Result of FASTA (omim) for pFN21AA0560
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0560, 1485 aa
  1>>>pF1KA0560 1485 - 1485 aa - 1485 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9750+/-0.000521; mu= 15.1712+/- 0.032
 mean_var=108.5748+/-21.370, 0's: 0 Z-trim(109.9): 33  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.123086
 statistics sampled from 18162 (18186) to 18162 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.549), E-opt: 0.2 (0.213), width:  16
 Scan time: 12.380

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055506 (OMIM: 610548) intron-binding protein aq (1485) 9917 1773.4       0
NP_002902 (OMIM: 601430) regulator of nonsense tra (1118)  324 69.9 1.3e-10
XP_016882595 (OMIM: 601430) PREDICTED: regulator o (1126)  324 69.9 1.3e-10
NP_001284478 (OMIM: 601430) regulator of nonsense  (1129)  324 69.9 1.3e-10
XP_016882594 (OMIM: 601430) PREDICTED: regulator o (1137)  324 69.9 1.3e-10
XP_016869985 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTE ( 857)  312 67.7 4.6e-10
XP_011516706 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTE (2706)  312 67.9 1.2e-09
XP_005272229 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTE (2706)  312 67.9 1.2e-09
XP_005272228 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTE (2706)  312 67.9 1.2e-09
XP_011516707 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTE (2706)  312 67.9 1.2e-09
XP_005272230 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTE (2706)  312 67.9 1.2e-09
XP_016869986 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTE ( 828)  284 62.7 1.4e-08
XP_016869984 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTE (2677)  284 62.9 3.8e-08
NP_055861 (OMIM: 602433,606002,608465) probable he (2677)  284 62.9 3.8e-08
XP_011516708 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTE (2413)  238 54.8   1e-05


