Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0680
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0680, 634 aa
1>>>pF1KSDA0680 634 - 634 aa - 634 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9378+/-0.00104; mu= -18.8288+/- 0.063
mean_var=421.0322+/-85.450, 0's: 0 Z-trim(116.1): 19 B-trim: 109 in 1/52
Lambda= 0.062505
statistics sampled from 16662 (16679) to 16662 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.512), width: 16
Scan time: 3.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47492.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 ( 634) 4121 385.6 1.1e-106
CCDS47493.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 ( 645) 4095 383.3 5.6e-106
CCDS43512.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 ( 554) 2662 254.0 3.9e-67
CCDS47494.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 ( 565) 2662 254.0 3.9e-67
CCDS41293.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1 ( 702) 995 103.7 8.5e-22
CCDS41294.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1 ( 712) 995 103.7 8.6e-22
CCDS75401.1 PHACTR1 gene_id:221692|Hs108|chr6 ( 580) 886 93.9 6.6e-19
CCDS42895.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 ( 518) 807 86.7 8.3e-17
CCDS56202.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 ( 556) 807 86.8 8.8e-17
CCDS13480.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 ( 559) 807 86.8 8.9e-17
CCDS13481.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 ( 448) 774 83.7 5.7e-16
>>CCDS47492.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 (634 aa)
initn: 4121 init1: 4121 opt: 4121 Z-score: 2028.9 bits: 385.6 E(32554): 1.1e-106
Smith-Waterman score: 4121; 99.8% identity (99.8% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS47 GNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRPKPKPKKSPVPPKGAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLT
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KSD PADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
610 620 630
>>CCDS47493.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 (645 aa)
initn: 4095 init1: 4095 opt: 4095 Z-score: 2016.2 bits: 383.3 E(32554): 5.6e-106
Smith-Waterman score: 4095; 99.7% identity (99.8% similar) in 631 aa overlap (4-634:15-645)
10 20 30 40
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGQTSVSTLSPQPGSVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS47 TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRPKPKP
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630
pF1KSD RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
610 620 630 640
>>CCDS43512.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 (554 aa)
initn: 2655 init1: 2655 opt: 2662 Z-score: 1318.8 bits: 254.0 E(32554): 3.9e-67
Smith-Waterman score: 3399; 87.4% identity (87.4% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-554)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGAT
::::::::::::::::::::
CCDS43 GNGSVSEKTPPLEEQAEDKK----------------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPST
::::::::::::::::::::
CCDS43 ----------------------------------------AGSSHSKKTTGSKASASPST
150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KSD IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLT
470 480 490 500 510 520
610 620 630
pF1KSD PADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
530 540 550
>>CCDS47494.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 (565 aa)
initn: 2655 init1: 2655 opt: 2662 Z-score: 1318.7 bits: 254.0 E(32554): 3.9e-67
Smith-Waterman score: 3373; 87.2% identity (87.3% similar) in 631 aa overlap (4-634:15-565)
10 20 30 40
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGQTSVSTLSPQPGSVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKP
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKK-----------------------------
130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKT
:::::::::
CCDS47 ---------------------------------------------------AGSSHSKKT
160
230 240 250 260 270 280
pF1KSD TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KSD DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KSD TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KSD ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD
470 480 490 500 510 520
590 600 610 620 630
pF1KSD RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
530 540 550 560
>>CCDS41293.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1 (702 aa)
initn: 1205 init1: 688 opt: 995 Z-score: 504.8 bits: 103.7 E(32554): 8.5e-22
Smith-Waterman score: 1293; 40.1% identity (59.5% similar) in 676 aa overlap (34-634:37-702)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD AVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLE
.: .:::::::::::::.::::.::: :::
CCDS41 EADQPTTEPGMVLDSVEAGDTTPPTKRKSKFSGFGKIFKPWKWRKKKSSDKFKETSEVLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENS---NGHMIPIGEESTREENVVKSEE
:::: :. ::::..:::: : :.: :. . .. ::: :::. . :. :
CCDS41 RKISMRKPREELVKRGVLLEDPEQGGEDPGKPSDAMLKNGHTTPIGNARSSSPVQVEEEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAE-----DKKENTENHS---ETPAAPALPPSAP---PKPRSKPKP
. .:. : :. . .. :.: .: ..: : :::. : . :. .
