Result of FASTA (omim) for
pFN21AB0019
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0019, 2843 aa
1>>>pF1KB0019 2843 - 2843 aa - 2843 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1190+/-0.000526; mu= -15.4054+/- 0.033
mean_var=414.2914+/-88.060, 0's: 0 Z-trim(119.7): 49 B-trim: 1792 in 2/57
Lambda= 0.063012
statistics sampled from 34076 (34125) to 34076 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.4), width: 16
Scan time: 22.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001120982 (OMIM: 114500,114550,135290,175100,17 (2843) 18537 1701.4 0
NP_000029 (OMIM: 114500,114550,135290,175100,17510 (2843) 18537 1701.4 0
NP_001120983 (OMIM: 114500,114550,135290,175100,17 (2825) 17037 1565.1 0
NP_005874 (OMIM: 612034,617169) adenomatous polypo (2303) 2327 227.8 1.5e-57
XP_006722672 (OMIM: 612034,617169) PREDICTED: aden (2303) 2327 227.8 1.5e-57
XP_006722670 (OMIM: 612034,617169) PREDICTED: aden (2326) 2327 227.8 1.5e-57
XP_005259532 (OMIM: 612034,617169) PREDICTED: aden (2327) 2327 227.8 1.5e-57
XP_006722673 (OMIM: 612034,617169) PREDICTED: aden (2403) 2327 227.8 1.5e-57
XP_006722671 (OMIM: 612034,617169) PREDICTED: aden (2404) 2327 227.8 1.5e-57
>>NP_001120982 (OMIM: 114500,114550,135290,175100,175100 (2843 aa)
initn: 18537 init1: 18537 opt: 18537 Z-score: 9116.8 bits: 1701.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 18537; 100.0% identity (100.0% similar) in 2843 aa overlap (1-2843:1-2843)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 RGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 QTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQRRIARIQQIEKDILRIRQLLQSQAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQRRIARIQQIEKDILRIRQLLQSQAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EAERSSQNKHETGSHDAERQNEGQGVGEINMATSGNGQGSTTRMDHETASVLSSSSTHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAERSSQNKHETGSHDAERQNEGQGVGEINMATSGNGQGSTTRMDHETASVLSSSSTHSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 PRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLPLLIQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLPLLIQLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 HGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLEQIRAYCETC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLEQIRAYCETC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 WEWQEAHEPGMDQDKNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELGGLQAIAELLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WEWQEAHEPGMDQDKNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELGGLQAIAELLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 VDCEMYGLTNDHYSITLRRYAGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALVAQLKSESEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDCEMYGLTNDHYSITLRRYAGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALVAQLKSESEDL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 QQVIASVLRNLSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLSALWNLSAHCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQVIASVLRNLSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLSALWNLSAHCT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 ENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNEDHRQILRENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNEDHRQILRENN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 CLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNLIHSKHKMIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNLIHSKHKMIAM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 GSAAALRNLMANRPAKYKDANIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAELDAQHLSETFDNIDNLS
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NP_001 GSAAALRNLMANRPAKYKDANIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAELDAQHLSETFDNIDNLS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 PKASHRSKQRHKQSLYGDYVFDTNRHDDNRSDNFNTGNMTVLSPYLNTTVLPSSSSSRGS
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NP_001 PKASHRSKQRHKQSLYGDYVFDTNRHDDNRSDNFNTGNMTVLSPYLNTTVLPSSSSSRGS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 LDSSRSEKDRSLERERGIGLGNYHPATENPGTSSKRGLQISTTAAQIAKVMEEVSAIHTS
