Result of FASTA (ccds) for pFN21AA0850
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0850, 642 aa
  1>>>pF1KA0850 642 - 642 aa - 642 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1149+/-0.000996; mu= 14.9167+/- 0.059
 mean_var=78.9470+/-16.295, 0's: 0 Z-trim(105.0): 156  B-trim: 333 in 1/50
 Lambda= 0.144347
 statistics sampled from 8044 (8214) to 8044 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.252), width:  16
 Scan time:  2.700

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1       ( 642) 4391 924.6       0
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1         ( 609)  662 148.0 3.6e-35
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 505)  642 143.8 5.5e-34
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 555)  642 143.8   6e-34
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5          ( 587)  642 143.8 6.3e-34
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19         ( 624)  590 133.0 1.2e-30
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 427)  584 131.7   2e-30
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1         ( 568)  585 131.9 2.3e-30
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 496)  584 131.7 2.3e-30
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 505)  584 131.7 2.4e-30
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 593)  584 131.7 2.7e-30
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 597)  584 131.7 2.7e-30
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14        ( 571)  582 131.3 3.5e-30
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14       ( 585)  582 131.3 3.6e-30
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17      ( 608)  578 130.5 6.6e-30
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 437)  567 128.1 2.4e-29
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 544)  567 128.2 2.9e-29
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4          ( 620)  567 128.2 3.3e-29
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1       ( 642)  536 121.8   3e-27
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2       ( 578)  516 117.6 4.9e-26
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3        ( 574)  511 116.5   1e-25
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7         ( 586)  511 116.5   1e-25
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 568)  491 112.4 1.8e-24
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4          ( 694)  491 112.4 2.1e-24
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 709)  491 112.4 2.2e-24
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 755)  491 112.4 2.3e-24
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3         ( 600)  464 106.7 9.2e-23
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 718)  455 104.9 3.9e-22
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 720)  455 104.9   4e-22
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2        ( 558)  451 104.0 5.6e-22
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13        ( 687)  451 104.1 6.8e-22
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13         ( 748)  451 104.1 7.3e-22
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7          ( 538)  410 95.5   2e-19
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1         ( 597)  405 94.5 4.6e-19
CCDS53882.1 KLHL33 gene_id:123103|Hs108|chr14      ( 533)  389 91.1 4.2e-18
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3         ( 601)  387 90.7 6.2e-18
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 613)  372 87.6 5.5e-17
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 639)  372 87.6 5.7e-17
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 655)  372 87.6 5.8e-17
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 658)  372 87.6 5.8e-17
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9          ( 617)  367 86.6 1.1e-16
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22       ( 634)  357 84.5 4.9e-16
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6       ( 634)  354 83.9 7.6e-16
CCDS30985.1 KLHDC8A gene_id:55220|Hs108|chr1       ( 350)  350 82.9   8e-16
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15       ( 589)  353 83.6 8.2e-16
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 582)  351 83.2 1.1e-15
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 584)  351 83.2 1.1e-15
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16           ( 597)  339 80.7 6.3e-15
CCDS69155.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6       ( 551)  336 80.1   9e-15
CCDS69154.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6       ( 584)  336 80.1 9.5e-15


>>CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1            (642 aa)
 initn: 4391 init1: 4391 opt: 4391  Z-score: 4941.4  bits: 924.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4391; 100.0% identity (100.0% similar) in 642 aa overlap (1-642:1-642)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 FNSDSDPHGISHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FNSDSDPHGISHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 CGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MLEDNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MLEDNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 AEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 TYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPKLSKSLSFEMQQDELIEKPMSPMQYARSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPKLSKSLSFEMQQDELIEKPMSPMQYARSG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 LGTAEMNGKLIAAGGYNREECLRTVECYNPHTDHWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGTAEMNGKLIAAGGYNREECLRTVECYNPHTDHWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 GGSNGHSDDLSCGEMYDSNIDDWIPVPELRTNRCNAGVCALNGKLYIVGGSDPYGQKGLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GGSNGHSDDLSCGEMYDSNIDDWIPVPELRTNRCNAGVCALNGKLYIVGGSDPYGQKGLK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 NCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 LIAPMNVARRGAGVAVLNGKLFVCGGFDGSHAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LIAPMNVARRGAGVAVLNGKLFVCGGFDGSHAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640  
pF1KA0 IATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYTKIFQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYTKIFQF
              610       620       630       640  

