Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0813
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0813, 1534 aa
1>>>pF1KSDA0813 1534 - 1534 aa - 1534 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1312+/-0.00177; mu= 16.8761+/- 0.106
mean_var=322.6122+/-62.781, 0's: 0 Z-trim(106.7): 305 B-trim: 5 in 1/50
Lambda= 0.071406
statistics sampled from 8783 (9111) to 8783 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 4.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 10855 1135.0 0
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 7433 782.4 0
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 7345 773.4 0
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 6692 706.1 2.1e-202
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 6094 644.5 7.4e-184
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 5519 585.3 5e-166
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 844 103.5 4.3e-21
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 822 101.6 2.6e-20
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 ( 723) 809 99.5 4e-20
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 788 98.2 3.2e-19
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 776 97.0 8e-19
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 777 97.4 8.8e-19
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 774 96.8 9.1e-19
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 631 81.5 1.7e-14
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 631 81.6 1.7e-14
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093) 615 79.8 5.1e-14
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 587) 606 78.5 7.1e-14
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 618) 606 78.5 7.3e-14
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2 (1413) 603 78.8 1.4e-13
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 ( 685) 587 76.6 3e-13
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144) 571 76.0 2e-12
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165) 571 76.0 2e-12
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2 ( 737) 542 72.0 7.7e-12
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 ( 870) 527 70.6 2.4e-11
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1406) 527 70.9 3.1e-11
>>CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534 aa)
initn: 10855 init1: 10855 opt: 10855 Z-score: 6064.9 bits: 1135.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10855; 99.9% identity (100.0% similar) in 1534 aa overlap (1-1534:1-1534)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS74 RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGAVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530
pF1KSD LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
1510 1520 1530
>>CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529 aa)
initn: 6576 init1: 3063 opt: 7433 Z-score: 4159.7 bits: 782.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7433; 66.1% identity (87.5% similar) in 1516 aa overlap (21-1533:15-1527)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
:. : ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
CCDS34 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
CCDS34 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
:...::::: .. : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
CCDS34 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
: :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
CCDS34 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
:: ::. ::: ::::::: :: :::. .. .:.:.. ::: :::::.:::::::::
CCDS34 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
: ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::
CCDS34 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..
CCDS34 SLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS34 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERI
::::::::::::::::::::: .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.::::.:
CCDS34 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTA
:: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.
CCDS34 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFD
:.::... ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::
CCDS34 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD TLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFR
::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. ::
CCDS34 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD CEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPG
:..:.....: : .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::::
CCDS34 CDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPK
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLS
.::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.::::::
CCDS34 ELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLS
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQD
:::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .
CCDS34 LHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGE
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD MEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKG
: :::::::.::: :::: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::
CCDS34 MADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKG
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD RDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGG
.::.: . .: :.::..::::: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. : :..
CCDS34 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD VCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGD
.::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::.:.
CCDS34 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ
.:. . :::.:..:.:::.: : ::.:.:.: ::::: .::. : . :. :::.. .::
CCDS34 HCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQ
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD NGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTA
:::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . . :..:::::..:
CCDS34 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM
::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.::
CCDS34 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD VNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNL
..::.:::.: . :..:. ::: ..:::::::: : :..: :::.::::::::
CCDS34 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD YINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPA
:::.::::: :. :. :..::::::.: : :: :::.. : :.:. ::.: ::: .
CCDS34 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD DGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGT
. :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::.. : .::....: ::.:. ::
CCDS34 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD KGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC
.: :. :..:. :..: :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: : :
CCDS34 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1500 1510 1520 1530
pF1KSD CQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
: :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :
CCDS34 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1500 1510 1520
>>CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525 aa)
initn: 7565 init1: 3063 opt: 7345 Z-score: 4110.8 bits: 773.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7345; 65.4% identity (86.8% similar) in 1519 aa overlap (21-1533:15-1523)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
:. : ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
CCDS75 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
CCDS75 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
:...::::: .. : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
CCDS75 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
: :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
CCDS75 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGR---VPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRG
:: ::. ::: ::::::: :: :: . :. . .:.:.. ::: :::::.::::::
CCDS75 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSDEEEGHQSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KGLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLR
:::: ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.:::::::::
CCDS75 KGLTEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKI
:::::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.
