Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1825
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1825, 1204 aa
1>>>pF1KA1825 1204 - 1204 aa - 1204 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9766+/-0.00095; mu= 19.2498+/- 0.057
mean_var=76.3894+/-15.209, 0's: 0 Z-trim(105.4): 68 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.146743
statistics sampled from 8358 (8425) to 8358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 5.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32970.2 ATP13A1 gene_id:57130|Hs108|chr19 (1204) 7957 1694.7 0
CCDS44072.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1 (1158) 426 100.4 2.8e-20
CCDS44073.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1 (1175) 339 82.0 9.8e-15
CCDS175.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1 (1180) 339 82.0 9.8e-15
>>CCDS32970.2 ATP13A1 gene_id:57130|Hs108|chr19 (1204 aa)
initn: 7957 init1: 7957 opt: 7957 Z-score: 9094.0 bits: 1694.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7957; 100.0% identity (100.0% similar) in 1204 aa overlap (1-1204:1-1204)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAAAAAVGNAVPCGARPCGVRPDGQPKPGPQPRALLAAGPALIANGDELVAAVWPYRRLA
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CCDS32 MAAAAAVGNAVPCGARPCGVRPDGQPKPGPQPRALLAAGPALIANGDELVAAVWPYRRLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LLRRLTVLPFAGLLYPAWLGAAAAGCWGWGSSWVQIPEAALLVLATICLAHALTVLSGHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLRRLTVLPFAGLLYPAWLGAAAAGCWGWGSSWVQIPEAALLVLATICLAHALTVLSGHW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGLEVLSFEFQKIKYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGLEVLSFEFQKIKYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 YDALEKKQFLPVAFPVGNAFSYYQSNRGFQEDSEIRAAEKKFGSNKAEMVVPDFSELFKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YDALEKKQFLPVAFPVGNAFSYYQSNRGFQEDSEIRAAEKKFGSNKAEMVVPDFSELFKE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSVFTLSMLVAFEASLVQQQMRNMSEIRKMGNKPHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSVFTLSMLVAFEASLVQQQMRNMSEIRKMGNKPHM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 IQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQENLVPCDVLLLRGRCIVDEAMLTGESVPQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQENLVPCDVLLLRGRCIVDEAMLTGESVPQM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KEPIEDLSPDRVLDLQADSRLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPVDSGCVAYVLRTGFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEPIEDLSPDRVLDLQADSRLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPVDSGCVAYVLRTGFN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 CTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 DSLVVRGVAGLRDGKEVTPVSSIPVETHRALASCHSLMQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSLVVRGVAGLRDGKEVTPVSSIPVETHRALASCHSLMQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 HSMFSQCPPDYHHIHTEISREGARVLALGYKELGHLTHQQAREVKREALECSLKFVGFIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HSMFSQCPPDYHHIHTEISREGARVLALGYKELGHLTHQQAREVKREALECSLKFVGFIV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAHTLILQPPSEKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAHTLILQPPSEKGR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 QCEWRSIDGSIVLPLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFARV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QCEWRSIDGSIVLPLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFARV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 APKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 APKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDSP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 TLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLGDASIAAPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLGDASIAAPF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 TSKLSSIQCICHVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDFQATLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSKLSSIQCICHVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDFQATLQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 GLLLAGCFLFISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFFVHFLSLVYLYREAQARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GLLLAGCFLFISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFFVHFLSLVYLYREAQARS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 PEKQEQFVDLYKEFEPSLVNSTVYIMAMAMQMATFAINYKGPPFMESLPENKPLVWSLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEKQEQFVDLYKEFEPSLVNSTVYIMAMAMQMATFAINYKGPPFMESLPENKPLVWSLAV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 SLLAIIGLLLGSSPDFNSQFGLVDIPVEFKLVIAQVLLLDFCLALLADRVLQFFLGTPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLLAIIGLLLGSSPDFNSQFGLVDIPVEFKLVIAQVLLLDFCLALLADRVLQFFLGTPKL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 KVPS
::::
CCDS32 KVPS
>>CCDS44072.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1 (1158 aa)
initn: 834 init1: 186 opt: 426 Z-score: 477.7 bits: 100.4 E(32554): 2.8e-20
Smith-Waterman score: 1033; 27.9% identity (55.1% similar) in 1037 aa overlap (148-1132:138-1035)
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GHWSVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGLEVLSFE-FQK
:... . . ::..: .. .:: . ::
CCDS44 QTEAIGEGSLEPSPQSQAEDGRSQAAVGAVPEGAWKDTAQLHKSE--EAKRVLRYYLFQG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 IKYSYDALEKKQ-FLPVAF-PVGNAFS-YYQSNRGFQ-EDSEIRAAEKKFGSNKAEMVVP
.: . .: .: : :.. : . . ..: .:.. .:. .: : .: : . :
CCDS44 QRYIW--IETQQAFYQVSLLDHGRSCDDVHRSRHGLSLQDQMVRKA--IYGPNVISIPVK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KA1 DFSELFKERATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYS--VFTLSML-VAFEASLVQQQMRNMS
.. .:. ..: :.. ::.: ..:: :.:..:. .: .: . . . ...: ...