>>NP_055506 (OMIM: 610548) intron-binding protein aquari  (1485 aa)
 initn: 9917 init1: 9917 opt: 9917  Z-score: 9515.9  bits: 1773.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 9917; 100.0% identity (100.0% similar) in 1485 aa overlap (1-1485:1-1485)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAAPAQPKKIVAPTVSQINAEFVTQLACKYWAPHIKKKSPFDIKVIEDIYEKEIVKSRFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MAAPAQPKKIVAPTVSQINAEFVTQLACKYWAPHIKKKSPFDIKVIEDIYEKEIVKSRFA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 IRKIMLLEFSQYLENYLWMNYSPEVSSKAYLMSICCMVNEKFRENVPAWEIFKKKPDHFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IRKIMLLEFSQYLENYLWMNYSPEVSSKAYLMSICCMVNEKFRENVPAWEIFKKKPDHFP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 FFFKHILKAALAETDGEFSLHEQTVLLLFLDHCFNSLEVDLIRSQVQQLISLPMWMGLQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FFFKHILKAALAETDGEFSLHEQTVLLLFLDHCFNSLEVDLIRSQVQQLISLPMWMGLQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 ARLELELKKTPKLRKFWNLIKKNDEKMDPEAREQAYQERRFLSQLIQKFISVLKSVPLSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ARLELELKKTPKLRKFWNLIKKNDEKMDPEAREQAYQERRFLSQLIQKFISVLKSVPLSE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 PVTMDKVHYCERFIELMIDLEALLPTRRWFNTILDDSHLLVHCYLSNLVRREEDGHLFSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVTMDKVHYCERFIELMIDLEALLPTRRWFNTILDDSHLLVHCYLSNLVRREEDGHLFSQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 LLDMLKFYTGFEINDQTGNALTENEMTTIHYDRITSLQRAAFAHFPELYDFALSNVAEVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLDMLKFYTGFEINDQTGNALTENEMTTIHYDRITSLQRAAFAHFPELYDFALSNVAEVD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 TRESLVKFFGPLSSNTLHQVASYLCLLPTLPKNEDTTFDKEFLLELLVSRHERRISQIQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TRESLVKFFGPLSSNTLHQVASYLCLLPTLPKNEDTTFDKEFLLELLVSRHERRISQIQQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 LNQMPLYPTEKIIWDENIVPTEYYSGEGCLALPKLNLQFLTLHDYLLRNFNLFRLESTYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LNQMPLYPTEKIIWDENIVPTEYYSGEGCLALPKLNLQFLTLHDYLLRNFNLFRLESTYE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 IRQDIEDSVSRMKPWQSEYGGVVFGGWARMAQPIVAFTVVEVAKPNIGENWPTRVRADVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IRQDIEDSVSRMKPWQSEYGGVVFGGWARMAQPIVAFTVVEVAKPNIGENWPTRVRADVT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 INLNVRDHIKDEWEGLRKHDVCFLITVRPTKPYGTKFDRRRPFIEQVGLVYVRGCEIQGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 INLNVRDHIKDEWEGLRKHDVCFLITVRPTKPYGTKFDRRRPFIEQVGLVYVRGCEIQGM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 LDDKGRVIEDGPEPRPNLRGESRTFRVFLDPNQYQQDMTNTIQNGAEDVYETFNIIMRRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LDDKGRVIEDGPEPRPNLRGESRTFRVFLDPNQYQQDMTNTIQNGAEDVYETFNIIMRRK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 PKENNFKAVLETIRNLMNTDCVVPDWLHDIILGYGDPSSAHYSKMPNQIATLDFNDTFLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PKENNFKAVLETIRNLMNTDCVVPDWLHDIILGYGDPSSAHYSKMPNQIATLDFNDTFLS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 IEHLKASFPGHNVKVTVEDPALQIPPFRITFPVRSGKGKKRKDADVEDEDTEEAKTLIVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IEHLKASFPGHNVKVTVEDPALQIPPFRITFPVRSGKGKKRKDADVEDEDTEEAKTLIVE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 PHVIPNRGPYPYNQPKRNTIQFTHTQIEAIRAGMQPGLTMVVGPPGTGKTDVAVQIISNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PHVIPNRGPYPYNQPKRNTIQFTHTQIEAIRAGMQPGLTMVVGPPGTGKTDVAVQIISNI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 YHNFPEQRTLIVTHSNQALNQLFEKIMALDIDERHLLRLGHGEEELETEKDFSRYGRVNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YHNFPEQRTLIVTHSNQALNQLFEKIMALDIDERHLLRLGHGEEELETEKDFSRYGRVNY
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 VLARRIELLEEVKRLQKSLGVPGDASYTCETAGYFFLYQVMSRWEEYISKVKNKGSTLPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VLARRIELLEEVKRLQKSLGVPGDASYTCETAGYFFLYQVMSRWEEYISKVKNKGSTLPD
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 VTEVSTFFPFHEYFANAPQPIFKGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VTEVSTFFPFHEYFANAPQPIFKGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 LDRSKYLLVKEAKIIAMTCTHAALKRHDLVKLGFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LDRSKYLLVKEAKIIAMTCTHAALKRHDLVKLGFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQN
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 PQDGFSRLKRWIMIGDHHQLPPVIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRVGVPTVDLDAQGRAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PQDGFSRLKRWIMIGDHHQLPPVIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRVGVPTVDLDAQGRAR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 ASLCNLYNWRYKNLGNLPHVQLLPEFSTANAGLLYDFQLINVEDFQGVGESEPNPYFYQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASLCNLYNWRYKNLGNLPHVQLLPEFSTANAGLLYDFQLINVEDFQGVGESEPNPYFYQN
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 LGEAEYVVALFMYMCLLGYPADKISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGNNPLIGRPNKVTTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LGEAEYVVALFMYMCLLGYPADKISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGNNPLIGRPNKVTTV
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 DRFQGQQNDYILLSLVRTRAVGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYIFARVSLFQNCFELTPAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DRFQGQQNDYILLSLVRTRAVGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYIFARVSLFQNCFELTPAF
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 SQLTARPLHLHIIPTEPFPTTRKNGERPSHEVQIIKNMPQMANFVYNMYMHLIQTTHHYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SQLTARPLHLHIIPTEPFPTTRKNGERPSHEVQIIKNMPQMANFVYNMYMHLIQTTHHYH
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 QTLLQLPPAMVEEGEEVQNQETELETEEEAMTVQADIIPSPTDTSCRQETPAFQTDTTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QTLLQLPPAMVEEGEEVQNQETELETEEEAMTVQADIIPSPTDTSCRQETPAFQTDTTPS
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480     
pF1KA0 ETGATSTPEAIPALSETTPTVVGAVSAPAEANTPQDATSAPEETK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ETGATSTPEAIPALSETTPTVVGAVSAPAEANTPQDATSAPEETK
             1450      1460      1470      1480     

