Result of FASTA (omim) for
pFN21ASDA0813
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0813, 1534 aa
1>>>pF1KSDA0813 1534 - 1534 aa - 1534 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4982+/-0.000741; mu= 8.3011+/- 0.045
mean_var=340.0353+/-68.024, 0's: 0 Z-trim(113.8): 704 B-trim: 893 in 2/50
Lambda= 0.069552
statistics sampled from 22411 (23308) to 22411 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 12.030
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein pr (1534) 10855 1106.0 0
NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein is (1529) 7433 762.6 0
XP_005248268 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1533) 7426 761.9 8.7e-219
NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1525) 7345 753.8 2.4e-216
XP_016864334 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1495) 7231 742.3 6.6e-213
XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1499) 7224 741.6 1.1e-212
NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein (1530) 6694 688.5 1.1e-196
NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1521) 6094 628.3 1.5e-178
NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein is (1523) 5521 570.8 3e-161
XP_016865268 (OMIM: 603745) PREDICTED: slit homolo (1460) 5519 570.5 3.4e-161
XP_011512212 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1159) 5426 561.1 1.9e-158
XP_006714049 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1509) 3735 391.6 2.7e-107
XP_016883196 (OMIM: 118450,187500,601920) PREDICTE (1059) 844 101.3 4.6e-20
NP_000205 (OMIM: 118450,187500,601920) protein jag (1218) 844 101.3 5e-20
NP_004548 (OMIM: 164951) neurogenic locus notch ho (2003) 822 99.4 3.1e-19
NP_005609 (OMIM: 606582) delta-like protein 1 prec ( 723) 809 97.5 4.2e-19
XP_005259981 (OMIM: 125310,130720,600276,615293) P (2269) 788 96.1 3.5e-18
NP_000426 (OMIM: 125310,130720,600276,615293) neur (2321) 788 96.1 3.6e-18
NP_001186930 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogen (1235) 774 94.3 6.5e-18
NP_060087 (OMIM: 109730,190198,616028) neurogenic (2555) 776 94.9 8.7e-18
XP_011539822 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 774 94.7 9.8e-18
XP_005270958 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 774 94.7 9.8e-18
XP_016856862 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 774 94.7 9.8e-18
XP_016856861 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2455) 774 94.7 9.8e-18
XP_011539821 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2467) 774 94.7 9.8e-18
NP_077719 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogenic (2471) 774 94.7 9.8e-18
NP_699197 (OMIM: 611691) sushi, von Willebrand fac (3571) 777 95.2 9.9e-18
XP_005266991 (OMIM: 606582) PREDICTED: delta-like ( 524) 664 82.8 8.3e-15
NP_660142 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform (1200) 631 80.0 1.3e-13
NP_002217 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform (1238) 631 80.0 1.4e-13
NP_056356 (OMIM: 608868) leucine-rich repeats and (1093) 615 78.3 3.9e-13
NP_982353 (OMIM: 277300,602768) delta-like protein ( 587) 606 77.0 5e-13
NP_058637 (OMIM: 277300,602768) delta-like protein ( 618) 606 77.1 5.2e-13
XP_016859265 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1420) 610 77.9 6.4e-13
XP_011509239 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido ( 905) 603 77.0 8e-13
XP_016859268 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 603 77.2 9.9e-13
XP_016859267 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 603 77.2 9.9e-13
XP_016859269 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 603 77.2 9.9e-13
XP_016859270 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 603 77.2 9.9e-13
XP_011509236 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1315) 603 77.2 9.9e-13
XP_011509235 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1351) 603 77.2 1e-12
XP_011509234 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1404) 603 77.2 1e-12
NP_001073906 (OMIM: 616634) sushi, nidogen and EGF (1413) 603 77.2 1e-12
XP_016859264 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1425) 603 77.2 1e-12
XP_016859263 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1434) 603 77.2 1e-12
XP_011509233 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1437) 603 77.3 1e-12
XP_016859262 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1458) 603 77.3 1.1e-12
NP_061947 (OMIM: 605185,616589) delta-like protein ( 685) 587 75.2 2.1e-12
NP_001136272 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3144) 571 74.5 1.5e-11
NP_001278938 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3165) 571 74.5 1.5e-11
>>NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein precur (1534 aa)
initn: 10855 init1: 10855 opt: 10855 Z-score: 5908.5 bits: 1106.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10855; 99.9% identity (100.0% similar) in 1534 aa overlap (1-1534:1-1534)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_003 RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGAVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
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pF1KSD GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
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pF1KSD GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
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pF1KSD CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530
pF1KSD LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
1510 1520 1530
>>NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein isofor (1529 aa)
initn: 6576 init1: 3063 opt: 7433 Z-score: 4052.7 bits: 762.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7433; 66.1% identity (87.5% similar) in 1516 aa overlap (21-1533:15-1527)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
:. : ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
NP_004 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
NP_004 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
:...::::: .. : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
NP_004 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
: :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
NP_004 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
:: ::. ::: ::::::: :: :::. .. .:.:.. ::: :::::.:::::::::
NP_004 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
: ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::
NP_004 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..
NP_004 SLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::
NP_004 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERI
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NP_004 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTA
:: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.
NP_004 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD NQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFD
:.::... ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::
NP_004 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD TLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFR
::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. ::
NP_004 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT
660 670 680 690 700 710
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pF1KSD CEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPG
:..:.....: : .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::::
NP_004 CDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPK
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pF1KSD QLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLS
.::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.::::::
NP_004 ELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLS
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pF1KSD LHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQD
