Result of FASTA (ccds) for pFN21ASDA0846
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0846, 689 aa
  1>>>pF1KSDA0846 689 - 689 aa - 689 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9618+/-0.000985; mu= 17.6402+/- 0.060
 mean_var=100.0831+/-19.145, 0's: 0 Z-trim(108.2): 127  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.128202
 statistics sampled from 9933 (10067) to 9933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.309), width:  16
 Scan time:  3.680

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS54346.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2       ( 689) 4677 876.0       0
CCDS46256.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2       ( 690) 4665 873.7       0
CCDS45222.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15      ( 797) 2315 439.1 1.1e-122
CCDS31598.1 RASGRP2 gene_id:10235|Hs108|chr11      ( 609) 2056 391.1 2.5e-108
CCDS46068.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19     ( 673) 1648 315.7 1.4e-85
CCDS59382.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19     ( 659) 1436 276.5 8.6e-74
CCDS76733.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15      ( 597) 1421 273.7 5.5e-73
CCDS45221.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15      ( 762) 1421 273.8 6.6e-73
CCDS59383.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19     ( 639) 1203 233.4 7.9e-61
CCDS54263.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19     ( 576)  929 182.7 1.3e-45
CCDS59384.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19     ( 604)  728 145.5 2.1e-34
CCDS54264.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19     ( 581)  726 145.1 2.7e-34
CCDS54262.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19     ( 484)  678 136.2 1.1e-31
CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5         (1237)  436 91.8 6.6e-18
CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15       ( 489)  397 84.2 4.9e-16
CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15       (1257)  397 84.5   1e-15
CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15       (1273)  397 84.6   1e-15
CCDS48047.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9        (1077)  385 82.3 4.1e-15
CCDS78450.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9        (1094)  385 82.3 4.2e-15
CCDS48048.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9        (1095)  385 82.3 4.2e-15


>>CCDS54346.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2            (689 aa)
 initn: 4677 init1: 4677 opt: 4677  Z-score: 4677.6  bits: 876.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4677; 100.0% identity (100.0% similar) in 689 aa overlap (1-689:1-689)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD IHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD LMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD TLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD RKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD LACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVH
              610       620       630       640       650       660

              670       680         
pF1KSD AGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG
              670       680         

>>CCDS46256.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2            (690 aa)
 initn: 2558 init1: 2558 opt: 4665  Z-score: 4665.6  bits: 873.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4665; 99.9% identity (99.9% similar) in 690 aa overlap (1-689:1-690)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD IHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD LMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLL
              310       320       330       340       350       360

              370       380        390       400       410         
pF1KSD TLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKS-PTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKH
       ::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSQPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKH
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD IRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLR
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD AKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLL
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD VLACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRK
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD ISVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ISVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRV
              610       620       630       640       650       660

     660       670       680         
pF1KSD HAGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HAGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG
              670       680       690

>>CCDS45222.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15           (797 aa)
 initn: 1992 init1: 1071 opt: 2315  Z-score: 2315.7  bits: 439.1 E(32554): 1.1e-122
Smith-Waterman score: 2320; 53.7% identity (76.9% similar) in 687 aa overlap (1-655:50-730)

                                              10        20         
pF1KSD                               MGSSG-LGKAATLDELLCTCIEMFDDNGEL
                                     : : : :.:.:.::.:. .::. :: .:.:
CCDS45 AASKARLEAKPANSPFPSHPSLAHITQFRMMVSLGHLAKGASLDDLIDSCIQSFDADGNL
      20        30        40        50        60        70         

      30         40        50        60        70        80        
pF1KSD DNS-YLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAE
         :  : ...: :::  .::.:: .:.. .:..: ...   . ::::::.:::: .: . 
CCDS45 CRSNQLLQVMLTMHRIVISSAELLQKVITLYKDALAKNSPGLCLKICYFVRYWITEFWVM
      80        90       100       110       120       130         

       90       100       110       120       130         140      
pF1KSD FNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSIPSYDWMRRVTQRKK--VSKKGKACL
       :..: .:    :::.:...  : : :  ::: ..: . :: :..::: :  .::: :. :
CCDS45 FKMDASLTDTMEEFQELVKAKGEELHCRLIDTTQINARDWSRKLTQRIKSNTSKKRKVSL
     140       150       160       170       180       190         

