Result of FASTA (ccds) for pFN21AA1938
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1938, 1343 aa
  1>>>pF1KA1938 1343 - 1343 aa - 1343 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2504+/-0.00101; mu= 4.3900+/- 0.062
 mean_var=357.2318+/-71.914, 0's: 0 Z-trim(115.1): 30  B-trim: 81 in 1/53
 Lambda= 0.067858
 statistics sampled from 15668 (15693) to 15668 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.482), width:  16
 Scan time:  4.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs108|chr6        (1343) 9089 904.8       0
CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9        (1065) 1727 184.0 1.9e-45
CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9        (1132) 1727 184.0   2e-45
CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1          (1280) 1705 181.9 9.7e-45
CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1          (1139) 1683 179.7   4e-44
CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs108|chr19       (1011) 1080 120.6 2.2e-26


>>CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs108|chr6             (1343 aa)
 initn: 9089 init1: 9089 opt: 9089  Z-score: 4823.2  bits: 904.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9089; 100.0% identity (100.0% similar) in 1343 aa overlap (1-1343:1-1343)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MSRSRASIHRGSIPAMSYAPFRDVRGPSMHRTQYVHSPYDRPGWNPRFCIISGNQLLMLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSRSRASIHRGSIPAMSYAPFRDVRGPSMHRTQYVHSPYDRPGWNPRFCIISGNQLLMLD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EDEIHPLLIRDRRSESSRNKLLRRTVSVPVEGRPHGEHEYHLGRSRRKSVPGGKQYSMEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EDEIHPLLIRDRRSESSRNKLLRRTVSVPVEGRPHGEHEYHLGRSRRKSVPGGKQYSMEG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 APAAPFRPSQGFLSRRLKSSIKRTKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 APAAPFRPSQGFLSRRLKSSIKRTKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKES
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 HSHESLLSPSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HSHESLLSPSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 KWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 ASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 QWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 AEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKGKEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMERE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKGKEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMERE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 HLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 ANLRMCCELALCKVVNSHCVFPRELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ANLRMCCELALCKVVNSHCVFPRELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 AIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSM
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 QQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLND
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 ISTALRNPNIQRQPSRQSERPRPQPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ISTALRNPNIQRQPSRQSERPRPQPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 MDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 VSMLDLQGDGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VSMLDLQGDGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSIT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 AAGMRLSQMGVTTDGVPAQQLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AAGMRLSQMGVTTDGVPAQQLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHH
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 HHHHHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HHHHHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRR
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 QLSLQDNLQHMLSPPQITIGPQRPAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QLSLQDNLQHMLSPPQITIGPQRPAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 AQKPRPSSGNLLQSPEPSYGPARPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHSQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AQKPRPSSGNLLQSPEPSYGPARPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHSQT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 PSTLNPTMPASERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRLDRVKEYEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSTLNPTMPASERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRLDRVKEYEE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 EIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIK
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 SIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNGLAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNGLAP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340   
pF1KA1 PAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
       :::::::::::::::::::::::
CCDS34 PAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
             1330      1340   

>>CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9             (1065 aa)
 initn: 3031 init1: 1706 opt: 1727  Z-score: 929.3  bits: 184.0 E(32554): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 3441; 49.4% identity (71.4% similar) in 1192 aa overlap (174-1342:1-1064)

           150       160       170       180       190       200   
pF1KA1 TKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSSAAEALELNLDED
                                     :  .:::.:::::::::::.:::.:...:.
CCDS68                               MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE
                                             10        20        30

           210       220       230       240       250       260   
pF1KA1 SIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNV
        .:::::::::::..:::::::::.:::.::::::::::.:::.:::.:::::::::...
CCDS68 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI
               40        50        60        70        80        90

           270       280       290       300       310       320   
pF1KA1 LKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRAL
       ::::.:::..:: ::.: :::::::.::::::.: ..   :.:::::::::.::: .:..
CCDS68 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKT---DNVFWGEHFEFHNLPPLRTV
              100       110       120          130       140       

           330       340       350       360       370       380   
pF1KA1 RLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGG
        .::::..:::.::.. .:.:::..:.:..:::.:.:.::::. :. .::          
CCDS68 TVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGG----------
       150       160       170       180       190                 

           390       400       410       420       430       440   
pF1KA1 GSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKG
               :: :  : .:.::::::..:::::.::::::..::::  :::.::: :..: 
CCDS68 --------KGPG--PMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKT
               200         210       220       230       240       

