Result of FASTA (ccds) for pFN21AB0065
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0065, 2041 aa
  1>>>pF1KB0065 2041 - 2041 aa - 2041 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3766+/-0.00121; mu= 15.7253+/- 0.073
 mean_var=143.1319+/-28.144, 0's: 0 Z-trim(106.1): 139  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.107203
 statistics sampled from 8622 (8774) to 8622 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.27), width:  16
 Scan time:  4.600

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47951.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9           (2041) 13162 2049.2       0
CCDS83342.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9           (2070) 11606 1808.6       0
CCDS59120.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9           (2037) 9434 1472.7       0
CCDS59119.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9           (2008) 8061 1260.3       0
CCDS617.2 PATJ gene_id:10207|Hs108|chr1            (1801)  926 156.8 7.7e-37
CCDS9323.1 LNX2 gene_id:222484|Hs108|chr13         ( 690)  421 78.4 1.2e-13
CCDS73357.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11          ( 852)  364 69.6 6.2e-11
CCDS41696.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11          ( 870)  364 69.6 6.3e-11
CCDS44690.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11          ( 975)  364 69.7 6.9e-11
CCDS55782.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11          ( 909)  363 69.5 7.3e-11
CCDS82050.1 DLG4 gene_id:1742|Hs108|chr17          ( 724)  360 69.0 8.4e-11
CCDS45599.1 DLG4 gene_id:1742|Hs108|chr17          ( 767)  360 69.0 8.8e-11


>>CCDS47951.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9                (2041 aa)
 initn: 13162 init1: 13162 opt: 13162  Z-score: 11001.6  bits: 2049.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 13162; 100.0% identity (100.0% similar) in 2041 aa overlap (1-2041:1-2041)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MLEAIDKNRALHAAERLQTKLRERGDVANEDKLSLLKSVLQSPLFSQILSLQTSVQQLKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLEAIDKNRALHAAERLQTKLRERGDVANEDKLSLLKSVLQSPLFSQILSLQTSVQQLKD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 QVNIATSATSNIEYAHVPHLSPAVIPTLQNESFLLSPNNGNLEALTGPGIPHINGKPACD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QVNIATSATSNIEYAHVPHLSPAVIPTLQNESFLLSPNNGNLEALTGPGIPHINGKPACD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 EFDQLIKNMAQGRHVEVFELLKPPSGGLGFSVVGLRSENRGELGIFVQEIQEGSVAHRDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EFDQLIKNMAQGRHVEVFELLKPPSGGLGFSVVGLRSENRGELGIFVQEIQEGSVAHRDG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 RLKETDQILAINGQALDQTITHQQAISILQKAKDTVQLVIARGSLPQLVSPIVSRSPSAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLKETDQILAINGQALDQTITHQQAISILQKAKDTVQLVIARGSLPQLVSPIVSRSPSAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 STISAHSNPVHWQHMETIELVNDGSGLGFGIIGGKATGVIVKTILPGGVADQHGRLCSGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STISAHSNPVHWQHMETIELVNDGSGLGFGIIGGKATGVIVKTILPGGVADQHGRLCSGD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 HILKIGDTDLAGMSSEQVAQVLRQCGNRVKLMIARGAIEERTAPTALGITLSSSPTSTPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HILKIGDTDLAGMSSEQVAQVLRQCGNRVKLMIARGAIEERTAPTALGITLSSSPTSTPE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 LRVDASTQKGEESETFDVELTKNVQGLGITIAGYIGDKKLEPSGIFVKSITKSSAVEHDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LRVDASTQKGEESETFDVELTKNVQGLGITIAGYIGDKKLEPSGIFVKSITKSSAVEHDG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 RIQIGDQIIAVDGTNLQGFTNQQAVEVLRHTGQTVLLTLMRRGMKQEAELMSREDVTKDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIQIGDQIIAVDGTNLQGFTNQQAVEVLRHTGQTVLLTLMRRGMKQEAELMSREDVTKDA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 DLSPVNASIIKENYEKDEDFLSSTRNTNILPTEEEGYPLLSAEIEEIEDAQKQEAALLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DLSPVNASIIKENYEKDEDFLSSTRNTNILPTEEEGYPLLSAEIEEIEDAQKQEAALLTK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 WQRIMGINYEIVVAHVSKFSENSGLGISLEATVGHHFIRSVLPEGPVGHSGKLFSGDELL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WQRIMGINYEIVVAHVSKFSENSGLGISLEATVGHHFIRSVLPEGPVGHSGKLFSGDELL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 