        150       160       170       180       190       200      
pF1KSD LFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQ
       ::::::: ::.::::.:: ::::::::.:::.:....:...:::.:::::: ::::.:::
CCDS45 LFDHLEPEELSEHLTYLEFKSFRRISFSDYQNYLVNSCVKENPTMERSIALCNGISQWVQ
     200       210       220       230       240       250         

        210       220       230       240       250       260      
pF1KSD LMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSE
       :::::.:::: ::::. :::.::.:: ::.::::::::.::: :::::::::: ::.  :
CCDS45 LMVLSRPTPQLRAEVFIKFIQVAQKLHQLQNFNTLMAVIGGLCHSSISRLKETSSHVPHE
     260       270       280       290       300       310         

        270       280       290       300       310       320      
pF1KSD VTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVN
       ..:  .:::::.::. :: :::.:...:  ::::::::::::::...  .::. :..:::
CCDS45 INKVLGEMTELLSSSRNYDNYRRAYGECTDFKIPILGVHLKDLISLYEAMPDYLEDGKVN
     320       330       340       350       360       370         

        330       340       350       360       370       380      
pF1KSD IVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSK
       . :.  :   .::::.::...  :: : ::..:::::::::.:::.::.:: . :::: .
CCDS45 VHKLLALYNHISELVQLQEVAPPLEANKDLVHLLTLSLDLYYTEDEIYELSYAREPRNHR
     380       390       400       410       420       430         

        390       400       410       420       430       440      
pF1KSD SPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFES
       .:  : ::.:: : ..:: :: ::::: .:.::....:.:::.:::::.:::::::.::.
CCDS45 AP--PLTPSKPPVVVDWASGVSPKPDPKTISKHVQRMVDSVFKNYDHDQDGYISQEEFEK
     440         450       460       470       480       490       

        450       460       470       480       490       500      
pF1KSD IAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTF
       :::.:::  ::::.:::..::::.::. :::.::.: .. :.: :: ::::: :::::::
CCDS45 IAASFPF--SFCVMDKDREGLISRDEITAYFMRASS-IYSKLGLGFPHNFQETTYLKPTF
       500         510       520       530        540       550    

        510       520       530       540       550         560    
pF1KSD CEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSL--P----
       :..:::::::.:::::.::::: :::::::::.:. :.. :. :   . ...   :    
CCDS45 CDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKRAKNPVAPTENNTSVGPVSNL
          560       570       580       590       600       610    

                 570           580       590       600       610   
pF1KSD ---GSPSLPPAQDE-VFEFPG---VTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQAT
          :. .:  : .:  : ::.   :  :... : :.: :.  ::.:::.::.::.. .::
CCDS45 CSLGAKDLLHAPEEGPFTFPNGEAVEHGEESKD-RTIMLMGVSSQKISLRLKRAVAHKAT
          620       630       640        650       660       670   

           620       630       640                      650        
pF1KSD QTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKA---------------AKDKGFAKWENEKPR
       :::     .. : ::  .. . ..  .:                 .. ..:.::::.   
CCDS45 QTESQPWIGSEGPSGPFVLSSPRKTAQDTLYVLPSPTSPCPSPVLVRKRAFVKWENKDSL
           680       690       700       710       720       730   

      660       670       680                                      
pF1KSD VHAGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG                             
                                                                   
CCDS45 IKSKEELRHLRLPTYQELEQEINTLKADNDALKIQLKYAQKKIESLQLEKSNHVLAQMEQ
           740       750       760       770       780       790   

>>CCDS31598.1 RASGRP2 gene_id:10235|Hs108|chr11           (609 aa)
 initn: 1300 init1: 845 opt: 2056  Z-score: 2058.5  bits: 391.1 E(32554): 2.5e-108
Smith-Waterman score: 2056; 52.7% identity (77.7% similar) in 588 aa overlap (2-583:3-585)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMY
         :.  : :. :..:::  ::: :::.:.. .  : :. :.:: ::. :..:: ::: .:
CCDS31 MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDSGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIY
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD RNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLID
       ...  .. : ...: :...::::  :::::.:.  : .. .:.. . .: : ..: ::::
CCDS31 QQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLID
               70        80        90       100       110       120