CCDS75 SLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRI
:..:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::
CCDS75 QTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIP
::::::::::: ::::: .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.:::
CCDS75 GQIKSKKFRCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIP
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ERIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELH
:.::: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:.
CCDS75 EHIPQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEIL
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LTANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPG
::.:.::... ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.::
CCDS75 LTSNRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPG
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KSD AFDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFP
:::::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::.
CCDS75 AFDTLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQ
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KSD DFRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTL
:: :..:.....: : .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::
CCDS75 DFTCDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KSD VPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLR
:: .::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.:::
CCDS75 VPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLR
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAG
::::::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::
CCDS75 LLSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAG
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KSD PQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSG
: .: :::::::.::: :::: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :
CCDS75 PGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYG
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD YKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACA
.::.::.: . .: :.::..::::: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. :
CCDS75 FKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCE
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD NGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGY
:...::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::
CCDS75 NNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGY
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD AGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGT
.:..:. . :::.:..:.:::.: : ::.:.:.: ::::: .::. : . :. :::..
CCDS75 VGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD ECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQV
.:::::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . . :..:::::.
CCDS75 DCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQI
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD STAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAF
.: ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.
CCDS75 ATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLAL
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD DQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCI
:: ..::.:::.: . :..:. ::: ..:::::::: : :..: :::.:::::
CCDS75 DQSLSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCI
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD RNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
::::::.::::: :. :. :..::::::.: : :: :::.. : :.:. ::.: ::
CCDS75 RNLYINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCD
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
: .. :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::.. : .::....: ::.:.
CCDS75 QRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRL
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
:: .: :. :..:. :..: :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: :
CCDS75 SGLGQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAG
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1500 1510 1520 1530
pF1KSD QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
:: :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :
CCDS75 GQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1490 1500 1510 1520
>>CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530 aa)
initn: 3610 init1: 1615 opt: 6692 Z-score: 3747.2 bits: 706.1 E(32554): 2.1e-202
Smith-Waterman score: 6692; 59.2% identity (82.8% similar) in 1545 aa overlap (3-1534:1-1530)
10 20 30 40 50
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLG--ASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKN
..:::.. .. :: .: : : :. : : :::. :::....::::: ::.:.:..
CCDS64 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD IPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNR
::::.:::.:. :::::: : ::::::.::::.: .::..:.:::::.:.:.:::::::.
CCDS64 IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFR
:.:..:::::::.. :.::::::: ::.:::::::: ::.::::::.:.:::::.::::
CCDS64 NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGL
::: ::.::::::::. : :.:::::::.::.:::::::.:::::::::.::::: :.:
CCDS64 ALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGK
:: : .:. :::.:::.:::.:. : . .. :.:. .: :::. :::::.:::::::
CCDS64 FTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP--HSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRS
:: ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.:::.:.:::..:::::::::.:
CCDS64 GLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ
:.::::::::::.. .:.: :: .:::::::::::::.: ..:::::::.::::::::.:
CCDS64 LTSLVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIG
...:: :. :..:::::::::::.:::.::::::.:. ::::::::::.::::::::::.
CCDS64 TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRIS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD QIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQ--LNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPE
:::::::::: :.:::. ..::: :.:::.:::::...:.::. ::..::
CCDS64 QIKSKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPS
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD RIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHL
..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::::..:...:::.:::::.:: :
CCDS64 HLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELML
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD TANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGA
:.::::.... .::::.::.:::::.: :.:. ::.:.:: .:::::::::.:::..:::
CCDS64 TGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGA
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KSD FDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPD
: :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.::::::.: ::..::.::::. :
CCDS64 FTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQD
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KSD FRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLV
: :. :.::..: :.::..:.:..:::::::: :::::.:.::.::::::.::..: :
CCDS64 FTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KSD PGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRL
: .::....: :.:::::.:: :.: .:.:::.:.::::::: :.::: ::.::::::.