>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1              (609 aa)
 initn: 1243 init1: 447 opt: 662  Z-score: 744.9  bits: 148.0 E(32554): 3.6e-35
Smith-Waterman score: 909; 31.0% identity (57.9% similar) in 617 aa overlap (22-636:58-584)

                        10        20        30        40        50 
pF1KA0          MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLA
                                     .: :::  ..::: : : .... :::..:.
CCDS13 GDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILS
        30        40        50        60        70        80       

              60        70        80        90       100       110 
pF1KA0 CCSPYLFEIFNSDSDPHGISHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKK
        ::::.  .:...      ..: . :.. .:.:.:...:::.:. ...  :. .  ::  
CCDS13 ACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACL
        90       100       110       120       130       140       

             120       130       140       150       160       170 
pF1KA0 LKMDRVKQVCGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFL
       :.. .....: ..:  ..: ..:.. : ::.  .  .::  .: . :... .. : :::.
CCDS13 LQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFM
       150       160       170       180       190       200       

              180       190       200       210       220       230
pF1KA0 KLPRLKL-EVMLEDNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHK
        ::  .: ...  :.. . :. .... :. ::. :: :   .: .....:.         
CCDS13 LLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRL-------P
       210       220       230       240       250              260

              240       250       260       270       280       290
pF1KA0 LLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWK
       ::. ..: : .   :::          :                       ..: ..   
CCDS13 LLSPKFLVGTV---GSD----------P----------------------LIKSDEECRD
              270                                          280     

              300       310       320       330       340       350
pF1KA0 IVASEKTSNNTYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPKLSKSLSFEMQQDELIEKP
       .:   :.    :: :                 ::  :             ::  .   .:
CCDS13 LVDEAKN----YLLL-----------------PQERPL------------MQGPR--TRP
         290                            300                     310

              360       370       380       390       400       410
pF1KA0 MSPMQYARSGLGTAEMNGKLIAAGGYNREECLRTVECYNPHTDHWSFLAPMRTPRARFQM
        .:.   : :    :.   :.:.::.   . . .:: :.:.:..: ..: :   :    .
CCDS13 RKPI---RCG----EV---LFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGV
                        320       330       340       350       360

              420       430       440        450       460         
pF1KA0 AVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDSNIDDWIP-VPELRTNRCNAGVCALNGKLYIVG
       .::   ::.::: .: :. :.  : :: . ..:   :    : : ..:: .:.: :: ::
CCDS13 SVLDDLLYAVGGHDG-SSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVG
              370        380       390       400       410         

     470       480       490       500       510       520         
pF1KA0 GSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTV
       :.:  : . :.  . .::  . ::  : .. ::   ::  :::.:: .::... . ::::
CCDS13 GQD--GVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTV
     420         430       440       450       460       470       

     530       540       550       560       570       580         
pF1KA0 ERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLNGKLFVCGGFDGSHAISCVEMYDPTRNEWKMM
       :::::..: :  ::::.. :.  : :: .  ... :: : .  .: .: :.:  :.:. .
CCDS13 ERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPV
       480       490       500       510       520       530       

     590       600       610       620       630       640         
pF1KA0 GNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYTKIFQF       
         ::: ::..:.:.:.. ..:::::::. .:.:.::.. ..: :  :             
CCDS13 VAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVG
       540       550       560       570       580       590       

CCDS13 VIKMTHCESHIW
       600         

>>CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5              (505 aa)
 initn: 383 init1: 383 opt: 642  Z-score: 723.7  bits: 143.8 E(32554): 5.5e-34
Smith-Waterman score: 750; 28.6% identity (58.6% similar) in 539 aa overlap (73-608:9-505)

             50        60        70        80        90       100  
pF1KA0 MLAHRAVLACCSPYLFEIFNSDSDPHGISHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELV
                                     ... :.. ...  :..: :::.... .: :
CCDS58                       MSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENV
                                     10        20        30        

            110       120       130       140       150       160  
pF1KA0 KDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLL
       . .  ::. :..  :.: : :.: :..  :.:.. : ::.    . ::....:: ..:. 
CCDS58 QVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFP
       40        50        60        70        80        90        

            170       180        190       200       210       220 
pF1KA0 QISEEEEFLKLPRLKLEVMLE-DNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQ
       ..   ::::.:   ..  ..  :.. . :. :..  ::.:..       . . .:::.:.
CCDS58 EVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVR
      100       110       120       130       140       150        

