Multiple alignment for pF1KE5406
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE5406, 357 aa
#  1    CCDS340.1 SNRNP40 gene_id:9410|Hs108|chr1    (357 aa)
#  2    CCDS54438.1 ATG16L1 gene_id:55054|Hs108|chr2    (444 aa)
#  3    CCDS2502.2 ATG16L1 gene_id:55054|Hs108|chr2    (588 aa)
#  4    CCDS2503.2 ATG16L1 gene_id:55054|Hs108|chr2    (607 aa)
#  5    CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2    (415 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    1.6e-107    2431  100.0         1     357
   2    1.2e-16      480   30.7       139     431
   3    1.4e-16      480   30.7       283     575
   4    1.5e-16      480   30.7       302     594
   5    7.6e-16      498   29.1        87     375

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   0  (    1)    MIEQQKRKGPELPLVPVKRQRHELLLGAGSGPGAGQQQATPGALLQAGPPRCSSLQAPIM
   1  (    1)    MIEQQKRKGPELPLVPVKRQRHELLLGAGSGPGAGQQQATPGALLQAGPPRCSSLQAPIM
   2  (  139)    ...............................PGSGKEVRVPATAL------C--------
   3  (  283)    ...............................PGSGKEVRVPATAL------C--------
   4  (  302)    ...............................PGSGKEVRVPATAL------C--------
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   61)    LLSGHEGEVYCCKFHPNGSTLASAGFDRLILLWNVYGD-CDNYATLKGHSGAVMELHYNT
   1  (   61)    LLSGHEGEVYCCKFHPNGSTLASAGFDRLILLWNVYGD-CDNYATLKGHSGAVMELHYNT
   2  (  154)    VFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWEVFGEKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDS
   3  (  298)    VFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWEVFGEKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDS
   4  (  317)    VFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWEVFGEKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDS
   5  (   87)    VLKAHILPLTNVALNKSGSCFITGSYDRTCKLWDT-AS-GEELNTLEGHRNVVYAIAFNN

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   0  (  120)    D-GSMLFSASTDKTVAVWDSETGERVKRLKGHTSFVNSCYPARRGPQLVCTGSDDGTVKL
   1  (  120)    D-GSMLFSASTDKTVAVWDSETGERVKRLKGHTSFVNSCYPARRGPQLVCTGSDDGTVKL
   2  (  214)    A-GSYLLAASNDFASRIWTVDDYRLRHTLTGHSGKVLSAKFLLDNARIV-SGSHDRTLKL
   3  (  358)    A-GSYLLAASNDFASRIWTVDDYRLRHTLTGHSGKVLSAKFLLDNARIV-SGSHDRTLKL
   4  (  377)    A-GSYLLAASNDFASRIWTVDDYRLRHTLTGHSGKVLSAKFLLDNARIV-SGSHDRTLKL
   5  (  145)    PYGDKIATGSFDKTCKLWSVETGKCYHTFRGHTAEI-VCLSFNPQSTLVATGSMDTTAKL

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   0  (  179)    WDIRKKAAIQTFQ-NTYQVLA-VTFND---TSDQIISGGIDNDIKVWDLRQNKLTYTMRG
   1  (  179)    WDIRKKAAIQTFQ-NTYQVLA-VTFND---TSDQIISGGIDNDIKVWDLRQNKLTYTMRG
   2  (  272)    WDLRSKVCIKT-------VFAGSSCNDIVCTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESIVREME-
   3  (  416)    WDLRSKVCIKT-------VFAGSSCNDIVCTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESIVREME-
   4  (  435)    WDLRSKVCIKT-------VFAGSSCNDIVCTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESIVREME-
   5  (  204)    WDIQNGEEVYTLRGHSAEIIS-LSFNT---SGDRIITGSFDHTVVVWDADTGRKVNILIG

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   0  (  234)    HADSVTGLSLSSEGSYLLSNAMDNTVRVWDVRPFAPKERCVKIFQGNVHNFEKNLLRCSW
   1  (  234)    HADSVTGLSLSSEGSYLLSNAMDNTVRVWDVRPFAPKERCVKIFQGNVHNFEKNLLRCSW
   2  (  324)    LLGKITALDLNPERTELLSCSRDDLLKVIDLRTNAIK----QTFSAPGFKCGSDWTRVVF
   3  (  468)    LLGKITALDLNPERTELLSCSRDDLLKVIDLRTNAIK----QTFSAPGFKCGSDWTRVVF
   4  (  487)    LLGKITALDLNPERTELLSCSRDDLLKVIDLRTNAIK----QTFSAPGFKCGSDWTRVVF
   5  (  260)    HCAEISSASFNWDCSLILTGSMDKTCKLWD----ATNGKCVATLTG--HDDE--ILDSCF

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   0  (  294)    SPDGSKIAAGSADRFVYVWDTTSRRILYKLPG-HAGSINEVAFHPDEPIIISASSDKRLY
   1  (  294)    SPDGSKIAAGSADRFVYVWDTTSRRILYKLPG-HAGSINEVAFHPDEPIIISASSDKRLY
   2  (  380)    SPDGSYVAAGSAEGSLYIWSVLTGKVEKVLSKQHSSSINAVAWSPSGSHVVS........
   3  (  524)    SPDGSYVAAGSAEGSLYIWSVLTGKVEKVLSKQHSSSINAVAWSPSGSHVVS........
   4  (  543)    SPDGSYVAAGSAEGSLYIWSVLTGKVEKVLSKQHSSSINAVAWSPSGSHVVS........
   5  (  312)    DYTGKLIATASADGTARIFSAATRKCIAKLEG-HEGEISKISFNPQGNHLLTGSSDKTAR

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   0  (  353)    MGEIQ
   1  (  353)    MGEIQ
   2  (    -)    .....
   3  (    -)    .....
   4  (    -)    .....
   5  (  371)    IWDAQ

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