CCDS64 PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGP
:.:::::::.. :: : :.:::::::.:.:::.::: ::::: :::.::::::::::..:
CCDS64 LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940
pF1KSD QDMEGKLLLTTPAKKFECQ-------GPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYR
. : .::::::...:.:. :: . . :::. ::::::.:.::: .::.:.::
CCDS64 EPMADRLLLTTPTHRFQCKVLWFCCPGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYR
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD CACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDC
:::: .:::.:: : ...: ..::..::::: .... :.:::: :::: : .: :::
CCDS64 CACPYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDC
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD VDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRC
:. : :...::::..::.: :: .: :. :....: : :.:: :::::.:. : :
CCDS64 EDNDCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSC
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD ECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-
::.:::.: : ..::: :.:..::::.: .:.:.: : .:.:: .:: :: . .
CCDS64 ECVPGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQT
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD SPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRA
:::. ::::::.:. ..:.:.: :::.::.::::..:::: .:.:..... . :.:
CCDS64 SPCDQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQA
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD NITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHT
::.:::.: .:::::::.:::: .:.::::::::. :: : : ...::.::.::::::.
CCDS64 NISLQVATDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHS
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD VELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGT
::::...: .:: .: :.: .. .. :. ... ..:::.::.:.... .:.:
CCDS64 VELVTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLG
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD GFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAG
::::::... :::::::: . :: :::. : : ::.:. . .:.:. :
CCDS64 GFHGCIHEVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPG
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD WVGLHCDQPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQC
:.: ::: : :: ::.: ::.:: . :: :.: .::.: ::.. . :. : ...:
CCDS64 WTGPLCDQEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKC
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD LHGHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVE
::.:. : .:.:.:::::: :.::. : :. ::. . :.::: : :. . .:
CCDS64 HHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIME
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KSD CRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
:::.: : ::: : ::::..:.:.::.::.::::. .::: :.
CCDS64 CRGGC-GPQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
1490 1500 1510 1520 1530
>>CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521 aa)
initn: 7570 init1: 3063 opt: 6094 Z-score: 3414.3 bits: 644.5 E(32554): 7.4e-184
Smith-Waterman score: 7352; 65.6% identity (86.9% similar) in 1516 aa overlap (21-1533:15-1519)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
:. : ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
CCDS75 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
CCDS75 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
:...::::: .. : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
CCDS75 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
: :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
CCDS75 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
:: ::. ::: ::::::: :: :::. .. .:.:.. ::: :::::.:::::::::
CCDS75 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
: ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::
CCDS75 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..
CCDS75 SLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS75 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERI
:::::::: ::::: .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.::::.:
CCDS75 KSKKFRCS--------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTA
:: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.
CCDS75 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFD
:.::... ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::
CCDS75 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KSD TLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFR
::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. ::
CCDS75 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KSD CEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPG
:..:.....: : .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::::
CCDS75 CDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPK
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLS
.::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.::::::
CCDS75 ELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLS
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQD
:::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .
CCDS75 LHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGE
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KSD MEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKG
: :::::::.::: :::: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::
CCDS75 MADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKG
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD RDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGG
.::.: . .: :.::..::::: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. : :..
CCDS75 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD VCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGD
.::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::.:.
CCDS75 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ
.:. . :::.:..:.:::.: : ::.:.:.: ::::: .::. : . :. :::.. .::
CCDS75 HCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQ
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD NGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTA
:::.:. . :.:.::::::. : .::::.::::.....:::. . . :..:::::..:
CCDS75 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM
::.:::::.::.::::::::.:.::.::: ::.:.:::::.::::::.:: :::.:.::
CCDS75 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD VNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNL
..::.:::.: . :..:. ::: ..:::::::: : :..: :::.::::::::
CCDS75 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD YINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPA
:::.::::: :. :. :..::::::.: : :: :::.. : :.:. ::.: ::: .