             230       240       250       260       270       280 
pF1KA0 TLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNAT
                ::  . :             .: :...   .:     ...    :      
CCDS58 L-------PLLPRDYL-------------VQTVEEEALIKN-----NNTCKDFLIEAMKY
             160                    170            180       190   

             290       300       310       320       330        340
pF1KA0 VQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPKLSKSLS-FE
          :  .  .. . .:.  : . :  .     .: . :.         .::  .:.  ..
CCDS58 HLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKV-----MIVVGGQ---------APKAIRSVECYD
           200       210       220                     230         

              350       360       370       380       390       400
pF1KA0 MQQDELIEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGKLIAAGGYNREECLRTVECYNPHTDHWSFLAP
       ...:.  .    : .  :.:.  . : :.. :.::.:    .:::. :.   :.:. .: 
CCDS58 FEEDRWDQIAELPSRRCRAGV--VFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIAS
     240       250       260         270       280       290       

              410       420       430       440       450       460
pF1KA0 MRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDSNIDDWIPVPELRTNRCNAGVCA
       :.  :. .  :::   ::.::: .: :  :.  : :. . ..:. :  . : : ..:: .
CCDS58 MQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDG-STGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGV
       300       310       320        330       340       350      

              470       480       490       500       510       520
pF1KA0 LNGKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGA
       ..:::: ::: :  ... :.. . ..:.:. :   : .. ::  ..:  :.: ::  :: 
CCDS58 VEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGH
        360       370       380       390       400       410      

              530       540       550       560       570       580
pF1KA0 ESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLNGKLFVCGGFDGSHAISCVEMYD
       ..    ..:: :.: .:::  .: ::. ::.::: ..:: :.: :: :::  .. ::.:.
CCDS58 DGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYN
        420       430       440       450       460       470      

              590        600       610       620       630         
pF1KA0 PTRNEWKMMG-NMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYTKI
       :. ..: ..  ::.. :: ::.:.. ...                               
CCDS58 PVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL                               
        480       490       500                                    

>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5              (555 aa)
 initn: 1066 init1: 383 opt: 642  Z-score: 723.0  bits: 143.8 E(32554): 6e-34
Smith-Waterman score: 869; 29.3% identity (59.3% similar) in 590 aa overlap (22-608:8-555)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEI
                            .: ::..  .::: . .   :. :::.::: ::::.  .
CCDS58               MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAM
                             10        20        30        40      

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 FNSDSDPHGISHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQV
       :..: .    ..... :.. ...  :..: :::.... .: :. .  ::. :..  :.: 
CCDS58 FTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQN
         50        60        70        80        90       100      

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 CGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEV
       : :.: :..  :.:.. : ::.    . ::....:: ..:. ..   ::::.:   ..  
CCDS58 CCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCS
        110       120       130       140       150       160      

               190       200       210       220       230         
pF1KA0 MLE-DNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDG
       ..  :.. . :. :..  ::.:..       . . .:::.:.         ::  . :  
CCDS58 LISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRL-------PLLPRDYL--
        170       180       190       200              210         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 QAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSN
                  .: :...   .:     ...    :         :  .  .. . .:. 
CCDS58 -----------VQTVEEEALIKN-----NNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKP
                  220            230       240       250       260 

     300       310       320       330        340       350        
pF1KA0 NTYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPKLSKSLS-FEMQQDELIEKPMSPMQYAR
        : . :  .     .: . :.         .::  .:.  .....:.  .    : .  :
CCDS58 RTPVSLPKV-----MIVVGGQ---------APKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCR
             270                     280       290       300       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA0 SGLGTAEMNGKLIAAGGYNREECLRTVECYNPHTDHWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLY
       .:.  . : :.. :.::.:    .:::. :.   :.:. .: :.  :. .  :::   ::
CCDS58 AGV--VFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLY
       310         320       330       340       350       360     

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA0 VVGGSNGHSDDLSCGEMYDSNIDDWIPVPELRTNRCNAGVCALNGKLYIVGGSDPYGQKG
       .::: .: :  :.  : :. . ..:. :  . : : ..:: ...:::: ::: :  ... 
CCDS58 AVGGFDG-STGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQC
         370        380       390       400       410       420    

