Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3030
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3030, 917 aa
1>>>pF1KB3030 917 - 917 aa - 917 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6663+/-0.00125; mu= 18.6990+/- 0.074
mean_var=66.9167+/-13.838, 0's: 0 Z-trim(99.9): 31 B-trim: 238 in 1/45
Lambda= 0.156786
statistics sampled from 5903 (5916) to 5903 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.512), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 4.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1956.1 HK2 gene_id:3099|Hs108|chr2 ( 917) 6111 1392.3 0
CCDS7292.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 917) 4668 1065.9 0
CCDS7289.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 921) 4572 1044.2 0
CCDS7290.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 905) 4571 1043.9 0
CCDS7291.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 916) 4571 1043.9 0
CCDS7288.1 HKDC1 gene_id:80201|Hs108|chr10 ( 917) 4379 1000.5 0
CCDS4407.1 HK3 gene_id:3101|Hs108|chr5 ( 923) 3425 784.7 0
CCDS5479.1 GCK gene_id:2645|Hs108|chr7 ( 465) 1742 403.9 3.5e-112
CCDS5481.1 GCK gene_id:2645|Hs108|chr7 ( 464) 1736 402.6 9.1e-112
CCDS5480.1 GCK gene_id:2645|Hs108|chr7 ( 466) 1734 402.1 1.2e-111
>>CCDS1956.1 HK2 gene_id:3099|Hs108|chr2 (917 aa)
initn: 6111 init1: 6111 opt: 6111 Z-score: 7463.6 bits: 1392.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6111; 100.0% identity (100.0% similar) in 917 aa overlap (1-917:1-917)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MIASHLLAYFFTELNHDQVQKVDQYLYHMRLSDETLLEISKRFRKEMEKGLGATTHPTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MIASHLLAYFFTELNHDQVQKVDQYLYHMRLSDETLLEISKRFRKEMEKGLGATTHPTAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VKMLPTFVRSTPDGTEHGEFLALDLGGTNFRVLWVKVTDNGLQKVEMENQIYAIPEDIMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 VKMLPTFVRSTPDGTEHGEFLALDLGGTNFRVLWVKVTDNGLQKVEMENQIYAIPEDIMR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 GSGTQLFDHIAECLANFMDKLQIKDKKLPLGFTFSFPCHQTKLDESFLVSWTKGFKSSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 GSGTQLFDHIAECLANFMDKLQIKDKKLPLGFTFSFPCHQTKLDESFLVSWTKGFKSSGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EGRDVVALIRKAIQRRGDFDIDIVAVVNDTVGTMMTCGYDDHNCEIGLIVGTGSNACYME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 EGRDVVALIRKAIQRRGDFDIDIVAVVNDTVGTMMTCGYDDHNCEIGLIVGTGSNACYME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EMRHIDMVEGDEGRMCINMEWGAFGDDGSLNDIRTEFDQEIDMGSLNPGKQLFEKMISGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 EMRHIDMVEGDEGRMCINMEWGAFGDDGSLNDIRTEFDQEIDMGSLNPGKQLFEKMISGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 YMGELVRLILVKMAKEELLFGGKLSPELLNTGRFETKDISDIEGEKDGIRKAREVLMRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 YMGELVRLILVKMAKEELLFGGKLSPELLNTGRFETKDISDIEGEKDGIRKAREVLMRLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LDPTQEDCVATHRICQIVSTRSASLCAATLAAVLQRIKENKGEERLRSTIGVDGSVYKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LDPTQEDCVATHRICQIVSTRSASLCAATLAAVLQRIKENKGEERLRSTIGVDGSVYKKH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PHFAKRLHKTVRRLVPGCDVRFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQHRARQKTLEHLQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PHFAKRLHKTVRRLVPGCDVRFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQHRARQKTLEHLQLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HDQLLEVKRRMKVEMERGLSKETHASAPVKMLPTYVCATPDGTEKGDFLALDLGGTNFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 