Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0604
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0604, 765 aa
1>>>pF1KSDA0604 765 - 765 aa - 765 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4257+/-0.000968; mu= 19.4161+/- 0.058
mean_var=67.7070+/-13.471, 0's: 0 Z-trim(104.3): 24 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.155868
statistics sampled from 7802 (7819) to 7802 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46969.1 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 ( 765) 5148 1167.2 0
CCDS3256.2 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 ( 883) 4888 1108.8 0
CCDS33899.1 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 ( 736) 4876 1106.0 0
CCDS43179.1 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 ( 811) 4876 1106.1 0
CCDS44082.1 ECE1 gene_id:1889|Hs108|chr1 ( 767) 3372 767.8 0
CCDS44081.1 ECE1 gene_id:1889|Hs108|chr1 ( 754) 3371 767.6 0
CCDS215.1 ECE1 gene_id:1889|Hs108|chr1 ( 770) 3371 767.6 0
CCDS44083.1 ECE1 gene_id:1889|Hs108|chr1 ( 758) 3306 753.0 4e-217
CCDS2493.1 ECEL1 gene_id:9427|Hs108|chr2 ( 775) 1818 418.4 2.2e-116
CCDS77540.1 ECEL1 gene_id:9427|Hs108|chr2 ( 773) 1812 417.0 5.5e-116
CCDS30569.2 MMEL1 gene_id:79258|Hs108|chr1 ( 779) 1397 323.7 6.8e-88
CCDS14204.1 PHEX gene_id:5251|Hs108|chrX ( 749) 1358 315.0 2.9e-85
CCDS3172.1 MME gene_id:4311|Hs108|chr3 ( 750) 1251 290.9 5.1e-78
CCDS34766.1 KEL gene_id:3792|Hs108|chr7 ( 732) 1185 276.0 1.5e-73
>>CCDS46969.1 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 (765 aa)
initn: 5148 init1: 5148 opt: 5148 Z-score: 6250.1 bits: 1167.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5148; 100.0% identity (100.0% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNVALQELGAGSNMVEYKRATLRDEDAPETPVEGGASPDAMEVGFQKGTRQLLGSRTQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MNVALQELGAGSNMVEYKRATLRDEDAPETPVEGGASPDAMEVGFQKGTRQLLGSRTQLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LVLAGASLLLAALLLGCLVALGVQYHRDPSHSTCLTEACIRVAGKILESLDRGVSPCEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LVLAGASLLLAALLLGCLVALGVQYHRDPSHSTCLTEACIRVAGKILESLDRGVSPCEDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YQFSCGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQKTQRFYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YQFSCGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQKTQRFYLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CLQVERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFFTVYISAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CLQVERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFFTVYISAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SKSSNSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGGRPTSTREQMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SKSSNSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGGRPTSTREQMQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QVLELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLSPLELSDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QVLELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLSPLELSDSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PVVVYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKLLETLYGTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PVVVYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKLLETLYGTK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KSCVPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEEALGQLVWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KSCVPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEEALGQLVWM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DEKTRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNLYNFSAKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DEKTRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNLYNFSAKVM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ADQLRKPPSRDQWSMTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARNHPKALNFGGIGVVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ADQLRKPPSRDQWSMTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARNHPKALNFGGIGVVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GHELTHAFDDQGREYDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQYQVNGERLNGRQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GHELTHAFDDQGREYDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQYQVNGERLNGRQTL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GENIADNGGLKAAYNAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFAQVWCSVRTPESSHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GENIADNGGLKAAYNAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFAQVWCSVRTPESSHE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KSD GLVTDPHSPARFRVLGTLSNSRDFLRHFGCPVGSPMNPGQLCEVW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GLVTDPHSPARFRVLGTLSNSRDFLRHFGCPVGSPMNPGQLCEVW
730 740 750 760
>>CCDS3256.2 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 (883 aa)
initn: 4882 init1: 4882 opt: 4888 Z-score: 5933.2 bits: 1108.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4888; 97.7% identity (98.0% similar) in 749 aa overlap (20-765:135-883)
10 20 30 40
pF1KSD MNVALQELGAGSNMVEYKRATLRDEDAPET-PVEGGASPDAM--EVGFQ
