Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDF0002
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDF0002, 1492 aa
1>>>pF1KSDF0002 1492 - 1492 aa - 1492 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3173+/-0.000869; mu= 24.1036+/- 0.052
mean_var=80.8666+/-16.263, 0's: 0 Z-trim(107.8): 79 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.142623
statistics sampled from 9747 (9827) to 9747 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 6.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS56430.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1492) 9816 2030.4 0
CCDS4896.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1464) 5845 1213.4 0
CCDS42122.1 ABCC1 gene_id:4363|Hs108|chr16 (1531) 2452 515.2 5.9e-145
CCDS10730.1 ABCC12 gene_id:94160|Hs108|chr16 (1359) 1681 356.5 3.1e-97
CCDS31437.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1581) 1506 320.6 2.4e-86
CCDS73264.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1582) 1506 320.6 2.4e-86
CCDS10568.1 ABCC6 gene_id:368|Hs108|chr16 (1503) 1424 303.7 2.8e-81
CCDS32681.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 (1527) 1332 284.8 1.4e-75
CCDS43176.1 ABCC5 gene_id:10057|Hs108|chr3 (1437) 1317 281.7 1.1e-74
CCDS7484.1 ABCC2 gene_id:1244|Hs108|chr10 (1545) 1294 277.0 3.2e-73
CCDS9474.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 (1325) 1292 276.5 3.8e-73
CCDS10732.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1382) 1094 235.8 7.1e-61
CCDS45061.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 859) 1018 220.0 2.5e-56
CCDS76643.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 784) 914 198.5 6.5e-50
CCDS10733.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1344) 738 162.5 7.9e-39
CCDS78129.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 686) 674 149.1 4.3e-35
CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 ( 738) 623 138.6 6.6e-32
CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 630) 612 136.3 2.8e-31
CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 718) 612 136.4 3.1e-31
CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 735) 612 136.4 3.2e-31
CCDS5606.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1286) 599 133.9 3.1e-30
CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7 (1280) 587 131.4 1.7e-29
CCDS4755.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 653) 583 130.4 1.8e-29
CCDS4758.1 TAP1 gene_id:6890|Hs108|chr6 ( 808) 575 128.8 6.7e-29
CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 766) 549 123.4 2.6e-27
CCDS64800.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 693) 540 121.5 8.7e-27
CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1279) 519 117.4 2.8e-25
CCDS2436.1 ABCB6 gene_id:10058|Hs108|chr2 ( 842) 506 114.6 1.3e-24
CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 812) 494 112.1 7e-24
CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2 (1321) 495 112.5 8.7e-24
CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (1257) 494 112.3 9.7e-24
CCDS65290.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 712) 485 110.2 2.3e-23
CCDS75994.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 713) 485 110.2 2.3e-23
CCDS65291.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 752) 485 110.2 2.4e-23
CCDS14428.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 753) 485 110.2 2.4e-23
CCDS5773.1 CFTR gene_id:1080|Hs108|chr7 (1480) 485 110.5 4e-23
CCDS45739.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 ( 572) 475 108.1 8e-23
CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1232) 479 109.2 8.1e-23
CCDS8693.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 461 105.6 1.3e-21
CCDS8694.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 461 105.6 1.3e-21
CCDS58286.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 703) 429 98.7 6.6e-20
CCDS58287.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 681) 426 98.1 9.9e-20
CCDS58288.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 683) 424 97.7 1.3e-19
CCDS6762.1 ABCA1 gene_id:19|Hs108|chr9 (2261) 297 71.9 2.4e-11
>>CCDS56430.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1492 aa)