EVNGITLLGENHQDVVNILKELPIEVTMVCCRRTVPPTTQSELDSLDLCDIELTEKPHVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EVNGITLLGENHQDVVNILKELPIEVTMVCCRRTVPPTTQSELDSLDLCDIELTEKPHVD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 LGEFIGSSETEDPVLAMTDAGQSTEEVQAPLAMWEAGIQHIELEKGSKGLGFSILDYQDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LGEFIGSSETEDPVLAMTDAGQSTEEVQAPLAMWEAGIQHIELEKGSKGLGFSILDYQDP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 IDPASTVIIIRSLVPGGIAEKDGRLLPGDRLMFVNDVNLENSSLEEAVEALKGAPSGTVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IDPASTVIIIRSLVPGGIAEKDGRLLPGDRLMFVNDVNLENSSLEEAVEALKGAPSGTVR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 IGVAKPLPLSPEEGYVSAKEDSFLYPPHSCEEAGLADKPLFRADLALVGTNDADLVDEST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IGVAKPLPLSPEEGYVSAKEDSFLYPPHSCEEAGLADKPLFRADLALVGTNDADLVDEST
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 FESPYSPENDSIYSTQASILSLHGSSCGDGLNYGSSLPSSPPKDVIENSCDPVLDLHMSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FESPYSPENDSIYSTQASILSLHGSSCGDGLNYGSSLPSSPPKDVIENSCDPVLDLHMSL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 EELYTQNLLQRQDENTPSVDISMGPASGFTINDYTPANAIEQQYECENTIVWTESHLPSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EELYTQNLLQRQDENTPSVDISMGPASGFTINDYTPANAIEQQYECENTIVWTESHLPSE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB0 VISSAELPSVLPDSAGKGSEYLLEQSSLACNAECVMLQNVSKESFERTINIAKGNSSLGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VISSAELPSVLPDSAGKGSEYLLEQSSLACNAECVMLQNVSKESFERTINIAKGNSSLGM
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB0 TVSANKDGLGMIVRSIIHGGAISRDGRIAIGDCILSINEESTISVTNAQARAMLRRHSLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TVSANKDGLGMIVRSIIHGGAISRDGRIAIGDCILSINEESTISVTNAQARAMLRRHSLI
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB0 GPDIKITYVPAEHLEEFKISLGQQSGRVMALDIFSSYTGRDIPELPEREEGEGEESELQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GPDIKITYVPAEHLEEFKISLGQQSGRVMALDIFSSYTGRDIPELPEREEGEGEESELQN
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB0 TAYSNWNQPRRVELWREPSKSLGISIVGGRGMGSRLSNGEVMRGIFIKHVLEDSPAGKNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TAYSNWNQPRRVELWREPSKSLGISIVGGRGMGSRLSNGEVMRGIFIKHVLEDSPAGKNG
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB0 TLKPGDRIVEVDGMDLRDASHEQAVEAIRKAGNPVVFMVQSIINRPRKSPLPSLLHNLYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TLKPGDRIVEVDGMDLRDASHEQAVEAIRKAGNPVVFMVQSIINRPRKSPLPSLLHNLYP
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB0 KYNFSSTNPFADSLQINADKAPSQSESEPEKAPLCSVPPPPPSAFAEMGSDHTQSSASKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KYNFSSTNPFADSLQINADKAPSQSESEPEKAPLCSVPPPPPSAFAEMGSDHTQSSASKI
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB0 SQDVDKEDEFGYSWKNIRERYGTLTGELHMIELEKGHSGLGLSLAGNKDRSRMSVFIVGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SQDVDKEDEFGYSWKNIRERYGTLTGELHMIELEKGHSGLGLSLAGNKDRSRMSVFIVGI
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB0 DPNGAAGKDGRLQIADELLEINGQILYGRSHQNASSIIKCAPSKVKIIFIRNKDAVNQMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DPNGAAGKDGRLQIADELLEINGQILYGRSHQNASSIIKCAPSKVKIIFIRNKDAVNQMA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB0 VCPGNAVEPLPSNSENLQNKETEPTVTTSDAAVDLSSFKNVQHLELPKDQGGLGIAISEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VCPGNAVEPLPSNSENLQNKETEPTVTTSDAAVDLSSFKNVQHLELPKDQGGLGIAISEE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB0 DTLSGVIIKSLTEHGVAATDGRLKVGDQILAVDDEIVVGYPIEKFISLLKTAKMTVKLTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DTLSGVIIKSLTEHGVAATDGRLKVGDQILAVDDEIVVGYPIEKFISLLKTAKMTVKLTI
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB0 HAENPDSQAVPSAAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HAENPDSQAVPSAAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATC
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB0 PIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEV
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KB0 NGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSI
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KB0 VGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKVSEGSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKVSEGSLS
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CCDS47 S
        

