Multiple alignment for pF1KE9282
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE9282, 1249 aa
#  1    CCDS11631.1 BRIP1 gene_id:83990|Hs108|chr17    (1249 aa)
#  2    CCDS13531.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20    (1219 aa)
#  3    CCDS63331.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20    (1300 aa)
#  4    CCDS13530.3 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20    (1243 aa)
#  5    CCDS74751.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20    (996 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0           8292   99.9         1    1249
   2    7.5e-52     1156   31.7       104     831
   3    8e-52       1156   31.7       104     831
   4    2e-46       1115   30.9       104     855
   5    1.4e-45      867   30.2         2     608

//
                                                                             
   0  (    1)    MSSMWSEYTIGGVKIYFPYKAYPSQLAMMNSILRGLNSKQHCLLESPTGSGKSLALLCSA
   1  (    1)    MSSMWSEYTIGGVKIYFPYKAYPSQLAMMNSILRGLNSKQHCLLESPTGSGKSLALLCSA
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   61)    LAWQQSLSGKPADEGVSEKAEVQLSCCCACHSKDFTNNDMNQGTSRHFNYPSTPPSERNG
   1  (   61)    LAWQQSLSGKPADEGVSEKAEVQLSCCCACHSKDFTNNDMNQGTSRHFNYPSTPPSERNG
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  121)    TSSTCQDSPEKTTLAAKLSAKKQASIYRDENDDFQVEKKRIRPLETTQQIRKRHCFGTEV
   1  (  121)    TSSTCQDSPEKTTLAAKLSAKKQASIYRDENDDFQVEKKRIRPLETTQQIRKRHCFGTEV
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  181)    HNLDAKVDSGKTVKLNSPLEKINSFSPQKPPGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTGK
   1  (  181)    HNLDAKVDSGKTVKLNSPLEKINSFSPQKPPGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTGK
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  241)    SKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYSG-----------VP------------MTILS
   1  (  241)    SKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYSG-----------VP------------MTILS
   2  (  104)    TDIPKIIYASRTHSQLTQVINELRNTSYRP------------K------------VCVLG
   3  (  104)    TDIPKIIYASRTHSQLTQVINELRNTSYRP------------K------------VCVLG
   4  (  104)    TDIPKIIYASRTHSQLTQVINELRNTSYRSRCRATLWVLETAPPRPTVLSPTRPKVCVLG
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  278)    SRDHTCVHPEVVGNFNRNEKCMELLDGK-NGKSCYFYHGVHKISDQHTLQTFQGMCKAWD
   1  (  278)    SRDHTCVHPEVVGNFNRNEKCMELLDGK-NGKSCYFYHGVHKISDQHTLQTFQGMCKAWD
   2  (  140)    SREQLCIHPEVKKQ-ESNHLQIHLCRKKVASRSCHFYNNVEEKSLEQELAS-----PILD
   3  (  140)    SREQLCIHPEVKKQ-ESNHLQIHLCRKKVASRSCHFYNNVEEKSLEQELAS-----PILD
   4  (  164)    SREQLCIHPEVKKQ-ESNHLQIHLCRKKVASRSCHFYNNVEEKSLEQELAS-----PILD
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  337)    IEELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQVVILDEAH
   1  (  337)    IEELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQVVILDEAH
   2  (  194)    IEDLVKSGSKHRVCPYYLSRNLKQQADIIFMPYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTVVIFDEAH
   3  (  194)    IEDLVKSGSKHRVCPYYLSRNLKQQADIIFMPYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTVVIFDEAH
   4  (  218)    IEDLVKSGSKHRVCPYYLSRNLKQQADIIFMPYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTVVIFDEAH
   5  (    2)    ...............................PYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTVVIFDEAH

//
                                                                             
   0  (  397)    NIEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMVNNNIRKKDH-EPLRAVCCSLINWLEANAEY
   1  (  397)    NIEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMVNNNIRKKDH-EPLRAVCCSLINWLEANAEY
   2  (  254)    NVEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQGEPHPEFSAD-------SPSP
   3  (  254)    NVEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQGEPHPEFSAD-------SPSP
   4  (  278)    NVEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQGEPHPEFSAD-------SPSP
   5  (   31)    NVEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQGEPHPEFSA------DSPSPG

//
                                                                             
   0  (  456)    LVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIYGKEEARE
   1  (  456)    LVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIYGKEEARE
   2  (  307)    GLNMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAVELP---GDDSGVTKPGSYIFELFA-----E
   3  (  307)    GLNMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAVELP---GDDSGVTKPGSYIFELFA-----E
   4  (  331)    GLNMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAVELP---GDDSGVTKPGSYIFELFA-----E
   5  (   85)    L-NMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAVELP---GDDSGVTKPGSYIFELFA-----E

//
                                                                             
   0  (  516)    VPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRFADD---YKIA--IQQTYSWT-NQIDISDKNG
   1  (  516)    VPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRFADD---YKIA--IQQTYSWT-NQIDISDKNG
   2  (  355)    AQITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFTNTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEGSPGSPAG
   3  (  355)    AQITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFTNTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEGSPGSPAG
   4  (  379)    AQITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFTNTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEGSPGSPAG
   5  (  132)    AQITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFTNTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEGSPGSPAG

