Result of FASTA (ccds) for pFN21ASDA0921
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0921, 1642 aa
  1>>>pF1KSDA0921 1642 - 1642 aa - 1642 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4294+/-0.00134; mu= 1.4679+/- 0.080
 mean_var=342.5743+/-68.682, 0's: 0 Z-trim(110.9): 66  B-trim: 111 in 1/50
 Lambda= 0.069294
 statistics sampled from 11930 (11984) to 11930 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.368), width:  16
 Scan time:  5.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31597.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11         (1642) 11111 1126.5       0
CCDS81831.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14         (1571) 4889 504.5 1.1e-141
CCDS9870.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14          (1061) 3976 413.1 2.5e-114
CCDS82450.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2          (1496) 3112 326.8 3.3e-88
CCDS82449.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2          (1499) 3112 326.8 3.3e-88
CCDS8077.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11          (1712) 3090 324.7 1.7e-87
CCDS54360.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2          (1477) 3055 321.1 1.7e-86
CCDS8078.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11          ( 666) 2898 305.1   5e-82
CCDS82451.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2          (1507) 2487 264.4 2.1e-69
CCDS46282.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2          (1547) 2487 264.4 2.2e-69
CCDS61515.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14         ( 637) 1784 193.7 1.6e-48
CCDS1845.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2           ( 442) 1261 141.3 6.8e-33
CCDS9871.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14          ( 432) 1143 129.5 2.4e-29
CCDS82447.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2          ( 469)  693 84.5 8.9e-16
CCDS82446.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2          ( 472)  693 84.6 8.9e-16
CCDS45145.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14         ( 459)  619 77.1 1.5e-13
CCDS82445.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2          ( 139)  530 67.8   3e-11
CCDS82444.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2          ( 142)  526 67.4   4e-11


>>CCDS31597.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11              (1642 aa)
 initn: 11111 init1: 11111 opt: 11111  Z-score: 6018.4  bits: 1126.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11111; 100.0% identity (100.0% similar) in 1642 aa overlap (1-1642:1-1642)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD HAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD GGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD PEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD EAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLND
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD NEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD HLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD HLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD WHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD GFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTC
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD DCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD VDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD VDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIR
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD ESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKE
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640  
pF1KSD KAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       ::::::::::::::::::::::
CCDS31 KAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
             1630      1640  

>>CCDS81831.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14              (1571 aa)
 initn: 4082 init1: 2804 opt: 4889  Z-score: 2657.0  bits: 504.5 E(32554): 1.1e-141
Smith-Waterman score: 6647; 61.7% identity (79.5% similar) in 1667 aa overlap (17-1642:16-1571)

               10        20        30        40        50        60
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                       .:: .: .   :::: : :.::::: ::  :.. ..:::...::
CCDS81  MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRW-DASTRSDLSFQFKTN
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       .. .::::::::: :::: : :::::..:::...::: :.:. .  : :. ::.....::
CCDS81 VSTGLLLYLDDGGVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLS-NKQVNDSSWHFLMVSRD
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pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
         ::.: .:::....:.. .:  :.:.::::.::.: :.: :::::. :.  : :.::. 
CCDS81 RLRTVLMLDGEGQSGELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLIL
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pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
       .:: :.  : ::::.:..  .  : :.  . :: :::.: .:  :.  :::: ::.:::.
CCDS81 DLKYGNSEPRLLGSRGVQMDAEGP-CG--ERPCENGGICFLL-DGHPTCDCSTTGYGGKL
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pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRN
       :::.     : .:: .. ...:: ::::.:.:..:::::.::::::.:::::.:.: :::
CCDS81 CSEDVSQDPGLSHLMMSEQAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRN
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pF1KSD GLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQ
       ::.::::::::::::.::.::: ::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS81 GLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ
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               :::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::
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pF1KSD KDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSA
       :.:::::::..:::::::. .: :::. :.. :.::.::.:::..::.:::...::.:..
CCDS81 KEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNT
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       :: ::::.::::::::::.::..:.      .  ..  ..:.::.:::::.:::::::::
CCDS81 KRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGS
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pF1KSD GGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGL
       : ::..:...:.::::: :::.:::::.:.:::::: ::: :.:.:::::::...:::::
CCDS81 GTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGL
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       ::. :. : :: :.::: :  :::::.:::::::::...: ::: :.:.::   ::: . 
CCDS81 PEN-RAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSA
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       ::: : ::.:..::..::::::::: :::. ::.:::::..:::::::::::..: .:::
CCDS81 KQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHT
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       ::::::.::::::::::..:::::.::::::::::::..:: :::         .:::::
CCDS81 EAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPET
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       :.::.:::::::::::::::::::.:.::. ..:: :.: : ::::::::::::::.:.:
CCDS81 LYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYI
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       :::::.:::::..:.:::  :.: ::.::: ::::.:::::: :.:::::::..::::.:
CCDS81 SVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSL
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       ::::::.:::::::::::.:::..:::::.:::::..:::::::::::::::::...:::
CCDS81 ATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGN
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       ::.:.:::::::::..:: .:.:.::.:...:::  :::.::::::.::..::...:.::
CCDS81 SDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSN
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       :::::::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::.:::::: :.::::::::
CCDS81 LPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVC
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       .:::.::::::.::::.:  :::::.::::::.:.:: :::: ::::::: :::::::::
CCDS81 MQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFST
         1070      1080      1090      1100      1110      1120    