>>NP_002902 (OMIM: 601430) regulator of nonsense transcr  (1118 aa)
 initn: 269 init1: 133 opt: 324  Z-score: 311.4  bits: 69.9 E(85289): 1.3e-10
Smith-Waterman score: 354; 24.2% identity (52.4% similar) in 492 aa overlap (1013-1481:590-1048)

            990      1000      1010      1020       1030      1040 
pF1KA0 KGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSGLDRS-KYLLVKEAKIIAMTCTH
                                     :.:    .: :. .  :. .: .:  ::. 
NP_002 ALHNQIRNMDSMPELQKLQQLKDETGELSSADEKRYRALKRTAERELLMNADVICCTCVG
     560       570       580       590       600       610         

            1050      1060      1070      1080      1090      1100 
pF1KA0 AALKRHDLVKLGFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQNPQDGFSRLKRWIMIGDHHQLP
       :.  :  :.:. :.  .::..:..:  : : ..:..:          :. :..::: :: 
NP_002 AGDPR--LAKMQFR--SILIDESTQATEPECMVPVVLGA--------KQLILVGDHCQLG
     620         630         640       650               660       

            1110      1120      1130      1140       1150      1160
pF1KA0 PVIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRVGVPTVDLDAQGRARASLCNL-YNWRYKNLGNLPHV
       ::.      : ... :::: :.: .:.  . :..: : . .:  .  :  :.  :.: . 
NP_002 PVVMCKKAAK-AGLSQSLFERLVVLGIRPIRLQVQYRMHPALSAFPSNIFYE--GSLQN-
       670        680       690       700       710         720    

