Result of FASTA (ccds) for pFN21ASDB0022
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0022, 520 aa
  1>>>pF1KSDB0022 520 - 520 aa - 520 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6231+/-0.00117; mu= -12.2164+/- 0.071
 mean_var=502.4979+/-100.574, 0's: 0 Z-trim(116.4): 39  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.057215
 statistics sampled from 16960 (16995) to 16960 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.796), E-opt: 0.2 (0.522), width:  16
 Scan time:  4.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1143.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1           ( 521) 3519 304.8 1.6e-82
CCDS60304.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1          ( 514) 3448 298.9 9.1e-81
CCDS81920.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15         ( 505) 1516 139.4 9.1e-33
CCDS53978.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15         ( 497) 1492 137.4 3.6e-32
CCDS45362.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15         ( 499) 1450 134.0 3.9e-31
CCDS45363.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15         ( 437)  990 96.0 9.6e-20
CCDS54878.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5          ( 483)  934 91.4 2.5e-18
CCDS78034.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5          ( 465)  929 90.9 3.3e-18
CCDS47245.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5          ( 473)  905 89.0 1.3e-17
CCDS47244.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5          ( 463)  856 84.9 2.1e-16
CCDS58401.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15         ( 429)  810 81.1 2.8e-15


>>CCDS1143.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1                (521 aa)
 initn: 3705 init1: 3519 opt: 3519  Z-score: 1595.1  bits: 304.8 E(32554): 1.6e-82
Smith-Waterman score: 3519; 99.8% identity (100.0% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLLS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PQQPALQRNSVSPGLPQRPASAGAMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLPVANG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PQQPALQRNSVSPGLPQRPASAGAMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLPVANG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD NSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQRLGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQRLGV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD VTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAPPPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAPPPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYET
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520 
pF1KSD GDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRLDTWVL 
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: 
CCDS11 GDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRLDTWTLK
              490       500       510       520 

>>CCDS60304.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1               (514 aa)
 initn: 3502 init1: 1933 opt: 3448  Z-score: 1563.5  bits: 298.9 E(32554): 9.1e-81
Smith-Waterman score: 3448; 98.5% identity (98.7% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-513)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLLS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PQQPALQRNSVSPGLPQRPASAGAMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLPVANG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PQQPALQRNSVSPGLPQRPASAGAMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLPVANG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD NSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQRLGV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       ::::::::
CCDS60 NSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHL-------NNAQRLGV
              250       260       270       280              290   

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGN
           300       310       320       330       340       350   

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD VTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSP
           360       370       380       390       400       410   

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAPPPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAPPPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYET
           420       430       440       450       460       470   

              490       500       510       520 
pF1KSD GDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRLDTWVL 
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: 
CCDS60 GDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRLDTWTLK
           480       490       500       510    

>>CCDS81920.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15              (505 aa)
 initn: 1544 init1: 620 opt: 1516  Z-score: 701.8  bits: 139.4 E(32554): 9.1e-33
Smith-Waterman score: 1699; 54.3% identity (73.2% similar) in 549 aa overlap (1-519:1-504)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
       :::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS81 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYAST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
       :::::::::::::::::::::.::.:::::::.:::.:  ::..: .:.::: ::.. . 
CCDS81 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCES--PDADDYFEHSPLSEDRFSKL
               70        80        90         100       110        

              130       140       150       160       170          
pF1KSD SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSS-LTDPRLL
       .:. : .:.:    .:  ::.: :::::.. ..:...::..:::.:::..:: :::  .:
CCDS81 NEDSDFIFKRGPPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLTDSSML
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200           210       220       230     
pF1KSD SPQQPALQRNSVSPGLPQRPAS---AGAMLGG-DLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLL
       :: : .:.:: :::: :::: :   ::.::.  ::.  :::  ::::::.:..::::.:.
CCDS81 SPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNLI
      180        190       200       210       220       230       

         240       250       260       270       280        290    
pF1KSD PVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDH-LDLNN
        ....:::.::.:.::::::  .. ::  ::::::::.   ..::.:  :.:.. :.::.
CCDS81 GATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGN-LGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLSEEEELELNT
       240       250       260        270       280       290      

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD AQRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPG
        ::.. ::.:. :.::::::.::::  ::: .:.:::::::::.::::.::.: .:.:::
CCDS81 -QRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFNSPG
         300       310       320       330       340       350     

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD GLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSN
        ::::.:.::::                                       ::  ..::.
CCDS81 MLSLGQVSAWQQ--------------------------------------HHLGQAALSS
         360                                             370       