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pF1KSD HQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFT
         ....:::.::: ::::.:::::.:: .::.::.:: ::.: :  . :.::::::::::
CCDS81 TVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFT
         1130      1140      1150      1160      1170      1180    

            1200      1210                                    1220 
pF1KSD RSGGNATLQVDSWPVNERYPAG------------------------------RQLTIFNS
       :.:::::::::.:::::.::.:                              :::::::.
CCDS81 RNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGNTDNERFQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFNT
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

            1230      1240      1250      1260      1270      1280 
pF1KSD QAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAE
       :: : :::.:.:: ::::.:::::.::::: .:::..::.. .: .::::: ::.: ...
CCDS81 QAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQ
         1250      1260      1270      1280      1290      1300    

            1290      1300      1310      1320      1330      1340 
pF1KSD TTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLE
       ::  ..  .:.::.:::::::::::::..::     .. : :.: ::.:::: :::::. 
CCDS81 TT--SMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS----TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFV
           1310      1320      1330          1340      1350        

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pF1KSD ECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRP
       ::::::                                                      
CCDS81 ECEPST------------------------------------------------------
     1360                                                          

            1410      1420      1430      1440      1450      1460 
pF1KSD PSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRK
                 : :     . .: : .:  . .  :  ...::  .    :.:::  :   
CCDS81 ----------DKS-----LSTSIFEGG--YKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTS---
                        1370        1380      1390      1400       

            1470      1480      1490        1500      1510         
pF1KSD PAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRD--PLQPLLENPPLGPGAPTSFE
           :.:    :... :..       :.:::::::.::  : :: .   ::    ::..:
CCDS81 --LSPELIRFTASSSSGMV-------PKLPAGKMNNRDLKP-QPDIVLLPL----PTAYE
           1410      1420             1430       1440          1450

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pF1KSD PRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALC
               : .:: : : ..:::::: :: :  ::: :::::::::::::::::::::::
CCDS81 LDSTKLKSPLITS-PMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALC
             1460       1470      1480      1490      1500         

    1580      1590      1600      1610      1620      1630         
pF1KSD ILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKE
       ::::::::::::::::::::::..::::::::::::...:::  .. :.  : .::::.:
CCDS81 ILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSS-KSGHKKQKNKDRE
    1510      1520      1530      1540      1550       1560        

    1640  
pF1KSD YYV
       :::
CCDS81 YYV
     1570 

>>CCDS9870.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14               (1061 aa)
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      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD RQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMG
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CCDS98                               MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
                                             10        20        30

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pF1KSD CLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRW
       :::.:::::::..:::::::. .: :::. :.. :.::.::.:::..::.:::...::.:
CCDS98 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
               40        50        60        70        80        90

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pF1KSD SAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDM
       ..:: ::::.::::::::::.::..:.      .  ..  ..:.::.:::::.:::::::
CCDS98 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
              100       110       120       130       140       150

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pF1KSD GSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLG
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CCDS98 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
              160       170       180       190       200       210

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD GLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRE
       ::::. :. : :: :.::: :  :::::.:::::::::...: ::: :.:.::   ::: 
CCDS98 GLPEN-RAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRM
               220       230       240       250       260         

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD TLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAM
       . ::: : ::.:..::..::::::::: :::. ::.:::::..:::::::::::..: .:
CCDS98 SAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVM
     270       280       290       300       310       320         

      720       730       740       750       760                  
pF1KSD HTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNL---------GKGP
       ::::::::.::::::::::..:::::.::::::::::::..:: :::         .:::
CCDS98 HTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGP
     330       340       350       360       370       380         

     770       780       790       800       810       820         
pF1KSD ETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERR
       :::.::.:::::::::::::::::::.:.::. ..:: :.: : ::::::::::::::.:
CCDS98 ETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKR
     390       400       410       420       430       440         

     830       840       850       860       870       880         
pF1KSD FISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYL
       .::::::.:::::..:.:::  :.: ::.::: ::::.:::::: :.:::::::..::::
CCDS98 YISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYL
     450       460       470       480       490       500         

     890       900       910       920       930       940         
pF1KSD ALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMK
       .:::::::.:::::::::::.:::..:::::.:::::..:::::::::::::::::...:
CCDS98 SLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIK
     510       520       530       540       550       560         