CCDS75 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD DGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGT
. :: :.::::: :.:..:.::::.: .:..:.::.. : .::....: ::.:. ::
CCDS75 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD KGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC
.: :. :..:. :..: :::. .::..: :.::: ::::. .: .::::.: : :
CCDS75 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1500 1510 1520 1530
pF1KSD CQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
: :: ::::..:::.::.::..:::: .::::. :
CCDS75 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1490 1500 1510 1520
>>CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523 aa)
initn: 4535 init1: 1903 opt: 5519 Z-score: 3094.1 bits: 585.3 E(32554): 5e-166
Smith-Waterman score: 6716; 59.4% identity (83.2% similar) in 1538 aa overlap (3-1534:1-1523)
10 20 30 40 50
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLG--ASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKN
..:::.. .. :: .: : : :. : : :::. :::....::::: ::.:.:..
CCDS43 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD IPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNR
::::.:::.:. :::::: : ::::::.::::.: .::..:.:::::.:.:.:::::::.
CCDS43 IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFR
:.:..:::::::.. :.::::::: ::.:::::::: ::.::::::.:.:::::.::::
CCDS43 NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGL
::: ::.::::::::. : :.:::::::.::.:::::::.:::::::::.::::: :.:
CCDS43 ALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGK
:: : .:. :::.:::.:::.:. : . .. :.:. .: :::. :::::.:::::::
CCDS43 FTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP--HSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRS
:: ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.:::.:.:::..:::::::::.:
CCDS43 GLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ
:.::::::::::.. .:.: :: .:::::::::::::.: ..:::::::.::::::::.:
CCDS43 LTSLVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIG
...:: :. :..:::::::::::.:::.::::::.:. ::::::::::.::::::::::.
CCDS43 TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRIS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD QIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQ--LNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPE
:::::::::: :.:::. ..::: :.:::.:::::...:.::. ::..::
CCDS43 QIKSKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPS
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD RIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHL
..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::::..:...:::.:::::.:: :
CCDS43 HLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELML
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD TANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGA
:.::::.... .::::.::.:::::.: :.:. ::.:.:: .:::::::::.:::..:::
CCDS43 TGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGA
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KSD FDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPD
: :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.::::::.: ::..::.::::. :
CCDS43 FTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQD
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KSD FRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLV
: :. :.::..: :.::..:.:..:::::::: :::::.:.::.::::::.::..: :
CCDS43 FTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KSD PGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRL
: .::....: :.:::::.:: :.: .:.:::.:.::::::: :.::: ::.::::::.
CCDS43 PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGP
:.:::::::.. :: : :.:::::::.:.:::.::: ::::: :::.::::::::::..:
CCDS43 LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KSD QDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGY
. : .::::::...:.:.:: . . :::. ::::::.:.::: .::.:.:::::: .:
CCDS43 EPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSY
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD KGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACAN
::.:: : ...: ..::..::::: .... :.:::: :::: : .: ::: :. : :
CCDS43 KGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCEN
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD GGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYA
...::::..::.: :: .: :. :....: : :.:: :::::.:. : :::.:::.
CCDS43 NATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD GDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTE
: : ..::: :.:..::::.: .:.:.: : .:.:: .:: :: . . :::. :
CCDS43 GKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD CQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVS
:::::.:. ..:.:.: :::.::.::::..:::: .:.:..... . :.:::.:::.
CCDS43 CQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVA
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD TAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFD
: .:::::::.:::: .:.::::::::. :: : : ...::.::.::::::.::::...
CCDS43 TDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLN
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD QMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIR
: .:: .: :.: .. .. :. ... ..:::.::.:.... .:.: ::::::.
CCDS43 QTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIH
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD NLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
.. :::::::: . :: :::. : : ::.:. . .:.:. ::.: ::
CCDS43 EVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCD
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
: : :: ::.: ::.:: . :: :.: .::.: ::.. . :. : ...: ::.:.
CCDS43 QEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHI
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
: .:.:.:::::: :.::. : :. ::. . :.::: : :. . .::::.: :
CCDS43 SDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-G
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1500 1510 1520 1530
pF1KSD QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
::: : ::::..:.:.::.::.::::. .::: :.