CCDS44 SYPQLLVDEALNPYYGFQAFSIALWLADHYYWYALCIFLISSISICLSLYKTRKQSQTLR
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 EIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQEN-LVPCDVLLLRGRCIVD
.. :.. . . . ..: . :.:.:::: . . :::. :.:::. :. :.:.:.
CCDS44 DMVKLSMRVCVCRPGGEEEW--VDSSELVPGDCLVL---PQEGGLMPCDAALVAGECMVN
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 EAMLTGESVPQMKEPI-EDLSPDRVLDLQADS-RLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPV
:. :::::.: .: . : :.: :.. : :..: :: ..: .: .: :
CCDS44 ESSLTGESIPVLKTALPEGLGP-----YCAETHRRHTLFCGTLILQ----ARAYVG--P-
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 DSGCVAYVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAY-VWIE
.: : :::: :..: :. .:: ... :. : :.:. .. : ..:
CCDS44 --HVLAVVTRTGFCTAKGGLVSSILHPRPINFKFYKHSMKFVAALSVLALLGTIYSIFIL
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 GTKDPSRNRYKL---FLECTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIP
::: : .. ..: :::: :: ... . . : . ..: .:.::
CCDS44 -----YRNRVPLNEIVIRALDLVTVVVPPALPAAMTVCTLYAQSRLRRQGIFCIHPLRIN
450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KA1 FAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVAGLRDGKEVTPV----SSIPV-ETHRALASCHSL
..::... ::::::::: :.: : ::. :. :. :. .:: ::::.::.:
CCDS44 LGGKLQLVCFDKTGTLTEDGLDVMGVVPLK-GQAFLPLVPEPRRLPVGPLLRALATCHAL
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610
pF1KA1 MQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDWTLTKD---EKVFPRSI-----------KTQGLK----
.:.: : ::::.. :. .. :.: .. ...: .. . :...
CCDS44 SRLQD-TPVGDPMDLKMVESTGWVLEEEPAADSAFGTQVLAVMRPPLWEPQLQAMEEPPV
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 ---IHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETLHSMFSQ--CPPDYHHI
. .:: :.:::.::::.... :.:. : :::.:: . .. . : :. ..
CCDS44 PVSVLHRFPFSSALQRMSVVVAWP--GATQPE--AYVKGSPELVAGLCNPETVPTDFAQM
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KA1 HTEISREGARVLALGYKELGHL-THQQAREVKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVI
. : ::.::. : : . . . :... :...: .:...:..:. :: .. ::
CCDS44 LQSYTAAGYRVVALASKPLPTVPSLEAAQQLTRDTVEGDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVI
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KA1 REIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIE-KAHTLILQPPS-EKGRQCEWRSIDGSI
. .. . :.::.:::: :: ::. .. . : .:.. :.:. :..
CCDS44 QALRRTRIRAVMVTGDNLQTAVTVARGCGMVAPQEHLIIVHATHPERGQPA---SLE---
740 750 760 770 780
800 810 820 830 840 850
pF1KA1 VLPLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFARVAPKQKEFVITS
::. :: :. .:. ... . ::::.::.:: ..
CCDS44 FLPME--SPTAV----------NGV------------KVLVQGTVFARMAPEQKTELVCE
790 800 810 820
860 870 880 890 900 910
pF1KA1 LKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDSPTLSNSGIRATS
:..: : . :::::.:: :::: ::::..:
CCDS44 LQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISL------------------------------
830 840 850
920 930 940 950 960 970
pF1KA1 RTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLGDASIAAPFTSKLSSIQCIC
::. .::...::::...::.:.
CCDS44 -----------------------SQA---------------EASVVSPFTSSMASIECVP
860 870
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 HVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDFQATLQGLLLAGCF-LF
::..:::.: :....:: .:: .: : .:: .....:.: :... ..
CCDS44 MVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDLQFLAIDLVITTTVAVL
880 890 900 910 920 930
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 ISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFFVHFLSLVYLYREAQARSPEKQEQFVDL
.::. : .:.: :: .... .. ...:: . :: . . : :: :
CCDS44 MSRTGPALVLGRVRPPGALLSVPVLSSLLLQ-----MVLVTGVQLGGYFLTLAQPWFVPL
940 950 960 970 980
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 YKEFE-----PSLVNSTVYIMAMAMQMATFAINYKGPPFMESLPENKPLVWSLAVSLLAI
. :. :..:. .. . . : :: :: . : :.