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CCDS83 PIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSI
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CCDS83 VGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKCSLGTVT
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pF1KB0 ----------------------VSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQGL
                             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LEVGRIKAGPFHSERRPSQSSQVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQGL
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

            1840      1850      1860      1870      1880      1890 
pF1KB0 RTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTS
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

            1900      1910      1920      1930      1940      1950 
pF1KB0 TEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDL
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

            1960      1970      1980      1990      2000      2010 
pF1KB0 GPPQCKSITLERGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQIIAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GPPQCKSITLERGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQIIAV
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

            2020      2030      2040 
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       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NGQSLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RLKETDQILAINGQALDQTITHQQAISILQKAKDTVQLVIARGSLPQLVSPIVSRSPSAA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 STISAHSNPVHWQHMETIELVNDGSGLGFGIIGGKATGVIVKTILPGGVADQHGRLCSGD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HILKIGDTDLAGMSSEQVAQVLRQCGNRVKLMIARGAIEERTAPTALGITLSSSPTSTPE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LRVDASTQKGEESETFDVELTKNVQGLGITIAGYIGDKKLEPSGIFVKSITKSSAVEHDG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RIQIGDQIIAVDGTNLQGFTNQQAVEVLRHTGQTVLLTLMRRGMKQEAELMSREDVTKDA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DLSPVNASIIKENYEKDEDFLSSTRNTNILPTEEEGYPLLSAEIEEIEDAQKQEAALLTK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 WQRIMGINYEIVVAHVSKFSENSGLGISLEATVGHHFIRSVLPEGPVGHSGKLFSGDELL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EVNGITLLGENHQDVVNILKELPIEVTMVCCRRTVPPTTQSELDSLDLCDIELTEKPHVD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGEFIGSSETEDPVLAMTDAGQSTEEVQAPLAMWEAGIQHIELEKGSKGLGFSILDYQDP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IDPASTVIIIRSLVPGGIAEKDGRLLPGDRLMFVNDVNLENSSLEEAVEALKGAPSGTVR
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pF1KB0 IGVAKPLPLSPEEGYVSAKEDSFLYPPHSCEEAGLADKPLFRADLALVGTNDADLVDEST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IGVAKPLPLSPEEGYVSAKEDSFLYPPHSCEEAGLADKPLFRADLALVGTNDADLVDEST
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FESPYSPENDSIYSTQASILSLHGSSCGDGLNYGSSLPSSPPKDVIENSCDPVLDLHMSL
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pF1KB0 EELYTQNLLQRQDENTPSVDISMGPASGFTINDYTPANAIEQQYECENTIVWTESHLPSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EELYTQNLLQRQDENTPSVDISMGPASGFTINDYTPANAIEQQYECENTIVWTESHLPSE
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pF1KB0 VISSAELPSVLPDSAGKGSEYLLEQSSLACNAECVMLQNVSKESFERTINIAKGNSSLGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VISSAELPSVLPDSAGKGSEYLLEQSSLACNAECVMLQNVSKESFERTINIAKGNSSLGM
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pF1KB0 TVSANKDGLGMIVRSIIHGGAISRDGRIAIGDCILSINEESTISVTNAQARAMLRRHSLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TVSANKDGLGMIVRSIIHGGAISRDGRIAIGDCILSINEESTISVTNAQARAMLRRHSLI
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pF1KB0 GPDIKITYVPAEHLEEFKISLGQQSGRVMALDIFSSYTGRDIPELPEREEGEGEESELQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GPDIKITYVPAEHLEEFKISLGQQSGRVMALDIFSSYTGRDIPELPEREEGEGEESELQN
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pF1KB0 TAYSNWNQPRRVELWREPSKSLGISIVGGRGMGSRLSNGEVMRGIFIKHVLEDSPAGKNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TAYSNWNQPRRVELWREPSKSLGISIVGGRGMGSRLSNGEVMRGIFIKHVLEDSPAGKNG
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pF1KB0 TLKPGDRIVEVDGMDLRDASHEQAVEAIRKAGNPVVFMVQSIINRPRKSPLPSLLHNLYP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::             
CCDS59 TLKPGDRIVEVDGMDLRDASHEQAVEAIRKAGNPVVFMVQSIINRPR-------------
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             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB0 KYNFSSTNPFADSLQINADKAPSQSESEPEKAPLCSVPPPPPSAFAEMGSDHTQSSASKI
                           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 --------------------APSQSESEPEKAPLCSVPPPPPSAFAEMGSDHTQSSASKI
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pF1KB0 SQDVDKEDEFGYSWKNIRERYGTLTGELHMIELEKGHSGLGLSLAGNKDRSRMSVFIVGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SQDVDKEDEFGYSWKNIRERYGTLTGELHMIELEKGHSGLGLSLAGNKDRSRMSVFIVGI
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             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB0 DPNGAAGKDGRLQIADELLEINGQILYGRSHQNASSIIKCAPSKVKIIFIRNKDAVNQMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DPNGAAGKDGRLQIADELLEINGQILYGRSHQNASSIIKCAPSKVKIIFIRNKDAVNQMA
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pF1KB0 VCPGNAVEPLPSNSENLQNKETEPTVTTSDAAVDLSSFKNVQHLELPKDQGGLGIAISEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VCPGNAVEPLPSNSENLQNKETEPTVTTSDAAVDLSSFKNVQHLELPKDQGGLGIAISEE
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             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB0 DTLSGVIIKSLTEHGVAATDGRLKVGDQILAVDDEIVVGYPIEKFISLLKTAKMTVKLTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DTLSGVIIKSLTEHGVAATDGRLKVGDQILAVDDEIVVGYPIEKFISLLKTAKMTVKLTI
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pF1KB0 HAENPDSQAVPSAAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HAENPDSQAVPSAAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATC
      1530      1540      1550      1560      1570      1580       

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB0 PIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEV
      1590      1600      1610      1620      1630      1640       

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KB0 NGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSI
      1650      1660      1670      1680      1690      1700       

             1750      1760      1770      1780      1790          
pF1KB0 VGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLK-------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
CCDS59 VGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKCSLGTVT
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                                1800      1810      1820      1830 
pF1KB0 ----------------------VSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQGL
                             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LEVGRIKAGPFHSERRPSQSSQVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQGL
      1770      1780      1790      1800      1810      1820       