     120       130        140       150       160       170        
pF1KSD ISSIPSYDWMRRVTQRKKVS-KKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQS
       :.:.:.: : :.::::. :. :: :  ::::::::.:::::::.::..:: .: : ::.:
CCDS31 IDSVPTYKWKRQVTQRNPVGQKKRKMSLLFDHLEPMELAEHLTYLEYRSFCKILFQDYHS
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KSD YVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNF
       .: :::  .::.::: :.:::..:.:::::.:::::  ::: :::.:..::.:::::.::
CCDS31 FVTHGCTVDNPVLERFISLFNSVSQWVQLMILSKPTAPQRALVITHFVHVAEKLLQLQNF
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD NTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFK
       ::::::::::::::::::::::::.: :. : :. .::::...::: :::. .: : ::.
CCDS31 NTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHVSPETIKLWEGLTELVTATGNYGNYRRRLAACVGFR
              250       260       270       280       290       300

      300       310       320         330       340       350      
pF1KSD IPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTE--ENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDL
       .::::::::::.:... .::: .  ....: .::.::   : ::. . .    .. : ::
CCDS31 FPILGVHLKDLVALQLALPDWLDPARTRLNGAKMKQLFSILEELAMVTSLRPPVQANPDL
              310       320       330       340       350       360

        360       370       380       390          400       410   
pF1KSD INLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSPTSPTT---PNKPVVPLEWALGVMPKPDP
       ..:::.::: :.:::..:.:::  :::...::::::.   : .: :  ::. .. :: : 
CCDS31 LSLLTVSLDQYQTEDELYQLSLQREPRSKSSPTSPTSCTPPPRPPVLEEWTSAAKPKLDQ
              370       380       390       400       410       420

           420       430       440       450       460       470   
pF1KSD TVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEM
       ... .::.:.:::::::.: : ::.::::.:. : .:::.:..:  ::..::: ::..::
CCDS31 ALVVEHIEKMVESVFRNFDVDGDGHISQEEFQIIRGNFPYLSAFGDLDQNQDGCISREEM
              430       440       450       460       470       480

           480       490       500       510       520       530   
pF1KSD MAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHK
       ..::::..: :  .::  :.::::: . :.:. :.:: ... :: ::: ::. ::.::::
CCDS31 VSYFLRSSSVLGGRMG--FVHNFQESNSLRPVACRHCKALILGIYKQGLKCRACGVNCHK
              490         500       510       520       530        

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD QCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLV
       :::: : . ::: :.. ::   .:: :.   .   . ..: :     :.:          
CCDS31 QCKDRLSVECRRRAQSVSL---EGSAPSPSPMHSHHHRAFSFSLPRPGRRGSRPPEIREE
      540       550          560       570       580       590     

           600       610       620       630       640       650   
pF1KSD TGSSRKISVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWE
                                                                   
CCDS31 EVQTVEDGVFDIHL                                              
         600                                                       

>>CCDS46068.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19          (673 aa)
 initn: 1589 init1: 880 opt: 1648  Z-score: 1650.0  bits: 315.7 E(32554): 1.4e-85
Smith-Waterman score: 1657; 43.3% identity (71.1% similar) in 630 aa overlap (1-619:43-651)

                                                 10        20      
pF1KSD                               MGSSGLG----KAATLDELLCTCIEMFDDN
                                     :.: .::     . . ::::  ::. ::. 
CCDS46 ECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDELLEKCIQSFDSA
             20        30        40        50        60        70  

          30        40        50        60        70        80     
pF1KSD GEL-DNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKF
       : :  ....  .:: :: : : :..:: .::  :..:::.. .  ::.::...:::... 
CCDS46 GSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQICHLVRYWLMRH
             80        90       100       110       120       130  

          90       100       110       120         130       140   
pF1KSD PAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSI--PSYDWMRRVTQRKKVSKKGK
       :  .. :  : ..  .:  .... :   .  : : :..  :.        .   ..:: :
CCDS46 PEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPLPMSSPGLGKKRK
            140       150       160       170       180       190  

           150       160       170       180       190       200   
pF1KSD ACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISK
       . :::::::  :::.:::.:: .::. :.  : .:::..: ... :.:: :..: :..:.
CCDS46 VSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPALEGSVGLSNSVSR
            200       210       220       230       240       250  

