRKQEDLGANCLSW--CM
610 620 630 640 650
550 560 570 580 590
pF1KB3 CNNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLR------RVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAF
.. ::. . . . .: .: ..::::::......:... : :::::. .
CCDS45 RHTFASSRHKYEFLHNRTTPDIRITVPPKKIGILLDYEHSKLSFFNVDLSQHLYTFSCQL
660 670 680 690 700 710
600 610 620
pF1KB3 AQPVCPTFTVWNK-CLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
. : : :.. . :: . .:. .: :.
CCDS45 HEFVHPCFSLEKPGCLKVHNGISMPKHVTFY
720 730 740
629 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:36:00 2016 done: Thu Nov 3 12:36:00 2016
Total Scan time: 3.500 Total Display time: 0.150
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]