initn: 9816 init1: 9816 opt: 9816 Z-score: 10905.0 bits: 2030.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9816; 100.0% identity (100.0% similar) in 1492 aa overlap (1-1492:1-1492)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MERLLAQLCGSSAAWPLPLWEGDTTGHCFTQLVLSALPHALLAVLSACYLGTPRSPDYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MERLLAQLCGSSAAWPLPLWEGDTTGHCFTQLVLSALPHALLAVLSACYLGTPRSPDYIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PCSPGWRLRLAASFLLSVFPLLDLLPVALPPGAGPGPIGLEVLAGCVAAVAWISHSLALW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PCSPGWRLRLAASFLLSVFPLLDLLPVALPPGAGPGPIGLEVLAGCVAAVAWISHSLALW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VLAHSPHGHSRGPLALALVALLPAPALVLTVLWHCQRGTLLPPLLPGPMARLCLLILQLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VLAHSPHGHSRGPLALALVALLPAPALVLTVLWHCQRGTLLPPLLPGPMARLCLLILQLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ALLAYALGWAAPGGPREPWAQEPLLPEDQEPEVAEDGESWLSRFSYAWLAPLLARGACGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ALLAYALGWAAPGGPREPWAQEPLLPEDQEPEVAEDGESWLSRFSYAWLAPLLARGACGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LRQPQDICRLPHRLQPTYLARVFQAHWQEGARLWRALYGAFGRCYLALGLLKLVGTMLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LRQPQDICRLPHRLQPTYLARVFQAHWQEGARLWRALYGAFGRCYLALGLLKLVGTMLGF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SGPLLLSLLVGFLEEGQEPLSHGLLYALGLAGGAVLGAVLQNQYGYEVYKVTLQARGAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SGPLLLSLLVGFLEEGQEPLSHGLLYALGLAGGAVLGAVLQNQYGYEVYKVTLQARGAVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NILYCKALQLGPSRPPTGEALNLLGTDSERLLNFAGSFHEAWGLPLQLAITLYLLYQQVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NILYCKALQLGPSRPPTGEALNLLGTDSERLLNFAGSFHEAWGLPLQLAITLYLLYQQVG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VAFVGGLILALLLVPVNKVIATRIMASNQEMLQHKDARVKLVTELLSGIRVIKFCGWEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VAFVGGLILALLLVPVNKVIATRIMASNQEMLQHKDARVKLVTELLSGIRVIKFCGWEQA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LGARVEACRARELGRLRVIKYLDAACVYLWAALPVVISIVIFITYVLMGHQLTATKVFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LGARVEACRARELGRLRVIKYLDAACVYLWAALPVVISIVIFITYVLMGHQLTATKVFTA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LALVRMLILPLNNFPWVINGLLEAKVSLDRIQLFLDLPNHNPQAYYSPDPPAEPSTVLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LALVRMLILPLNNFPWVINGLLEAKVSLDRIQLFLDLPNHNPQAYYSPDPPAEPSTVLEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD HGALFSWDPVGTSLETFISHLEVKKGMLVGIVGKVGCGKSSLLAAIAGELHRLRGHVAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HGALFSWDPVGTSLETFISHLEVKKGMLVGIVGKVGCGKSSLLAAIAGELHRLRGHVAVR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GLSKGFGLATQEPWIQFATIRDNILFGKTFDAQLYKEVLEACALNDDLSILPAGDQTEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GLSKGFGLATQEPWIQFATIRDNILFGKTFDAQLYKEVLEACALNDDLSILPAGDQTEVG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EKGVTLSGGQRARIALARAVYQEKELYLLDDPLAAVDADVANHLLHRCILGMLSYTTRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EKGVTLSGGQRARIALARAVYQEKELYLLDDPLAAVDADVANHLLHRCILGMLSYTTRLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CTHRTEYLERADAVLLMEAGRLIRAGPPSEILPLVQAVPKAWAENGQESDSATAQSVQNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CTHRTEYLERADAVLLMEAGRLIRAGPPSEILPLVQAVPKAWAENGQESDSATAQSVQNP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD EKTKEGLEEEQSTSGRLLQEESKKEGAVALHVYQAYWKAVGQGLALAILFSLLLMQATRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EKTKEGLEEEQSTSGRLLQEESKKEGAVALHVYQAYWKAVGQGLALAILFSLLLMQATRN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AADWWLSHWISQLKAENSSQEAQPSTSPASMGLFSPQLLLFSPGNLYIPVFPLPKAAPNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AADWWLSHWISQLKAENSSQEAQPSTSPASMGLFSPQLLLFSPGNLYIPVFPLPKAAPNG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SSDIRFYLTVYATIAGVNSLCTLLRAVLFAAGTLQAAATLHRRLLHRVLMAPVTFFNATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SSDIRFYLTVYATIAGVNSLCTLLRAVLFAAGTLQAAATLHRRLLHRVLMAPVTFFNATP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD TGRILNRFSSDVACADDSLPFILNILLANAAGLLGLLAVLGSGLPWLLLLLPPLSIMYYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TGRILNRFSSDVACADDSLPFILNILLANAAGLLGLLAVLGSGLPWLLLLLPPLSIMYYH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VQRHYRASSRELRRLGSLTLSPLYSHLADTLAGLSVLRATGATYRFEEENLRLLELNQRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VQRHYRASSRELRRLGSLTLSPLYSHLADTLAGLSVLRATGATYRFEEENLRLLELNQRC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QFATSATMQWLDIRLQLMGAAVVSAIAGIALVQHQQGLANPGLVGLSLSYALSLTGLLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QFATSATMQWLDIRLQLMGAAVVSAIAGIALVQHQQGLANPGLVGLSLSYALSLTGLLSG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD LVSSFTQTEAMLVSVERLEEYTCDLPQEPQGQPLQLGTGWLTQGGVEFQDVVLAYRPGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LVSSFTQTEAMLVSVERLEEYTCDLPQEPQGQPLQLGTGWLTQGGVEFQDVVLAYRPGLP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD NALDGVTFCVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLLVLFRLLEPSSGRVLLDGVDTSQLELAQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NALDGVTFCVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLLVLFRLLEPSSGRVLLDGVDTSQLELAQLR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD SQLAIIPQEPFLFSGTVRENLDPQGLHKDRALWQALKQCHLSEVITSMGGLDGELGEGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SQLAIIPQEPFLFSGTVRENLDPQGLHKDRALWQALKQCHLSEVITSMGGLDGELGEGGR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD SLSLGQRQLLCLARALLTDAKILCIDEATASVDQKTDQLLQQTICKRFANKTVLTIAHRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLSLGQRQLLCLARALLTDAKILCIDEATASVDQKTDQLLQQTICKRFANKTVLTIAHRL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD NTILNSDRVLVLQAGRVVELDSPATLRNQPHSLFQQLLQSSQQGVPASLGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NTILNSDRVLVLQAGRVVELDSPATLRNQPHSLFQQLLQSSQQGVPASLGGP
