Result of FASTA (omim) for
pFN21AB3109
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3109, 1786 aa
1>>>pF1KB3109 1786 - 1786 aa - 1786 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8544+/-0.000646; mu= 9.9441+/- 0.040
mean_var=423.8418+/-88.398, 0's: 0 Z-trim(115.1): 396 B-trim: 381 in 2/53
Lambda= 0.062298
statistics sampled from 24975 (25419) to 24975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 14.550
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit be (1786) 12583 1148.2 0
XP_016867690 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1810) 12510 1141.7 0
XP_016867691 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1212) 8367 769.1 0
NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin sub (1798) 6774 626.2 8.8e-178
XP_005265184 (OMIM: 150325,609049,614199) PREDICTE (1798) 6774 626.2 8.8e-178
NP_031382 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 is (1761) 4457 417.9 4.2e-115
NP_001304975 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1761) 4457 417.9 4.2e-115
XP_011514280 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1723) 4448 417.1 7.3e-115
XP_016867368 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1753) 4438 416.2 1.4e-114
XP_011514277 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1772) 4438 416.2 1.4e-114
XP_011514281 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1703) 4434 415.8 1.7e-114
XP_011514282 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1564) 4407 413.3 8.9e-114
XP_016867369 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1567) 4407 413.3 9e-114
NP_001304976 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1101) 3866 364.5 3.2e-99
NP_001304977 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 ( 772) 2428 235.0 2.1e-60
NP_001316629 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 2 pre ( 605) 1284 132.0 1.7e-29
NP_067052 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 1 precur ( 628) 1284 132.1 1.7e-29
NP_001316631 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 3 [Ho ( 591) 1260 129.9 7.3e-29
NP_001316630 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 3 [Ho ( 591) 1260 129.9 7.3e-29
NP_002284 (OMIM: 150290) laminin subunit gamma-1 p (1609) 1210 126.0 2.9e-27
NP_006050 (OMIM: 604349,614115) laminin subunit ga (1575) 1143 120.0 1.8e-25
XP_011516423 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1581) 1127 118.5 5e-25
NP_000219 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) lami (1172) 1119 117.6 6.9e-25
NP_001017402 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 1119 117.6 6.9e-25
XP_005273181 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1172) 1119 117.6 6.9e-25
NP_001121113 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 1119 117.6 6.9e-25
XP_006716984 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1259) 1097 115.7 2.8e-24
NP_001073291 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit (3118) 1054 112.4 6.8e-23
NP_000417 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit al (3122) 1054 112.4 6.8e-23
XP_011523959 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2489) 1004 107.8 1.4e-21
XP_011523958 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2561) 1004 107.8 1.4e-21
NP_005550 (OMIM: 150320,615960) laminin subunit al (3075) 1004 107.9 1.5e-21
XP_011523957 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (3085) 1004 107.9 1.5e-21
XP_016866342 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (1916) 972 104.7 8.6e-21
XP_016866341 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (2587) 972 104.9 1e-20
XP_005267039 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3206) 972 105.1 1.1e-20
XP_011534122 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3208) 972 105.1 1.1e-20
XP_005267038 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3210) 972 105.1 1.1e-20
XP_016866340 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3212) 972 105.1 1.1e-20
NP_009054 (OMIM: 276901,608400,613809) usherin iso (1546) 833 92.1 4.4e-17
XP_006721658 (OMIM: 601614) PREDICTED: netrin-1 is ( 604) 816 90.0 7.6e-17
NP_004813 (OMIM: 601614) netrin-1 precursor [Homo ( 604) 816 90.0 7.6e-17
NP_996816 (OMIM: 276901,608400,613809) usherin iso (5202) 833 92.9 8.6e-17
XP_016856761 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1108) 813 90.1 1.3e-16
NP_001289925 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l ( 488) 655 75.4 1.5e-12
XP_016878162 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1021) 660 76.3 1.7e-12
NP_115821 (OMIM: 612454) multiple epidermal growth (1044) 660 76.3 1.7e-12
XP_016878161 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1044) 660 76.3 1.7e-12
XP_016878160 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1092) 660 76.3 1.7e-12
XP_016878159 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1097) 660 76.3 1.8e-12
>>NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit beta-1 (1786 aa)
initn: 12583 init1: 12583 opt: 12583 Z-score: 6134.4 bits: 1148.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 12583; 99.9% identity (100.0% similar) in 1786 aa overlap (1-1786:1-1786)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 RHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCY
430 440 450 460 470 480
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pF1KB3 CKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQC
490 500 510 520 530 540
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pF1KB3 NEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 IDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPG
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670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGG
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pF1KB3 SGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGS
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pF1KB3 LSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQC
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pF1KB3 HCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLA
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pF1KB3 GYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACVCDPGYIGSRCDDCAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACVCDPGYIGSRCDDCAS
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pF1KB3 GYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDA
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pF1KB3 LRQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTG
