Result of FASTA (omim) for
pFN21ASDB3800
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB3800, 1323 aa
1>>>pF1KSDB3800 1323 - 1323 aa - 1323 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1230+/-0.000418; mu= 15.7144+/- 0.026
mean_var=131.0436+/-27.766, 0's: 0 Z-trim(115.1): 171 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.112038
statistics sampled from 25162 (25337) to 25162 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 17.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004790 (OMIM: 603755) zinc finger FYVE domain-c (1425) 8942 1457.9 0
XP_011540739 (OMIM: 603755) PREDICTED: zinc finger (1425) 8942 1457.9 0
XP_016858334 (OMIM: 603755) PREDICTED: zinc finger (1167) 7085 1157.7 0
NP_015563 (OMIM: 603755) zinc finger FYVE domain-c (1366) 4466 734.4 1.3e-210
NP_001271165 (OMIM: 608880) zinc finger FYVE domai (1539) 1962 329.7 9.9e-89
NP_001098721 (OMIM: 608880) zinc finger FYVE domai (1539) 1962 329.7 9.9e-89
NP_055548 (OMIM: 608880) zinc finger FYVE domain-c (1539) 1962 329.7 9.9e-89
XP_016865585 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger ( 632) 1954 328.1 1.2e-88
XP_016865584 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger ( 727) 1954 328.2 1.3e-88
XP_016865582 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger ( 727) 1954 328.2 1.3e-88
XP_016865583 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger ( 727) 1954 328.2 1.3e-88
XP_016865580 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger (1539) 1954 328.4 2.4e-88
XP_005248689 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger (1539) 1954 328.4 2.4e-88
XP_016865581 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger (1539) 1954 328.4 2.4e-88
XP_011542055 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger (1539) 1954 328.4 2.4e-88
NP_001271166 (OMIM: 608880) zinc finger FYVE domai ( 809) 388 75.1 2.3e-12
NP_060821 (OMIM: 613520) FYVE, RhoGEF and PH domai (1430) 297 60.5 9.6e-08
NP_076976 (OMIM: 613504) zinc finger FYVE domain-c ( 234) 245 51.6 7.7e-06
NP_001185882 (OMIM: 613504) zinc finger FYVE domai ( 252) 245 51.6 8.2e-06
NP_077286 (OMIM: 615200) pleckstrin homology domai ( 279) 244 51.5 9.9e-06
XP_011525611 (OMIM: 615200) PREDICTED: pleckstrin ( 279) 244 51.5 9.9e-06
NP_775829 (OMIM: 605091) FYVE, RhoGEF and PH domai ( 655) 249 52.6 1.1e-05
XP_005259313 (OMIM: 615200) PREDICTED: pleckstrin ( 364) 244 51.6 1.2e-05
NP_078889 (OMIM: 615208) pleckstrin homology domai ( 249) 238 50.5 1.8e-05
NP_001291413 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 422) 239 50.8 2.4e-05
NP_001291412 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 471) 239 50.8 2.6e-05
XP_011518861 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 511) 239 50.9 2.8e-05
XP_005253367 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 518) 239 50.9 2.8e-05
XP_011518860 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 567) 239 50.9 3.1e-05
XP_016874294 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 582) 239 50.9 3.1e-05
XP_011518859 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 582) 239 50.9 3.1e-05
XP_005253365 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 673) 239 50.9 3.5e-05
NP_001317303 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 673) 239 50.9 3.5e-05
XP_005253366 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 673) 239 50.9 3.5e-05
NP_001317302 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 673) 239 50.9 3.5e-05
NP_640334 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF and P ( 766) 239 51.0 3.9e-05
XP_011518858 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 766) 239 51.0 3.9e-05
XP_011518857 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 766) 239 51.0 3.9e-05
NP_001291410 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 851) 239 51.0 4.2e-05
XP_011518856 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 864) 239 51.0 4.3e-05
NP_001291409 (OMIM: 609311,611104) FYVE, RhoGEF an ( 878) 239 51.0 4.3e-05
XP_016874292 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 914) 239 51.0 4.5e-05
XP_005253361 (OMIM: 609311,611104) PREDICTED: FYVE ( 930) 239 51.0 4.5e-05
XP_005257843 (OMIM: 603559) PREDICTED: myotubulari (1195) 238 50.9 6.2e-05
NP_004678 (OMIM: 603559) myotubularin-related prot (1195) 238 50.9 6.2e-05
XP_006722231 (OMIM: 603559) PREDICTED: myotubulari (1195) 238 50.9 6.2e-05
XP_005257842 (OMIM: 603559) PREDICTED: myotubulari (1199) 238 50.9 6.2e-05