:::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .
NP_004 LHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGE
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: :::::::.::: :::: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::
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900 910 920 930 940 950
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.::.: . .: :.::..::::: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. : :..
NP_004 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS
960 970 980 990 1000 1010
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pF1KSD VCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGD
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NP_004 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KSD NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ
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NP_004 HCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQ
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KSD NGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTA
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NP_004 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KSD EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM
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NP_004 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KSD VNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNL
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NP_004 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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pF1KSD YINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPA
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NP_004 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
1320 1330 1340 1350 1360 1370
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pF1KSD DGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGT
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NP_004 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
1380 1390 1400 1410 1420 1430
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pF1KSD KGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC
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NP_004 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
1440 1450 1460 1470 1480 1490
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pF1KSD CQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
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NP_004 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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>>XP_005248268 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolog 2 (1533 aa)
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Smith-Waterman score: 7426; 66.0% identity (87.3% similar) in 1519 aa overlap (21-1533:15-1531)
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pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
:. : ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
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pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
:...::::: .. : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
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:: ::. ::: ::::::: :: :: . :. . .:.:.. ::: :::::.::::::
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XP_005 SLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKL
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pF1KSD QSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRI
:..:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::
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pF1KSD ERIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELH
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:::::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::.
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pF1KSD DFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTL
:: :..:.....: : .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::
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:: .::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::
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: .: :::::::.::: :::: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :
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pF1KSD YKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACA
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pF1KSD AGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGT
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XP_005 VGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNF
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XP_005 DCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI
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XP_005 ATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLAL
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pF1KSD DQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCI
:: ..::.:::.: . :..:. ::: ..:::::::: : :..: :::.:::::
XP_005 DQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCI
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pF1KSD RNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
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XP_005 RNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCD
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pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
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XP_005 QRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRL
1380 1390 1400 1410 1420 1430
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pF1KSD SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
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XP_005 SGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAG
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1500 1510 1520 1530
pF1KSD QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
:: :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :
XP_005 GQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1500 1510 1520 1530
>>NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein iso (1525 aa)
initn: 7565 init1: 3063 opt: 7345 Z-score: 4005.0 bits: 753.8 E(85289): 2.4e-216
Smith-Waterman score: 7345; 65.4% identity (86.8% similar) in 1519 aa overlap (21-1533:15-1523)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
:. : ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
NP_001 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
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pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
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NP_001 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
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pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
:...::::: .. : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
NP_001 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
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pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
: :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
NP_001 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
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pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGR---VPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRG
:: ::. ::: ::::::: :: :: . :. . .:.:.. ::: :::::.::::::
NP_001 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSDEEEGHQSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRG
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NP_001 KGLTEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLR
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:::::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.