          420       430       440        450                       
pF1KSD LIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRER-SPA--------------PPPPAVF
       :. :. : . :. :...:. .:::::::.:: :.: .:.              ::::   
CCDS81 LVAGGQLSQ-GSNLSINTNQNISIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPPPPQPQ
       380        390       400       410       420       430      

     460                470       480       490       500       510
pF1KSD PAA-RPEP----G----DGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAV
       :   .:.:    :    :.::: ...::. .::.: ::::   . : ::    . :. .:
CCDS81 PQPPQPQPRQEMGRSPVDSLSS-SSSSYDGSDREDPRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPSV
        440       450        460       470       480       490     

              520
pF1KSD KRMRLDTWVL
       ::::.:.:: 
CCDS81 KRMRMDAWVT
         500     

>>CCDS53978.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15              (497 aa)
 initn: 1622 init1: 620 opt: 1492  Z-score: 691.1  bits: 137.4 E(32554): 3.6e-32
Smith-Waterman score: 1675; 53.8% identity (72.1% similar) in 548 aa overlap (1-519:1-496)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
       :::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS53 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYAST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
       :::::::::::::::::::::.::.:::::::.:::.:  ::..: .:.::: ::.. . 
CCDS53 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCES--PDADDYFEHSPLSEDRFSKL
               70        80        90         100       110        

              130       140       150       160       170          
pF1KSD SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSS-LTDPRLL
       .:. : .:.:    .:  ::.: :::::.. ..:...::..:::.:::..:: :::  .:
CCDS53 NEDSDFIFKRGPPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLTDSSML
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200           210       220       230     
pF1KSD SPQQPALQRNSVSPGLPQRPAS---AGAMLGG-DLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLL
       :: : .:.:: :::: :::: :   ::.::.  ::.  :::  ::::::.:..::::.:.
CCDS53 SPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNLI
      180        190       200       210       220       230       

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD PVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNA
        ....:::.::.:.::::::  .. ::  ::::::::.   ..::.:  :        :.
CCDS53 GATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGN-LGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPL--------NT
       240       250       260        270       280                

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD QRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGG
       ::.. ::.:. :.::::::.::::  ::: .:.:::::::::.::::.::.: .:.::: 
CCDS53 QRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFNSPGM
      290       300       310       320       330       340        

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD LSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNL
       ::::.:.::::                                       ::  ..::.:
CCDS53 LSLGQVSAWQQ--------------------------------------HHLGQAALSSL
      350                                             360       370

         420       430       440        450                     460
pF1KSD IPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRER-SPA--------------PPPPAVFP
       . :. : . :. :...:. .:::::::.:: :.: .:.              ::::   :
CCDS53 VAGGQLSQ-GSNLSINTNQNISIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPPPPQPQP
               380       390       400       410       420         

                       470       480       490       500       510 
pF1KSD AA-RPEP----G----DGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVK
          .:.:    :    :.::: ...::. .::.: ::::   . : ::    . :. .::
CCDS53 QPPQPQPRQEMGRSPVDSLSS-SSSSYDGSDREDPRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPSVK
     430       440       450        460       470       480        

             520
pF1KSD RMRLDTWVL
       :::.:.:: 
CCDS53 RMRMDAWVT
      490       

>>CCDS45362.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15              (499 aa)
 initn: 1766 init1: 764 opt: 1450  Z-score: 672.4  bits: 134.0 E(32554): 3.9e-31
Smith-Waterman score: 1633; 52.9% identity (71.1% similar) in 550 aa overlap (1-519:1-498)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
       :::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS45 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYAST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
       :::::::::::::::::::::.::.:.: ::   :::::.::   :   .:  :.::.. 
CCDS45 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKEHRGCDSPDPD--TSYVLTPHTEEKYKKI
               70        80        90       100         110        

                130       140       150       160       170        
pF1KSD SEELDGLFR--RYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSS-LTDPR
       .::.:...:  . .  .:  ::.: :::::.. ..:...::..:::.:::..:: :::  
CCDS45 NEEFDNMMRNHKIAPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLTDSS
      120       130       140       150       160       170        

       180       190       200           210       220       230   
pF1KSD LLSPQQPALQRNSVSPGLPQRPAS---AGAMLGG-DLNSANGACPSPVGNGYVSARASPG
       .::: : .:.:: :::: :::: :   ::.::.  ::.  :::  ::::::.:..::::.
CCDS45 MLSPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPN
      180       190        200       210       220       230       