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LQQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTG
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pF1KB3 CDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB3 TPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF
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pF1KB3 LEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDV
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pF1KB3 TEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDS
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1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB3 ITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDE
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pF1KB3 LAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNA
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1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 WQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 WQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEEL
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pF1KB3 RNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVI
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KB3 LQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KB3 QGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVK
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1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB3 QSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780
pF1KB3 KDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVYSTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVYSTCL
1750 1760 1770 1780
>>XP_016867690 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: laminin (1810 aa)
initn: 12510 init1: 12510 opt: 12510 Z-score: 6098.9 bits: 1141.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 12510; 99.9% identity (100.0% similar) in 1774 aa overlap (13-1786:37-1810)
10 20 30 40
pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APTPPPPLVRFFRAPLPACVPPTLLPVLPAALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LIGRAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIGRAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 FAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGV
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170 180 190 200 210 220
pF1KB3 YRYFAYDCEASFPGISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YRYFAYDCEASFPGISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSP
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230 240 250 260 270 280
pF1KB3 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP
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290 300 310 320 330 340
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSI
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350 360 370 380 390 400
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMME
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGE
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pF1KB3 RKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKA
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pF1KB3 AQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEML
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pF1KB3 QNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVY
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pF1KB3 STCL
::::
XP_016 STCL
1810
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10 20 30 40
pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDL
::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 LIGRAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIGRAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTT
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pF1KB3 FAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP
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pF1KB3 VDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQL
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pF1KB3 ACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLY
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pF1KB3 HTEGEHCQFCRFGYYGDALRQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIG
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HTEGEHCQFCRFGYYGDALQQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB3 QNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFW
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB3 GDPDVECRACDCDPRGI-ETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQ
:::::::: : . . . : : .. .: ::
XP_016 GDPDVECR----DVEDVTQFP--DYPGSHNMCGEGRIYHLSPQFMLLTIMLYSSNLPLES
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB3 CFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAE
XP_016 LECRGRTKTIKR
1210
>>NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin subunit (1798 aa)
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Smith-Waterman score: 6774; 50.5% identity (77.6% similar) in 1785 aa overlap (7-1785:22-1797)
10 20 30 40
pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIG
: .: :: : .: :. ::..:::::::::::.:
NP_002 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLA--QAPAPDVP-GCSRGSCYPATGDLLVG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 RAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAP
::..:...:::::. :.:::::::::..::::.:.:. :. :: :: :.::::.:::
NP_002 RADRLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAP
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pF1KB3 NRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRY
.: :::::::. :::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:: ::::
NP_002 QRRAAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 FAYDCEASFPGISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQ
:.::: :.:::. .: .. ::..:.::::.::::::::::.:.::::. : :::: :::
NP_002 FSYDCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 NLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDG
:::::::::.....:::::::::: : :::::::::.:..:::::::::::::::::. :
NP_002 NLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 FNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCH
..:::::: :.:.:::.::::: :.:::.:::::::: .:.::.::.:. :. :::
NP_002 APAHAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSCH
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 FDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGS
::::::::.::::::::: ::::: ::.:: :.::.:. : .:.::: :. : ::: ::
NP_002 FDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMGS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
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