NP_001 SLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRI
:..:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::
NP_001 QTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIP
::::::::::: ::::: .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.:::
NP_001 GQIKSKKFRCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIP
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ERIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELH
:.::: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:.
NP_001 EHIPQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEIL
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD LTANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPG
::.:.::... ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.::
NP_001 LTSNRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPG
590 600 610 620 630 640
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pF1KSD AFDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFP
:::::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::.
NP_001 AFDTLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQ
650 660 670 680 690 700
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pF1KSD DFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTL
:: :..:.....: : .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::
NP_001 DFTCDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTL
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pF1KSD VPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLR
:: .::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::
NP_001 VPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLR
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pF1KSD LLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAG
::::::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::
NP_001 LLSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAG
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pF1KSD PQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSG
: .: :::::::.::: :::: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :
NP_001 PGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYG
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pF1KSD YKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACA
.::.::.: . .: :.::..::::: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. :
NP_001 FKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCE
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pF1KSD NGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGY
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NP_001 NNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGY
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KSD AGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGT
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NP_001 VGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KSD ECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQV
.:::::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . . :..:::::.
NP_001 DCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KSD STAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAF
.: ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.
NP_001 ATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLAL
1190 1200 1210 1220 1230 1240
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pF1KSD DQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCI
:: ..::.:::.: . :..:. ::: ..:::::::: : :..: :::.:::::
NP_001 DQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCI
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KSD RNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
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NP_001 RNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCD
1310 1320 1330 1340 1350 1360
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pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
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NP_001 QRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRL
1370 1380 1390 1400 1410 1420
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pF1KSD SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
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NP_001 SGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAG
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pF1KSD QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
:: :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :
NP_001 GQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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pF1KSD AWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIPRNTERL----ELNGNNITRIHKNDF
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:::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.:...::::: .. : :::::
XP_016 AGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPELLFLGTAKLYRLDLS
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pF1KSD ENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSF
:: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::: :::::::::::: . :.::
XP_016 ENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVLTLNNNNITRLSVASF
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pF1KSD NHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEF
::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.::: ::. ::: ::::::: ::
XP_016 NHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPSHLRGHNVAEVQKREF
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:::. .. .:.:.. ::: :::::.:::::::::: ::.:::::.:::::: : :
XP_016 VCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPETITEIRLEQNTI
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pF1KSD KSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLY
: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.::...: ::.
XP_016 KVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLF
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.:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..:::::. ::::::.:::::::
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::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY
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pF1KSD --QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQSTAELRLNNNEISILEATG
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XP_016 RSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRLNNNEFTVLEATG
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pF1KSD MFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQLESIRSGMFRGLDGLRTLM
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XP_016 IFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHKMFKGLESLKTLM
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pF1KSD LRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQL
::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::: :
XP_016 LRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLNLLANPFNCNCYL
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:::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. :: :..:.....: : .:: ::.
XP_016 AWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNSCSPLSRCPTECT
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pF1KSD CLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSL
::::::::::: :..::::::..::::::::::::::: .::..:.: :.:::::.::.:
XP_016 CLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTL
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:::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .: :::::::.::: ::::
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pF1KSD LAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTC
. . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::.::.: . .: :.::..::::
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: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. : :...::::..:::: :: .: :.