CCDS41 VRLASLRKAIPEEDLKKRLGSTGSQPNSEAESVPENVPKPPLLPPKRPLSSSHEASEGQA
130 140 150 160 170 180
170 180 190
pF1KSD KKS------------------PVPPKGATAGA---------SHKGDEVP--PIKKNTKA-
: . :. .::. : : .: : . :: :
CCDS41 KDATSSGGTARFIISTSITTAPAATTAATSLAKTVNLSVTPSPAPRTLPAAPASTNTTAT
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230
pF1KSD -------PGKQAPVPPPKPASRNTTREAA--------GSSHSKKTT------GSKASASP
:.:: :.:::::: ::.. : :. :: . : ... :
CCDS41 PSLTHMVPAKQPPIPPPKPAHRNSNPVIAELSQAINSGTLLSKPSPPLPPKRGIPSTSVP
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KSD STSS----TSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGE
. : :.. :. .: . . :. . .. . :. .:. . . :
CCDS41 TLESAAAITTKTPSDEREKSTCSMGSELLPMISPRSPSPPLPTHIPPEPPRTPPFPAKTF
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PAETRVE---SFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAP-APSPLAPPLPLEDQCITAS
. ..: :. :.: .: :.:. : .. : :: : :::::. . :
CCDS41 QVVPEIEFPPSLDLHQEIPQQEDQKKEVPKRILDQNFGEPHIPSRL-PPLPLHIRIQQAL
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400
pF1KSD DTPVVLVSV--GADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELG
.:. .. . :. : : .. ..:. . :: .: .. : : .::
CCDS41 TSPLPMTPILEGSHRAHSLLFENSDSFSEDSS---TLGRTRSLPITIEMLKVPDDEEEEE
430 440 450 460 470 480
410 420 430 440 450 460
pF1KSD KTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESA
.: :. .. : .: . . ..: . .::::.::: : :.::::: : .::
CCDS41 QTCPSTFSEE-MTPTSVIPKLPQCLREEEEKESDSDSEGPIQYRDEEDEDE----SYQSA
490 500 510 520 530
470 480 490 500 510 520
pF1KSD LASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTE
::.:..:.::::.::..:::. :: . : :.:: .:::.:::. :.:::::::: :
CCDS41 LANKVKRKDTLAMKLNHRPSEPEL-NLNSWPCKSKEEWNEIRHQIGNTLIRRLSQRPTPE
540 550 560 570 580 590
530 540 550 560 570 580
pF1KSD ELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDY
::::::::. ::: ..: : :.::::.:::: ::::::: ::.::::::::::::. ::
CCDS41 ELEQRNILQPKNEADRQAEKREIKRRLTRKLSQRPTVAELLARKILRFNEYVEVTDAQDY
600 610 620 630 640 650
590 600 610 620 630
pF1KSD DRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
::::::::..::::::::::::::::::.::::::::..:::.:::
CCDS41 DRRADKPWTKLTPADKAAIRKELNEFKSSEMEVHEESKHFTRYHRP
660 670 680 690 700
>>CCDS41294.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1 (712 aa)
initn: 1205 init1: 688 opt: 995 Z-score: 504.7 bits: 103.7 E(32554): 8.6e-22
Smith-Waterman score: 1293; 40.1% identity (59.5% similar) in 676 aa overlap (34-634:47-712)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD AVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLE
.: .:::::::::::::.::::.::: :::
CCDS41 EADQPTTEPGMVLDSVEAGDTTPPTKRKSKFSGFGKIFKPWKWRKKKSSDKFKETSEVLE
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENS---NGHMIPIGEESTREENVVKSEE
:::: :. ::::..:::: : :.: :. . .. ::: :::. . :. :
CCDS41 RKISMRKPREELVKRGVLLEDPEQGGEDPGKPSDAMLKNGHTTPIGNARSSSPVQVEEEP
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAE-----DKKENTENHS---ETPAAPALPPSAP---PKPRSKPKP
. .:. : :. . .. :.: .: ..: : :::. : . :. .