      480       490       500       510       520       530        
pF1KA0 LKNCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNT
       :.. . ..:.:. :   : .. ::  ..:  :.: ::  :: ..    ..:: :.: .::
CCDS58 LSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNT
          430       440       450       460       470       480    

      540       550       560       570       580       590        
pF1KA0 WTLIAPMNVARRGAGVAVLNGKLFVCGGFDGSHAISCVEMYDPTRNEWKMMG-NMTSPRS
       :  .: ::. ::.::: ..:: :.: :: :::  .. ::.:.:. ..: ..  ::.. ::
CCDS58 WKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRS
          490       500       510       520       530       540    

       600       610       620       630       640  
pF1KA0 NAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYTKIFQF
        ::.:.. ...                                  
CCDS58 YAGVAVIHKSL                                  
          550                                       

>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5               (587 aa)
 initn: 909 init1: 383 opt: 642  Z-score: 722.6  bits: 143.8 E(32554): 6.3e-34
Smith-Waterman score: 869; 29.3% identity (59.3% similar) in 590 aa overlap (22-608:40-587)

                        10        20        30        40        50 
pF1KA0          MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLA
                                     .: ::..  .::: . .   :. :::.:::
CCDS41 SQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
      10        20        30        40        50        60         

              60        70        80        90       100       110 
pF1KA0 CCSPYLFEIFNSDSDPHGISHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKK
        ::::.  .:..: .    ..... :.. ...  :..: :::.... .: :. .  ::. 
CCDS41 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAASL
      70        80        90       100       110       120         

             120       130       140       150       160       170 
pF1KA0 LKMDRVKQVCGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFL
       :..  :.: : :.: :..  :.:.. : ::.    . ::....:: ..:. ..   ::::
CCDS41 LQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFL
     130       140       150       160       170       180         

             180        190       200       210       220       230
pF1KA0 KLPRLKLEVMLE-DNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHK
       .:   ..  ..  :.. . :. :..  ::.:..       . . .:::.:.         
CCDS41 SLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRL-------P
     190       200       210       220       230       240         

              240       250       260       270       280       290
pF1KA0 LLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWK
       ::  . :             .: :...   .:     ...    :         :  .  
CCDS41 LLPRDYL-------------VQTVEEEALIKN-----NNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRL
                         250       260            270       280    

              300       310       320       330        340         
pF1KA0 IVASEKTSNNTYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPKLSKSLS-FEMQQDELIEK
       .. . .:.  : . :  .     .: . :.         .::  .:.  .....:.  . 
CCDS41 LIKNPRTKPRTPVSLPKV-----MIVVGGQ---------APKAIRSVECYDFEEDRWDQI
          290       300                     310       320       330

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA0 PMSPMQYARSGLGTAEMNGKLIAAGGYNREECLRTVECYNPHTDHWSFLAPMRTPRARFQ
          : .  :.:.  . : :.. :.::.:    .:::. :.   :.:. .: :.  :. . 
CCDS41 AELPSRRCRAGV--VFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLG
              340         350       360       370       380        

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 MAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDSNIDDWIPVPELRTNRCNAGVCALNGKLYIVG
        :::   ::.::: .: :  :.  : :. . ..:. :  . : : ..:: ...:::: ::
CCDS41 AAVLNDLLYAVGGFDG-STGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVG
      390       400        410       420       430       440       

     470       480       490       500       510       520         
pF1KA0 GSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTV
       : :  ... :.. . ..:.:. :   : .. ::  ..:  :.: ::  :: ..    ..:
CCDS41 GYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSV
       450       460       470       480       490       500       

     530       540       550       560       570       580         
pF1KA0 ERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLNGKLFVCGGFDGSHAISCVEMYDPTRNEWKMM
       : :.: .:::  .: ::. ::.::: ..:: :.: :: :::  .. ::.:.:. ..: ..
CCDS41 EVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLL
       510       520       530       540       550       560       

     590        600       610       620       630       640  
pF1KA0 G-NMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYTKIFQF
         ::.. :: ::.:.. ...                                  
CCDS41 PTNMSTGRSYAGVAVIHKSL                                  
       570       580                                         

>>CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19              (624 aa)
 initn: 1110 init1: 455 opt: 590  Z-score: 663.7  bits: 133.0 E(32554): 1.2e-30
Smith-Waterman score: 769; 28.9% identity (58.2% similar) in 584 aa overlap (12-580:57-585)