XP_011523762 (OMIM: 603559) PREDICTED: myotubulari (1199) 238 50.9 6.2e-05
XP_005257841 (OMIM: 603559) PREDICTED: myotubulari (1209) 238 51.0 6.3e-05
NP_001171471 (OMIM: 121850,609414) 1-phosphatidyli ( 548) 232 49.8 6.5e-05
>>NP_004790 (OMIM: 603755) zinc finger FYVE domain-conta (1425 aa)
initn: 8942 init1: 8942 opt: 8942 Z-score: 7811.9 bits: 1457.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8942; 99.9% identity (99.9% similar) in 1323 aa overlap (1-1323:103-1425)
10 20 30
pF1KSD MWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SLAHSAPLTTEEEDHCANGQDCNLNPEIATMWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KSD EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KSD MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KSD QVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTK
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KSD NKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRSCLALAPDSPDND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_004 NKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRPCLALAPDSPDND
620 630 640 650 660 670
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
680 690 700 710 720 730
640 650 660 670 680 690
pF1KSD CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
740 750 760 770 780 790
700 710 720 730 740 750
pF1KSD QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
800 810 820 830 840 850
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
860 870 880 890 900 910
820 830 840 850 860 870
pF1KSD VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
920 930 940 950 960 970
880 890 900 910 920 930
pF1KSD VGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGG
980 990 1000 1010 1020 1030
940 950 960 970 980 990
pF1KSD FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMN
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD SGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDD
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD KNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADH
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD SRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDL
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1300 1310 1320
pF1KSD DSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
1400 1410 1420
>>XP_011540739 (OMIM: 603755) PREDICTED: zinc finger FYV (1425 aa)
initn: 8942 init1: 8942 opt: 8942 Z-score: 7811.9 bits: 1457.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8942; 99.9% identity (99.9% similar) in 1323 aa overlap (1-1323:103-1425)
10 20 30
pF1KSD MWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLAHSAPLTTEEEDHCANGQDCNLNPEIATMWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KSD EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KSD MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KSD QVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTK
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KSD NKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRSCLALAPDSPDND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
XP_011 NKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRPCLALAPDSPDND
620 630 640 650 660 670
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
680 690 700 710 720 730
640 650 660 670 680 690
pF1KSD CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
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700 710 720 730 740 750
pF1KSD QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
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820 830 840 850 860 870
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDL
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:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
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Smith-Waterman score: 7085; 98.6% identity (99.1% similar) in 1063 aa overlap (1-1063:103-1164)
10 20 30
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
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pF1KSD QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
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pF1KSD SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGG
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pF1KSD FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .: :
XP_016 RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEVSSA-N
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pF1KSD KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
. :: . :.