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD LLPVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLN
       :. ....:::.::.:.::::::  .. ::  ::::::::.   ..::.:  :        
CCDS45 LIGATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGN-LGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPL--------
       240       250       260        270       280                

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD NAQRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSP
       :.::.. ::.:. :.::::::.::::  ::: .:.:::::::::.::::.::.: .:.::
CCDS45 NTQRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFNSP
      290       300       310       320       330       340        

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD GGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLS
       : ::::.:.::::                                       ::  ..::
CCDS45 GMLSLGQVSAWQQ--------------------------------------HHLGQAALS
      350       360                                             370

           420       430       440        450                      
pF1KSD NLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRER-SPA--------------PPPPAV
       .:. :. : . :. :...:. .:::::::.:: :.: .:.              ::::  
CCDS45 SLVAGGQLSQ-GSNLSINTNQNISIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPPPPQP
              380        390       400       410       420         

      460                470       480       490       500         
pF1KSD FPAA-RPEP----G----DGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSA
        :   .:.:    :    :.::: ...::. .::.: ::::   . : ::    . :. .
CCDS45 QPQPPQPQPRQEMGRSPVDSLSS-SSSSYDGSDREDPRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPS
     430       440       450        460       470       480        

     510       520
pF1KSD VKRMRLDTWVL
       :::::.:.:: 
CCDS45 VKRMRMDAWVT
      490         

>>CCDS45363.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15              (437 aa)
 initn: 1195 init1: 432 opt: 990  Z-score: 467.9  bits: 96.0 E(32554): 9.6e-20
Smith-Waterman score: 1173; 46.8% identity (69.0% similar) in 464 aa overlap (86-519:18-436)

          60        70        80        90       100       110     
pF1KSD QYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLED
                                     .::::::.:::.::  :..: .:.::: ::
CCDS45              MGRKKIQITRIMDERNRQTLRKKGLNGCESP--DADDYFEHSPLSED
                            10        20        30          40     

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD KYRRASEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSS-LT
       .. . .:. : .:.:    .:  ::.: :::::.. ..:...::..:::.:::..:: ::
CCDS45 RFSKLNEDSDFIFKRGPPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLT
          50        60        70        80        90       100     

          180       190       200           210       220       230
pF1KSD DPRLLSPQQPALQRNSVSPGLPQRPAS---AGAMLGG-DLNSANGACPSPVGNGYVSARA
       :  .::: : .:.:: :::: :::: :   ::.::.  ::.  :::  ::::::.:..::
CCDS45 DSSMLSPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRA
         110       120        130       140       150       160    

              240       250       260       270       280          
pF1KSD SPGLLPVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDH-
       ::.:. ....:::.::.:.::::::  .. ::  ::::::::.   ..::.:  :.:.. 
CCDS45 SPNLIGATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGN-LGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLSEEEE
          170       180       190        200       210       220   

     290       300       310       320       330       340         
pF1KSD LDLNNAQRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPA
       :.::. ::.. ::.:. :.::::::.::::  ::: .:.:::::::::.::::.::.: .
CCDS45 LELNT-QRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQG
            230       240       250       260       270       280  

     350       360       370       380       390       400         
pF1KSD FSSPGGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVP
       :.::: ::::.:.::::                                       ::  
CCDS45 FNSPGMLSLGQVSAWQQ--------------------------------------HHLGQ
            290                                             300    

     410       420       430       440        450                  
pF1KSD VSLSNLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRER-SPA--------------PP
       ..::.:. :. : . :. :...:. .:::::::.:: :.: .:.              ::
CCDS45 AALSSLVAGGQLSQ-GSNLSINTNQNISIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPP
          310        320       330       340       350       360   

          460                470       480       490       500     
pF1KSD PPAVFPAA-RPEP----G----DGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEA
       ::   :   .:.:    :    :.::: ...::. .::.: ::::   . : ::    . 
CCDS45 PPQPQPQPPQPQPRQEMGRSPVDSLSS-SSSSYDGSDREDPRGDFHSPIVLGRPPNTEDR
           370       380       390        400       410       420  

         510       520
pF1KSD EGSAVKRMRLDTWVL
       :. .:::::.:.:: 
CCDS45 ESPSVKRMRMDAWVT
            430       

>>CCDS54878.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5               (483 aa)
 initn: 1261 init1: 649 opt: 934  Z-score: 442.4  bits: 91.4 E(32554): 2.5e-18
Smith-Waterman score: 1425; 48.8% identity (68.6% similar) in 547 aa overlap (1-518:1-481)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
       :::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS54 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100                    
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDS-LEQ----------
       :::::::::::::::::::::.::.:::::::.::::::.::..:: :..          
CCDS54 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSALNKKENKGCESPD
               70        80        90       100       110       120