HDQLLEVKRRMKVEMERGLSKETHASAPVKMLPTYVCATPDGTEKGDFLALDLGGTNFRV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LLVRVRNGKWGGVEMHNKIYAIPQEVMHGTGDELFDHIVQCIADFLEYMGMKGVSLPLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LLVRVRNGKWGGVEMHNKIYAIPQEVMHGTGDELFDHIVQCIADFLEYMGMKGVSLPLGF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 TFSFPCQQNSLDESILLKWTKGFKASGCEGEDVVTLLKEAIHRREEFDLDVVAVVNDTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 TFSFPCQQNSLDESILLKWTKGFKASGCEGEDVVTLLKEAIHRREEFDLDVVAVVNDTVG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 TMMTCGFEDPHCEVGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNMEWGAFGDNGCLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 TMMTCGFEDPHCEVGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNMEWGAFGDNGCLDD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 FRTEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLLFRGRISERLKTRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 FRTEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLLFRGRISERLKTRG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 IFETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCTVVARRAAQLCGAGMAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 IFETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCTVVARRAAQLCGAGMAA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 VVDRIRENRGLDALKVTVGVDGTLYKLHPHFAKVMHETVKDLAPKCDVSFLQSEDGSGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 VVDRIRENRGLDALKVTVGVDGTLYKLHPHFAKVMHETVKDLAPKCDVSFLQSEDGSGKG
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB3 AALITAVACRIREAGQR
:::::::::::::::::
CCDS19 AALITAVACRIREAGQR
910
>>CCDS7292.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 (917 aa)
initn: 6476 init1: 4668 opt: 4668 Z-score: 5699.6 bits: 1065.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4668; 73.8% identity (92.5% similar) in 912 aa overlap (1-912:1-912)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MIASHLLAYFFTELNHDQVQKVDQYLYHMRLSDETLLEISKRFRKEMEKGLGATTHPTAA
:::..::::.::::. :::.:.:.::: ::::::::..: ::::::..::. .:::.
CCDS72 MIAAQLLAYYFTELKDDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VKMLPTFVRSTPDGTEHGEFLALDLGGTNFRVLWVKVTDNGLQKVEMENQIYAIPEDIMR
:::::::::: :::.:.:.:.::::::..::.: :.:. . :.:.::...: ::.:..
CCDS72 VKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 GSGTQLFDHIAECLANFMDKLQIKDKKLPLGFTFSFPCHQTKLDESFLVSWTKGFKSSGV
:::.:::::.::::..::.: .:::::::.::::::::.:.:.::..:..::: ::.:::
CCDS72 GSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EGRDVVALIRKAIQRRGDFDIDIVAVVNDTVGTMMTCGYDDHNCEIGLIVGTGSNACYME
:: ::: :. :::..:::.: .:::::::::::::::::::..::.:::.:::.::::::
CCDS72 EGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EMRHIDMVEGDEGRMCINMEWGAFGDDGSLNDIRTEFDQEIDMGSLNPGKQLFEKMISGM
:.::::.::::::::::: :::::::::::.:::::::.::: :::::::::::::.:::
CCDS72 ELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 YMGELVRLILVKMAKEELLFGGKLSPELLNTGRFETKDISDIEGEKDGIRKAREVLMRLG
:.:::::::::::::: ::: :...::::. :.:.:.:.: :: .:.:...:.:.: :::
CCDS72 YLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LDPTQEDCVATHRICQIVSTRSASLCAATLAAVLQRIKENKGEERLRSTIGVDGSVYKKH
..:...:::.....: ::: :::.: ::::.:.:.:...::: :::.:.:::::.:: :
CCDS72 VEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PHFAKRLHKTVRRLVPGCDVRFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQHRARQKTLEHLQLS
:....:.:::.::::: ::::: ::.:::::::::::::::::.::: ..:: :..:.
