Result of FASTA (omim) for
pFN21AB8019
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8019, 670 aa
1>>>pF1KB8019 670 - 670 aa - 670 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2293+/-0.000424; mu= -6.6026+/- 0.026
mean_var=386.5833+/-78.220, 0's: 0 Z-trim(122.7): 16 B-trim: 0 in 0/58
Lambda= 0.065231
statistics sampled from 41242 (41258) to 41242 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.484), width: 16
Scan time: 13.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004412 (OMIM: 180700,601365,616331) segment pol ( 670) 4518 439.6 1.8e-122
XP_005244790 (OMIM: 180700,601365,616331) PREDICTE ( 549) 3669 359.6 1.8e-98
XP_005244789 (OMIM: 180700,601365,616331) PREDICTE ( 574) 2504 250.0 1.8e-65
NP_001317240 (OMIM: 180700,601365,616331) segment ( 695) 2504 250.1 2.1e-65
NP_004414 (OMIM: 601368,616894) segment polarity p ( 716) 1868 190.2 2.2e-47
XP_005247229 (OMIM: 601368,616894) PREDICTED: segm ( 718) 1868 190.2 2.2e-47
XP_005256559 (OMIM: 602151) PREDICTED: segment pol ( 732) 1691 173.6 2.3e-42
NP_004413 (OMIM: 602151) segment polarity protein ( 736) 1682 172.7 4.2e-42
XP_011510815 (OMIM: 601368,616894) PREDICTED: segm ( 548) 1009 109.3 4e-23
XP_016879787 (OMIM: 602151) PREDICTED: segment pol ( 476) 791 88.7 5.4e-17
>>NP_004412 (OMIM: 180700,601365,616331) segment polarit (670 aa)
initn: 4518 init1: 4518 opt: 4518 Z-score: 2319.7 bits: 439.6 E(85289): 1.8e-122
Smith-Waterman score: 4518; 100.0% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (1-670:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSAST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFSSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPIDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPIDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 AAWLSHTAALTGALPRYELEEAPLTVKSDMSAVVRVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AAWLSHTAALTGALPRYELEEAPLTVKSDMSAVVRVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 IGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGFLRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGFLRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 TLNLNSGSSGTSDQDTLAPLPHPAAPWPLGQGYPYQYPGPPPCFPPAYQDPGFSYGSGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TLNLNSGSSGTSDQDTLAPLPHPAAPWPLGQGYPYQYPGPPPCFPPAYQDPGFSYGSGST
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 GSQQSEGSKSSGSTRSSRRAPGREKERRAAGAGGSGSESDHTAPSGVGSSWRERPAGQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GSQQSEGSKSSGSTRSSRRAPGREKERRAAGAGGSGSESDHTAPSGVGSSWRERPAGQLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RGSSPRSQASATAPGLPPPHPTTKAYTVVGGPPGGPPVRELAAVPPELTGSRQSFQKAMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RGSSPRSQASATAPGLPPPHPTTKAYTVVGGPPGGPPVRELAAVPPELTGSRQSFQKAMG
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB8 NPCEFFVDIM
::::::::::
NP_004 NPCEFFVDIM
670
>>XP_005244790 (OMIM: 180700,601365,616331) PREDICTED: s (549 aa)
initn: 3669 init1: 3669 opt: 3669 Z-score: 1889.1 bits: 359.6 E(85289): 1.8e-98
Smith-Waterman score: 3669; 100.0% identity (100.0% similar) in 546 aa overlap (1-546:1-546)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSAST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFSSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPIDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPIDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 AAWLSHTAALTGALPRYELEEAPLTVKSDMSAVVRVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AAWLSHTAALTGALPRYELEEAPLTVKSDMSAVVRVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 IGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGFLRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGFLRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 TLNLNSGSSGTSDQDTLAPLPHPAAPWPLGQGYPYQYPGPPPCFPPAYQDPGFSYGSGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLNLNSGSSGTSDQDTLAPLPHPAAPWPLGQGYPYQYPGPPPCFPPAYQDPGFSYGSGST
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 GSQQSEGSKSSGSTRSSRRAPGREKERRAAGAGGSGSESDHTAPSGVGSSWRERPAGQLS
::::::
XP_005 GSQQSEALD
>>XP_005244789 (OMIM: 180700,601365,616331) PREDICTED: s (574 aa)
initn: 3651 init1: 2500 opt: 2504 Z-score: 1296.3 bits: 250.0 E(85289): 1.8e-65
Smith-Waterman score: 3605; 95.4% identity (95.6% similar) in 571 aa overlap (1-546:1-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSAST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFSSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPIDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPIDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB8 AAWLSHTAALTGALPRY-------------------------ELEEAPLTVKSDMSAVVR