     950       960       970       980       990      1000         
pF1KSD GNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMF
       ::::.:.:::::::::..:: .:.:.::.:...:::  :::.::::::.::..::...:.
CCDS98 GNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMY
     570       580       590       600       610       620         

    1010      1020      1030      1040      1050      1060         
pF1KSD SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQG
       :::::::::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::.:::::: :.::::::
CCDS98 SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQG
     630       640       650       660       670       680         

    1070      1080      1090      1100      1110      1120         
pF1KSD VCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGF
       ::.:::.::::::.::::.:  :::::.::::::.:.:: :::: ::::::: :::::::
CCDS98 VCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGF
     690       700       710       720       730       740         

    1130      1140      1150      1160      1170      1180         
pF1KSD STHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVR
       ::  ....:::.::: ::::.:::::.:: .::.::.:: ::.: :  . :.::::::::
CCDS98 STTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVR
     750       760       770       780       790       800         

    1190      1200      1210      1220      1230      1240         
pF1KSD FTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLK
       :::.:::::::::.:::::.::.::::::::.:: : :::.:.:: ::::.:::::.:::
CCDS98 FTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLK
     810       820       830       840       850       860         

    1250      1260      1270      1280      1290      1300         
pF1KSD VLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRR
       :: .:::..::.. .: .::::: ::.: ...::  ..  .:.::.:::::::::::::.
CCDS98 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTT--SMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRK
     870       880       890       900         910       920       

    1310      1320      1330      1340      1350      1360         
pF1KSD GRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATR
       .::     .. : :.: ::.:::: :::::. ::::::                      
CCDS98 NRST----ASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPST----------------------
       930           940       950       960                       

    1370      1380      1390      1400      1410      1420         
pF1KSD SPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGE
                                                                   
CCDS98 ------------------------------------------------------------
                                                                   

    1430      1440      1450      1460      1470      1480         
pF1KSD VFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPN
                                                                   
CCDS98 ------------------------------------------------------------
                                                                   

    1490      1500      1510      1520      1530      1540         
pF1KSD LPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGE
                                                           :::: :: 
CCDS98 ----------------------------------------------------ANPTEPGI
                                                                   

    1550      1560      1570      1580      1590      1600         
pF1KSD RGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISN
       :  ::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::
CCDS98 RRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISN
     970       980       990      1000      1010      1020         

    1610      1620      1630      1640  
pF1KSD SAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       ::::::...:::  .. :.  : .::::.::::
CCDS98 SAQSNGTLMKEKQQSS-KSGHKKQKNKDREYYV
    1030      1040       1050      1060 

>>CCDS82450.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2               (1496 aa)
 initn: 5897 init1: 2253 opt: 3112  Z-score: 1697.2  bits: 326.8 E(32554): 3.3e-88
Smith-Waterman score: 6324; 59.8% identity (75.2% similar) in 1688 aa overlap (14-1642:16-1496)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
                      : ::::   :  ..:::: :. :::.:. .: .:   .:.::.:.
CCDS82 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
               10        20        30        40         50         

       60        70        80         90       100       110       
pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
       : ..:.:.::.:: : ::::::.:.  :::.: :.. :::::::  :::: :  :: : .
CCDS82 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
      60        70        80        90       100       110         

       120       130        140       150       160         170    
pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
        :. : :.: .:  ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .::  ::..:. . :
CCDS82 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
     120       130       140       150       160       170         

          180         190            200       210          220    
pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP
       :.: . .....     :.  :   :      .. ..:  :  ..    : :::.:.:.  
CCDS82 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD
     180       190       200       210       220       230         

          230       240       250           260       270       280
pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH
         : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: ..    :.::::..:::::.:.::::::.
CCDS82 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ
     240        250       260       270       280       290        

              290       300       310       320       330       340
pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV
       ::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::
CCDS82 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV
      300       310       320       330       340       350        

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG
       ::::::::::::.:::::::        :::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS82 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG
      360       370               380       390       400       410

              410       420       430       440       450       460
pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA
       ::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.
CCDS82 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT
              420       430       440       450       460       470

              470       480       490       500       510       520
pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA
       :::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:.      ..: .  ..
CCDS82 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV
              480       490       500       510       520       530

              530       540       550       560       570       580
pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF
       :.::.:.:::::::::::::: ::..:  .::::::: :::::::::.:.::::.  ::.
CCDS82 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY
              540       550       560       570       580       590

              590       600       610       620       630       640
pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR
        : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: :  :::::.:::::::.:.:.:
CCDS82 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR
              600       610        620       630       640         

              650       660       670       680       690       700
pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT
        .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::
CCDS82 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT
     650       660       670       680       690       700         

              710       720       730       740       750       760
pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK
       ::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..:
CCDS82 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK
     710       720       730       740       750       760         