CCDS44 NRTVAAPDNLPNYENTVVFSLSSFQYLILAAAVSKGAPFRRPLYTNERARPVPPRLPAPP
990 1000 1010 1020 1030 1040
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 IGLLLGSSPDFNSQFGLVDIPVEFKLVIAQVLLLDFCLALLADRVLQFFLGTPKLKVPS
CCDS44 PAQAGLQEALQAAGTRAGRAALAAAARRPPEVVQAHGHPRHWNSLPLSHQLDPSPATPPP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
>>CCDS44073.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1 (1175 aa)
initn: 925 init1: 186 opt: 339 Z-score: 378.0 bits: 82.0 E(32554): 9.8e-15
Smith-Waterman score: 1121; 27.6% identity (55.9% similar) in 1107 aa overlap (148-1191:138-1133)
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GHWSVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGLEVLSFE-FQK
:... . . ::.. :.. .:: . ::
CCDS44 QTEAIGEGSLEPSPQSQAEDGRSQAAVGAVPEGAWKDTAQLHKS--EEAKRVLRYYLFQG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 IKYSYDALEKKQ-FLPVAF-PVGNAFS-YYQSNRGFQ-EDSEIRAAEKKFGSNKAEMVVP
.: . .: .: : :.. : . . ..: .:.. .:. .: : .: : . :
CCDS44 QRYIW--IETQQAFYQVSLLDHGRSCDDVHRSRHGLSLQDQMVRKA--IYGPNVISIPVK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KA1 DFSELFKERATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYS--VFTLSML-VAFEASLVQQQMRNMS
.. .:. ..: :.. ::.: ..:: :.:..:. .: .: . . . ...: ...
CCDS44 SYPQLLVDEALNPYYGFQAFSIALWLADHYYWYALCIFLISSISICLSLYKTRKQSQTLR
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 EIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQEN-LVPCDVLLLRGRCIVD
.. :.. . . . ..: . :.:.:::: . . :::. :.:::. :. :.:.:.
CCDS44 DMVKLSMRVCVCRPGGEEEW--VDSSELVPGDCLVL---PQEGGLMPCDAALVAGECMVN
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 EAMLTGESVPQMKEPI-EDLSPDRVLDLQADS-RLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPV
:. :::::.: .: . : :.: :.. : :..: :: ..: .: .: :
CCDS44 ESSLTGESIPVLKTALPEGLGP-----YCAETHRRHTLFCGTLILQ----ARAYVG--P-
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 DSGCVAYVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAY-VWIE
.: : :::: :..: :. .:: ... :. : :.:. .. : ..:
CCDS44 --HVLAVVTRTGFCTAKGGLVSSILHPRPINFKFYKHSMKFVAALSVLALLGTIYSIFIL
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 GTKDPSRNRYKL---FLECTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIP
::: : .. ..: :::: :: ... . . : . ..: .:.::
CCDS44 -----YRNRVPLNEIVIRALDLVTVVVPPALPAAMTVCTLYAQSRLRRQGIFCIHPLRIN
450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KA1 FAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVAGLRDGKEVTPV----SSIPV-ETHRALASCHSL
..::... ::::::::: :.: : ::. :. :. :. .:: ::::.::.:
CCDS44 LGGKLQLVCFDKTGTLTEDGLDVMGVVPLK-GQAFLPLVPEPRRLPVGPLLRALATCHAL
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610
pF1KA1 MQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDWTLTKD---EKVFPRSI-----------KTQGLK----
.:.: : ::::.. :. .. :.: .. ...: .. . :...
CCDS44 SRLQD-TPVGDPMDLKMVESTGWVLEEEPAADSAFGTQVLAVMRPPLWEPQLQAMEEPPV
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 ---IHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETLHSMFSQ--CPPDYHHI
. .:: :.:::.::::.... :.:. : :::.:: . .. . : :. ..
CCDS44 PVSVLHRFPFSSALQRMSVVVAWP--GATQPE--AYVKGSPELVAGLCNPETVPTDFAQM
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KA1 HTEISREGARVLALGYKELGHL-THQQAREVKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVI
. : ::.::. : : . . . :... :...: .:...:..:. :: .. ::
CCDS44 LQSYTAAGYRVVALASKPLPTVPSLEAAQQLTRDTVEGDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVI
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770 780
pF1KA1 REIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIE-KAHTLILQPPS-EKGRQC--EWRSIDG
. .. . :.::.:::: :: ::. .. . : .:.. :.:. :. ...
CCDS44 QALRRTRIRAVMVTGDNLQTAVTVARGCGMVAPQEHLIIVHATHPERGQPASLEFLPMES
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