             1170      1180            1190      1200      1210    
pF1KA0 QLLPEFSTANAGLLYDFQLINVED--F----QGVGESEPNPYFYQNLGEAEYVVALFMYM
         .   . .. :  .:::  . .   :    ::  :   .   : :  ::  :  .   .
NP_002 -GVTAADRVKKG--FDFQWPQPDKPMFFYVTQGQEEIASSGTSYLNRTEAANVEKITTKL
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pF1KA0 CLLGYPADKISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGNNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQNDYILLS
          :   :.:.:.: :.::.  . . ..   . .  . .  ....:: :::...:.:.::
NP_002 LKAGAKPDQIGIITPYEGQRSYLVQYMQFSGSLHTKLYQEVEIASVDAFQGREKDFIILS
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pF1KA0 LVRT---RAVGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYIFARVSLFQNCFELTPAFSQLTARPLHLH
        ::.   ...: : : ::: ::..::: :. : .  . ...     : ...:     . .
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pF1KA0 IIPTEPFPTTRKNGERPSHEVQIIKNMPQMANFVYNMYMHLIQTTHHYHQTLLQLPPAMV
       ..   :. . :..  . :.  ......   : :.         ::  :      .: .. 
NP_002 VLVEGPLNNLRESLMQFSKPRKLVNTINPGARFM---------TTAMYDAREAIIPGSVY
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pF1KA0 EEGEEVQNQETELETEEEAMTVQADI-------IPSPTDTSCRQETPAFQTDTTPSETGA
       ... . . .   ..:...   ..:         :: : .       :      . . ...
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pF1KA0 TSTPEAIPALSETTPTVVGAVSAPAEANTP-----QDATSAPEETK              
        .::..  . .    .  : . .:...: :     ::..: :                  
NP_002 RGTPKGKTGRGGRQKNRFG-LPGPSQTNLPNSQASQDVASQPFSQGALTQGYISMSQPSQ
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>>XP_016882595 (OMIM: 601430) PREDICTED: regulator of no  (1126 aa)
 initn: 269 init1: 133 opt: 324  Z-score: 311.4  bits: 69.9 E(85289): 1.3e-10
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                                     :.:    .: :. .  :. .: .:  ::. 
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       :.  :  :.:. :.  .::..:..:  : : ..:..:          :. :..::: :: 
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pF1KA0 PVIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRVGVPTVDLDAQGRARASLCNL-YNWRYKNLGNLPHV
       ::.      : ... :::: :.: .:.  . :..: : . .:  .  :  :.  :.: . 
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         .   . .. :  .:::  . .   :    ::  :   .   : :  ::  :  .   .
XP_016 -GVTAADRVKKG--FDFQWPQPDKPMFFYVTQGQEEIASSGTSYLNRTEAANVEKITTKL
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pF1KA0 CLLGYPADKISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGNNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQNDYILLS
          :   :.:.:.: :.::.  . . ..   . .  . .  ....:: :::...:.:.::
XP_016 LKAGAKPDQIGIITPYEGQRSYLVQYMQFSGSLHTKLYQEVEIASVDAFQGREKDFIILS
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pF1KA0 LVRT---RAVGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYIFARVSLFQNCFELTPAFSQLTARPLHLH
        ::.   ...: : : ::: ::..::: :. : .  . ...     : ...:     . .
XP_016 CVRANEHQGIGFLNDPRRLNVALTRARYGVIIVGNPKALSK----QPLWNHLLNYYKEQK
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pF1KA0 IIPTEPFPTTRKNGERPSHEVQIIKNMPQMANFVYNMYMHLIQTTHHYHQTLLQLPPAMV
       ..   :. . :..  . :.  ......   : :.         ::  :      .: .. 
XP_016 VLVEGPLNNLRESLMQFSKPRKLVNTINPGARFM---------TTAMYDAREAIIPGSVY
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pF1KA0 EEGEEVQNQETELETEEEAMTVQADI-------IPSPTDTSCRQETPAFQTDTTPSETGA
       ... . . .   ..:...   ..:         :: : .       :      . . ...
XP_016 DRSSQGRPSSMYFQTHDQIGMISAGPSHVAAMNIPIPFNLVMPPMPPPGYFGQANGPAAG
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pF1KA0 TSTPEAIPALSETTPTVVGAVSAPAEANTP-----QDATSAPEETK              
        .::..  . .    .  : . .:...: :     ::..: :                  
XP_016 RGTPKGKTGRGGRQKNRFG-LPGPSQTNLPNSQASQDVASQPFSQGALTQGYISMSQPSQ
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XP_016 MSQPGLSQPELSQDSYLGDEFKSQIDVALSQDSTYQGERAYQHGGVTGLSQY
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>>NP_001284478 (OMIM: 601430) regulator of nonsense tran  (1129 aa)
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pF1KA0 KGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSGLDRS-KYLLVKEAKIIAMTCTH
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NP_001 ALHNQIRNMDSMPELQKLQQLKDETGELSSADEKRYRALKRTAERELLMNADVICCTCVG
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pF1KA0 AALKRHDLVKLGFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQNPQDGFSRLKRWIMIGDHHQLP
       :.  :  :.:. :.  .::..:..:  : : ..:..:          :. :..::: :: 
NP_001 AGDPR--LAKMQFR--SILIDESTQATEPECMVPVVLGA--------KQLILVGDHCQLG
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pF1KA0 PVIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRVGVPTVDLDAQGRARASLCNL-YNWRYKNLGNLPHV
       ::.      : ... :::: :.: .:.  . :..: : . .:  .  :  :.  :.: . 
NP_001 PVVMCKKAAK-AGLSQSLFERLVVLGIRPIRLQVQYRMHPALSAFPSNIFYE--GSLQN-
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pF1KA0 QLLPEFSTANAGLLYDFQLINVED--F----QGVGESEPNPYFYQNLGEAEYVVALFMYM
         .   . .. :  .:::  . .   :    ::  :   .   : :  ::  :  .   .
NP_001 -GVTAADRVKKG--FDFQWPQPDKPMFFYVTQGQEEIASSGTSYLNRTEAANVEKITTKL
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pF1KA0 CLLGYPADKISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGNNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQNDYILLS
          :   :.:.:.: :.::.  . . ..   . .  . .  ....:: :::...:.:.::
NP_001 LKAGAKPDQIGIITPYEGQRSYLVQYMQFSGSLHTKLYQEVEIASVDAFQGREKDFIILS
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pF1KA0 LVRT---RAVGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYIFARVSLFQNCFELTPAFSQLTARPLHLH
        ::.   ...: : : ::: ::..::: :. : .  . ...     : ...:     . .
NP_001 CVRANEHQGIGFLNDPRRLNVALTRARYGVIIVGNPKALSK----QPLWNHLLNYYKEQK
             860       870       880       890           900       