                       770       780       790       800        810
pF1KSD LTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAG
       :::::         .:::::::::..::::::::::::::::::.:.::.  .. :::::
CCDS82 LTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAG
     770       780       790       800       810       820         

              820       830       840       850       860       870
pF1KSD AHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARF
        : :::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: ::::::::
CCDS82 DHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARF
     830       840       850       860       870       880         

              880       890       900       910       920       930
pF1KSD GLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIEL
       :.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::
CCDS82 GFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVEL
     890       900       910       920       930       940         

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD VKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGA
       ::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::
CCDS82 VKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGA
     950       960       970       980       990      1000         

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KSD RNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVE
       ::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.:::   ::.:
CCDS82 RNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIE
    1010      1020      1030      1040      1050      1060         

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KSD RGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITY
       :::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. :::
CCDS82 RGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITY
    1070      1080      1090      1100      1110      1120         

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KSD TWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDD
        :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: :::::::
CCDS82 KWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDD
    1130      1140      1150      1160      1170      1180         

             1180      1190      1200      1210                    
pF1KSD ITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG-----------------
       :.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: ::::::                 
CCDS82 IAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYR
    1190      1200      1210      1220      1230      1240         

                       1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD -------------RQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN
                    ::::::::::.: :::..::.:::::.::::::::::: .:::.: :
CCDS82 LGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDAN
    1250      1260      1270      1280      1290      1300         

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT
       .   :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.::.:.:::. :: ..  .
CCDS82 IAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPIS
    1310      1320       1330      1340      1350      1360        

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY
       :.:::.:::::::::::::.. ::::.                                 
CCDS82 QTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSS---------------------------------
      1370      1380      1390                                     

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD
                                                                   
CCDS82 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP
                                                                   
CCDS82 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             1510      1520      1530      1540      1550          
pF1KSD LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVI
                                                ::::  : : : ::..:::
CCDS82 -----------------------------------------ANPTRAGGREPYPGSAEVI
                                                  1400      1410   

    1560      1570      1580      1590      1600      1610         
pF1KSD RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS82 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVK
          1420      1430      1440      1450      1460      1470   

    1620      1630      1640  
pF1KSD EKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       :: :.. :. .: ::::::::::
CCDS82 EKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
          1480      1490      

>>CCDS82449.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2               (1499 aa)
 initn: 6028 init1: 2253 opt: 3112  Z-score: 1697.2  bits: 326.8 E(32554): 3.3e-88
Smith-Waterman score: 6345; 59.9% identity (75.3% similar) in 1688 aa overlap (14-1642:16-1499)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
                      : ::::   :  ..:::: :. :::.:. .: .:   .:.::.:.
CCDS82 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
               10        20        30        40         50         

       60        70        80         90       100       110       
pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
       : ..:.:.::.:: : ::::::.:.  :::.: :.. :::::::  :::: :  :: : .
CCDS82 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
      60        70        80        90       100       110         

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pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
        :. : :.: .:  ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .::  ::..:. . :
CCDS82 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
     120       130       140       150       160       170         

          180         190            200       210          220    
pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP
       :.: . .....     :.  :   :      .. ..:  :  ..    : :::.:.:.  
CCDS82 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD
     180       190       200       210       220       230         

          230       240       250           260       270       280
pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH
         : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: ..    :.::::..:::::.:.::::::.
CCDS82 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ
     240        250       260       270       280       290        

              290       300       310       320       330       340
pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV
       ::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::
CCDS82 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV
      300       310       320       330       340       350        

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG
       ::::::::::::.:::::::        :::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS82 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG
      360       370               380       390       400       410

              410       420       430       440       450       460
pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA
       ::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.
CCDS82 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT
              420       430       440       450       460       470

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pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA
       :::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:.      ..: .  ..
CCDS82 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV
              480       490       500       510       520       530

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pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF
       :.::.:.:::::::::::::: ::..:  .::::::: :::::::::.:.::::.  ::.
CCDS82 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY
              540       550       560       570       580       590

              590       600       610       620       630       640
pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR
        : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: :  :::::.:::::::.:.:.:
CCDS82 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR
              600       610        620       630       640         

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pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT
        .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::
CCDS82 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT
     650       660       670       680       690       700         

              710       720       730       740       750       760
pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK
       ::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..:
CCDS82 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK
     710       720       730       740       750       760         

                       770       780       790       800        810
pF1KSD LTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAG
       :::::         .:::::::::..::::::::::::::::::.:.::.  .. :::::
CCDS82 LTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAG
     770       780       790       800       810       820         

              820       830       840       850       860       870
pF1KSD AHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARF
        : :::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: ::::::::
CCDS82 DHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARF
     830       840       850       860       870       880         

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pF1KSD GLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIEL
       :.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::
CCDS82 GFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVEL
     890       900       910       920       930       940         