::::::::::::::::: .:::::::::::::::::
XP_005 AAWLSHTAALTGALPRYGTSPCSSAVTRTSSSSLTSSVPGAPQLEEAPLTVKSDMSAVVR
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 VMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGFL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 RHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNSGSSGTSDQDTLAPLPHPAAPWPLGQGYPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNSGSSGTSDQDTLAPLPHPAAPWPLGQGYPY
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 QYPGPPPCFPPAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEGSKSSGSTRSSRRAPGREKERRAAGAGGS
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QYPGPPPCFPPAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEALD
550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 GSESDHTAPSGVGSSWRERPAGQLSRGSSPRSQASATAPGLPPPHPTTKAYTVVGGPPGG
>>NP_001317240 (OMIM: 180700,601365,616331) segment pola (695 aa)
initn: 4500 init1: 2500 opt: 2504 Z-score: 1295.2 bits: 250.1 E(85289): 2.1e-65
Smith-Waterman score: 4454; 96.3% identity (96.4% similar) in 695 aa overlap (1-670:1-695)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSAST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFSSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPIDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPIDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB8 AAWLSHTAALTGALPRY-------------------------ELEEAPLTVKSDMSAVVR
::::::::::::::::: .:::::::::::::::::
NP_001 AAWLSHTAALTGALPRYGTSPCSSAVTRTSSSSLTSSVPGAPQLEEAPLTVKSDMSAVVR
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 VMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGFL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 RHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNSGSSGTSDQDTLAPLPHPAAPWPLGQGYPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNSGSSGTSDQDTLAPLPHPAAPWPLGQGYPY
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 QYPGPPPCFPPAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEGSKSSGSTRSSRRAPGREKERRAAGAGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYPGPPPCFPPAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEGSKSSGSTRSSRRAPGREKERRAAGAGGS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 GSESDHTAPSGVGSSWRERPAGQLSRGSSPRSQASATAPGLPPPHPTTKAYTVVGGPPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSESDHTAPSGVGSSWRERPAGQLSRGSSPRSQASATAPGLPPPHPTTKAYTVVGGPPGG
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670
pF1KB8 PPVRELAAVPPELTGSRQSFQKAMGNPCEFFVDIM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPVRELAAVPPELTGSRQSFQKAMGNPCEFFVDIM
670 680 690
>>NP_004414 (OMIM: 601368,616894) segment polarity prote (716 aa)
initn: 1993 init1: 1198 opt: 1868 Z-score: 971.5 bits: 190.2 E(85289): 2.2e-47
Smith-Waterman score: 2822; 63.8% identity (81.4% similar) in 709 aa overlap (1-654:1-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
:.:::::::.: .:::::::::. :::::::::.::. :: .:::::::::.::::::
NP_004 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQ-RP--SYKFFFKSMDDDFGVVK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
::: :::::::::::::::::: :::.: : . .:. ..::::.::::::::::::::
NP_004 EEISDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 HPNVAS-SRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNR-EEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSA
::.... :....::.: :.:.:: .::: :::. :.:.: :: .:.:::. : ::.
NP_004 HPHAGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPG-GYDSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 STALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFS
:: .:::::..:: ::::: ::::.:::::::..:::.:.::::::::.. . .:.::::
NP_004 STLMSSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SITDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
:::::::::::.:::::::...:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DMLLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPI
:::::::..:::::::::::::::::: . :::.:::::::::.::. ::.::..:.:::
NP_004 DMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB8 DPAAWLSHTAALTGALPRY------------------------ELEEAPLTVKSDMSAVV
:::::.:::::.::..: : .:.. :...:::.:.:
NP_004 DPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 RVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGF
..: :.::::.:::::::::: :: ::.::::::: .:::: .:::::::::.::: ::
NP_004 KAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAGF
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460 470 480 490 500 510
pF1KB8 LRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNS--GSSGTSDQDTLAPLPHP-AAPWPLGQ
.:::::::::::::::.:::::.:.:.:.:.. ::::.:::::::::::: :::::..
