Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0080
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0080, 431 aa
1>>>pF1KSDA0080 431 - 431 aa - 431 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7519+/-0.00093; mu= 15.5524+/- 0.056
mean_var=86.1457+/-16.779, 0's: 0 Z-trim(107.4): 115 B-trim: 140 in 2/48
Lambda= 0.138184
statistics sampled from 9399 (9536) to 9399 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 2.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1 ( 431) 2851 578.4 4.6e-165
CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18 ( 425) 1497 308.5 8.2e-84
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 811 171.7 1.1e-42
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 386) 797 168.9 7.7e-42
CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 419) 788 167.1 2.9e-41
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 ( 419) 787 166.9 3.3e-41
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 422) 785 166.5 4.4e-41
CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 403) 774 164.3 1.9e-40
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 447) 774 164.4 2.1e-40
CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 478) 774 164.4 2.2e-40
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 ( 425) 750 159.6 5.5e-39
CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12 ( 523) 740 157.6 2.6e-38
CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19 ( 590) 724 154.5 2.6e-37
CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11 ( 491) 711 151.8 1.4e-36
CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 413) 619 133.4 3.9e-31
CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 470) 619 133.5 4.3e-31
CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 474) 619 133.5 4.4e-31
CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17 ( 412) 539 117.5 2.5e-26
CCDS8154.1 SYT12 gene_id:91683|Hs108|chr11 ( 421) 438 97.4 2.9e-20
CCDS73103.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 421) 434 96.6 5e-20
CCDS7726.2 SYT8 gene_id:90019|Hs108|chr11 ( 401) 418 93.4 4.4e-19
CCDS31470.1 SYT13 gene_id:57586|Hs108|chr11 ( 426) 412 92.2 1.1e-18
CCDS73104.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 390) 343 78.4 1.4e-14
CCDS298.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 ( 550) 294 68.7 1.6e-11
CCDS53286.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 ( 562) 294 68.7 1.6e-11
CCDS10666.1 DOC2A gene_id:8448|Hs108|chr16 ( 400) 291 68.0 1.8e-11
CCDS31904.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 690) 285 67.0 6.5e-11
CCDS44979.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 694) 285 67.0 6.6e-11
>>CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1 (431 aa)
initn: 2851 init1: 2851 opt: 2851 Z-score: 3076.9 bits: 578.4 E(32554): 4.6e-165
Smith-Waterman score: 2851; 99.8% identity (100.0% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFIHMLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS11 MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKQKNPPYKFIHMLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRK
370 380 390 400 410 420
430
pF1KSD PVAKWHSLSEY
:::::::::::
CCDS11 PVAKWHSLSEY
430
>>CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18 (425 aa)
initn: 1124 init1: 825 opt: 1497 Z-score: 1618.2 bits: 308.5 E(32554): 8.2e-84
Smith-Waterman score: 1497; 53.0% identity (79.5% similar) in 434 aa overlap (1-430:1-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFIHMLK
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CCDS11 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSL--FAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD GISIYPETLSNKKKIIKVRRD--KDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSR-DKDPRGPSSGS
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CCDS11 GVDIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVP--KNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD CIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKT-TSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVV
... :. :.. :..: :. :: .: :.. ::.: ::..::: .::.::
CCDS11 DLENATPKL----FLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQ
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CCDS11 NIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQ
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CCDS11 IQELALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLN
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CCDS11 ISLCYQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLS-DPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCE
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CCDS11 AVFNELFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGA-AAEGTGGEHWKEICD
360 370 380 390 400 410
420 430
pF1KSD SPRKPVAKWHSLSEY
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CCDS11 YPRRQIAKWHVLCDG
420
>>CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (382 aa)
initn: 613 init1: 253 opt: 811 Z-score: 879.8 bits: 171.7 E(32554): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 811; 42.0% identity (67.9% similar) in 333 aa overlap (108-428:48-370)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPIT
:: : : : : : . .: .:..