           210       220       230       240       250       260   
pF1KSD WVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHL
       :::.::::.: : :::.:. :::.::..: ::.::::::::.::: ::.:::::..:.::
CCDS46 WVQVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHSAISRLKDSHAHL
            260       270       280       290       300       310  

           270       280       290       300       310       320   
pF1KSD SSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEEN
       : . ::   :.:::..:..::  ::...: : ::..:.::::::::...:   ::   ..
CCDS46 SPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDG
            320       330       340       350       360       370  

           330       340       350       360       370       380   
pF1KSD KVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPR
       .... :...: . :.:::.::.       : ::..::::::::..:::.::.:: . :::
CCDS46 RLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPR
            380       390       400       410       420       430  

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD NSKS-PTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQE
         :: : ::   : :.: .::: :: :::: .....:...::::::.::: .  : ::::
CCDS46 CPKSLPPSPF--NAPLV-VEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQE
            440          450       460       470       480         

            450        460       470       480       490       500 
pF1KSD DFESIAANFPFL-DSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTY
       ::: ...::::   ..    ..  : .:..:. .:.::: : .  :.: .:.:.:.:.:.
CCDS46 DFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRA-SAICSKLGLAFLHTFHEVTF
     490       500       510       520        530       540        

             510       520       530       540       550       560 
pF1KSD LKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSLPG
        :::::. :.:::::. ::::.:..::  :::.:.: . . :..    :. ..: .. ::
CCDS46 RKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKK---RPG-AKGDAGPPG
      550       560       570       580       590           600    

               570       580       590       600       610         
pF1KSD SPSLP--PAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQATQTEPVW
       .: .:  ::       : .. : ..  : ...:      . . .:..: : :. . .: :
CCDS46 AP-VPSTPA-------PHASCGSEENHSYTLSLEP----ETGCQLRHAWT-QTESPHPSW
           610              620       630           640        650 

     620       630       640       650       660       670         
pF1KSD SEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVHAGVDVVDRGTEFELDQDEG
                                                                   
CCDS46 ETDTVPCPVMDPPSTASSKLDS                                      
             660       670                                         

>>CCDS59382.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19          (659 aa)
 initn: 1415 init1: 880 opt: 1436  Z-score: 1438.2  bits: 276.5 E(32554): 8.6e-74
Smith-Waterman score: 1661; 43.5% identity (71.2% similar) in 628 aa overlap (1-619:43-637)

                                                 10        20      
pF1KSD                               MGSSGLG----KAATLDELLCTCIEMFDDN
                                     :.: .::     . . ::::  ::. ::. 
CCDS59 ECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDELLEKCIQSFDSA
             20        30        40        50        60        70  

          30        40        50        60        70        80     
pF1KSD GEL-DNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKF
       : :  ....  .:: :: : : :..:: .::  :..:::.. .  ::.::...:::... 
CCDS59 GSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQICHLVRYWLMRH
             80        90       100       110       120       130  

          90       100       110       120       130       140     
pF1KSD PAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKAC
       :  .. :  : ..  .:  .... :   .  : : :..:.            ..:: :. 
CCDS59 PEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLPG------------LGKKRKVS
            140       150       160       170                   180

         150       160       170       180       190       200     
pF1KSD LLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWV
       :::::::  :::.:::.:: .::. :.  : .:::..: ... :.:: :..: :..:.::
CCDS59 LLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPALEGSVGLSNSVSRWV
              190       200       210       220       230       240

         210       220       230       240       250       260     
pF1KSD QLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSS
       :.::::.: : :::.:. :::.::..: ::.::::::::.::: ::.:::::..:.::: 
CCDS59 QVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHSAISRLKDSHAHLSP
              250       260       270       280       290       300

         270       280       290       300       310       320     
pF1KSD EVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKV
       . ::   :.:::..:..::  ::...: : ::..:.::::::::...:   ::   ....
CCDS59 DSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDGRL
              310       320       330       340       350       360

         330       340       350       360       370       380     
pF1KSD NIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNS
       .. :...: . :.:::.::.       : ::..::::::::..:::.::.:: . :::  
CCDS59 HLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPRCP
              370       380       390       400       410       420