           450       460       470       480       490       500   
pF1KA1 KEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQ
       :::.:::::::::::::.::::.:. ::::::  . ::::::::::::::::::..:.::
CCDS68 KEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQ
       250       260       270       280       290       300       

           510       520       530       540       550       560   
pF1KA1 KYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELALCKVVNSHCVFPR
       :::.::.::::.:::::.::::::: ::.:..: :::.::.::::::.::..::.:::::
CCDS68 KYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPR
       310       320       330       340       350       360       

           570       580       590       600       610       620   
pF1KA1 ELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTL
       :::::::::: .:. ::: ::..::::::::::::::::::::::.:.:::::..:.:::
CCDS68 ELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTL
       370       380       390       400       410       420       

           630       640       650       660       670       680   
pF1KA1 TLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYI
       :::::: ::::::.:: :::....:::.::: :: .::.:: :::: .::.:...:::::
CCDS68 TLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYI
       430       440       450       460       470       480       

           690       700       710       720       730       740   
pF1KA1 DLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNPNIQRQPSRQSERPRP
       :::::::.::.::::.. :: .  . :::::::.: :. ::: .:.  . :. ..    :
CCDS68 DLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTP
       490       500       510       520       530       540       

           750       760       770       780       790       800   
pF1KA1 QPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGK
             : :.   :  .. .    ::.     ::   .:..:::::: :.         :
CCDS68 GS----GSSSISAG--LQKMVIENDLS-----GL---IDFTRLPSPTPEN---------K
           550         560            570          580             

           810       820       830       840           850         
pF1KA1 DLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSMLDLQG----DGPGGRLNSSS
       :::.:.:   .. :::  .: :. .::. .: . .::.::.:::     :: .:   . .
CCDS68 DLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPD
          590       600       610       620       630       640    

     860       870       880       890       900       910         
pF1KA1 VSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAGMRLSQMGVTTDGVPAQ
       :  : . :   ... :.:.:.    :: :  .. .. ...  ::.  .  : :..:.:..
CCDS68 V--LPTDG---QAAAAQLVAGW---PARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPG-TSEGAPGR
            650          660          670       680        690     

      920       930       940         950       960       970      
pF1KA1 -QLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGG--GHGPPSSHHHHHHHHHHRGGEPPGDTF
        ::  :::::::...:::  :  : : : .:  ::.  :::                   
CCDS68 PQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSH-------------------
         700       710       720       730                         

        980       990      1000      1010      1020      1030      
pF1KA1 APFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRRQLSLQDNLQHMLSPPQ
             :.::.:..      ::..    . ..:..    ...:::.:: ..  .   : :
CCDS68 ------SNSEELAA------AAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQ
              740             750       760       770       780    

       1040          1050      1060      1070      1080      1090  
pF1KA1 ITIGPQR----PAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSAAQKPRPSSGNLL
        . ::::    : :  :               :::  ::..    .:. : ::::::.: 
CCDS68 NSAGPQRRIDQPPPPPP--------------PPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLA
          790       800                     810       820       830

           1100       1110      1120      1130      1140      1150 
pF1KA1 QSPEPSYGPA-RPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHSQTPSTLNPTMPAS
       ..     ::. : :::: :..:.           .  :::  .  :.: :: ..:.  : 
CCDS68 SASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGD-----------SPELKPRAV--HKQGPSPVSPN--AL
              840       850                  860         870       

            1160      1170      1180      1190       1200      1210
pF1KA1 ERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRL-DRVKEYEEEIHSLKERLH
       .::.::. .:        .:.. ..:  :       :. :  :.... :...  :...:.
CCDS68 DRTAAWLLTM--------NAQLLEDE-GLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLR
         880               890        900       910       920      

             1220      1230      1240      1250      1260      1270
pF1KA1 MSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIKSIIGRLMLVE
       .:..::::::  .  ::: :.:....::::::..:.:::.:: .:: :.:.::.::: ::
CCDS68 ISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVE
        930       940       950       960       970       980      

             1280      1290      1300      1310                1320
pF1KA1 EELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLA----------PPWNGLAP
       :::..::  :   . . :....::::...  :  .: :.  :             ::..:
CCDS68 EELKKDHAEMQAAV-DSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKERYSMQARNGISP
        990      1000       1010      1020      1030      1040     

             1330      1340   
pF1KA1 PAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
         :    .:::::::::::... 
CCDS68 TNPT---KLQITENGEFRNSSNC
           1050      1060     