CCDS72 PQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HDQLLEVKRRMKVEMERGLSKETHASAPVKMLPTYVCATPDGTEKGDFLALDLGGTNFRV
.:.:::::.::..::: :: :.:: .: :::::..: ::::::.:::::::::::::::
CCDS72 KDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LLVRVRNGKWGGVEMHNKIYAIPQEVMHGTGDELFDHIVQCIADFLEYMGMKGVSLPLGF
:::..:.:: ::::::::::: :.:.:::.:::::::.::.:::.:::.:: .::::
CCDS72 LLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 TFSFPCQQNSLDESILLKWTKGFKASGCEGEDVVTLLKEAIHRREEFDLDVVAVVNDTVG
::::::::.::: .::. :::::::. : :.::::::..::.::::::::::::::::::
CCDS72 TFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 TMMTCGFEDPHCEVGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNMEWGAFGDNGCLDD
:::::..:.: :::::::::::::::::::.:::.:::..:.::.:::::::::::::::
CCDS72 TMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 FRTEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLLFRGRISERLKTRG
.::..: ::: ::: ::::.::::::::::::::::::::::.:.::::.::: :::::
CCDS72 IRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 IFETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCTVVARRAAQLCGAGMAA
::::::::::::: :::::::::::.:::.:::::::.:: :: ::.:::::::::::::
CCDS72 IFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 VVDRIRENRGLDALKVTVGVDGTLYKLHPHFAKVMHETVKDLAPKCDVSFLQSEDGSGKG
:::.:::::::: :.::::::::::::::::...::.:::.:.:::.:::: ::::::::
CCDS72 VVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKG
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB3 AALITAVACRIREAGQR
:::::::. :.:
CCDS72 AALITAVGVRLRTEASS
910
>>CCDS7289.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 (921 aa)
initn: 6365 init1: 4557 opt: 4572 Z-score: 5582.2 bits: 1044.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4572; 73.8% identity (92.5% similar) in 892 aa overlap (21-912:25-916)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MIASHLLAYFFTELNHDQVQKVDQYLYHMRLSDETLLEISKRFRKEMEKGLGATTH
..:.::: ::::::::..: ::::::..::. .
CCDS72 MGQICQRESATAAEKPKLHLLAESEIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 PTAAVKMLPTFVRSTPDGTEHGEFLALDLGGTNFRVLWVKVTDNGLQKVEMENQIYAIPE
:::.:::::::::: :::.:.:.:.::::::..::.: :.:. . :.:.::...: ::
CCDS72 PTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 DIMRGSGTQLFDHIAECLANFMDKLQIKDKKLPLGFTFSFPCHQTKLDESFLVSWTKGFK
.:..:::.:::::.::::..::.: .:::::::.::::::::.:.:.::..:..::: ::
CCDS72 NIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 SSGVEGRDVVALIRKAIQRRGDFDIDIVAVVNDTVGTMMTCGYDDHNCEIGLIVGTGSNA
.::::: ::: :. :::..:::.: .:::::::::::::::::::..::.:::.:::.::
CCDS72 ASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 CYMEEMRHIDMVEGDEGRMCINMEWGAFGDDGSLNDIRTEFDQEIDMGSLNPGKQLFEKM
:::::.::::.::::::::::: :::::::::::.:::::::.::: :::::::::::::
CCDS72 CYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ISGMYMGELVRLILVKMAKEELLFGGKLSPELLNTGRFETKDISDIEGEKDGIRKAREVL
.::::.:::::::::::::: ::: :...::::. :.:.:.:.: :: .:.:...:.:.:
CCDS72 VSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEIL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 MRLGLDPTQEDCVATHRICQIVSTRSASLCAATLAAVLQRIKENKGEERLRSTIGVDGSV
:::..:...:::.....: ::: :::.: ::::.:.:.:...::: :::.:.:::::.
CCDS72 TRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 YKKHPHFAKRLHKTVRRLVPGCDVRFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQHRARQKTLEH
:: ::....:.:::.::::: ::::: ::.:::::::::::::::::.::: ..:: :
CCDS72 YKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAH
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 LQLSHDQLLEVKRRMKVEMERGLSKETHASAPVKMLPTYVCATPDGTEKGDFLALDLGGT
..:..:.:::::.::..::: :: :.:: .: :::::..: ::::::.:::::::::::
CCDS72 FHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGT
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 NFRVLLVRVRNGKWGGVEMHNKIYAIPQEVMHGTGDELFDHIVQCIADFLEYMGMKGVSL
:::::::..:.:: ::::::::::: :.:.:::.:::::::.::.:::.:::.:: .