          390       400       410       420       430       440    
pF1KSD KS-PTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDF
       :: : ::   : :.: .::: :: :::: .....:...::::::.::: .  : ::::::
CCDS59 KSLPPSPF--NAPLV-VEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQEDF
                430        440       450       460       470       

          450        460       470       480       490       500   
pF1KSD ESIAANFPFL-DSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLK
       : ...::::   ..    ..  : .:..:. .:.::: : .  :.: .:.:.:.:.:. :
CCDS59 ERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRA-SAICSKLGLAFLHTFHEVTFRK
       480       490       500       510        520       530      

           510       520       530       540       550       560   
pF1KSD PTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSLPGSP
       ::::. :.:::::. ::::.:..::  :::.:.: . . :..    :. ..: .. ::.:
CCDS59 PTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKK---RPG-AKGDAGPPGAP
        540       550       560       570          580        590  

             570       580       590       600       610       620 
pF1KSD SLP--PAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQATQTEPVWSE
        .:  ::       : .. : ..  : ...:      . . .:..: : :. . .: :  
CCDS59 -VPSTPA-------PHASCGSEENHSYTLSLEP----ETGCQLRHAWT-QTESPHPSWET
                    600       610           620        630         

             630       640       650       660       670       680 
pF1KSD AGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVHAGVDVVDRGTEFELDQDEGEE
                                                                   
CCDS59 DTVPCPVMDPPSTASSKLDS                                        
     640       650                                                 

>>CCDS76733.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15           (597 aa)
 initn: 1918 init1: 1070 opt: 1421  Z-score: 1423.8  bits: 273.7 E(32554): 5.5e-73
Smith-Waterman score: 2011; 56.5% identity (77.4% similar) in 554 aa overlap (1-550:50-563)

                                              10        20         
pF1KSD                               MGSSG-LGKAATLDELLCTCIEMFDDNGEL
                                     : : : :.:.:.::.:. .::. :: .:.:
CCDS76 AASKARLEAKPANSPFPSHPSLAHITQFRMMVSLGHLAKGASLDDLIDSCIQSFDADGNL
      20        30        40        50        60        70         

      30         40        50        60        70        80        
pF1KSD DNS-YLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAE
         :  : ...: :::  .::.:: .:.. .:..: ...   . ::::::.:::: .: . 
CCDS76 CRSNQLLQVMLTMHRIVISSAELLQKVITLYKDALAKNSPGLCLKICYFVRYWITEFWVM
      80        90       100       110       120       130         

       90       100       110       120       130         140      
pF1KSD FNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSIPSYDWMRRVTQRKK--VSKKGKACL
       :..: .:    :::.:...  : : :  ::: ..: . :: :..::: :  .::: :. :
CCDS76 FKMDASLTDTMEEFQELVKAKGEELHCRLIDTTQINARDWSRKLTQRIKSNTSKKRKVSL
     140       150       160       170       180       190         

        150       160       170       180       190       200      
pF1KSD LFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQ
       ::::::: ::.::::.:: ::::::::.:::.:....:...:::.:::::: ::::.:::
CCDS76 LFDHLEPEELSEHLTYLEFKSFRRISFSDYQNYLVNSCVKENPTMERSIALCNGISQWVQ
     200       210       220       230       240       250         

        210       220       230       240       250       260      
pF1KSD LMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSE
       :::::.:::: ::::. :::.::.:: ::.::::::::.::: :::::::::: ::.  :
CCDS76 LMVLSRPTPQLRAEVFIKFIQVAQKLHQLQNFNTLMAVIGGLCHSSISRLKETSSHVPHE
     260       270       280       290       300       310         

        270       280       290       300       310       320      
pF1KSD VTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVN
       ..:  .:::::.::. :: :::.:...:  ::::::::::::::...  .::. :..:::
CCDS76 INKVLGEMTELLSSSRNYDNYRRAYGECTDFKIPILGVHLKDLISLYEAMPDYLEDGKVN
     320       330       340       350       360       370         

        330       340       350       360       370       380      
pF1KSD IVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSK
       . :.  :   .::::.::...  :: : ::..:::::::::.:::.::.:: . :::: .
CCDS76 VHKLLALYNHISELVQLQEVAPPLEANKDLVHLLTLSLDLYYTEDEIYELSYAREPRNHR
     380       390       400       410       420       430         