>>CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9             (1132 aa)
 initn: 2999 init1: 1706 opt: 1727  Z-score: 929.0  bits: 184.0 E(32554): 2e-45
Smith-Waterman score: 3631; 50.4% identity (72.8% similar) in 1225 aa overlap (107-1312:23-1123)

         80        90       100       110          120       130   
pF1KA1 SRNKLLRRTVSVPVEGRPHGEHEYHLGRSRRKSVPGG---KQYSMEGAPAAPFRPSQGFL
                                     :.:.::.   :. ::: . :.::: . :::
CCDS68         MEPDSLLDQDDSYESPQERPGSRRSLPGSLSEKSPSMEPSAATPFRVT-GFL
                       10        20        30        40         50 

           140       150       160            170       180        
pF1KA1 SRRLKSSIKRTKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSA-----DHDRARLMQSFKESHSHESLLS
       :::::.:::::::::::::. :::.::: ::::     :..:..::  .:::.:::::::
CCDS68 SRRLKGSIKRTKSQPKLDRNHSFRHILPGFRSAAAAAADNERSHLMPRLKESRSHESLLS
              60        70        80        90       100       110 

      190       200       210       220       230       240        
pF1KA1 PSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQR
       ::::.:::.:...:. .:::::::::::..:::::::::.:::.::::::::::.:::.:
CCDS68 PSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRR
             120       130       140       150       160       170 

      250       260       270       280       290       300        
pF1KA1 AVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFW
       ::.:::::::::...::::.:::..:: ::.: :::::::.::::::.: ..   :.:::
CCDS68 AVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKT---DNVFW
             180       190       200       210       220           

      310       320       330       340       350       360        
pF1KA1 GEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLP
       ::::::.::: .:.. .::::..:::.::.. .:.:::..:.:..:::.:.:.::::. :
CCDS68 GEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTP
      230       240       250       260       270       280        

      370       380       390       400       410       420        
pF1KA1 TGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHY
       .                   .:::: :  : .:.::::::..:::::.::::::..::::
CCDS68 NP------------------KGGKGPG--PMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHY
      290                           300       310       320        

      430       440       450       460       470       480        
pF1KA1 RMLCAVLEPALNVKGKEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENT
         :::.::: :..: :::.:::::::::::::.::::.:. ::::::  . :::::::::
CCDS68 LGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENT
      330       340       350       360       370       380        

      490       500       510       520       530       540        
pF1KA1 LATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCE
       :::::::::..:.:::::.::.::::.:::::.::::::: ::.:..: :::.::.::::
CCDS68 LATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCE
      390       400       410       420       430       440        

      550       560       570       580       590       600        
pF1KA1 LALCKVVNSHCVFPRELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLF
       ::.::..::.::::::::::::::: .:. ::: ::..::::::::::::::::::::::
CCDS68 LAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLF
      450       460       470       480       490       500        

      610       620       630       640       650       660        
pF1KA1 GLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEIS
       .:.:::::..:.::::::::: ::::::.:: :::....:::.::: :: .::.:: :::
CCDS68 NLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEIS
      510       520       530       540       550       560        

      670       680       690       700       710       720        
pF1KA1 NLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNP
       : .::.:...::::::::::::.::.::::.. :: .  . :::::::.: :. ::: .:
CCDS68 NPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTP
      570       580       590       600       610       620        

      730       740       750       760       770       780        
pF1KA1 NIQRQPSRQSERPRPQPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDMARLPS
       .  . :. ..    :      . :: .: .....     ::.     ::   .:..::::
CCDS68 GSGQLPGTNDLASTPGSGS-SSISAGLQKMVIEN-----DLS-----GL---IDFTRLPS
      630       640        650       660                    670    

      790       800       810       820       830       840        
pF1KA1 PTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSMLDLQG
       :: :.         ::::.:.:   .. :::  .: :. .::. .: . .::.::.::: 
CCDS68 PTPEN---------KDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQD
                   680       690       700       710       720     

          850       860       870       880       890       900    
pF1KA1 ----DGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAGM
           :: .:   . .:  : . :   ... :.:.:.    :: :  .. .. ...  ::.
CCDS68 ARTLDGEAGSPAGPDV--LPTDG---QAAAAQLVAGW---PARATPVNLAGLATVRRAGQ
         730       740            750          760       770       

          910        920       930       940       950       960   
pF1KA1 RLSQMGVTTDGVPAQ-QLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHHHHH
         .  : :..:.:.. ::  :::::::...:::  :  : : : .:..:  :   :    
CCDS68 TPTTPG-TSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSH----
       780        790       800       810       820       830      