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NP_001 LDSSRSEKDRSLERERGIGLGNYHPATENPGTSSKRGLQISTTAAQIAKVMEEVSAIHTS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 QEDRSSGSTTELHCVTDERNALRRSSAAHTHSNTYNFTKSENSNRTCSMPYAKLEYKRSS
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NP_001 QEDRSSGSTTELHCVTDERNALRRSSAAHTHSNTYNFTKSENSNRTCSMPYAKLEYKRSS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 NDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSIESYSEDDESKFCSYGQYPADLAHKIHSANHMDDNDGE
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NP_001 NDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSIESYSEDDESKFCSYGQYPADLAHKIHSANHMDDNDGE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 LDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWARPKHIIEDEIKQSEQRQSRNQSTTYPVYTE
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NP_001 LDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWARPKHIIEDEIKQSEQRQSRNQSTTYPVYTE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 STDDKHLKFQPHFGQQECVSPYRSRGANGSETNRVGSNHGINQNVSQSLCQEDDYEDDKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STDDKHLKFQPHFGQQECVSPYRSRGANGSETNRVGSNHGINQNVSQSLCQEDDYEDDKP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 TNYSERYSEEEQHEEEERPTNYSIKYNEEKRHVDQPIDYSLKYATDIPSSQKQSFSFSKS
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NP_001 TNYSERYSEEEQHEEEERPTNYSIKYNEEKRHVDQPIDYSLKYATDIPSSQKQSFSFSKS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB0 SSGQSSKTEHMSSSSENTSTPSSNAKRQNQLHPSSAQSRSGQPQKAATCKVSSINQETIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSGQSSKTEHMSSSSENTSTPSSNAKRQNQLHPSSAQSRSGQPQKAATCKVSSINQETIQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB0 TYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCNQTTQEADSANTLQIAEIKEKIGTRSAEDPV
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NP_001 TYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCNQTTQEADSANTLQIAEIKEKIGTRSAEDPV
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB0 SEVPAVSQHPRTKSSRLQGSSLSSESARHKAVEFSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEVPAVSQHPRTKSSRLQGSSLSSESARHKAVEFSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQET
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB0 PLMFSRCTSVSSLDSFESRSIASSVQSEPCSGMVSGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLMFSRCTSVSSLDSFESRSIASSVQSEPCSGMVSGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB0 PPPQTAQTKREVPKNKAPTAEKRESGPKQAAVNAAVQRVQVLPDADTLLHFATESTPDGF
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NP_001 PPPQTAQTKREVPKNKAPTAEKRESGPKQAAVNAAVQRVQVLPDADTLLHFATESTPDGF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB0 SCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPVQENDNGNETESEQPKESNENQEKEAEKTIDSE
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NP_001 SCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPVQENDNGNETESEQPKESNENQEKEAEKTIDSE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB0 KDLLDDSDDDDIEILEECIISAMPTKSSRKAKKPAQTASKLPPPVARKPSQLPVYKLLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDLLDDSDDDDIEILEECIISAMPTKSSRKAKKPAQTASKLPPPVARKPSQLPVYKLLPS
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB0 QNRLQPQKHVSFTPGDDMPRVYCVEGTPINFSTATSLSDLTIESPPNELAAGEGVRGGAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNRLQPQKHVSFTPGDDMPRVYCVEGTPINFSTATSLSDLTIESPPNELAAGEGVRGGAQ
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB0 SGEFEKRDTIPTEGRSTDEAQGGKTSSVTIPELDDNKAEEGDILAECINSAMPKGKSHKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGEFEKRDTIPTEGRSTDEAQGGKTSSVTIPELDDNKAEEGDILAECINSAMPKGKSHKP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB0 FRVKKIMDQVQQASASSSAPNKNQLDGKKKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNADSKNNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRVKKIMDQVQQASASSSAPNKNQLDGKKKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNADSKNNLN
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB0 AERVFSDNKDSKKQNLKNNSKVFNDKLPNNEDRVRGSFAFDSPHHYTPIEGTPYCFSRND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AERVFSDNKDSKKQNLKNNSKVFNDKLPNNEDRVRGSFAFDSPHHYTPIEGTPYCFSRND
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB0 SLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKAKENKESEAKVTSHTELTSNQQSANKTQAIAKQPINR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKAKENKESEAKVTSHTELTSNQQSANKTQAIAKQPINR