1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS4896.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1464 aa)
initn: 5845 init1: 5845 opt: 5845 Z-score: 6489.2 bits: 1213.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9416; 99.0% identity (99.0% similar) in 1455 aa overlap (53-1492:10-1464)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD DTTGHCFTQLVLSALPHALLAVLSACYLGTPRSPDYILPCSPGWRLRLAASFLLSVFPLL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MCLLVFPLVPRSPDYILPCSPGWRLRLAASFLLSVFPLL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KSD DLLPVALPPGAGPGPIGLEVLAGCVAAVAWISHSLALWVLAHSPHGHSRGPLALALVALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DLLPVALPPGAGPGPIGLEVLAGCVAAVAWISHSLALWVLAHSPHGHSRGPLALALVALL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KSD PAPALVLTVLWHCQRGTLLPPLLPGPMARLCLLILQLAALLAYALGWAAPGGPREPWAQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PAPALVLTVLWHCQRGTLLPPLLPGPMARLCLLILQLAALLAYALGWAAPGGPREPWAQE
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PLLPEDQEPEVAEDGESWLSRFSYAWLAPLLARGACGELRQPQDICRLPHRLQPTYLARV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PLLPEDQEPEVAEDGESWLSRFSYAWLAPLLARGACGELRQPQDICRLPHRLQPTYLARV
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KSD FQAHWQEGARLWRALYGAFGRCYLALGLLKLVGTMLGFSGPLLLSLLVGFLEEGQEPLSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FQAHWQEGARLWRALYGAFGRCYLALGLLKLVGTMLGFSGPLLLSLLVGFLEEGQEPLSH
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KSD GLLYALGLAGGAVLGAVLQNQYGYEVYKVTLQARGAVLNILYCKALQLGPSRPPTGEALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GLLYALGLAGGAVLGAVLQNQYGYEVYKVTLQARGAVLNILYCKALQLGPSRPPTGEALN
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LLGTDSERLLNFAGSFHEAWGLPLQLAITLYLLYQQVGVAFVGGLILALLLVPVNKVIAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LLGTDSERLLNFAGSFHEAWGLPLQLAITLYLLYQQVGVAFVGGLILALLLVPVNKVIAT
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RIMASNQEMLQHKDARVKLVTELLSGIRVIKFCGWEQALGARVEACRARELGRLRVIKYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RIMASNQEMLQHKDARVKLVTELLSGIRVIKFCGWEQALGARVEACRARELGRLRVIKYL
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KSD DAACVYLWAALPVVISIVIFITYVLMGHQLTATKVFTALALVRMLILPLNNFPWVINGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DAACVYLWAALPVVISIVIFITYVLMGHQLTATKVFTALALVRMLILPLNNFPWVINGLL
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600
pF1KSD EAKVSLDRIQLFLDLPNHNPQAYYSPD---------------PPAEPSTVLELHGALFSW
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS48 EAKVSLDRIQLFLDLPNHNPQAYYSPDCGRLGAQIKWLLCSDPPAEPSTVLELHGALFSW
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DPVGTSLETFISHLEVKKGMLVGIVGKVGCGKSSLLAAIAGELHRLRGHVAVRGLSKGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DPVGTSLETFISHLEVKKGMLVGIVGKVGCGKSSLLAAIAGELHRLRGHVAVRGLSKGFG
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LATQEPWIQFATIRDNILFGKTFDAQLYKEVLEACALNDDLSILPAGDQTEVGEKGVTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LATQEPWIQFATIRDNILFGKTFDAQLYKEVLEACALNDDLSILPAGDQTEVGEKGVTLS
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GGQRARIALARAVYQEKELYLLDDPLAAVDADVANHLLHRCILGMLSYTTRLLCTHRTEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GGQRARIALARAVYQEKELYLLDDPLAAVDADVANHLLHRCILGMLSYTTRLLCTHRTEY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LERADAVLLMEAGRLIRAGPPSEILPLVQAVPKAWAENGQESDSATAQSVQNPEKTKEGL
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CCDS48 HWISQLKAENSSQEAQPSTSPASMGLFSPQLLLFSPGNLYIPVFPLPKAAPNGSSDIRFY
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CCDS48 SSRELRRLGSLTLSPLYSHLADTLAGLSVLRATGATYRFEEENLRLLELNQRCQFATSAT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MQWLDIRLQLMGAAVVSAIAGIALVQHQQGLANPGLVGLSLSYALSLTGLLSGLVSSFTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TEAMLVSVERLEEYTCDLPQEPQGQPLQLGTGWLTQGGVEFQDVVLAYRPGLPNALDGVT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FCVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLLVLFRLLEPSSGRVLLDGVDTSQLELAQLRSQLAIIP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QEPFLFSGTVRENLDPQGLHKDRALWQALKQCHLSEVITSMGGLDGELGEGGRSLSLGQR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QLLCLARALLTDAKILCIDEATASVDQKTDQLLQQTICKRFANKTVLTIAHRLNTILNSD
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RVLVLQAGRVVELDSPATLRNQPHSLFQQLLQSSQQGVPASLGGP
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:..:. : : : :.: :
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:: .:. ..: .. . . :. . . . ::.. .. . . ..