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD VKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGA
       ::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::
CCDS82 VKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGA
     950       960       970       980       990      1000         

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KSD RNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVE
       ::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.:::   ::.:
CCDS82 RNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIE
    1010      1020      1030      1040      1050      1060         

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KSD RGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITY
       :::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. :::
CCDS82 RGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITY
    1070      1080      1090      1100      1110      1120         

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KSD TWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDD
        :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: :::::::
CCDS82 KWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDD
    1130      1140      1150      1160      1170      1180         

             1180      1190      1200      1210                    
pF1KSD ITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG-----------------
       :.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: ::::::                 
CCDS82 IAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYR
    1190      1200      1210      1220      1230      1240         

                       1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD -------------RQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN
                    ::::::::::.: :::..::.:::::.::::::::::: .:::.: :
CCDS82 LGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDAN
    1250      1260      1270      1280      1290      1300         

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT
       .   :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.::.:.:::. :: ..  .
CCDS82 IAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPIS
    1310      1320       1330      1340      1350      1360        

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY
       :.:::.:::::::::::::.. ::::.::                               
CCDS82 QTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGG-------------------------------
      1370      1380      1390                                     

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD
                                                                   
CCDS82 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP
                                                                   
CCDS82 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             1510      1520      1530      1540      1550          
pF1KSD LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVI
                                                ::::  : : : ::..:::
CCDS82 ----------------------------------------LANPTRAGGREPYPGSAEVI
                                               1400      1410      

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pF1KSD RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS82 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVK
       1420      1430      1440      1450      1460      1470      

    1620      1630      1640  
pF1KSD EKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       :: :.. :. .: ::::::::::
CCDS82 EKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
       1480      1490         

>>CCDS8077.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11               (1712 aa)
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pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
              130       140       150       160       170       180

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pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
              190       200       210       220       230       240

              250                               260       270      
pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSE------------------------GKEEFVATFKGNEFFCY
       :::::::::::::::::::                        :::::::::::::::::
CCDS80 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
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pF1KSD VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMV-------TISVDGILTTTGYTQEDYTM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::       ::::::::::::::::::::
CCDS80 VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVNKLHYLVTISVDGILTTTGYTQEDYTM
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pF1KSD LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
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pF1KSD DLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 DLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGG
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pF1KSD GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
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pF1KSD SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
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pF1KSD LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
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pF1KSD FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
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pF1KSD LRLELDGGQMKLTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVD
       ::::::::::::::::         .::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LRLELDGGQMKLTVNLDCLRVGCAPSKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVD
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pF1KSD NVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 NVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGD
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pF1KSD ITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 ITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSG
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pF1KSD NGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 NGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDS
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pF1KSD RTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 RTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KSD DALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 DALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYI
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

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pF1KSD FGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 FGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1170      1180      1190      1200      1210          
pF1KSD GVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG-------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
CCDS80 GVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGNFDNERL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

                                 1220      1230      1240      1250
pF1KSD -----------------------RQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKV
                              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 AIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKV
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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pF1KSD LALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRG
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KSD RSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 RSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRS
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KSD PFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEV
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1440      1450      1460      1470      1480      1490
pF1KSD FDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 FDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNL
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1500      1510      1520      1530      1540      1550
pF1KSD PAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGER
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1560      1570      1580      1590      1600      1610
pF1KSD GPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 GPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNS
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1620      1630      1640  
pF1KSD AQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 AQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
             1690      1700      1710  

>>CCDS54360.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2               (1477 aa)
 initn: 6293 init1: 2565 opt: 3055  Z-score: 1666.4  bits: 321.1 E(32554): 1.7e-86
Smith-Waterman score: 6495; 61.4% identity (77.1% similar) in 1658 aa overlap (14-1642:16-1477)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
                      : ::::   :  ..:::: :. :::.:. .: .:   .:.::.:.
CCDS54 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
               10        20        30        40         50         

       60        70        80         90       100       110       
pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
       : ..:.:.::.:: : ::::::.:.  :::.: :.. :::::::  :::: :  :: : .
CCDS54 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
      60        70        80        90       100       110         

       120       130        140       150       160         170    
pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
        :. : :.: .:  ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .::  ::..:. . :
CCDS54 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
     120       130       140       150       160       170         

          180         190            200       210          220    
pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP
       :.: . .....     :.  :   :      .. ..:  :  ..    : :::.:.:.  
CCDS54 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD
     180       190       200       210       220       230         

          230       240       250           260       270       280
pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH
         : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: ..    :.::::..:::::.:.::::::.
CCDS54 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ
     240        250       260       270       280       290        

              290       300       310       320       330       340
pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV
       ::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::
CCDS54 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV
      300       310       320       330       340       350        

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG
       ::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS54 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG
      360       370       380       390       400       410        