CCDS74 HGSWSSLLCVGLKGRLGWEWGTRVLECLCRKDSRTPPPCSRSPQ-PRGLHRPTRLPTPVA
20 30 40 50 60 70
140 150 160 170 180
pF1KSD SLTPG-----ESKTTSPSSPEEDVM----LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMD
: : : .::.: ..: :: : .:.::.: . :.: : .: :: ..:
CCDS74 SATAQVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLS
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CCDS74 -LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYD
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQLTRDI--IKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVA
::::::.:.:::: ::...:: :. :: :.. :. .: :.. :: : :.:
CCDS74 FDRFSRNDAIGEVRVPMSSVD--LGRPVQAWRELQAAPREEEKL---GDICFSLRYVPTA
200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIY
..::.::.:..: :::. ::: .:::::.. : :.. :::: .:: :::: .::.: .
CCDS74 GKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSF
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKW
..: : . ...:. :.:.:. :::..::. .:: .. ..: .:: .. .::.:.:.:
CCDS74 EVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQW
310 320 330 340 350 360
430
pF1KSD HSLSEY
:::
CCDS74 HSLRPPDRVRLLPAP
370 380
>>CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (386 aa)
initn: 666 init1: 253 opt: 797 Z-score: 864.6 bits: 168.9 E(32554): 7.7e-42
Smith-Waterman score: 797; 43.0% identity (71.2% similar) in 302 aa overlap (133-428:79-374)
110 120 130 140 150
pF1KSD LLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPG-ESKTTSPSSPEEDVM----
.: : .. : : .::.: ..:
CCDS12 CLYRKSCRRRTGKKSQAQAQVHLQEVKGLGQSYIDKVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHE
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRK
:: : .:.::.: . :.: : .: :: ..: .::::... .:::::.: .:.: :.
CCDS12 LGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD-LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQ
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KSD TLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQ
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CCDS12 TLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVD--LGRPVQ
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNV
:.. .. . :.. :: : :.: ..::.::.:..: :::. ::: .:::::..
CCDS12 AWRELQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKVHL
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KSD YYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRL
: :.. :::: .:: :::: .::.: ...: : . ...:. :.:.:. :::..::.
CCDS12 LQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRV
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430
pF1KSD ILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKWHSLSEY
.:: .. ..: .:: .. .::.:.:.::::
CCDS12 AVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
350 360 370 380
>>CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (419 aa)
initn: 588 init1: 231 opt: 788 Z-score: 854.4 bits: 167.1 E(32554): 2.9e-41
Smith-Waterman score: 788; 39.7% identity (69.6% similar) in 335 aa overlap (103-428:84-405)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD KKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSG--SCIDQLPIKMDYGE
:... . .: .: . :.. .: : :.
CCDS76 IPLPPWALIAIAIVAVLLVLTCCFCICKKCLFKKKNKKKGKEKGGKNAINMKDVK-DLGK
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180
pF1KSD ELRSPI----TSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPV
... :.:: :: : :.:. ::.: .:.::.: .. :.: : .: ::.
CCDS76 TMKDQDDDAETGLTDGEEKEE----PKEEEKLGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPA
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLV
.: . ::::.:. .::::... .:.: ::::.:::.: ::: .:::.: .: . :
CCDS76 LD-MGGTSDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFK-VPYSELGGKTLVMAV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKV-QLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVA
.:::::. :.::: ::. :: :.: . ::. . . .. . :.. :: : :.:
CCDS76 YDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVD--FGHVTEEWRDLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYVPTA
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIY
..:::.:.:..: :::. ::: .::::.... . ::. :::: .:: :::: .:::: .
CCDS76 GKLTVVILEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSF
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAE--HWREVCESPRKPVA
..: . . ... :.:.:. ::...:....: .: .::: :: .. .::.:.:
CCDS76 EVPFEQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNS---TGAELRHWSDMLANPRRPIA
350 360 370 380 390 400
430
pF1KSD KWHSLSEY
.::.:
CCDS76 QWHTLQVEEEVDAMLAVKK
410
>>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 (419 aa)
initn: 661 init1: 234 opt: 787 Z-score: 853.3 bits: 166.9 E(32554): 3.3e-41
Smith-Waterman score: 790; 39.9% identity (70.6% similar) in 326 aa overlap (106-428:93-405)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD IKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSP
..: .: . . ... .: :.. .
CCDS14 WALIAIAVVAGLLLLTCCFCICKKCCCKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKDMK--GGQDDDDA
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KSD ITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSD
:.:: ::.. . ::. ::.: ::.::.: . :.: . .: ::..: . ::
CCDS14 ETGLTEGEGEGEEEKEPEN---LGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALD-MGGTSD
130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KSD PYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRD
::.:. .::::... .:.: ::::.:.:.::::: .::..: .: . . .:::::.