           970       980       990      1000      1010      1020   
pF1KA1 HHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRRQLS
                          :.::.:..      ::..    . ..:..    ...:::.:
CCDS68 -------------------SNSEELAA------AAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMS
                               840             850       860       

          1030      1040          1050      1060      1070         
pF1KA1 LQDNLQHMLSPPQITIGPQR----PAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVS
       : ..  .   : : . ::::    : :  :               :::  ::..    .:
CCDS68 LTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPP--------------PPPPAPRGRTPPNLLS
       870       880       890                     900       910   

    1080      1090      1100       1110      1120      1130        
pF1KA1 AAQKPRPSSGNLLQSPEPSYGPA-RPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHS
       . : ::::::.: ..     ::. : :::: :..:.           .  :::  .  :.
CCDS68 TLQYPRPSSGTLASASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGD-----------SPELKPRAV--HK
           920       930       940                  950         960

     1140      1150      1160      1170      1180      1190        
pF1KA1 QTPSTLNPTMPASERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRL-DRVKE
       : :: ..:.  : .::.::. .:        .:.. ..:  :       :. :  :....
CCDS68 QGPSPVSPN--ALDRTAAWLLTM--------NAQLLEDE-GLGPDPPHRDRLRSKDELSQ
                970       980                990      1000         

      1200      1210      1220      1230      1240      1250       
pF1KA1 YEEEIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDS
        :...  :...:..:..::::::  .  ::: :.:....::::::..:.:::.:: .:: 
CCDS68 AEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDI
    1010      1020      1030      1040      1050      1060         

      1260      1270      1280      1290      1300      1310       
pF1KA1 QIKSIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNG
       :.:.::.::: :::::..::  :   . . :....::::...  :  .: :.  :     
CCDS68 QMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAV-DSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLK
    1070      1080      1090       1100      1110      1120        

      1320      1330      1340   
pF1KA1 LAPPAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
                                 
CCDS68 ESMH                      
     1130                        

>>CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1               (1280 aa)
 initn: 3056 init1: 1691 opt: 1705  Z-score: 916.7  bits: 181.9 E(32554): 9.7e-45
Smith-Waterman score: 3480; 45.7% identity (69.6% similar) in 1356 aa overlap (17-1341:62-1279)

                             10        20        30         40     
pF1KA1               MSRSRASIHRGSIPAMSYAPFRDVRGPSMHRTQYVHSPY-DRPGWN
                                     :..   ::.::  :: .  .::: .   :.
CCDS13 EDLDAVVPVSGAVAGGMLDRILLESVCQQQSWVRVYDVKGPPTHRLSCGQSPYTETTTWE
              40        50        60        70        80        90 

          50        60         70        80        90              
pF1KA1 PRFCIISGNQLLMLDEDEIHPLLI-RDRRSESSRNKLLRRTVSVPVEGR-----PHGEHE
        ..::.. .::..:....  :.   ......:.... :::::::: ::.     :.:  .
CCDS13 RKYCILTDSQLVLLNKEKEIPVEGGQEQQTDSTKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATK
             100       110       120       130       140       150 

     100          110           120       130       140       150  
pF1KA1 YHLG--RS-RRKSVPGG----KQYSMEGAPAAPFRPSQGFLSRRLKSSIKRTKSQPKLDR
        ..   :: ::.:. :     :  ::. : ..::.   ::.:.:::.:::::::: ::::
CCDS13 LEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANTSPFK-VPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDR
             160       170       180        190       200       210

            160       170       180       190       200       210  
pF1KA1 TSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSS
       ..:::  :: .::.: ::.: . ..:::.:::::::: :..: :.:.  :   .::.:::
CCDS13 NTSFR--LPSLRSTD-DRSRGLPKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSS
                220        230       240       250       260       

            220       230       240       250       260       270  
pF1KA1 ILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEAR
       ::::.::::::  ::.:::.: ::.:::::.:::.:.:.::::: ::..:::.::::::.
CCDS13 ILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAK
       270       280       290       300       310       320       

            280       290       300       310       320       330  
pF1KA1 ELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSD
       .: :::.:.::::::: :.:::::: ..   :..:::::::: .:: .... .:.:.: .
CCDS13 DLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKA---DNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVE
       330       340       350          360       370       380    