                                  10        20        30        40 
pF1KA0                    MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGH
                                     :.  ... . .: :: : :.::: :::  .
CCDS12 AGDAVMYASTECKAEVTPSQHGNRTFSYTLEDHTKQAFGIMNELRLSQQLCDVTLQVKYQ
         30        40        50        60        70        80      

                   50        60        70        80        90      
pF1KA0 E-----MLAHRAVLACCSPYLFEIFNSDSDPHGISHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLK
       .     ..::..:::  :: .  .:..    .:.  :... ..:...: :...::::...
CCDS12 DAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLIEFAYTASIS
         90       100       110       120       130       140      

        100       110       120       130       140       150      
pF1KA0 ADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAY
         .. :  :...:   ..: : ..:.:.:....: .. :.  :::  .:  .: ...  :
CCDS12 MGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCVELHQRAREY
        150       160       170       180       190       200      

        160       170       180        190       200       210     
pF1KA0 IQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVML-EDNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEE
       :  :. .....:::..: . .: ... .:.. .  .....   ::::. .        :.
CCDS12 IYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDC-------EQ
        210       220       230       240       250                

         220       230       240          250       260       270  
pF1KA0 LMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQ---AEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSST
           ::.:  ..  . :  :.:. :    :.. ::.   ... :   . . ::   ..  
CCDS12 RRFYVQALLRAVRCHSLTPNFLQMQLQKCEILQSDSRCKDYLVKIFEELTLHKP--TQVM
     260       270       280       290       300       310         

            280       290       300       310       320       330  
pF1KA0 GCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPK
        :        ..::                        .  .:.  :    ::       
CCDS12 PC--------RAPK------------------------VGRLIYTAGGYFRQS-------
               320                               330               

            340       350       360       370       380            
pF1KA0 LSKSLSFEMQQDELIEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGKLIAAGGYNREECLRT----VECY
       ::   ... ..   ..  .. .:  ::::.   ..: : :.:: :      :    ..::
CCDS12 LSYLEAYNPSDGTWLR--LADLQVPRSGLAGCVVGGLLYAVGGRNNSPDGNTDSSALDCY
      340       350         360       370       380       390      

      390       400       410       420         430       440      
pF1KA0 NPHTDHWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNG--HSDDLSCGEMYDSNIDDWIPV
       :: :..::  ::: .:: :. ..:. :..:.::::.:  : ...   : :. . :.:  :
CCDS12 NPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYAVGGSHGCIHHNSV---ERYEPERDEWHLV
        400       410       420       430       440          450   

        450       460       470       480       490       500      
pF1KA0 PELRTNRCNAGVCALNGKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSA
         . : : ..:: .::  :: ::: :  : . :.. . . :  . :   . .:  :  ..
CCDS12 APMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFD--GTNRLNSAECYYPERNEWRMITAMNTIRSGAG
           460       470         480       490       500       510 

        510       520       530       540       550       560      
pF1KA0 VCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLNGKLFVCGG
       :: : . .:  :: .. . ::.::::. :..:::..:::.  : . :..: .:...: ::
CCDS12 VCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVETETWTFVAPMKHRRSALGITVHQGRIYVLGG
             520       530       540       550       560       570 

        570       580       590       600       610       620      
pF1KA0 FDGSHAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVY
       .::   .. :: ::                                              
CCDS12 YDGHTFLDSVECYDPDTDTWSEVTRMTSGRSGVGVAVTMEPCRKQIDQQNCTC       
             580       590       600       610       620           

>>CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4              (427 aa)
 initn: 470 init1: 368 opt: 584  Z-score: 659.5  bits: 131.7 E(32554): 2e-30
Smith-Waterman score: 661; 38.9% identity (65.4% similar) in 283 aa overlap (354-634:126-405)

           330       340       350       360       370       380   
pF1KA0 QSSPTSTPKLSKSLSFEMQQDELIEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGKLIAAGGYNREECLR
                                     :. .:. : :     ::... : .  . .:
CCDS82 EALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIR
         100       110       120       130       140       150     

           390       400       410       420       430       440   
pF1KA0 TVECYNPHTDHWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDSNIDDW
       .::::. . ..:  .: . . : :  :. . : ...::: :: :  .   . ::   :.:
CCDS82 SVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNG-SLRVRTVDSYDPVKDQW
         160       170       180       190        200       210    