            1840      1850      1860      1870      1880      1890 
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTS
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            1900      1910      1920      1930      1940      1950 
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GPPQCKSITLERGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQIIAV
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            2020      2030      2040 
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       ::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS59 RIQIGDQIIAVDGTNLQGFTNQQAVEVLRHTGQTVLLTLMRRGMKQEAELMSREDVTKDA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGEFIGSSETEDPVLAMTDAGQSTEEVQAPLAMWEAGIQHIELEKGSKGLGFSILDYQDP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IGVAKPLPLSPEEGYVSAKEDSFLYPPHSCEEAGLADKPLFRADLALVGTNDADLVDEST
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FESPYSPENDSIYSTQASILSLHGSSCGDGLNYGSSLPSSPPKDVIENSCDPVLDLHMSL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EELYTQNLLQRQDENTPSVDISMGPASGFTINDYTPANAIEQQYECENTIVWTESHLPSE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VISSAELPSVLPDSAGKGSEYLLEQSSLACNAECVMLQNVSKESFERTINIAKGNSSLGM
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TVSANKDGLGMIVRSIIHGGAISRDGRIAIGDCILSINEESTISVTNAQARAMLRRHSLI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GPDIKITYVPAEHLEEFKISLGQQSGRVMALDIFSSYTGRDIPELPEREEGEGEESELQN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TAYSNWNQPRRVELWREPSKSLGISIVGGRGMGSRLSNGEVMRGIFIKHVLEDSPAGKNG
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pF1KB0 TLKPGDRIVEVDGMDLRDASHEQAVEAIRKAGNPVVFMVQSIINRPRKSPLPSLLHNLYP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::             
CCDS59 TLKPGDRIVEVDGMDLRDASHEQAVEAIRKAGNPVVFMVQSIINRPR-------------
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pF1KB0 KYNFSSTNPFADSLQINADKAPSQSESEPEKAPLCSVPPPPPSAFAEMGSDHTQSSASKI
                           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SQDVDKEDEFGYSWKNIRERYGTLTGELHMIELEKGHSGLGLSLAGNKDRSRMSVFIVGI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DPNGAAGKDGRLQIADELLEINGQILYGRSHQNASSIIKCAPSKVKIIFIRNKDAVNQMA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VCPGNAVEPLPSNSENLQNKETEPTVTTSDAAVDLSSFKNVQHLELPKDQGGLGIAISEE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DTLSGVIIKSLTEHGVAATDGRLKVGDQILAVDDEIVVGYPIEKFISLLKTAKMTVKLTI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HAENPDSQAVPSAAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEV
      1590      1600      1610      1620      1630      1640       

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pF1KB0 NGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSI
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pF1KB0 VGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKVSEGSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKVSEGSLS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQGLRTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTSTEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGD
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             1930      1940      1950      1960      1970      1980
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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      1890      1900      1910      1920      1930      1940       

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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      1950      1960      1970      1980      1990      2000       

        
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CCDS59 S
        

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       :..:...  . :  : : :.: .::.::::::::::.:::..::.:.::.:::.::. ::
CCDS61 STSSSLNDTTLPETVCWGHVEEVELINDGSGLGFGIVGGKTSGVVVRTIVPGGLADRDGR
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       : .:::::::: :.. ::.:::::::::.::: :....::   : :     ::.:: ..:
CCDS61 LQTGDHILKIGGTNVQGMTSEQVAQVLRNCGNSVRMLVARDPAGDISVTPPAPAALPVAL
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CCDS61 IIPGSAAYHNGHIQVNDKIVAVDGVNIQGFANHDVVEVLRNAGQVVHLTLVRRKTSSSTS
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CCDS61 PLEPPSDRGTVVEPLKPPALFLTGAVETETNVDGEDEEIKERIDTLKNDNIQALEK----
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CCDS61 RLGVEVDSFDGHHYISSIVSGGPVDTLGLLQPEDELLEVNGMQLYGKSRREAVSFLKEVP
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          :.:::::              : : : .    ::  .   .:  :  :    :.. .
CCDS61 PPFTLVCCRR--------------LFDDEAS----VDEPRRTETSLPETEVDHNMDVN-T
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CCDS61 EEDDDGELALWSPEVKIVELVKDCKGLGFSILDYQDPLDPTRSVIVIRSLVADGVAERSG
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CCDS61 GLLPGDRLVSVNEYCLDNTSLAEAVEILKAVPPGLVHLGICKPLVEDNEE------ESCY
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CCDS61 ILHSSSNEDKTEFSGTIHDINSSLILEAPKGFRDEPYFKEELVDEPFLDLGKSFHSQQKE
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       :      .  .. ..   :  .:  . ...  . ..: ..   :::       ::   ::
CCDS61 I-----EQSKEAWEMHEFL--TPRLQEMDEEREILVDEEY---ELY-------QD---PS
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        .. . : :   :.. ::. .... .   .   : ... :::   : :  .      :. 
CCDS61 PSMELYPLSH--IQEATPVPSVNELHFGTQ---WLHDNEPSE---SQEART------GR-
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       . :  : .  .   : :: .:   ::.  ..  ..:::. :     . ..:. .... . 
CCDS61 TVYSQEAQPYGYCPENVMKENFVMESLP-SVPSTEGNSQQGRF--DDLENLNSLAKTSLD
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        : :  :                                 . ::.. :   : :.. :. 
CCDS61 LGMIPND---------------------------------VQGPSLLIDLPVVAQRREQE
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pF1KB0 KISLGQ-QSGRVMA-----LDIFSSYTGRDIPELPEREEGEGEESELQNTAYSNWNQPRR
        . : : :. ::..       ..::  . :  ::::::::::::.      .:.:. :: 
CCDS61 DLPLYQHQATRVISKASAYTGMLSSRYATDTCELPEREEGEGEET----PNFSHWGPPRI
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pF1KB0 VELWREPSKSLGISIVGGRGMGSRLSNGEVMRGIFIKHVLEDSPAGKNGTLKPGDRIVEV
       ::..:::. :::::::::. . .::.::: ..:::::.:::::::::...:: ::.:.::
CCDS61 VEIFREPNVSLGISIVGGQTVIKRLKNGEELKGIFIKQVLEDSPAGKTNALKTGDKILEV
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CCDS61 SGVDLQNASHSEAVEAIKNAGNPVVFIVQSLSSTPRVIP------NVHNKANKITGNQNQ
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       :. .    :   :. . :   :. ..:::    .  . .:         :.. ..:: : 
CCDS61 DTQE---KKEKRQGTAPP---PM-KLPPP----YKALTDD---------SDENEEEDAF-
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        . ..::.::. : ::::.::::: ..::::::::::::::::.:.:::.:.: :. :::
CCDS61 -TDQKIRQRYADLPGELHIIELEKDKNGLGLSLAGNKDRSRMSIFVVGINPEGPAAADGR
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       ..:.:::::::.::::::::::::.::: ::::::..::::.:::::::: :     :.:
CCDS61 MRIGDELLEINNQILYGRSHQNASAIIKTAPSKVKLVFIRNEDAVNQMAVTP----FPVP
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pF1KB0 SNSENLQNKETEPTVTTSDAAVDLSSFKNVQHLELPKDQGGLGIAISEEDTLSGVIIKSL
       :.:         :           ::..         ::.:     ::::          
CCDS61 SSS---------P-----------SSIE---------DQSGTEPISSEED----------
                1340                          1350                 