        390       400       410       420       430       440      
pF1KSD SPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFES
       .:                                     :::.:::::.:::::::.::.
CCDS76 AP-------------------------------------SVFKNYDHDQDGYISQEEFEK
     440                                            450       460  

        450       460       470       480       490       500      
pF1KSD IAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTF
       :::.:::  ::::.:::..::::.::. :::.:: :... :.: :: ::::: :::::::
CCDS76 IAASFPF--SFCVMDKDREGLISRDEITAYFMRA-SSIYSKLGLGFPHNFQETTYLKPTF
              470       480       490        500       510         

        510       520       530       540       550       560      
pF1KSD CEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLP
       :..:::::::.:::::.::::: :::::::::.:. :.. :. :                
CCDS76 CDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKRAKNPVAPTENNTSVGPVSNL
     520       530       540       550       560       570         

        570       580       590       600       610       620      
pF1KSD PAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGD
                                                                   
CCDS76 CSLGAKDLLHGNKYSESR                                          
     580       590                                                 

>>CCDS45221.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15           (762 aa)
 initn: 1988 init1: 1070 opt: 1421  Z-score: 1422.4  bits: 273.8 E(32554): 6.6e-73
Smith-Waterman score: 2096; 50.9% identity (72.6% similar) in 687 aa overlap (1-655:50-695)

                                              10        20         
pF1KSD                               MGSSG-LGKAATLDELLCTCIEMFDDNGEL
                                     : : : :.:.:.::.:. .::. :: .:.:
CCDS45 AASKARLEAKPANSPFPSHPSLAHITQFRMMVSLGHLAKGASLDDLIDSCIQSFDADGNL
      20        30        40        50        60        70         

      30         40        50        60        70        80        
pF1KSD DNS-YLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAE
         :  : ...: :::  .::.:: .:.. .:..: ...   . ::::::.:::: .: . 
CCDS45 CRSNQLLQVMLTMHRIVISSAELLQKVITLYKDALAKNSPGLCLKICYFVRYWITEFWVM
      80        90       100       110       120       130         

       90       100       110       120       130         140      
pF1KSD FNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSIPSYDWMRRVTQRKK--VSKKGKACL
       :..: .:    :::.:...  : : :  ::: ..: . :: :..::: :  .::: :. :
CCDS45 FKMDASLTDTMEEFQELVKAKGEELHCRLIDTTQINARDWSRKLTQRIKSNTSKKRKVSL
     140       150       160       170       180       190         

        150       160       170       180       190       200      
pF1KSD LFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQ
       ::::::: ::.::::.:: ::::::::.:::.:....:...:::.:::::: ::::.:::
CCDS45 LFDHLEPEELSEHLTYLEFKSFRRISFSDYQNYLVNSCVKENPTMERSIALCNGISQWVQ
     200       210       220       230       240       250         

        210       220       230       240       250       260      
pF1KSD LMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSE
       :::::.:::: ::::. :::.::.:: ::.::::::::.::: :::::::::: ::.  :
CCDS45 LMVLSRPTPQLRAEVFIKFIQVAQKLHQLQNFNTLMAVIGGLCHSSISRLKETSSHVPHE
     260       270       280       290       300       310         

        270       280       290       300       310       320      
pF1KSD VTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVN
       ..:  .:::::.::. :: :::.:...:  ::::::::::::::...  .::. :..:::
CCDS45 INKVLGEMTELLSSSRNYDNYRRAYGECTDFKIPILGVHLKDLISLYEAMPDYLEDGKVN
     320       330       340       350       360       370         

        330       340       350       360       370       380      
pF1KSD IVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSK
       . :.  :   .::::.::...  :: : ::..:::::::::.:::.::.:: . :::: .
CCDS45 VHKLLALYNHISELVQLQEVAPPLEANKDLVHLLTLSLDLYYTEDEIYELSYAREPRNHR
     380       390       400       410       420       430         

        390       400       410       420       430       440      
pF1KSD SPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFES
       .:                                     :::.:::::.:::::::.::.
CCDS45 AP-------------------------------------SVFKNYDHDQDGYISQEEFEK
     440                                            450       460  