           450       460       470       480       490       500   
pF1KA0 IPVPELRTNRCNAGVCALNGKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRH
         : ..:  : . :. .::: :: ::: :  :. ::.. ....  .. :   ::.: :: 
CCDS82 TSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFD--GSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRS
          220       230       240         250       260       270  

           510       520         530       540       550       560 
pF1KA0 QSAVCELGGYLYIIGGAE--SWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLNGKL
       . .:  .:: :: .:: .  : .::.::: ::  .: :: :: :.. : ::::.:::. :
CCDS82 SVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLL
            280       290       300       310       320       330  

             570       580       590       600       610       620 
pF1KA0 FVCGGFDGSHAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLN
       .. :: ::  . . ::.:::: : :.....:.  : :::. .:.. .:.::: ::.  : 
CCDS82 YAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLA
            340       350       360       370       380       390  

             630       640                
pF1KA0 TVEVYNLESNEWSPYTKIFQF              
       .:: ::  ...:.                      
CCDS82 SVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
            400       410       420       

>>CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1              (568 aa)
 initn: 1174 init1: 462 opt: 585  Z-score: 658.7  bits: 131.9 E(32554): 2.3e-30
Smith-Waterman score: 833; 28.1% identity (57.0% similar) in 630 aa overlap (16-639:17-553)

                10        20        30        40        50         
pF1KA0  MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFE
                       .: . ..:.::::. .::: :.:  ... ::: ::: :: :.  
CCDS14 MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACSDYFCA
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA0 IFNSDSDPHGISHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQ
       .:.:. . .:  .: .. :.  ..:.::...::  ...  : :...  ::  :..  :::
CCDS14 MFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQ
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA0 VCGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLE
       .: ..: :..: ..:.. :.::   .   :.. .... :.:. .. ..:::. : . ..:
CCDS14 ACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQGEVE
              130       140       150       160       170       180

     180        190       200       210       220       230        
pF1KA0 VMLE-DNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLD
        ... :.. . :.  ..  :::::...  :  .:: .:.                     
CCDS14 KLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLL---------------------
              190       200       210                              

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 GQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTS
                    :.: . :                       . .:..   .. .:   
CCDS14 -------------QYV-RMP-----------------------LLTPRYITDVIDAEPFI
                  220                               230       240  

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA0 NNTYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPKLSKSLSFEMQQDELIEKPMSPMQYAR
         .  :  ..:    .  .: :          :.: .    .::         .:   ::
CCDS14 RCSLQCRDLVDE---AKKFHLR----------PELRS----QMQ---------GPRTRAR
            250          260                              270      

      360       370       380        390       400       410       
pF1KA0 SGLGTAEMNGKLIAAGGYNREEC-LRTVECYNPHTDHWSFLAPMRTPRARFQMAV-LMGQ
         ::. :.   :...::.. ..  . .:: :.:.:..:::: :  : . :.  .: :  .
CCDS14 --LGANEV---LLVVGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFL-PSITRKRRYVASVSLHDR
          280          290       300       310        320       330

        420       430       440          450       460       470   
pF1KA0 LYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDSNIDD---WIPVPELRTNRCNAGVCALNGKLYIVGGSDP
       .::.:: .:.:  ::  :  : . :.   :  :  . . :  ::. .:.  .:. :: : 
CCDS14 IYVIGGYDGRSR-LSSVECLDYTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFD-
              340        350       360       370       380         

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pF1KA0 YGQKGLKNCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYN
        :..   . . .::    :.  . ..  :. ...   .: .: .:: .. : ::.::.:.
CCDS14 -GSRRHTSMERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYD
       390       400       410       420       430       440       

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pF1KA0 PENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLNGKLFVCGGFDGSHAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMT
       :... :: ..:: . : :::::.:: ...: :::::.  .: :: :.   . :  . .::
CCDS14 PHTGHWTNVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMT
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pF1KA0 SPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYTKIFQF           
       .::  .: ... . .::..:.::: .:...: :.   . :   :..              
CCDS14 TPRCYVGATVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLRE
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CCDS14 K
        

>>CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4              (496 aa)
 initn: 470 init1: 368 opt: 584  Z-score: 658.5  bits: 131.7 E(32554): 2.3e-30
Smith-Waterman score: 696; 29.1% identity (55.7% similar) in 530 aa overlap (108-634:35-474)

        80        90       100       110       120       130       
pF1KA0 LNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVTSCISY
                                     ::  :... ::..: ..: :..  ..:.. 
CCDS82 WQKTWKFLLIEWCWPPVVLIFMPCLQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGI
           10        20        30        40        50        60    