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB0 GQPKPILQKQSTFPQSSKDIPDRGAATDEKLQNFAIENTPVCFSHNSSLSSLSDIDQENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQPKPILQKQSTFPQSSKDIPDRGAATDEKLQNFAIENTPVCFSHNSSLSSLSDIDQENN
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB0 NKENEPIKETEPPDSQGEPSKPQASGYAPKSFHVEDTPVCFSRNSSLSSLSIDSEDDLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKENEPIKETEPPDSQGEPSKPQASGYAPKSFHVEDTPVCFSRNSSLSSLSIDSEDDLLQ
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB0 ECISSAMPKKKKPSRLKGDNEKHSPRNMGGILGEDLTLDLKDIQRPDSEHGLSPDSENFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECISSAMPKKKKPSRLKGDNEKHSPRNMGGILGEDLTLDLKDIQRPDSEHGLSPDSENFD
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB0 WKAIQEGANSIVSSLHQAAAAACLSRQASSDSDSILSLKSGISLGSPFHLTPDQEEKPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WKAIQEGANSIVSSLHQAAAAACLSRQASSDSDSILSLKSGISLGSPFHLTPDQEEKPFT
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB0 SNKGPRILKPGEKSTLETKKIESESKGIKGGKKVYKSLITGKVRSNSEISGQMKQPLQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNKGPRILKPGEKSTLETKKIESESKGIKGGKKVYKSLITGKVRSNSEISGQMKQPLQAN
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KB0 MPSISRGRTMIHIPGVRNSSSSTSPVSKKGPPLKTPASKSPSEGQTATTSPRGAKPSVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPSISRGRTMIHIPGVRNSSSSTSPVSKKGPPLKTPASKSPSEGQTATTSPRGAKPSVKS
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KB0 ELSPVARQTSQIGGSSKAPSRSGSRDSTPSRPAQQPLSRPIQSPGRNSISPGRNGISPPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELSPVARQTSQIGGSSKAPSRSGSRDSTPSRPAQQPLSRPIQSPGRNSISPGRNGISPPN
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KB0 KLSQLPRTSSPSTASTKSSGSGKMSYTSPGRQMSQQNLTKQTGLSKNASSIPRSESASKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLSQLPRTSSPSTASTKSSGSGKMSYTSPGRQMSQQNLTKQTGLSKNASSIPRSESASKG
2350 2360 2370 2380 2390 2400
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pF1KB0 LNQMNNGNGANKKVELSRMSSTKSSGSESDRSERPVLVRQSTFIKEAPSPTLRRKLEESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNQMNNGNGANKKVELSRMSSTKSSGSESDRSERPVLVRQSTFIKEAPSPTLRRKLEESA
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KB0 SFESLSPSSRPASPTRSQAQTPVLSPSLPDMSLSTHSSVQAGGWRKLPPNLSPTIEYNDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFESLSPSSRPASPTRSQAQTPVLSPSLPDMSLSTHSSVQAGGWRKLPPNLSPTIEYNDG
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KB0 RPAKRHDIARSHSESPSRLPINRSGTWKREHSKHSSSLPRVSTWRRTGSSSSILSASSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPAKRHDIARSHSESPSRLPINRSGTWKREHSKHSSSLPRVSTWRRTGSSSSILSASSES
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KB0 SEKAKSEDEKHVNSISGTKQSKENQVSAKGTWRKIKENEFSPTNSTSQTVSSGATNGAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEKAKSEDEKHVNSISGTKQSKENQVSAKGTWRKIKENEFSPTNSTSQTVSSGATNGAES
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KB0 KTLIYQMAPAVSKTEDVWVRIEDCPINNPRSGRSPTGNTPPVIDSVSEKANPNIKDSKDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTLIYQMAPAVSKTEDVWVRIEDCPINNPRSGRSPTGNTPPVIDSVSEKANPNIKDSKDN
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KB0 QAKQNVGNGSVPMRTVGLENRLNSFIQVDAPDQKGTEIKPGQNNPVPVSETNESSIVERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAKQNVGNGSVPMRTVGLENRLNSFIQVDAPDQKGTEIKPGQNNPVPVSETNESSIVERT
2710 2720 2730 2740 2750 2760
2770 2780 2790 2800 2810 2820
pF1KB0 PFSSSSSSKHSSPSGTVAARVTPFNYNPSPRKSSADSTSARPSQIPTPVNNNTKKRDSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFSSSSSSKHSSPSGTVAARVTPFNYNPSPRKSSADSTSARPSQIPTPVNNNTKKRDSKT
2770 2780 2790 2800 2810 2820
2830 2840
pF1KB0 DSTESSGTQSPKRHSGSYLVTSV
:::::::::::::::::::::::
NP_001 DSTESSGTQSPKRHSGSYLVTSV
2830 2840
>>NP_000029 (OMIM: 114500,114550,135290,175100,175100,61 (2843 aa)
initn: 18537 init1: 18537 opt: 18537 Z-score: 9116.8 bits: 1701.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 18537; 100.0% identity (100.0% similar) in 2843 aa overlap (1-2843:1-2843)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAM
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70 80 90 100 110 120
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:. : : :..:
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