CCDS43 PQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
1490 1500 1510 1520
>>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218 aa)
initn: 881 init1: 282 opt: 844 Z-score: 492.2 bits: 103.5 E(32554): 4.3e-21
Smith-Waterman score: 902; 28.9% identity (51.8% similar) in 629 aa overlap (867-1463:248-828)
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGP
: : :. : . . .:: :
CCDS13 KTCMEGWMGPECNRAICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPG---C---
220 230 240 250 260 270
900 910 920 930 940 950
pF1KSD QDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCD----LCLS-SPCQNQGTCHNDPLEVYRCA
..: . . : ..: . . : :: : . .:: : ::: : . :.:.
CCDS13 --VHG--ICNEP---WQCLCETNWGGQL-CDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCS
280 290 300 310 320
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD CPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVD
:: ::.: .::.. .: : ::.: :.:. . : : : :. ::::..: :::
CCDS13 CPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKET---SLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSP
330 340 350 360 370 380
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD HACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCEC
. :..::.: : :... : :: :. ::.:. .. : . .:: . .: . . :.:
CCDS13 NNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANEC--EAKPCVNAKSCKNLIASYYCDC
390 400 410 420 430
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD MPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPC
.::. :.::. : .:: . ::: :.: : ::.: :.: ::.:. :: . :
CCDS13 LPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCE------RDIDEC
440 450 460 470 480 490
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD EGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANIT
.. : ::..: .. :: : : ::.: :. :.... . . . : . ::.
CCDS13 ASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQ--LDIDYCEPNPCQN--GAQCYNRASDY
500 510 520 530 540
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD LQVSTAEDNGILLYNGDN-DHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVE
. . :: :.: : .:. . : :.. .. .... .: .
CCDS13 F-CKCPED-----YEGKNCSHL-----KDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISS
550 560 570 580 590
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD LVAFDQMVNLSIDGGSPMTMD-NFG-----KHYTLNS--EAPLYVGGMPVD-VNSAAFRL
: . : .::. .: : : : : ..:. : :: .: :::
CCDS13 NVCGPHGKCKSQSGGK-FTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCIC
600 610 620 630 640 650
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD ---WQ-ILNGTGFHGCIRNLYIN-----NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGIC
:. :... : .: : . ..:: . : : : : .. :
CCDS13 SDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFY-CDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATC
660 670 680 690 700 710
1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD QPNAT---PGPM--CHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHG-QCVPLDALSYSCQCQDG
. ..: : : : .:: : :. .. : . : .: :: ... :..: :..:
CCDS13 NNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCV-VNGESFTCVCKEG
720 730 740 750 760 770
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KSD YSGALCNQAGALAEPCRGLQCLH-GHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQE-SECRGDPV
. : .: : .. : : . : : ..: . .: : :::.: :. . .::...:
CCDS13 WEGPICAQN---TNDCSPHPCYNSGTC-VDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPC
780 790 800 810 820
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KSD RDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEK
CCDS13 AFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGR
830 840 850 860 870 880
>>CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003 aa)
initn: 753 init1: 262 opt: 822 Z-score: 478.0 bits: 101.6 E(32554): 2.6e-20
Smith-Waterman score: 963; 27.8% identity (48.1% similar) in 899 aa overlap (694-1530:47-832)
670 680 690 700 710 720
pF1KSD STLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQ-NPDFLRQIPLQDVAFPDFRCEEG
:. :: : :: . ::: :...
CCDS34 CVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFLGET----CQFPD-PCQNA
20 30 40 50 60 70
730 740 750 760
pF1KSD Q--EEGG-C---LPRP----QCPQE------CACLD--TVVRCSNKHLRALPKGIPKNVT
: ..:: : :: : . :. :.:: : ::. : : .. ..
CCDS34 QLCQNGGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKLEDPCPPSFCSKRG
80 90 100 110 120 130
770 780 790 800 810 820
pF1KSD ELYLDGN---QFTLVPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQ
. ..... : . .:: : . :: :. . .: .. :.: : .:
CCDS34 RCHIQASGRPQCSCMPGW--TGEQCQLRDFCS------ANPCVNGGVCLAT----YPQIQ
140 150 160 170
830 840 850 860 870 880
pF1KSD CIPPLAFQGLRSLRLLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWV
: : .:.: : .. .: . .: :: : ..:. . : : .