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pF1KB0 TEHGVAATDGRLKVGDQILAVDDEIVVGYPIEKFISLLKTAKMTVKLTIHAENPDSQAVP
                : ..:: . :  .. . ..      .: .:  :. .:...     .:: .:
CCDS61 ---------GSVEVGIKQLPESESFKLA------VSQMKQQKYPTKVSF-----SSQEIP
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pF1KB0 SAAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCETTIE
        : ...     .:... ..  .:   : :.              :::::::.:: :  ::
CCDS61 LAPASSY----HSTDADFTGYGGFQAPLSV--------------DPATCPIVPGQEMIIE
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       :::::.:::::::::.:: :.::.:::::::::: .:::::::::::::::.:::...:.
CCDS61 ISKGRSGLGLSIVGGKDTPLNAIVIHEVYEEGAAARDGRLWAGDQILEVNGVDLRNSSHE
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pF1KB0 EAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSIVGKRNDTGVFV
       :::..::::::.:::..::::: :..::  . . ..:::: :.::::::::::: .:::.
CCDS61 EAITALRQTPQKVRLVVYRDEAHYRDEENLEIFPVDLQKKAGRGLGLSIVGKRNGSGVFI
    1500      1510      1520      1530      1540      1550         

            1760      1770      1780      1790      1800           
pF1KB0 SDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKVSEGSLS---------SF
       ::::::: :: ::::.:::::: :::::.:::.::.::..:: ..: ..         :.
CCDS61 SDIVKGGAADLDGRLIQGDQILSVNGEDMRNASQETVATILKCAQGLVQLEIGRLRAGSW
    1560      1570      1580      1590      1600      1610         

           1810      1820         1830                             
pF1KB0 TFPLSGSSTSESLESSSKKN---ALASEIQGL-----------------------RTVEM
       :   . :..:.. ..:....   ..:  : ::                       ::::.
CCDS61 TSARTTSQNSQGSQQSAHSSCHPSFAPVITGLQNLVGTKRVSDPSQKNSGTDMEPRTVEI
    1620      1630      1640      1650      1660      1670         

       1840      1850      1860      1870      1880      1890      
pF1KB0 KKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTSTEGMT
       ..  .:.:::::::: ::::::.:.::::.. .::::.::::.::::::.: :   .:..
CCDS61 NRELSDALGISIAGGRGSPLGDIPVFIAMIQASGVAARTQKLKVGDRIVSINGQPLDGLS
    1680      1690      1700      1710      1720      1730         

       1900      1910      1920      1930      1940      1950      
pF1KB0 HTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDLGPPQC
       :...::::::: : : .::::  ..:.... : :  :.                      
CCDS61 HADVVNLLKNAYGRIILQVVADTNISAIAA-QLENMSTGYHLGSPTAEHHPEDTEEQLQM
    1740      1750      1760       1770      1780      1790        

       1960      1970      1980      1990      2000      2010      
pF1KB0 KSITLERGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQIIAVNGQSL
                                                                   
CCDS61 TAD                                                         
     1800                                                          

>>CCDS9323.1 LNX2 gene_id:222484|Hs108|chr13              (690 aa)
 initn: 811 init1: 218 opt: 421  Z-score: 358.7  bits: 78.4 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 777; 33.0% identity (60.7% similar) in 524 aa overlap (1564-2040:169-683)

          1540      1550      1560      1570          1580         
pF1KB0 DEIVVGYPIEKFISLLKTAKMTVKLTIHAENPDSQAVPSA----AGAASGEKKNSSQSLM
                                     .: .   : :    .::.  :.. .: :: 
CCDS93 GASHRRVALERRKTSRTQAEIENENGPTLLDPAGTLSPEADCLGTGAVPVERHLTSASL-
      140       150       160       170       180       190        

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pF1KB0 VPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCETTIEI--SKGRTGLGLSIVGGS
         .. : ::     . . :. :  ...: . :   :  :::::  :.    ::.:::::.
CCDS93 --STWSEEPGLDNPAFEESAGADTTQQPLSLP--EGEITTIEIHRSNPYIQLGISIVGGN
         200       210       220         230       240       250   

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pF1KB0 DTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEVNGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLT
       .: :  :.:.:::..:.  .:::: ::::::.::. .. ...:. :  :: :  . ..::
CCDS93 ETPLINIVIQEVYRDGVIARDGRLLAGDQILQVNNYNISNVSHNYARAVLSQPCNTLHLT
           260       270       280       290       300       310   

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pF1KB0 LYRD-----------EAPYKEEEVCDTLTIELQKKP-GKGLGLSIVGKRNDTGVFVSDIV
       . :.           ..   .::.   . . :.:.  :. ::...: . .. :::. :..
CCDS93 VLRERRFGNRAHNHSDSNSPREEI---FQVALHKRDSGEQLGIKLVRRTDEPGVFILDLL
           320       330          340       350       360       370