            340       350       360       370       380       390  
pF1KA1 KKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGK
       ::.:::: .:::::..:.:...::.:.:.::::. :: .                    :
CCDS13 KKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPN--------------------K
          390       400       410       420                        

            400       410       420       430       440       450  
pF1KA1 GKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKGKEEVASALV
       :: : :..:.:.:.::..::::: ::::::.::..: :::.::::...:..:::.: :::
CCDS13 GKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALV
          430       440       450       460       470       480    

            460       470       480       490       500       510  
pF1KA1 HILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGE
       :::::::.:::::.:..::::::  :.. :::::::.:::.::::..:.::.::.::.::
CCDS13 HILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGE
          490       500       510       520       530       540    

            520       530       540       550       560       570  
pF1KA1 FIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELALCKVVNSHCVFPRELKEVFASW
       ::.:::::.::::::: ::..: : .::.::.::::::.::..::.::::::::::::::
CCDS13 FIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASW
          550       560       570       580       590       600    

            580       590       600       610       620       630  
pF1KA1 RLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQN
       . .: .::..::..::::::::::::::::::::::.:::::::..::::::::::::::
CCDS13 KQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQN
          610       620       630       640       650       660    

            640       650       660       670       680       690  
pF1KA1 LANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTL
       ::::.:: .::....:::.::: :::.:..:: :::: ::..:. .:.::::::::::.:
CCDS13 LANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVL
          670       680       690       700       710       720    

            700       710       720        730       740       750 
pF1KA1 HALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNPN-IQRQPSRQSERPRPQPVVLRGP
       :.:::::. ::.: .. :::::::.: ::. .: ::. ::.:  : .:         .. 
CCDS13 HSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTE---------HNS
          730       740       750       760       770              

             760       770       780       790       800       810 
pF1KA1 SAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRP
       : ...: .      :  ::...    .:  :. .: ::....      :  : :. :.. 
CCDS13 SPNVSGSL------SSGLQKIFEDPTDS--DLHKLKSPSQDNTDSYFRG--KTLLLVQQA
         780             790         800       810         820     

             820       830       840       850       860       870 
pF1KA1 PLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSMLDLQGDGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLH
           :: ..  : .:  :   . :  ..:::..::: :  ..... .::  .  :   : 
CCDS13 ----SSQSMTYSEKDERE---SSLPNGRSVSLMDLQ-DTHAAQVEHASV--MLDVPIRLT
             830          840       850        860         870     

             880       890       900       910       920       930 
pF1KA1 SSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAGMRLSQMGVTTDGVPAQQLRIPLSFQNPL
       .:: :.: . ...     : .:.. .:   .   :        :.       :::::::.
CCDS13 GSQLSITQVASIKQL---RETQSTPQSAPQVRRPLHPALNQPGGLQ------PLSFQNPV
         880       890          900       910             920      

             940       950       960       970       980       990 
pF1KA1 FHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHHHHHHHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSG
       .:.    :. : .       .  :: ..               . :  .. :.:::.. .
CCDS13 YHLNNPIPAMPKA-------SIDSSLENL--------------STASSRSQSNSEDFKLS
        930              940                     950       960     

            1000      1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KA1 VPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRRQLSLQDNLQHMLSPPQITIGPQRPAPSGPGG
        :.  .   . ..: ..:      ::.::. .. :    .  : : . :  .      ::
CCDS13 GPSNSSMEDFTKRSTQSE------DFSRRH-TVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGG
         970       980              990      1000      1010        

            1060      1070      1080      1090      1100      1110 
pF1KA1 GSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSAAQKPRPSSGNLLQSPEPSYGPARPRQQSLS-
              :. .  :: : .. : . : : .      :. :.   ::  . .: :::: : 
CCDS13 L------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMS----VVSAALVA--EPVQNGSRSRQQSSSS
           1020      1030      1040          1050        1060      

             1120      1130       1140          1150      1160     
pF1KA1 KEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITK-QHSQTPSTLNP----TMPASERTVAWVSNMPHLS
       .:. .               :..   :..:: .. .:    ::   :::.::: :  .  
CCDS13 RESPV---------------PKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYE
       1070                     1080      1090      1100      1110 

        1170      1180      1190      1200      1210      1220     
pF1KA1 ADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRLDRVKEYEEEIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLS
        :.:            :  ...::..  ....::.:: .:::::..:.:.::::::::: 
CCDS13 EDVE------------ETEQNLDEAK--HAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLV
                        1120        1130      1140      1150       