CCDS42 SLNKEDTSEQVVPVLVKNWKKECAKTRKQPVKVVYSSKDPAQPKESSKVDANEEVEALIV
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. : .:. . :...:: .:: .: ..: . .. :::: .:.::. :... . :
CCDS42 KSPQKEWNPS--LFKVLYKTFGPYFLMSFFFKAIHDLMMFSGPQILKLLIKFVNDTKAPD
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330 340 350 360 370
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.: .:.. : : : ... .:: . . .. . ::.. .: ::: . : : .
CCDS42 WQGYFYTVLLFVTACLQTLVLHQYFHICFVSGMRIKTAVIGAVYRKALVITNSARKSSTV
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:: .::...:..:....: .. :. :::. ..::::. ..: . ..:. . .:.::::
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:.: . . . .. :: :.::..:.:.::.:.:. .:: :. .: : : .:: :.
CCDS42 AVMAMKTKTYQVAHMKSKDNRIKLMNEILNGIKVLKLYAWELAFKDKVLAIRQEELKVLK
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::.:. .. :. : .... : .:: . .. : : .:..::: .: .::: .:
CCDS42 KSAYLSAVGTFTWVCTPFLVALCTFAVYVTIDENNILDAQTAFVSLALFNILRFPLNILP
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560 570 580 590 600 610
pF1KSD WVINGLLEAKVSLDRIQLFLDLPNHNPQAY-YSPDPPAEPSTVLELHGALFSW---DPVG
::.....:.::: :...::. . .:.. : . .. . ...: :.: ::
CCDS42 MVISSIVQASVSLKRLRIFLSHEELEPDSIERRPVKDGGGTNSITVRNATFTWARSDPPT
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pF1KSD TSLETFISHLEVKKGMLVGIVGKVGCGKSSLLAAIAGELHRLRGHVAVRGLSKGFGLATQ
. :: . .: ::..::.:::::::::.:. .:. ...::::..: . . . :
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pF1KSD EPWIQFATIRDNILFGKTFDAQLYKEVLEACALNDDLSILPAGDQTEVGEKGVTLSGGQR
. ::: ..:.::::: .. :. :..:::: :: :::.::.::.:::::.:::::.
CCDS42 QAWIQNDSLRENILFGCQLEEPYYRSVIQACALLPDLEILPSGDRTEIGEKGVNLSGGQK
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pF1KSD ARIALARAVYQEKELYLLDDPLAAVDADVANHLLHRCI--LGMLSYTTRLLCTHRTEYLE
:..::::::.. ..::.::::.:::: :..:... : :::. ::.: :: ::
CCDS42 QRVSLARAVYSNADIYLFDDPLSAVDAHVGKHIFENVIGPKGMLKNKTRILVTHSMSYLP
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pF1KSD RADAVLLMEAGRLIRAGPPSEILPLVQAVP---KAWAENGQESDSAT--AQSVQNPEKTK
..:....: .:.. . : .:.: : ...: . ::.:. . .:..:
CCDS42 QVDVIIVMSGGKISEMGSYQELLARDGAFAEFLRTYASTEQEQDAEENGVTGVSGP----
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pF1KSD EGLEEEQSTSGRLLQEESKKEGAVALHVYQAYWKAVGQGLALAILFSLLLMQATRNAADW
: : .: .: :. . . :. : ..: ... . :..: . .
CCDS42 -GKEAKQMENGMLVTDSAGKQLQRQLSSSSSYSGDISRHHNS----TAELQKAEAKKEET
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910 920 930 940 950
pF1KSD WLSHWISQLKAENSSQEAQPSTSP-----ASMGLFSPQLLLFS---------PGNLYIPV
: .: ...: .: . : ..::: : .: .: .. .