        1760      1770      1780      1790      1800           1810
pF1KB0 KGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKVSEGSLSSFTF-----PLSGSS
       .::.:  :::: ..:..: .::.:.. .: : .: ....: :   ..:.     :  :..
CCDS93 EGGLAAQDGRLSSNDRVLAINGHDLKYGTPELAAQIIQAS-GERVNLTIARPGKPQPGNT
              380       390       400       410        420         

             1820              1830              1840      1850    
pF1KB0 TSESLESSSKKN--------ALASEIQGL--------RTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGS
         :. . ::...        .  :  . :        . . .:: : .:::...::: ::
CCDS93 IREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRPSSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLGMTVAGGRGS
     430       440       450       460       470       480         

         1860      1870      1880      1890      1900        1910  
pF1KB0 PLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTSTEGMTHTQAVNLLKN--ASGSIE
         :..:::.. . : :  :.  ... :: ...: : .  ...:..:: .::   :: .. 
CCDS93 KSGELPIFVTSVPPHGCLARDGRIKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLKASAASPAVA
     490       500       510       520       530       540         

           1920      1930       1940      1950          1960       
pF1KB0 MQVVAGGDVSVVTGHQQE-PASSSLSFTGLTSSSIFQDDLGPPQ----CKSITLERGPDG
       ....    :  .: . .: :.. : .    . :  .   :: :.    :..:.:.:.  :
CCDS93 LKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDASWSPSWVMWLGLPSTLHSCHDIVLRRSYLG
     550       560       570       580       590       600         

       1970      1980      1990      2000      2010      2020      
pF1KB0 -LGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQIIAVNGQSLEGVTHEEAVA
         ::::::::   : . :...::.     :  ::::: ::.:.:::: :  :..:   : 
CCDS93 SWGFSIVGGYEENHTNQPFFIKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTVGMSHSALVP
     610       620       630       640       650       660         

       2030      2040       
pF1KB0 ILKRTKGTVTLMVLS      
       .::. .. ::: :.       
CCDS93 MLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
     670       680       690

>>CCDS73357.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11               (852 aa)
 initn: 554 init1: 222 opt: 364  Z-score: 309.7  bits: 69.6 E(32554): 6.2e-11
Smith-Waterman score: 530; 31.9% identity (59.5% similar) in 474 aa overlap (1586-2038:61-497)

        1560      1570      1580      1590      1600      1610     
pF1KB0 VKLTIHAENPDSQAVPSAAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFAS
                                     :: . : ..:: :  . . . .. : . ..
CCDS73 RLTHEVRGPELVHVSEKNLSQIENVHGYVLQSHISPLKASPAPIIVNTDTLDTIPYVNGT
               40        50        60        70        80        90

        1620      1630      1640       1650         1660      1670 
pF1KB0 DPATCPIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDT-LLG---AIIIHEVYEEGAACKDGRL
       .      :      : . .: .:::.::.::.:.  .:   .:.: ..   ::: .::::
CCDS73 E------IEYEFEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDPGIFITKIIPGGAAAEDGRL
                    100       110       120       130       140    

            1680      1690      1700      1710      1720      1730 
pF1KB0 WAGDQILEVNGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKK
        ..: ::.:: .:. ...:..:...:... . ::: . : . :  :  :     :.: : 
CCDS73 RVNDCILRVNEVDVSEVSHSKAVEALKEAGSIVRLYVRRRR-PILETVV----EIKLFKG
          150       160       170       180        190             

            1740            1750      1760      1770      1780     
pF1KB0 PGKGLGLSI---VGKRN---DTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNAT-
       : ::::.::   ::...   :....:. :. :: :. ::::. ::..::::. .....: 
CCDS73 P-KGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIDGGAAQKDGRLQVGDRLLMVNNYSLEEVTH
     200        210       220       230       240       250        

         1790              1800      1810      1820      1830      
pF1KB0 QEAVAAL--------LKVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQGLRTVEM
       .:::: :        :::.. .   .: : .  . ..:  :   .: : :  .:  :.:.
CCDS73 EEAVAILKNTSEVVYLKVGKPTTIYMTDPYGPPDITHSY-SPPMENHLLSGNNG--TLEY
      260       270       280       290        300       310       

       1840      1850      1860      1870      1880      1890      
pF1KB0 KKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTSTEGMT
       :     ::   :. :  ::   .:    :.     .   .   : . .  .:  .  .  
CCDS73 KT----SLP-PISPGRYSP---IPKH--MLVDDDYTRPPEP--VYSTVNKLCD-KPASPR
             320           330         340         350        360  

       1900      1910      1920        1930      1940      1950    
pF1KB0 HTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDV--SVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDLGPP
       : . :.  :.   :  ..    : .  : .:.:.:. ...      :  .  ..   : :
CCDS73 HYSPVECDKSFLLSAPYSHYHLGLLPDSEMTSHSQHSTATRQPSMTLQRAVSLE---GEP
            370       380       390       400       410            

         1960      1970      1980      1990      2000      2010    
pF1KB0 QCKSITLERGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQIIAVNGQ
         ....:..:  ::::.::::     :.  :.:. ..: : :. .:.:.:::::..::: 
CCDS73 --RKVVLHKGSTGLGFNIVGG---EDGE-GIFVSFILAGGPADLSGELQRGDQILSVNGI
       420       430          440        450       460       470   

         2020      2030      2040                                  
pF1KB0 SLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS                                 
       .:.:..::.:.: :: .  :::..                                    
CCDS73 DLRGASHEQAAAALKGAGQTVTIIAQYQPEDYARFEAKIHDLREQMMNHSMSSGSGSLRT
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>>CCDS41696.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11               (870 aa)
 initn: 554 init1: 222 opt: 364  Z-score: 309.6  bits: 69.6 E(32554): 6.3e-11
Smith-Waterman score: 530; 31.9% identity (59.5% similar) in 474 aa overlap (1586-2038:61-497)