CCDS14 PYVKVFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFK-VPYQELGGKTLVMAIYDFDRFSKH
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KSD DVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVAQRMTVVVLK
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CCDS14 DIIGEVKVPMNTVD--LGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILE
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KSD ARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPD
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CCDS14 AKNLKKMDVGGLS-DPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQK
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KSD ISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAE--HWREVCESPRKPVAKWHSLSEY
... :.:.:. :::..:....:.. :.:.: :: .. .::.:.:.::::
CCDS14 VQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGSN---ATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEE
360 370 380 390 400
CCDS14 EVDALLGKNK
410
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CCDS90 IPLPPWALIAIAIVAVLLVLTCCFCICKKCLFKKKNKKKGKEKGGKNAINMKDVK-DLGK
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CCDS90 TMKDQALKDDDAETGLTDGEEKEE----PKEEEKLGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAE
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CCDS90 LPALD-MGGTSDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFK-VPYSELGGKTLV
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CCDS90 MAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVD--FGHVTEEWRDLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYV
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CCDS90 PTAGKLTVVILEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNES
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: ...: . . ... :.:.:. ::...:....: .: .::: :: .. .::.
CCDS90 FSFEVPFEQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNS---TGAELRHWSDMLANPRR
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430
pF1KSD PVAKWHSLSEY
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CCDS90 PIAQWHTLQVEEEVDAMLAVKK
410 420
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CCDS31 NSLETVGT-PDSGRGRSEKKAIKL------PA--GGKA---VNTAPVPGQTPHDESDRRT
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CCDS31 EPRSSVS------DLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSREN--LGRIQFSVGYNFQES
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CCDS31 TLTVKIMKAQELPA-KDFSGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGF
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pF1KSD PYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISR
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CCDS31 PYEKVVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLT--QMQTFWKDLKPCSDGSGSR
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CCDS31 GELLLSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTS-DPYVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMK
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pF1KSD CTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWR
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CCDS31 RNLNPIFNESFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLSWKS-GPGEVKHWK
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pF1KSD EVCESPRKPVAKWHSLSEY
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CCDS31 DMIARPRQPVAQWHQLKA
390 400
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CCDS73 MYRDPEAASPGAPSRDV------LLVSAIITVSLSVTVVLCGLCHWCQRKLGKR--YKNS
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CCDS73 LETVGTPDSGRGRSEKKAINDLDRDFWNNNESTVQQKWSSYPPKEFILNISPYAPYGDPR
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pF1KSD G----PSSGSCIDQLPI-------KMDYGEELRSPITSLT---PGESKTTSPSSPEEDVM
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CCDS73 LSLKLPAGGKAVNTAPVPGQTPHDESDRRTEPRSSVSDLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAH
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CCDS73 EGCSRENLGRIQFSVGYNFQESTLTVKIMKAQELPA-KDFSGTSDPFVKIYLLPDKKHKL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDP
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CCDS73 ETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYEKVVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDL
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CCDS73 T--QMQTFWKDLKPCSDGSGSRGELLLSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTS-DP
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CCDS73 YVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMKRNLNPIFNESFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRN
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CCDS73 DVIGKIYLSWKS-GPGEVKHWKDMIARPRQPVAQWHQLKA
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CCDS58 RLGEKPAPVPPPGEDALRSGGAAPSEPGSGGKAGRGRWRTVQSHLAAGKLNLSKLPAG--
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CCDS58 -GKAVNTAPVPGQTPHDESDRRTEPRSSVSDLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSREN
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CCDS58 LGRIQFSVGYNFQESTLTVKIMKAQELPA-KDFSGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRK
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pF1KSD TLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQL
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CCDS58 NLNPHWNETFLFEGFPYEKVVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLT--QMQT
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CCDS58 FWKDLKPCSDGSGSRGELLLSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTS-DPYVKVWLM
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pF1KSD YGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLI
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CCDS58 YKDKRVEKKKTVTMKRNLNPIFNESFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIY
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CCDS58 LSWKSGPGE-VKHWKDMIARPRQPVAQWHQLKA
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431 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]