        1230      1240      1250      1260      1270      1280     
pF1KA1 QEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIKSIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLP
       ::.: .:.:..:.::::.::.:::.:: :::::.::::.::: :::::..::  : . . 
CCDS13 QEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEM-QAVI
      1160      1170      1180      1190      1200      1210       

        1290      1300      1310                1320      1330     
pF1KA1 EPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPW----------NGLAPPAPPPPPRLQITENG
       . :....::::...  :  .: :.  :             ::..:     : .:.:::::
CCDS13 DAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGISPTN---PTKLSITENG
       1220      1230      1240      1250      1260         1270   

        1340   
pF1KA1 EFRNTADH
       ::.:..  
CCDS13 EFKNSSC 
          1280 

>>CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1               (1139 aa)
 initn: 2944 init1: 1588 opt: 1683  Z-score: 905.6  bits: 179.7 E(32554): 4e-44
Smith-Waterman score: 3289; 46.6% identity (69.6% similar) in 1264 aa overlap (106-1341:13-1138)

          80        90       100       110           120       130 
pF1KA1 SSRNKLLRRTVSVPVEGRPHGEHEYHLGRSRRKSVPGG----KQYSMEGAPAAPFRPSQG
                                     ::.:. :     :  ::. : ..::.   :
CCDS13                   MQTPEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANTSPFK-VPG
                                 10        20        30         40 

             140       150       160       170       180       190 
pF1KA1 FLSRRLKSSIKRTKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSS
       :.:.:::.:::::::: ::::..:::  :: .::.: ::.: . ..:::.:::::::: :
CCDS13 FFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFR--LPSLRSTD-DRSRGLPKLKESRSHESLLSPCS
              50        60          70         80        90        

             200       210       220       230       240       250 
pF1KA1 AAEALELNLDEDSIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVK
       ..: :.:.  :   .::.:::::::.::::::  ::.:::.: ::.:::::.:::.:.:.
CCDS13 TVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQ
      100       110       120       130       140       150        

             260       270       280       290       300       310 
pF1KA1 PNKDNSRRVDNVLKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEH
       ::::: ::..:::.::::::..: :::.:.::::::: :.:::::: ..   :..:::::
CCDS13 PNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKA---DNIFWGEH
      160       170       180       190       200          210     

             320       330       340       350       360       370 
pF1KA1 FEFNNLPAVRALRLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGS
       ::: .:: .... .:.:.: .::.:::: .:::::..:.:...::.:.:.::::. :: .
CCDS13 FEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPN
         220       230       240       250       260       270     

             380       390       400       410       420       430 
pF1KA1 GGSGGMGSGGGGGSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRML
                           ::: : :..:.:.:.::..::::: ::::::.::..: ::
CCDS13 --------------------KGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTML
                             280       290       300       310     

             440       450       460       470       480       490 
pF1KA1 CAVLEPALNVKGKEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLAT
       :.::::...:..:::.: ::::::::::.:::::.:..::::::  :.. :::::::.::
CCDS13 CSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIAT
         320       330       340       350       360       370     

             500       510       520       530       540       550 
pF1KA1 KAIEEYMRLIGQKYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELAL
       :.::::..:.::.::.::.::::.:::::.::::::: ::..: : .::.::.::::::.
CCDS13 KSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAF
         380       390       400       410       420       430     

             560       570       580       590       600       610 
pF1KA1 CKVVNSHCVFPRELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLM
       ::..::.::::::::::::::. .: .::..::..::::::::::::::::::::::.::
CCDS13 CKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLM
         440       450       460       470       480       490     

             620       630       640       650       660       670 
pF1KA1 QEYPDEQTSRTLTLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEISNLD
       :::::..::::::::::::::::::.:: .::....:::.::: :::.:..:: :::: :
CCDS13 QEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPD
         500       510       520       530       540       550     

             680       690       700              710       720    
pF1KA1 TLTNSSSFEGYIDLGRELSTLHALLWEVLPQLSK-------EALLKLGPLPRLLNDISTA
       :..:. .:.::::::::::.::.:::::. ::.:        .. :::::::.: ::. .
CCDS13 TISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKGENSFLQATVAKLGPLPRVLADITKS
         560       570       580       590       600       610     

           730       740       750       760       770       780   
pF1KA1 LRNPN-IQRQPSRQSERPRPQPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDM
       : ::. ::.:  : .:.         . : ...: .      :  ::...    .:  :.
CCDS13 LTNPTPIQQQLRRFTEH---------NSSPNVSGSL------SSGLQKIFEDPTDS--DL
         620       630                640             650          