            110       120       130        140       150       160 
pF1KSD -------SPLLEDKYRRASEELDGLFRRYG-STVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSG
              .:  :.::.. .::.:.... .   .:: ::: :::..:::...:: .:::  
CCDS54 PDSSYALTPRTEEKYKKINEEFDNMIKSHKIPAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNP--
              130       140       150       160       170          

             170       180       190       200          210        
pF1KSD SLVTPSLVTSSLTDPRLLSPQQPALQRNSVSPGLPQRPASAG---AMLGGDLNSANGACP
               .::: .: ::   .:.:::::.:::. .:: :::   ...::::.:. :   
CCDS54 --------VSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAG---
              180       190       200       210       220          

      220       230       240       250       260       270        
pF1KSD SPVGNGYVSARASPGLLPVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAG
       . .:::: . : ::::: :. :: ::: . ::::::     .::  .:::::::.   ..
CCDS54 TSAGNGYGNPRNSPGLL-VSPGN-LNKNMQAKSPPP----MNLGMNNRKPDLRVLIPPGS
       230       240         250       260           270       280 

      280       290       300       310       320          330     
pF1KSD KGLMHHLTEDHLDLNNAQRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGL---PFSSMPTAYNT
       :. :  ..         ::.. :::..::.:::::::::.: .::.   : :.. :.:.:
CCDS54 KNTMPSVN---------QRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYP-SAISTTYGT
                      290       300       310       320        330 

         340       350       360       370       380       390     
pF1KSD DYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQ
       .:.:.::.:::: .:.. ..: ::.::.::: .  ..:                      
CCDS54 EYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMP----------------------
             340       350       360                               

         400       410       420       430       440       450     
pF1KSD QPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAP--
            :.  :.:   . ..:  .:        :.. .   ..:::::::: :.:. .:  
CCDS54 -----PSALSQLGACTSTHLSQSS-------NLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSR
          370       380              390       400       410       

            460       470       480       490       500       510  
pF1KSD -PPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKR
        :  .   :.:  : :.:::  ..::. .::.: :..:   .:: ::.:. : :. .:::
CCDS54 YPQHTRHEAGRS-PVDSLSS-CSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPD-ERESPSVKR
       420        430        440       450       460        470    

             520
pF1KSD MRL-DTWVL
       ::: . :  
CCDS54 MRLSEGWAT
          480   

>>CCDS78034.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5               (465 aa)
 initn: 1279 init1: 718 opt: 929  Z-score: 440.4  bits: 90.9 E(32554): 3.3e-18
Smith-Waterman score: 1478; 50.9% identity (70.5% similar) in 529 aa overlap (1-518:1-463)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
       :::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS78 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
       :::::::::::::::::::::.::.:::::::.::::::.::..::. .::  :::::. 
CCDS78 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
               70        80        90       100       110       120

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pF1KSD SEELDGLF-RRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLL
       .:..: .. :.   .:: ::: :::..:::...:: .:::          .::: .: ::
CCDS78 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNP----------VSSLGNPNLL
              130       140       150       160                 170

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pF1KSD SPQQPALQRNSVSPGLPQRPASAG---AMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLP
          .:.:::::.:::. .:: :::   ...::::.:. :   . .:::: . : ::::: 
CCDS78 PLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAG---TSAGNGYGNPRNSPGLL-
              180       190       200          210       220       

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pF1KSD VANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQ
       :. :: ::: . ::::::     .::  .:::::::.   ..:. :  ..         :
CCDS78 VSPGN-LNKNMQAKSPPP----MNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVN---------Q
        230        240           250       260       270           

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pF1KSD RLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGL---PFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSP
       :.. :::..::.:::::::::.: .::.   : :.. :.:.:.:.:.::.:::: .:.. 
CCDS78 RINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYP-SAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTA
            280       290       300        310       320       330 

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pF1KSD GGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLS
       ..: ::.::.::: .  ..:                           :.  :.:   . .
CCDS78 SALHLGSVTGWQQQHLHNMP---------------------------PSALSQLGACTST
             340       350                                  360    

           420       430       440       450          460       470
pF1KSD NLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAP---PPPAVFPAARPEPGDGL
       .:  .:        :.. .   ..:::::::: :.:. .:   :  .   :.:  : :.:
CCDS78 HLSQSS-------NLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRS-PVDSL
          370              380       390       400       410       

