#  0    Query: pF1KE5334, 261 aa
#  1    CCDS35345.1 RPA4 gene_id:29935|Hs108|chrX    (261 aa)
#  2    CCDS314.1 RPA2 gene_id:6118|Hs108|chr1    (270 aa)
#  3    CCDS72740.1 RPA2 gene_id:6118|Hs108|chr1    (278 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    4.8e-114    1717  100.0         1     261
   2    1.8e-43      708   45.9         1     268
   3    5.8e-43      701   45.7        10     276

//
                                                                             
   0  (    1)    MSKSGFGSYGSISAADGASGGSDQLCERDATPAIKT--QRPKVRIQDVVPCNVNQLLSST
   1  (    1)    MSKSGFGSYGSISAADGASGGSDQLCERDATPAIKT--QRPKVRIQDVVPCNVNQLLSST
   2  (    1)    MWNSGFESYGSSSY--GGAGGYTQSPGGFGSPAPSQAEKKSRARAQHIVPCTISQLLSAT
   3  (   10)    .SIRGFESYGSSSY--GGAGGYTQSPGGFGSPAPSQAEKKSRARAQHIVPCTISQLLSAT

//
                                                                             
   0  (   59)    VFDPVFKVRGIIVSQVSIVGVIRGAEKASNHICYKIDDMTAKPIEARQWFGREKVK-QVT
   1  (   59)    VFDPVFKVRGIIVSQVSIVGVIRGAEKASNHICYKIDDMTAKPIEARQWFGREKVK-QVT
   2  (   59)    LVDEVFRIGNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDTSSENT
   3  (   67)    LVDEVFRIGNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDTSSENT

//
                                                                             
   0  (  118)    PLSVGVYVKVFGILKCPTGTKSLEVLKIHVLEDMNEFTVHILETVNAHMMLDKARRDTTV
   1  (  118)    PLSVGVYVKVFGILKCPTGTKSLEVLKIHVLEDMNEFTVHILETVNAHMMLDKARRDTTV
   2  (  119)    VVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIMPLEDMNEFTTHILEVINAHMVLSKANSQPSA
   3  (  127)    VVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIMPLEDMNEFTTHILEVINAHMVLSKANSQPSA

//
                                                                             
   0  (  178)    ESVPVS-P--SEVNDAGDNDESHRNFI---QDEVLRLIHECPHQEGKSIHELRAQLCDLS
   1  (  178)    ESVPVS-P--SEVNDAGDNDESHRNFI---QDEVLRLIHECPHQEGKSIHELRAQLCDLS
   2  (  179)    GRAPISNPGMSEAGNFGGNSFMPANGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFQDLKNQLKHMS
   3  (  187)    GRAPISNPGMSEAGNFGGNSFMPANGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFQDLKNQLKHMS

//
                                               
   0  (  232)    VKAIKEAIDYLTVEGHIYPTVDREHFKSAD
   1  (  232)    VKAIKEAIDYLTVEGHIYPTVDREHFKSAD
   2  (  239)    VSSIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTD
   3  (  247)    VSSIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTD

//