XP_016 TLVRSGLARNICWMKT
1160
>>NP_015563 (OMIM: 603755) zinc finger FYVE domain-conta (1366 aa)
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10 20 30
pF1KSD MWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 SLAHSAPLTTEEEDHCANGQDCNLNPEIATMWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
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pF1KSD EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
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pF1KSD DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
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pF1KSD GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
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pF1KSD MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
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pF1KSD EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
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340 350 360 370 380 390
pF1KSD GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
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400 410 420 430 440 450
pF1KSD KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_015 NKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRPCLALAPDSPDND
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pF1KSD LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
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pF1KSD CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
:::::::::::::::::::::::::::
NP_015 CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMN---------------------------------
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pF1KSD QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 --------------------------VAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
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760 770 780 790 800 810
pF1KSD SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
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pF1KSD VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
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pF1KSD VGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 VGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGG
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940 950 960 970 980 990
pF1KSD FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
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1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMN
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD SGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 SGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDD
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD KNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 KNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADH
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD SRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 SRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDL
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1300 1310 1320
pF1KSD DSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 DSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
1340 1350 1360
>>NP_001271165 (OMIM: 608880) zinc finger FYVE domain-co (1539 aa)
initn: 1917 init1: 1072 opt: 1962 Z-score: 1714.0 bits: 329.7 E(85289): 9.9e-89
Smith-Waterman score: 2570; 37.6% identity (64.1% similar) in 1374 aa overlap (90-1322:216-1538)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQTDQFSFSINESTE--KDMNSEKQMDPLNRP
.:....: .:. . : .:. ... .:
NP_001 REQQNDISSELQNREIGGIKELGIKVDTTLSDSYNYSGTENLKDKKIFNQLESIVDFNMS
190 200 210 220 230 240
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSP-SQLKDDGSIGRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGC
.. :. ... ..:.: .: . ::: : . .. ....::. .. .: .
NP_001 SALTRQSSKMFH-AKDKLQHKSQPCGLLKDVGLVKEEVDVAVITAAE---CLKEEGKTSA
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220
pF1KSD PAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSHMSEGILMKKEPAEESTTEE-------
. . .: ::: . :. : . . .:: . . ..:. :.: . .
NP_001 LTCSLPKN----EDLCLNDSNSRDENFKLPDFSFQEDKTVIKQSAQEDSKSLDLKDNDVI
310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KSD -SLRSGLPLLLKPDMPNG-SGRNNDCERCSDCLVPNEVRADENEGYEHEETLGTT-----
. :.: . : :.:.. : . :.. :. ...:.: .::.... .
NP_001 QDSSSALHVSSK-DVPSSLSCLPASGSMCGS-LIESKARGDFLPQHEHKDNIQDAVTIHE
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290 300 310 320 330
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NP_055 DSEAPNCMNCQVKFTFTKRRHHCRACGKVFCGVCCNRKCKLQYLE-KEARVCVVCYETIS
750 760 770 780 790 800
660 670 680 690 700 710
pF1KSD NAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQAQASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAE
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NP_055 KAQAFERMMSPTGSNLKSNHSDE-CTTVQPPQENQTS---SIPSPATL-PVSALKQPGVE
810 820 830 840 850 860
720 730 740 750 760
pF1KSD VAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS---------------SAGTLAVSHDP
.::.::::::::::::::::..::. .:.. ...:. ::.
NP_055 GLCSKEQKRVWFADGILPNGEVADTTKLS-SGSKRCSEDFSPLSPDVPMTVNTVDHSHST
870 880 890 900 910
770 780
pF1KSD V--KP-----------VTTSPL---PAETDICL--------FSGSIT----------QVG
. :: . ::. :. . . :::.: . .
NP_055 TVEKPNNETGDITRNEIIQSPISQVPSVEKLSMNTGNEGLPTSGSFTLDDDVFAETEEPS
920 930 940 950 960 970
790 800 810
pF1KSD SPVGSAMN--------------------------LIP--EDGLPPILISTGVKGDY-AVE
::.: .: :.: ::.:::.:...: ::. .::
NP_055 SPTGVLVNSNLPIASISDYRLLCDINKYVCNKISLLPNDEDSLPPLLVASGEKGSVPVVE
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pF1KSD EKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHAVGQSEIVI
:.::. ... :: : :..:::::::: ::.. : . : : :.:.:.:..::.::.:
NP_055 EHPSHEQIILLLEGEGFHPVTFVLNANLLVNVKFIFYSSDKYWYFSTNGLHGLGQAEIII
1040 1050 1060 1070 1080 1090
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGGFLYVTSTY
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NP_055 LLLCLPNEDTIPKDIFRLFITIYKDALKGKYIENLDNITFTESFLSSKDHGGFLFITPTF
1100 1110 1120 1130 1140 1150
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pF1KSD QSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSVRFRKPLFG
:.:.:: ::. :.: :::::: : :::::::.::::::::::. :: :: :.: ::::::
NP_055 QKLDDLSLPSNPFLCGILIQKLEIPWAKVFPMRLMLRLGAEYKAYPAPLTSIRGRKPLFG
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD ETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMNKSNEHVLA
: ::::::::.:.::::::: .. :.. ::. :. :::: ..:...::..:.:::::..