CCDS41 VRLASLRKAIPEEDLKKRLGSTGSQPNSEAESVPENVPKPPLLPPKRPLSSSHEASEGQA
140 150 160 170 180 190
170 180 190
pF1KSD KKS------------------PVPPKGATAGA---------SHKGDEVP--PIKKNTKA-
: . :. .::. : : .: : . :: :
CCDS41 KDATSSGGTARFIISTSITTAPAATTAATSLAKTVNLSVTPSPAPRTLPAAPASTNTTAT
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230
pF1KSD -------PGKQAPVPPPKPASRNTTREAA--------GSSHSKKTT------GSKASASP
:.:: :.:::::: ::.. : :. :: . : ... :
CCDS41 PSLTHMVPAKQPPIPPPKPAHRNSNPVIAELSQAINSGTLLSKPSPPLPPKRGIPSTSVP
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KSD STSS----TSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGE
. : :.. :. .: . . :. . .. . :. .:. . . :
CCDS41 TLESAAAITTKTPSDEREKSTCSMGSELLPMISPRSPSPPLPTHIPPEPPRTPPFPAKTF
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PAETRVE---SFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAP-APSPLAPPLPLEDQCITAS
. ..: :. :.: .: :.:. : .. : :: : :::::. . :
CCDS41 QVVPEIEFPPSLDLHQEIPQQEDQKKEVPKRILDQNFGEPHIPSRL-PPLPLHIRIQQAL
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400
pF1KSD DTPVVLVSV--GADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELG
.:. .. . :. : : .. ..:. . :: .: .. : : .::
CCDS41 TSPLPMTPILEGSHRAHSLLFENSDSFSEDSS---TLGRTRSLPITIEMLKVPDDEEEEE
440 450 460 470 480 490
410 420 430 440 450 460
pF1KSD KTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESA
.: :. .. : .: . . ..: . .::::.::: : :.::::: : .::
CCDS41 QTCPSTFSEE-MTPTSVIPKLPQCLREEEEKESDSDSEGPIQYRDEEDEDE----SYQSA
500 510 520 530 540
470 480 490 500 510 520
pF1KSD LASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTE
::.:..:.::::.::..:::. :: . : :.:: .:::.:::. :.:::::::: :
CCDS41 LANKVKRKDTLAMKLNHRPSEPEL-NLNSWPCKSKEEWNEIRHQIGNTLIRRLSQRPTPE
550 560 570 580 590 600
530 540 550 560 570 580
pF1KSD ELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDY
::::::::. ::: ..: : :.::::.:::: ::::::: ::.::::::::::::. ::
CCDS41 ELEQRNILQPKNEADRQAEKREIKRRLTRKLSQRPTVAELLARKILRFNEYVEVTDAQDY
610 620 630 640 650 660
590 600 610 620 630
pF1KSD DRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
::::::::..::::::::::::::::::.::::::::..:::.:::
CCDS41 DRRADKPWTKLTPADKAAIRKELNEFKSSEMEVHEESKHFTRYHRP
670 680 690 700 710
>>CCDS75401.1 PHACTR1 gene_id:221692|Hs108|chr6 (580 aa)
initn: 720 init1: 522 opt: 886 Z-score: 453.0 bits: 93.9 E(32554): 6.6e-19
Smith-Waterman score: 1081; 38.1% identity (59.2% similar) in 633 aa overlap (4-634:83-580)
10 20 30
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGK
:.. ... . ::. . :..:::..:..:
CCDS75 DDIDRRPIRRVRSKSDTPYLAEARISFNLGAAEEVERLAAMRSDSLVPGTHTPPIRRRSK
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTV
....:.::::::::::: :.::..:::.:::::: ::::::::.::::::. :.::....
CCDS75 FANLGRIFKPWKWRKKK-SEKFKHTSAALERKISMRQSREELIKRGVLKEIYDKDGELSI
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KSD NFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAP
. : :.: .. . ..: . . . . :. . . .. . :. .:
CCDS75 SNE----------EDSLENGQSLSSSQLSLPALSEMEPVPMPRDPCSYEVLQPSDIMDGP
180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KSD ALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPAS
:.:: : : . :.::: . : .. .. ... :.:. :.