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pF1KSD CEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCM
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XP_016 CEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCT
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pF1KSD DEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFG
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XP_016 GEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYR
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pF1KSD GHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYT
:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.:: ..::.:::.: . :..:. :
XP_016 GRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQST
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:: ..:::::::: : :..: :::.:::::::::::.::::: :. :. :..::
XP_016 LNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDFQKVPMQTGILPG
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pF1KSD CEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALS
::::.: : :: :::.. : :.:. ::.: ::: .. :: :.::::: :.:..:.:
XP_016 CEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFS
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pF1KSD YSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESE
:::.: .:..:.::.. : .::....: ::.:. :: .: :. :..:. :..:
XP_016 YSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDREIS
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pF1KSD CRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSF
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XP_016 CRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSF
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1520 1530
pF1KSD AEEVEKPTKCGCALCA
..:::: .::::. :
XP_016 VDEVEKVVKCGCTRCVS
1480 1490
>>XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolog 2 (1499 aa)
initn: 7435 init1: 3063 opt: 7224 Z-score: 3939.5 bits: 741.6 E(85289): 1.1e-212
Smith-Waterman score: 7224; 65.9% identity (87.0% similar) in 1488 aa overlap (56-1533:12-1497)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD AWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIPRNTERL----ELNGNNITRIHKNDF
:..: : :: .::::::::: :.::
XP_011 MPGASETPLCSPESINGVTLRLPASRDLNGNNITRITKTDF
10 20 30 40
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pF1KSD AGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQLHMLPELLFQNNQALSRLDLS
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XP_011 AGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPELLFLGTAKLYRLDLS
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pF1KSD ENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSF
:: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::: :::::::::::: . :.::
XP_011 ENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVLTLNNNNITRLSVASF
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pF1KSD NHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEF
::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.::: ::. ::: ::::::: ::
XP_011 NHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPSHLRGHNVAEVQKREF
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD SCSGQGEAGR---VPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLEL
:: . :. . .:.:.. ::: :::::.:::::::::: ::.:::::.::::::
XP_011 VCSDEEEGHQSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPETITEIRLEQ
230 240 250 260 270
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pF1KSD NGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITDLPRGVFG
: :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.::...:
XP_011 NTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITELPKSLFE
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pF1KSD GLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQ
::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..:::::. ::::::.::::
XP_011 GLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQ
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KSD NPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGT
:::::::.::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGT
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KSD EDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQSTAELRLNNNEISILE
::: .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.::::.::: ::::::::::...::
XP_011 EDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRLNNNEFTVLE
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KSD ATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQLESIRSGMFRGLDGLR
:::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.:.::... ::.::..:.
XP_011 ATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHKMFKGLESLK
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD TLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTLQSLSTLNLLANPFNCN
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XP_011 TLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLNLLANPFNCN
580 590 600 610 620 630
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pF1KSD CQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQ
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XP_011 CYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNSCSPLSRCPT
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pF1KSD ECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQLSTFKYLQLVDLSNNKI
::.::::::::::: :..::::::..::::::::::::::: .::..:.: :.:::::.:
XP_011 ECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLTLIDLSNNRI
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pF1KSD SSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLHGNDISTLQEGIFADVT
:.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::::::::::::.. :: : :..