            1340      1350      1360      1370      1380      1390 
pF1KA0 IIPTEPFPTTRKNGERPSHEVQIIKNMPQMANFVYNMYMHLIQTTHHYHQTLLQLPPAMV
       ..   :. . :..  . :.  ......   : :.         ::  :      .: .. 
NP_001 VLVEGPLNNLRESLMQFSKPRKLVNTINPGARFM---------TTAMYDAREAIIPGSVY
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pF1KA0 EEGEEVQNQETELETEEEAMTVQADI-------IPSPTDTSCRQETPAFQTDTTPSETGA
       ... . . .   ..:...   ..:         :: : .       :      . . ...
NP_001 DRSSQGRPSSMYFQTHDQIGMISAGPSHVAAMNIPIPFNLVMPPMPPPGYFGQANGPAAG
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pF1KA0 TSTPEAIPALSETTPTVVGAVSAPAEANTP-----QDATSAPEETK              
        .::..  . .    .  : . .:...: :     ::..: :                  
NP_001 RGTPKGKTGRGGRQKNRFG-LPGPSQTNLPNSQASQDVASQPFSQGALTQGYISMSQPSQ
     1020      1030       1040      1050      1060      1070       

NP_001 MSQPGLSQPELSQDSYLGDEFKSQIDVALSQDSTYQGERAYQHGGVTGLSQY
      1080      1090      1100      1110      1120         

>>XP_016882594 (OMIM: 601430) PREDICTED: regulator of no  (1137 aa)
 initn: 269 init1: 133 opt: 324  Z-score: 311.3  bits: 69.9 E(85289): 1.3e-10
Smith-Waterman score: 354; 24.2% identity (52.4% similar) in 492 aa overlap (1013-1481:609-1067)

            990      1000      1010      1020       1030      1040 
pF1KA0 KGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSGLDRS-KYLLVKEAKIIAMTCTH
                                     :.:    .: :. .  :. .: .:  ::. 
XP_016 ALHNQIRNMDSMPELQKLQQLKDETGELSSADEKRYRALKRTAERELLMNADVICCTCVG
      580       590       600       610       620       630        

            1050      1060      1070      1080      1090      1100 
pF1KA0 AALKRHDLVKLGFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQNPQDGFSRLKRWIMIGDHHQLP
       :.  :  :.:. :.  .::..:..:  : : ..:..:          :. :..::: :: 
XP_016 AGDPR--LAKMQFR--SILIDESTQATEPECMVPVVLGA--------KQLILVGDHCQLG
      640         650         660       670               680      

            1110      1120      1130      1140       1150      1160
pF1KA0 PVIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRVGVPTVDLDAQGRARASLCNL-YNWRYKNLGNLPHV
       ::.      : ... :::: :.: .:.  . :..: : . .:  .  :  :.  :.: . 
XP_016 PVVMCKKAAK-AGLSQSLFERLVVLGIRPIRLQVQYRMHPALSAFPSNIFYE--GSLQN-
        690        700       710       720       730         740   

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pF1KA0 QLLPEFSTANAGLLYDFQLINVED--F----QGVGESEPNPYFYQNLGEAEYVVALFMYM
         .   . .. :  .:::  . .   :    ::  :   .   : :  ::  :  .   .
XP_016 -GVTAADRVKKG--FDFQWPQPDKPMFFYVTQGQEEIASSGTSYLNRTEAANVEKITTKL
             750         760       770       780       790         

         1220      1230      1240      1250      1260      1270    
pF1KA0 CLLGYPADKISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGNNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQNDYILLS
          :   :.:.:.: :.::.  . . ..   . .  . .  ....:: :::...:.:.::
XP_016 LKAGAKPDQIGIITPYEGQRSYLVQYMQFSGSLHTKLYQEVEIASVDAFQGREKDFIILS
     800       810       820       830       840       850         