           790       800       810       820       830       840   
pF1KA1 ARLPSPTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSM
        .: ::....      :  : :. :..     :: ..  : .:  : :.. :  ..:::.
CCDS13 HKLKSPSQDNTDSYFRG--KTLLLVQQA----SSQSMTYSEKD--ERESS-LPNGRSVSL
      660       670         680           690         700          

           850       860       870       880       890       900   
pF1KA1 LDLQGDGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAG
       .::: :  ..... .::  .  :   : .:: :.: . ...     : .:.. .:   . 
CCDS13 MDLQ-DTHAAQVEHASV--MLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQL---RETQSTPQSAPQVR
     710        720         730       740          750       760   

           910       920       930       940       950       960   
pF1KA1 MRLSQMGVTTDGVPAQQLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHHHHH
         :        :.       :::::::..:.    :. : .       .  :: ..    
CCDS13 RPLHPALNQPGGLQ------PLSFQNPVYHLNNPIPAMPKA-------SIDSSLENL---
           770             780       790              800          

           970       980       990      1000      1010      1020   
pF1KA1 HHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRRQLS
                  . :  .. :.:::.. . :.  .   . ..: ..:      ::.::. .
CCDS13 -----------STASSRSQSNSEDFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSE------DFSRRH-T
                  810       820       830       840                

          1030      1040      1050      1060      1070      1080   
pF1KA1 LQDNLQHMLSPPQITIGPQRPAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSAAQK
       . :    .  : : . :  .      ::       :. .  :: : .. : . : : .  
CCDS13 VPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGL------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSV-
     850       860       870             880       890       900   

          1090      1100      1110       1120      1130       1140 
pF1KA1 PRPSSGNLLQSPEPSYGPARPRQQSLS-KEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITK-QHSQTP
           :. :.   ::  . .: :::: : .:. .               :..   :..:: 
CCDS13 ---VSAALV--AEPVQNGSRSRQQSSSSRESPV---------------PKVRAIQRQQTQ
                 910       920       930                      940  

                1150      1160      1170      1180      1190       
pF1KA1 STLNP----TMPASERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRLDRVKE
       .. .:    ::   :::.::: :  .   :.:            :  ...::..  ....
CCDS13 QVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVE------------ETEQNLDEAK--HAEK
            950       960       970                   980          

      1200      1210      1220      1230      1240      1250       
pF1KA1 YEEEIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDS
       ::.:: .:::::..:.:.::::::::: ::.: .:.:..:.::::.::.:::.:: ::::
CCDS13 YEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDS
      990      1000      1010      1020      1030      1040        

      1260      1270      1280      1290      1300      1310       
pF1KA1 QIKSIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPW--
       :.::::.::: :::::..::  : . . . :....::::...  :  .: :.  :     
CCDS13 QMKSIISRLMAVEEELKKDHAEM-QAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVK
     1050      1060      1070       1080      1090      1100       

                1320      1330      1340   
pF1KA1 --------NGLAPPAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
               ::..:  :    .:.:::::::.:..  
CCDS13 ERYSMQVRNGISPTNP---TKLSITENGEFKNSSC 
      1110      1120         1130          

>>CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs108|chr19            (1011 aa)
 initn: 1270 init1: 1000 opt: 1080  Z-score: 587.3  bits: 120.6 E(32554): 2.2e-26
Smith-Waterman score: 1433; 38.6% identity (61.5% similar) in 733 aa overlap (113-817:145-831)

             90       100       110       120       130       140  
pF1KA1 RRTVSVPVEGRPHGEHEYHLGRSRRKSVPGGKQYSMEGAPAAPFRPSQGFLSRRLKSSIK
                                     ::   . :   .: ::  :  : . .  . 
CCDS46 PELEPPTPQIPEAPTPNVPVWDIGGFTLLDGKLVLLGGEEEGPRRPRVGSASSEGSIHVA
          120       130       140       150       160       170    

                      150          160       170       180         
pF1KA1 RT----------KSQPKL---DRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSP
                   :..:.    ... . : .: :..  .. .:::        .  :  : 
CCDS46 MGNFRDPDRMPGKTEPETAGPNQVHNVRGLLKRLK--EKKKARLEPRDGPPSALGSRESL
          180       190       200         210       220       230  