CCDS42 W------KLMEADKAQTGQVKLSVYWDYMKAIGLFISFLSIFLFMCNHVSALASNYWLSL
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. ::... . :.::.... ... .. .. . : . :. :: ::: .:
CCDS42 WT-DDPIVNGTQEHTKVRLSVYGALGISQGIAVFGYSMAVSIGGILASRCLHVDLLHSIL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD MAPVTFFNATPTGRILNRFSSDVACADDSLPFILNILLANAAGLLGLLAVLGSGLPWLLL
.:..::. ::.: ..::::... .:. .: ........ ...: :. . : .
CCDS42 RSPMSFFERTPSGNLVNRFSKELDTVDSMIPEVIKMFMGSLFNVIGACIVILLATPIAAI
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pF1KSD LLPPLSIMYYHVQRHYRASSRELRRLGSLTLSPLYSHLADTLAGLSVLRATGATYRF-EE
..:::...:. ::: : ::::.:.:: :.. ::.:::. .:: :.::.:: :: ..
CCDS42 IIPPLGLIYFFVQRFYVASSRQLKRLESVSRSPVYSHFNETLLGVSVIRAFEEQERFIHQ
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.:.. : ::. . . .. .:: .::. .: .: : .:...... . ::::::.
CCDS42 SDLKVDE-NQKAYYPSIVANRWLAVRLECVGNCIVLFAALFAVISRHS--LSAGLVGLSV
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::.:..: :. :: .. :. .:.::::.::. . : : : ..: : ::
CCDS42 SYSLQVTTYLNWLVRMSSEMETNIVAVERLKEYSETEKEAPWQIQETAPPSSWPQVGRVE
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:.. : :: : .: .. .. :::.:::::::.::::: : :::. : . :....:
CCDS42 FRNYCLRYREDLDFVLRHINVTINGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLGLFRINESAEGEIIID
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pF1KSD GVDTSQLELAQLRSQLAIIPQEPFLFSGTVRENLDPQGLHKDRALWQALKQCHLSEVITS
:.. ... : .:: ...::::.: ::::..: :::: . ..:. .: .:. ::.. ...
CCDS42 GINIAKIGLHDLRFKITIIPQDPVLFSGSLRMNLDPFSQYSDEEVWTSLELAHLKDFVSA
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1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD MGG-LDGELGEGGRSLSLGQRQLLCLARALLTDAKILCIDEATASVDQKTDQLLQQTICK
. :: : .:::..::.:::::.::::::: .::: .:::::.:: .::.:.:.::
CCDS42 LPDKLDHECAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKILVLDEATAAVDLETDDLIQSTIRT
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pF1KSD RFANKTVLTIAHRLNTILNSDRVLVLQAGRVVELDSPATLRNQPHSLFQQLLQSSQQGVP
.: . ::::::::::::.. ::.::. :.. : .:. : .: ..:: .. ...
CCDS42 QFEDCTVLTIAHRLNTIMDYTRVIVLDKGEIQEYGAPSDLLQQ-RGLFYSMAKDAGLV
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1490
pF1KSD ASLGGP
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CCDS10 EGPYLISDLDQRGRRRSFAERYDPSLKTMIPVRPCARLAPNPVDDAGLLSFATFSWLTPV
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pF1KSD LARGACGELRQPQDICRLPHRLQPTYL-----ARVFQAHW-QEGARLW--RA----LYGA
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CCDS10 MVKG----YRQRLTVDTLPP--LSTYDSSDTNAKRFRVLWDEEVARVGPEKASLSHVVWK
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pF1KSD FGRCYLALGLL-KLVGTMLGFSGPLLLSLLVGFLEEGQEPLSHGLLYALGLAGGAVLGAV
: : . . .. ... ... ::..: . . . : : . ..:: :....
CCDS10 FQRTRVLMDIVANILCIIMAAIGPVIL---IHQILQQTERTSGKVWVGIGLCI-ALFATE
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pF1KSD LQNQYGYEV-----YKVTLQARGAVLNILYCKALQLGP-SRPPTGEALNLLGTDSERLLN
. . . . . :..... . :. .... . ... .. .::.::.:..:: :..
CCDS10 FTKVFFWALAWAINYRTAIRLKVALSTLVFENLVSFKTLTHISVGEVLNILSSDSYSLFE
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pF1KSD FAGSFHEAWGLPLQLAITLYLLYQQVGVAFVGGLILALLLVPVNKVIATRIMASNQEMLQ
: .:. ... . .: . . :. . ....::. .: : . .
CCDS10 AALFCPLPATIPILMVFCAAYAFFILGPTALIGISVYVIFIPVQMFMAKLNSAFRRSAIL
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pF1KSD HKDARVKLVTELLSGIRVIKFCGWEQALGARVEACRARELGRLRVIKYLDAACVYLWAAL
: ::. ..:.:. ::.::. .::... .. : :: :. ..... :
CCDS10 VTDKRVQTMNEFLTCIRLIKMYAWEKSFTNTIQDIRRRERKLLEKAGFVQSGNS---ALA
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pF1KSD PVVISIVIFIT---YVLMGHQLTATKVFTALALVRMLILPLNNFPWVINGLLEAKVSLDR
:.: .:.: .: ..:. ..::: .:...:. .. . . .:. :... ::.::: :
CCDS10 PIVSTIAIVLTLSCHILLRRKLTAPVAFSVIAMFNVMKFSIAILPFSIKAMAEANVSLRR
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pF1KSD IQLFLDLPNHNPQAYYSPDPPAEPSTVLELHGALFSWD----------------------
.. .: ...: .: . : .:.::: : .: ..:.