: : : : : :: . : . :::::
CCDS32 PQLRWETMDVRKLDFPSASFDVVLEKGTLDALLAGERDPWTVSSEGVHTVDQVLSEVGFQ
110 120 130 140 150 160
50 60 70 80 90 100
pF1KSD KGTRQLLGSRTQLELVLAGASLLLAALLLGCLVALGVQYHRDPSHSTCLTEACIRVAGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGTRQLLGSRTQLELVLAGASLLLAALLLGCLVALGVQYHRDPSHSTCLTEACIRVAGKI
170 180 190 200 210 220
110 120 130 140 150 160
pF1KSD LESLDRGVSPCEDFYQFSCGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LESLDRGVSPCEDFYQFSCGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNS
230 240 250 260 270 280
170 180 190 200 210 220
pF1KSD SSEAEQKTQRFYLSCLQVERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSEAEQKTQRFYLSCLQVERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGT
290 300 310 320 330 340
230 240 250 260 270 280
pF1KSD YRATPFFTVYISADSKSSNSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YRATPFFTVYISADSKSSNSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGM
350 360 370 380 390 400
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LLGGRPTSTREQMQQVLELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLGGRPTSTREQMQQVLELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEF
410 420 430 440 450 460
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LSFLLSPLELSDSEPVVVYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSFLLSPLELSDSEPVVVYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFE
470 480 490 500 510 520
410 420 430 440 450 460
pF1KSD SAQEKLLETLYGTKKSCVPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SAQEKLLETLYGTKKSCVPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEI
530 540 550 560 570 580
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RTAFEEALGQLVWMDEKTRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RTAFEEALGQLVWMDEKTRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFF
590 600 610 620 630 640
530 540 550 560 570 580
pF1KSD QNMLNLYNFSAKVMADQLRKPPSRDQWSMTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QNMLNLYNFSAKVMADQLRKPPSRDQWSMTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARN
650 660 670 680 690 700
590 600 610 620 630 640
pF1KSD HPKALNFGGIGVVMGHELTHAFDDQGREYDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HPKALNFGGIGVVMGHELTHAFDDQGREYDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQ
710 720 730 740 750 760
650 660 670 680 690 700
pF1KSD YQVNGERLNGRQTLGENIADNGGLKAAYNAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YQVNGERLNGRQTLGENIADNGGLKAAYNAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFA
770 780 790 800 810 820
710 720 730 740 750 760
pF1KSD QVWCSVRTPESSHEGLVTDPHSPARFRVLGTLSNSRDFLRHFGCPVGSPMNPGQLCEVW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QVWCSVRTPESSHEGLVTDPHSPARFRVLGTLSNSRDFLRHFGCPVGSPMNPGQLCEVW
830 840 850 860 870 880
>>CCDS33899.1 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 (736 aa)
initn: 4876 init1: 4876 opt: 4876 Z-score: 5919.8 bits: 1106.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4888; 96.2% identity (96.2% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-736)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNVALQELGAGSNMVEYKRATLRDEDAPETPVEGGASPDAMEVGFQKGTRQLLGSRTQLE
::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS33 MNVALQELGAGSN-----------------------------VGFQKGTRQLLGSRTQLE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LVLAGASLLLAALLLGCLVALGVQYHRDPSHSTCLTEACIRVAGKILESLDRGVSPCEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LVLAGASLLLAALLLGCLVALGVQYHRDPSHSTCLTEACIRVAGKILESLDRGVSPCEDF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YQFSCGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQKTQRFYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YQFSCGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQKTQRFYLS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CLQVERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFFTVYISAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CLQVERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFFTVYISAD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SKSSNSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGGRPTSTREQMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SKSSNSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGGRPTSTREQMQ
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QVLELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLSPLELSDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QVLELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLSPLELSDSE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PVVVYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKLLETLYGTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PVVVYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKLLETLYGTK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KSCVPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEEALGQLVWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSCVPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEEALGQLVWM
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DEKTRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNLYNFSAKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DEKTRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNLYNFSAKVM
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ADQLRKPPSRDQWSMTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARNHPKALNFGGIGVVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ADQLRKPPSRDQWSMTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARNHPKALNFGGIGVVM
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GHELTHAFDDQGREYDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQYQVNGERLNGRQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GHELTHAFDDQGREYDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQYQVNGERLNGRQTL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GENIADNGGLKAAYNAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFAQVWCSVRTPESSHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GENIADNGGLKAAYNAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFAQVWCSVRTPESSHE
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760
pF1KSD GLVTDPHSPARFRVLGTLSNSRDFLRHFGCPVGSPMNPGQLCEVW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GLVTDPHSPARFRVLGTLSNSRDFLRHFGCPVGSPMNPGQLCEVW
700 710 720 730
>>CCDS43179.1 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 (811 aa)
initn: 4876 init1: 4876 opt: 4876 Z-score: 5919.2 bits: 1106.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4959; 94.2% identity (94.2% similar) in 797 aa overlap (15-765:15-811)
10 20 30 40
pF1KSD MNVALQELGAGSNMVEYKRATLRDEDAPETPVEGGASPDAMEVG----------------
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MNVALQELGAGSNMVEYKRATLRDEDAPETPVEGGASPDAMEVGKGASPFSPGPSPGMTP
10 20 30 40 50 60
50 60 70
pF1KSD ------------------------------FQKGTRQLLGSRTQLELVLAGASLLLAALL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GTPRSSGLFWRVTCPHLRSISGLCSRTMVGFQKGTRQLLGSRTQLELVLAGASLLLAALL
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KSD LGCLVALGVQYHRDPSHSTCLTEACIRVAGKILESLDRGVSPCEDFYQFSCGGWIRRNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LGCLVALGVQYHRDPSHSTCLTEACIRVAGKILESLDRGVSPCEDFYQFSCGGWIRRNPL
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KSD PDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQKTQRFYLSCLQVERIEELGAQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQKTQRFYLSCLQVERIEELGAQP
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFFTVYISADSKSSNSNVIQVDQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFFTVYISADSKSSNSNVIQVDQS
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KSD GLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGGRPTSTREQMQQVLELEIQLANITV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGGRPTSTREQMQQVLELEIQLANITV
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KSD PQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLSPLELSDSEPVVVYGMDYLQQVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLSPLELSDSEPVVVYGMDYLQQVS
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KSD ELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKLLETLYGTKKSCVPRWQTCISNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKLLETLYGTKKSCVPRWQTCISNT
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KSD DDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEEALGQLVWMDEKTRQAAKEKADA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEEALGQLVWMDEKTRQAAKEKADA
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KSD IYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNLYNFSAKVMADQLRKPPSRDQWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNLYNFSAKVMADQLRKPPSRDQWS
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KSD MTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARNHPKALNFGGIGVVMGHELTHAFDDQGRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARNHPKALNFGGIGVVMGHELTHAFDDQGRE
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620 630 640 650 660 670
pF1KSD YDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQYQVNGERLNGRQTLGENIADNGGLKAAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQYQVNGERLNGRQTLGENIADNGGLKAAY
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680 690 700 710 720 730
pF1KSD NAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFAQVWCSVRTPESSHEGLVTDPHSPARFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFAQVWCSVRTPESSHEGLVTDPHSPARFRV
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740 750 760
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CCDS43 LGTLSNSRDFLRHFGCPVGSPMNPGQLCEVW
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CCDS44 TQVEKRLVVLVVLLAAGLVACLAALGIQYQTRSPS--VCLSEACVSVTSSILSSMDPTVD
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD PCEDFYQFSCGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQKTQ
::.::....:::::. ::.:::.:::.::..::..::::.::::::.: : ::::.:.:
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pF1KSD RFYLSCLQVERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFFTV
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CCDS44 VYYRACMNETRIEELRAKPLMELIERLGGWNITGPWAKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSV
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pF1KSD YISADSKSSNSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGG-RPTS
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pF1KSD TREQMQQVLELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLSPL
: ::::.:..: :::::.::..::::: ::::.. .:::.:::...:: ::. .. :.