XP_011 STLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVVPEGAFNDLS
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pF1KSD SLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDMEGKLLLTTPAKKFECQG
.:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .: :::::::.::: :::
XP_011 ALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTTPSKKFTCQG
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pF1KSD PPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENG
: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::.::.: . .: :.::..:
XP_011 PVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHACISNPCKHG
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pF1KSD GTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYE
:::: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. : :...::::..:::: :: .:
XP_011 GTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYT
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pF1KSD GKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGA
:. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::.:..:. . :::.:..:.:::
XP_011 GELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KSD QCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLP
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XP_011 HCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KSD GFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVE
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XP_011 GYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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pF1KSD LYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGK
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XP_011 LYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGNPKIITNLSK
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KSD HYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKPGV
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XP_011 QSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDFQKVPMQTGI
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD VPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHGQCVPLD
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XP_011 LPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHGTCLPIN
1300 1310 1320 1330 1340 1350
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pF1KSD ALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQ
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XP_011 AFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCDR
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KSD ESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDG
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XP_011 EISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDG
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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pF1KSD TSFAEEVEKPTKCGCALCA
.::..:::: .::::. :
XP_011 SSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1480 1490
>>NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein iso (1530 aa)
initn: 3611 init1: 1617 opt: 6694 Z-score: 3652.0 bits: 688.5 E(85289): 1.1e-196
Smith-Waterman score: 6694; 59.2% identity (82.8% similar) in 1545 aa overlap (3-1534:1-1530)
10 20 30 40 50
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLG--ASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKN
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NP_001 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRG
10 20 30 40 50
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pF1KSD IPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNR
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NP_001 IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
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pF1KSD NQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFR
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NP_001 NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD ALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGL
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NP_001 ALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQ
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pF1KSD FTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGK
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NP_001 FTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP--HSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGK
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD GLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRS
:: ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.:::.:.:::..:::::::::.:
NP_001 GLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKS
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pF1KSD LNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ
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NP_001 LTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD SLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIG
...:: :. :..:::::::::::.:::.::::::.:. ::::::::::.::::::::::.
NP_001 TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRIS
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pF1KSD QIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQ--LNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPE
:::::::::: :.:::. ..::: :.:::.:::::...:.::. ::..::
NP_001 QIKSKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPS
480 490 500 510 520
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pF1KSD RIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHL
..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::::..:...:::.:::::.:: :
NP_001 HLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELML
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD TANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGA
:.::::.... .::::.::.:::::.: :.:. ::.:.:: .:::::::::.:::..:::
NP_001 TGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGA
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pF1KSD FDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPD
: :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.::::::.: ::..::.::::. :
NP_001 FTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQD
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pF1KSD FRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLV
: :. :.::..: :.::..:.:..:::::::: :::::.:.::.::::::.::..: :
NP_001 FTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV
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pF1KSD PGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRL
: .::....: :.:::::.:: :.: .:.:::.:.::::::: :.::: ::.::::::.
NP_001 PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
770 780 790 800 810 820
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pF1KSD LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGP
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NP_001 LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
830 840 850 860 870 880
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pF1KSD QDMEGKLLLTTPAKKFECQ-------GPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYR
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NP_001 EPMADRLLLTTPTHRFQCKVLWFCCPGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYR
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pF1KSD CACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDC
:::: .:::.:: : ...: ..::..::::: .... :.:::: :::: : .: :::
NP_001 CACPYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDC
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pF1KSD VDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRC
:. : :...::::..::.: :: .: :. :....: : :.:: :::::.:. : :
NP_001 EDNDCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSC
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KSD ECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-
::.:::.: : ..::: :.:..::::.: .:.:.: : .:.:: .:: :: . .
NP_001 ECVPGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQT
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KSD SPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRA
:::. ::::::.:. ..:.:.: :::.::.::::..:::: .:.:..... . :.:
NP_001 SPCDQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQA
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pF1KSD NITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHT
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NP_001 NISLQVATDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHS
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pF1KSD VELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGT
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NP_001 VELVTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLG
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KSD GFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAG
::::::... :::::::: . :: :::. : : ::.:. . .:.:. :
NP_001 GFHGCIHEVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPG
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD WVGLHCDQPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQC
:.: ::: : :: ::.: ::.:: . :: :.: .::.: ::.. . :. : ...:
NP_001 WTGPLCDQEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKC
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD LHGHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVE
::.:. : .:.:.:::::: :.::. : :. ::. . :.::: : :. . .:
NP_001 HHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIME
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KSD CRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
:::.: : ::: : ::::..:.:.::.::.::::. .::: :.