        1560      1570      1580      1590      1600      1610     
pF1KB0 VKLTIHAENPDSQAVPSAAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFAS
                                     :: . : ..:: :  . . . .. : . ..
CCDS41 RLTHEVRGPELVHVSEKNLSQIENVHGYVLQSHISPLKASPAPIIVNTDTLDTIPYVNGT
               40        50        60        70        80        90

        1620      1630      1640       1650         1660      1670 
pF1KB0 DPATCPIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDT-LLG---AIIIHEVYEEGAACKDGRL
       .      :      : . .: .:::.::.::.:.  .:   .:.: ..   ::: .::::
CCDS41 E------IEYEFEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDPGIFITKIIPGGAAAEDGRL
                    100       110       120       130       140    

            1680      1690      1700      1710      1720      1730 
pF1KB0 WAGDQILEVNGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKK
        ..: ::.:: .:. ...:..:...:... . ::: . : . :  :  :     :.: : 
CCDS41 RVNDCILRVNEVDVSEVSHSKAVEALKEAGSIVRLYVRRRR-PILETVV----EIKLFKG
          150       160       170       180        190             

            1740            1750      1760      1770      1780     
pF1KB0 PGKGLGLSI---VGKRN---DTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNAT-
       : ::::.::   ::...   :....:. :. :: :. ::::. ::..::::. .....: 
CCDS41 P-KGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIDGGAAQKDGRLQVGDRLLMVNNYSLEEVTH
     200        210       220       230       240       250        

         1790              1800      1810      1820      1830      
pF1KB0 QEAVAAL--------LKVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQGLRTVEM
       .:::: :        :::.. .   .: : .  . ..:  :   .: : :  .:  :.:.
CCDS41 EEAVAILKNTSEVVYLKVGKPTTIYMTDPYGPPDITHSY-SPPMENHLLSGNNG--TLEY
      260       270       280       290        300       310       

       1840      1850      1860      1870      1880      1890      
pF1KB0 KKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTSTEGMT
       :     ::   :. :  ::   .:    :.     .   .   : . .  .:  .  .  
CCDS41 KT----SLP-PISPGRYSP---IPKH--MLVDDDYTRPPEP--VYSTVNKLCD-KPASPR
             320           330         340         350        360  

       1900      1910      1920        1930      1940      1950    
pF1KB0 HTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDV--SVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDLGPP
       : . :.  :.   :  ..    : .  : .:.:.:. ...      :  .  ..   : :
CCDS41 HYSPVECDKSFLLSAPYSHYHLGLLPDSEMTSHSQHSTATRQPSMTLQRAVSLE---GEP
            370       380       390       400       410            

         1960      1970      1980      1990      2000      2010    
pF1KB0 QCKSITLERGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQIIAVNGQ
         ....:..:  ::::.::::     :.  :.:. ..: : :. .:.:.:::::..::: 
CCDS41 --RKVVLHKGSTGLGFNIVGG---EDGE-GIFVSFILAGGPADLSGELQRGDQILSVNGI
       420       430          440        450       460       470   

         2020      2030      2040                                  
pF1KB0 SLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS                                 
       .:.:..::.:.: :: .  :::..                                    
CCDS41 DLRGASHEQAAAALKGAGQTVTIIAQYQPEDYARFEAKIHDLREQMMNHSMSSGSGSLRT
           480       490       500       510       520       530   

>>CCDS44690.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11               (975 aa)
 initn: 554 init1: 222 opt: 364  Z-score: 308.9  bits: 69.7 E(32554): 6.9e-11
Smith-Waterman score: 530; 31.9% identity (59.5% similar) in 474 aa overlap (1586-2038:166-602)

        1560      1570      1580      1590      1600      1610     
pF1KB0 VKLTIHAENPDSQAVPSAAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFAS
                                     :: . : ..:: :  . . . .. : . ..
CCDS44 RLTHEVRGPELVHVSEKNLSQIENVHGYVLQSHISPLKASPAPIIVNTDTLDTIPYVNGT
         140       150       160       170       180       190     

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pF1KB0 DPATCPIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDT-LLG---AIIIHEVYEEGAACKDGRL
       .      :      : . .: .:::.::.::.:.  .:   .:.: ..   ::: .::::
CCDS44 E------IEYEFEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDPGIFITKIIPGGAAAEDGRL
               200       210       220       230       240         

            1680      1690      1700      1710      1720      1730 
pF1KB0 WAGDQILEVNGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKK
        ..: ::.:: .:. ...:..:...:... . ::: . : . :  :  :     :.: : 
CCDS44 RVNDCILRVNEVDVSEVSHSKAVEALKEAGSIVRLYVRRRR-PILETVV----EIKLFKG
     250       260       270       280       290            300    

            1740            1750      1760      1770      1780     
pF1KB0 PGKGLGLSI---VGKRN---DTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNAT-
       : ::::.::   ::...   :....:. :. :: :. ::::. ::..::::. .....: 
CCDS44 P-KGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIDGGAAQKDGRLQVGDRLLMVNNYSLEEVTH
           310       320       330       340       350       360   

         1790              1800      1810      1820      1830      
pF1KB0 QEAVAAL--------LKVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQGLRTVEM
       .:::: :        :::.. .   .: : .  . ..:  :   .: : :  .:  :.:.
CCDS44 EEAVAILKNTSEVVYLKVGKPTTIYMTDPYGPPDITHSY-SPPMENHLLSGNNG--TLEY
           370       380       390       400        410         420