            1280      1290      1300      1310      1320      1330 
pF1KA0 LVRT---RAVGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYIFARVSLFQNCFELTPAFSQLTARPLHLH
        ::.   ...: : : ::: ::..::: :. : .  . ...     : ...:     . .
XP_016 CVRANEHQGIGFLNDPRRLNVALTRARYGVIIVGNPKALSK----QPLWNHLLNYYKEQK
     860       870       880       890       900           910     

            1340      1350      1360      1370      1380      1390 
pF1KA0 IIPTEPFPTTRKNGERPSHEVQIIKNMPQMANFVYNMYMHLIQTTHHYHQTLLQLPPAMV
       ..   :. . :..  . :.  ......   : :.         ::  :      .: .. 
XP_016 VLVEGPLNNLRESLMQFSKPRKLVNTINPGARFM---------TTAMYDAREAIIPGSVY
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            1400      1410             1420      1430      1440    
pF1KA0 EEGEEVQNQETELETEEEAMTVQADI-------IPSPTDTSCRQETPAFQTDTTPSETGA
       ... . . .   ..:...   ..:         :: : .       :      . . ...
XP_016 DRSSQGRPSSMYFQTHDQIGMISAGPSHVAAMNIPIPFNLVMPPMPPPGYFGQANGPAAG
        970       980       990      1000      1010      1020      

         1450      1460      1470           1480                   
pF1KA0 TSTPEAIPALSETTPTVVGAVSAPAEANTP-----QDATSAPEETK              
        .::..  . .    .  : . .:...: :     ::..: :                  
XP_016 RGTPKGKTGRGGRQKNRFG-LPGPSQTNLPNSQASQDVASQPFSQGALTQGYISMSQPSQ
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XP_016 MSQPGLSQPELSQDSYLGDEFKSQIDVALSQDSTYQGERAYQHGGVTGLSQY
        1090      1100      1110      1120      1130       

>>XP_016869985 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTED: p  (857 aa)
 initn: 214 init1:  75 opt: 312  Z-score: 301.7  bits: 67.7 E(85289): 4.6e-10
Smith-Waterman score: 331; 21.4% identity (51.5% similar) in 681 aa overlap (792-1424:85-695)