        450       460       470       480       490       500      
pF1KSD IAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTF
       :::.:::  ::::.:::..::::.::. :::.::.: .. :.: :: ::::: :::::::
CCDS45 IAASFPF--SFCVMDKDREGLISRDEITAYFMRASS-IYSKLGLGFPHNFQETTYLKPTF
              470       480       490        500       510         

        510       520       530       540       550         560    
pF1KSD CEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSL--P----
       :..:::::::.:::::.::::: :::::::::.:. :.. :. :   . ...   :    
CCDS45 CDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKRAKNPVAPTENNTSVGPVSNL
     520       530       540       550       560       570         

                 570           580       590       600       610   
pF1KSD ---GSPSLPPAQDE-VFEFPG---VTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQAT
          :. .:  : .:  : ::.   :  :... : :.: :.  ::.:::.::.::.. .::
CCDS45 CSLGAKDLLHAPEEGPFTFPNGEAVEHGEESKD-RTIMLMGVSSQKISLRLKRAVAHKAT
     580       590       600       610        620       630        

           620       630       640                      650        
pF1KSD QTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKA---------------AKDKGFAKWENEKPR
       :::     .. : ::  .. . ..  .:                 .. ..:.::::.   
CCDS45 QTESQPWIGSEGPSGPFVLSSPRKTAQDTLYVLPSPTSPCPSPVLVRKRAFVKWENKDSL
      640       650       660       670       680       690        

      660       670       680                                      
pF1KSD VHAGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG                             
                                                                   
CCDS45 IKSKEELRHLRLPTYQELEQEINTLKADNDALKIQLKYAQKKIESLQLEKSNHVLAQMEQ
      700       710       720       730       740       750        

>>CCDS59383.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19          (639 aa)
 initn: 1341 init1: 647 opt: 1203  Z-score: 1205.5  bits: 233.4 E(32554): 7.9e-61
Smith-Waterman score: 1474; 41.0% identity (66.8% similar) in 630 aa overlap (1-619:43-617)

                                                 10        20      
pF1KSD                               MGSSGLG----KAATLDELLCTCIEMFDDN
                                     :.: .::     . . ::::  ::. ::. 
CCDS59 ECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDELLEKCIQSFDSA
             20        30        40        50        60        70  

          30        40        50        60        70        80     
pF1KSD GEL-DNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKF
       : :  ....  .:: :: : : :..:: .::  :..:::.. .  ::.::...:::... 
CCDS59 GSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQICHLVRYWLMRH
             80        90       100       110       120       130  

          90       100       110       120         130       140   
pF1KSD PAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSI--PSYDWMRRVTQRKKVSKKGK
       :  .. :  : ..  .:  .... :   .  : : :..  :.        .   ..:: :
CCDS59 PEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPLPMSSPGLGKKRK
            140       150       160       170       180       190  

           150       160       170       180       190       200   
pF1KSD ACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISK
       . :::::::  :::.:::.:: .::. :.                               
CCDS59 VSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAIT-------------------------------
            200       210       220                                

           210       220       230       240       250       260   
pF1KSD WVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHL
          .::::.: : :::.:. :::.::..: ::.::::::::.::: ::.:::::..:.::
CCDS59 ---VMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHSAISRLKDSHAHL
                230       240       250       260       270        

           270       280       290       300       310       320   
pF1KSD SSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEEN
       : . ::   :.:::..:..::  ::...: : ::..:.::::::::...:   ::   ..
CCDS59 SPDSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDG
      280       290       300       310       320       330        

           330       340       350       360       370       380   
pF1KSD KVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPR
       .... :...: . :.:::.::.       : ::..::::::::..:::.::.:: . :::
CCDS59 RLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPR
      340       350       360       370       380       390        

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD NSKS-PTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQE
         :: : ::   : :.: .::: :: :::: .....:...::::::.::: .  : ::::
CCDS59 CPKSLPPSPF--NAPLV-VEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQE
      400         410        420       430       440       450     

            450        460       470       480       490       500 
pF1KSD DFESIAANFPFL-DSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTY
       ::: ...::::   ..    ..  : .:..:. .:.::: : .  :.: .:.:.:.:.:.
CCDS59 DFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRA-SAICSKLGLAFLHTFHEVTF
         460       470       480       490        500       510    