CCDS10 MKKIL--IDKSPPSYITQ--PEDPDTVLLLANATLTWEHEASRKSTPKKLQNQKRHLCKK
420 430 440 450 460
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pF1KSD -----------PV---------GTSLETFISHLE--VKKGMLVGIVGKVGCGKSSLLAAI
:. . ::.. . . :.:: ..:: :.:: ::::::::.
CCDS10 QRSEAYSERSPPAKGATGPEEQSDSLKSVLHSISFVVRKGKILGICGNVGSGKSSLLAAL
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pF1KSD AGELHRLRGHVAVRGLSKGFGLATQEPWIQFATIRDNILFGKTFDAQLYKEVLEACALND
:... .: ::: : .. ..:. :: ...:.:::::. .: : :......:.:.
CCDS10 LGQMQLQKGVVAVNGT---LAYVSQQAWIFHGNVRENILFGEKYDHQRYQHTVRVCGLQK
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD DLSILPAGDQTEVGEKGVTLSGGQRARIALARAVYQEKELYLLDDPLAAVDADVANHLLH
::: :: :: ::.::.:..:::::: ::.::::::....::::::::.:::: :..:...
CCDS10 DLSNLPYGDLTEIGERGLNLSGGQRQRISLARAVYSDRQLYLLDDPLSAVDAHVGKHVFE
590 600 610 620 630 640
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pF1KSD RCILGMLSYTTRLLCTHRTEYLERADAVLLMEAGRLIRAGPPSEILP-------LVQ---
.:: : : .: ::. ..:: : :.:.: :.. . : .:.. :..
CCDS10 ECIKKTLRGKTVVLVTHQLQFLESCDEVILLEDGEICEKGTHKELMEERGRYAKLIHNLR
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pF1KSD -------------AVPKAWAENGQESDSATAQSVQNPEKTK-EGLEEEQSTS--------
:. .:. :. : . .. : : . : :: : : ..
CCDS10 GLQFKDPEHLYNAAMVEAFKESPAEREEDAGIIVLAPGNEKDEGKESETGSEFVDTKVPE
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pF1KSD GRLLQEESKKEGAVALHVYQAYWKAVGQGL-ALAILFSLLLMQATRNAADWWLSHWISQL
.:.: :: .::.:. ..:..: :: : : .: .: .::: .. ..:::. :..
CCDS10 HQLIQTESPQEGTVTWKTYHTYIKASGGYLLSLFTVFLFLLMIGSAAFSNWWLGLWLD--
770 780 790 800 810 820
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pF1KSD KAENSSQEAQPSTSPASMGLFSPQLLLFSPG-NLYIPVFPLPKAAPNGSSDIRFYLTVYA
:. . : . . .: .: . : ..: :. .... :.:
CCDS10 KGSRMTCGPQGNRTMCEVGA-----VLADIGQHVYQWVY---------TASMVFML----
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pF1KSD TIAGVNSLCTLLRAVLFAAGTLQAAATLHRRLLHRVLMAPVTFFNATPTGRILNRFSSDV
. ::. .. .:. ::.:...:: .. ..: .:..::..:::::..::::.:.
CCDS10 -VFGVT------KGFVFTKTTLMASSSLHDTVFDKILKSPMSFFDTTPTGRLMNRFSKDM
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pF1KSD ACADDSLPFILNILLANAAGLLGLLAVLGSGLPWLLLLLPPLSIMYYHVQRHYRASSREL
: ::: . .: . .. .:..:.. .: .::.. :.. .. . : .. . .::
CCDS10 DELDVRLPFHAENFLQQFFMVVFILVILAAVFPAVLLVVASLAVGFFILLRIFHRGVQEL
920 930 940 950 960 970
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pF1KSD RRLGSLTLSPLYSHLADTLAGLSVLRATGATYRFEEENLRLLELNQRCQFATSATMQWLD
... ... :: ..:..... ::....: : . . .:: .: : ...:.
CCDS10 KKVENVSRSPWFTHITSSMQGLGIIHAYGK--KESCITYHLLYFN--C------ALRWFA
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pF1KSD IRLQLMGAAVVSAIAGIALVQHQQGLANPGLVGLSLSYALSLTGLLSGLVSSFTQTEAML
.:.... .. ..: .. .. .. . . :::::: ..:.:::. : . :.:.: .
