Result of FASTA (omim) for
pFN21AA1677
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1677, 604 aa
1>>>pF1KA1677 604 - 604 aa - 604 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2003+/-0.000484; mu= 19.9421+/- 0.030
mean_var=95.4004+/-20.792, 0's: 0 Z-trim(109.3): 353 B-trim: 1579 in 2/54
Lambda= 0.131310
statistics sampled from 17008 (17464) to 17008 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 7.910
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 4119 791.8 0
NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 4119 791.8 0
NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 907 183.3 2e-45
NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 907 183.4 2.1e-45
NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 907 183.4 2.1e-45
XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 907 183.4 2.1e-45
NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 907 183.4 2.1e-45
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 907 183.4 2.1e-45
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 907 183.4 2.1e-45
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 907 183.4 2.1e-45
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 907 183.4 2.1e-45
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 907 183.4 2.1e-45
NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 898 181.6 6.7e-45
XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 684 141.1 1.1e-32
XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 684 141.1 1.1e-32
NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 684 141.1 1.1e-32
NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 573 120.1 2.3e-26
NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 573 120.1 2.3e-26
NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Ho ( 628) 551 115.9 4.1e-25
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 538 113.4 2.3e-24
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 525 110.9 1e-23
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 525 110.9 1.1e-23
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 525 110.9 1.2e-23
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 525 111.0 1.2e-23
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 525 111.0 1.3e-23
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 524 110.8 1.3e-23
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 524 110.9 1.6e-23
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 524 110.9 1.6e-23
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 524 110.9 1.7e-23
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 524 110.9 1.7e-23
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 524 110.9 1.7e-23
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 524 110.9 1.7e-23
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 524 110.9 1.7e-23
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 524 110.9 1.7e-23
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 524 110.9 1.7e-23
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 524 110.9 1.7e-23
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 522 110.4 1.8e-23
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 522 110.4 1.8e-23
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 520 110.0 2.3e-23
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 520 110.0 2.4e-23
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 520 110.1 2.7e-23
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 516 109.2 3.8e-23
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 510 108.1 8.6e-23
XP_016856699 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 531) 508 107.7 1e-22
NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein ( 582) 508 107.7 1.1e-22
NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584) 508 107.7 1.1e-22
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 506 107.3 1.4e-22
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 500 106.3 3.6e-22
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 497 105.7 4.9e-22
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 497 105.7 4.9e-22
>>XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelch-li (604 aa)
initn: 4119 init1: 4119 opt: 4119 Z-score: 4225.0 bits: 791.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4119; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALLATQSDYFRIMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALLATQSDYFRIMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 CSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 MSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 HKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 DKQIMVLGGLCYNGHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DKQIMVLGGLCYNGHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEV
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RRCN
::::
XP_006 RRCN
>>NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein 15 (604 aa)
initn: 4119 init1: 4119 opt: 4119 Z-score: 4225.0 bits: 791.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4119; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALLATQSDYFRIMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALLATQSDYFRIMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 TADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAMYVQLIEVVKFC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 CSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 CSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 MSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 MSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPTSVFEKVKTSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 FYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 LKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 QMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 GTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 HKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 HKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 DKQIMVLGGLCYNGHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 DKQIMVLGGLCYNGHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEV
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RRCN
::::
NP_085 RRCN
>>NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (613 aa)
initn: 987 init1: 285 opt: 907 Z-score: 936.4 bits: 183.3 E(85289): 2e-45
Smith-Waterman score: 1109; 32.2% identity (65.3% similar) in 599 aa overlap (2-593:21-596)
10 20 30
pF1KA1 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVI--ED
:: .. : :. :.. : :: : :::: ::::. :
NP_001 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 HQFQAHKALLATQSDYFRIMFTADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMN
: .:....:. ::::. :::. :.:.: :.:.:.. .:. ....:.: . . :.:.
NP_001 DAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 TVHEILQAAMYVQLIEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLL
.... :.:: ..:.. :. :: ::.. . :.::.:. :. . . :. : . ...:.:
NP_001 NLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTY--NLTEVDKYVNSFVL
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 DNFVPLMSRPDFLSYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTII
:: :.: .::. : ::.: :... :.. :.::..:. ::: .. : . ..
NP_001 KNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLM
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 QNIRFCLMTPTSVFEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAK
.:::: :::: ... :.: .:.: . . .: :: . ..::... . :::
NP_001 KNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 PQTTVFRGMIGHSMVNSKILLL--KKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGE-E
. ... :.. ...: :: : . .: . : : ..: .:...::....::. .
NP_001 THLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSN
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 LGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYST
:. : . :::.::: :.:.:.:... :. : .... ..:::.::. . ..
NP_001 YDTKGKT-AVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 ERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQ
: :. ...: .: . .::: ::: .. ..:.:::: .. .:.. :::.
NP_001 ECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPD-------
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYN
:. : .:. :. .: .: : . . .:::.:: .:.. . . : : :.
NP_001 --------TDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNH--FRGTSDYDDVLSCEYYS
470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 PETDQWTILASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDPDENKWKEDEY
: :::: .:.: :.: ::.:....:.:.:: .:.. . . . .:::...:..
NP_001 PILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHK--V
520 530 540 550 560 570
580 590 600
pF1KA1 PRMPCKLDGLQVCNLH-FPDYVLDEVRRCN
.: .: :...:.: ::
NP_001 FDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
580 590 600 610
>>NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (639 aa)
initn: 987 init1: 285 opt: 907 Z-score: 936.2 bits: 183.4 E(85289): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 1109; 32.2% identity (65.3% similar) in 599 aa overlap (2-593:47-622)
10 20 30
pF1KA1 MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLL
:: .. : :. :.. : :: : ::::
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>>NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (649 aa)
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Smith-Waterman score: 1109; 32.2% identity (65.3% similar) in 599 aa overlap (2-593:57-632)
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pF1KA1 VREKLDTFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDR
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NP_001 VDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEE
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210 220 230 240 250 260
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pF1KA1 FVFLLGGE-ELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAG
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NP_001 DPD---------------TDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNH--FRGTSDY
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pF1KA1 QGCPSTEVYNPETDQWTILASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGH-YSDSILTFDP
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pF1KA1 DENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLH-FPDYVLDEVRRCN
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NP_001 DKDEWHK--VFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
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>>NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isoform (655 aa)
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NP_277 VDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEE
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NP_277 PRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQ
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NP_277 FLYVVGGQSNYDTKGKT-AVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGG
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390 400 410 420 430 440
pF1KA1 RTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVF
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NP_277 RNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCF
450 460 470 480 490 500
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NP_277 DPD---------------TDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNH--FRGTSDY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]