# 0 Query: pF1KSDB0238, 1257 aa
# 1 CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257 aa)
# 2 CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253 aa)
# 3 CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248 aa)
# 4 CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192 aa)
# 5 CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 8540 100.0 1 1257
2 0 8499 99.7 1 1253
3 0 8433 99.2 1 1248
4 2.4e-105 3024 39.3 21 1186
5 4.3e-100 2908 39.0 17 1206
//
0 ( 1) MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYE-G-HHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDD-ISLKC
1 ( 1) MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYE-G-HHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDD-ISLKC
2 ( 1) MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYE-G-HHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDD-ISLKC
3 ( 1) MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEE-------LMEPPVITEQSPRRLVVFPTDD-ISLKC
4 ( 21) ..........LFLCQMISALEVPLDPK-LLEDLVQPPTITQQSPKDYIIDPREN-IVIQC
5 ( 17) .................LLLKFSKAIEIP-SSVQQVPTIIKQS-KVQVAFPFDEYFQIEC
//
0 ( 58) EASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFAS
1 ( 58) EASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFAS
2 ( 58) EASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFAS
3 ( 53) EASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFAS
4 ( 69) EAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTM--KPGTGTLIINIMSEGKAETYEGVYQCTAR
5 ( 58) EAKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDH---RIIPSNNSGTFRIP--NEGHISHFQGKYRCFAS
//
0 ( 118) NKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKIL
1 ( 118) NKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKIL
2 ( 118) NKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKIL
3 ( 113) NKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKIL
4 ( 127) NERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPIIFWMDNSFQ
5 ( 113) NKLGIAMSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELE
//
0 ( 178) HIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMID
1 ( 178) HIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMID
2 ( 178) HIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMID
3 ( 173) HIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMID
4 ( 187) RLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKVISAKSSRE
5 ( 173) HIEQDERVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQ
//
0 ( 238) RKPRLLFP---TNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHN
1 ( 238) RKPRLLFP---TNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHN
2 ( 238) RKPRLLFP---TNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHN
3 ( 233) RKPRLLFP---TNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHN
4 ( 247) RPPTFLTP---EGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLPTPIIYWAKEDGMLPKNRTVYKNFE
5 ( 233) RKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGRETKENYG
//
0 ( 295) KTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDC
1 ( 295) KTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDC
2 ( 295) KTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDC
3 ( 290) KTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDC
4 ( 304) KTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVKAAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLIC
5 ( 293) KTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLC
//
0 ( 355) QVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLL
1 ( 355) QVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLL
2 ( 355) QVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLL
3 ( 350) QVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLL
4 ( 364) RANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLL
5 ( 353) EAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPR-EISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTIL
//
0 ( 415) ANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERF
1 ( 415) ANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERF
2 ( 415) ANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERF
3 ( 410) ANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERF
4 ( 424) ANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIY
5 ( 412) ANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRY
//
0 ( 475) FPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSR
1 ( 475) FPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSR
2 ( 475) FPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSR
3 ( 470) FPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSR
4 ( 484) VLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSM
5 ( 472) HIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHM
//
0 ( 535) VTFTCQASFDPSLQPSI--TWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDG-RLVIHSLDYSDQGNYSC
1 ( 535) VTFTCQASFDPSLQPSI--TWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDG-RLVIHSLDYSDQGNYSC
2 ( 535) VTFTCQASFDPSLQPSI--TWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDG-RLVIHSLDYSDQGNYSC
3 ( 530) VTFTCQASFDPSLQPSI--TWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDG-RLVIHSLDYSDQGNYSC
4 ( 544) VSFECKVKHDHTLSLTV--LWLKDNR---ELPSDERFTVDKD-HLVVADVSDDDSGTYTC
5 ( 532) LELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCC
//
0 ( 592) VASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLHLLTQ--SQVRVSWSPAEDHNA
1 ( 592) VASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLHLLTQ--SQVRVSWSPAEDHNA
2 ( 592) VASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLHLLTQ--SQVRVSWSPAEDHNA