CCDS75 --DPGAPVKLPCLPVKLSPPLPPKKVMICMPVGGPDLSLVSYTAQKSGQQGV------AQ
230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KSD RNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQ
.. : . .:. . ::... ::: :.: : . : : :.
CCDS75 HHHTVLPSQIQHQLQY-GSHGQHLPST--TGSLPMHPS--------------GCRMIDEL
280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAP
: .. . :.:: :: :: . ... ..: :. :
CCDS75 NKTLAMTMQ----------------RLESS--EQRVPCSTSYHSSGLHS---GDGVTKA-
320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSV
.:.. : ..:.:.. : :. .. .
CCDS75 GPMGLP--------EIRQVPTVVI-------------------ECDDNKENVPHES----
360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KSD NRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTD
. :...:. :.:: .
CCDS75 DYEDSSCLYTREE----------------------------------------------E
390
460 470 480 490 500 510
pF1KSD DEDEDEDEDGS-GESALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQ
.:.::::.:.: :.:: :. :.:.:::::.:::::.:::.:::: : ..::: :.:::
CCDS75 EEEEDEDDDSSLYTSSLAMKVCRKDSLAIKLSNRPSKRELEEKNILPRQTDEERLELRQQ
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KSD IGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARR
:::::.::::::::.:::::::::: .::.:::: : :.::::.:::: :::: ::. :.
CCDS75 IGTKLTRRLSQRPTAEELEQRNILKPRNEQEEQEEKREIKRRLTRKLSQRPTVEELRERK
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KSD IL-RFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRF
:: ::..::::.:. ::::::::::.::: :::::::::::::::::::::: ::..:::
CCDS75 ILIRFSDYVEVADAQDYDRRADKPWTRLTAADKAAIRKELNEFKSTEMEVHELSRHLTRF
520 530 540 550 560 570
pF1KSD HRP
:::
CCDS75 HRP
580
>>CCDS42895.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 (518 aa)
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Smith-Waterman score: 924; 34.1% identity (58.1% similar) in 628 aa overlap (8-634:1-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
.:.. : . ..: .::: .:..::.:.:.::::::::::: ..:...:..
CCDS42 MDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLATLGRIFKPWKWRKKK-NEKLKQTTS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
.::.:.. ::.:::::..:.: :. .::.. . : .: : .: :.::
CCDS42 ALEKKMAGRQGREELIKKGLL-EMMEQDAESKTC--NPDG-----GPRS------VQSE-
60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGAT
:: . .:. . : :. : .. : :: .:
CCDS42 ---------PPTPK--------SETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSS--------
100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPST
:.: : . : . . :..: . :.. . .. ::..
CCDS42 --AAHLDDAA---KMPSASSGEEADAGSLLPTTNELSQALAGAD----------------
140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
: .: :. ...:. . . :. .... :... :. . ..
CCDS42 -SLDSPPRPLERSVG-------------QLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQA
180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
:.: .:. . :.... . : .. . :: : .:. . . :
CCDS42 SSMK------SADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELHRALATKHRQDSFQG
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
. : .:.. : : . :.. . .::.: : : .:
CCDS42 RE---SKGSPKKRL-----DVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRT----------
280 290 300 310
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
.:.:.: ..: .:. .: .::. .: :: .: : .. . ::
CCDS42 -------AAKESEENKENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISG--TLPRKCKK-ELLA
320 330 340 350 360
490 500 510 520 530 540
pF1KSD IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
.:: :::::.::::.::. : ..:::::::::: :: .::::::..::::.::::::.:
CCDS42 VKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRN
370 380 390 400 410 420
550 560 570 580 590
pF1KSD EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRIL-RFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARL
.. ::: . :.:.::.:::. :::: ::. :.:: ::..::::. . ::::::::::.::
CCDS42 DQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRL
430 440 450 460 470 480
600 610 620 630
pF1KSD TPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
. ::::::::::::.::.::::: :...::::::
CCDS42 SAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFHRP
490 500 510
>>CCDS56202.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 (556 aa)
initn: 683 init1: 422 opt: 807 Z-score: 414.7 bits: 86.8 E(32554): 8.8e-17
Smith-Waterman score: 937; 34.2% identity (58.0% similar) in 634 aa overlap (2-634:33-556)
10 20 30
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRK
: : : .:.. : . ..: .::: .:.