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pF1KSD ELSDSEPVVVYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKLLE
:...:::.::: .::.:.: ::: :. .::::.:::::.::.: ::.::..:.::..:
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360 370 380 390 400 410
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pF1KSD TLYGTKKSCVPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEEAL
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pF1KSD GQLVWMDEKTRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNLYN
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CCDS44 STLKWMDEETRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFFN
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD FSAKVMADQLRKPPSRDQWSMTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARNHPKALNFG
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CCDS44 FSWRVTADQLRKAPNRDQWSMTPPMVNAYYSPTKNEIVFPAGILQAPFYTRSSPKALNFG
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pF1KSD GIGVVMGHELTHAFDDQGREYDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQYQVNGERL
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CCDS44 GIGVVVGHELTHAFDDQGREYDKDGNLRPWWKNSSVEAFKRQTECMVEQYSNYSVNGEPV
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pF1KSD NGRQTLGENIADNGGLKAAYNAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFAQVWCSVRT
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CCDS44 NGRHTLGENIADNGGLKAAYRAYQNWVKKNGAEHSLPTLGLTNNQLFFLGFAQVWCSVRT
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pF1KSD PESSHEGLVTDPHSPARFRVLGTLSNSRDFLRHFGCPVGSPMNPGQLCEVW
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CCDS44 PESSHEGLITDPHSPSRFRVIGSLSNSKEFSEHFRCPPGSPMNPPHKCEVW
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CCDS44 MMSTYKRATLDEEDLVDSLSEGDAYPNGLQVNFHSPRSGQRCWAARTQ
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pF1KSD LELVLAGASLLLAALLLGCLVALGVQYH-RDPSHSTCLTEACIRVAGKILESLDRGVSPC
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CCDS44 VEKRLVVLVVLLAAGLVACLAALGIQYQTRSPS--VCLSEACVSVTSSILSSMDPTVDPC
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pF1KSD EDFYQFSCGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQKTQRF
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CCDS44 HDFFSYACGGWIKANPVPDGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLENST-ASVSEAERKAQVY
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pF1KSD YLSCLQVERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFFTVYI
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CCDS44 YRACMNETRIEELRAKPLMELIERLGGWNITGPWAKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYV
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pF1KSD SADSKSSNSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGG-RPTSTR
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CCDS44 SADSKNSNSNVIQVDQSGLGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEEAIR
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pF1KSD EQMQQVLELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLSPLEL
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CCDS44 PQMQQILDFETALANITIPQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEI
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pF1KSD SDSEPVVVYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKLLETL
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CCDS44 NESEPIVVYDKEYLEQISTLINTTDRCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDADEKFMEVM
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pF1KSD YGTKKSCVPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEEALGQ
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CCDS44 YGTKKTCLPRWKFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKSIATEIILEIKKAFEESLST
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pF1KSD LVWMDEKTRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNLYNFS
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CCDS44 LKWMDEETRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFFNFS
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD AKVMADQLRKPPSRDQWSMTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARNHPKALNFGGI
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CCDS44 WRVTADQLRKAPNRDQWSMTPPMVNAYYSPTKNEIVFPAGILQAPFYTRSSPKALNFGGI
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pF1KSD GVVMGHELTHAFDDQGREYDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQYQVNGERLNG
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CCDS44 GVVVGHELTHAFDDQGREYDKDGNLRPWWKNSSVEAFKRQTECMVEQYSNYSVNGEPVNG
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pF1KSD RQTLGENIADNGGLKAAYNAYKAWLRKHGEEQQLPAVGLTNHQLFFVGFAQVWCSVRTPE
:.:::::::::::::::: ::. :..:.: :..::..::::.::::.:::::::::::::
CCDS44 RHTLGENIADNGGLKAAYRAYQNWVKKNGAEHSLPTLGLTNNQLFFLGFAQVWCSVRTPE
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CCDS44 SSHEGLITDPHSPSRFRVIGSLSNSKEFSEHFRCPPGSPMNPPHKCEVW
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pF1KSD MNVALQELGAGSNMVEYKRATLRDEDAPETPVEGGASPDAMEVGFQ--KGTRQLLG
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CCDS21 MRGVWPPPVSALLSALGMSTYKRATLDEEDLVDSLSEGDAYPNGLQVNFHSPRSGQRCWA
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pF1KSD SRTQLELVLAGASLLLAALLLGCLVALGVQYH-RDPSHSTCLTEACIRVAGKILESLDRG
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CCDS21 ARTQVEKRLVVLVVLLAAGLVACLAALGIQYQTRSPS--VCLSEACVSVTSSILSSMDPT
70 80 90 100 110
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pF1KSD VSPCEDFYQFSCGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQK
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CCDS21 VDPCHDFFSYACGGWIKANPVPDGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLENST-ASVSEAERK
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD TQRFYLSCLQVERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFF
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CCDS21 AQVYYRACMNETRIEELRAKPLMELIERLGGWNITGPWAKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFF
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pF1KSD TVYISADSKSSNSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGG-RP
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CCDS21 SVYVSADSKNSNSNVIQVDQSGLGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDE
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pF1KSD TSTREQMQQVLELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLS
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CCDS21 EAIRPQMQQILDFETALANITIPQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFY
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pF1KSD PLELSDSEPVVVYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKL
:.:...:::.::: .::.:.: ::: :. .::::.:::::.::.: ::.::..:.::.