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pF1KA0 RNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLE-DNVCLPSNGKLYT
       : ::.  . . ::::...: ..:. ..   ::::.:   ..  ..  :.. . :. :.. 
CCDS82 RAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFE
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pF1KA0 KVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQK
        :: ::...     . . .:::.:.         ::  . :             .: :..
CCDS82 AVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRL-------PLLPREYL-------------VQRVEE
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pF1KA0 KPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGIFCVIF
       .   .:        :..:    .  ... :.  ... .:.                  :.
CCDS82 EALVKN--------SSAC---KDYLIEAMKY--HLLPTEQR-----------------IL
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pF1KA0 LHGRNSPQSSPTSTPKLSKSLSFEMQQDELIEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGKLIAAGGY
       ...  .   .: . :::                                    ....:: 
CCDS82 MKSVRTRLRTPMNLPKL------------------------------------MVVVGG-
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pF1KA0 NREECLRTVECYNPHTDHWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMY
       .  . .:.::::. . ..:  .: . . : :  :. . : ...::: :: :  .   . :
CCDS82 QAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNG-SLRVRTVDSY
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pF1KA0 DSNIDDWIPVPELRTNRCNAGVCALNGKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKLWTSCA
       :   :.:  : ..:  : . :. .::: :: ::: :  :. ::.. ....  .. :   :
CCDS82 DPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFD--GSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVA
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pF1KA0 PLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAE--SWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGV
       :.: :: . .:  .:: :: .:: .  : .::.::: ::  .: :: :: :.. : ::::
CCDS82 PMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGV
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pF1KA0 AVLNGKLFVCGGFDGSHAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGF
       .:::. :.. :: ::  . . ::.:::: : :.....:.  : :::. .:.. .:.::: 
CCDS82 GVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGD
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pF1KA0 DGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYTKIFQF              
       ::.  : .:: ::  ...:.                      
CCDS82 DGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
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>>CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4              (505 aa)
 initn: 470 init1: 368 opt: 584  Z-score: 658.4  bits: 131.7 E(32554): 2.4e-30
Smith-Waterman score: 750; 28.5% identity (57.0% similar) in 565 aa overlap (73-634:9-483)

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CCDS54                       MSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENV
                                     10        20        30        

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pF1KA0 KDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLL
       . .  ::  :... ::..: ..: :..  ..:.. : ::.  . . ::::...: ..:. 
CCDS54 QVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFA
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pF1KA0 QISEEEEFLKLPRLKLEVMLE-DNVCLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQ
       ..   ::::.:   ..  ..  :.. . :. :..  :: ::...     . . .:::.:.
CCDS54 DVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVR
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                ::  . :             .: :...         . ..:..:    .  
CCDS54 L-------PLLPREYL-------------VQRVEEE--------ALVKNSSAC---KDYL
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pF1KA0 VQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGIFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPKLSKSLSFEM
       ... :..  .. .:.                  :....  .   .: . :::        
CCDS54 IEAMKYH--LLPTEQR-----------------ILMKSVRTRLRTPMNLPKL--------
       190         200                        210       220        

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pF1KA0 QQDELIEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGKLIAAGGYNREECLRTVECYNPHTDHWSFLAPM
                                   ....::    . .:.::::. . ..:  .: .
CCDS54 ----------------------------MVVVGGQA-PKAIRSVECYDFKEERWHQVAEL
                                           230       240       250 

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pF1KA0 RTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDSNIDDWIPVPELRTNRCNAGVCAL
        . : :  :. . : ...::: :: :  .   . ::   :.:  : ..:  : . :. .:
CCDS54 PSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNG-SLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVL
             260       270        280       290       300       310

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pF1KA0 NGKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKLWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAE
       :: :: ::: :  :. ::.. ....  .. :   ::.: :: . .:  .:: :: .:: .
CCDS54 NGLLYAVGGFD--GSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYD
              320         330       340       350       360        

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         : .::.::: ::  .: :: :: :.. : ::::.:::. :.. :: ::  . . ::.:
CCDS54 GASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVY
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       ::: : :.....:.  : :::. .:.. .:.::: ::.  : .:: ::  ...:.     
CCDS54 DPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSC
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CCDS54 MSTGRSYAGVTVIDKPL
      490       500     




642 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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