              410       420       430       440       450       460
pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA
       ::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.
CCDS54 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT
      420       430       440       450       460       470        

              470       480       490       500       510       520
pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA
       :::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:.      ..: .  ..
CCDS54 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV
      480       490       500       510       520       530        

              530       540       550       560       570       580
pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF
       :.::.:.:::::::::::::: ::..:  .::::::: :::::::::.:.::::.  ::.
CCDS54 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY
      540       550       560       570       580       590        

              590       600       610       620       630       640
pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR
        : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: :  :::::.:::::::.:.:.:
CCDS54 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR
      600       610       620        630       640       650       

              650       660       670       680       690       700
pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT
        .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::
CCDS54 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT
       660       670       680       690       700       710       

              710       720       730       740       750       760
pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK
       ::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..:
CCDS54 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK
       720       730       740       750       760       770       

                       770       780       790       800        810
pF1KSD LTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAG
       :::::         .:::::::::..::::::::::::::::::.:.::.  .. :::::
CCDS54 LTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAG
       780       790       800       810       820       830       

              820       830       840       850       860       870
pF1KSD AHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARF
        : :::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: ::::::::
CCDS54 DHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARF
       840       850       860       870       880       890       

              880       890       900       910       920       930
pF1KSD GLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIEL
       :.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::
CCDS54 GFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVEL
       900       910       920       930       940       950       

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD VKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGA
       ::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::
CCDS54 VKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGA
       960       970       980       990      1000      1010       

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KSD RNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVE
       ::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.:::   ::.:
CCDS54 RNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIE
      1020      1030      1040      1050      1060      1070       

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KSD RGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITY
       :::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. :::
CCDS54 RGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITY
      1080      1090      1100      1110      1120      1130       

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KSD TWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDD
        :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: :::::::
CCDS54 KWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDD
      1140      1150      1160      1170      1180      1190       

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KSD ITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGR
       :.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.: :::.
CCDS54 IAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGK
      1200      1210      1220      1230      1240      1250       

             1240      1250      1260      1270      1280      1290
pF1KSD DQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLAD
       .::.:::::.::::::::::: .:::.: :.   :..::::: :: . ..:.:::.. ..
CCDS54 EQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSE
      1260      1270      1280      1290      1300       1310      

             1300      1310      1320      1330      1340      1350
pF1KSD MATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGE
       :.:.:::::::.::.:.:::. :: ..  .:.:::.:::::::::::::.. ::::.:: 
CCDS54 MSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGG-
       1320      1330      1340       1350      1360      1370     

             1360      1370      1380      1390      1400      1410
pF1KSD LILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAE
                                                                   
CCDS54 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             1420      1430      1440      1450      1460      1470
pF1KSD RDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRT
                                                                   
CCDS54 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
pF1KSD DGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGV
                                                                   
CCDS54 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             1540      1550       1560      1570      1580         
pF1KSD TSAPGFPHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYK
                  ::::  : : : ::..:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ----------LANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYK
                   1380      1390      1400      1410      1420    

    1590      1600      1610      1620      1630      1640  
pF1KSD YRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       :::::::::.::.::::::::::::::::::: :.. :. .: ::::::::::
CCDS54 YRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
         1430      1440      1450      1460      1470       

>>CCDS8078.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11               (666 aa)
 initn: 2889 init1: 2889 opt: 2898  Z-score: 1586.1  bits: 305.1 E(32554): 5e-82
Smith-Waterman score: 3605; 94.8% identity (94.8% similar) in 577 aa overlap (1096-1642:90-666)

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KSD ANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 THHVHHFHSKHGTVPIAINRMPFLTRGGHAGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRL
      60        70        80        90       100       110         

        1130      1140      1150      1160      1170      1180     
pF1KSD AVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 AVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKY
     120       130       140       150       160       170         

        1190      1200      1210                                   
pF1KSD HVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG------------------------------RQ
       ::::::::::::::::::::::::::::                              ::
CCDS80 HVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGNFDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQ
     180       190       200       210       220       230         

        1220      1230      1240      1250      1260      1270     
pF1KSD LTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPS
     240       250       260       270       280       290         

        1280      1290      1300      1310      1320      1330     
pF1KSD VLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 VLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPS
     300       310       320       330       340       350         

        1340      1350      1360      1370      1380      1390     
pF1KSD DDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 DDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPP
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pF1KSD PAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTT
     420       430       440       450       460       470         

        1460      1470      1480      1490      1500      1510     
pF1KSD LLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAP
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        1520      1530      1540      1550      1560      1570     
pF1KSD TSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 TSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAA
     540       550       560       570       580       590         

        1580      1590      1600      1610      1620      1630     
pF1KSD AALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 AALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKN
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        1640  
pF1KSD KDKEYYV
       :::::::
CCDS80 KDKEYYV
     660      