NP_055 EIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHMEMGKSCIKIPRKKYSDVMKVLNSSNEHVIS
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD GGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSSSGYLAKSS
:: :. .:::::::.::: : :.::: : ..::::::::: ::.::::.:::.:::::
NP_055 IGASFSTEADSHLVCIQND-GIYETQANSATGHPRKVTGASFVVFNGALKTSSGFLAKSS
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD IVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDDKNVSKGVV
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NP_055 IVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLREYVDICWVDAEEKGNKGVI
1340 1350 1360 1370 1380 1390
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pF1KSD SPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADHSRLTEHVA
: .:: :.. . . :: ...... :... ::::.. .:.. . :: ......:
NP_055 SSVDGISLQGFPSEKIKLEADFETDEKIVKCTEVFYFLKDQDLSILST---SYQFAKEIA
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pF1KSD KAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDLDSALVPVI
: ::::::: :: .::.:.::::..:.:.: .::::.:: ::..:.:::::::.:::
NP_055 MACSAALCPHLKTLKSNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGQLLPQHYLNDLDSALIPVI
1460 1470 1480 1490 1500 1510
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pF1KSD HGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
:::. . : :. .::.:.:.:..
NP_055 HGGTSN-SSLPLEIELVFFIIEHLF
1520 1530
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pF1KSD MVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMN----GTSSAGTLAVSH
: ..: .. ::.:: : ..:.....
XP_016 VNTVDHSHSTTVEKPNNETGDITRNEIIQSPISQVPSVEKLSMNTGNEGLPTSGSFTLDD
10 20 30 40 50 60
760 770 780 790 800
pF1KSD DPVKPVT--TSPLPAETDICLFSGSITQ------VGSPVGSAMNLIP--EDGLPPILIST
: . .:: . .. : .::.. ... : . ..:.: ::.:::.:...
XP_016 DVFAETEEPSSPTGVLVNSNLPIASISDYRLLCDINKYVCNKISLLPNDEDSLPPLLVAS
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pF1KSD GVKGDY-AVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGM
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XP_016 GEKGSVPVVEEHPSHEQIILLLEGESFHPVTFVLNANLLVNVKFIFYSSDKYWYFSTNGL
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pF1KSD HAVGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEH
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XP_016 HGLGQAEIIILLLCLPNEDTIPKDIFRLFITIYKDALKGKYIENLDNITFTESFLSSKDH
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pF1KSD GGFLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLF
::::..: :.:.:.:: ::. :.: :::::: : :::::::.::::::::::. :: ::
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pF1KSD SVRFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKA
:.: ::::::: ::::::::.:.::::::: .. :.. ::. :. :::: ..:...::.
XP_016 SIRGRKPLFGEIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHMEMGKSCIKIPRKKYSDVMKV
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pF1KSD MNKSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALK
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XP_016 LNSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCIQND-GIYETQANSATGHPRKVTGASFVVFNGALK
370 380 390 400 410 420
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pF1KSD SSSGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVD
.:::.::::::::::.::::: :.:..:: ::::.::: :::::.:: . .:.. : :::
XP_016 TSSGFLAKSSIVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLREYVDICWVD
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pF1KSD DDKNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPA
... .:::.: .:: :.. . . :: ...... :... ::::.. .:.. . ::
XP_016 AEEKGNKGVISSVDGISLQGFPSEKIKLEADFETDEKIVKCTEVFYFLKDQDLSILST--
490 500 510 520 530
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD DHSRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMN
......: : ::::::: :: .::.:.::::..:.:.: .::::.:: ::..:.:
XP_016 -SYQFAKEIAMACSAALCPHLKTLKSNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGQLLPQHYLN
540 550 560 570 580 590
1290 1300 1310 1320
pF1KSD DLDSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
::::::.::::::. . : :. .::.:.:.:..