CCDS72 NFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRM
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 PLGFTFSFPCQQNSLDESILLKWTKGFKASGCEGEDVVTLLKEAIHRREEFDLDVVAVVN
::::::::::::.::: .::. :::::::. : :.::::::..::.::::::::::::::
CCDS72 PLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVN
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 DTVGTMMTCGFEDPHCEVGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNMEWGAFGDNG
:::::::::..:.: :::::::::::::::::::.:::.:::..:.::.:::::::::::
CCDS72 DTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNG
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 CLDDFRTEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLLFRGRISERL
::::.::..: ::: ::: ::::.::::::::::::::::::::::.:.::::.::: :
CCDS72 CLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETL
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 KTRGIFETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCTVVARRAAQLCGA
::::::::::::::::: :::::::::::.:::.:::::::.:: :: ::.:::::::::
CCDS72 KTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGA
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 GMAAVVDRIRENRGLDALKVTVGVDGTLYKLHPHFAKVMHETVKDLAPKCDVSFLQSEDG
:::::::.:::::::: :.::::::::::::::::...::.:::.:.:::.:::: ::::
CCDS72 GMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDG
850 860 870 880 890 900
900 910
pF1KB3 SGKGAALITAVACRIREAGQR
:::::::::::. :.:
CCDS72 SGKGAALITAVGVRLRTEASS
910 920
>>CCDS7290.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 (905 aa)
initn: 6365 init1: 4557 opt: 4571 Z-score: 5581.1 bits: 1043.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4571; 73.8% identity (92.5% similar) in 891 aa overlap (22-912:10-900)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MIASHLLAYFFTELNHDQVQKVDQYLYHMRLSDETLLEISKRFRKEMEKGLGATTHPTAA
.:.::: ::::::::..: ::::::..::. .:::.
CCDS72 MAKRALHDFIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTAT
10 20 30 40
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CCDS72 IRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRG
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pF1KB3 AALITAVACRIREAGQR
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CCDS72 AALITAVGVRLRTEASS
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CCDS72 LEPSEADCIAVQHVCTIVSFRSANLCAAALAAILTRLRENKKVERLRTTVGMDGTLYKIH
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CCDS72 IWTRYDTEVDEGSLNPGKQRYEKMTSGMYLGEIVRQILIDLTKQGLLFRGQISERLRTRG
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CCDS72 IFETKFLSQIESDRLALLQVRRILQQLGLDSTCEDSIVVKEVCGAVSRRAAQLCGAGLAA
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CCDS72 IVEKRREDQGLEHLRITVGVDGTLYKLHPHFSRILQETVKELAPRCDVTFMLSEDGSGKG
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pF1KB3 AALITAVACRIREAGQR
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CCDS72 AALITAVAKRLQQAQKEN
900 910
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CCDS44 ALRGQASPAPAVRMLPTYVGSTPHGTEQGDFVVLELGATGASLRVLWVTLTGIEGHRVEP
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CCDS44 GAARVHAILQDLGLSPGASDVELVQHVCAAVCTRAAQLCAAALAAVLSCLQHSREQQTLQ
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410 420 430 440 450 460
pF1KB3 STIGVDGSVYKKHPHFAKRLHKTVRRLVPGCDVRFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQH
.... : : ..::.: . :. :: :.: ::: .. : ::.:.:.::::::: ::: ..