CCDS56 GRGGGRARCPAPLRSLLGAFGARDAAAAARDPAQDEMDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDV
.::.:.:.::::::::::: ..:...:...::.:.. ::.:::::..:.: :. .::..
CCDS56 SKLATLGRIFKPWKWRKKK-NEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLL-EMMEQDAES
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPA
. : .: : .: :.:: :: . .:. . :
CCDS56 KTC--NPDG-----GPRS------VQSE----------PPTPK--------SETLTSEDA
130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KSD APALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKP
:. : .. : :: .: :.: : . : . . :..: . :
CCDS56 QPGSPLATGTDQVSLDKPLSS----------AAHLDDAA---KMPSASSGEEADAGSLLP
150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTD
.. . .. ::.. : .: :. ...:. .
CCDS56 TTNELSQALAGAD-----------------SLDSPPRPLERSVG-------------QLP
200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KSD KQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAP
. :. .... :... :. . .. :.: .:. . :.... . : ..
CCDS56 SPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMK------SADPSLRGQLSTPTGSPHLTT
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KSD APSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGL
. :: : .:. . . : . : .:.. : : . :..
CCDS56 VHRPLPPSRVIEELHRALATKHRQDSFQGRE---SKGSPKKRL-----DVRLSRTSSVER
290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KSD SVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILY
. .::.: : : .: .:.:.: ..: .:. .:
CCDS56 GKEREEAWSFDGALENKRT-----------------AAKESEENKENLIINSELKDDLLL
340 350 360 370
460 470 480 490 500 510
pF1KSD TDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQ
.::. .: :: .: : .. . ::.:: :::::.::::.::. : ..::::::::
CCDS56 YQDEEALNDSIISG--TLPRKCKK-ELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQ
380 390 400 410 420 430
520 530 540 550 560 570
pF1KSD QIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQAR
:: :: .::::::..::::.::::::.:.. ::: . :.:.::.:::. :::: ::. :
CCDS56 QIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDR
440 450 460 470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KSD RIL-RFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTR
.:: ::..::::. . ::::::::::.::. ::::::::::::.::.::::: :...::
CCDS56 KILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTR
500 510 520 530 540 550
pF1KSD FHRP
::::
CCDS56 FHRP
>>CCDS13480.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 (559 aa)
initn: 683 init1: 422 opt: 807 Z-score: 414.7 bits: 86.8 E(32554): 8.9e-17
Smith-Waterman score: 929; 34.1% identity (58.1% similar) in 630 aa overlap (6-634:40-559)
10 20 30
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLS
: .:.. : . ..: .::: .:..::.
CCDS13 CLVSRGRSQSDPSVLTDSSATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD TIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNF
:.:.::::::::::: ..:...:...::.:.. ::.:::::..:.: :. .::.. .
CCDS13 TLGRIFKPWKWRKKK-NEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLL-EMMEQDAESKTC-
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPAL
: .: : .: :.:: :: . .:. . : :.
CCDS13 -NPDG-----GPRS------VQSE----------PPTPK--------SETLTSEDAQPGS
130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRN
: .. : :: .: :.: : . : . . :..: . :.. .
CCDS13 PLATGTDQVSLDKPLSS----------AAHLDDAA---KMPSASSGEEADAGSLLPTTNE
160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KSD TTREAAGSSHSKKTTGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPI
.. ::. .: .: :. ...:. . . :.
CCDS13 LSQALAGA-----------------DSLDSPPRPLERSVG-------------QLPSPPL
210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSP
.... :... :. . .. :.: .:. . :.... . : .. . :
CCDS13 LPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMK------SADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRP
240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
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CCDS13 EEAWSFDGALENKRT-----------------AAKESEENKENLIINSELKDDLLLYQDE
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