3 ( 587) VASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLHLLTQ--SQVRVSWSPAEDHNA
4 ( 598) VANTTLDSVSASAVLSVV-APTPTPAPVYDVPNPPFDLELTDQLDKSVQLSWTPGDDNNS
5 ( 592) SAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLS------ERQ---N--RSVRLTWEAGADHNS
//
0 ( 644) PIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPV
1 ( 644) PIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPV
2 ( 644) PIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPV
3 ( 639) PIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPV
4 ( 657) PITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFRVMAVNSIGKSLPSEA
5 ( 641) NISEYIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQP
//
0 ( 704) SETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPW
1 ( 704) SETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPW
2 ( 704) SETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPW
3 ( 699) SETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPW
4 ( 717) SEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGLQYKVSWRQKDGDDEW
5 ( 701) SDHHETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEW
//
0 ( 764) QEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIE
1 ( 764) QEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIE
2 ( 764) QEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIE
3 ( 759) QEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIE
4 ( 777) TSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHSGEDLPMVAPGNVRVN
5 ( 761) EEETVTN-HTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVD
//
0 ( 823) ILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVV-VPANTTSVI
1 ( 823) ILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVV-VPANTTSVI
2 ( 823) ILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVV-VPANTTSVI
3 ( 818) ILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVV-VPANTTSVI
4 ( 837) VVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIEKKILT-FQGSKTHGM
5 ( 820) VINSTLVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLD-GRTHPKEVNILRFSGQRNSGM
//
0 ( 882) LSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPAS-E-FTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQ
1 ( 882) LSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPAS-E-FTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQ
2 ( 882) LSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPAS-E-FTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQ
3 ( 877) LSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPAS-E-FTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQ
4 ( 896) LPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPD-RVFNTPEGVPSAPSSLKIVNPTLDSLTLEWD
5 ( 879) VPSLDAFSEFHLTVLAYNSKGAGPES-EPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWG
//
0 ( 940) PPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLS-FNLRDPELRTH-NLTDLSPHLRYRFQLQAT
1 ( 940) PPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLS-FNLRDPELRTH-NLTDLSPHLRYRFQLQAT
2 ( 940) PPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLS-FNLRDPELRTH-NLTDLSPHLRYRFQLQAT
3 ( 935) PPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLS-FNLRDPELRTH-NLTDLSPHLRYRFQLQAT
4 ( 955) PPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPL--VDLKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKFYFYAQ
5 ( 938) LPKKLNGNLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSW-HLSNLNATTKYKFYLRAC
//
0 ( 997) TKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGE
1 ( 997) TKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGE
2 ( 997) TKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGE
3 ( 992) TKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGE
4 ( 1013) TSAGSGSQITEE----AVTTVDEAG---------------------------ILPPDVGA
5 ( 997) TSQGCGKPITEESSTLG-EGSKGIGKIS---GVNLTQKTH-PIE---------VFEP---
//
0 ( 1057) EKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAG
1 ( 1057) EKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAG
2 ( 1057) EKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAG
3 ( 1052) EKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAG
4 ( 1042) GKAMAS-------------RQVDI------------------------------------
5 ( 1040) ---GAEHIVRLMTKN------WG---DND---SIFQD-------VIETRGREYAGLYD-D
//
0 ( 1117) FATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMK--DETFG
1 ( 1117) FATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMK--DETFG
2 ( 1117) FATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMK--DETFG
3 ( 1112) FATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMK--DETFG
4 ( 1053) -ATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFG
5 ( 1077) ISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVK--DETFG
//
0 ( 1175) EYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKE
1 ( 1175) EYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKE
2 ( 1175) EY----SDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKE
3 ( 1170) EY----SDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKE
4 ( 1112) EYSDAE-DHKPLKKGSRTPS-DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKE
5 ( 1135) EY----SDSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKE
//
0 ( 1235) KEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
1 ( 1235) KEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
2 ( 1231) KEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
3 ( 1226) KEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
4 ( 1170) KEPAEGNESSEAPSPVN......
5 ( 1191) KGSVESNGSSTATFPL.......
//