             770       780       790       800       810       820 
pF1KA0 KDADVEDEDTEEAKTLIVEPHVIPNRGPYPYNQPKRNTIQFTHTQIEAIRAGMQPGLTMV
                                     .:. ....:. ......  ..     . ..
XP_016 RAVLNPNPMDFCTKDLLTTTSERIIAYLRDFNEDQKKAIETAYAMVK--HSPSVAKICLI
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pF1KA0 VGPPGTGKTDVAVQIISNIY-------HN-------FPEQRTLIVTHSNQALNQLFEKIM
        :::::::. . : ..  .        :.       . ..:.:. . :: :...:..::.
XP_016 HGPPGTGKSKTIVGLLYRLLTENQRKGHSDENSNAKIKQNRVLVCAPSNAAVDELMKKII
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pF1KA0 ALDIDERHLLRLGHGEEELETEKDFSRYGRVNYVLARRIELLEEVKRLQKSLGVPGDASY
                  :   :.  . .. ..  : .: :                 :: : . : 
XP_016 -----------LEFKEKCKDKKNPLGNCGDINLV----------------RLG-P-EKSI
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pF1KA0 TCETAGYFFLYQVMSRWEEYISKVKNKGSTLPDVTEVSTFFPFHEYFANAPQPIFKGRSY
       . :.  . .  ::  : .      :.  : .  . . . :. ..    .  . . .:   
XP_016 NSEVLKFSLDSQVNHRMK------KELPSHVQAMHKRKEFLDYQLDELSRQRALCRGGRE
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pF1KA0 EEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASEL--LRSGLDRSKYLLVKEAKIIAMT-CTHAAL
        . .:. :    .:.:.  . .:. ::..  ...  .... ... :..::  :  : ..:
XP_016 IQRQELDE----NISKVSKERQEL-ASKIKEVQGRPQKTQSIIILESHIICCTLSTSGGL
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pF1KA0 KRHDLVKL--GFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQNPQDGFSRLKRWIMIGDHHQLPP
         ..  .   :  .. ....::.:  ::::. ::.         : .. :..:: .::::
XP_016 LLESAFRGQGGVPFSCVIVDEAGQSCEIETLTPLI--------HRCNKLILVGDPKQLPP
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pF1KA0 VIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRV-----------GVPTVDLDAQGRARASLCNLYNWRY
       .. .:  :.:. ..::...:: :.            .: ..: .: : . ..: :.   :
XP_016 TVISMKAQEYG-YDQSMMARFCRLLEENVEHNMISRLPILQLTVQYRMHPDIC-LFPSNY
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pF1KA0 KNLGNLPHVQLLPEFSTANAGLLYDFQLINVEDFQGVGESEPNPYFYQNLGEAEYVVALF
           ::   .    .  ..    . ::   : :  : :  . .   : :. : . :. ..
XP_016 VYNRNLKTNRQTEAIRCSSD---WPFQPYLVFDV-GDGSERRDNDSYINVQEIKLVMEII
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pF1KA0 MYMCLLGYPAD--KISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGNNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQND
         .      ..  .:.:.: :..:: .:.  ....   .     : .: ::: :::.:.:
XP_016 KLIKDKRKDVSFRNIGIITHYKAQKTMIQKDLDKEFDRKG----PAEVDTVDAFQGRQKD
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pF1KA0 YILLSLVRTRAV----GHLRDVRRLVVAMSRARLGLYIFARVSLFQNCFELTPAFSQLTA
        .... ::. ..    : : ...:: :...::. .:.:....  ..          ::  
XP_016 CVIVTCVRANSIQGSIGFLASLQRLNVTITRAKYSLFILGHLRTLM----------QLLP
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pF1KA0 RPLHLHIIPTEPFPTTRK----NGERPSHEVQIIKNMPQMANFVYNM---YMH---LIQT
       : . .:.  .  :    :      .. .:  :.:..  . . .. .    : :    :  
XP_016 RSFCVHVNHSPFFSPEPKYLHWALKENQHWNQLIQDAQKRGAIIKTCDKNYRHDAVKILK
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pF1KA0 THHYHQTLLQLPPAMVEEGEEVQN--QETELETEEEAMTVQADIIPSPTDTSCRQETPAF
        .   :  :  ::... :: . :.    ..:..     .: :..  .:.:.         
XP_016 LKPVLQRSLTHPPTIAPEGSRPQGGLPSSKLDSGFAKTSVAASLYHTPSDSKEITLTVTS
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pF1KA0 QTDTTPSETGATSTPEAIPALSETTPTVVGAVSAPAEANTPQDATSAPEETK        
                                                                   
XP_016 KDPERPPVHDQLQDPRLLKRMGIEVKGGIFLWDPQPSSPQHPGATPPTGEPGFPVVHQDL
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>>XP_011516706 (OMIM: 602433,606002,608465) PREDICTED: p  (2706 aa)
 initn: 214 init1:  75 opt: 312  Z-score: 294.0  bits: 67.9 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 331; 21.4% identity (51.5% similar) in 681 aa overlap (792-1424:1934-2544)

             770       780       790       800       810       820 
pF1KA0 KDADVEDEDTEEAKTLIVEPHVIPNRGPYPYNQPKRNTIQFTHTQIEAIRAGMQPGLTMV
                                     .:. ....:. ......  ..     . ..
XP_011 RAVLNPNPMDFCTKDLLTTTSERIIAYLRDFNEDQKKAIETAYAMVK--HSPSVAKICLI
          1910      1920      1930      1940      1950        1960 

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pF1KA0 VGPPGTGKTDVAVQIISNIY-------HN-------FPEQRTLIVTHSNQALNQLFEKIM
        :::::::. . : ..  .        :.       . ..:.:. . :: :...:..::.
XP_011 HGPPGTGKSKTIVGLLYRLLTENQRKGHSDENSNAKIKQNRVLVCAPSNAAVDELMKKII
            1970      1980      1990      2000      2010      2020 

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pF1KA0 ALDIDERHLLRLGHGEEELETEKDFSRYGRVNYVLARRIELLEEVKRLQKSLGVPGDASY
                  :   :.  . .. ..  : .: :                 :: : . : 
XP_011 -----------LEFKEKCKDKKNPLGNCGDINLV----------------RLG-P-EKSI
                       2030      2040                        2050  