CCDS34 CHCPPGFEGHACERDVNECFQDPGPCPKG-----TS-CHNTLGS--FQCLCPV-------
180 190 200 210 220
890 900 910 920
pF1KSD KTGYKEPGIARC---AGPQDMEGK------LLLTTPAKKFE-CQGPPTLAVQAKC----D
: . : :: ::: .: :. . :. : :: . . : :
CCDS34 --GQEGP---RCELRAGPCPPRGCSNGGTCQLMPEKDSTFHLCLCPPGF-IGPDCEVNPD
230 240 250 260 270
930 940 950 960 970 980
pF1KSD LCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSC-SSGP--CENGGTCHAQEG
:.: ::: :::. : :..: : :: . : :: ..: : ..:: :.:::::. . :
CCDS34 NCVSHQCQNGGTCQ-DGLDTYTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAG
280 290 300 310 320 330
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD EDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLV
: : : .:. : .: : :::. .:: :..:.: ::...: :: : : .:
CCDS34 S---FHCVCVSGWGGTSCEENLDDCIAATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLC-HLE
340 350 360 370 380 390
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD DLCSPDLNPCQHEAQCVGTP-DGPR-CECMPGYAGDNCSENQDDCRDHR-----CQNGAQ
:.: .::. .::: .: : : :.:::.: .: .. :.: . :..:..
CCDS34 DMCLS--QPCHGDAQCSTNPLTGSTLCLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGS
400 410 420 430 440 450
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD CMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGF
:.. .:..::: ::.:. :: : .. : . :. :..:.: : : ::.
CCDS34 CLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCE------ADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGL
460 470 480 490 500
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD GGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELY
: :: . .: :. .: .. : :: . : . .
CCDS34 EGQLCE--VETNECASAPCLNHADCHD-------------------LLNG-FQCICLPGF
510 520 530 540
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD QGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETIND--GQFHTVELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGK
.: .: : :: .. .: : :: : .:. .: . . .
CCDS34 SG-TRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAFHCKCLPGFE----------GPRCQTEVDE
550 560 570 580 590
1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD HYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHG-------CIRNLYINNELQDFTK
:.. : ::. .:. .: : : .:: : : :: ... :
CCDS34 --CLSDPCP--VGASCLDLPGAFF----CLCPSGFTGQLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQK
600 610 620 630 640
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD TQ---MKPGVVPGCEPCR-KLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGH
. . : ::: : . . : :: :: .. : :..::.: .:. : : .
CCDS34 DKANCLCPDGSPGCAPPEDNCTCHHGHCQRSS-----CVCDVGWTGPECEAELGG-CISA
650 660 670 680 690
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD KCVHG-QCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGAHCV
:.:: : : . .:.: : ::.: :.. :.. ::.: . : .:.