XP_016 DLDSALIPVIHGGTSN-SSLPLEIELVFFIIEHLF
600 610 620 630
>>XP_016865584 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger FYV (727 aa)
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pF1KSD KCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQAQAS
::: .... . :. : :.:. : :. :.:
XP_016 MMSPTGSNLKSNHSDE-CTTVQPPQENQTS
10 20
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pF1KSD GALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS---
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XP_016 ---SIPSPATL-PVSALKQPGVEGLCSKEQKRVWFADGILPNGEVADTTKLS-SGSKRCS
30 40 50 60 70 80
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pF1KSD ------------SAGTLAVSHDPV--KP-----------VTTSPL---PAETDICL----
...:. ::. . :: . ::. :. . .
XP_016 EDFSPLSPDVPMTVNTVDHSHSTTVEKPNNETGDITRNEIIQSPISQVPSVEKLSMNTGN
90 100 110 120 130 140
780 790
pF1KSD ----FSGSIT----------QVGSPVGSAMN--------------------------LIP
:::.: . .::.: .: :.:
XP_016 EGLPTSGSFTLDDDVFAETEEPSSPTGVLVNSNLPIASISDYRLLCDINKYVCNKISLLP
150 160 170 180 190 200
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pF1KSD --EDGLPPILISTGVKGDY-AVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNY
::.:::.:...: ::. .:::.::. ... :: . :..:::::::: ::.. :
XP_016 NDEDSLPPLLVASGEKGSVPVVEEHPSHEQIILLLEGESFHPVTFVLNANLLVNVKFIFY
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD VNRKCWCFTTKGMHAVGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGH
. : : :.:.:.:..::.::.::: :::.: .::::: :. .:.::: :. . :: .
XP_016 SSDKYWYFSTNGLHGLGQAEIIILLLCLPNEDTIPKDIFRLFITIYKDALKGKYIENLDN
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD SFFSQSFLGSKEHGGFLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLR
:..:::.::.:::::..: :.:.:.:: ::. :.: :::::: : :::::::.:::::
XP_016 ITFTESFLSSKDHGGFLFITPTFQKLDDLSLPSNPFLCGILIQKLEIPWAKVFPMRLMLR
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD LGAEYRLYPCPLFSVRFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSI
:::::. :: :: :.: ::::::: ::::::::.:.::::::: .. :.. ::. :. :
XP_016 LGAEYKAYPAPLTSIRGRKPLFGEIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHMEMGKSCI
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD KIPSNRYNEMMKAMNKSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKV
::: ..:...::..:.:::::.. :: :. .:::::::.::: : :.::: : ..::::
XP_016 KIPRKKYSDVMKVLNSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCIQND-GIYETQANSATGHPRKV
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD TGASFFVFSGALKSSSGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADA
::::: ::.::::.:::.::::::::::.::::: :.:..:: ::::.::: :::::.::
XP_016 TGASFVVFNGALKTSSGFLAKSSIVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDA
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD EEPQEHIHIQWVDDDKNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFL
. .:.. : ::: ... .:::.: .:: :.. . . :: ...... :... ::::..
XP_016 VDLREYVDICWVDAEEKGNKGVISSVDGISLQGFPSEKIKLEADFETDEKIVKCTEVFYF
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pF1KSD ENDDQHNCLSDPADHSRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQA
.:.. . :: ......: : ::::::: :: .::.:.::::..:.:.: .::
XP_016 LKDQDLSILSTSY---QFAKEIAMACSAALCPHLKTLKSNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQA
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD GSNGQPLPSQYMNDLDSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
::.:: ::..:.:::::::.::::::. . : :. .::.:.:.:..