       930       940       950       960       970       980       
pF1KA0 TCETAGYFFLYQVMSRWEEYISKVKNKGSTLPDVTEVSTFFPFHEYFANAPQPIFKGRSY
       . :.  . .  ::  : .      :.  : .  . . . :. ..    .  . . .:   
XP_011 NSEVLKFSLDSQVNHRMK------KELPSHVQAMHKRKEFLDYQLDELSRQRALCRGGRE
           2060      2070            2080      2090      2100      

       990      1000      1010        1020      1030       1040    
pF1KA0 EEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASEL--LRSGLDRSKYLLVKEAKIIAMT-CTHAAL
        . .:. :    .:.:.  . .:. ::..  ...  .... ... :..::  :  : ..:
XP_011 IQRQELDE----NISKVSKERQEL-ASKIKEVQGRPQKTQSIIILESHIICCTLSTSGGL
       2110          2120       2130      2140      2150      2160 

         1050        1060      1070      1080      1090      1100  
pF1KA0 KRHDLVKL--GFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQNPQDGFSRLKRWIMIGDHHQLPP
         ..  .   :  .. ....::.:  ::::. ::.         : .. :..:: .::::
XP_011 LLESAFRGQGGVPFSCVIVDEAGQSCEIETLTPLI--------HRCNKLILVGDPKQLPP
            2170      2180      2190              2200      2210   

           1110      1120                 1130      1140      1150 
pF1KA0 VIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRV-----------GVPTVDLDAQGRARASLCNLYNWRY
       .. .:  :.:. ..::...:: :.            .: ..: .: : . ..: :.   :
XP_011 TVISMKAQEYG-YDQSMMARFCRLLEENVEHNMISRLPILQLTVQYRMHPDIC-LFPSNY
          2220       2230      2240      2250      2260       2270 

            1160      1170      1180      1190      1200      1210 
pF1KA0 KNLGNLPHVQLLPEFSTANAGLLYDFQLINVEDFQGVGESEPNPYFYQNLGEAEYVVALF
           ::   .    .  ..    . ::   : :  : :  . .   : :. : . :. ..
XP_011 VYNRNLKTNRQTEAIRCSSD---WPFQPYLVFDV-GDGSERRDNDSYINVQEIKLVMEII
            2280      2290         2300       2310      2320       

            1220        1230      1240      1250      1260         
pF1KA0 MYMCLLGYPAD--KISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGNNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQND
         .      ..  .:.:.: :..:: .:.  ....   .     : .: ::: :::.:.:
XP_011 KLIKDKRKDVSFRNIGIITHYKAQKTMIQKDLDKEFDRKG----PAEVDTVDAFQGRQKD
      2330      2340      2350      2360          2370      2380   

    1270      1280          1290      1300      1310      1320     
pF1KA0 YILLSLVRTRAV----GHLRDVRRLVVAMSRARLGLYIFARVSLFQNCFELTPAFSQLTA
        .... ::. ..    : : ...:: :...::. .:.:....  ..          ::  
XP_011 CVIVTCVRANSIQGSIGFLASLQRLNVTITRAKYSLFILGHLRTLM----------QLLP
          2390      2400      2410      2420                2430   

        1330      1340          1350      1360         1370        
pF1KA0 RPLHLHIIPTEPFPTTRK----NGERPSHEVQIIKNMPQMANFVYNM---YMH---LIQT
       : . .:.  .  :    :      .. .:  :.:..  . . .. .    : :    :  
XP_011 RSFCVHVNHSPFFSPEPKYLHWALKENQHWNQLIQDAQKRGAIIKTCDKNYRHDAVKILK
          2440      2450      2460      2470      2480      2490   

        1380      1390        1400      1410      1420      1430   
pF1KA0 THHYHQTLLQLPPAMVEEGEEVQN--QETELETEEEAMTVQADIIPSPTDTSCRQETPAF
        .   :  :  ::... :: . :.    ..:..     .: :..  .:.:.         
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       . :.  . .  ::  : .      :.  : .  . . . :. ..    .  . . .:   
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        . .:. :    .:.:.  . .:. ::..  ...  .... ... :..::  :  : ..:
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         ..  .   :  .. ....::.:  ::::. ::.         : .. :..:: .::::
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       .. .:  :.:. ..::...:: :.            .: ..: .: : . ..: :.   :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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