CCDS44 VAVATGGRVCERHPRFCSVLQGTVMLLAPECDVSLIPSVDGGGRGVAMVTAVAARLAAHR
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 RARQKTLEHLQLSHDQLLEVKRRMKVEMERGLSKETHASAPVKMLPTYVCATPDGTEKGD
: ..:: ..:.:::: :. .:. : .:: : .. ..::::.: :::::.:.::
CCDS44 RLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGE---ASSLRMLPTFVRATPDGSERGD
490 500 510 520 530
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pF1KB3 FLALDLGGTNFRVLLVRVRNGKWGGVEMHNKIYAIPQEVMHGTGDELFDHIVQCIADFLE
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CCDS44 FLALDLGGTNFRVLLVRVTTG----VQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQ
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 YMGMKGVSLPLGFTFSFPCQQNSLDESILLKWTKGFKASGCEGEDVVTLLKEAIHRREEF
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CCDS44 KQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAV
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pF1KB3 DLDVVAVVNDTVGTMMTCGFEDPHCEVGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNM
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CCDS44 ELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINM
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pF1KB3 EWGAFGDNGCLDDFRTEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLL
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CCDS44 EWGAFGDDGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVL
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pF1KB3 FRGRISERLKTRGIFETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCTVVA
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CCDS44 FRGQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVS
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pF1KB3 RRAAQLCGAGMAAVVDRIRENRGLDALKVTVGVDGTLYKLHPHFAKVMHETVKDLAPKCD
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CCDS44 QRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFSSLVAATVRELAPRCV
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890 900 910
pF1KB3 VSFLQSEDGSGKGAALITAVACRIREAGQR
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CCDS44 VTFLQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQLTRV
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pF1KB3 KRLHKTVRRLVPGCDVRFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQHRARQKTLEHLQLSHDQL
:. : : ... .. : ..::....:
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pF1KB3 LEVKRRMKVEMERGLSKETHASAPVKMLPTYVCATPDGTEKGDFLALDLGGTNFRVLLVR
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CCDS54 KKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVK
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pF1KB3 VRNGKWG--GVEMHNKIYAIPQEVMHGTGDELFDHIVQCIADFLEYMGMKGVSLPLGFTF
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CCDS54 VGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTF
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::: .....:..:::.::::::::: ::..:: ::..::.:: .:..::::.:::::.::
CCDS54 SFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATM
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pF1KB3 MTCGFEDPHCEVGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNMEWGAFGDNGCLDDFR
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CCDS54 ISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFL
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pF1KB3 TEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLLFRGRISERLKTRGIF
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CCDS54 LEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAF
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pF1KB3 ETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCTVVARRAAQLCGAGMAAVV
::.:.::.::: :. ::. :::. . : ::...: :. :::..:.::.:.:.
CCDS54 ETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVI
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pF1KB3 DRIRENRGLDALKVTVGVDGTLYKLHPHFAKVMHETVKDLAPKCDVSFLQSEDGSGKGAA
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CCDS54 NRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAA
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910
pF1KB3 LITAVACRIREAGQR
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CCDS54 LVSAVACKKACMLGQ
460
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pF1KB3 QRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLLFRGRISERLKTRGIFETKFLSQIESDCLALL
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CCDS54 QLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRK
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pF1KB3 QVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCTVVARRAAQLCGAGMAAVVDRIRENRGLDALKVTV
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CCDS54 QIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITV
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CCDS54 GVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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Smith-Waterman score: 1740; 56.6% identity (84.4% similar) in 442 aa overlap (471-910:18-459)
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pF1KB3 RFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQHRARQKTLEHLQLSHDQLLEVKRRMKVEMERGLS
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CCDS54 MAMDVTRSQAQTALTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLR
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510 520 530 540 550
pF1KB3 KETHASAPVKMLPTYVCATPDGTEKGDFLALDLGGTNFRVLLVRVRNGKWG--GVEMHNK
::: : :::::::: .::.:.: ::::.::::::::::.::.: .:. : .:. ...
CCDS54 LETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQ
50 60 70 80 90 100
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 IYAIPQEVMHGTGDELFDHIVQCIADFLEYMGMKGVSLPLGFTFSFPCQQNSLDESILLK
.:.::...: ::.. :::.: .::.:::. :: .:::::::::: .....:..:::.
CCDS54 MYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLN
110 120 130 140 150 160
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 WTKGFKASGCEGEDVVTLLKEAIHRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCGFEDPHCEVGLIV
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CCDS54 WTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIV
170 180 190 200 210 220
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pF1KB3 GTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNMEWGAFGDNGCLDDFRTEFDVAVDELSLNPGK
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CCDS54 GTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQ
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CCDS54 QIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITV
350 360 370 380 390 400
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CCDS54 GVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
410 420 430 440 450 460
917 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:09:59 2016 done: Thu Nov 3 12:10:00 2016
Total Scan time: 4.120 Total Display time: 0.350
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]