XP_016 GSEGQLLPQHYLNDLDSALIPVIHGGTSN-SSLPLEIELVFFIIEHLF
690 700 710 720
>>XP_016865582 (OMIM: 608880) PREDICTED: zinc finger FYV (727 aa)
initn: 1549 init1: 1064 opt: 1954 Z-score: 1711.7 bits: 328.2 E(85289): 1.3e-88
Smith-Waterman score: 2078; 47.6% identity (71.9% similar) in 737 aa overlap (664-1322:1-726)
640 650 660 670 680 690
pF1KSD KCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQAQAS
::: .... . :. : :.:. : :. :.:
XP_016 MMSPTGSNLKSNHSDE-CTTVQPPQENQTS
10 20
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS---
: : :... ::..::.::.: .::.::::::::::::::::..::. .:..
XP_016 ---SIPSPATL-PVSALKQPGVEGLCSKEQKRVWFADGILPNGEVADTTKLS-SGSKRCS
30 40 50 60 70 80
760 770
pF1KSD ------------SAGTLAVSHDPV--KP-----------VTTSPL---PAETDICL----
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XP_016 EDFSPLSPDVPMTVNTVDHSHSTTVEKPNNETGDITRNEIIQSPISQVPSVEKLSMNTGN
90 100 110 120 130 140
780 790
pF1KSD ----FSGSIT----------QVGSPVGSAMN--------------------------LIP
:::.: . .::.: .: :.:
XP_016 EGLPTSGSFTLDDDVFAETEEPSSPTGVLVNSNLPIASISDYRLLCDINKYVCNKISLLP
150 160 170 180 190 200
800 810 820 830 840 850
pF1KSD --EDGLPPILISTGVKGDY-AVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNY
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XP_016 NDEDSLPPLLVASGEKGSVPVVEEHPSHEQIILLLEGESFHPVTFVLNANLLVNVKFIFY
210 220 230 240 250 260
860 870 880 890 900 910
pF1KSD VNRKCWCFTTKGMHAVGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGH
. : : :.:.:.:..::.::.::: :::.: .::::: :. .:.::: :. . :: .
XP_016 SSDKYWYFSTNGLHGLGQAEIIILLLCLPNEDTIPKDIFRLFITIYKDALKGKYIENLDN
270 280 290 300 310 320
920 930 940 950 960 970
pF1KSD SFFSQSFLGSKEHGGFLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLR
:..:::.::.:::::..: :.:.:.:: ::. :.: :::::: : :::::::.:::::
XP_016 ITFTESFLSSKDHGGFLFITPTFQKLDDLSLPSNPFLCGILIQKLEIPWAKVFPMRLMLR
330 340 350 360 370 380
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD LGAEYRLYPCPLFSVRFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSI
:::::. :: :: :.: ::::::: ::::::::.:.::::::: .. :.. ::. :. :
XP_016 LGAEYKAYPAPLTSIRGRKPLFGEIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHMEMGKSCI
390 400 410 420 430 440
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD KIPSNRYNEMMKAMNKSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKV
::: ..:...::..:.:::::.. :: :. .:::::::.::: : :.::: : ..::::
XP_016 KIPRKKYSDVMKVLNSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCIQND-GIYETQANSATGHPRKV
450 460 470 480 490 500
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD TGASFFVFSGALKSSSGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADA
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XP_016 TGASFVVFNGALKTSSGFLAKSSIVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDA
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pF1KSD EEPQEHIHIQWVDDDKNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFL
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XP_016 VDLREYVDICWVDAEEKGNKGVISSVDGISLQGFPSEKIKLEADFETDEKIVKCTEVFYF
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.:.. . :: ......: : ::::::: :: .::.:.::::..:.:.: .::
XP_016 LKDQDLSILSTSY---QFAKEIAMACSAALCPHLKTLKSNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQA
630 640 650 660 670 680
1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD GSNGQPLPSQYMNDLDSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
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XP_016 GSEGQLLPQHYLNDLDSALIPVIHGGTSN-SSLPLEIELVFFIIEHLF
690 700 710 720
1323 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:44:27 2016 done: Thu Nov 3 08:44:30 2016
Total Scan time: 17.420 Total Display time: 0.530
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]