       1840      1850      1860      1870      1880      1890      
pF1KB0 KKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTSTEGMT
       :     ::   :. :  ::   .:    :.     .   .   : . .  .:  .  .  
CCDS44 KT----SLP-PISPGRYSP---IPKH--MLVDDDYTRPPEP--VYSTVNKLCD-KPASPR
                   430            440       450         460        

       1900      1910      1920        1930      1940      1950    
pF1KB0 HTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDV--SVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDLGPP
       : . :.  :.   :  ..    : .  : .:.:.:. ...      :  .  ..   : :
CCDS44 HYSPVECDKSFLLSAPYSHYHLGLLPDSEMTSHSQHSTATRQPSMTLQRAVSLE---GEP
       470       480       490       500       510       520       

         1960      1970      1980      1990      2000      2010    
pF1KB0 QCKSITLERGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQIIAVNGQ
         ....:..:  ::::.::::     :.  :.:. ..: : :. .:.:.:::::..::: 
CCDS44 --RKVVLHKGSTGLGFNIVGG---EDGE-GIFVSFILAGGPADLSGELQRGDQILSVNGI
            530       540           550       560       570        

         2020      2030      2040                                  
pF1KB0 SLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS                                 
       .:.:..::.:.: :: .  :::..                                    
CCDS44 DLRGASHEQAAAALKGAGQTVTIIAQYQPEDYARFEAKIHDLREQMMNHSMSSGSGSLRT
      580       590       600       610       620       630        

>>CCDS55782.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11               (909 aa)
 initn: 554 init1: 222 opt: 363  Z-score: 308.5  bits: 69.5 E(32554): 7.3e-11
Smith-Waterman score: 529; 31.3% identity (59.5% similar) in 489 aa overlap (1572-2038:85-536)

            1550      1560      1570       1580      1590      1600
pF1KB0 IEKFISLLKTAKMTVKLTIHAENPDSQAVPSAAGAAS-GEKKNSSQSLMVPQSGSPEPES
                                     :. : .. ::. .  .. . : ..:: :  
CCDS55 GPGGPASNRTGGSSFNRTLWDSVRKSPHKTSTKGKGTCGEHCTCPHGWFSPAQASPAPII
           60        70        80        90       100       110    

             1610      1620      1630      1640       1650         
pF1KB0 IRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCETTIEISKGRTGLGLSIVGGSDT-LLG---AIII
       . . . .. : . ...      :      : . .: .:::.::.::.:.  .:   .:.:
CCDS55 VNTDTLDTIPYVNGTE------IEYEFEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDPGIFI
          120       130             140       150       160        

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pF1KB0 HEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEVNGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDEAPYK
        ..   ::: .:::: ..: ::.:: .:. ...:..:...:... . ::: . : . :  
CCDS55 TKIIPGGAAAEDGRLRVNDCILRVNEVDVSEVSHSKAVEALKEAGSIVRLYVRRRR-PIL
      170       180       190       200       210       220        

       1720      1730      1740            1750      1760      1770
pF1KB0 EEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSI---VGKRN---DTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGD
       :  :     :.: : : ::::.::   ::...   :....:. :. :: :. ::::. ::
CCDS55 ETVV----EIKLFKGP-KGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIDGGAAQKDGRLQVGD
       230            240       250       260       270       280  

             1780       1790              1800      1810      1820 
pF1KB0 QILMVNGEDVRNAT-QEAVAAL--------LKVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKK
       ..::::. .....: .:::: :        :::.. .   .: : .  . ..:  :   .
CCDS55 RLLMVNNYSLEEVTHEEAVAILKNTSEVVYLKVGKPTTIYMTDPYGPPDITHSY-SPPME
            290       300       310       320       330        340 

            1830      1840      1850      1860      1870      1880 
pF1KB0 NALASEIQGLRTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVG
       : : :  .:  :.:.:     ::   :. :  ::   .:    :.     .   .   : 
CCDS55 NHLLSGNNG--TLEYKT----SLP-PISPGRYSP---IPKH--MLVDDDYTRPPEP--VY
             350              360          370         380         

            1890      1900      1910      1920        1930         
pF1KB0 DRIVTICGTSTEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDV--SVVTGHQQEPASSSLSFT
       . .  .:  .  .  : . :.  :.   :  ..    : .  : .:.:.:. ...     
CCDS55 STVNKLCD-KPASPRHYSPVECDKSFLLSAPYSHYHLGLLPDSEMTSHSQHSTATRQPSM
       390        400       410       420       430       440      

    1940      1950      1960      1970      1980      1990         
pF1KB0 GLTSSSIFQDDLGPPQCKSITLERGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASED
        :  .  ..   : :  ....:..:  ::::.::::     :.  :.:. ..: : :. .
CCDS55 TLQRAVSLE---GEP--RKVVLHKGSTGLGFNIVGG---EDGE-GIFVSFILAGGPADLS
        450            460       470          480        490       

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pF1KB0 GRLKRGDQIIAVNGQSLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS                  
       :.:.:::::..::: .:.:..::.:.: :: .  :::..                     
CCDS55 GELQRGDQILSVNGIDLRGASHEQAAAALKGAGQTVTIIAQYQPEDYARFEAKIHDLREQ
       500       510       520       530       540       550       

CCDS55 MMNHSMSSGSGSLRTNQKRSLYVRAMFDYDKSKDSGLPSQGLSFKYGDILHVINASDDEW
       560       570       580       590       600       610       




2041 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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