NP_004 IRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMA-
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.::::: :: : : :.. . :.:::.::..::.::::.::::.::. :: .::.
NP_004 -FPYQYPPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRR---KEKDP
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570 580 590 600
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.:. . ::::::::::. :.. . : : ::. . : .:: ::.
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670
pF1KB8 FVDIM
NP_004 FVDVM
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:.:::::::.: .:::::::::. :::::::::.::. :: .:::::::::.::::::
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::.... :....::.: :.:.:: .::: :::. :.:.: :: .:.:::. : ::.
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:: .:::::..:: ::::: ::::.:::::::..:::.:.::::::::.. . .:.::::
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:::::::..:::::::::::::::::: . :::.:::::::::.::. ::.::..:.:::
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pF1KB8 DPAAWLSHTAALTGALPRY------------------------ELEEAPLTVKSDMSAVV
:::::.:::::.::..: : .:.. :...:::.:.:
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..: :.::::.:::::::::: :: ::.::::::: .:::: .:::::::::.::: ::
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.:::::::::::::::.:::::.:.:.:.:.. ::::.:::::::::::: :::::..
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pF1KB8 GYPYQYPGPP-PCFP-PAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEGSKSSGSTRSS--RRAPGREKER
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.:. . ::::::::::. :.. . : : ::. . : .:: ::.
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pF1KB8 SATAPGLPP----PHPTTKAYTVVGGPPGGPPVRELAAVPPELTGSRQSFQKAMGNPCEF
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pF1KB8 FVDIM
XP_005 FGLFDFL
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: .:. .: .:.:: ..:::::.:. ::::. . ::.:::::::..:::...: ::
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::::: . .:.:::::.:::::::::.:::::::...:::::::::::.::::::::::
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::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:: . ::: :::::::::.
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:..:::.:: .:..:::::::.::.:::::..: : : :.
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:..::..:...: :.::::.:::::::::: :: .:.::::::: ::::: ::::::::
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:: :.:::: . ::::.: : : : :.. ...::.::..::.::::.:::::::
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560 570 580 590 600 610
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. : :: .:: . .::::::. ::. :.: :. :. : :. : :..:. .
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pF1KB8 -------PGL----PPPH---PTTKAYTVVGGPP-----------GGPPVRELAAVPPEL
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:.::
XP_005 TASRQSFHMAMGNPSEFFVDVM
720 730
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pF1KB8 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFK
..:::.:::.::::::::::.:: ::.::.:::.::. ::. : :.:::
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pF1KB8 SMDQDFGVVKEEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPL----
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NP_004 SMDQDFGVVKEEISDDNARLPCFNGRVVSWLVSSDNPQPEMAPPVHEPRAELAPPAPPLP
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.: : .:. .: .:.:: ..:::::.:. ::::. . ::.:::::::..:::...:
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::::::: . .:.:::::.:::::::::.:::::::...:::::::::::.:::::::
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:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:: . ::: :::::::
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::.:..:::.:: .:..:::::::.::.:::::..: : :
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:::. : :: .:: . .::::::. ::. :.: :. :. : :. : :..:
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pF1KB8 ATA-------PGL----PPPH---PTTKAYTVVGGPP-----------GGPPVRELAAVP
. . ::: ::: : . ..:. :: :.::::.:..::
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pF1KB8 PELTGSRQSFQKAMGNPCEFFVDIM
::::.::
NP_004 PELTASRQSFHMAMGNPSEFFVDVM
720 730
>>XP_011510815 (OMIM: 601368,616894) PREDICTED: segment (548 aa)
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:: .::. .:. . ::::::::::. :.. . : : ::. . :
XP_011 SDRR---KEKDPKAGDSKSGGSGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHS
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