CCDS34 PCAHGGTCYPQPS-GYNCTCPTGYTGPTCSEE---MTACHSGPCLNGGSCNPSPGGYYCT
700 710 720 730 740 750
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD CDPGFSGELCEQESE-CRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC-CQGL
: :. .: :. .. : . : :. . : ..:: .. : . :: :.:
CCDS34 CPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPC--FNG-----GTC-VNRPGTF-SCLCAMGFQGPRCEG-
760 770 780 790 800
1510 1520 1530
pF1KSD RLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
.:. : . .. . . : .: :
CCDS34 KLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGP-RCLCPTGYTGGSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTG
810 820 830 840 850 860
>>CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 (723 aa)
initn: 648 init1: 261 opt: 809 Z-score: 474.8 bits: 99.5 E(32554): 4e-20
Smith-Waterman score: 828; 37.4% identity (58.4% similar) in 305 aa overlap (867-1166:240-520)
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGI--ARCA
: : :.. : . . . :: . :
CCDS53 KVCNPGWKGPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQ
210 220 230 240 250 260
900 910 920 930 940 950
pF1KSD GPQDMEGKLLLTTPAKKFECQ-GPPTLAVQAKCDLCLS-SPCQNQGTCHNDPLEVYRCAC
: . .:: : : . . : .::.: .:: : : :.:
CCDS53 QPW-------------QCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSC
270 280 290 300 310
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD PSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDH
:: : ::...: :. .::.:::.: :. ..:.:: :: : : ... :.:
CCDS53 RPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLEN---SYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADG
320 330 340 350 360 370
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD ACANGGVCVDGV-GNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCEC
: ::: : :. :.:.:.::. : : ::. .: :: .::.. :.:: :. :.:
CCDS53 PCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSS--SPCSNGAKCVDLGDAYLCRC
380 390 400 410 420 430
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD MPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPC
. :..: .:..: ::: . : ::. : : ::..:: : ::.:. : :: : :
CCDS53 QAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCS------APVSRC
440 450 460 470 480
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD EGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANIT
: . :.:::.: ..:.: ::.: :.:::.:. ::
CCDS53 EHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVVDLTEKLEGQGGPFPW
490 500 510 520 530 540
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD LQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVEL
CCDS53 VAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREKDISVS
550 560 570 580 590 600
>>CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321 aa)
initn: 733 init1: 469 opt: 788 Z-score: 458.5 bits: 98.2 E(32554): 3.2e-19
Smith-Waterman score: 974; 30.3% identity (51.8% similar) in 627 aa overlap (859-1463:95-665)
830 840 850 860 870 880
pF1KSD QGLRSLRLLSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEP
: .. :. . : : :.. :
CCDS12 CLCPPGWVGERCQLEDPCHSGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRC---------PRGFRGP
70 80 90 100 110
890 900 910 920 930 940
pF1KSD GIAR---CAGPQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTL---AVQAKCDLC-LSSPCQNQGTCH
. : . .: . : .: :. :: . .. : : .. ::.. :::
CCDS12 DCSLPDPCLSSPCAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEPCRHGGTCL
120 130 140 150 160 170
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD NDPLEVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPT
: : .:: ::.:: : :: :. .::.:::::. : : : . :.: :::: .
CCDS12 NTP-GSFRCQCPAGYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCR-QSG-DLTYDCACLPGFEGQN
180 190 200 210 220 230
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD CGVNTDDCVDHACANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCV
: ::.::: : : :::.:::::..:.:::: .. :. : . :: :. . : :.. . :
CCDS12 CEVNVDDCPGHRCLNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCF
240 250 260 270 280 290
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD GTPDGPRCECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIP
.: : : :. :..:..::.: ::: : .:: : :.: :. : : : .: ::
CCDS12 NTLGGHSCVCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLC---
300 310 320 330 340
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD PHLPAPKSPCEGTECQNGANCVDQ--GNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQF
:: . : .. :.. : : . ..: .: : ::: : :.. : :
CCDS12 -HLD---DACVSNPCHEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQ-------DVDE----
350 360 370 380 390
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD TDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAE
.. : .. :.: ....: : . : : : : . :. .
CCDS12 CSIGANPCEHLGRCVNT--QGSFLCQCGRG-------YTGP-RCETDVNECLSGPCRNQA
400 410 420 430 440
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD TIND--GQFHTVELVAFD-QMVNLSID--GGSPMTMDNFGKHYT--LNSEAPLYVGGMPV
: : ::: . ...: . ...:: .:: . . : . .. : .:
CCDS12 TCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVNGGVCKDRVNGFSCTCPSGFSGSTC
450 460 470 480 490 500
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD DVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIR--NLYINNELQDFTKTQMKPGVVPGC--EPCRKLYCL
... ::. :. . : . : : . : : .::.. :.