//
                                                                             
   0  (  570)    LLVLPKNK---------KRSRQKTAV----------HVLNFWCLNPAVAFSD-INGKVQT
   1  (  570)    LLVLPKNK---------KRSRQKTAV----------HVLNFWCLNPAVAFSD-INGKVQT
   2  (  415)    LGALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTTAARKRGKVLSYWCFSPGHSMHELVRQGVRS
   3  (  415)    LGALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTTAARKRGKVLSYWCFSPGHSMHELVRQGVRS
   4  (  439)    LGALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTTAARKRGKVLSYWCFSPGHSMHELVRQGVRS
   5  (  192)    LGALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTTAARKRGKVLSYWCFSPGHSMHELVRQGVRS

//
                                                                             
   0  (  610)    IVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANHIIKNSQVWVGTIGSGPKGRNLCATFQNTET
   1  (  610)    IVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANHIIKNSQVWVGTIGSGPKGRNLCATFQNTET
   2  (  475)    LILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHIIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSSAFDRRFS
   3  (  475)    LILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHIIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSSAFDRRFS
   4  (  499)    LILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHIIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSSAFDRRFS
   5  (  252)    LILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHIIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSSAFDRRFS

//
                                                                             
   0  (  670)    FEFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKERWLSTGLWHNLELVKTVIVEPQG
   1  (  670)    FEFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKERWLSTGLWHNLELVKTVIVEPQG
   2  (  535)    EECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYPVMEKSLEFWRARDLARKMEALKPLFVEPRS
   3  (  535)    EECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYPVMEKSLEFWRARDLARKMEALKPLFVEPRS
   4  (  559)    EECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYPVMEKSLEFWRARDLARKMEALKPLFVEPRS
   5  (  312)    EECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYPVMEKSLEFWRARDLARKMEALKPLFVEPRS

//
                                                                             
   0  (  730)    GEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVAVCRGKVSEGLDFSDDNARAVITIGIPFPNV
   1  (  730)    GEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVAVCRGKVSEGLDFSDDNARAVITIGIPFPNV
   2  (  595)    --KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLAVCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVTGLPYPPR
   3  (  595)    --KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLAVCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVTGLPYPPR
   4  (  619)    --KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLAVCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVTGLPYPPR
   5  (  372)    --KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLAVCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVTGLPYPPR

//
                                                                             
   0  (  790)    KDLQVELKRQYNDHHSKLRG----LLPGRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRNDWGALILV
   1  (  790)    KDLQVELKRQYNDHHSKLRG----LLPGRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRNDWGALILV
   2  (  652)    MDPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQEWYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQDYGAVFLC
   3  (  652)    MDPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQEWYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQDYGAVFLC
   4  (  676)    MDPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQEWYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQDYGAVFLC
   5  (  429)    MDPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQEWYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQDYGAVFLC

//
                                                                             
   0  (  846)    DDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSKKHQKVLNV--------SIK
   1  (  846)    DDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSKKHQKVLNV--------SIK
   2  (  712)    DHRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFGHVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPRATAPSVR
   3  (  712)    DHRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFGHVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPRATAPSVR
   4  (  736)    DHRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFGHVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPRATAPSVR
   5  (  489)    DHRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFGHVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPRATAPSVR

//
                                            *                                
   0  (  898)    DRTNIQDNES------TLEVTSLKYSTPPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQELQCPKI
   1  (  898)    DRTNIQDNES------TLEVTSLKYSTSPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQELQCPKI
   2  (  770)    GEDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS--LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVEYEQEP-V
   3  (  770)    GEDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS--LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVEYEQEP-V
   4  (  794)    GEDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS--LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVEYEQEP-V
   5  (  547)    GEDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS--LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVEYEQEP-V

//
                                                                             
   0  (  952)    ITKNSPLPSSIISRKEKNDPVFLEEAGKAEKIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSSFNSLGQY
   1  (  952)    ITKNSPLPSSIISRKEKNDPVFLEEAGKAEKIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSSFNSLGQY
   2  (  826)    PARQRP......................................................
   3  (  826)    PARQRP......................................................
   4  (  850)    PARQRP......................................................
   5  (  603)    PARQRP......................................................

//
                                                                             
   0  ( 1012)    FTGKIPKATPELGSSENSASSPPRFKTEKMESKTVLPFTDKCESSNLTVNTSFGSCPQSE
   1  ( 1012)    FTGKIPKATPELGSSENSASSPPRFKTEKMESKTVLPFTDKCESSNLTVNTSFGSCPQSE
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1072)    TIISSLKIDATLTRKNHSEHPLCSEEALDPDIELSLVSEEDKQSTSNRDFETEAEDESIY
   1  ( 1072)    TIISSLKIDATLTRKNHSEHPLCSEEALDPDIELSLVSEEDKQSTSNRDFETEAEDESIY
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1132)    FTPELYDPEDTDEEKNDLAETDRGNRLANNSDCILAKDLFEIRTIKEVDSAREVKAEDCI
   1  ( 1132)    FTPELYDPEDTDEEKNDLAETDRGNRLANNSDCILAKDLFEIRTIKEVDSAREVKAEDCI
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                           
   0  ( 1192)    DTKLNGILHIEESKIDDIDGNVKTTWINELELGKTHEIEIKNFKPSPSKNKGMFPGFK
   1  ( 1192)    DTKLNGILHIEESKIDDIDGNVKTTWINELELGKTHEIEIKNFKPSPSKNKGMFPGFK
   2  (    -)    ..........................................................
   3  (    -)    ..........................................................
   4  (    -)    ..........................................................
   5  (    -)    ..........................................................

//
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