     190       200       210       220       230       240         
pF1KA1 SSAAEALELNLDEDSIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRA
       .. .: :.:. ..:  : :.: :.::.  ::.:: ..:..::.::::::::.:::.:.: 
CCDS46 ATLSE-LDLGAERDVRIWPLHPSLLGEPHCFQVTWTGGSRCFSCRSAAERDRWIEDLRRQ
             240       250       260       270       280       290 

     250       260       270             280       290       300   
pF1KA1 VKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEARELP------PKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASG
        .:..:: .: .. :..:. ::. ::      :  :   :: ::  : :::.  ::.. :
CCDS46 FQPTQDNVEREETWLSVWVHEAKGLPRAAAGAPGVR--AELWLDGALLARTA--PRAGPG
             300       310       320         330       340         

           310       320       330       340           350         
pF1KA1 DTVFWGEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGL----VTVPVATLAGRHFT
       . .::.:.:.:. :: .: : :.:   .  .      : :.:    . .: :  ::    
CCDS46 Q-LFWAERFHFEALPPARRLSLRLRGLGPGS---AVLGRVALALEELDAPRAPAAG---L
        350       360       370          380       390          400

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA1 EQWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKE
       :.:.:.           .:. .:.               :.: . : . . .:: : :::
CCDS46 ERWFPL-----------LGAPAGA---------------ALRARIRARRLRVLPSERYKE
                         410                      420       430    

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA1 FAEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKGKEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMER
       .::..: ::  ::..::::: ...:::.:.:.:..:..::.:. ...:.. .:. :   :
CCDS46 LAEFLTFHYARLCGALEPALPAQAKEELAAAMVRVLRATGRAQALVTDLGTAELARCGGR
          440       450       460       470       480       490    

     480       490       500       510       520       530         
pF1KA1 EHLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEH
       : :.:::::::::::.:::.:..: ::....:. .: :  : :.::::: :: :: : ::
CCDS46 EALLFRENTLATKAIDEYMKLVAQDYLQETLGQVVRRLCASTEDCEVDPSKCPASELPEH
          500       510       520       530       540       550    

     540       550       560       570       580       590         
pF1KA1 QANLRMCCELALCKVVNSHCVFPRELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLC
       :: ::  :: ..  ...:.  :: ::  ::.:::  : ::: : .. ::. ::::::.::
CCDS46 QARLRNSCEEVFETIIHSYDWFPAELGIVFSSWREACKERGSEVLGPRLVCASLFLRLLC
          560       570       580       590       600       610    

     600       610       620       630       640       650         
pF1KA1 PAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGS
       :::..::::::  ..:    .::::::::::::::: . :  :: ..:::: ::: .  .
CCDS46 PAILAPSLFGLAPDHPAPGPARTLTLIAKVIQNLANRAPFGEKEAYMGFMNSFLEEHGPA
          620       630       640       650       660       670    

     660       670       680       690       700       710         
pF1KA1 MQQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLN
       :: :: ... .:. .  :...:  ::. .:..::: :  .. .:.. .   : ::: .: 
CCDS46 MQCFLDQVAMVDVDAAPSGYQGSGDLALQLAVLHAQLCTIFAELDQTTRDTLEPLPTILR
          680       690       700       710       720       730    

     720       730       740       750        760          770     
pF1KA1 DISTALRNPNIQRQPSRQSERPRPQPVVLRGPSA-EMQGYMM-RDLNSSIDL--QSFMAR
        :  .  .: .   : :    : :   :  . :: :  :..  ::: .   :  .:   :
CCDS46 AIEEG--QPVLVSVPMRL---PLPPAQVHSSLSAGEKPGFLAPRDLPKHTPLISKSQSLR
            740       750          760       770       780         

         780       790        800       810       820       830    
pF1KA1 GLNSSMDMARLPSPTKEKP-PPPPPGGGKDLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKM
       ..  : . :: : : .:.:   : :    .   : ::   :.:                 
CCDS46 SVRRSESWAR-PRPDEERPLRRPRPVQRTQSVPVRRPARRRQSAGPWPRPKGSLSMGPAP
     790        800       810       820       830       840        

          840       850       860       870       880       890    
pF1KA1 LSVNKSVSMLDLQGDGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQG
                                                                   
CCDS46 RARPWTRDSASLPRKPSVPWQRQMDQPQDRNQALGTHRPVNKLAELQCEVAALREEQKVL
      850       860       870       880       890       900        




1343 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 11:27:21 2016 done: Thu Nov  3 11:27:21 2016
 Total Scan time:  4.730 Total Display time:  0.330

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com