CCDS12 QLDVDECASTPCRNGA---KCVDQPDGYECRCAEGFEGT-LCDRNVDDCSPDPCHHGRCV
510 520 530 540 550 560
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD HGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHG-QCVPLDALSYSCQCQDGY
:: . . : : :..: .:.. .: :... : :: .:. : . .: :.: .:
CCDS12 DGIASFS------CACAPGYTGTRCESQVD-ECRSQPCRHGGKCLDL-VDKYLCRCPSGT
570 580 590 600 610
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KSD SGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQE-SECRGDPVRD
.:. :. . : . : : :. .: . :::.:::.: ::. : .:: ..:
CCDS12 TGVNCEVN---IDDCASNPCTFGVCR-DGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINECASSPCGE
620 630 640 650 660
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KSD FHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPT
CCDS12 GGSCVDGENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSGPR
670 680 690 700 710 720
>--
initn: 523 init1: 281 opt: 684 Z-score: 400.6 bits: 87.5 E(32554): 5.4e-16
Smith-Waterman score: 877; 29.8% identity (49.8% similar) in 607 aa overlap (916-1500:726-1258)
890 900 910 920 930 940
pF1KSD KEPGIARCAGPQDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPL
:: :. : : :.::. ::: .: .
CCDS12 SHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLAR-DACESQPCRAGGTCSSDGM
700 710 720 730 740 750
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD EVYRCACPSGYKGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVN
..:.:: : .::.::. :. :. .:::.:: :.. :. : .:::: :..:: : .
CCDS12 G-FHCTCPPGVQGRQCEL-LSPCTPNPCEHGGRCESAPGQ-LP-VCSCPQGWQGPRCQQD
760 770 780 790 800 810
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD TDDCVDHA-CANGGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTP
.:.:. : :. :.:.. .:...: : : : .:.: .. :.: ::: . ..:
CCDS12 VDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDCDP--NPCLNGGSCQDGV
820 830 840 850 860
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD DGPRCECMPGYAGDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHL
. : :.::.:: :... :.: .. : :. : :.: :..: : ::.: :: :
CCDS12 GSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPCGPGT-CTDHVASFTCTCPPGYGGFHCE--QDL
870 880 890 900 910 920
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD PAPKSPCEGTECQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQN
: : . : ::..::: : : : ::. : .:.. . : :.
CCDS12 P----DCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQH-------EADPCLS------
930 940 950 960
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD WPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDG
: . : .: :. .: . : : : . ..:
CCDS12 --RPCLHGGVCSAAHPGFRC-------TCLESFTG-------PQCQTLVDWCSRQPCQNG
970 980 990 1000 1010
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD QFHTVELVAFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQI
. :. :. : : : :. . : : .. . : :: :.
CCDS12 G-RCVQTGAY----CLCPPGWS-------GRLCDIRS-LPCREAAAQIGV-----RLEQL
1020 1030 1040 1050
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD LNGTGFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPG--CE----PCRKLYCLHGICQPNATP
.. : :. .: .. . : : :: :: : :: .
CCDS12 CQAGG--QCVD--------EDSSHYCVCPEGRTGSHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYMG
1060 1070 1080 1090 1100
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD GPMCHCEAGWVGLHCDQPADGPCHGHKCVHG-QCVPLDALSYSCQCQDGYSGALC----N
: ::.: :. : .:.. .: : .. : :: .:. : : : :.: : :.:: .
CCDS12 GYMCECLPGYNGDNCEDDVD-ECASQPCQHGGSCIDLVA-RYLCSCPPGTLGVLCEINED
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1420 1430 1440 1450 1460
pF1KSD QAGALAEPCRGLQCLH-GHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQE-SECRGDP-----VRD
. : : .::: : : .. . : .:.: ::..: :: . .:::. .::
CCDS12 DCGPGPPLDSGPRCLHNGTC-VDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECRSGACHAAHTRD
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KSD FHQVQRGYAICQTTRPLSWVECR---GSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVE
: : : .: .:. . : .: : .:
CCDS12 CLQDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTVLSPCESQPCQHGGQCRPSPGPGGGLTFTCHCAQPF
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1530
pF1KSD KPTKCGCALCA
CCDS12 WGPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQTPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSPPGASNASCAA
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1534 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 03:14:11 2016 done: Thu Nov 3 03:14:12 2016
Total Scan time: 4.990 Total Display time: 0.700
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]