>>CCDS82451.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2               (1507 aa)
 initn: 6096 init1: 2253 opt: 2487  Z-score: 1359.5  bits: 264.4 E(32554): 2.1e-69
Smith-Waterman score: 6425; 60.3% identity (75.8% similar) in 1688 aa overlap (14-1642:16-1507)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
                      : ::::   :  ..:::: :. :::.:. .: .:   .:.::.:.
CCDS82 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
               10        20        30        40         50         

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pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
       : ..:.:.::.:: : ::::::.:.  :::.: :.. :::::::  :::: :  :: : .
CCDS82 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
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pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
        :. : :.: .:  ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .::  ::..:. . :
CCDS82 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
     120       130       140       150       160       170         

          180         190            200       210          220    
pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP
       :.: . .....     :.  :   :      .. ..:  :  ..    : :::.:.:.  
CCDS82 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD
     180       190       200       210       220       230         

          230       240       250           260       270       280
pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH
         : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: ..    :.::::..:::::.:.::::::.
CCDS82 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ
     240        250       260       270       280       290        

              290       300       310       320       330       340
pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV
       ::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::
CCDS82 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV
      300       310       320       330       340       350        

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG
       ::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS82 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG
      360       370       380       390       400       410        

              410       420       430       440       450       460
pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA
       ::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.
CCDS82 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA
       :::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:.      ..: .  ..
CCDS82 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV
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pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF
       :.::.:.:::::::::::::: ::..:  .::::::: :::::::::.:.::::.  ::.
CCDS82 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY
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pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR
        : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: :  :::::.:::::::.:.:.:
CCDS82 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR
      600       610       620        630       640       650       

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pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT
        .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::
CCDS82 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT
       660       670       680       690       700       710       

              710       720       730       740       750       760
pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK
       ::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..:
CCDS82 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK
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                       770       780       790       800        810
pF1KSD LTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAG
       :::::         .:::::::::..::::::::::::::::::.:.::.  .. :::::
CCDS82 LTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAG
       780       790       800       810       820       830       

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pF1KSD AHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARF
        : :::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: ::::::::
CCDS82 DHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARF
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              880       890       900       910       920       930
pF1KSD GLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIEL
       :.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::
CCDS82 GFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVEL
       900       910       920       930       940       950       

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD VKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGA
       ::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::
CCDS82 VKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGA
       960       970       980       990      1000      1010       

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KSD RNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVE
       ::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.:::   ::.:
CCDS82 RNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIE
      1020      1030      1040      1050      1060      1070       

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KSD RGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITY
       :::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. :::
CCDS82 RGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITY
      1080      1090      1100      1110      1120      1130       

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KSD TWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDD
        :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: :::::::
CCDS82 KWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDD
      1140      1150      1160      1170      1180      1190       

             1180      1190      1200      1210                    
pF1KSD ITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG-----------------
       :.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: ::::::                 
CCDS82 IAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYR
      1200      1210      1220      1230      1240      1250       

                       1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD -------------RQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN
                    ::::::::::.: :::..::.:::::.::::::::::: .:::.: :
CCDS82 LGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDAN
      1260      1270      1280      1290      1300      1310       

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT
       .   :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.::.:.:::. :: ..  .
CCDS82 IAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPIS
      1320      1330       1340      1350      1360      1370      

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY
       :.:::.:::::::::::::.. ::::.::                               
CCDS82 QTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGG-------------------------------
        1380      1390      1400                                   

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD
                                                                   
CCDS82 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP
                                                                   
CCDS82 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             1510      1520      1530      1540      1550          
pF1KSD LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVI
                                                ::::  : : : ::..:::
CCDS82 ----------------------------------------LANPTRAGGREPYPGSAEVI
                                                 1410      1420    

    1560      1570      1580      1590      1600      1610         
pF1KSD RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS82 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVK
         1430      1440      1450      1460      1470      1480    

    1620      1630      1640  
pF1KSD EKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       :: :.. :. .: ::::::::::
CCDS82 EKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
         1490      1500       

>>CCDS46282.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2               (1547 aa)
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CCDS46 RGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLKTRSARGL
        10        20        30        40         50        60      

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       .::.:: : ::::::.:.  :::.: :.. :::::::  :::: :  :: : . :. : :
CCDS46 VLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIRRQFRNT
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pF1KSD ALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPPFRGLLAN
       .: .:  ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .::  ::..:. . ::.: . .
CCDS46 TLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPFKGWIRD
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pF1KSD LKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAPGEVGCDC
       ....     :.  :   :      .. ..:  :  ..    : :::.:.:.    : :::
CCDS46 VRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQAV-CDC
        190       200       210       220       230       240      