CCDS10 LRMDVLMNILTFTVALLVTLSFSS--ISTSSKGLSLSYIIQLSGLLQVCVRTGTETQAKF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD VSVERLEEY--TCDLPQEPQGQPLQLGT---GWLTQGGVEFQDVVLAYRPGLPNALDGVT
.::: :.:: :: .:. . ::..:: : ..: . :.: . :: . : .::...
CCDS10 TSVELLREYISTC-VPECTH--PLKVGTCPKDWPSRGEITFRDYQMRYRDNTPLVLDSLN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD FCVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLLVLFRLLEPSSGRVLLDGVDTSQLELAQLRSQLAIIP
. .: :. .::::::::::::: ..::::.::.:: ...: :: : : .::..:..::
CCDS10 LNIQSGQTVGIVGRTGSGKSSLGMALFRLVEPASGTIFIDEVDICILSLEDLRTKLTVIP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KSD QEPFLFSGTVRENLDPQGLHKDRALWQALKQCHLSEVITSMG-GLDGELGEGGRSLSLGQ
:.: :: :::: :::: : :. :::.:.. . ..: .. :..:. :.:...:.:.
CCDS10 QDPVLFVGTVRYNLDPFESHTDEMLWQVLERTFMRDTIMKLPEKLQAEVTENGENFSVGE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD RQLLCLARALLTDAKILCIDEATASVDQKTDQLLQQTICKRFANKTVLTIAHRLNTILNS
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CCDS10 RQLLCVARALLRNSKIILLDEATASMDSKTDTLVQNTIKDAFKGCTVLTIAHRLNTVLNC
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KSD DRVLVLQAGRVVELDSPATLRNQPHSLFQQLLQSSQQGVPASLGGP
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CCDS10 DHVLVMENGKVIEFDKPEVLAEKPDSAFAMLLAAEVRL
1330 1340 1350
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CCDS31 FVSSQEFLANAYVLAVLLFLALLLQRTFLQASYYVAIETGINLRGAIQTKIYNKIMHLST
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380 390 400 410 420
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: .:. ::.. . ... .:.:.. .. :. .: . .. .. . .:..:.: .
CCDS31 TRRKEMTSLRAFAIYTSISIFMNTAIPIAAVLITFVGHVSFFKEADFSPSVAFASLSLFH
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CCDS31 PRGQLTMIVGQVGCGKSSLLLAALGEMQKVSGAVFWSSLPDSEIGEDPSPERETATDLDI
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:.:..:::::: ::..:::.::. .. .::::..:.: ...::.. :: .: :
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. .:. : :: . .:. :::.: ..: .: :: . :.: ..
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:. : ..:: :: . . : :.::..: .:. :.. :. :
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: ::: ::.:...::. ::..:: : :::::::: :. .: :. : .. ..
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1060 1070 1080 1090 1100 1110
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:::.. : .:. : ::.:. : .:...:..::.:..: . : :: ::.:.:. ::..
CCDS31 LAVISYVTPVFLVALLPLAIVCYFIQKYFRVASRDLQQLDDTTQLPLLSHFAETVEGLTT
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.:: ::... :. . :. .. .:. .::..:.. .:: :: .:...:. :
CCDS31 IRAFRYEARFQQKLLEYTDSNNIASLFLTAANRWLEVRMEYIGACVVLIAAVTSISNSLH
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.. . :::::.:.::: ... :. .: .... : .: .:.:.. . .:
CCDS31 RE--LSAGLVGLGLTYALMVSNYLNWMVRNLADMELQLGAVKRIHGLLKTEAESYEGLLA
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CCDS31 PSLIPKNWPDQGKIQIQNLSVRYDSSLKPVLKHVNALIAPGQKIGICGRTGSGKSSFSLA
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CCDS31 FFRMVDTFEGHIIIDGIDIAKLPLHTLRSRLSIILQDPVLFSGTIRFNLDPERKCSDSTL
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pF1KSD WQALKQCHLSEVITSM-GGLDGELGEGGRSLSLGQRQLLCLARALLTDAKILCIDEATAS
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CCDS31 WEALEIAQLKLVVKALPGGLDAIITEGGENFSQGQRQLFCLARAFVRKTSIFIMDEATAS
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CCDS31 IDMATENILQKVVMTAFADRTVVTIAHRVHTILSADLVIVLKRGAILEFDKPEKLLSRKD
1520 1530 1540 1550 1560 1570
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CCDS31 SVFASFVRADK
1580
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CCDS73 TYWWMNAFIKTAH----KKPIDLRAIGKLPIAMRALTNYQRLCEAFDAQVRKDIQGTQGA
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CCDS73 FVSSQEFLANAYVLAVLLFLALLLQRTFLQASYYVAIETGINLRGAIQTKIYNKIMHLST
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CCDS73 SNLSMGEMTAGQICNLVAIDTNQLMWFFFLCPNLWAMPVQIIVGVILLYYILGVSALIGA
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD ILALLLVPVNKVIATRIMASNQEMLQHKDARVKLVTELLSGIRVIKFCGWEQALGARVEA
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CCDS73 AVIILLAPVQYFVATKLSQAQRSTLEYSNERLKQTNEMLRGIKLLKLYAWENIFRTRVET