             510       520       530       540       550       560 
pF1KSD LKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSLPG
        :::::. :.:::::. ::::.:..::  :::.:.: . . :..    :. ..: .. ::
CCDS59 RKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKK---RPG-AKGDAGPPG
          520       530       540       550          560        570

               570       580       590       600       610         
pF1KSD SPSLP--PAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQATQTEPVW
       .: .:  ::       : .. : ..  : ...:      . . .:..: : :. . .: :
CCDS59 AP-VPSTPA-------PHASCGSEENHSYTLSLEP----ETGCQLRHAWT-QTESPHPSW
                      580       590           600        610       

     620       630       640       650       660       670         
pF1KSD SEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVHAGVDVVDRGTEFELDQDEG
                                                                   
CCDS59 ETDTVPCPVMDPPSTASSKLDS                                      
       620       630                                               

>>CCDS54263.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19          (576 aa)
 initn: 1198 init1: 498 opt: 929  Z-score: 932.3  bits: 182.7 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 1078; 34.6% identity (58.4% similar) in 630 aa overlap (1-619:43-554)

                                                 10        20      
pF1KSD                               MGSSGLG----KAATLDELLCTCIEMFDDN
                                     :.: .::     . . ::::  ::. ::. 
CCDS54 ECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDELLEKCIQSFDSA
             20        30        40        50        60        70  

          30        40        50        60        70        80     
pF1KSD GEL-DNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKF
       : :  ....  .:: :: : : :..:: .::  :..:::.. .  ::.::...:::... 
CCDS54 GSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQICHLVRYWLMRH
             80        90       100       110       120       130  

          90       100       110       120         130       140   
pF1KSD PAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSI--PSYDWMRRVTQRKKVSKKGK
       :  .. :  : ..  .:  .... :   .  : : :..  :.        .   ..:: :
CCDS54 PEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLLSPGGPGPPLPMSSPGLGKKRK
            140       150       160       170       180       190  

           150       160       170       180       190       200   
pF1KSD ACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISK
       . :::::::  :::.:::.:: .::. :.                       ::.     
CCDS54 VSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAIT-----------------------ALL-----
            200       210       220                                

           210       220       230       240       250       260   
pF1KSD WVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHL
                                                                   
CCDS54 ------------------------------------------------------------
                                                                   

           270       280       290       300       310       320   
pF1KSD SSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEEN
                :.:::..:..::  ::...: : ::..:.::::::::...:   ::   ..
CCDS54 ---------ELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDG
                   230       240       250       260       270     

           330       340       350       360       370       380   
pF1KSD KVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPR
       .... :...: . :.:::.::.       : ::..::::::::..:::.::.:: . :::
CCDS54 RLHLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPR
         280       290       300       310       320       330     

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD NSKS-PTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQE
         :: : ::   : :.: .::: :: :::: .....:...::::::.::: .  : ::::
CCDS54 CPKSLPPSPF--NAPLV-VEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQE
         340         350        360       370       380       390  

            450        460       470       480       490       500 
pF1KSD DFESIAANFPFL-DSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTY
       ::: ...::::   ..    ..  : .:..:. .:.::: : .  :.: .:.:.:.:.:.
CCDS54 DFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRA-SAICSKLGLAFLHTFHEVTF
            400       410       420       430        440       450 

             510       520       530       540       550       560 
pF1KSD LKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSLPG
        :::::. :.:::::. ::::.:..::  :::.:.: . . :..    :. ..: .. ::
CCDS54 RKPTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKK---RPG-AKGDAGPPG
             460       470       480       490           500       

               570       580       590       600       610         
pF1KSD SPSLP--PAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQATQTEPVW
       .: .:  ::       : .. : ..  : ...:      . . .:..: : :. . .: :
CCDS54 AP-VPSTPA-------PHASCGSEENHSYTLSLEP----ETGCQLRHAWT-QTESPHPSW
        510              520       530           540        550    

     620       630       640       650       660       670         
pF1KSD SEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVHAGVDVVDRGTEFELDQDEG
                                                                   
CCDS54 ETDTVPCPVMDPPSTASSKLDS                                      
          560       570                                            




689 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 03:43:56 2016 done: Thu Nov  3 03:43:57 2016
 Total Scan time:  3.680 Total Display time:  0.160

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com