             240                                        250        
pF1KSD SHTGFGGKFCSEE--------------------------EHPM-------EGPAHLTLN-
       :.::: :: ::.:                           .:.       :: ::: .. 
CCDS46 SRTGFRGKDCSQEIKFGLQCVLPVLLHDNDQGKYCCINTAKPLTEKDNNVEGLAHLMMGD
         250       260       270       280       290       300     

          260       270       280       290       300       310    
pF1KSD ---SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVN
          :.::::..:::::.:.::::::.::::::.:::::.:.:::::::::::::::::::
CCDS46 QGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVN
         310       320       330       340       350       360     

          320       330       340       350       360              
pF1KSD LSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMV-----
       :.::.::: :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::     
CCDS46 LALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVNKLHC
         370       380       390       400       410       420     

       370       380       390       400       410       420       
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         ::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::::
CCDS46 SVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKN
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pF1KSD NDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSIS
       :: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.:::.:::.::.:..::.:.::.:::::
CCDS46 NDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSIS
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       490       500       510       520       530       540       
pF1KSD LDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRA
       .::::::::::.:::.:.      ..: .  ..:.::.:.:::::::::::::: ::..:
CCDS46 FDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKA
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       550       560       570       580       590       600       
pF1KSD SSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVD
         .::::::: :::::::::.:.::::.  ::. : :.::::::..:::::::::. .. 
CCDS46 LLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAG
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       610       620       630       640       650       660       
pF1KSD LPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAP
       : .: ::::: :  :::::.:::::::.:.:.: .::.:...:: : ::.:: : : : :
CCDS46 LVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNP
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       :.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::::::::::.:::.:: .::::::::::
CCDS46 CKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSL
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pF1KSD RFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNL---------GKGPETLFAGHKL
       :: ::::::..::::::.::::::::::.:..::::::         .:::::::::..:
CCDS46 RFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNL
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pF1KSD NDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSN
       :::::::::::::::::.:.::.  .. ::::: : :::::::::::.::::..: ::::
CCDS46 NDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSN
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       840       850       860       870       880       890       
pF1KSD FIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAY
       :::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::::.: :.:::::::..:::.::::::::
CCDS46 FIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAY
          910       920       930       940       950       960    

       900       910       920       930       940       950       
pF1KSD ASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVN
       .:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::::::.::::::::: .:.::.:.::.:
CCDS46 TSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLN
          970       980       990      1000      1010      1020    

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KSD DNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVA
       :::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::::::::..:::::..:. ...::::: 
CCDS46 DNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVH
         1030      1040      1050      1060      1070      1080    

      1020      1030      1040      1050      1060      1070       
pF1KSD SRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDG
       ...:::::::::::::::::::.:::   ::.::::.:::::: :.::.:::::::::::
CCDS46 AKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDG
         1090      1100      1110      1120      1130      1140    

      1080      1090      1100      1110      1120      1130       
pF1KSD FTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAV
       :.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: :::::::::: ::::.:::: :. ::
CCDS46 FSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAV
         1150      1160      1170      1180      1190      1200    

      1140      1150      1160      1170      1180      1190       
pF1KSD LVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNA
       ::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::::.:.: :::..::::::::::::::::
CCDS46 LVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNA
         1210      1220      1230      1240      1250      1260    

      1200      1210                                    1220       
pF1KSD TLQVDSWPVNERYPAG------------------------------RQLTIFNSQAAIKI
       ::::::::: ::::::                              ::::::::::.: :
CCDS46 TLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIII
         1270      1280      1290      1300      1310      1320    

      1230      1240      1250      1260      1270      1280       
pF1KSD GGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTL
       ::..::.:::::.::::::::::: .:::.: :.   :..::::: :: . ..:.:::..
CCDS46 GGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAM
         1330      1340      1350      1360      1370       1380   

      1290      1300      1310      1320      1330      1340       
pF1KSD LADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPST
        ..:.:.:::::::.::.:.:::. :: ..  .:.:::.:::::::::::::.. ::::.
CCDS46 QSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSS
          1390      1400      1410       1420      1430      1440  

      1350      1360      1370      1380      1390      1400       
pF1KSD GGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPC
       ::                                                          
CCDS46 GG----------------------------------------------------------
                                                                   

      1410      1420      1430      1440      1450      1460       
pF1KSD QAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPN
                                                                   
CCDS46 ------------------------------------------------------------
                                                                   

      1470      1480      1490      1500      1510      1520       
pF1KSD LRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLR
                                                                   
CCDS46 ------------------------------------------------------------
                                                                   

      1530      1540      1550       1560      1570      1580      
pF1KSD PGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYA
                     ::::  : : : ::..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 -------------LANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYA
                      1450      1460      1470      1480      1490 

       1590      1600      1610      1620      1630      1640  
pF1KSD MYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       ::::::::::::.::.::::::::::::::::::: :.. :. .: ::::::::::
CCDS46 MYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
            1500      1510      1520      1530      1540       




1642 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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