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pF1KSD CRARELGRLRVIKYLDAACVYLWAALPVVISIVIFITYVLMGHQ--LTATKVFTALALVR
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CCDS73 TRRKEMTSLRAFAIYTSISIFMNTAIPIAAVLITFVGHVSFFKEADFSPSVAFASLSLFH
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pF1KSD MLILPLNNFPWVINGLLEAKVSLDRIQLFLD---------LPN----HNPQAYYSPDP--
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CCDS73 ILVTPLFLLSSVVRSTVKALVSVQKLSEFLSSAEIREEQCAPHEPTPQGPASKYQAVPLR
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pF1KSD ------PAE--------------PST-------VLELHGALFSWDPVGTSLETFISHLEV
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CCDS73 VVNRKRPAREDCRGLTGPLQSLVPSADGDADNCCVQIMGGYFTWTPDGIPTLSNIT-IRI
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CCDS73 PRGQLTMIVGQVGCGKSSLLLAALGEMQKVSGAVFWSSSLPDSEIGEDPSPERETATDLD
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CCDS73 VVLVTHKLQYLPHADWIIAMKDGTIQREGTLKDFQRSECQLFEHWKTLMNRQDQELEKET
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CCDS73 YLSSAGILLLSLLVFSQLLKHMVLVAIDYWLAKWT------DSALTLTPAARNCSL---S
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CCDS73 ALAVISYVTPVFLVALLPLAIVCYFIQKYFRVASRDLQQLDDTTQLPLLSHFAETVEGLT
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CCDS73 TIRAFRYEARFQQKLLEYTDSNNIASLFLTAANRWLEVRMEYIGACVVLIAAVTSISNSL
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CCDS73 HRE--LSAGLVGLGLTYALMVSNYLNWMVRNLADMELQLGAVKRIHGLLKTEAESYEGLL
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CCDS73 APSLIPKNWPDQGKIQIQNLSVRYDSSLKPVLKHVNALIAPGQKIGICGRTGSGKSSFSL
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CCDS73 AFFRMVDTFEGHIIIDGIDIAKLPLHTLRSRLSIILQDPVLFSGTIRFNLDPERKCSDST
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1580
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840 850 860
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CCDS10 KDPRGTSAGRRPELRRERSIKSVPEKDRTTSEAQTEVPLDDPDRAGWPAGKDSIQYGRVK
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CCDS10 TFQGSTVVRAFRTQAPFVAQNNARVDESQRISFPRLVADRWLAANVELLGNGLVFAAATC
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CCDS10 ATAAVDPGTELQMQAMLGSWFAQCTVLLIAHRLRSVMDCARVLVMDKGQVAESGSPAQLL
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CCDS32 DIYVVDEVLAPVILMLLNSFFNAISTLVVIMASTPLFTVVILPLAVLYTLVQRFYAATSR
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CCDS32 QLKRLESVSRSPIYSHFSETVTGASVIRAYNRSRDFEIISDTKVDANQRSCYPYIISNRW
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CCDS32 LSIGVEFVGNCVVLFAALFAVIGRSS--LNPGLVGLSVSYSLQVTFALNWMIRMMSDLES
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1220 1230 1240 1250 1260
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CCDS32 NIVAVERVKEYSKTETEAPWVVEGSRPPE---GWPPRGEVEFRNYSVRYRPGLDLVLRDL
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pF1KSD TFCVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLLVLFRLLEPSSGRVLLDGVDTSQLELAQLRSQLAII
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CCDS32 SLHVHGGEKVGIVGRTGAGKSSMTLCLFRILEAAKGEIRIDGLNVADIGLHDLRSQLTII
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pF1KSD PQEPFLFSGTVRENLDPQGLHKDRALWQALKQCHLSEVITSM-GGLDGELGEGGRSLSLG
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CCDS32 PQDPILFSGTLRMNLDPFGSYSEEDIWWALELSHLHTFVSSQPAGLDFQCSEGGENLSVG
1370 1380 1390 1400 1410 1420
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CCDS32 QRQLVCLARALLRKSRILVLDEATAAIDLETDNLIQATIRTQFDTCTVLTIAHRLNTIMD
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1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD SDRVLVLQAGRVVELDSPATLRNQPHSLFQQLLQSSQQGVPASLGGP
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CCDS32 YTRVLVLDKGVVAEFDSPANLIAARGIFYGMARDAGLA
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CCDS43 LDEEHPKGKYHHGLSALKPIRTTSKHQHPVDNAGLFSCMTFSWLSSL-ARVAHKKGELSM
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pF1KSD PQDICRLPHRLQPTYLARVFQAHWQE--------GARLWRALYGAFGRCYLALGLLKLVG
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