CCDS21 PVEINESEPIVVYDKEYLEQISTLINTTDRCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDADEKF
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD LETLYGTKKSCVPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEE
.:..:::::.:.:::. :.:.:.. :::::: .:::::: ..:: :: .: ::. ::::
CCDS21 MEVMYGTKKTCLPRWKFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKSIATEIILEIKKAFEE
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pF1KSD ALGQLVWMDEKTRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNL
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CCDS21 SLSTLKWMDEETRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRF
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD YNFSAKVMADQLRKPPSRDQWSMTPQTVNAYYLPTKNEIVFPAGILQAPFYARNHPKALN
.::: .: :::::: :.:::::::: ::::: ::::::::::::::::::.:. :::::
CCDS21 FNFSWRVTADQLRKAPNRDQWSMTPPMVNAYYSPTKNEIVFPAGILQAPFYTRSSPKALN
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pF1KSD FGGIGVVMGHELTHAFDDQGREYDKEGNLRPWWQNESLAAFRNHTACMEEQYNQYQVNGE
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CCDS21 FGGIGVVVGHELTHAFDDQGREYDKDGNLRPWWKNSSVEAFKRQTECMVEQYSNYSVNGE
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.:::.:::::::::::::::: ::. :..:.: :..::..::::.::::.:::::::::
CCDS21 PVNGRHTLGENIADNGGLKAAYRAYQNWVKKNGAEHSLPTLGLTNNQLFFLGFAQVWCSV
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pF1KSD RTPESSHEGLVTDPHSPARFRVLGTLSNSRDFLRHFGCPVGSPMNPGQLCEVW
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CCDS21 RTPESSHEGLITDPHSPSRFRVIGSLSNSKEFSEHFRCPPGSPMNPPHKCEVW
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pF1KSD LGAGSNMVEYKRATLRDEDAPETPVEGGASPDAMEVGFQ--KGTRQLLGSRTQLELVLAG
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CCDS44 MPLQGLGLQRNPFLQGKRGPGLTSSPPLLPPSLQVNFHSPRSGQRCWAARTQVEKRLVV
10 20 30 40 50
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pF1KSD ASLLLAALLLGCLVALGVQYH-RDPSHSTCLTEACIRVAGKILESLDRGVSPCEDFYQFS
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CCDS44 LVVLLAAGLVACLAALGIQYQTRSPS--VCLSEACVSVTSSILSSMDPTVDPCHDFFSYA
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD CGGWIRRNPLPDGRSRWNTFNSLWDQNQAILKHLLENTTFNSSSEAEQKTQRFYLSCLQV
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CCDS44 CGGWIKANPVPDGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLENST-ASVSEAERKAQVYYRACMNE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ERIEELGAQPLRDLIEKIGGWNITGPWDQDNFMEVLKAVAGTYRATPFFTVYISADSKSS
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CCDS44 TRIEELRAKPLMELIERLGGWNITGPWAKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYVSADSKNS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD NSNVIQVDQSGLFLPSRDYYLNRTANEKVLTAYLDYMEELGMLLGG-RPTSTREQMQQVL
:::::::::::: :::::::::.: ::::::.::.:: .:: :::: . : ::::.:
CCDS44 NSNVIQVDQSGLGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEEAIRPQMQQIL
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pF1KSD ELEIQLANITVPQDQRRDEEKIYHKMSISELQALAPSMDWLEFLSFLLSPLELSDSEPVV
..: :::::.::..::::: ::::.. .:::.:::...:: ::. .. :.:...:::.:
CCDS44 DFETALANITIPQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIV
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD VYGMDYLQQVSELINRTEPSILNNYLIWNLVQKTTSSLDRRFESAQEKLLETLYGTKKSC
:: .::.:.: ::: :. .::::.:::::.::.: ::.::..:.::..:..:::::.:
CCDS44 VYDKEYLEQISTLINTTDRCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDADEKFMEVMYGTKKTC
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD VPRWQTCISNTDDALGFALGSLFVKATFDRQSKEIAEGMISEIRTAFEEALGQLVWMDEK
.:::. :.:.:.. :::::: .:::::: ..:: :: .: ::. ::::.:. : ::::.
CCDS44 LPRWKFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKSIATEIILEIKKAFEESLSTLKWMDEE
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD TRQAAKEKADAIYDMIGFPDFILEPKELDDVYDGYEISEDSFFQNMLNLYNFSAKVMADQ
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CCDS44 TRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFFNFSWRVTADQ
480 490 500 510 520 530
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CCDS77 SPMNPAHKCSVW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]