NP_001 CRGGC-GPQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
1490 1500 1510 1520 1530
>>NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein iso (1521 aa)
initn: 7570 init1: 3063 opt: 6094 Z-score: 3326.6 bits: 628.3 E(85289): 1.5e-178
Smith-Waterman score: 7352; 65.6% identity (86.9% similar) in 1516 aa overlap (21-1533:15-1519)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
:. : ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
NP_001 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
10 20 30 40 50
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pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
NP_001 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
:...::::: .. : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
NP_001 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
: :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
NP_001 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
:: ::. ::: ::::::: :: :::. .. .:.:.. ::: :::::.:::::::::
NP_001 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
: ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::
NP_001 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
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NP_001 SLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTI
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pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
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NP_001 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI
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pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERI
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NP_001 KSKKFRCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI
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NP_001 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS
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:.::... ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::
NP_001 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD
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pF1KSD TLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFR
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NP_001 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT
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:..:.....: : .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::::
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.::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.::::::
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: :::::::.::: :::: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::
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.::.: . .: :.::..::::: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. : :..
NP_001 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS
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pF1KSD VCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGD
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NP_001 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE
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pF1KSD NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ
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NP_001 HCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQ
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pF1KSD NGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTA
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NP_001 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD
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pF1KSD EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM
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NP_001 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS
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pF1KSD VNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNL
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NP_001 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL
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pF1KSD YINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPA
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NP_001 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
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pF1KSD DGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGT
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NP_001 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
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pF1KSD KGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC
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pF1KSD CQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
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NP_001 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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>>NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein isofor (1523 aa)
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pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLG--ASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKN
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pF1KSD IPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNR
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:: ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.:::.:.:::..:::::::::.:
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NP_003 LTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ
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pF1KSD SLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIG
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NP_003 TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRIS
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pF1KSD QIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQ--LNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPE
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..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::::..:...:::.:::::.:: :
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: :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.::::::.: ::..::.::::. :
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pF1KSD FRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLV
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: .::....: :.:::::.:: :.: .:.:::.:.::::::: :.::: ::.::::::.
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NP_003 EPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSY
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NP_003 NATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYS
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: : ..::: :.:..::::.: .:.:.: : .:.:: .:: :: . . :::. :
NP_003 GKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYE
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NP_003 TDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLN
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pF1KSD QMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIR
: .:: .: :.: .. .. :. ... ..:::.::.:.... .:.: ::::::.
NP_003 QTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIH
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pF1KSD NLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
.. :::::::: . :: :::. : : ::.:. . .:.:. ::.: ::
NP_003 EVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCD
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pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
: : :: ::.: ::.:: . :: :.: .::.: ::.. . :. : ...: ::.:.
NP_003 QEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHI
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pF1KSD SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
: .:.:.:::::: :.::. : :. ::. . :.::: : :. . .::::.: :
NP_003 SDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-G
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pF1KSD QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
::: : ::::..:.:.::.::.::::. .::: :.
NP_003 PQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
1490 1500 1510 1520
>>XP_016865268 (OMIM: 603745) PREDICTED: slit homolog 3 (1460 aa)
initn: 4346 init1: 1903 opt: 5519 Z-score: 3015.0 bits: 570.5 E(85289): 3.4e-161
Smith-Waterman score: 6487; 59.9% identity (83.5% similar) in 1472 aa overlap (67-1534:4-1460)
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pF1KSD LCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQ
.:. :::::: : ::::::.::::.: .::
XP_016 MMGDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQ
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..:.:::::.:.:.:::::::.:.:..:::::::.. :.::::::: ::.::::::::
XP_016 VSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGI
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD TDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNH
::.::::::.:.:::::.::::::: ::.::::::::. : :.:::::::.::.::::::
XP_016 TDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNH
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD LFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCT
:.:::::::::.::::: :.: :: : .:. :::.:::.:::.:. : . .. :.:.
XP_016 LYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPH--SEPPSCN
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLR
.: :::. :::::.::::::::: ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.
XP_016 ANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]