              480       490       500       510        520
pF1KSD SSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRL-DTWVL
       ::  ..::. .::.: :..:   .:: ::.:. : :. .:::::: . :  
CCDS78 SS-CSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPD-ERESPSVKRMRLSEGWAT
         420       430       440        450       460     

>>CCDS47245.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5               (473 aa)
 initn: 1285 init1: 718 opt: 905  Z-score: 429.6  bits: 89.0 E(32554): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 1515; 51.6% identity (71.5% similar) in 529 aa overlap (1-518:1-471)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
       :::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS47 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
       :::::::::::::::::::::.::.:::::::.::::::.::..::. .::  :::::. 
CCDS47 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
               70        80        90       100       110       120

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pF1KSD SEELDGLF-RRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLL
       .:..: .. :.   .:: ::: :::..:::...:: .:::          .::: .: ::
CCDS47 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNP----------VSSLGNPNLL
              130       140       150       160                 170

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pF1KSD SPQQPALQRNSVSPGLPQRPASAG---AMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLP
          .:.:::::.:::. .:: :::   ...::::.:. :   . .:::: . : ::::: 
CCDS47 PLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAG---TSAGNGYGNPRNSPGLL-
              180       190       200          210       220       

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pF1KSD VANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQ
       :. :: ::: . ::::::     .::  .:::::::.   ..:. :  ..:: .::   :
CCDS47 VSPGN-LNKNMQAKSPPP----MNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSED-VDLLLNQ
        230        240           250       260       270        280

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pF1KSD RLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGL---PFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSP
       :.. :::..::.:::::::::.: .::.   : :.. :.:.:.:.:.::.:::: .:.. 
CCDS47 RINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYP-SAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTA
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pF1KSD GGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLS
       ..: ::.::.::: .  ..:                           :.  :.:   . .
CCDS47 SALHLGSVTGWQQQHLHNMP---------------------------PSALSQLGACTST
     340       350                                  360       370  

           420       430       440       450          460       470
pF1KSD NLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAP---PPPAVFPAARPEPGDGL
       .:  .:        :.. .   ..:::::::: :.:. .:   :  .   :.:  : :.:
CCDS47 HLSQSS-------NLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRS-PVDSL
                   380       390       400       410        420    

              480       490       500       510        520
pF1KSD SSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRL-DTWVL
       ::  ..::. .::.: :..:   .:: ::.:. : :. .:::::: . :  
CCDS47 SS-CSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPD-ERESPSVKRMRLSEGWAT
           430       440       450        460       470   

>>CCDS47244.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5               (463 aa)
 initn: 1155 init1: 594 opt: 856  Z-score: 407.8  bits: 84.9 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 1405; 49.1% identity (69.6% similar) in 529 aa overlap (1-518:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
       :::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS47 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
       :::::::::::::::::::::.::.:.: ::  .::.::.::.  .:  .:  :.::.. 
CCDS47 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKENKGCESPDPDSSYAL--TPRTEEKYKKI
               70        80        90       100         110        

              130        140       150       160       170         
pF1KSD SEELDGLFRRYG-STVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLL
       .::.:.... .   .:: ::: :::..:::...:: .:::          .::: .: ::
CCDS47 NEEFDNMIKSHKIPAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNP----------VSSLGNPNLL
      120       130       140       150                 160        

     180       190       200          210       220       230      
pF1KSD SPQQPALQRNSVSPGLPQRPASAG---AMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLP
          .:.:::::.:::. .:: :::   ...::::.:. :   . .:::: . : ::::: 
CCDS47 PLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAG---TSAGNGYGNPRNSPGLL-
      170       180       190       200          210       220     

        240       250       260       270       280       290      
pF1KSD VANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQ
       :. :: ::: . ::::::     .::  .:::::::.   ..:. :  ..         :
CCDS47 VSPGN-LNKNMQAKSPPP----MNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVN---------Q
           230       240           250       260                270

        300       310       320          330       340       350   
pF1KSD RLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGL---PFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSP
       :.. :::..::.:::::::::.: .::.   : :.. :.:.:.:.:.::.:::: .:.. 
CCDS47 RINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYP-SAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTA
              280       290       300        310       320         

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD GGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLS
       ..: ::.::.::: .  ..:                           :.  :.:   . .
CCDS47 SALHLGSVTGWQQQHLHNMP---------------------------PSALSQLGACTST
     330       340                                  350       360  

           420       430       440       450          460       470
pF1KSD NLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAP---PPPAVFPAARPEPGDGL
       .:  .:        :.. .   ..:::::::: :.:. .:   :  .   :.:  : :.:
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